免费文献传递   相关文献

蓝猪耳胚珠磷脂酶C基因TfPLC1启动子的克隆、序列分析及植物表达载体的构建



全 文 :农业生物技术学报 JournalofAgriculturalBiotechnology 2007,15 (2):263~267
*基金项目:国家自然科学基金项目(No.30270141)资助。
**通讯作者。Authorforcorespondence.教授,主要从事植物发育生物学研究。E-mail:.
收稿日期:2006-05-31 接受日期:2006-06-09
·研究论文·
蓝猪耳胚珠磷脂酶C基因TfPLC1启动子的克隆、
序列分析及植物表达载体的构建*
罗滟苏,宋梅芳,韩玉珍**
(中国农业大学生物学院植物生理学与生物化学国家重点实验室,北京100094)
摘要:应用衔接头PCR技术,以蓝猪耳(Toreniafournieri)全基因组DNA分别经DraⅠ、EcoRⅤ、PvuⅡ和SmaⅠ消化后与
衔接头连接产物为模板,用衔接头引物和TfPLC1基因的特异引物经过多轮的巢式PCR,先后克隆到2个798和813bp的Tf-
PLC1基因上游序列;经测序、blast比较分析和拼接得到一个蓝猪耳TfPLC1基因的启动子序列,共1432bp。序列分析表明它
含有类似于TATAbox和CAATbox的元件,在其远端上游区域还有多个AT富含区,而且还含有多个胚乳特异表达启动子的
元件。将该启动子全序列和5端缺失的700bp序列与PBI121分别构建了植物表达载体PPP1326和PPP700,用于转化蓝猪
耳,以验证该启动子的功能。
关键词:蓝猪耳;衔接头PCR;磷脂酶C;启动子
中图分类号:S188 文献标识码:A 文章编号:1006-1304(2007)02-0263-05
Clone,SequenceAnalysisandPlantExpressionVectorConstructionof
OvulePhospholipaseCGeneTfPLC1PromoterfromToreniafournieri
LUOYan-su,SONGMei-fang,HANYu-zhen*
(StateKeyLaboratoryofPlantPhysiologyandBiochemistry,ColegeofBiologicalSciences,
ChinaAgriculturalUniversity,Beijing100094,China)
Abstract:ToreniafournierigenomicDNAwasdigestedbyDraⅠ,EcoRⅤ,PvuⅡandSmaⅠrespectively.Aspecialadaptorwas
ligatedtotheendsofthedigestedDNAfragmentsasatemplateforadaptorPCR.WiththeadaptorandTfPLC1gene-specificprimers,
bandsof798and813bpupstreamofTfPLC1wereobtainedsuccessively.Aftersequenced,blastandcombined,aTfPLC1promoter
of1432bpwasgained.TATAboxandCAATbox-likeelementswerefoundinthesequence,andATdomainswererichinthefar
upstreamofthepromoter.Andalsosomeendosperm-specificelementswerefoundinthesequence.PBI121andthepromoterwere
doubledigestedtoconstructplantexpressionvectorsPPP1326andPPP700by5deletion.Thenthevectorsweretransformedto
Toreniafournieritovalidatethefunctionofthepromoter.
Keywords:Toreniafournieri;adaptorPCR;phospholipaseC;promoter
肌醇磷脂信号途径广泛参与生物体内多种细胞
信号转导过程(Mueler-RoeberandPical,2002)。在动
物中的研究表明该信号途径在受精和早期胚胎发育
过程中起重要作用 (Miyazakietal.,1993;Carolet
al.,1997;LeeandShen,1998;Schlessinger,1997)。而
在植物中,肌醇磷脂信号途径的研究目前大多都集
中在植物对逆境信号反应方面 (Mueler-Roeberand
Pical,2002),对PLC/IP3信号是否参与被子植物受
精过程还知之甚少。Musgraveetal.(1993)曾报道绿
藻配子在融合过程中胞内 IP3水平升高,Hanetal.
(2002)通过显微注射实验表明三磷酸肌醇信号能诱
导蓝猪耳胚囊中央细胞胞质钙浓度提高。这些工作
初步表明肌醇磷脂信号途径在植物受精和发育过程
中也可能起重要作用。本实验室以蓝猪耳胚珠为材
料,克隆到了2个磷脂酶C基因 (分别命名为Tf-
PLC1和TfPLC2),初步分析表明TfPLC1在胚珠中
表达量比较高。由于启动子是基因表达调控的重要
顺式元件,因此为全面分析TfPLC1基因的表达及
农 业 生 物 技 术 学 报 2007年
调控,以深入了解TfPLC1基因在胚珠发育和受精
中的作用,应用衔接头PCR方法,从蓝猪耳基因组
DNA中成功地克隆到一个 TfPLC1基因上游的 1
432bp启动子片段。目前胚珠特异表达启动子的研
究还不多,有研究报道了水稻和小麦胚珠特异启动
子,并分析了其功能区段,验证了特异元件的作用
(Yoshiharaetal.,1996;Wuetal.,2000;苗红梅等,
2004)。在双子叶植物,还未见胚珠特异启动子功能
元件分析的报道。本研究对克隆到的启动子序列进
行分析,表明该启动子具有启动子的特征序列及胚
珠特异表达启动子的特征元件。
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料 25℃,16h光照/8h黑暗的条件
下温室培养约60d的蓝猪耳(Toreniafournieri)。
1.1.2 主要试剂 大肠杆菌(Escherichiacoli)DH5α
和根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)LBA4404
均由本实验室保存;PBI121植物表达载体由中国农
业大学植物分子遗传实验室董江丽老师惠赠;LA
TaqDNA聚合酶、PCR产物克隆载体 pMD18-T
vector、限制性内切酶和T4连接酶均购于宝生生物
工程(大连)有限公司;DNA凝胶回收试剂盒和高保
真TaqDNA聚合酶均购于天根生化(北京)科技有
限公司;DNAMarker购于晶美生物工程公司和天
根生化(北京)科技有限公司;衔接头和PCR引物由
上海生工生物工程技术服务有限公司合成;测序工
作由北京三博远志生物技术有限公司完成。
1.1.3 衔接头和引物 衔接头序列:
衔接头长链:5-CTAATACGACTCACTATAGGGCTCGAGCGGCC
GCCCGGGCAGGT-3;
衔接头短链:5-ACCTGCCC-3。
衔接头引物:
衔接头引物1(AP1):5-GGATCCTAATACGACTCACTATAGGGC-3;
衔接头引物2(AP2):5-AATAGGGCTCGAGCGGC-3。
基因特异引物:
基因特异引物 1(GSP1):5-GCTTGGCGATGTGGTGCCGCTTCT
GC-3;
基因特异引物2(GSP2):5-CCTCCTTCACATCTTGGGTAGGC-3。
基因特异引物1(GSP1):5-CCACAGATTGCTCGTTGCGT3;
基因特异引物2’(GSP2’):5-CCGATAACAAGCGAACCAAG-3。
载体构建用带酶切位点引物:
正义引物1(SP1):5-GCAAGCTTAACAAGATTGGGCCATTCT-3;
HindⅢ
正义引物2(SP2):5-GCAAGCTTTTGAACAACGCTTCGAAC-3;
HindⅢ
反义引物(AP):5-GAGGATCCGCTCCCCATTTTCTCTCAA-3。
BamHⅠ
1.2 方法
1.2.1 蓝猪耳基因组DNA的提取 将蓝猪耳种子
种于温室里,生长 2个月以后,取 50~100mg幼嫩
的蓝猪耳叶片,液氮速冻研磨成粉末后,用2mL离
心管分装,每管加入700μLCTAB提取缓冲液[2%
CTAB,2.8mol/LNaCl,50mmol/LTris-HCl(pH8.0),
10mmol/LEDTA(pH8.0),室温保存;β-巯基乙醇
133μL/200mL,颠倒混匀。65℃水浴40~60min。取
出离心管,冷却至室温后加入700μL氯仿∶异戊醇
(24∶1)混匀,4℃12500r/min离心15min,转移上
清,重复抽提1次,取上清至干净离心管,加入等体
积异丙醇,混匀,–20℃沉淀 30min。4℃ 12500
r/min离心 15min,弃上清,75%酒精洗涤 1次,沉
淀干燥后,溶于 50μLddH2O中。取 2~3μL进行
0.8%琼脂糖凝胶电泳检测DNA的完整性。
1.2.2 蓝猪耳基因组DNA的酶切和连接 取1~2
μg蓝猪耳基因组DNA,分别用平端酶DraⅠ、EcoR
Ⅴ、PvuⅡ和SmaⅠ进行单酶切、纯化并回溶于20
μL去离子水中。衔接头长链和短链均单独配成50
μmol/L的浓度,取等体积的长链和短链溶液,混匀,
以程序94℃2min,1.5℃/s降到25℃,25℃2min
制作双链衔接头备用。连接反应体系为:10×连接反
应缓冲液2.5μL,酶切的基因组DNA8μL,衔接头
(25μmol/L)4μL,50%PEG4μL,连接酶1μL,总
体积为25μL;16℃连接过夜。
1.2.3 PCR组分和反应条件 参照王新国等(2001)
的方法,PCR体系组分为:10×PCR缓冲液2.5μL,
DNA连接产物3μL,dNTP(2.5mmol/L)4μL,AP1
(10μmol/L)1μL,GSP1/1,(10μmol/L)1μL,LATaq
DNA聚合酶 0.25μL,ddH2O13.25μL,总体积为
25μL。反应条件为:94℃预变性6min;94℃1min,
67.5℃,8min,35个循环;72℃,15min。将上述
PCR产物稀释50倍,取2μL作模板进行第二轮
PCR。PCR体系组分为:10×PCR缓冲液2.5μL,稀
释 DNA2μL,dNTP(2.5mmol/L)4μL,AP2(10
μmol/L)1μL,GSP2/2,(10μmol/L)1μL,LATaq
DNA聚合酶0.25μL,ddH2O14.25μL,总体积为25
μL。反应条件为:94℃预变性 5min;94℃50s,
59/53℃45s,72℃5min,32个循环;72℃10min。
1.2.4 PCR产物的克隆和序列分析 PCR产物电
泳后切取目标条带,用琼脂糖凝胶回收试剂盒回收,
回收产物克隆到pMD18-Tvector中,转化至大肠杆
菌DH5α,筛选阳性克隆并测序。测序结果与已知序
列末端部分进行blast比较分析、拼接得到1432bp
的启动子序列,并对其进行序列分析。
1.2.5 植物表达载体的构建 根据扩增到的启动
子序列设计含酶切位点的正义引物(含HindⅢ酶切
位点)2条,反义引物(含BamHⅠ酶切位点)1条,用
264
第2期 罗滟苏等:蓝猪耳胚珠磷脂酶C基因TfPLC1启动子的克隆、序列分析及植物表达载体的构建
高保真 TaqDNA酶分别从蓝猪耳基因组 DNA扩
增启动子 710和 1336bp2个片段,克隆到
pMD18-TSimpleVector上,将其分别命名为PP710
和PP1336。PP710和PP1336经HindⅢ和BamHⅠ
双酶切后,分别与相同消化的植物表达载体PBI121
连接,转化大肠杆菌,菌液PCR检测筛选阳性克隆
并测序鉴定,分别获得重组质粒载体,命名为
PPP700和PPP1326,通过液氮冻融法转化至根癌农
杆菌LBA4404中。菌液PCR检测阳性转化子用于
植物转化。
2 结果
2.1蓝猪耳胚珠磷脂酶C基因TfPLC1启动子的
PCR扩增
以消化DNA和衔接头的连接产物为模板,衔
接头引物 AP1、AP2和基因特异引物 GSP1、GSP2
(分别在起始密码子ATG下游212和52bp处)经过
2轮巢式PCR后,扩增到1条798bp特异条带 (图
1),该条带是由DraⅠ酶切的连接产物作模板扩增
出来的。测序和blast分析显示该片段3端序列与
TfPLC1基因起始密码子附近序列完全一致,表明该
序列可能是TfPLC1基因的启动子部分。
根据已得到的798bp序列,在其远离起始密码
子的区域分别设计另2条基因特异反义引物GSP1
和GSP2,与衔接头引物AP1和AP2配对巢式扩增
得到以PvuⅡ酶切连接产物作模板的1条813bp片
段(图2)。测序和blast分析显示该片段3端与先前
得到的798bp片段5端序列完全一致 (52bp序列
完全相同)。拼接后,得到1条1432bp片段(图3),
推测其为蓝猪耳TfPLC1基因的启动子部分。
图1.798bpPCR
产物电泳谱带
Fig.1.Agarosegel
electrophoretogramforPCR
productof798bp
1,PCRproducts;2,PCRmarker.
2.2 启动子序列分析
对1432bp片段序列分析表明,在起始密码子
ATG上游-59和-83处各有一个类似于TATA-box
的元件,它 们 的 序 列 分 别 为 TATTATA和
TATAAATA;在-239处有 1个类似于 CAAT-box
的元件,在5上游序列中还发现多个AT富含区,这
些都是启动子的特征元件。另外还有一些胚乳特异
的固定序列或元件,如 AACA为种子特异元件,
GCN4为胚乳特异启动子特征序列,G盒为种子贮
藏蛋白基因保守序列,其中心序列能与bZIP转录因
子结合,胚乳盒能够被基本区域/螺旋-桶-螺旋蛋
白识别,醇溶蛋白盒为种子贮藏蛋白基因保守序列
(Yoshiharaetal.,1996;Wuetal.,2000;苗红梅等,
2004)(图3)。
图2.813bpPCR
产物电泳谱带
Fig.2.Agarosegel
electrophoretogramforPCR
productof813bp
1,PCRproducts;2,PCRmarker.
从序列分析结果可以看出,该序列具有启动子
特征,且存在多个胚乳特异启动子的元件,表明该启
动子可能与胚珠或种子发育相关。由于上述分析的
胚乳特异启动子特征元件均来自单子叶植物小麦和
水稻,而克隆到的启动子来自双子叶植物蓝猪耳的
胚珠,说明单子叶植物和双子叶植物的胚珠或种子
发育基因的表达调控具有保守性。
2.3 用高保真TaqDNA聚合酶从基因组DNA扩
增700和1326bp片段
根据 1438bp序列分别在 ATG的–1326bp
和–700bp位置设计带HindⅢ酶切位点正义引物
SP2和SP1,在ATG位置处设计带BamHⅠ酶切位
点反义引物AP,以蓝猪耳全基因组DNA为模板,
用高保真TaqDNA聚合酶分别扩增2段启动子序
列,普通TaqDNA聚合酶加A后直接用于TA克
隆,分别得到710和1336bp片段(图4,5)。将该产
物克隆到pMD18-Tsimplevector后筛选阳性克隆
并测序,将测序结果与衔接头PCR结果进行序列比
对,相似性为100%,表明该序列确实为TfPLC1基
因的上游序列。阳性克隆用于下一步的载体构建。
2.4 植物表达载体的构建
阳性克隆和 PBI121双酶切消化后连接转化
DH5α,Kan抗性筛选阳性克隆,菌液PCR检测重组
子;扩增出的目标条带经回收,克隆到测序载体后测
序;测序结果经与启动子序列比对后证明重组子即
为构建好的植物表达载体,并分别命名为PPP700
265
农 业 生 物 技 术 学 报 2007年
图3.TfPLC1启动子序列分析
Fig.3.AnalysisofTfPLC1promotersequence
TATA,TATA-box;CAAT,CAAT-box;AT,AT富含区,广泛存
在于植物启动子中,起增强子的作用;AACA,种子特异元件;
GCN4,序列为TGAGTCA,胚乳特异启动子特征序列;G盒,
序列为CACGTG,中心序列为ACGT,种子贮藏蛋白基因保守
序列,其中心序列能与 bZIP转录因子结合;胚乳盒,序列为
TGAAAAAG,能够被基本区域/螺旋-桶-螺旋蛋白识别;醇
溶蛋白盒,序列为TGAAAT,为种子贮藏蛋白基因保守序列。
TATA,TATA-box;CAAT,CAAT-box;AT,ATrichregion,ex-
istinplantpromoterdifusely,actasenhancer;AACA,seed-spe-
cificmotif;GCN4,thesequenceisTGAGTCA,endosperm-specif-
icpromotercharacterizedsequence;G-box,thesequenceis
CACGTG,centralsequenceisACGT,seedstorageproteingene
conservedsequence,anditscentralsequencecancombinewith
transcriptional factor;endosperm-box,the sequence is
TGAAAAAG,canberecongnizedbybasicregion/helix-pail-helix
protein;Prolamin-box,thesequenceisTGAAAT,seedstorage
proteingeneconservedsequence.
图4.高保真710bp
PCR产物电泳谱带
Fig.4.Agarosegel
electrophoretogram
forPCRproductof710bp
1,PCRmarker;2,PCRproduct.
图5.高保真1336bpPCR产
物电泳谱带
Fig.5.Agarosegel
electrophoretogramofPCR
productof1336bp
1,PCRproduct;2,PCRmarker.
图6.重组质粒PPP700的菌液PCR鉴定
Fig.6.DetectionoftherecombinantplasmidPPP700byPCR
1,PCRmarker;2,CK;3,CK-;4~8,PCR
图7.重组质粒PPP1326的菌液PCR鉴定
Fig.7.DetectionoftherecombinantplasmidPPP1326byPCR
1,PCRmarker;2,CK;3,CK-;4~9,PCR
266
第2期 罗滟苏等:蓝猪耳胚珠磷脂酶C基因TfPLC1启动子的克隆、序列分析及植物表达载体的构建
和PPP1326,菌液PCR结果分别如图6,7所示。
3 讨论
王新国等(2001)通过衔接头 PCR方法从胡萝
卜中分离到一个新的Ⅱ型转化酶基因的启动子,对
已知序列附近的未知序列的分离提供了一个有效简
便的方法,尤其是对未知启动子的克隆提供了实验
依据。本实验根据该方法克隆到了在蓝猪耳胚珠表
达的TfPLC1基因的启动子,唯一不同的是设计的
衔接头短链3端没有加氨基,但是也同样扩增到了
启动子片段,相比这个方法更经济。实验也进一步证
明了衔接头PCR是一种高效,准确,快速的分离已
知序列附近未知序列的好方法。
通过衔接头 PCR方法分离了蓝猪耳胚珠 Tf-
PLC1基因启动子1432bp序列。分析表明,该序列
具有启动子的特征元件,并且还含有多个胚乳启动
子特征元件。同时,克隆到的启动子片段还具有连续
的17个T碱基,这种现象在已报道的其它启动子
序列中非常少见,至于具有什么功能尚需进一步分
析。TfPLC1启动子的克隆及载体构建为研究 Tf-
PLC1基因的表达调控及功能提供基本资料。
参 考 文 献
MiaoHM(苗红梅),FlemingJE,LvDB(吕德彬)andHanJF
(韩锦峰).Characteristicanalysisandevaluationofen-
dosperm-specificsbeⅡapromoterinTriticumaestivumL(J).
ChineseScienceBuletin(科学通报),2004,49(5):451~456
(inChinese)
WangXG(王新国),XiaoCZ(肖成祖),ZhangGH(张国华)
andFangRX(方荣祥).Isolationofanovelcarotinvertase
Ⅱ promoterbyadaptor-PCR (J).ChineseJournalofBio-
chemistryandMolecularBiology(中国生物化学与分子生
物学报),2001,17(1):61~65(inChinesewithEnglishab-
stract)
CarolDJ,RamaraoCS,MehlmannL,RocheS,TerasakiM
andJafeLA.Calciumreleaseatfertilizationinstarfish
eggsismediatedbyphospholipaseC (J).JournalofCelBi-
ology,1997,138:1303~1311
HanYZ,HuangBQ,GuoFL,ZeeSYandGuHK.Sperm
extractandinositol1,4,5-triphosphateinducecytosoliccalci-
umriseinthecentralcelofToreniafournieri(J).Sexual
PlantReproduction,2002,15:187~193
LeeSJandShenSS.Thecalciumtransientinseaurchineggs
during fertilization requirestheproduction ofinositol
1,4,5-trisphosphate(J).DevelopmentalBiology,1998,193:
195~208
MiyazakiS,ShirakawaH,NakadaKandHondaY.Essential
roleoftheinositol1,4,5-trisphosphate/Ca2+releasechannelin
Ca2+wavesandCa2+oscilationsatfertilizationofmammalian
eggs(J).DevelopmentalBiology,1993,158:62~78
Mueler-Roeber B and Pical C.Inositol phospholipids
metabolisminArabidopsis,characterizedandputativeiso-
formsofinositolphospholipidskinaseandphosphoinosi-
tide-specificphospholipaseC (J).PlantPhysiology,2002,
130:22~46
MusgraveA,SchuringF,MunnikTandVisserK.Inositol
1,4,5-trisphosphateasfertilizationsignalinplants:Jestcase
Chlamydomonaseugametos (J).Planta,1993,191 (2):
280~284
SchlessingerJ.PhospholipaseCγactivationandphosphoinosi-
tidehydrolysisareessentialforembryonaldevelopment(J).
PNAS,1997,94:2798~2799
YoshiharaT,WashidaHandTakaiwaT.A-45bpproximalre-
gioncontainingAACAandGCN4motifissuficienttocon-
ferendosperm-specificexpressionofthericestorageprotein
glutelingene,GluA-3(J).FEBSLeters,1996,383:213~218
WuCY,WashidaH,OnoderaY,HaradaKandTakaiwaF.
QuantitativenatureoftheProlamin-box,ACGTandAACA
motifsinariceglutelingenepromoter:Minimalcis-element
requirementsforendosperm-specificgeneexpression(J).The
PlantJournal,2000,23(3):415~421
267