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Genetic Diversity Analysis of Populus yunnanensis by SRAP Markers

滇杨遗传多样性的SRAP分析



全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2016, 32(4):159-167
收稿日期 :2015-04-22
基金项目 :国家林业公益性行业专项(201104076),国家自然科学基金项目(31360184,31460205),云南省中青年学术与技术带头人后备
人才培养基金项目(2012HB021),西南林业大学大学生创新基金项目(C14113)
作者简介 :颜璐茜,女,硕士研究生,研究方向 :植物生物技术 ;E-mail :695253285@qq.com
通讯作者 :何承忠,男,教授,博士生导师,研究方向 :林木遗传育种与分子生物学 ;E-mail :hcz70@163.com
滇杨遗传多样性的 SRAP 分析
颜璐茜1,2  李佳蔓1,2  员涛1,2  周安佩1,2  纵丹1,2   
李旦3  辛培尧1,2,4  何承忠1,2,4
(1. 西南林业大学 云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,昆明 650224 ;2. 西南林业大学 西南地区生物多样性保育国家林业局重点
实验室,昆明 650224 ;3. 西南林业大学 云南生物多样性研究院,昆明 650224 ;4. 西南林业大学 西南山地森林资源保育与利用省部共建
教育部重点实验室,昆明 650224)
摘 要 : 采用 SRAP 标记分析滇杨的遗传多样性和遗传结构。用筛选出的 7 对引物组合分析来自 7 个居群共 208 个样本,
共扩增得到条带 146 条,多态性条带 73 条,多态带百分率为 50%。滇杨物种水平上的观测等位基因数(Na)为 1.500 0,有效等
位基因数(Ne)为 1.230 9,Nei’s 基因多样性指数(H)与 Shannon’s 信息指数(I)分别为 0.136 6 与 0.210 0。遗传分化系数(Gst)
为 0.529 4,基因流(Nm)为 0.444 4,表明居群间的遗传变异大于居群内,其基因交流处于中等水平。AMOVA 分析也表明居群间
的变异占总变异的 55.61%。UPGMA、PCoA 和 Bayesian 聚类分析结果一致,均显示丽江与曲靖居群、楚雄与昭通居群的亲缘关系
较近。Mantel test 结果表明滇杨居群间的遗传距离与地理距离不相关。
关键词 : 滇杨 ;遗传多样性 ;遗传结构 ;SRAP 标记
DOI :10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.04.021
Genetic Diversity Analysis of Populus yunnanensis by SRAP Markers
YAN Lu-xi1,2 LI Jia-man1,2 YUAN Tao1,2 ZHOU An-pei1,2 ZONG Dan1,2
LI Dan3 XIN Pei-yao1,2,4 HE Cheng-zhong1,2,4
(1. Key Laboratory for Forest Genetic and Tree Improvement & Propagation in Universities of Yunnan Province,Southwest Forestry University,
Kunming 650224 ;2. Key Laboratory of Biodiversity Conservation in Southwest China,State Forestry Administration,Southwest Forestry
University,Kunming 650224 ;3. Yunnan Academy of Biodiversity,Southwest Forestry University,Kunming 650224 ;4. Key Laboratory for
Forest Resources Conservation and Use in the Southwest Mountains of China,Ministry of Education,Southwest Forestry University,
Kunming 650224)
Abstract: To figure out the genetic diversity and genetic structure of Populus yunnanensis,208 samples from 7 populations were
analyzed by sequence-related amplified polymorphism(SRAP)markers. With selected 7 pairs of primers,146 bands were obtained,in which
73 fragments(50%)were polymorphic. The values at the species level were 1.500 0 for observed alleles number(Na),1.230 9 for effective
alleles number(Ne),0.136 6 for Nei’s genetic diversity index(H),and 0.210 0 for Shannon’s information index(I). The genetic
differentiation coefficient(Gst)was 0.529 4 and gene flow(Nm)was 0.444 4 and on intermediate stage,indicating that genetic variability
of P. yunnanensis mainly took place among populations. Similarly,AMOVA showed that the genetic diversity among populations accounted
for 55.61% of total. Clustering analysis by UPGMA,PCoA and Bayesian constantly revealed that population Lijiang and Qujing were in close
relationship,and the same for population Chuxiong and Zhaotong. In addition,no correlation between the genetic distance and geographical
distance was found by Mantel Test.
Key words: Populus yunnanensis ;genetic diversity ;genetic structure ;SRAP marker
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2016,Vol.32,No.4160
滇杨(Populus yunnanensis Dode)是我国西南地
区特有的杨属青杨派树种,分布于云南中部、北部
及南部的开远、蒙自和文山,贵州威宁,四川凉山
州的美姑、布拖等地,生长于海拔 1 300-3 200 m,
部分地区可达到 3 700 m,多沿山涧河溪生长,在
海拔 2 000 m 以上地带有纯林存在,而在海拔较低
地区(<1 900 m)主要以混交林或散生形式存在[1]。
由于滇杨具有生长速度快、耐寒、易无性繁殖、抗
叶锈病和叶斑病等优良性状[1,2],兼有较高的观赏
价值[3],被应用于环境保护、城市绿化并在林业生
产中扮演着重要角色[4],具有独特的培养价值。目
前关于滇杨的研究主要集中于生长特性[5-8]及栽培
繁育[9-12]方面,通过与美洲黑杨(P. deltoides)、欧
洲黑杨(P. nigra)的种间杂交对其遗传改良做出了
尝试[13,14]。但有关其分布区域内的遗传多样性研究
还未见报道。
在用于分析植物遗传多样性及种质资源的多
种 分 子 标 记 中,SRAP(Sequence-Related Amplified
Polymorphism)针对开放阅读框进行标记,在分析种
间、种内杂交调查基因多态性与发现新的变异位点
等方面有不可估量的价值[15]。该方法已被应用于遗
传多样性分析[16]、遗传图谱构建[17]及差异表达基
因分离[18]等实验研究。杨树 SRAP 标记体系的建立
和优化已表明 SRAP 标记是一种适于杨树遗传多样
性研究的分子标记技术[19,20]。基于此,本研究采用
SRAP 标记分析采集于四川省凉山州、云南省丽江
市、曲靖市、昆明市、大理市、楚雄市和昭通市 7
个滇杨居群的 208 个样本,探讨滇杨遗传多样性与
遗传结构,以期为其种质资源的保护、开发和利用
提供科学理论依据。
1 材料与方法
1.1 材料
以行政区划的地级市(自治州)为居群单位,
按照随机取样的原则,从四川省凉山州、云南省丽
江市、曲靖市、昆明市、大理市、楚雄市和昭通市
共计 7 个滇杨居群中选取样株,样株间相隔 100 m
以上,采集嫩叶用硅胶干燥,带回实验室保存备用。
1.2 方法
1.2.1 DNA 提取和 SRAP 分析 干燥后的叶片用冷
冻混合球磨仪进行研磨,采用改良的 SDS 法依照标
准酚 / 氯仿流程[21]提取分析样本基因组 DNA,利
用 0.8% 的琼脂糖凝胶电泳和核酸蛋白检测仪共同检
测基因组 DNA 的纯度和浓度。
1.2.2 SRAP 分析 根据 SRAP 引物设计原理[22,23],
在已有标准引物序列的基础上自行设计正反引物各
15 条,共计 225 对引物组合。从中筛选出重复性好、
多态性高、分辨率高的 7 对引物组合用于后续实验。
PCR 反 应 体 系(10 μL):10×buffer( 含 25
mmol/L Mg2+)1 μL,dNTP(2.5 mmol/L)0.7 μL,正
反引物(10 μmol/L)各 1.5 μL,Taq 酶(2.5 U/μL)0.2
μL,DNA 模 板 2.5 μL,ddH2O 补 足(2.6 μL) 至 10
μL。PCR 扩增程序为 :94℃预变性 5 min ;前 5 个循
环,94℃变性 50 s,36℃退火 50 s,72℃延伸 90 s ;
后 30 个循环,94℃变性 50 s,50℃退火 50 s,72℃
延伸 90 s ;72℃延伸 10 min。
PCR 扩增产物经 94℃变性 10 min 后在 6% 变性
聚丙烯酰胺上进行电泳分离,恒定功率为 70 W,电
泳产物采用银染法[24]进行谱带的显色反应。
1.2.3 数据分析 根据电泳图谱中相同片段位置谱
带的“有”与“无”构建 0/1 矩阵。采用 POPGENE
version 1.32 软件[25]计算滇杨每个居群的多态性条
带数、多态带百分率、观测等位基因数(Na)、有
效等位基因数(Ne)、Nei’s 基因多样性指数(H)、
Shannon’s 信息指数(I),以及滇杨总遗传多样性
(Ht)、居群内遗传多样性(Hs)、居群间遗传分化
系数(Gst)、基因流(Nm)、Nei’s 遗传距离和遗传
相似系数。应用 AMOVA 1.55 软件[26]进行分子变
异方差分析。利用 GENALEX v6.41 软件[27]对滇杨
居群地理距离和遗传距离的相关性进行 Mantel test
分析,依据遗传距离进行主坐标轴分析(PCoA)。
在 NTSYS2.1e 软件[28]中运用非加权配对算术平均
法(UPGMA)进行基于遗传相似系数的聚类分析。
采用 Structure 2.3.1[29]进行 Bayesian 聚类分析,选
择混合模型(Admixture model)和相关等位基因模
型(Correlated alleles frequencies model), 设 定 参 数
“burn-in-period”为 104,MCMC 重复运算 105 次,K
值检测范围设定为 1-11,每个 K 值独立运行 20 次。
应用 Clumpp 1.1.2[30]对数据进行整理和分析,参照
Evanno 等[31]的方法确定最佳 K 值,利用 Distruct 1.1[32]
2016,32(4) 161颜璐茜等:滇杨遗传多样性的 SRAP分析
绘制 Bayesian 聚类图。
2 结果
2.1 SRAP多态性分析
筛选出的 7 对引物组合共扩增出条带 146 条,
多态性条带 73 条,多态带百分率为 50%。引物组
合 Me3/Em9 获得的总条带数(32 条)、多态性条带
数(19 条)、多态带百分率(59.4%)均最高,引物
组合 Me3/Em8 的最少,总条带数、多态性条带数和
多态带百分率分别为 14 条、3 条和 21.4%(图 1 和
表 1)。
2.2 滇杨居群的遗传多样性和遗传结构
7 个居群的遗传多样性(表 2)显示,平均多态
带百分率为 22.70%,平均观测等位基因数为 1.227 0,
平均有效等位基因数为 1.107 6,Nei’s 基因多样性
指数与 Shannon’s 信息指数分别为 0.064 4 与 0.098 9。
其中丽江居群的有效等位基因数(1.148 2)、Nei’s
基因多样性指数(0.088 7)和 Shannon’s 信息指数
(0.134 8)均最高,略高于曲靖居群(Ne=1.134 3,
H=0.081 2,I=0.125 7);而多态带百分率与观测等
位 基 因 数 则 是 曲 靖 居 群 最 高, 分 别 为 30.82% 和
1.308 2 ;昭通居群的多态带百分率(14.38%)、观测
等位基因数(1.143 8)、有效等位基因数(1.070 1)、
图 1 PCR 扩增产物的 6% 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳银染图
表 1 SRAP 引物及其扩增结果
引物 引物序列(5-3) 总条带数 多态性条带数 多态带百分率 /%
Me3/Em9
Me3 :TGAGTCCAAACCGGAAT
32 19 59.4
Em9 :GACTGCGTACGAATTTCA
Me10/Em1
Me10 :TGAGTCCAAACCGGTAC
26 14 53.8
Em1 :GACTGCGTACGAATTAAT
Me1/Em3
Me1 :TGAGTCCAAACCGGATA
16 8 50.0
Em3 :GACTGCGTACGAATTGAC
Me3/Em8
Me3 :TGAGTCCAAACCGGAAT
14 3 21.4
Em8 :GACTGCGTACGAATTGCC
Me4/Em8
Me4 :TGAGTCCAAACCGGACC
20 9 45.0
Em8 :GACTGCGTACGAATTGCC
Me15/Em14
Me15 :TGAGTCCAAACCGGGGC
19 9 47.4
Em14 :GACTGCGTACGAATTGGC
Me9/Em7
Me9 :TGAGTCCAAACCGGTGA
19 11 57.9
Em7 :GACTGCGTACGAATTGAG
平均 20.9 10.4 50.0
总计 146 73 50.0
Nei’s 基因多样性指数(0.042 6)和 Shannon’s 信息
指数(0.065 2)均最低。
滇杨总遗传多样性(Ht)为 0.136 9,居群内平
均遗传多样性(Hs)为 0.064 4,7 个居群总遗传分
化系数(Gst)为 0.529 4,基因流(Nm)为 0.444 4,
表明居群间的遗传变异大于居群内,其基因交流处
于中等水平。分子方差分析结果(表 3)显示,居
群间的变异分量为 6.71,占总变异的 55.61%,差异
达极显著水平(P<0.001)。而居群内个体的变异分
量为 5.36,占总变异的 44.39%,低于居群间的变异
程度。由此可知,滇杨的遗传差异主要来自于不同
居群之间。
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2016,Vol.32,No.4162
两两居群间的最高遗传分化系数出现在昆明
与凉山居群之间,其 Gst 值为 0.523 3 ;其次为昭通
与凉山居群 Gst 值为 0.509 2 ;而楚雄与昭通居群
(Nm=1.987 8)、丽江与曲靖居群(Nm=1.704 9)基
因交流最多,其 Nm 值均大于 1(表 4)。经 Mantel
检验,滇杨 7 个居群的地理距离与遗传距离的相
关系数为 -0.157(P=0.241),表明两者间无相关性
(图 2)。
表 2 滇杨 7 个居群的遗传多样性
居群 样本数
多态性
条带数
多态带
百分率 /%
观测等位
基因数(Na)
有效等位
基因数(Ne)
Nei’s 基因
多样性指数(H)
Shannon’s
信息指数(I)
凉山 31 25 17.12 1.1712 1.0749 0.0454 0.0703
丽江 30 42 28.77 1.2877 1.1482 0.0887 0.1348
曲靖 30 45 30.82 1.3082 1.1343 0.0812 0.1257
昆明 30 34 23.29 1.2329 1.1016 0.0613 0.0957
大理 30 38 26.03 1.2603 1.1082 0.0674 0.1059
楚雄 24 27 18.49 1.1849 1.1158 0.0643 0.0946
昭通 33 21 14.38 1.1438 1.0701 0.0426 0.0652
居群水平 - 33.1 22.70 1.2270 1.1076 0.0644 0.0989
物种水平 208 73 50.00 1.5000 1.2309 0.1366 0.2100
表 3 滇杨 7 个居群的分子方差分析
变异源 自由度 方差和 均方 变异组分 变异百分率 P-value
居群间 6 1227.41 204.57 6.71 55.61 <0.001
居群内 201 1077.08 5.36 5.36 44.39
总计 207 2304.49
表 4 滇杨居群间的遗传分化系数(Gst)和基因流(Nm)
凉山 丽江 曲靖 昆明 大理 楚雄 昭通
凉山 **** 0.6979 0.5885 0.4554 0.6249 0.5827 0.4820
丽江 0.4174 **** 1.7049 0.8066 0.9800 0.8548 0.8932
曲靖 0.4593 0.2268 **** 0.6792 0.8202 0.9947 0.8073
昆明 0.5233 0.3827 0.4240 **** 0.8327 0.6414 0.6020
大理 0.4445 0.3378 0.3787 0.3752 **** 0.8332 0.6809
楚雄 0.4618 0.3691 0.3345 0.4381 0.3750 **** 1.9878
昭通 0.5092 0.3589 0.3825 0.4537 0.4234 0.2010 ****
注 :对角线以下为遗传分化系数(Gst),对角线以上为基因流(Nm)
R=-0.157 P=0.241
0.000
0.020
0.040
0.060
0.080
0.100
0.120
0.140
0 100 200 300 400 500 600
Geographic distance / Km
G
en
et
ic
d
is
ta
nc
e
图 2 滇杨 7 个居群的地理距离和遗传距离相关性
2.3 聚类分析
居群间的平均遗传相似系数为 0.909 7,变幅为
0.876 2-0.971 6,楚雄与昭通居群之间遗传相似系数
最高,为 0.971 6,其次为丽江与曲靖居群(0.945 6),
凉山与昆明居群最低,为 0.876 2。如图 3 所示,在
阈值为 0.91 时可分为 3 个组,凉山居群为第 1 组,
昆明与大理居群构成第 2 组,其余 4 个居群为第 3
组。主坐标轴分析(PCoA)中,前 3 个特征向量的
2016,32(4) 163颜璐茜等:滇杨遗传多样性的 SRAP分析
累计贡献率为 72%,基于 PCoA 的结果与 UPGMA
聚类结果基本一致,昭通与楚雄居群聚类,丽江与
曲靖居群聚类,而凉山、大理、昆明 3 个居群相对
分散(图 4)。
和 UPGMA 的聚类结果类似。如当 K=4 时,凉山居
群单独构成第 1 组,丽江和曲靖居群为第 2 组,昆
明和大理居群组成第 3 组,昭通和楚雄居群被分到
第 4 组。
0.89 0.91 0.94
Genetic similarity coefficient
߹ኡት㗔ѭ⊏ት㗔ᴢ䶆ት㗔ᾊ䳴ት㗔ᱝ䙊ት㗔ᰶ᰾ት㗔བྷ⨶ት㗔
0.96 0.98
图 3 滇杨 7 个居群之间的 UPGMA 聚类图
߹ኡት㗔ѭ⊏ት㗔ᴢ䶆ት㗔
ᾊ䳴ት㗔ᱝ䙊ት㗔 ᰶ᰾ት㗔བྷ⨶ት㗔
图 4 滇杨 7 个居群的主坐标轴分析
根据 Evanno 等[31] 的方法确定最佳 K 值,滇
杨 7 个 居 群 的 Delta K 在 K=2 时 最 大(3.47),K=4
(2.71)和 K=6(1.97)时次之,分别对其进行聚类
(图 5),3 种 K 值的聚类结果基本一致,也与 PCoA
1
-14000
k=2
k=4
k=6
-12000
-10000
-8000
-6000
L K Delta K
2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1
1
2
3
2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
߹ኡት㗔 ѭ⊏ት㗔 ᴢ䶆ት㗔 ᾊ䳴ት㗔 ᱝ䙊ት㗔ᰶ᰾ት㗔 བྷ⨶ት㗔
图 5 滇杨 7 个居群的 Bayesian 分析
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2016,Vol.32,No.4164
3 讨论
SRAP 标记多态性高,产率中等,重复性好,
在基因组中分布均匀 ;较易对扩增得到的目的片段
进行测序 ;操作简单,其正向引物可以与反向引物
两两搭配组合,用少量的引物可以得到多个引物
对,引物的使用效率高,可降低实验成本,研究表
明,SRAP 标记比 AFLP、RAPD 等标记方式更能体
现表型的多样性及进化史 [33,34],其聚类结果要比
AFLP 更相似于形态学分析结果[19]。SRAP 标记已
广泛应用于遗传多样性分析,但在不同树种中扩增
得到的多态性各异,如紫铆( Butea monosperma)、
桑树(Morus)和石榴(Punica granatum)的多态带
百分率分别为 91.90%、78.41% 和 53.20%[35-37]。而
SRAP 标记在杨树遗传变异分析中的应用较少,还
处于起步阶段,郭丽琴等[19]、陈罡等[20]通过建立
和优化 SRAP-PCR 体系,为 SRAP 标记在杨树中的
应用奠定了科学基础,随后郭娟等[38]对比了 SRAP
和 EST-SSR 标记在美洲黑杨品种间遗传差异分析中
的结果,并认为 SRAP 标记更适合用于杨树亲缘关
系较近材料的分析。
遗传多样性是生物长期生存、进化和适应的结
果[39],研究遗传多样性,有利于合理保存和利用
基因资源[40]。在滇杨的研究中,纵丹等[41]采用
AFLP 分析 52 株滇杨优树的遗传多样性,其多态带
百分率为 64.52%,李里等[42]同样用 AFLP 标记对
采集于四川省和云南省的 56 株滇杨优树的遗传多
样性进行了分析,多态带百分率为 59.25%。本研
究中,滇杨的 SRAP 多态带百分率为 50%,略低于
AFLP 分析结果。与杨属其他树种相比,辽宁杨为
95.3%(SRAP)[20],美洲黑杨为 72.8%(SRAP)[43],
毛 白 杨 为 65.17%(AFLP)[44], 毛 果 杨 为 58%
(AFLP)[45],大青杨为 52%(RAPD)[46],胡杨为
49.2%(RAPD)[47],表明滇杨的遗传多样性水平中
等。同时,由于无性繁殖群体与近缘有性繁殖种
相 比 遗 传 多 样 性 较 低[39], 滇 杨 居 群 的 Nei’s 基
因 多 样 性 指 数 与 Shannon’s 信 息 指 数(H=0.1366,
I=0.2100)均低于无性繁殖与有性繁殖同时存在的苦
杨(P. laurifoli,SSR,H=0.3924,I=0.9185)和欧洲
黑杨(SSR,H=0.2187,I=0.3348)[48](表 5)。
表 5 分子标记揭示的杨属树种多态带百分率
树种 标记类型 多态带百分率 /% 文献
滇杨(P. yunnanensis)
SRAP 50.00 本研究
AFLP
64.52 [41]
59.25 [42]
辽宁杨(P. liaoningensis) SRAP 95.30 [20]
美洲黑杨(P. deltoides) SRAP 72.80 [43]
毛白杨(P. tomentosa) AFLP 65.17 [44]
毛果杨(P. trichocarpa) AFLP 58.00 [45]
大青杨(P. ussuriensis) RAPD 52.00 [46]
胡杨(P. euphratica) RAPD 49.20 [47]
遗传分化系数 Gst 为居群间变异与总变异的比
值,Nm 为居群间和居群内的遗传物质交流[49],二
者均为分析居群遗传结构的重要指标。Govindajaru
认为,Nm>1 则基因交流程度高,0.250则基因交流适中[50]。本研究中,丽江与曲靖居群
(Gst=0.226 8)、楚雄与昭通居群(Gst=0.201 0)遗
传分化系数低且 Nm 值大于 1,表明其变异主要来
自于居群内部且居群间存在较大的基因交流。然
而,上述各居群的地理位置相互间隔并不利于基因
交流,滇杨自身的无性繁殖方式和绿化造林及木材
生产等人为活动很可能是造成这种现象的主要原因。
滇杨是雌雄异株植物,但由于雄株比雌株更能适应
恶劣的环境条件[4,51-53],使滇杨林分基本由雄株组
成,雌株极为少见,在自然状态下多以根蘖方式繁
衍。生殖方式上的差异可以造成遗传分化系数 Gst
上近 40% 的变异,一般而言,自交种总的遗传变异
中有 51% 的变异存在于居群之间[54],其平均基因
流为 0.43[55]。本研究中滇杨居群间差异占总变异的
55.61%,基因流为 0.444 4,仅略高于自交种,而当
前滇杨的繁殖方式使其更接近于无性系植物,无性
系植物种群间基因流存在较大障碍时,居群间遗传
变异比例会大为增加[56]。由此推断,滇杨居群间差
异有继续增大的可能,即使居群相邻也会因基因交
流受阻而继续分化。滇杨现存林分以人工林为主,
人工繁殖主要通过大枝扦插来实现,致使人为因素
发挥了重要作用。丽江与曲靖居群、楚雄与昭通居
群,两对居群的地理距离较远而遗传相似度较高可
能也与此有关。
滇杨主要被用作行道树或民间自发地用于四旁
2016,32(4) 165颜璐茜等:滇杨遗传多样性的 SRAP分析
零散种植,栽种地域内的百姓根据自己的判断在有
限范围内选取本地优良单株采枝扦插繁殖[1],促使
滇杨在选取一定种源后仅在小范围内传播,缺乏居
群间的交流。同时,不科学的人工种植会造成遗传
上的高度同质化[57],降低滇杨的遗传多样性。因此,
保护滇杨的遗传多样性,构建核心种质并完善遗传
改良策略,是开发滇杨资源的必要环节。
4 结论
本研究利用 7 对 SRAP 引物组合从 7 个不同居
群的 208 个滇杨样本中共扩增出 146 条条带,多态
带百分率为 50%。滇杨居群间的遗传分化系数(Gst)
为 0.529 4,基因流(Nm)为 0.444 4,AMOVA 分析
结果表明居群间的变异占总变异的 55.61%,表明滇
杨的遗传变异主要存在于居群间,居群间基因交流
处于中等水平。UPGMA、PCoA 和 Bayesian 聚类分
析结果均显示丽江与曲靖居群、楚雄与昭通居群的
亲缘关系较近,Mantel test 结果表明滇杨居群间的遗
传距离与地理距离不相关。
参 考 文 献
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(责任编辑 马鑫)