全 文 ：第３０卷第２期
２０１２年３月
泉州师范学院学报
Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｑｕａｎｚｈｏｕ　Ｎｏｒｍａｌ　Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ
Ｖｏｌ．３０Ｎｏ．２
Ｍａｒ．２０１２
龙竹和麻竹ＦＴ同源序列的扩增与序列分析
桑庆亮，黄周英，孙亮先
（泉州师范学院 化学与生命科学学院，福建 泉州　３６２０００）
摘　要：根据拟南芥Ｆｌｏｗｅｒｉｎｇ　Ｌｏｃｕｓ　Ｔ（ＦＴ）基因和水稻Ｈｅａｄｉｎｇ　ｄａｔｅ　３ａ（Ｈｄ３ａ）基因的序列设计引物，
通过ＰＣＲ扩增的方法分别从麻竹和龙竹基因组ＤＮＡ中各得到长为３３４ｂｐ的ＤＮＡ片段．经ＢＬＡＳＴ检索、基
因结构分析和编码蛋白功能域预测等分析，初步确定所得ＤＮＡ片段可能是麻竹和龙竹中的ＦＴ同源基因的部
分序列．
关键词：麻竹；龙竹；ＦＴ同源基因；ＰＣＲ扩增；序列分析 ①
中图分类号：Ｑ５２３；Ｓ７１８．４６　　文献标识码：Ａ　　 文章编号：１００９－８２２４（２０１２）０２－００６７－０５　
竹子是非常有特色的禾本科植物，快速生长能力、较高的木质化程度和地下茎长期无性繁殖等特点造就
了其重要经济价值［１］．大多数竹种具有３～１２０年的开花周期，并且在开花后表现为竹林成片死亡．因此，对竹
子开花机制的研究具有重要意义，而分离开花相关基因可为竹子开花机制研究提供重要的工具．
在竹类植物中已有部分开花相关基因得到克隆和初步分析，如麻竹ＭＡＤＳ－ｂｏｘ基因［１］、早竹花器官中的
四个ＭＡＤＳ－ｂｏｘ基因［２］、多个竹种的ＦＴ或ＲＦＴ１相似基因序列［３］等．
竹类植物基因功能分析的困难主要有：（１）缺少高效稳定的遗传转化体系，已克隆的竹子基因的功能鉴定
很难在竹子中实现，而只能利用拟南芥、水稻等体系；（２）竹子开花时间周期过长，很难稳定地获得具有开花基
因表达产物的样品．
本实验采用具有经济和观赏价值的龙竹（Ｄｅｎｄｒｏｃａｌａｍｕｓ　ｇｉｇａｎｔｅｕｓ）和麻竹（Ｄ．ｌａｔｉｆｌｏｒｕｓ）基因组ＤＮＡ
作为模板，以水稻（Ｏｒｙｚａ　ｓａｔｉｖａ）Ｈｄ３ａ基因、拟南芥（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ　ｔｈａｌｉａｎａ）ＦＴ基因的保守外显子序列设计特
异性引物进行ＰＣＲ扩增、将扩增产物转化并测序，并对其核苷酸和预测编码蛋白的氨基酸序列进行分析，为
今后竹子开花机制的研究提供重要基础．
１　材料与方法
１．１　实验材料
龙竹鲜叶取自泉州师范学院校园内，麻竹鲜叶取自永春县五里街镇．大肠杆菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉ）菌株
ＤＨ５α由本实验室保存．
１．２　实验方法
１．２．１　ＰＣＲ引物设计与合成　根据拟南芥的ＦＴ基因和水稻 Ｈｄ３ａ基因的保守外显子序列设计引物，
ｆｏｒｗａｒｄ　ｐｒｉｍｅｒ　ｂｆ２０８：５’－ＧＴＧ　ＡＴＧ　ＧＴＡ　ＧＡＣ　ＣＣＡ　ＧＡＴ　ＧＣ－３’，ｒｅｖｅｒｓｅ　ｐｒｉｍｅｒ　ｂｒ３３８：５’－ＧＧＧ　ＣＴＣ　ＴＣＧ
ＴＡＧ　ＣＡＣ　ＡＴＣ　ＡＴ－３’．
１．２．２　基因组ＤＮＡ的提取与鉴定　采用ＳＤＳ法［４］和ＣＴＡＢ法［５］从龙竹和麻竹鲜叶中提取并纯化基因组
ＤＮＡ，电泳和紫外分光光度法鉴定后备用．
１．２．３　ＦＴ 基因的ＰＣＲ扩增及纯化　ＰＣＲ的扩增体系（２５μＬ体系）：１０×ＰＣＲ　ｒｅａｃｔｉｏｎ　ｂｕｆｆｅｒ　２．５μＬ，
１００ｍｍｏｌ／Ｌ的 Ｍｇ２＋２．５μＬ，ｒＴａｑ　ＤＮＡ　Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ（５Ｕ／μＬ）０．２μＬ，２ｍｍｏｌ／Ｌ的ｄＮＴＰ　２．０μＬ，ＤＭＳＯ
① 收稿日期：２０１１－０９－２７
作者简介：桑庆亮（１９７６—），男，山东莱芜人，讲师，博士，从事植物分子生物学研究．
基金项目：福建省科技厅青年人才项目（２００７Ｆ３０８７）；泉州市科技局计划项目（２００８Ｚ１５）
DOI:10.16125/j.cnki.1009-8224.2012.02.007
２．０μＬ，ｆｏｒｗａｒｄ　ｐｒｉｍｅｒ　ｂｆ２０８　０．５μＬ，ｒｅｖｅｒｓｅ　ｐｒｉｍｅｒ　ｂｒ３３８　０．５μＬ，模板基因组ＤＮＡ　１．０μＬ，加无菌ｄｄＨ２Ｏ
至总体积为２５μＬ．
ＰＣＲ反应条件：９４℃预变性６ｍｉｎ，９４℃变性１ｍｉｎ，５８℃退火１ｍｉｎ，７２℃延伸７５ｓ，３５个循环，７２℃延
伸１０ｍｉｎ．
将ＰＣＲ产物以１．５％的琼脂糖凝胶电泳以鉴定其大小，将ＰＣＲ产物回收并纯化，与Ｔ载体连接，转入大
肠杆菌ＤＨ５α感受态细胞中，挑阳性单克隆进行ＰＣＲ鉴定并测序．
１．２．４　序列分析　测序结果用 Ｖｅｃｔｏｒ　ＮＴＩ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ　Ｃｏｒｐ．）软件包中的ＣｏｎｔｉｇＥｘｐｒｅｓｓ读出，碱基组成分
析用ＤＮＡｓｐ　３．５０
［６］完成，多序列比对用Ｃｌｕｓｔａｌ　Ｘ　２．０［７］进行，密码子偏性分析用ＣｏｄｏｎＷ１．４．２［８］完成，氨基
酸序列的系统演化分析用 ＭＥＧＡ　５．０［９］进行，序列同源性分析通过Ｂｌａｓｔｎ［１０］和Ｐｓｉ－Ｂｌａｓｔ［１１］检索得出，蛋白质
序列功能域预测用ＳＭＡＲＴ　４．０［１２］完成．
２　结果与分析
２．１　序列获取与序列分析
通过ＰＣＲ扩增、转化并测序，分别从龙竹和麻竹基因组 ＤＮＡ中得到长为３３４ｂｐ的序列，分别命名为
ＤｇＦＴ（ＪＮ６６２５０３）和ＤｌＦＴ（ＪＮ６６２５０４）．
将ＤｇＲＦＴ和ＤｌＲＦＴ 的核苷酸序列及推出的氨基酸序列分别进行Ｂｌａｓｔ分析，发现其核苷酸序列与马来
甜龙竹（Ｄ．ａｓｐｅｒ）ＲＦＴ（ＡＢ２６１１１３．１）、毛竹（Ｐｈｙｌｌｏｓｔａｃｈｙｓ　ｅｄｕｌｉｓ）ＲＦＴ（ＡＢ２４０５８０．１）等的部分序列相似性达
８０％以上．其中，与同属的马来甜龙竹ＲＦＴ基因的相似性均达到９１％，而与同为禾本科的水稻印地栽培种
（Ｏｒｙｚａ　ｓａｔｉｖａ　Ｉｎｄｉｃａ　Ｃｕｌｔｉｖａｒ－Ｇｒｏｕｐ）的Ｈｄ３ａ基因（ＡＢ４２６８８２．１）部分序列的相似性也达７３％以上．
得出所克隆的龙竹ＤｇＦＴ和麻竹ＤｌＦＴ 的部分编码序列长度均为１３１ｂｐ，各自编码４３个氨基酸残基．
Ｂｌａｓｔ检索的结果显示它们的相似蛋白质序列包括ＦＴ直系同源基因的蛋白质序列（包括小麦ＶＲＮ３、马来甜
龙竹ＲＦＴ１、毛竹ＲＦＴ、毛环竹ＲＦＴ１、拟南芥ＦＴ），相似性均达７０％以上．其中，与马来甜龙竹ＲＦＴ１、毛竹
ＲＦＴ等基因的ｃＤＮＡ中相应的序列相似性可达９０％以上．
２．２　ＤｇＦＴ 和ＤｌＦＴ 序列特征分析
２．２．１　序列相似性与泊松校正距离　对ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 部分序列编码区的碱基组成进行分析，结果表明：
ＤｌＦＴ编码区碱基组成为Ａ（２４．４％）、Ｃ（２５．２％）、Ｇ（２９．０％）、Ｔ（２１．４％），而ＤｇＦＴ碱基组成为Ａ（２３．７％）、
Ｃ（２４．４％）、Ｇ（２９．８％）、Ｇ（２２．１％），与水稻Ｈｄ３ａ、ＦＴ基因的碱基组成相似．
将龙竹ＤｇＦＴ、麻竹ＤｌＦＴ、马来甜龙竹ＲＦＴ１、毛竹ＲＦＴ１、毛环竹（Ｐｈｙｌｌｏｓｔａｃｈｙｓ　ｍｙｅｒｉ）ＲＦＴ１、小麦
ＶＲＮ３、水稻Ｈｄ３ａ和拟南芥ＦＴ 对应的氨基酸序列进行多序列比对，并用 ＭＥＧＡ　５．０［９］计算其泊松校正距
离．结果表明：这些序列两两之间的泊松校正距离均小于０．３，总的泊松校正距离也仅为０．１２，从遗传距离上
看，它们可能是直系同源基因．相对进化速率检验的结果表明它们具有相似的进化速率（χ
２＝１，Ｐ＞０．０５），表
明它们属于同一基因家族．
２．２．２　基因结构　将ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 基因片段与拟南芥ＦＴ、水稻 Ｈｄ３ａ、小麦ＶＲＮ３、马来甜龙竹ＲＦＴ进
行多序列比对，以确定其内含子－外显子的相对位置，结果见图１．
图１　ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 的基因结构
由图１可知，所克隆的ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 基因片段跨越外显子２、内含子２、外显子３、内含子３和外显子４
的一部分，其中外显子２长６２ｂｐ，外显子３长４１ｂｐ，与目前已经分离得到的ＦＴ／ＴＦＬ１亚家族基因的结构一
致［１３］．与拟南芥ＦＴ、水稻Ｈｄ３ａ、马来甜龙竹ＲＦＴ相比，对应的外显子长度一致，而内含子长度存在差异（如
拟南芥ＦＴ的内含子３长为１２６ｂｐ，内含子２长度为７１５ｂｐ；水稻Ｈｄ３ａ的内含子２长１３５ｂｐ，内含子３长为
１　３１０ｂｐ；马来甜龙竹的内含子２长为１２３ｂｐ，内含子３长８３ｂｐ；而ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 的内含子２均为１２０ｂｐ，
内含子３长为８３ｂｐ）．基因结构上的一致性反映了功能上的相似性，因此，ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 基因片段可能与拟
南芥ＦＴ 基因、水稻Ｈｄ３ａ基因具有相同的生物学功能．
８６ 　 泉州师范学院学报 ２０１２年３月　
２．３　系统演化分析
将拟南芥ＦＴ、小麦ＶＲＮ３、水稻的 Ｈｄ３ａ、毛竹ＲＦＴ１、毛环竹ＲＦＴ１、马来甜龙竹ＲＦＴ中对应于所克隆
的龙竹和麻竹的氨基酸的４３个氨基酸残基的序列片段构建系统树（图２）．
图２　ＤｌＦＴ、ＤｇＦＴ及其同源基因氨基酸序列的系统演化关系
由图２可以看出，竹子中同一属的ＦＴ同源基因位于同一分支（毛竹ＲＦＴ１和毛环竹ＲＦＴ１成一分支；马
来甜龙竹ＲＦＴ１、龙竹ＤｇＦＴ和麻竹ＤｌＦＴ 形成一分支），近缘属的小麦ＶＲＮ３和水稻 Ｈｄ３ａ形成一分支，拟
南芥ＦＴ单独一分支，作为外类群．据此我们认为，ＤｌＦＴ和ＤｇＦＴ 与ＦＴ 和Ｈｄ３ａ是垂直进化的基因，即直系
同源基因．
２．４　功能域分析
２．４．１　保守结构域与保守氨基酸残基　用Ｖｅｃｔｏｒ　ＮＴＩ软件将ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 基因片段的蛋白编码序列人
工转译成氨基酸序列．ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 基因片段部分的氨基酸序列长度均为４３个氨基酸残基．
用ＳＭＡＲＴ４．０［１２］对该两段４３个氨基酸残基的序列进行检索，得出从１～４２位为ＰＥＢＰ结构域部分，属
于ＰＥＢＰ家族成员（Ｅ值为３．４０×１０－１０），进一步表明该功能域的存在．
将这些具较高同源性的氨基酸序列提取出来，与麻竹ＤｌＦＴ和龙竹ＤｇＦＴ 基因片段的氨基酸序列进行
多序列比对．
图３　多个物种的ＦＴ同源基因的氨基酸序列比对图（并显示ＰＥＢＰ功能域）
注：图中黑色实线框内为Ｄ－Ｐ－Ｄ－ｘ－Ｐ模块，黑色虚线框内为保守的Ｙ残基，而黑色点线框内为Ｈ残基，这些保守的氨
基酸残基均与配体结合位点的形成有关．
由图３可以看出，龙竹ＤｇＦＴ与麻竹ＤｌＦＴ 的氨基酸序列片段中均含有磷脂酰乙醇胺结合蛋白（ＰＥＢＰ）
结构域，图中及植物ＦＴ基因家族蛋白质序列中的保守结构域（７１～７５）残基间的Ｄ－Ｐ－Ｄ－ｘ－Ｐ模块、８７位保守
的组氨酸 Ｈ，但１１１～１１４位的Ｇ－ｘ－Ｈ－Ｒ模块［１４－１５］超出了我们所克隆的序列的范围而未体现．功能域分析表
明龙竹ＤｇＦＴ与麻竹ＤｌＦＴ 属于ＰＥＢＰ－ＰＫＩＰ蛋白质超家族中的ＦＴ／ＴＦＬ１基因家族，可能在竹子诱导成花
方面具有重要作用．
２．４．２　氨基酸序列区域保守性　将这些ＦＴ直系基因进行多序列比对，然后用 Ｗｅｂｌｏｇｏ［１６］对上述多序列比
对结果进行作图，以显示保守氨基酸残基的位置（图４）．
９６　第２期 桑庆亮，等：龙竹和麻竹ＦＴ同源序列的扩增与序列分析 　
图４　多序列比对中保守氨基酸残基的位置
　　由图４可知，靠近５’端的氨基酸残基相对保守，靠近３’端区保守性相对较差．Ａｈｎ等［１３］认为外显子４的
高可变性对ＦＴ家族基因的的功能意义重大，可能带来功能的变化，而所克隆的序列的３’端即位于ＦＴ的外
显子４对应的区域，３’侧的氨基酸残基的保守性差也体现了具有该基因家族成员的特征．因此，从序列保守性
来看，ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 为ＦＴ 家族成员．
２．４．３　Ｐｓｉ－ｂｌａｓｔ分析　将所克隆的ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 分别进行Ｐｓｉ－Ｂｌａｓｔ检索，结果表明，该两段氨基酸序列片
段均具有ＰＥＢＰ结构域：第５位（对应ＦＴ蛋白第７１位）的脯氨酸（Ｐ），第１８位（对应ＦＴ蛋白第８５位）的酪氨
酸（Ｙ）和第２０位（对应ＦＴ蛋白第８７位）的组氨酸（Ｈ），为ＰＥＢＰ结构域中底物结合位点的保守氨基酸残基．
决定ＦＴ生物学功能的位点包括一些关键性氨基酸残基和外显子４区域的１４个保守氨基酸残基：ＦＴ蛋
白８５位的酪氨酸（Ｙ），８８位的组氨酸（Ｈ）以及外显子４中的１４个保守氨基酸残基（未克隆区域）在ＦＴ 基因
中几乎不变［１３］．
３　讨论
本研究以龙竹和麻竹基因组ＤＮＡ为模板进行ＰＣＲ扩增，成功得到了ＦＴ相似基因的部分序列．序列相
似性分析发现，所克隆的ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ 序列与拟南芥ＦＴ 基因以及水稻Ｈｄ３ａ基因具有很高的相似性，因
此认为所克隆的基因序列可能具有与ＦＴ 和Ｈｄ３ａ相似的功能．将近缘物种的ＦＴ 同源基因与ＤｇＦＴ 和
ＤｌＦＴ 构建系统树，它们与水稻Ｈｄ３ａ、小麦ＶＲＮ３、毛竹ＲＦＴ１以及毛环竹ＲＦＴ１位于同一分支，说明ＤｇＦＴ
和ＤｌＦＴ 可能是ＦＴ 直系同源基因．通过对氨基酸序列保守性以及结构域的分析，我们得出，ＤｇＦＴ和ＤｌＦＴ
具有ＦＴ 基因家族的特征氨基酸残基，进一步说明它们与ＦＴ基因可能具有相似的功能．
由于竹子开花时间不确定，且成花素基因表达时间很短，因此，在竹子成花机理研究中，合适的取样时间
的确定是竹子亟待解决的问题．由于无法找到合适的材料和转基因体系，本研究也只能从基因组ＤＮＡ中扩
增，而无法通过ＲＴ－ＰＣＲ等方法获得ＦＴ相似基因的ｃＤＮＡ序列，并对序列特征、基因结构和功能域进行分
析，从而推测其功能，为今后竹子开花基因的克隆与功能分析工作提供一定的基础．
参 考 文 献：
［１］　田波，陈永燕，严远鑫，等．一个竹类植物ＭＡＤＳ盒基因的克隆及其在拟南芥中的表达［Ｊ］．科学通报，２００５，５０（２）：１４５－１５１．
［２］　彭华正．竹子分生组织发育特点以及相关基因的克隆和功能研究［Ｄ］．杭州：浙江大学，２００５．
［３］　ＨＩＳＡＭＯＴＯ　Ｙ，ＫＡＳＨＩＷＡＧＩ　Ｈ，ＫＯＢＡＹＡＳＨＩ　Ｍ．Ｕｓｅ　ｏｆ　ｆｌｏｗｅｒｉｎｇ　ｇｅｎｅ　ＦＬＯＷＥＲＩＮＧ　ＬＯＣＵＳ　Ｔ （ＦＴ）ｈｏｍｏｌｏｇｓ　ｉｎ　ｔｈｅ　ｐｈｙｌｏ－
ｇｅｎｅｔｉｃ　ａｎａｌｙｓｉｓ　ｏｆ　ｂａｍｂｕｓｏｉｄ　ａｎｄ　ｅａｒｌｙ　ｄｉｖｅｒｇｉｎｇ　ｇｒａｓｓｅｓ［Ｊ］．Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｐｌａｎｔ　Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２００８，１２１（５）：４５１－４６１．
［４］　ＤＥＬＬＡＰＯＲＴＡ　Ｓ　Ｌ，ＷＯＯＤ　Ｊ，ＨＩＣＫＳ　Ｊ　Ｂ．Ａ　ｐｌａｎｔ　ＤＮＡ　ｍｉｎｉｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ：ｖｅｒｓｉｏｎ　ＩＩ［Ｊ］．Ｐｌａｎｔ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ　Ｒｅｐｏｒｔｅｒ，１９８３，
１（４）：１９－２１．
［５］　ＣＩＭＭＹＴ．Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ：ＣＩＭＭＹＴ　ａｐｐｌｉｅｄ　ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　ｇｅｎｅｔｉｃｓ　ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ［Ｍ］．Ｍｅｘｉｃｏ　Ｄｉｓｔｒｉｔｏ　Ｆｅｄｅｒａｌ：ＣＩＭＭＹＴ，２００５．
［６］　ＲＯＺＡＳ　Ｊ，ＳＡＮＣＨＥＺ－ＤＥＬＢＡＲＲＩＯ　Ｊ　Ｃ，ＭＥＳＳＥＧＵＥＲ　Ｘ，ｅｔ　ａｌ．ＤｎａＳＰ，ＤＮＡ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　ａｎａｌｙｓｅｓ　ｂｙ　ｔｈｅ　ｃｏａｌｅｓｃｅｎｔ　ａｎｄ　ｏｔｈｅｒ
ｍｅｔｈｏｄｓ［Ｊ］．Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ，２００３，１９（１８）：２４９６－２４９７．
［７］　ＬＡＲＫＩＮ　Ｍ　Ａ，ＢＬＡＣＫＳＨＩＥＬＤＳ　Ｇ，ＢＲＯＷＮ　Ｎ　Ｐ，ｅｔ　ａｌ．Ｃｌｕｓｔａｌ　Ｗ　ａｎｄ　Ｃｌｕｓｔａｌ　Ｘ　ｖｅｒｓｉｏｎ　２．０［Ｊ］．Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ，２００７，２３（２１）：
２９４７－２９４８．
［８］　ＰＥＤＥＮ　Ｊ　Ｆ．Ａｎａｌｙｓｉｓ　ｏｆ　ｃｏｄｏｎ　ｕｓａｇｅ［Ｄ］．Ｎｏｔｔｉｎｇｈａｍ：Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ　ｏｆ　Ｎｏｔｔｉｎｇｈａｍ，１９９９．
［９］　ＴＡＭＵＲＡ　Ｋ，ＰＥＴＥＲＳＯＮ　Ｄ，ＰＥＴＥＲＳＯＮ　Ｎ，ｅｔ　ａｌ．ＭＥＧＡ５：ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ　ｇｅｎｅｔｉｃｓ　ａｎａｌｙｓｉｓ　ｕｓｉｎｇ　ｍａｘｉｍｕｍ　ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ，
ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ　ｄｉｓｔａｎｃｅ，ａｎｄ　ｍａｘｉｍｕｍ　ｐａｒｓｉｍｏｎｙ　ｍｅｔｈｏｄｓ［Ｊ］．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ　ａｎｄ　Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ，２０１１，２８（１０）：２７３１－２７３９．
０７ 　 泉州师范学院学报 ２０１２年３月　
［１０］　ＡＬＴＳＣＨＵＬ　Ｓ　Ｆ，ＧＩＳＨ　Ｗ，ＭＩＬＬＥＲ　Ｗ，ｅｔ　ａｌ．Ｂａｓｉｃ　ｌｏｃａｌ　ａｌｉｇｎｍｅｎｔ　ｓｅａｒｃｈ　ｔｏｏｌ［Ｊ］．Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ，１９９０，２１５（３）：
４０３－４１０．
［１１］　ＳＣＨＦＦＥＲ　Ａ　Ａ，ＡＲＡＶＩＮＤ　Ｌ，ＭＡＤＤＥＮ　Ｔ　Ｌ，ｅｔ　ａｌ．Ｉｍｐｒｏｖｉｎｇ　ｔｈｅ　ａｃｃｕｒａｃｙ　ｏｆ　ＰＳＩ－ＢＬＡＳＴ　ｐｒｏｔｅｉｎ　ｄａｔａｂａｓｅ　ｓｅａｒｃｈｅｓ　ｗｉｔｈ　ｃｏｍ－
ｐｏｓｉｔｉｏｎ－ｂａｓｅｄ　ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ　ａｎｄ　ｏｔｈｅｒ　ｒｅｆｉｎｅｍｅｎｔｓ［Ｊ］．Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２００１，２９（１４）：２９９４－３００５．
［１２］　ＬＥＴＵＮＩＣ　Ｉ，ＣＯＰＬＥＹ　Ｒ　Ｒ，ＳＣＨＭＩＤＴ　Ｓ，ｅｔ　ａｌ．ＳＭＡＲＴ　４．０：ｔｏｗａｒｄｓ　ｇｅｎｏｍｉｃ　ｄａｔａ　ｉｎｔｅｇｒａｔｉｏｎ［Ｊ］．Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２００４，
３２（ｓｕｐｐｌ　１）：１４２－１４４．
［１３］　ＡＨＮ　Ｊ　Ｈ，ＭＩＬＬＥＲ　Ｄ，ＷＩＮＴＥＲ　Ｖ　Ｊ，ｅｔ　ａｌ．Ａ　ｄｉｖｅｒｇｅｎｔ　ｅｘｔｅｒｎａｌ　ｌｏｏｐ　ｃｏｎｆｅｒｓ　ａｎｔａｇｏｎｉｓｔｉｃ　ａｃｔｉｖｉｔｙ　ｏｎ　ｆｌｏｒａｌ　ｒｅｇｕｌａｔｏｒｓ　ＦＴａｎｄ
ＴＦＬ１［Ｊ］．ＥＭＢＯ　Ｊ，２００６，２５（３）：６０５－６１４．
［１４］　ＢＡＮＦＩＥＬＤ　Ｍ　Ｊ，ＢＲＡＤＹ　Ｒ　Ｌ．Ｔｈｅ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ｏｆ　Ａｎｔｉｒｒｈｉｎｕｍｃｅｎｔｒｏｒａｄｉａｌｉｓ　ｐｒｏｔｅｉｎ（ＣＥＮ）ｓｕｇｇｅｓｔｓ　ａ　ｒｏｌｅ　ａｓ　ａ　ｋｉｎａｓｅ　ｒｅｇｕｌａｔｏｒ［Ｊ］．
Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ，２０００，２９７（５）：１１５９－１１７０．
［１５］　ＫＯＴＯＤＡ　Ｎ，ＷＡＤＡ　Ｍ．ＭｄＴＦＬ１，ａＴＦＬ１－ｌｉｋｅ　ｇｅｎｅ　ｏｆ　ａｐｐｌｅ，ｒｅｔａｒｄｓ　ｔｈｅ　ｔｒａｎｓｉｔｉｏｎ　ｆｒｏｍ　ｔｈｅ　ｖｅｇｅｔａｔｉｖｅ　ｔｏ　ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｖｅ　ｐｈａｓｅ　ｉｎ
ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ　Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ［Ｊ］．Ｐｌａｎｔ　Ｓｃｉｅｎｃｅ，２００５，１６８（１）：９５－１０４．
［１６］　ＣＲＯＯＫＳ　Ｇ，ＨＯＮ　Ｇ，ＣＨＡＮＤＯＮＩＡ　Ｊ　Ｍ，ｅｔ　ａｌ．ＷｅｂＬｏｇｏ：ａ　ｓｅｑｕｅｎｃｅ　ｌｏｇｏ　ｇｅｎｅｒａｔｏｒ［Ｊ］．Ｇｅｎｏｍｅ　Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２００４，１４（６）：１１８８－
１１９０．
Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ　ａｎｄ　Ｓｅｑｕｅｎｃｅ　Ａｎａｌｙｓｉｓ　ｏｆ　Ｐａｒｔｉａｌ　ＦＴ－ｌｉｋｅ　Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ
ｉｎ　Ｄｅｎｄｒｏｃａｌａｍｕｓ　ｇｉｇａｎｔｅｕｓ　ａｎｄ　Ｄｅｎｄｒｏｃａｌａｍｕｓ　ｌａｔｉｆｌｏｒｕｓ
ＳＡＮＧ　Ｑｉｎｇ－ｌｉａｎｇ，ＨＵＡＮＧ　Ｚｈｏｕ－ｙｉｎｇ，ＳＵＮ　Ｌｉａｎｇ－ｘｉａｎ
（Ｓｃｈｏｏｌ　ｏｆ　Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ　ａｎｄ　Ｌｉｆｅ　Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｑｕａｎｚｈｏｕ　Ｎｏｒｍａｌ　Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｆｕｊｉａｎ　３６２０００，Ｃｈｉｎａ）
Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｉｎ　ｔｈｉｓ　ｐａｐｅｒ，ｐｒｉｍｅｒｓ　ｗｅｒｅ　ｄｅｓｉｇｎｅｄ　ａｃｃｏｒｄｉｎｇ　ｔｏ　ｔｈｅ　ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ　ｅｘｏｎｓ　ｏｆ　Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ　ｔｈａｌｉａｎａ
Ｆｌｏｗｅｒｉｎｇ　Ｌｏｃｕｓ　Ｔ （ＦＴ）ｇｅｎｅ　ａｎｄ　Ｏｒｙｚａ　ｓａｔｉｖａ　Ｈｅａｄｉｎｇ　ｄａｔｅ　３ａ（Ｈｄ３ａ）ｇｅｎｅ　ｔｏ　ａｍｐｌｉｆｙ　ｔｈｅ
ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇ　ＤＮＡ　ｓｅｑｕｅｎｃｅ　ｆｒｏｍ　ｇｅｎｏｍｉｃ　ＤＮＡ　ｏｆ　Ｄ．ｌａｔｉｆｌｏｒｕｓ　ａｎｄ　Ｄ．ｇｉｇａｎｔｅｕｓ，ａｎｄ　ｔｗｏ　３３４ｂｐ
ｌｏｎｇ　ＤＮＡ　ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ　ｗｅｒｅ　ｏｂｔａｉｎｅｄ．Ｔｈｒｏｕｇｈ　ｂｌａｓｔ　ｓｅａｒｃｈ，ｇｅｎｅ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ａｎａｌｙｓｉｓ　ａｎｄ　ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ
ｄｏｍａｉｎ　ｓｅａｒｃｈ，ｗｅ　ｃｏｎｃｌｕｄ　ｔｈａｔ　ｔｈｅｓｅ　ｔｗｏ　ＤＮＡ　ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ　ｍｉｇｈｔ　ｂｅ　ｍｅｍｂｅｒｓ　ｏｆ　ＦＴｇｅｎｅ　ｆａｍｉｌｙ　ｉｎ
Ｄ．ｌａｔｉｆｌｏｒｕｓ　ａｎｄ　Ｄ．ｇｉｇａｎｔｅｕｓ．
Ｋｅｙ　ｗｏｒｄｓ：ｄｅｎｄｒｏｃａｌａｍｕｓ　ｌａｔｉｆｌｏｒｕｓ；ｄｅｎｄｒｏｃａｌａｍｕｓ　ｇｉｇａｎｔｅｕｓ；ＦＴ－ｌｉｋｅ　ｇｅｎｅ；ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ；ｓｅｑｕｅｎｃｅ
ａｎａｌｙｓｉｓ
１７　第２期 桑庆亮，等：龙竹和麻竹ＦＴ同源序列的扩增与序列分析