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独行菜CBF基因的克隆及其植物表达载体的构建



全 文 :收稿日期:2011 - 12 - 02
基金项目:教育部科学技术研究重点项目(编号:209142) ;新疆维吾尔自治区重大科技专项项目科技支疆工程(编号:200840102)。
作者简介:赵琼珍(1987 -) ,女,硕士,主要从事植物逆境生理与分子生物学方面的研究。
通讯作者:李 群,女,副教授,硕士生导师;E-mail:liqun_007@ 126. com。
独行菜 CBF基因的克隆及其植物表达载体的构建
赵琼珍, 师秋菊, 李 群
(新疆大学生命科学与技术学院, 乌鲁木齐 830046)
摘要:本实验以新疆早春短命植物独行菜(Lepidiumapetalum Willd)为主要材料,利用聚合酶链式反应从独行菜中克隆了
CBF(C-repeatbinding factor)基因家族中的 CBF 3 基因和 CBF 4 基因,并将其成功构建到带有 35 S + Ω 的植物表达载体
pCAMBIA 2300 中,为进一步转化拟南芥以了解独行菜 CBF基因的结构和功能奠定了基础。
关键词: 独行菜;CBF;克隆;表达载体
中图分类号: Q 781 文献标志码: A 文章编号:1001 - 4705(2012)04-0004-03
Cloning and Plant Expression Vector Construction of
Transcription Factor CBF Gene in Lepidiumapetalum Willd
ZHAO Qiong-zhen,SHI Qiu-ju,LI Qun
(College of Life Science and Technology,Xingjiang University,Urmuqi 830046,China)
Abstract:The experiment had cloned CBF 3 and CBF 4 genes by PCR technique from the plants of Lepidiuma-
pet-alum Willd. Then connected the gene into the plant expression vector pCAMBIA 2300 which had 35 S +Ω.
Basic above all,the experiment had been successfully constructed the plant expression vector which was suit-
able for the Arabidopsis thaliana transformation. It was a foundation that for next step to learn about the struc-
ture and function of the cbf gene of Lep-idiumapetalum Willd.
Key words: Lepidiumapetalum Willd;CBF;clone;plant expression vector
新疆早春短命植物主要分布于新疆干旱和半干旱
地区,利用早春雨雪水进行萌发生长,在 4 ~ 6 月迅速
完成生活周期,并以种子形式渡过不良环境的特殊植
物类群[1]。目前对早春短命植物研究主要集中在植
物区系[2]、植物地理[3]、物候学[4]、生态生物学[4]、生
殖生态学[5]以及短命植物生长与环境的关系[6]等方
面,而对其适应低温的生理与分子机制的研究报道较
少,尤其对短命植物耐受早春低温分子机制的研究尚
未见报道。
低温是影响植物地理分布以及产量的一个重要的
环境胁迫因子。温带植物经过非冰冻低温胁迫后其抗
冻能力得到增加,这种现象称为“低温驯化”[7]。在低
温驯化的过程中导致植物发生多种生理、生化以及分
子水平上的变化。包括抗氧化机制的上调,低温防护
溶质和蛋白的合成和积累,细胞膜成分发生改变[7,8]。
这些生理、生化、分子水平的变化主要是由于植物在低
温胁迫的条件下基因表达发生了改变。因此低温对转
录组的激活以及对基因表达的抑制成了低温影响植物
的关键[9]。CBF 转录激活因子在其中起关键性的调
节作用。最近,基因组学和代谢组学的研究表明,CBF
冷响应途径在植物低温响应中占主导地位。
独行菜(Lepidiumapetalum Willd)属十字花科独行
菜属植物,分布广泛,我国南北各省均有分布,多生于
路旁、荒地、屋旁及田间。生活在新疆北部的独行菜属
于比较典型的早春短命植物类型[10]。孟君发现,独行
菜种子在 4 ℃的条件下不能萌发[10]。赵惠新认为,独
行菜种子不能耐受 4 ℃低温萌发,原因可能是在露白
前存在一个关键的生理阶段,在 4 ℃胁迫逆境中不能
越过这个阶段,该阶段之前与之后的萌发过程都能耐
受 4 ℃低温,因此对低温胁迫有良好的耐受性[12]。基
于短命植物独行菜对低温耐受以及具有模式植物的特
点,本实验利用 PCR技术从早春短命植物拟南芥中成
功同时克隆了 CBF基因家族的两个 CBF基因,并构建
到带有 35 S + Ω 的植物表达载体 pCAMBIA 2300 中,
为进一步转化拟南芥以了解独行菜 CBF 基因的结构
和功能奠定了基础。
·4·
第 31 卷 第 4 期 2012 年 4 月 种 子 (Seed) Vol. 31 No. 4 Apr. 2012
DOI:10.16590/j.cnki.1001-4705.2012.04.042
上排:拟南芥 CBF 3 cDNA;下排:独行菜 CBF 3 cDNA。
图 3 CBF 3 基因序列对比图(同源性 86. 18%)
1 材料和方法
1. 1 材 料
1. 1. 1 植物材料及菌种来源
独行菜种子,质粒 pCAMBIA 2300、大肠杆菌
DH 5 a及根癌农杆菌菌株 EHA 105 均由本实验室
保存。
1. 1. 2 供试试剂
Taq酶、dNTP购自天根公司;DNA 凝胶回收试剂
盒购自鼎国公司;各种限制性内切酶、pMD 18-T 载体
及 T 4 DNA连接试剂盒均购自 TaKaRa 公司;其他试
剂均为国产分析纯产品。引物由华大基因公司合成。
1. 2 方 法
1. 2. 1 独行菜基因组 DNA的提取
取独行菜幼嫩叶片 0. 5 g,采用改良的 CTAB
法[13]提取独行菜叶片总 DNA。
1. 2. 2 CBF基因的克隆
根据 NCBI GenBank 已报道的 CBF 基因的序列,
利用 DNAMAN生物软件设计 CBF的简并引物,CBF 5
端:ATGAMCTCAKTTTCWRCBTTYTC;CBF 3'端 YTAR-
TAACTCCARAGSGAYAYG,引物由华大基因公司合
成。以独行菜总 DNA 为模板,用简并引物进行 PCR
扩增。反应程序为:95 ℃,5 min;94 ℃,30 s;58 ℃,
40 s;72 ℃,50 s;30 个循环;72 ℃,7 min;4 ℃保存。扩
增产物经 1%琼脂糖凝胶电泳后用 DNA 胶回收试剂
盒回收,然后与克隆载体 pMD 18-T连接。将连接产物
转入大肠杆菌 DH 5 a,并在含有 50 mg /L Amp 的 LB
固体培养基上筛选,对重组子进行 PCR 鉴定,将阳性
克隆子送往大基因公司测序,DNAMAN 软件分析序列
同源性。
1. 2. 3 植物表达载体的构建
用 Sac 1 和 Pst 1 双酶切 pCAMBIA 2300 和 pMD
18-T-CBF 3,pMD 18-T-CBF 4,回收目的片段后经 T 4
DNA 连接酶连接,得到重组质粒 pCAMBIA 2300::
CBF 3,pCAMBIA 2300::CBF 4,转化大肠杆菌 DH 5 a,
在含 50 mg /L Kan的 LB固体培养上筛选重组子,进一
步采用 PCR 检测和酶切鉴定确定阳性克隆子,采用
SDS碱裂解法中量提取重组质粒 pCAMBIA 2300::
CBF 3 和 pCAMBIA 2300::CBF 4,采用冻融法将其质
粒导入根癌农杆菌 EHA 105 中。
2 结果与分析
2. 1 CBF基因的克隆与鉴定
采用简并引物进行 PCR扩增的产物经 1%的琼脂
糖凝胶电泳后得到 650 bp 特异性强的 DNA 条带,与
预期结果相符(图 1)。将该片段连接到克隆载体 pMD
18-T后,用简并引物进行 PCR 鉴定(图 2) ,得到 650
bp左右的 DNA片段;实验结果与预期结果一致,证明
CBF基因目的片段已经成功克隆到 pMD 18-T载体上。
1 为阴性对照;2 ~ 5 为 PCR扩增产物;6 为 Marker。
图 1 CBF基因片段的 PCR扩增
1 ~ 9 为 9 个不同的克隆;10 为 Marker。
图 2 兼并引物 PCR鉴定阳性克隆
2. 2 CBF基因的序列分析
阳性克隆子经测序分析,其中一个克隆子长度为
662 bp,与拟南芥 CBF 4 基因同源性为 83. 48% (图
3) ,另一个克隆子长度为 648 bp,与拟南芥 CBF 3 基因
同源性为 84. 40% (图 4)。兼并引物能同时扩增出
CBF基因家族中的两条不同 CBF基因,这与 CBF基因
家族具有高度的同源性有关。
·5·
研究报告 赵琼珍 等:独行菜 CBF基因的克隆及其植物表达载体的构建
2. 3 植物表达载体 pCAMBIA 2300::CBF 3 /CBF 4 的构建
上排:拟南芥 CBF 4 cDNA;下排:独行菜 CBF 4 cDNA。
图 4 CBF 4 基因序列对比图(同源性 83. 48%)
用 PCR 和酶切检
测所构建的植物表达载
体 pCAMBIA 2300::
CBF 3 /CBF 4 构建的正
确 性。在 表 达 载 体
pCAMBIA 2300::CBF
3 /CBF 4 上有 Sac 1 和
Pst 1 两个酶切位点,用
Sac 1 和 Pst 1 进行双酶切应得到两个片段,一个为
CBF基因 650 bp,另外一个为 pCAMBIA 2300 8. 7 kb。
从图 5 酶切电泳检测的结果来看,与预测的结果一致,
证明所构建的 pCAMBIA 2300::CBF 3 /CBF 4 表达载
体正确,可用于今后的遗传转化。
M:Marker;1:质粒 pCAMBIA 2300;2:Sac1 和 Pst1 双酶切 pCAMBIA 2300
条带;3:Sac 1 和 Pst 1 双酶切 pCAMBIA2300-CBF3 条带;4:Sac 1 和 Pst 1
双酶切 pCAMBIA 2300-CBF 4 条带。
图 5 pCAMBIA 2300::CBF 3 /CBF 4 酶切鉴定
3 讨论与结论
CBF基因家族成员在植物抗旱、抗寒及抗盐碱方
面可能起着很大的作用,其中 CBF 1,CBF 2,CBF 3 基
因均受低温诱导表达,CBF 4 受干旱和 ABA 诱导表
达,而且目前对 CBF 家族成员的研究集中在 CBF 1,
CBF 2 和 CBF 3 基因,而对 CBF 4 基因的研究相对较
少。利用 35 S组成型启动子使 CBF 4 过量表达,能引
起 COR 15 a及 COR 78 a的组成型表达,而这两个基因
是与抗寒性和抗旱性有关,结果使 CBF 4 转基因拟南
芥的抗寒性和抗旱性都大大提高,本实验以新疆典型
的早春短命植物独行菜 DNA为模板,用筛选出的 CBF
兼并引物对其进行 PCR扩增,得到了 650 bp左右的片
段,通过 PCR和酶切鉴定后进行 DNA测序,结果得到
两条不同的 DNA序列,其中一条序列与拟南芥 CBF 3
的同源性最高达到 86. 18%,另一条序列与拟南芥
CBF 4 基因的同源性最高达到 83. 48%,因此初步确定
这两个序列分别是 CBF 3 基因和 CBF 4 基因,这是因
为 CBF家族具有很高的同源性,因此用兼并引物同时
扩增出 CBF家族中的两条基因,正是因为 CBF基因家
族本身具有高度的同源性,同时也需要做进一步的实
验来验证其功能。因此本实验构建了适于拟南芥农杆
菌遗传转化的表达载体,为进一步验证这 2 个基因的
功能奠定了基础,同时也为下一步利用 CBF 3 基因、
CBF 4 基因快速培育耐逆性强的新品种奠定了基础。
参考文献:
[1]新疆莫索湾地区短命植物的初步研究[J].植物生态学与地
植物丛刊,1985,9(3) :213 - 221.
[2]毛祖美,张佃民.新疆北部早春短命植物区系纲要[J].干旱
区研究,1994,11(3) :1 - 26.
[3]钱亦兵,吴兆宁,张立运,等.古尔班通古特沙漠短命植物的
空间分布特征[J].科学通报,2007,52(19) :2 299 - 2 306.
[4]王烨.新疆早春短命及类短命植物的物候观测[J].干旱区
研究,1993,10(3) :34 - 39.
[5]潘伟斌,黄培祐.四种短命植物若干生物学生态学特性的研
究[J].植物生态学报,1995,19(1) :85 - 91.
[6]马生军,谭敦炎.短命植物甘新念珠芥和宽翅菘蓝的物候与
性表达特征[J].生态学报,2007,27(2) :486 - 496.
[7]Thomashow MF. PLAMT COLD ACCLIMATION:Freezing tol-
erance genes and regulatory mechanisms. Annu Rev Plant Phys-
iol Plant Mol Biol. 1999,50:571 - 599.
[8]Chinnusamy V,Zhu J,Zhu JK. Cold stress regulation of gene
expression in plants[J]. Trends Plant Sci. 2007,12:444 -
451.
[9]Zhu J,Dong C-H,Zhu J-K. Interplay between cold-responsive
gene regulation,metabolism and RNA processing during plant
cold acclimation [J]. Curr Opin Plant Biol. 2007;10:
290 - 295.
[10]袁祯燕,多力坤·买买提玉素甫,黄培佑. 早春短命植物
独行菜天然种衣与水分的关系[J]. 种子,2006,25(9) :
1 - 3.
[11]孟君,李群,李冠.两种独行菜种子萌发生理特性研究[J].
生物技术,2008,18(2) :32 - 35.
[12]赵惠新,李群,周晶,等.短命植物独行菜种子萌发过程对
低温的耐受特性[J]. 云南植物研究,2010,32(5) :448 -
454.
[13]王富荣,赵剑波,章镇,等. 适于 AFLP 分析用的桃成熟叶
片 DNA提取方法[J].果树学报,2006,23(4) :638 - 641.
·6·
第 31 卷 第 4 期 2012 年 4 月 种 子 (Seed) Vol. 31 No. 4 Apr. 2012