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利用欧榛SSR标记分析榛属亲缘关系的研究



全 文 :利用欧榛SSR标记分析榛属亲缘关系的研究
收稿日期:2010-10-10
基金项目:黑龙江省自然科学基金(C200926);佳木斯大学科技开发项目(KF2010-039)
作者简介:李修平(1981-),女,讲师,博士,研究方向为植物生物技术。E-mail: lixiuping100@yahoo. com. cn
*通讯作者:李秀霞,教授,博士生导师,研究方向为植物遗传与植物生理。E-mail: lixiuxia2006@163. com
李修平,李秀霞*,王 仲,薛春梅,张丽敏,郭 勇
(佳木斯大学生命科学学院,黑龙江 佳木斯 154007)
摘 要:利用54对欧榛SSR引物,对榛属12个种、平欧杂交榛及平平欧杂交榛共64份榛属资源进行了遗传
多样性及亲缘关系分析。结果表明,欧榛遗传变异丰富,64份榛属资源18对SSR引物在欧榛10个样本中共检测
到 95个等位基因,每个位点的等位基因数 2~10个,观测杂合度值(Ho)和期望杂合度值(He)的变化范围分别为
0.214~0.816和0.348~0.800。聚类分析结果显示,64份榛属种质可划分为6组,平榛与欧榛亲缘关系最近。由此可
知,欧榛SSR标记是榛属植物资源遗传分析的有力工具,为平榛资源的遗传改良在分子水平上提供了理论依据和
基础。
关键词:欧榛;SSR标记;亲缘关系分析;遗传改良
中图分类号:S664.4;Q75 文献标志码:A 文章编号:1005-9369(2011)04-0129-08
Study on phylogenetic analysis of Corylus germplasm resouces with
SSR molecular markers for Corylus avellana/LI Xiuping, LI Xiuxia, WANG Zhong,
XUE Chunmei, ZHANG Limin, GUO Yong (College of Life Sciences, Jiamusi University, Jiamusi
Heilongjiang 154007, China)
Abstract: Genetic divers ity and clus te r ana lys is of 64 haze lnut germplasm materia ls were s tudied
with SSR molecula r markers for Corylus ave llana in this s tudy. The results showed tha t gene tic varia tion
of Corylus ave llana germplasm was abundant, 95 a lle les were de tected in 10 Corylus ave llana
materials, the number of alleles each loci changed from 2 to 10, the range of Ho and He was 0.214-
0.816 and 0.348-0.800,respective ly. The results of clus te r ana lys is showed 64 haze lnut materia ls were
divided into s ix groups , the gene tic re la tionship be tween Corylus he te rophylla and Corylus ave llana was
close . The s tudy proved tha t SSR molecula r markers for Corylus ave llana were useful tools for gene tic
ana lys is of haze lnut germplasm, and this would provide theore tica l bas is and useful ana lys is tools for
Corylus he te rophylla germplasm genetic improvement.
Key words: Corylus avellana; SSR molecular marker; phylogenetic analysis; genetic improvement
榛子为榛科(Corylaceae)榛属(Corylus)植物,
是世界四大坚果之一,其坚果营养丰富,用途广
泛,深受消费者喜爱。商业性的食用榛多为欧洲
榛(Corylus avellana),欧洲榛具有果个大、出仁率
高和产量高等优良遗传特性,但由于欧榛原产于
地中海沿岸,不能适应我国东北的寒冷气候条
件。而我国榛属资源虽十分丰富,但大部分呈野
生状态,且我国原产平榛存在果个小、果壳厚、
出仁率低、栽培适应性差的特点,进行榛子的遗
传改良研究,对于改良我国平榛资源、培育我国
的商业榛品种、研究榛属资源多样性、探究榛属
种间亲缘关系和合理利用丰富榛属种质资源具有
重要意义。
随着生物技术的发展,国内外已利用RAPD、
第42卷第4期 东 北 农 业 大 学 学 报 42(4): 129~136
2011年4月 Journal of Northeast Agricultural University April 2011
AFLP分子标记进行欧榛遗传多样性、构建遗传图谱
以及亲缘关系分析等方面的研究[1-3]。简单重复序列
(Simple sequence repeat,SSR),也称微卫星DNA或
短串联重复序列(Short tandem repeat,STR)[4-5],广
泛存在于真核基因组中 [6]。作为共显性分子标记
SSR,因具有多态性高、试验操作简单、稳定重复
性好、DNA用量少和可以进行位点在属内种间进
行保守性探查等优点,目前已广泛应用于欧洲榛
的基因型鉴定[1]、遗传图谱构建[7]、目的基因定位[8]
等领域。
本研究以榛属 12种、平平欧杂交榛优良品系
以及平欧杂交榛品种(系)共 64份材料为试材,利
用欧榛 SSR分子标记分析榛属种质资源遗传多样
性,探查 64份榛子资源亲缘关系远近,为榛属种
质资源在分子水平上的遗传分析提供参考,为种质
资源的合理利用和我国榛子遗传改良提供理论依
据。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料
本研究以榛属 12个种 34份材料、平平欧杂交
榛14份材料、平欧杂交榛16份材料共64份榛属资
源为试材(见表1、2)。
表1 榛属12种(变种)及种间杂交品种(系)
Table 1 Total 12 Corylus species (variety) and hybrid
编号
Number
1~5
6~11
12~13
14~23
24~26
27
28
29~30
31
32
33
34
35~48
49~64

Species
平榛
毛榛
华榛
欧榛
欧洲大果
Tibetica
Pontica
Cornuta
Sieboldiana
Longycarpe
Jacquemontii
土耳其榛
平平欧杂交榛
平欧杂交榛
拉丁名称
Latin name
Corylus heterophylla
Corylus mandshurica
Corylus chinensis
Corylus avellana
Corylus maxima
Corylus tibetica
Corylus pontica C. Koch
Corylus cornuta
Corylus sieboldiana
Corylus longycarpe
Corylus jacquemontii
Corylus colurna L. rylobosa
Corylus heterophylla×(Corylus heterophylla× Corylus avellana)
Corylus heterophylla×Corylus avellana
样本量
Sample number
5
6
2
10
3
1
1
2
1
1
1
1
14
16
表2 欧榛品种名录
Table 2 List of introduced Corylus avellana cultivars
编号
Number
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
品种名
Varieties
欧榛
爱内斯
巴特勒
罗亚尔
巴塞罗那
倒垂欧榛
黄叶欧榛
Laciniata
Praecox
蛇形欧榛
拉丁名称
Latin name
Corylus avellana
Corylus avellana
Corylus avellana
Corylus avellana
Corylus avellana
Corylus avellana L. Pendula
Corylus avellana L. Aurea
Corylus avellana L. Laciniata
Corylus avellana L. Praecox
Corylus avellana L. Contorta
采集地
Collection site
乌克兰国家科学院索菲耶夫卡森林树木园
佳木斯大学生命科学学院榛子园基地
佳木斯大学生命科学学院榛子园基地
佳木斯大学生命科学学院榛子园基地
佳木斯大学生命科学学院榛子园基地
乌克兰国家科学院索菲耶夫卡森林树木园
乌克兰国家科学院索菲耶夫卡森林树木园
乌克兰国家科学院索菲耶夫卡森林树木园
乌克兰国家科学院索菲耶夫卡森林树木园
乌克兰国家科学院索菲耶夫卡森林树木园
1.1.2 SSR引物
本研究采用54对欧榛SSR分子标记引物,引物
序列参照文献[9-14],由上海生物工程有限公司合成。
1.2 方法
1.2.1 总DNA的提取
采用改良的CTAB法[15],取榛子幼叶为试验材
·130· 东 北 农 业 大 学 学 报 第42卷
料,进行基因组总DNA提取。用1%琼脂糖凝胶电
泳检测总DNA浓度和纯度。
1.2.2 PCR扩增及银染
引物序列参见文献[9-14],由上海生物工程有
限公司合成。
SSR扩增在Biometra公司的T1 Theromcycler PCR
仪上进行。20 μL体系为:50 ng·μL-1的模板DNA 3
μL,10 × PCR buffer 2 μL,dNTP(10 mmol·L-1)0.3
μL,TaqDNA Polymerase(5 U·μL-1)0.2 μL,MgCl2
1.5 μL,SSR引物 3 μL,ddH2O 9.9 μL。扩增程序
为: 95 ℃预变性 5 min,94 ℃变性 40 s,50~61 ℃
复性 40 s,72 ℃延伸 40 s,共 38个循环,最后在
72℃延伸5 min,4℃保存。
PCR产物,加上 8 μL甲酰胺双色缓冲液(2.5
mg·mL-1溴酚兰,2.5 mg·mL-1二甲苯青,10 mmol·L-1
EDTA,95%去离子甲酰胺),置于 PCR仪中变性
5 min,迅速放入冰水混合物中冷却5 min。
PCR产物在 POWERPAC3000电泳仪中 100 W
恒功率,以 6%聚丙烯酰胺标准测序胶为介质,以
1×TBE为缓冲液,电泳分离,快速银染后检测。
1.2.3 统计分析方法
利用软件 Popgene32计算以下遗传多样性参
数:①等位基因数Na(Average number of alleles per
locus);② 有效基因数 Ne(Effective number of alleles
per locus);③ 观测杂合度值Ho(Observed hetero-
zygosity);④ 期望杂合度值 He(Expected hetero-
zygosity);⑤多态信息量PIC(Polymorphic informa-
tion content);利用软件NTSYS-pc2.1[16],对64份榛
属种质进行树状图分析。
2 结果与分析
2.1 引物的筛选
由于SSR位点序列在属内种间甚至在科内都具
有高度保守性和相似性,本研究采用已发表的欧榛
SSR引物扩增 64份榛属试验材料,进行同源性及
有效性扩增,文献中共收集 54对欧榛微卫星引
物[9-14]。
从54对欧榛SSR引物中筛选出18对引物(引物
信息详见表 3)用于 64份榛子种质资源遗传多样性
的SSR分析,部分扩增图谱如图1所示。
表3 18对欧榛SSR引物序列
Table 3 Total 18 paris of SSR primers
引物名称
Primers
CAC-A024b
CAC-C115
CaDCAT11
CAC-B028
CaDCAT28
CaDCAT22
CaDCAT10
CAC-B005
CAC-C119
CAC-B014
CAC-B105
CaDCAT6
核心序列
Core sequence
(GA)18(AT)7
(TAA)5(GAA)12
(GA)10
(AG)16
(CT)14
(CT)17CC(CT)2
(GA)1(GC(GA)2GC(GA)14
(GA)22
(GA)7,(GA)9
(GA)16
(GA)16
(CTT)2T(CTT)8
引物序列(5-3)
Primer sequence
CAC AAC ATG CAA CGT CTA TGT A
AGG TAC GTA TTG ACA GGC TTT T
CAT TTT CCG CAG ATA ATA CAG G
GTT TCC AGA TCT GCC TCC ATA TAA T
GGG TCA AGA TTT GAT AAA GTG GGA
GCA CTC CAC TTG TGC GTT TTC
ATG GAC GAG GAA TAT TTC AGC
CCT GTT TCT CTT TGT TTT CGA G
GTA GGT GCA CTT GAT GTG CTT TAC
AAC ACC ATA TTG AGT CTT TCA AAG C
AGA GAA CGA CTT TGT ATG ACA AAG A
TTG AAC CAT TAA ATA CAT CAT GTG A
CTA AGC TCA CCA AGA GGA AGT TGA T
GCT TCT GGG TCT CCT GCT CA
CAA ACT TAT GAT AGG CAT GCA A
TGT CAC TTT GGA AGA CAA GAG A
CTC ACC TTT ACC CCT TCA TTT T
GTT TCC TCA TCT TCT GAG AAC CAT C
CTT CCA AGG ATG GCT CAG
TTT CAG GAC GAG GAC TCT G
AAA GGA GCA AGC ATG TTA GG
GTT TGT ACG GAT GAT CCA CTG AG
GGT CTC CTT CGC TAA CAT AAC CAA
GTT GCC CTC GAG TTG TAG TA
退火温度(℃)
Annealing temperature
50
51
51
51
51
51
51
51
51
55
51
52
李修平等:利用欧榛SSR标记分析榛属亲缘关系的研究第4期 ·131·
2.2 榛子种质资源的SSR多样性
18对欧榛 SSR引物用于榛属植物遗传分析,
这18对引物均能够在本研究的64份材料中扩增出
DNA片段,呈现多态性,但各位点的检测结果不
同,表明在不同位点上榛属植物的遗传多样性存
在差别。64份种质材料中,共检测到176个等位基
因,每个位点的等位基因数(Na)变化范围在 4~
18,平均值为9.778个。有效基因数(Ne)为每个位
点的等位基因的有效数目,其数值越大,表明等
位基因的作用就越大。本研究榛属种Ne变化范围
为 2.462~8.640,平均值为 5.950。多态信息量指数
(PIC)反映位点多态性水平和具有区分群体的能
力,其值越大表明其使用价值越高,从表4可以看
出,PIC变幅为 0.368~0.853,平均值为 0.716(大
于0.5),说明大部分位点为多态位点。Ho和He反
映遗传变异性大小,Ho越大,则杂合度越高。从
表 5中可以看出,Ho的变化范围为 0.314~0.889,
平均值为0.689;He的变化范围为0.365~0.846,平
均值为0.742,表明榛属植物变异性较高。
由表 5可知,18对 SSR引物在欧榛 10个样本
中共检测到 95个等位基因,每个位点的等位基因
数 2~10个,平均值为 5.278个。其中 CaDCAT28、
CaDCAT10、CaDCAT22、CaT-B504、CaT-B503等
位基因数较多,分别为 10、8、7、8、8;CAC-
C119位点只有2个等位基因。欧榛等位基因有效数
目(Ne)变幅在 1.663~5.649,平均值为 3.299。观测
杂合度(Ho)和预期杂合度(He)的变化范围分别为
0.214~0.816、0.348~0.800,平均值分别为 0.517和
0.631。PIC变化范围为 0.301~0.759,其平均值为
0.576。
2.3 64份榛子种质资源的NTSYS聚类分析
聚类图2结果显示,64份榛属种质样本间的相
似系数最大为0.980,最小为0.590,表明榛属种质
遗传多样性比较丰富。在相似系数 0.68处可将榛
子种质资源划分为 6组:第 1组包含 5份平榛(1~
5)、14份平平欧杂交榛(35~48)和 8份平欧杂交榛
(61、54、60、55、58、53、57和59);第2组包含
10份欧榛(14~23)、8份平欧杂交榛(51、50、49、
52、 62、 64、 56和 63)以及其他 6个种(Corylus
maxima、 Corylus tibetica、 Corylus pontica、 Corylus
cornuta、Corylus sieboldiana和Corylus colurna L.)的 9份
材料;第3组包括Corylus longycarpe 1份(32);第4
组包括Corylus jacquemontii 1份(33);第 5组包括 2
份华榛(12,13);第6组包含6份毛榛(6~11)。
续表
引物名称
Primers
CAC-C028
CAC-A14a
CAC-C040
CaT-B503
CaT-B504
CaT-B107
核心序列
Core sequence
(GAA)10
(CA)13
(GAA)8(GGA)5
(GA)18
(CT)18
(CT)14
引物序列(5-3)
Primer sequence
CTA CCC CAT CGC TTG ACA C
GGA GAC TTG TTT GCC ACA GA
GGT TTG TTA CAG AAA TTC AGA CG
GCG TGT GGT TAA TGT TTT CTT T
AGC CCC ATT AGC CTT CTT AG
GTT TCC AGA TCT GCC TCC ATA TAA T
CTC AAT TCA CTC GAA CGG ATA C
AGC CGA TAC CAG CCT CTC GC
CGC CAT CTC CAT TTC CCA AC
CGG AAT GGT TTT CTG CTT CAG
GTAGGTGCACTTGATGTGCTTTAC
AACACCATATTGAGTCTTTCAAAGC
退火温度(℃)
Annealing temperature
51
51
62
55
55
58
图1 引物CaDCAT28部分PCR扩增产物PAGE银染检测
Fig. 1 PAGE electrophoresis of some PCR products with primer CaDCAT28
·132· 东 北 农 业 大 学 学 报 第42卷
表4 18个SSR位点在64份试验材料中的检测结果
Table 4 SSR marking results of 64 experimental materials using 18 SSR primers
位点
SSR locus
CaDCAT28
CaDCAT10
CAC-B028
CAC-A14a
CAC-C115
CAC-B005
CAC-B014
CAC-C028
CaDCAT11
CaDCAT22
CAC-C040
CaT-B504
CaT-B107
CaDCAT6
CAC-C119
CAC-A024b
CaT-B503
CAC-B105
合计 Total
均值 Mean
个体数
Sample
number
64
64
64
64
64
64
64
64
64
64
64
64
64
64
64
64
64
64
-
-
等位基因
平均数
Na
18
15
8
10
6
8
6
6
10
11
5
15
9
9
4
9
15
12
176
9.778
等位基因
有效数
Ne
8.640
8.261
5.936
7.325
3.895
6.015
2.998
4.369
3.968
4.356
3.453
8.264
7.231
6.568
2.462
6.594
8.600
7.896
107.101
5.950
多态信息量
指数
PIC
0.8230
0.8102
0.7820
0.7120
0.6980
0.7730
0.6720
0.6430
0.7140
0.7820
0.3680
0.8530
0.7170
0.8000
0.4580
0.7020
0.8170
0.7620
12.8860
0.7160
观测
杂合度
Ho
0.859
0.800
0.693
0.638
0.492
0.801
0.676
0.768
0.654
0.787
0.388
0.845
0.889
0.314
0.468
0.786
0.834
0.711
12.403
0.689
预期
杂合度
He
0.846
0.832
0.754
0.746
0.744
0.845
0.780
0.689
0.726
0.803
0.457
0.829
0.832
0.816
0.361
0.804
0.757
0.743
13.368
0.742
表5 欧榛的遗传多样性
Table 5 Genetic diversity of C. avellana
位点
SSR locus
CaDCAT28
CaDCAT10
CAC-B028
CAC-A14a
CAC-C115
CAC-B005
CAC-B014
CAC-C028
CaDCAT11
CaDCAT22
CAC-C040
CaT-B504
CaT-B107
CaDCAT6
CAC-C119
CAC-A024b
CaT-B503
CAC-B105
合计 Total
均值 Mean
个体数
Sample
number
10
10
10
10
10
10
10
10
10
10
10
10
10
10
10
10
10
10
-
-
等位基因
平均数
Na
10
8
4
6
3
4
3
4
6
7
3
8
5
4
2
4
8
6
95
5.278
等位基因
有效数
Ne
5.326
4.168
3.597
3.982
2.430
3.262
1.726
1.992
1.957
3.049
1.694
5.649
4.001
3.094
1.663
3.946
4.156
3.698
59.390
3.299
多态信息量
指数
PIC
0.759
0.706
0.649
0.597
0.459
0.684
0.367
0.375
0.596
0.695
0.301
0.724
0.589
0.579
0.305
0.584
0.694
0.700
10.363
0.573
观测
杂合度
Ho
0.816
0.629
0.491
0.367
0.583
0.581
0.266
0.403
0.618
0.700
0.320
0.632
0.600
0.240
0.214
0.655
0.599
0.587
9.301
0.517
预期
杂合度
He
0.800
0.726
0.764
0.652
0.619
0.758
0.492
0.539
0.549
0.754
0.451
0.799
0.663
0.573
0.348
0.620
0.642
0.613
11.362
0.631
李修平等:利用欧榛SSR标记分析榛属亲缘关系的研究第4期 ·133·
本研究利用了 12个种榛属种质为试验材料,
但可能由于样本量太少(其中5个种只有1个样本)
以及标记数据不够丰富(18对SSR引物用于遗传分
析),使得欧洲大果、Tibetica、Pontica、Cornuta、
Sieboldiana和土耳其榛这 6个种最终与欧榛材料划
分在同一组内。
聚类图结果显示,平榛与欧榛亲缘关系最
近,在相似系数为 0.664时聚合在一起,其次是
Corylus longycarpe和 Corylus jacvemot,在相似系数
为 0.635时与平榛和欧榛聚合在一起,接着是华
榛,亲缘关系最远的是毛榛。14份平平欧杂交榛
都与平榛分在了一组,可能是由于这 14份平平欧
杂交榛的母本均为饶河三人班平榛,并且经过平
榛的回交而使平平欧杂交榛亲缘关系上更倾向于
12453615460555835394147424436373840454346485357591551501649171820522334242527645663142122192662282931303233121367101189
图2 64份榛子种质资源聚类分析
Fig. 2 Phylogenetic analysis of 64 hazelnut germplasm resources
0.59 0.68 0.78 0.88 0.98
遗传系数 Coefficient
·134· 东 北 农 业 大 学 学 报 第42卷
平榛;16份平欧杂交榛分成了2组,一组倾向于平
榛,一组倾向于欧榛。49号(玉坠)、50号(金
铃)、51号(辽榛3号)和52号(薄壳红)均为推广的
优良平欧杂交榛品种,可能是人工选择的结果使
得在分组时,它们与欧榛的亲缘关系更近些。
3 讨 论
3.1 欧榛SSR标记榛子种质资源的遗传多样性
SSR标记具有共显性、操作简单、多态性高等
特点,被广泛应用于基因定位、遗传图谱构建等
研究 [9-11]。但根据数据库获得 SSR两翼序列或引
物、或者建立基因组DNA文库获得引物都是很困
难的方法。SSR位点序列在属内种间、甚至在科内
都是保守的,因此利用欧榛的引物进行榛属遗传
多样性分析是相对简易的方法。
54对欧榛 SSR引物在 64份榛属材料中扩增,
筛选出 18对引物在 64份材料中均具有扩增产物。
欧榛 SSR是进行榛属其他种遗传分析的有效工具。
但也有引物在本研究中的平榛、毛榛和华榛材料
中扩增效果不佳,这说明我国榛属资源和欧榛遗
传背景差异很大。这 54对欧榛 SSR引物在 14份平
平欧杂交榛和 16份平欧杂交榛材料上的扩增效果
良好,有的标记对杂交榛的扩增效果甚至优于欧
榛材料,例如标记CAC-A032和标记CAC-C001a。
CaDCAT28、CaDCAT10、CAC-B028和 CAC-
A14a携带信息位点较多,其等位基因数分别为
18、15、8、10,这与 Gökirmak等的研究结果相
近[9],其研究结果显示这四个位点是信息位点最丰
富的位点,其等位基因数分别为 20、15、15、
14。本研究和Gökirmak等的研究中,CAC-C028具
有 6个等位基因,位点CAC-C119信息最少,该位
点具有 4个等位基因,Ne值为 2.462、PIC值为
0.458、Ho为 0.468、He为 0.365,这与 Bassil等研
究结果相一致[10]。标记CAC-C119具有数目最少的
二核苷酸串联重复序列,Cho等研究结果表明 [17],
一个微卫星位点具有突变和遗传等位基因变异倾
向的主要决定因素不是以碱基形式的排列长度而
是串联重复单位的单元数目。研究表明,欧榛SSR
引物是榛属植物资源遗传分析、品种改良以及种
间遗传图谱构建的有力工具。
3.2 欧榛是平榛遗传改良的重要种质资源
我国榛属资源丰富,而平榛在我国分布广
泛,栽培适应性强,但大部分处于野生状态,并
且具有坚果小(平均单果重仅 1 g)、果壳厚、出仁
率低(只有 25%~30%)、单位面积产量不高的缺
点。因而利用优良种质资源,种间远缘杂交是改良
平榛的重要手段。欧榛具有果大(单果重2~4 g)、果
壳薄、出仁率高(40%~50%)、产量高等优良遗传
特性,但由于其原产地中海沿岸,不能适应我国
东北的寒冷气候条件,因此直接引种我国东北比
较困难。欧榛资源遗传变异丰富,对于欧榛遗传
多样性的研究已有相关报道[9-13, 18-22],尽管本研究欧
榛样本量较少,但从表5的结果中仍显示了欧榛丰
富的遗传变异,这为我国平榛遗传改良提供了丰
富的种质资源。研究表明,平榛与欧榛亲缘关系
较近,这与王艳梅得出的平榛与欧榛亲缘关系较
近结果相一致[22],这为利用欧榛资源改良平榛提供
了理论依据。
本研究利用欧榛SSR引物扩增平欧杂交榛和平
平欧杂交榛材料时,具有良好的扩增效果,54对
SSR欧榛引物在杂交榛扩增过程均得到了扩增产
物,这也为杂交榛的品种选育提供了有力的分子
检测工具。
4 结 论
欧榛SSR标记是进行榛属植物遗传分析的有力
工具;平榛与欧榛亲缘关系较近,欧榛遗传变异
较丰富,利用欧榛SSR引物对杂交榛的扩增结果良
好,鉴于平榛和欧榛的特性,平榛与欧榛杂交育
种是我国平榛品质改良的有效途径。
[ 参 考 文 献 ]
[ 1 ] Galderisi U, Cipollaro M, Bernardo D G, et al. Identification of
hazelnut (Corylus avellana) cultivars by RAPD analysis[J]. Plant
Cell Reports, 1999, 17(7-8): 652-655.
[ 2 ] Miaja M L, Vallania R, Me C, et al. Varietal characterization in
hazelnut by RAPD markers[J]. Acta Horticulturae, 2001, 556: 247-
250.
[ 3 ] Ferrari M, Scarascia G I, Gori M, et al. DNA fingerprinting of
Corylus avellana L. accessions revealed by AFLP molecular mar-
kers[J]. Acta Hort (ISHS), 2005, 686: 125-134.
[ 4 ] Amos W, Rubinstzein D C. Microsatellite are subject to direc-
tional evolution[J]. Nat Genet, 1996, 12(1): 13-14.
李修平等:利用欧榛SSR标记分析榛属亲缘关系的研究第4期 ·135·
[ 5 ] Debrauwere H, Gendrel C G, Lechat S, et al. Differences and
similarities between various tandemrepeat sequences: Minisa-
tellites and microsatellites[J]. Biochimie, 1997, 79(9-10): 577-
586.
[ 6 ] Toch G , Gaspari Z, Jurka J. Microsatellites in different eukaryotic
genomes: Survey and analysis[J]. Genome Research, 2000, 10:
967-981.
[ 7 ] Mehlenbacher S A, Brown R N, Nouhra E R, et al. A linkage map
of hazelnut[J]. Acta Hort (ISHS), 2005, 686: 135-140.
[ 8 ] Pomper K W, Azarenko A N, Bassil N, et al. Identification of
random amplified polymorphic DNA(RAPD) markers for selfin-
compatibility alleles in Corylus avellana L.[J]. Theor Appl Genet,
1998(97): 479-487.
[ 9 ] Gökirmak T, Mehlenbacher S A, Bassil N V. Investigation of
genetic diversity among european hazelnut (Corylus avellana)
cultivars using SSR markers[J]. Acta Horticulturae, 2005, 686:
141-147.
[10] Bassil N V, Botta R, Mehlenbacher S A. Additional microsatellite
markers of the european hazelnut[J]. Acta Hort (ISHS), 2005a,
686: 105-110.
[11] Bassil N V, Botta R, Mehlenbacher S A. Microsatellite markers in
hazelnut: Isolation, characterization and cross-species amplifica-
tion[J]. J Amer Soc Hort Sci, 2005b, 130(4): 543-549.
[12] Boccacci P, Akkak A, Bassil N V, et al. Characterization and
evaluation of microsatellite loci in european hazelnut (Corylus
avellana L.) and their transferability to other Corylus species[J].
Molecular Ecology Note, 2005(5): 934-937.
[13] Boccacci P, Akkak A, Botta R. DNA typing and genetic relations
among european hazelnut (Corylus avellana L.) cultivars using
microsatellite markers[J]. Genome, 2006, 49: 598-611.
[14] Shawn A M, Rebecca N B, Eduardo R N, et al. A genetic linkage
map for hazelnut (Corylus avellana L.) based on RAPD and SSR
markers[J]. Genome, 2006, 49(2): 122-133.
[15] Doyle J J. Isolation of plant DNA from fresh tissue[J]. Focus, 1990
(12): 13-15.
[16] Rohlf F J. NTSYS-pc. Numerical Taxonomy and multivariate
analysis system[M]. NewYork: Exeter Software, Setauket, 1998.
[17] Cho Y G, Ishii T, Temnykh S, et al. Diversity of microsatellites
derived from genomic libraries and GenBank sequences in rice
(Oryza sativa L.)[J]. Theor Appl Genet, 2000, 100: 713-722.
[18] Gökirmak T, Shawn A M, Bassil N V. Characterization of eu-
ropean hazelnut (Corylus avellana) cultivars using SSR markers[J].
Genet Resour Crop Evol, 2009, 56: 147-172.
[19] 程丽莉,黄武刚,周志军.欧洲榛微卫星对我国榛属种质资源
的分析[J].林业科学,2009, 45(2): 22-26.
[20] 冯斌,张希踔,解明.榛子种质资源遗传多样性的RAPD分析
[J].辽宁师范大学学报:自然科学版, 2007, 30(2): 216-219.
[21] 杨青珍.平榛、欧榛及种间杂种榛品种(系)的遗传多态性及
亲缘关系分析[D].太古:山西农业大学, 2004: 36-40.
[22] 王艳梅.利用 SSR研究榛属种间亲缘关系及平榛居群遗传多
样性[D].北京:北京林业大学, 2008: 38-49.
·136· 东 北 农 业 大 学 学 报 第42卷