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香樟树新病原菌——二年残孔菌的形态学鉴定及ITS序列系统发育分析



全 文 :Vol. 32 No. 5
May 2012
第 32卷 第 5期
2012年 5月
中 南 林 业 科 技 大 学 学 报
Journal of Central South University of Forestry & Technology
在 2009~ 2010年秋冬季于绵阳市江油方水
镇、绵阳市涪城区香樟树树干基部多次采集到一
种残孔菌标本(见图 1)。本研究从采集的子实体
中分离获得纯菌丝体,进行平板培养获得菌落形
态,在实验室成功培养出子实体,对其 形态特征
进行观察,确定其分类地位;测定分析其 ITS序
列,与基因库 (GenBank)中同属近缘序列进行比对,
构建系统进化树。
香樟树新病原菌——二年残孔菌的
形态学鉴定及 ITS 序列系统发育分析
郑俊 娟,商圆圆,霍存录,方英杰,贺新生
(西南科技大学 生命科学与工程学院,四川 绵阳 62 101 0)
摘 要: 报道了香樟树的一种新病原菌,对采集的标本及其培养物的 形态特征进行观察,对其 ITS区序列
进行测定和系统发育分析,将所测得的序列提交至 Genbank 获得序列号为 JN182923。通过 Blast比对获得同
属近缘的序列后构建系统发育树并进行同源性分析。形态学鉴定和分子鉴定相结合将标本鉴定为二年残孔菌
Abortiporu s biennis,由系统发育树推断,二年残孔菌是多元进化的。
关键词: 二年残孔菌;形态特征;ITS rDNA;系统发育
中图分类号: S718.81 文献标志码: A 文章编号: 1673-923X (2012)05-0073-03
A new pathogenic fungi of Cinnamomum camphora: morphological
identifi cation and ITS phylogenetic analysis of Abortiporus biennis
ZHENG Jun-juan, SHANG Yuan-yuan, HUO C un-lu, FANG Ying-jie, HE Xin-sheng
(School of Life Science and Engineering, Southwest University of Science and T echnology, Mianyang 621010, Sichuan, China)
Abs tract: A new pathogenic fungi of Cinnamomum camphora was repor ted. The morphological characteristics and microscopic
observation of the pathogen were conducted. The specimen’s ITS rDNA sequence was submitted to Genbank and acquired a gene number
JN182923. Through blast comparison we got the relative sequences and made homology analysis by constructed the phylogenetic tree.
Combining traditional morphological identification and molecular identification,the ITS rDNA sequence were determined, and ITS
rDNA system development was analyzed. The parasite was identifi ed as Abortiporus biennis and the phylogenetic tree indicates that
Abortiporus biennis is probably polyphyletic.
Key words: Abortiporus biennis;morphological characteristics;ITS rDNA;phylogeny
1 材料与方法
1.1 形态特征观察
2009年 11月 10日在绵阳市江油方水镇,在
香樟树根部采集到真菌子实体 ,保存在西南科技
大学菌物标本室(SWUST2009111001)。先对其
外部形态特征进行描述,再取少量菌肉组织制成
水浸片,在侧置显微镜下进行显微结构观察。从
收稿日期:2011-11-24
基金项目:西南科技大学研究生创新基金项目(11ycjj41)
作者简介:郑俊娟(1987-),女 ,江苏丹阳人 ,硕士研究生 ,研究方向 :野生蕈菌资源;E-mail:junjuan_zheng@126.com
通讯作者:贺新生(1965-),男 ,四川金堂人 ,教授 ,主要从事食用药用蕈菌资源研究;E-mail:hexinsheng@swust.edu.cn
DOI:10.14067/j.cnki.1673-923x.2012.05.017
郑俊娟,等:香樟树新病原菌——二年残孔菌的形态学鉴定及 ITS序列系统发育分析74 第 5期
野生子实体中分离获得纯菌丝,进行平板培养获
得菌落形态。
1.2 系统发育树的构建
1.2.1 供试菌株
本研究供试菌株包括 25份材料 (见表 1),其
中二年残孔菌 Abortiporus biennis菌株分离自四川
省绵阳市江油方水镇生长在香樟树根部的真菌子
实体标本,分离菌株编号 Ab.1,保存在西南科技
大学菌种保藏管理中心。本实验测定了它的 ITS
序列,其余序列均来自基因库 (GenBank)。
的 Method 中 选 择“Full Alignment” 和 “Try both
strands”;在 Output的 Tree /Homology Tree中选择
“Observed Divergency”和 “Toss gaps”,输出树形图。
树形图上的百分数表示比较菌株之间的相似度。
2 结果与分析
2.1 形态鉴定
该菌株子实体一年生,盖状,无柄或有短柄,
柄侧生或偏生,菌盖单生或覆瓦状叠生,新鲜时
间软木栓质,味淡,干后木栓质,质量明显减轻;
菌盖半圆形、圆形或扇形,单个菌盖 3~ 12 cm
长,宽 2~ 15 cm,厚 5~ 11 mm;菌盖表面新鲜
时粉红色、火烈鸟色,有不明显的环纹,被有细
而短的绒毛,干后灰白、灰褐色;边缘新鲜时与
菌盖表面同色或颜色稍浅,干后同色,内卷。菌
肉木栓质,木材色,厚 2~ 8 mm。菌柄不规则,
长 0.1~ 10 cm,如果有枯叶或腐烂的木屑覆盖,
可以形成分枝状的菌柄,粉红色,木栓质。子实
层体近菌管状,孔口表面新鲜时浅褐色至粉红色,
手触后变黑色,干后木材色或浅黑褐色;不育边
缘不明显;孔口多角形至迷宫 状,有时几乎为菌
褶状,每毫米 1~ 4个;管口边缘薄,撕裂状;
菌管浅木材色,单层,木栓质,长度 3~ 6 mm。
孢子印粉白 色。孢子宽椭圆形、卵圆形,无色,
光滑,大小为 4.5~ 6.0×3.0~ 4.5 m。上述形态
特征与国内外已发表的 该菌的研究进行对比 [2-5],
将其鉴定为二年残孔菌 Abortiporus biennis。
表 1 供试菌株
Table 1 Strains used in the study
物种 基因库 物种 基因库
Abortiporus biennis(Ab.1) JN182923 Phlebia chrysocrea AY219367
A. biennis FJ608589 P. acanthocystis AB210074
A. biennis EU232187 Gloeoporus pannocinctus EU546099
Podoscypha multizonata EU118663 G. dichrous EU546097
P. petalodes DQ917655 Ceriporiopsis pannocincta AY219361
Trametes cervina AY684175 C. niger EU546098
T. cervina AY986501 C. aneirina FJ496682
Hypochnicium geogenium FN552534 Phanerochaete sordi da FJ228210
H. michelii FN552535 P. sordida AY781266
H. lundellii AY781277 P.chrysosporium AY219344
H. lyndoniae DQ309069 Physisporinus sanguinolentus FJ496671
H. bombycinum FN552537 Flavodon fl avus FJ478126
Phlebia acanthocystis AB210075
1.2.2 DNA的提取
称取少量采样分离培养的Ab.1菌株的菌丝,
加液氮充分研磨后,迅速转移至 1.5 mL离心管
中, 用 Universal DNA Genomic Extraction Kit
Ver3.0 (大连 TaKaRa, Cat#DV811A)按照其使用说
明提取基因组 DNA。
1.2.3 ITS区域的特异性 PCR扩增
选择 ITS-1和 ITS-4这两个引物扩增 ITS的全
长序列 ,它们由上海生工生物公司合成。引物序列、
PCR反应体系以及 PCR反应条件和 ITS序列的测
定均参考文献 [1]。
1.2.4 ITS序列的分析
将测得的 Ab.1菌株的 rDNA-ITS序列提交
到美国 NCBI的 GenBank数据库,获得基因号,
并进行 Blast比对,获得指标靠前的 24条相似序
列,将这 24个菌株的 rDNA序列通过 Blast工具
和 DNAMAN软件(6.0.40版本)进行比对分析,
构建系统进化树。在Multiple Sequence Alignment
A:生长在香樟树根部的子实体;B:锁状联合;C:瓶栽出菇的子实体;
D:椴木埋土出菇的子实体 .
图 1 二年残孔菌的子实体和菌丝体形态
Fig. 1 Fruiting body and mycelium morphology of
Abortiporus bienni
75第 32卷 中 南 林 业 科 技 大 学 学 报
该菌菌丝体白色,气生菌丝旺盛,具有明显
的爬壁性,无色素分泌;生殖菌丝管状,透明,
有明显的锁状联合。可以在琼脂或其他固体培养
基上直接形成子实层。在水平向上的培养基表面
只发育子实层,不形成菌盖。在空间位置适当时
才形成菌盖,如垂直于地面的培养基表面,或向
下有空间的基物表面。与培养皿内污染的杂菌形
成明显的拮抗线,表明有一定的抗杂菌能力。在
子实体发生过程中,在形成菌管后分泌出大量琥
珀色的液滴。
属于菌物界 Fungi,担子菌门 Basidiomycota,伞菌
亚门 Agaricomycotina,伞菌纲 Agaricomycetes,多
孔菌目 Polyporales,干朽菌科 Meruliaceae,残孔
菌属 Abortiporus(Murrill et al.1904)。二年残孔
菌 Abortiporus biennis的同物异名 有:A bortiporus
distortus (Schwein.) Murrill et al.、Daedalea
albida Purton.、Grifola biennis (Bull.) Zmitr. &
Mal ysheva.、Polyporus sericellus Sacc.、Polystictus
rufescens (Pers.) P. Karst.、Trametes rufescens (Pers . )
G.H. Otth.。主要分布在 中国、日本 以及西欧等国
家,稀生于针叶树上,寄生于许多种类的阔叶树上
或地下埋有腐木的地上,导致木材白色腐朽。生长
在抗真菌能力很强的香樟树上还是首次发现,造成
树叶提前发黄、落叶,生长缓慢 ,逐渐枯萎、死亡。
世界分布广泛:中国、日本、挪威、丹麦、瑞典、
英国、澳大利亚、美国;在中国,江苏、浙江、 福
建、山西、广西、海 南等地均有该 菌的报道 [2-3],
该菌对园林植物造成的危害也越来越严重,逐渐
受到关注。对该菌的研究大都是对其进行形态学
描述和生态分布调查 [2-5];也有研究发现二年残孔
菌 A. biennis具有药用价值,能够抑制肿瘤 [6];二
年残孔菌 A. biennis通过分泌草酸而对有毒的金属
氧化物有一定的耐受力 [7-9]。
系统进化树中所选取的对比菌株属于不同的
属,亲缘关系较近的聚类在一起,但 ITS rDNA序
A:形成白色菌丝体之初;B:形成菌管后分泌大量琥珀色的液滴,与
杂菌形成的拮抗线
图 2 菌 落
Fig. 2 Colony
2.2 亲缘关系比较
将标本 Ab.1测定的 DNA序列提交到 NC BI
的 Genbank数据库获得基因号为 JN182923。该序
列 671 bp,其中 18S rDNA部分序列 14 bp,ITS1
rDNA序列 267 bp,5.8S rDNA序列 143 bp,ITS2
rDNA序列 221 bp,28S rDNA部分序列 27 bp。
供比较的 ITS rDNA序列长度不一致,最长为
Podoscypha multizonata (EU118663) 986 bp,最短
为 Hypochnicium lundellii(AY781277)菌株 557 bp。
利 用 DANMAN 软 件 分 析 25 个 菌 株 的
ITS rDNA序列,得到系统进化树(图 3)。与
Ab.1(JN182923)亲缘关系较近近的菌株是 A.
biennis(FJ608589)、A. biennis(EU232187)
和 Podoscypha multizonata(EU118663), 与
Genbank中 FJ608589和 EU232187序列相似度达
到 100%,确定 Ab.1菌株是残孔菌属的二年残孔
菌(A. biennis),由 系统发育树推断二年残孔菌(A.
biennis)是多元进化的。
3 讨 论
二年残孔菌 Abortiporus biennis (Bull.)Singer
图 3 基于ITS rDNA序列的Abortiporus系统进化树
Fig. 3 Phylogenetic tree of Abortiporus based on
ITS rDNA sequences
(下转至第 124页 )
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[ 本文编校: 谢荣秀 ]
列都在 80%的同源水平上与二年残孔菌 A. biennis
相似。本研究是首次将二年残孔菌 A. biennis进行
详细的形态描述、实验室培养及其 ITS区序列的
PCR扩增测序,根据其 ITS序列构建系统进化树。
对二年残孔菌 A. biennis在国内的分布、子实体和
菌落形态特征方面提供了重要的新信息,其分子
结果有助于更大规模干朽菌科的系统发育研究,
为该菌的鉴定提供可靠的依据,同时对该种病原
菌的生物防治也有一定的意义。根据形态特征和
分子系统分析相结合将 Ab.1菌株鉴定为二年残孔
菌 A. biennis是比较科学的。
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[本文编校:吴 毅 ]
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