全 文 :分子植物育种 , 2004 年 , 第 2 卷 , 第 3 期 ,第 4 5 5一 4 56 页
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编读往来
L E T T E R
植物基因的命名和书写 ( 以拟南芥为例 )
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a l l i gr ap h (nA E
x a m P l e o f A ar b id op s i s)
于宁 徐麟
分子植物育种编辑部 , 三亚 , 5 7 2 01 2
不 同的植物种类 , 其命名和书写方式不尽相同 ,如拟南芥 、 玉米 、豌豆 、 衣藻等植物 , 它们的命名和书写
规则均由各自的学术组织机构制定命名规则 。 迄今为止 , 对植物基因的命名尚没有一个统一的规则 。 拟南
芥是植物分子生物学领域最著名的模式植物 , 拟南芥基因组计划 的北美和多国指导委员会 ( N o hrt A ln e ir -
c an an d M ult in iat on al st e 血g co ~ it e s ) 负责制定 了现行的拟南芥基因命名规则 , 有关命名规则可在
rA ab 记叩 51 5 G en iet cs/ M e ikn e l:ab h t tP 刃m u tant
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du 网址上获取 。 因此 ,拟南芥植物基因的命名和
书写规则是值得借鉴的 , 新近克隆和鉴定的一些水稻功能基因的命名和书写方法均符合拟南芥植物基因
的命名和书写规则 。
1植物基因命名和书写的基本原则
1
.
1基因 (基因座 )
野生型基因名用大写的斜体字母表示 , 如 : 五九f
B R Y O
、
D E FE C T IV E I
。
野生型基因符号由三个斜体的大写字母组成 ,
具有相同字母符号的不 同基因座 , 可用不 同的编号
区分 , 如 二五侧旧 1 0
突变体基因名用小写斜体字母表示 , 如 : de 一 e it -
O la et d l
。
突变体基因符号用相应的基因座名称的三个
小写斜体字母命名 , 如 : de lt 。
1
.
2 等位基因
相 同基因座的不同等位基因的命名在基因名
后加一个连字符和 一个数字表示 , 如 : de -t1 、 de -t2
(注 : 若仅知道一个等位基因 , 可以不加连字符 , 例
如 , 只知道一个等位基因时 ab c3 =a b c3 一 1 ) 。 显性和
隐性等位基因不需要特别的区分 , 也允许在某个等
位基因名称的后面加一个 D 表示显性 , 如 : ab 叮突
变体等位基因 2 在杂交中对野生型是显性的 , 可以
用 a bc s一D 表示 。 在玉米中隐性等位基因用小写 ,
显性与共显性等位基因则采用首字母大写 , 如 :
d e k 12
一
4乡6 7 、 D ek 12 一环佗3 。
1
.
3 蛋白质
蛋白质常用相应的基因符号命名 , 要大写 , 且
不用斜体 , 如 : EM B I 、 EM B Z 、 D E T I 、 D E T Z 。
1
.
4 表型
常用基因名或一个描述性的短语表示表型 。 有
时也可 以用基因符号来命名表型 (正体 , 首字母大
写 ) , 并用上标 ” + ” 或 ” 一 ” 代表野生型或突变型 ,
如 : A b e + 、 A b e 一 。
2 基因命名的应用实例
2
.
1 水稻寡集基 因的命名解析 ( iL et .al ,
2 0 0 3 )
野生型基因名为 : M O N O C ULM I
野生型基因符号为 : M O C I
突变体基因符号为 : 。 oc l
蛋白质符号为 : M O C I
2
.
2 水稻脆杆基因命名解析 (L i e t a l . , 2 0 0 3 )
野生型基因名为 : B咫 T T毛E C U工M l
野生型基因符号为 : B C I
突变体基因符号为 : b cl
蛋白质符号为 : B C I
2
.
3 水稻最上节间伸长基因的命名解析 ( 方
宣钧 , 2 0 0 4 , 私人通讯 )
野生 型基因名为正工O N G A T E D U尹M O S T IN `
分子植物育种
M o l e c u lar P lan t B re
e d l n g
几吸N O D E
野生型基因符号为 : E UI
突变体基因符号为 : e ui
蛋 白质符号为 : E U I
三个不同基因座符号为 : E Ul l , E U理 , E U 13
L i X
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Y
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Q ian Q
. ,
uF Z M
. ,
W a n g Y
.
H
. ,
X io n g G
.
S
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Z en g D
.
L
. ,
W an g X
.
Q
,
L i u X
.
F , T e n g S
. ,
H ior s h i F
. ,
Y u a n M
.
,
L u o
D
. ,
H an B
,
an d L i J
.
Y
. ,
20 03
,
C o n tr o l o f t ill e n n g in ir e e
,
参考文献
iL 丫 .H , iQ an .Q , hZ ou 丫 .H , Y a n M . .x , Sun L , hZ an g M . , uF
Z
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M
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W
ang Y
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H
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H an B
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P a l l g X
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M
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C h e n M
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S
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J
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E R I T T工E C U LM I , w h i e h e n e o d e s a C O -
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《分子植物育种》 征订
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现“ 只要 “ O元且日可得至。2 0 0 3 年全套期干。
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1
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