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一个蛇苔氧甲基转移酶基因的克隆与功能鉴定



全 文 : 第54卷 第12期
 Vol.54  No.12     
山 东 大 学 学 报 (医 学 版)
JOURNALOFSHANDONGUNIVERSITY(HEALTHSCIENCES)
     2016年12月 
Dec.2016 
收稿日期:20160909;网络出版时间:
网络出版地址:
基金项目:国家自然科学基金(31370330)
通讯作者:程爱霞。Email:aixiacheng@sdu.edu.cn
 文章编号:1671-7554(2016)12-0020-07   DOI:10.6040/j.issn.16717554.0.2016.1137
一个蛇苔氧甲基转移酶基因的
克隆与功能鉴定
李丹丹,刘慧,程爱霞
(山东大学药学院 天然产物化学生物学教育部重点实验室,山东 济南 250012)
摘要:目的 克隆蛇苔氧甲基转移酶(CcOMT1)基因并对其进行功能鉴定。方法 通过 RTPCR技术获得
CcOMT1基因的cDNA全长。构建原核表达质粒 pET32aCcOMT1,在大肠杆菌 BL21(DE3)中表达后,利用
NiNTA吸附柱对表达的重组蛋白进行纯化,并通过体外酶活分析其活性。采用 DNAMAN7.0和 MEGA5.1软
件分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析。结果 克隆得到的CcOMT1开放读码框为837bp,编码278个氨
基酸,预测分子量为30.95kDa,等电点为5.59。与来自钝鳞紫背苔、紫花苜蓿和冰叶日中花的氧甲基转移酶的同
源性分别为73.18%、53.60%和44.60%。对纯化的重组蛋白进行酶活检测,结果表明融合蛋白可以催化具有邻
二酚羟基的黄酮和苯丙类化合物,产生相应的氧甲基化产物,其最适底物为槲皮素。结论 克隆并鉴定了一个
CcOMT1基因,为通过酶法实现化合物的氧甲基化修饰提供了一个候选基因。
关键词:蛇苔;氧甲基转移酶;黄酮;基因克隆;酶活分析
中图分类号:Q789   文献标志码:A
CloningandfunctionalcharacterizationofanOmethyltransferase
genefromConocephalumconicum
LIDandan,LIUHui,CHENGAixia
(KeyLaboratoryofChemicalBiologyofNaturalProducts,MinistryofEducation;Schoolof
PharmaceuticalSciences,ShandongUniversity,Jinan250012,Shandong,China)
Abstract:Objective ToisolateandcharacterizeanOmethyltransferase(OMT)genefromConocephalumconicum.
Methods ThefullengthcDNAsequenceofCcOMT1wasobtainedbyRTPCRandinsertedintotheprokaryotic
expressionplasmidpET32a,andthenwastransformedintoEscherichiacoliBL21(DE3)forexpression.Therecombi
nantproteinwascolectedbyNiNTAafinitycolumnandpurifiedforenzymecharacterization.Theanalysesofmultiple
alignmentandphylogenetictreewereperformedusingDNAMAN7.0andMEGA5.1softwares.Results Sequence
analysisshowedthatthefullengthcDNAofCcOMT1was837bpandencodeda278aaproteinwithacalculatedmo
lecularweightof30.95kDaandanisoelectricpointof5.59.TheaminoacidsequenceofCcOMT1showed73.18%,
53.60%,and44.60% identitywithOmethyltransferase(OMT)fromPlagiochasmaappendiculatum,Medicagosativa
andMesembryanthemumcrystalinum,respectively.Thepurifiedrecombinantproteinwasabletomethylateavarietyof
flavonoidsandphenylpropanoidswitharomaticvicinaldihydroxylgroups,andthepreferedsubstratewasquercetin.
Conclusion AnOMTgenefromConocephalumconicumisclonedandcharacterized.Thepresentinvestigationwould
provideacandidategeneforsynthesisofmethylatedcompoundsatspecificpositionthroughenzymaticmethod.
Keywords:Conocephalumconicum;Omethyltransferase;Flavonoids;Genecloning;Enzymeactivityassay
2016-11-14 15:10:25
http://www.cnki.net/kcms/detail/37.1390.R.20161219.1443.118.html
李丹丹,等.一个蛇苔氧甲基转移酶基因的克隆与功能鉴定 21   
  苔藓植物资源丰富,分布广泛,是最早的陆生植
物[1]。为适应陆地环境,苔藓植物体内产生了极为
丰富的次级代谢产物,包括联苄类[2]、木脂素[3]、香
豆素[4]、黄酮类[5]化合物等。这些次级代谢产物具
有各种各样的生物活性[6],其后修饰需要氧甲基转
移酶(Omethyltransferase,OMT)的参与,它可以将
甲基供体 S腺苷 -甲硫氨酸(SadenosyLmethio
nine,SAM)的甲基转移到化合物的氧原子上,生成
氧甲基化产物和 S腺苷L高半胱氨酸(Sadenosyl
Lhomocysteine,SAH),该反应对植物自身的生长
发育以及植物适应环境有重要影响[78]。植物的
OMT分为两类,一类是 Mg2+依赖的Ⅰ型 OMT,包
括真正的咖啡酰辅酶 A氧甲基转移酶(cafeoyl
CoAOmethyltransferase,CCoAOMT)和CCoAOMT
like;另一类是不需要 Mg2+的Ⅱ型 OMT,通常命名
为咖啡酸氧甲基转移酶(cafeicacidOmethyltrans
ferases,COMT)。CCoAOMT属于Ⅰ型 OMT,可以
催化咖啡酰辅酶A(cafeoylCoA,CCoA)生成阿魏
酰辅酶A,是木质素生物合成途径中一类重要的甲
基转移酶[911]。紫花苜蓿的氧甲基转移酶(Medica
gosativacafeoylCoA Omethyltransferase,MsC
CoAOMT)属于真正的CCoAOMT,其催化机制和晶
体结构已被阐明[12]。研究表明,经典的CCoAOMT也
可以催化某些黄酮类化合物[1314]。作为 CCoAOMT
的亚类,CCoAOMTlike存在于一些植物中,例如拟
南芥(ArabidopsisthalianaCCoAOMTlike)[15]、水
稻[16]、香草兰[17]、白杨[18]、冰叶日中花等,可以催
化各种黄酮、花青素和苯丙素类化合物。来源于冰
叶日中花的氧甲基转移酶(Mesembryanthemum
crystalinumOmethyltransferase,McPFOMT)是首
次发现的可同时催化 CCoA和黄酮类化合物的
OMT[9];CCoAOMTlike虽然均具有广泛的底物选
择性,但最适底物一般都不同。本研究首次克隆了
蛇苔氧甲基转移酶(ConocephalumconicumOmeth
yltransferase,CcOMT1)基因,并鉴定了体外重组蛋
白的催化活性,为一些化合物的氧甲基化提供了工
具酶,同时也为研究其在蛇苔次生代谢中的生物学
功能提供了依据。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料、菌种和质粒 蛇苔生长于12h
光周期、25℃的温室中,通过胞芽和有性杂交的方
式繁殖。大肠杆菌 DH5α和 BL21(DE3)购自北京
全式金生物技术有限公司;原核表达载体 pET32a
(+)(Ampr,T7lac启动子)购自德国 Novagen公
司;pMD19T载体购自宝生物工程(大连)有限
公司。
1.1.2 主要试剂及仪器 槲皮素、木犀草素、圣草
酚、黄芩素、野黄芩素和秦皮乙素购自成都曼斯特生
物科技有限公司;rTaqDNA聚合酶、KODPlus
DNA聚合酶购自东洋纺(上海)生物科技有限公
司;BamHⅠ和 XhoⅠ限制性内切酶、T4DNA连接
酶、PrimeScriptRTMasterMix反转录试剂盒均购自
宝生物工程(大连)有限公司;DNA凝胶回收试剂
盒、质粒提取试剂盒购自天根生化科技(北京)有限
公司;其他试剂均为国产分析纯。阳性克隆由上海
铂尚科技有限公司进行序列测定。
SWCJIC型双人单面净化工作台(苏州净化
设备有限公司)、AlegraX12R型离心机(美国
BeckmanCoulter公司)、EC25090DNA电泳仪(美
国ThermoElection公司)、PCR仪(美国 BIORAD
公司)、1260高效液相色谱仪(美国 Agilent科技有
限公司)。
1.2 方法
1.2.1 RNA提取与cDNA第一链的合成 取生长
两个月的蛇苔叶状体数片,洗净、吸干表面水分、液
氮速冻,采用 CTAB法[19]提取 RNA。利用 Prime
ScriptRTMasterMix逆转录体系反转录合成cDNA
第一链。取1μg总 RNA作为模板进行 RTPCR,
10μL体系中含总 RNA1μg,5×PrimeScriptRT
MasterMix2μL,DEPC水补齐至10μL。PCR程序
为:37℃ 15min;85℃ 15s,4℃保温。逆转录产物
保存于-20℃,使用前稀释10倍。
1.2.2 蛇苔CCoAOMT基因 cDNA全长序列克隆
 根据转录组测序数据(SRP076966),设计引物
CcOMT1F:5′CTMSGCATAGCVGAYATCAT3′和
CcOMT1R:5′CTTCATRAARAYWGMATCAG3′。
用KODPlusDNA聚合酶扩增,产物电泳后用凝胶
成像分析系统进行拍照及分析。扩增产物按照说明
书进行回收。
1.2.3 克隆载体 PMD19TCcOMT1的构建 回
收目的片段通过 TA克隆连接到 pMD19T载体,
连接产物转化大肠杆菌 DH5α感受态细胞,筛选阳
性单克隆。
1.2.4 生物信息学分析 通过查询文献[9,2021]
以及比对 NCBI数据库,获得不同植物的 OMT序
列。将测序得到的cDNA序列通过NCBI数据库进
行同源性比对(htp://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
 22  山 东 大 学 学 报 (医 学 版) 54卷12期 
Blast.cgi),用DNAMAN7.0和 MEGA5.1软件分
别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析。
1.2.5 蛋白表达载体 pET32aCcOMT1的构建 
以pMD19TCcOMT1质粒为模板,分别以CcOMT1
BamHⅠF:5′CGGGATCCATGGCGACCACCAC
TGAAGC3′和 CcOMT1XhoⅠR:5′CCCTCGA
GTCATACCAGTCTTCGGCAGA3′为引物,用 KOD
PlusDNA聚合酶进行 PCR扩增电泳检测后,将回
收目的片段连接到 pET32a载体,以 BamHⅠ和 XhoⅠ
分别双酶切pET32a质粒和含酶切位点的目的DNA
片段,胶回收后用T4DNA连接酶连接,转化大肠杆
菌DH5α感受态细胞。经过含 Amp100mg/L抗生
素的LB平板筛选。挑取阳性单菌落扩大培养,阳性
质粒命名为 pET32aCcOMT1。选取测序正确的单
克隆存菌并提取质粒。
1.2.6 目的蛋白在重组菌株中的诱导表达 构建
含有目的片段的载体和 pET32a空载体,用热击法
将其转入表达型大肠杆菌 BL21(DE3)感受态细胞
中。挑取阳性单克隆接种于4mL含 Amp抗性的
LB培养基中,37℃、200r/min振荡培养过夜。将
重组菌株扩大培养至 OD600=0.4~0.6时,加入
IPTG至终浓度为0.5mmol/L,16℃、110r/min培
养13h,诱导蛋白表达。诱导完成后,离心收集细
菌,超声破碎,用NiNTA亲和层析柱对融合蛋白进
行纯化,得到目的蛋白。分别取6~8μL超声破碎
后的上清和纯化蛋白点样进行 SDSPAGE蛋白电
泳,结束后染色2h,脱色40min(过程中换两次脱
色液)。
1.2.7 CcOMT1的体外酶活功能检测 对照组加
入表达的空载体 pET32a蛋白,底物包括:槲皮素、
木犀草素、圣草酚、黄芩素、野黄芩素、秦皮乙素和
CCoA。反应体系为:TrisHCl(pH7.5)200mmol/L,
SAM0.5mmol/L,MgCl22.0mmol/L,DTT4.0mmol/L,底
物0.2mmol/L,蛋白4.0μg,ddH2O补齐至100μL,
37℃反应30min,加入100μLCH3CN终止反应。
当底物为CCoA时,加入5mol/LNaOH(12μL)终
止反应,40℃反应20min;用6mol/LHCl(28μL)
中和后,等体积的乙酸乙酯萃取咖啡酸和阿魏酸,乙
酸乙酯挥发后,加50μL甲醇复溶。在上述反应体
系的基础上,不加入 MgCl2,加入 2.0mmol/L的
EDTA二钠进行Mg2+依赖性实验。
酶活反应产物通过 HPLC进行鉴定,所用
HPLC分析柱为ZORBAXSBC18,5μm,4.6mm×
150mm(Agilent)色谱柱;流速 1.0mL/min;进样
20μL;检测波长为254、280、320、346nm;流动相:A
相为0.1%乙酸-水,B相为100%甲醇。当底物为
CCoA和秦皮乙素时的分析条件:0~20min:20%~
50% B;20~25min:100% B;25~30min:20% B。
当底物为木犀草素、槲皮素、圣草酚时的分析条件:
0~20min:35%~65% B;20~25min:100% B;
25~30min:35% B。当底物为黄芩素和野黄芩
素时的分析条件:0~20min:45% ~75% B;20~
25min:100% B;25~30min:45% B[20]。
2 结 果
2.1 CcOMT1基因的生物信息学分析 见图1~
2、表1。进化树由两个大的分支组成,分别为Ⅰ型
的OMT和Ⅱ型的COMT,其中Ⅰ型的OMT又包括
CCoAOMT和CCoAOMTlike两个小分支。进化树
结果显示,CcOMT1和PaOMT1位于 CCoAOMT和
CCoAOMlike分支的根部,属于Ⅰ型OMTs。
图1 CcOMT1及其他植物OMTs的进化关系分析图
Fig.1 PhylogenyofCcOMT1andotherplantOMTs
李丹丹,等.一个蛇苔氧甲基转移酶基因的克隆与功能鉴定 23   
图2 CcOMT1与PaOMT1、MsCCoAOMT及McPFOMT的序列比对结果
红色三角标注的为MsCCoAOMT的基因底物结合位点,绿色三角标注的为金属离子和 SAM结合位点,蓝色
方框环绕的为插入环部分。
Fig.2 SequencealignmentofCcOMT1withthesequencesofPaOMT1,MsCCoAOMT,andMcPFOMT
ThesubstratebindingresiduesofMsCCoAOMTweremarkedbytheredtriangles,thegreentrianglesbelowthe
sequencesindicatedthemetalionandSAMbindingresidues,andtheinsertionloopwasshownboxedinblue.
表1 物种中英文对应关系
物种来源中文名称 基因英文(拉丁文)名称 基因简称 序列号
拟南芥 ArabidopsisthalianaCCoAOMTlike AtCCoAOMTlike ABH04519.1
葡萄 VitisviniferaFAOMT VvFAOMT ADJ57332.1
冰叶日中花 MesembryanthemumcrystalinumPFOMT McPFOMT AY145521.1
紫花苜蓿 MedicagosativaCCoAOMT MsCCoAOMT AAC28973.1
玉米 ZeamaysCCoAOMT ZmCCoAOMT AJ242980
火炬松 PinustaedaCCoAOMT PtCCoAOMT AAD02050
钝鳞紫背苔 PlagiochasmaappendiculatumOMT1 PaOMT1 KP729179.1
紫花苜蓿 MedicagosativaIOMT MsIOMT AAC49928.1
火炬松 PinustaedaCOMT PtCOMT U39301.1
蛇苔 ConocephalumconicumOMT1 CcOMT1 KY012319
  CcOMT1与PaOMT1、MsCCoAOMT和McPFO
MT的同源性分别为73.18%、53.60%和44.60%;
与MsCCoAOMT的序列对比结果表明,CcOMT1中
与底物、金属离子、SAM结合相关的18个氨基酸残
基高度保守,只有92位和235位的氨基酸与 MsC
CoAOMT不同。
2.2 CcOMT1基因的克隆与重组质粒 pET32a
CcOMT1的构建 见图3。目的基因条带位于750~
1000bp之间(泳道1),大于5000bp的条带为空载
体(泳道2)。
2.3 大肠杆菌中CcOMT1编码蛋白的诱导表达与
纯化 见图4。蛋白电泳结果表明,表达的融合蛋
白在泳道1和泳道3有明显条带,以可溶性形式存
在;纯化之后得到的融合蛋白,其分子量约为51kDa
(包含20.4kDa的His标签)。
图3 CcOMT1基因全长克隆以及重组质粒 pET32a
CcOMT1酶切验证结果
M:DNAmarker(DL5000);1:CcOMT1基因全长PCR
结果;2:重组质粒pET32aCcOMT1双酶切验证。
Fig.3 CloningoffullengthcDNAofCcOMT1geneanddoub
ledigestswithrestrictionenzymesofpET32aCcOMT1
M:DNAmarker(DL5000);1:PCRamplificationof
thefullengthcDNA CcOMT1;2:Doubledigests
withrestrictionenzymesofpET32aCcOMT1.
 24  山 东 大 学 学 报 (医 学 版) 54卷12期 
图4 pET32aCcOMT1重组蛋白和空载体 pET32a重组蛋
白的SDSPAGE电泳结果
M:已知蛋白分子量标准;泳道 1:重组表达的
pET32aCcOMT1上 清 液 蛋 白;泳 道 2:纯 化 的
CcOMT1蛋白;泳道3:空载体 pET32a上清液蛋白;
泳道4:纯化的空载体pET32a表达的蛋白。
Fig.4 SDSPAGEofrecombinantpET32aCcOMT1and
emptypET32aprotein
M:molecularmassstandards;lane1:supernatant
fractionofpET32aCcOMT1;lane2:proteinspuri
fiedfrom pET32aCcOMT1;lane3:supernatant
fractionofpET32a;lane4:proteinspurifiedfrom
pET32a.
2.4 CcOMT1酶活性的分析结果 酶活结果显示
CcOMT1对槲皮素、木犀草素、圣草酚、黄芩素、野黄
芩素、秦皮乙素和 CCoA均具有催化活性(表 2)。
HPLC分析产物与标准品的保留时间以及紫外图谱
结果显示,CcOMT1可以催化槲皮素(图5)和木犀
草素,分别生成异鼠李素和金圣草素。CcOMT1也
可以催化圣草酚生成相应的高圣草素和橙皮素,催
化黄芩素和野黄芩素分别生成千层纸素 A和高车
前素。CcOMT1能够将 CCoA转化为阿魏酰辅酶
A,产物被水解后以阿魏酸的形式被检测(图 6)。
Mg2+依赖性的实验结果表明,当没有Mg2+存在时,
CcOMT1对于底物无催化活性(图7)。
表2 CcOMT1重组蛋白酶活结果
底物 产物生成速率[nmol/(mg·min)±STDEV]
槲皮素 112.36±3.10
木犀草素 40.55±5.80
圣草酚 35.44±6.03
黄芩素 40.55±5.80
野黄芩素 71.14±5.98
秦皮乙素 13.77±1.75
CCoA 16.47±1.08
图5 CcOMT1以槲皮素为底物的酶活产物液相分析结果
A:CcOMT1催化产物;B:空载体表达蛋白催化;C:异鼠李素;D:槲皮素;E:CcOMT1酶活产物紫外图谱;F:空载体
对照紫外图谱;G:异鼠李素标准品紫外图谱;H:槲皮素标准品紫外图谱。
Fig.5 HPLCanalysisofcatalyticproductsofrecombinantCcOMT1usingquercetinassubstrate
A:catalyticproductofCcOMT1;B:catalyticproductofemptyvectorcontrol;C:isorhamnetin;D:quercetin;E:UV
spectraofcatalyticproductofCcOMT1;F:UVspectraoftheemptyvectorcontrol;G:UVspectraofisorhamnetinstand
ard;H:UVspectraofquercetinstandard.
3 讨 论
OMTs是在植物次生代谢产物合成过程中普遍
存在的酶,能够调控木质素的合成[21],并且对于天
然产物生物合成中苯丙素类、香豆素类和黄酮类化
合物的后修饰具有重要意义。植物的 OMTs可以
分为两类,Ⅰ型 OMT分子量较小,约23~29kDa,
反应需要辅助因子 Mg2+的参与,以 CCoAOMT为
代表;Ⅱ型OMT分子量在38~42kDa之间,可以催
化咖啡酸、香豆素以及各种黄酮和生物碱类化合
物[22]。CCoAOMTlike是Ⅰ型 OMT的一个分支,
李丹丹,等.一个蛇苔氧甲基转移酶基因的克隆与功能鉴定 25   
可以催化各种黄酮、花青素、香豆素和苯丙素类化合
物的甲基化[23]。目前 CCoAOMT的研究主要集中
于含有维管组织的高等植物,而其在苔藓植物中却
较少被鉴定。
图6 CcOMT1催化CCoA的酶活产物液相检测结果
A:CcOMT1催化产物;B:空载体表达蛋白催化;C:阿魏酸标准品;D:CcOMT1酶活产物紫外吸收光谱;E:阿魏酸标
准品紫外吸收光谱。
Fig.6 HPLCanalysisofcatalyticproductsofrecombinantCcOMT1usingcafeoylCoAassubstrate
A:catalyticproductofCcOMT1;B:catalyticproductofemptyvectorcontrol;C:ferulicacid;D:UVspectraofcatalytic
productofCcOMT1;E:UVspectraofferulicacidstandard.
图7 无Mg2+存在时,CcOMT1以槲皮素为底物进行酶活
反应的液相分析结果
A:CcOMT1表达蛋白催化;B:空载体对照表达蛋白
催化。
Fig.7 HPLCanalysisofcatalyticproductsofrecombinant
CcOMT1usingquercetinassubstratewithoutMg2+
A:catalyticproductofCcOMT1;B:catalyticprod
uctofemptyvectorcontrol.
  本研究从蛇苔中克隆了一个 OMT基因:
CcOMT1,其预测分子量(30.95kDa)与两类 OMTs
均不同。进化树分析可以看出,CcOMT1与PaOMT1
聚成一簇,它们既不属于真正的CCoAOMT,也不属
于CCoAOMTlike,而是同时位于Ⅰ型 OMTs的根
部,因此推测其可能是 I型 OMTs的起源。氨基酸
序列比对结果表明,相对于 McPFOMT,CcOMT1更
接近于MsCCoAOMT,CcOMT1与 PaOMT1的相似
性最高。CcOMT1、PaOMT1与来自其他植物的
CCoAOMT相比,都具有较长的 N端。据文献报
道,截掉 PaOMT1的 N端前50个氨基酸后表达的
PaOMT1蛋白对于底物亲和性无影响,但可以提高
蛋白转化率。亚细胞定位结果表明,截掉 N端序列
不影响蛋白表达位置,序列上不存在信号肽[20]。而
如果截掉CcOMT1N端的一部分后,是否也会出现
上述结果还需要深入研究。酶活结果显示,
CcOMT1可以催化一系列含有邻苯二酚结构的黄酮
类、苯丙类及香豆素类化合物。其催化特点为苯丙
素类化合物CCoA生成间位甲基化产物,这是Ⅰ型
OMT最常见的产物;香豆素(秦皮乙素)在间位或
者对位甲基化;B环上有邻二羟基的黄酮(木犀草
素、槲皮素)在3′位甲基化;二氢黄酮(圣草酚)除了
在3′位甲基化,还能生成少见的4′位甲基化产物,
其原因可能是因为碳环上存在手性碳;而当 A环上
含有3个相邻羟基(黄芩素、野黄芩素)时,可特异
性生成6位甲基化产物。本研究的酶活检测发现,
CcOMT1能够催化CCoA生成阿魏酰辅酶 A,表明
其在植物体内可能参与了木质素的生物合成。此外,
CcOMT1对黄酮和香豆素也具有广谱的催化特性。
尽管OMT在高等植物中被广泛鉴定,但是对
于低等陆生植物的苯丙素类、香豆素类和黄酮类
OMT研究较少。苔藓植物在植物进化中具有特殊
的地位,处于藻类和维管束植物之间,被称为“非维
管植物”,其细胞壁中含有类木质素化合物[24]。鉴
定参与木质素生物合成相关的OMT,有助于理解木
质素类化合物的起源。本研究为第一次从蛇苔中鉴
定出OMT,它可催化一系列的黄酮和苯丙素类化合
物,生成相应的甲氧基化产物,最适底物为槲皮素,
CcOMT1催化槲皮素产生异鼠李素,这为异鼠李素
 26  山 东 大 学 学 报 (医 学 版) 54卷12期 
的生物合成提供了工具酶,也为研究原始陆生植物
中的OMT奠定了基础。
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(编辑:相峰)