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高羊茅黔草1号SAMDC基因的克隆及植物表达载体的构建



全 文 :32 卷 08 期
Vol. 32,No. 08
草 业 科 学
PRATACULTURAL SCIENCE
1237 - 1242
08 /2015
DOI:10. 11829 \ j. issn. 1001-0629. 2014-0573
曾庆飞,杨春燕,李小冬,吴佳海,王小利. 高羊茅黔草 1 号 SAMDC 基因的克隆及植物表达载体的构建[J]. 草业科学,2015,
32(8) :1237-1242.
ZENG Qing-fei,YANG Chun-yan,LI Xiao-dong,WU Jia-hai,WANG Xiao-li. Cloning of SAMDC gene from Festuca arundinacea Qian-
cao No. 1 and construction of its plant expression vector[J]. Pratacultural Science,2015,32(8) :
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1237-1242.
植物
生产层
高羊茅黔草 1 号 SAMDC基因的
克隆及植物表达载体的构建
曾庆飞1,2,杨春燕1,2,李小冬1,2,吴佳海1,2,王小利1,2
(1.贵州省草业研究所,贵州 贵阳 550006;2.贵州阳光草业科技有限责任公司,贵州 贵阳 550006)
摘要:采用高保真平末端法从高羊茅“黔草 1 号”(Festuca arundinacea cv. Qiancao No. 1)叶片 cDNA中扩增 S-腺
苷甲硫氨酸脱羧酶基因(SAMDC)序列。基因测序分析表明,扩增片段含有 1 835 个核苷酸,包含有 9 bp的微型上
游阅读框、147 bp的小型上游阅读框和 1 185 bp的主阅读框。微型上游阅读框和小型上游阅读框存在一个碱基
重叠,主阅读框编码 395 个氨基酸。整个克隆片段与 GenBank上注册的高羊茅 FaSAMDC基因的核苷酸同源性为
95. 05%,编码氨基酸的同源性为 98. 22%。利用 KpnI和 PstI酶切位点将该片段插入到经贵州省草业研究所分子
生物学实验室改造过的 pCAMBIA1300 植物表达载体的多克隆位点内,经琼脂糖凝胶电泳检测、酶切鉴定和序列
测定,获得具有 SAMDC基因和潮霉素抗性基因的适合于单子叶植物遗传转化的表达载体 pCAM-SAMDC。通过冻
融法将构建的重组质粒导入根癌农杆菌 GV3101 和 EHA105 感受态细胞中,并通过 PCR 反应对所获得的工程菌
株进行鉴定,为进一步通过农杆菌介导法培养抗逆禾草新材料奠定了基础。
关键词:SAMDC;基因克隆;过表达载体;农杆菌导入
中图分类号:Q943. 2 文献标识码:A 文章编号:1001-0629(2015)08-1237-06*
Cloning of SAMDC gene from Festuca arundinacea Qiancao No. 1 and
construction of its plant expression vector
ZENG Qing-fei1,2,YANG Chun-yan1,2,LI Xiao-dong1,2,WU Jia-hai1,2,WANG Xiao-li1,2
(1. Guizhou Institute of Prataculture,Guiyang 550006,China;
2. Guizhou Sunshine Prataculture Technology Co.,Ltd.,Guiyang 550006,China)
Abstact:SAMDC gene was amplified from cDNA of Festuca arundinacea Qiancao No. 1 leaves and DNA sequen-
cing analysis indicated that the amplified fragment contained 1 835 nucleotides,which involved a tiny upstream
open reading frame(ORF)of 9 bp,a small upstream ORF of 147 bp and a main ORF of 1 185 bp encoding 395 a-
mino acids. There was one overlap base between the tiny upstream ORF and the small upstream ORF. The homolo-
gy between the cloned fragment and the FaSAMDC gene of Festuca arundinacea registered in GenBank was 95. 05%
and the homology of their encoded amino acid was 98. 22% . This cloned fragment was inserted into modified plant
expression vector pCAMBIA1300 with multiple cloning sites using the KpnI and PstI enzyme. The plant expression
vector pCAM-SAMDC with genes of SAMDC and hygromycin resistance was obtained by agarose gel detection,re-
* 收稿日期:2014-12-10 接受日期:2015-03-10
基金项目:贵州省农业科技攻关项目(黔科合 NY[2013]3060 号);贵州省农业科学院博士科研启动基金(2013-06) ;贵州省重大科技专
项基金[(2014)6017 号]
第一作者:曾庆飞(1969-) ,男(土家族) ,贵州德江人,副研究员,博士,主要从事牧草生物技术研究。E-mail:zengqingfei2008@ 163. com
通信作者:王小利(1977-) ,男,甘肃镇原人,副研究员,博士,主要从事牧草分子生物学研究。E-mail:wangxiaolizhenyuan@ 126. com
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striction enzyme digestion and sequencing which was suitable for monocotyledons genetic transformation. The re-
combinant plasmid was transmitted into Agrobacterium tumefaciens component cells GV3101 and EHA105 and the
positive clone was selected by PCR. These works laid a foundation for further stress tolerance Poaceae grass via
Agrobacterium-mediated method.
Key words:SAMDC;gene cloning;over-expression vector;transmission into Agrobacterium tumefaciens
Corresponding author:WANG Xiao-li E-mail:wangxiaolizhenyuan@ 126. com
S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因(SAMDC)是一个
在植物生长发育过程中起着重要作用的抗逆相关基
因[1-3]。SAMDC是植物多胺生物合成途径中的一个
关键酶,该酶以 S-腺苷甲硫氨酸(SAM)为底物催化
形成脱羧 S-腺苷甲硫氨酸(dcSAM),为精氨和亚精
氨的合成提供氨丙基,是亚精胺和精胺合成的限速
酶[4]。迄今为止,已从生菜(Lactuca sativa)、康乃馨
(Dianthus caryophyllus)、拟南芥(Arabidopsis thali-
ana)、大豆(Glycine max)、水稻(Oryza sativa)、芥菜
型油菜(Brassica juncea)、番茄(Lycopersicon esculen-
tum)等植物中克隆出 SAMDC编码基因[5]。
通过超量表达 SAMDC 基因来提高农作物的抗
盐、抗高温、抗旱性研究在国外已有不少成功的先
例。Bhavna和 Manchikatla[6]将人类 SAMDC 基因导
入烟草(Nicotiana tabacum),烟草内源腐胺和亚精胺
含量显著升高,植物耐盐性和渗透性提高。Cheng
等[7]将酵母 SAMDC 基因转入番茄,转基因植株亚
精胺和精胺含量升高,且植株对高温胁迫表现明显
抗性。Momtaz等[8]将酵母的 SAMDC 基因通过基因
枪法转化茎尖导入棉花(Gossypium hirsutum)Giza88
和 Giza90,发现转基因植株中精胺水平显著提高,耐
旱性增强。Zhao 等[9]通过融合 GUS 蛋白对 Md-
SAMDC2 启动子进行定位分析和逆境胁迫诱导表达
分析,GUS活性在盐和低温胁迫下上升表达,表明
SAMDC启动子控制着逆境条件下的基因表达。
在国内,李昌澎等[10]以小麦(Triticum aesti-
vum)品种“晋麦 47”为材料,利用半定量 RT-PCR
方法,对 SAMDC 基因在正常供水、PEG-6000 模拟
水分胁迫和复水过程中小麦叶片的表达模式进行
了分析。结果表明,小麦 SAMDC 基因的表达受水
分胁迫诱导。同时,SAMDC 基因还参与水分胁迫
后的复水调节,说明 S-腺苷甲硫氨酸代谢途径在
小麦抗旱节水中具有重要作用。陆俊杏等[11]对甘
蓝型油菜(Brassica napus)的 SAMDC3 基因及其启
动子进行了克隆分析,表明 SAMDC3 可能通过
ABA、6-BA和 SA信号途径介导植物对非生物胁迫
的响应。众多研究已证实 SAMDC 是参与抗旱响
应和受盐胁迫诱导的抗逆功能基因,植物 SAMDC
基因的研究与利用正逐渐受到重视[6]。本研究克
隆了贵州省草业研究所自主育成的高羊茅新品种
“黔草 1 号”(Festuca arundinacea cv. Qiancao No.
1)的 SAMDC 基因,并针对高羊茅和黑麦草(Lolium
perenne)组培再生系统对特定抗生素的敏感特性,
构建了适合于单子叶禾本科牧草特别是高羊茅和
黑麦草遗传转化的植物过量表达载体,以期通过
下一步的遗传转化培育出禾草抗逆种质新材料。
1 材料与方法
1. 1 材料
1. 1. 1 植物材料 高羊茅“黔草 1 号”由贵州省草
业研究所于 2005 年育成并保存。
1. 1. 2 菌株和质粒 大肠杆菌(Escherichia coli)
DH5α、JM109 购自 TAKARA 公司,农杆菌 GV3101、
EHA105 和改造过的 pCAMBIA1300 载体由贵州省
农业科学院草业研究所分子生物学实验室保存。
1. 1. 3 酶和化学试剂 植物总 RNA 提取试剂盒、
pGM-T平末端 DNA片段加 A 试剂盒购自天根生化
科技(北京)有限公司;cDNA合成试剂盒购自 Clon-
tech公司;限制性内切酶、T-DNA 连接酶购自 Ther-
mo Scientific公司;DNA 片段回收试剂盒、潮霉素、
卡那霉素、氨苄青霉素等购自生工生物工程(上海)
股份有限公司;其他试剂均为分析纯。
1. 2 试验方法
1. 2. 1 高羊茅总 RNA的提取及 cDNA的合成 高
羊茅“黔草 1 号”叶片总 RNA 的提取按照天根公司
的总 RNA 提取试剂盒操作步骤进行;以提取的
RNA为模板,按照 Clontech cDNA 扩增试剂盒的操
作说明合成 cDNA第一链。
1. 2. 2 目的基因的克隆与序列分析 根据 Gen-
Bank上所登录的高羊茅 SAMDC 基因序列,采用
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Primer Premier 5 软件设计一对引物 FaSF /R,用于扩
增高羊茅 SAMDC 基因的全长 CDS。并根据载体
pCAMBIA1300 的结构特点,在引物的 5端分别加上
KpnI 和 PstI 酶切位点,引物序列为,FaSFwd1:5-
CGGGGTACCAAAATCCGTAAACTCGTCG-3; FaS-
Rev1: 5-ACGCTGCAGCCTAGAGCCAACAATAGTT-
TAT-3。
扩增产物大小为 1 821 bp。以高羊茅“黔草 1
号”cDNA为模板,用 FaSF /R引物扩增高羊茅 SAM-
DC基因的全长 CDS。PCR 反应采用 Thermo Fisher
公司的 Thermo Scientific Phusion 高保真 DNA 聚合
酶进行扩增。通过平末端 DNA 片段加 A 试剂盒在
纯化的 PCR 产物 3末端加 A 后与 pGM-T 连接,得
到 pGM-T-FaSAMDC重组质粒,通过热激法将质粒
转入大肠杆菌 DH5α 中,挑选阳性克隆送大连宝生
物有限公司测序。
1. 2. 3 SAMDC基因表达载体的构建
1)酶切反应:在一灭菌的 EP 管中依次加入
10 × Tango Buffer 2 μL、改造后的 pCAMBIA1300 或
pGM-T-FaSAMDC 15 μL、KpnI 2 μL、PstI 1 μL,轻轻
混匀,瞬时离心,37 ℃水浴 3 h,60 ℃灭活 15 min终
止反应。琼脂糖凝胶电泳,DNA 片段回收试剂盒回
收目的片段。
2)连接反应:在一灭菌的 EP 管中依次加入经
双酶切后回收的 pCAMBIA1300 2 μL、经双酶切后
回收的 FasAMDC 8 μL、灭菌去离子水 7 μL、10 ×连
接 Buffer 2 μL,45 ℃水浴 5 min 后加入 T4-DNA 连
接酶 1 μL,混匀于 16 ℃条件下过夜。
3)转化及鉴定:取 10 μL 连接产物转化 JM109
感受态细胞,涂布于含氨苄青霉素的 LB 琼脂平板
上,挑选阳性单菌落于 LB液体培养基中,37 ℃培养
过夜,少量抽提质粒,用 PCR及双酶切进行鉴定。
1. 2. 4 根癌农杆菌重组质粒的导入 取 5 μL
pCAM-SAMDC过表达载体,分别加入 200 μL 根癌
农杆菌 GV3101 和 EHA105 感受态细胞中,混匀,冰
浴 15 min;转入液氮冷冻 l min,迅速置 37 ℃水浴锅
温浴 5 min;加入 400 μLYEB液体培养基,28 ℃ 250
r·min -1预表达 4 ~ 5 h;取适当体积均匀涂布于含
有抗生素的 YEB 平板,28 ℃培养 2 d,待长出单菌
落后挑取单克隆,扩大培养后提取质粒,并进行
PCR和酶切验证,将阳性克隆加 15%的甘油置于
- 70 ℃冰箱中保存。
2 结果
2. 1 目的片段的克隆与序列分析
2. 1. 1 FaSAMDC基因 cDNA片段的扩增与回收
以反转录合成的高羊茅“黔草 1 号”cDNA 为模板,
利用设计合成的引物 FaSFwd1 和 FaSRev1 进行
PCR扩增,得到预期约 1 821 bp的条带(图 1),采用
DNA胶回收试剂盒纯化回收 PCR产物。
图 1 高羊茅“黔草 1 号”的 SAMDC基因扩增
Fig. 1 Amplification of SAMDC geng from Qiancao No. 1
注:M,λDNA HindIII marker;泳道 1,扩增产物。
Note:M,λDNA HindIII marker;lane 1,amplified product.
2. 1. 2 基因的克隆与序列分析 通过平末端 DNA
片段加 A试剂盒在纯化的 PCR 产物 3末端加 A 后
与 pGM-T 连接,得到 pGM-T-FaSAMDC 重组质粒,
通过热激法将质粒转入大肠杆菌 DH5α 中,挑选阳
性克隆送大连宝生物有限公司测序。基因测序分析
表明,包括引物的扩增片段共 1 835 个核苷酸,包含
有 9 bp的微型上游阅读框、147 bp的小型上游阅读
框和 1 185 bp的主阅读框。微型上游阅读框和小型
上游阅读框存在一个碱基重叠。整个克隆片段与
GenBank 上公布的高羊茅 SAMDC 基因的核苷酸同
源性为 95. 05%。
2. 1. 3 克隆基因氨基酸序列的推导与分析 采用
DNAMAN软件推导得出,扩增的 SAMDC 基因主阅
读框编码 395 个氨基酸,与 GenBank登录的 FaSAM-
DC 基因编码的氨基酸数量相同,同源性为 98.
22%,说明克隆的“黔草 1 号”的 SAMDC 基因与注
册的高羊茅 FaSAMDC基因存在着微小的差异。
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2. 2 SAMDC基因植物表达载体的构建
根据克隆出的 FaSAMDC 基因核苷酸的序列特
征,选择经贵州省草业研究所分子生物学实验室改
造后的 pCAMBIA 1300 作为表达载体。用 KpnI 和
PstI双酶切 pGM-T-FaSAMDC重组质粒,回收 1. 8 kb
的 SAMDC基因片段,与经 KpnI 和 PstI 双酶切回收
的 pCAMBIA 1300 大片段连接,获得重组质粒
pCAM-SAMDC。
用重组质粒转化 JM109 感受态细胞,挑选阳
性克隆培养抽提质粒,以提取的重组质粒为模板,
采用与扩增 FaSAMDC 基因相同的引物和体系进
行 PCR鉴定,结果扩出了 1. 8 kp 的目的片段(图
2);用 KpnI 和 PstI 双酶切重组质粒 pCAM-SAM-
DC,得到 8. 9 和 1. 8 kb 的两条片段(图 3) ,说明
pCAM-SAMDC 为本文需要的过表达载体,接下来
重组质粒部分序列的测定结果进一步证明了表达
载体构建的正确性。构建出的过表达载体结构如
图 4 所示。
2. 3 重组质粒导入农杆菌株
通过冻融法将构建的重组质粒 pCAM-SAMDC
导入根癌农杆菌 GV3101 和 EHA105 菌株中,提取 2
个转化后的根癌农杆菌菌株的质粒,经 PCR扩增都
获得了 1. 8 kb的目的片段(图 5),证明构建的过表
达载体已成功转入农杆菌菌株中,为下一步通过农
杆菌介导法将 SAMDC 基因导入禾本科牧草奠定了
基础。
图 2 重组质粒的 PCR鉴定
Fig. 2 Identification of recombinant plasmids with PCR
注:M,DL2000 marker;1 - 3,重组质粒扩增产物;4,空白对照。
Note:M,DL2000 marker;1 - 3,recombinant plasmids amplified prod-
uct;4,negative CK.
图 3 重组质粒的酶切鉴定
Fig. 3 Analysis of recombinant plasmid
with restriction enzyme
注:M,λDNA HindIII marker;泳道 1,酶切产物。
Note:M,λDNA HindIII marker;lane 1,products of digestion.
图 4 构建的植物表达载体结构简图
Fig. 4 The structural diagram of constructed plant expression vector
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图 5 农杆菌转化菌株的 PCR鉴定
Fig. 5 Identification of transmitted Agrobacterium
tumefacien strains with PCR
注:M,DL2000 marker;1,GV3101 扩增产物;2,EHA105 扩增产物。
Note:M,DL2000 marker;1,amplified product of GV3101;2,ampli-
fied product of EHA105.
3 讨论与结论
高羊茅、黑麦草等草种是世界上广泛栽培的重
要冷季型禾草,在我国很多地区被大量引进种植,其
株型外观优美,植株营养丰富、耐践踏,具有作为牧
草和草坪草的很多优点,但在草地草坪建植过程中
也存在着一些缺点,如不耐高温、干旱及高盐等非生
物胁迫[12],通过转入可利用的抗性基因来提高它们
的抗性具有重要的生产意义。
S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因(SAMDC)是一个
在植物多胺合成途径中起着重要调节作用的抗逆相
关基因。SAMDC 基因表达受高盐、高热、干旱及寒
冷的诱导,但不受植物创伤的影响,说明 SAMDC 能
对多种环境条件的胁迫作出反应[13]。Wi 等[14]在
烟草中过量表达康乃馨的 SAMDC 能让转基因植株
获得对非生物胁迫的广谱抗性;Peremarti等[15]研究
证明,SAMDC调节合成的精胺积累有助于植物在经
受干旱后的快速复苏;Hazarika 和 Rajam[16]的试验
还证明,转基因番茄中 SAMDC基因的组成
型表达同时提高了植株对生物及非生物胁迫的耐受
性。Lasanajak等[17]将酵母 SAMDC 基因转入番茄,
结果在果实中观察到多胺生物合成流量的增加,而
乙烯的生成减少。Wi 等[18]最近发现,除调节多胺
的生物合成外,SAMDC还能通过抑制活性氧的积累
来增强拟南芥对干旱的耐受性。
植物的 SAMDC 基因存在着序列结构的多态
性。本研究从高羊茅“黔草 1 号”叶片中扩增 SAM-
DC基因时,采用高保真 DNA聚合酶平末端扩增法,
以最大程度降低碱基的错配率。克隆出的 SAMDC
基因包括引物序列共有 1 835 个核苷酸,包含有 9
bp的微型上游阅读框、147 bp 的小型上游阅读框和
1 185 bp的主阅读框,微型上游阅读框和小型上游
阅读框存在一个碱基重叠,这与葡萄(Vitis vinif-
era)、马铃薯(Solanum tuberosum)、大豆中的 SAMDC
基因上游阅读框的结构特征相同。Tassoni 等[3]将
去除上游 2 个微小读码框的葡萄 SAMDC cDNA 片
段导入酵母细胞内表达,结果显示 SAMDC 酶的活
性比完整片段的酶活性要高出 50 倍之多,说明
SAMDC基因上游的 2 个微小读码框具有很强的调
节功能。本研究克隆出的高羊茅“黔草 1 号”SAM-
DC基因主阅读框编码 395 个氨基酸,这与 GenBank
登录的 FaSAMDC 基因编码的氨基酸数量一致,但
与大豆 GmSAMDC1 基因编码 355 个氨基酸的片段
长度差异较大[13]。
本研究构建 SAMDC 基因植物表达载体的目的
是针对黑麦草和高羊茅的遗传转化。高羊茅与黑麦
草的胚性愈伤组织对卡那霉素、头孢霉素等抗生素
较为敏感,选用潮霉素作为筛选抗生素能明显提高
阳性株系的出苗率[19-20]。本研究选择经贵州省草
业研究所分子生物学实验室改造过的 pCAM-
BIA1300 作为表达载体,一方面,能将插入的 SAM-
DC基因直接置于 35S 启动子之下,另一方面,可用
潮霉素作为遗传转化时的筛选抗生素,以增加转基
因株系的获得率。成功构建的 pCAM-SAMDC 过表
达载体,为下一步通过遗传转化手段培育黑麦草和
高羊茅的抗旱、耐热、耐盐新品系奠定了物质基础。
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(责任编辑 王芳)
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