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Purification of GST-TRAF6 Fusion Proteins from Inculsion Body Expressed in E. coli

一种从大肠杆菌包涵体中分离纯化GST-TRAF6融合蛋白的方法



全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2014年第8期
收稿日期 : 2014-01-23
基金项目 :国家自然科学基金项目(81101220),天津市应用基础与前沿研究计划项目(12JCQNJC08100),“十二五”天津市中青年骨干创
新人才支持计划,天津市教委高等学校科技发展基金计划项目(20130624)
作者简介 :张西轩,男,硕士研究生,研究方向 :病原微生物与基因工程 ;E-mail :xixuanzhang@163.com
通讯作者 :阮海华,博士,副教授,研究方向 :病原微生物与基因工程 ;E-mail :ruanhaihua@tjcu.edu.cn
一种从大肠杆菌包涵体中分离纯化 GST-TRAF6
融合蛋白的方法
张西轩  李晔  张振奇  董世瑞  赵培  阮海华
(天津商业大学 天津市食品生物技术重点实验室 生物技术与食品科学学院,天津 300134)
摘 要 : 利用 8 mol/L 尿素溶液对表达在大肠杆菌包涵体中的 GST-TRAF6 融合蛋白进行变性,通过逐级稀释复性的方法对
尿素溶解后的 GST-TRAF6 融合蛋白进行复性,将复性后的 GST-TRAF6 融合蛋白进一步利用谷胱甘肽琼脂糖树脂亲和层析的方法
进行分离纯化,将分离纯化后的蛋白通过 Western blot 方法进行验证,最后利用体外泛素化反应检测经包涵体变性、复性和纯化
后的 GST-TRAF6 融合蛋白的生物学活性。经过包涵体变性、梯度稀释复性和谷胱甘肽琼脂糖树脂亲和层析 3 个步骤后纯化得到纯
度达 90% 以上、浓度为 396 ng/μL 的蛋白质溶液。利用 GST 蛋白作为对照,经 Western blot 验证表明,纯化得到的蛋白确为 GST-
TRAF6 融合蛋白。进一步利用体外泛素化反应分析其泛素连接酶活性发现,17 ng/μL 浓度的 GST-TRAF6 融合蛋白能够以泛素分子
作为底物在 5 min 内快速催化自由泛素链的生成。结果表明,表达在大肠杆菌包涵体中的 GST-TRAF6 融合蛋白经尿素变性溶解后
能够成功复性并分离纯化,在溶解性改变的同时恢复了其泛素连接酶活性。为从大肠杆菌包涵体中大规模分离纯化蛋白质提供了
一种新的复性方法。
关键词 : TRAF6 蛋白纯化 包涵体复性 重组蛋白
Purification of GST-TRAF6 Fusion Proteins from
Inculsion Body Expressed in E. coli
Zhang Xixuan Li Ye Zhang Zhenqi Dong Shirui Zhao Pei Ruan Haihua
(Tianjin Key Laboratory of Food Science & Biotechnology,College of Biotechnology & Food Science,
Tianjin University of Commerce,Tianjin 300134)
Abstract:  There was only a minor fraction of GST-TRAF6 fusion proteins were observed soluble when expressed in E.coli. Most of
the GST-TRAF6 fusion proteins were present in the inclusion body, in which the expressed proteins aggregate and exist in inactive. To obtain
GST-TRAF6 fusion protein in a high yield and high purity, a method to purify the GST-TRAF6 fusion proteins from inclusion body without
any loss of its bioactivity was constructed. Firstly, the inclusion body was denatured with 8 mol/L urea. Secondly, the GST-TRAF6 fusion
protein in inclusion body were gradually solubilized by gradient dilution renaturation. Once the GST-TRAF6 fusion protein was fully dissolved
in renaturation solution, it was conventional to purify the GST-TRAF6 fusion protein with glutathione sepharose 4B. The specificity and the
bioactivity of the purified GST-TRAF6 fusion protein were testified by western blot and in vitro ubiquitination assay, respectively. The results
indicated that GST-TRAF6 fusion protein were successfully solubilized by gradient dilution renaturation following the denaturation of 8 mol/L
urea, the concentration of the purified GST-TRAF6 fusion protein was achieved a concentration of 396 ng/μL with a purity over 90%. The
specificity of this GST-TRAF6 fusion proteins were identified with anti-GST western blot. In vitro ubiquitination assay indicated that the GST-
TRAF6 fusion protein in a concentration of 17 ng/μL could rapidly catalyze the formation of free ubiquitin chains within 5 minutes. In conclusion,
it was found that the GST-TRAF6 fusion protein could be successfully renatured with the method of gradient dilution renaturation with the
recovery of its capability of ubiquitin ligase. This results would supply a useful method for the large-scale purification of proteins from inclusion
body when expressed in E. coli.
Key words:  TRAF6 Protein purification Inclusion body renaturation Recombinant protein
2014年第8期 183张西轩等 :一种从大肠杆菌包涵体中分离纯化 GST-TRAF6 融合蛋白的方法
肿瘤坏死因子受体相关因子(Tumornecrosis fac-
tor receptor-associated factors,TRAFs)是肿瘤坏死因
子(Tumornecrosis factor,TNF)超家族和 Toll 样 / 白
细胞介素 -1 受体(toll/IL-1 receptor,TIR)超家族重
要的接头分子,在天然免疫和获得性免疫中发挥
重要作用[1,2]。TRAFs 包括 7 个密切相关的蛋白
(TRAF1-7),其中 TRAF6 是脂多糖(Lipopolysacch-
aride,LPS)、TIR 和 TNF(Tumor necrosis factor)等
刺激信号的下游分子[3-5]。TRAF6 含有 C 端 TRAF
结构域和 N 端激活结构域,可以和多种激酶结合[6]。
其中,其 N 端激活结构域包括一个 RING 型泛素连
接酶(ubiquitin ligase enzyme,E3)结构域,该结构
域具有泛素连接酶活性,可在泛素结合酶(ubiquitin-
conjugating enzyme,E2)UbcH5c 的介导下催化自由
泛素分子形成多聚泛素链[7,8]。研究表明,TRAF6
与炎症、骨代谢、乳腺发育、淋巴结的形成密切相关,
参与免疫性疾病、骨髓瘤、急性胰腺炎、前列腺癌
等疾病的病理机制,在细胞的生长、发育以及疾病
过程中发挥重要的作用[9]。孙利等[10]在大肠杆菌
中诱导了 GST-TRAF6 融合蛋白的表达,并利用谷胱
甘肽琼脂糖树脂纯化到了该融合蛋白。但是,大肠
杆菌中表达的 GST-TRAF6 融合蛋白只有少部分重组
蛋白是可溶的,大部分的重组蛋白在大肠杆菌表达
过程中主要以包涵体的形式存在。较低的蛋白可溶
性降低了 GST-TRAF6 融合蛋白的纯化效率以及重组
蛋白的纯化总量,因此,在孙利等[10]的研究成果
基础上,本研究运用了一种从包涵体中复性并分离
纯化 GST-TRAF6 融合蛋白的方法,以期获得更高产
量更高纯度的 GST-TRAF6 融合蛋白,降低纯化成本,
并为今后进一步研究 TRAF6 蛋白的结构与功能打下
坚实的基础。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌株与质粒 E.coli DH5α、E.coli BL21(DE3)
感受态细胞购自美国 Promega 公司 ;pGEX-6P-2 原
核表达载体购自 GE Healthcare 公司。
1.1.2 酶 与 试 剂 辣 根 过 氧 化 物 酶(HRP) 偶 联
羊抗小鼠二抗、辣根过氧化物酶(HRP)偶联羊
抗 兔 二 抗、γ-ATP 购 自 美 国 Promega 公 司 ;兔 源
TRAF6 抗体(α-TRAF6 Cat :sc-7221)、鼠源泛素抗
体(α-Ub,Cat :sc-8017) 购 自 美 国 Santa Cruz 公
司 ;HeLa 细 胞 cDNA 文 库(Cat :YJ0001) 购 自 上
海英基生物科技有限公司 ;琼脂糖、尿素、DTT、
Triton X-100、IPTG、PMSF 购自美国 Amresco 公司 ;
Bgl Ⅱ、BamH Ⅰ和 Xho Ⅰ限制性内切酶、T4 DNA
连 接 酶、Pfu DNA 聚 合 酶、dNTP、DNA Marker 购
自日本 TaKaRa 公司 ;PCR 及酶切产物纯化试剂盒、
质粒 DNA 提取试剂盒购自中国北京天根公司 ;预
染蛋白 Marker 购自美国 Thermo 公司 ;超滤浓缩管、
泛 素 激 活 酶 E1(Cat :14-857)、UbcH5c(Cat :23-
035)、ECL 化学发光试剂盒购自美国 Millipore 公司;
X 光片购自美国 Kodak 公司 ;Ubiquitin 蛋白由西南
大学李洪涛教授提供 ;引物合成以及测序由上海英
骏生物技术有限公司完成。
1.2 方法
1.2.1 TRAF6 基因的克隆与原核表达载体的构建
以 HeLa 细胞 cDNA 文库为模板,上游引物序列为
5-CGAGATCTATGAGTCTGCTAAACTGTGAAAAC-3
(下划线为 Bgl Ⅱ酶切位点),下游引物序列为 5-G-
CCTCGAGCTATACCCCTGCATCAGTAC-3(下划线为
Xho Ⅰ酶切位点),以 58℃作为退火温度进行 PCR
扩增,将 PCR 产物回收后分别用 Bgl Ⅱ和 Xho Ⅰ
双酶切并回收产物。同时利用 BamH Ⅰ和 Xho Ⅰ
双酶切 pGEX-6p-2 空载体,回收并将其与酶切后
的 TRAF6 片段进行连接。将连接产物转入 DH5α 大
肠杆菌感受态细胞,在氨苄青霉素抗性平板上挑取
单克隆并抽提质粒。其中,由于 TRAF6 基因片段
上第 31-36 位碱基间为 BamH Ⅰ位点,因此在设计
TRAF6 上游引物时选择了 BamH Ⅰ的同尾酶 Bgl Ⅱ
作为酶切位点,而对候选阳性重组质粒的酶切鉴
定采用 BamH Ⅰ和 Xho Ⅰ两个酶切位点,将阳性
pGEX-6P-2-TRAF6 重组质粒送上海英骏生物技术有
限公司进行 DNA 测序。测序正确的阳性克隆用于之
后的质粒转化和蛋白的诱导表达。
1.2.2 TRAF6 在大肠杆菌中的诱导表达 将 pGEX-
6P-2-TRAF6 重组质粒转化至大肠杆菌 BL21(DE3),
挑取单克隆至 5 mL LB(含 100 μg/mL 氨苄青霉素)
液体培养基中,并于 37℃、220 r/min 振荡培养过夜。
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2014年第8期184
将过夜培养物接入 1 L LB(含 100 μg/mL 氨苄青霉
素)液体培养基中,并于 37℃、220 r/min 振荡培养
至 OD600=0.6-0.8 之间。将培养物降温至 20℃左右后
加入终浓度为 0.5 mmol/L 的 IPTG,20℃、220 r/min
振荡培养过夜 ;收集菌液,室温下 8 000 r/min 离心
30 min ;弃上清,保留沉淀 ;取 10 μL 离心后菌体用
90 μL 无菌水重悬,加入 100 μL 2×SDS 上样缓冲液
混匀,煮沸 5-10 min 后离心,进行 SDS-PAGE,观
察全菌蛋白的表达情况 ;以未经 IPTG 诱导的菌为阴
性对照。
1.2.3 包涵体蛋白的变性、复性与纯化 将上述
收集的菌体利用 50 mmol/L Tris-HCl pH8.0 内含 150
mmol/L NaCl、1 mmol/L PMSF 的缓冲溶液于冰上进
行超声破碎,超声 3 s、间隔 7 s,超声约 100 次至
悬 液 半 透 明 ;于 14 000 r/min 转 速 下 低 温 离 心 30
min,将离心后的上清弃掉,用破碎缓冲重悬沉淀并
将悬液再次于 14 000 r/min 转速下低温离心 30 min,
沉淀即为包涵体部分。为了去除包涵体中的部分杂
蛋白,首先对包涵体进行洗涤,洗涤液的组成为 50
mmol/L Tris-HCl pH8.0,内含 2 mol/L 尿素、1 mmol/L
EDTA、0.5% Triton X-100、0.1 mol/L NaCl 以 及 10
mmol/L DTT,14 000 r/min 转速下低温离心 10 min,
离心后收集沉淀。将洗涤后的包涵体利用变性液(50
mmol/L Tris-HCl pH8.0,含 8 mol/L 尿素、20 mmol/L
DTT)进行变性溶解 ;将溶解后的包涵体溶液利用
复 性 液(50 mmol/L Tris-HCl pH8.0, 含 0.5 mmol/L
EDTA、50 mmol/L NaCl、5% glycerol、1 mmol/L
DTT)按照 2 倍的梯度进行稀释复性,直至稀释到
尿素终浓度达到 0.5 mol/L ;最后利用截留分子量为
3 kD 的超滤浓缩管浓缩复性后的溶液。浓缩后的复
性溶液与适量的谷胱甘肽琼脂糖树脂匀浆混合,4℃
轻摇 30 min ;于 500 r/min 离心 5 min 后弃上清 ;沉
淀加入 10 倍柱床体积的漂洗液,即 50 mmol/L Tris-
HCl(pH8.0)溶液反复颠倒混匀以洗去未与谷胱甘
肽琼脂糖树脂结合的杂蛋白,4℃、500 r/min 离心 5
min 后弃上清,继续用漂洗液重复洗涤谷胱甘肽琼
脂糖树脂 3 次 ;加入等柱床体积的洗脱缓冲液(50
mmol/L Tris-HCl pH8.0,内含 10 mmol/L GSH)重悬
树脂,室温孵育 10 min 后于 500 r/min 离心 5 min,
保留上清 ;再用等体积的洗脱缓冲液洗脱并离心后
合并 2 次所得上清,即为纯化得到的 GST-TRAF6 融
合蛋白 ;取 100 μL 该蛋白溶液与等体积 2×SDS 上
样缓冲液混匀,煮沸 5-10 min 后离心,进行 SDS-
PAGE,观察蛋白纯化情况。
1.2.4 GST-TRAF6 融合蛋白的 Western blot 检测 将
纯化得到的 GST-TRAF6 融合蛋白样品稀释至终浓度
为 10 ng/μL,取 20 μL 稀释后的蛋白与等体积 2×SDS
上样缓冲液混匀,煮沸 5-10 min 后离心,进行 SDS-
PAGE 电泳后利用半干法转印至 PVDF 膜,转印条件
为 23 V 1 h ;将转印后的 PVDF 膜于 5% 的脱脂奶粉
中封闭 1 h,将兔源 TRAF6 抗体按照 1∶1 000 的比
例稀释后于 4℃下孵育 PVDF 膜过夜 ;次日,TBST
溶液润洗 PVDF 膜 3 次,每次 15 min ;将润洗干净
的 PVDF 膜于室温下用辣根过氧化物酶标记的羊抗
兔 IgG 二抗(稀释比例 1∶5 000)孵育 1 h,TBST
溶液分别润洗 3 次后进行 ECL 化学发光检测,并用
X 光片压片。
1.2.5 GST-TRAF6 融 合 蛋 白 泛 素 连 接 酶 活 性 检
测 泛素连接酶活性测定采用 Yang 等[7]的方法,
30 μL 反应体系包含 50 mmol/L Tris-HCl(pH7.4),2.5
mmol/L MgCl2,50 ng 泛素激活酶 E1,300 ng 泛素结
合酶 UbcH5c,500 ng GST-TRAF6,1 μg 泛素,最后
加入终浓度为 2 mmol/L 的 γ-ATP 启动泛素化反应。
反应温度是 37℃,至 5、10 和 20 min 时分别从反应
体系中吸取 10 μL 反应液并迅速加入 10 μL 2×SDS
载样缓冲终止反应,煮沸 5-10 min 后离心,利用
12.5% SDS-PAGE 进行电泳分离,Western blot 方法
同 1.2.4,一抗为鼠源泛素抗体(稀释倍数 1∶1 000),
二抗为辣根过氧化物酶偶联羊抗小鼠 IgG(稀释倍
数 1∶5 000)。
2 结果
2.1 TRAF6 基因的扩增
TRAF6 是一个包括 522 个氨基酸的具有泛素连
接酶活性的蛋白质。利用 TRAF6 基因特异性引物从
HeLa 细胞 cDNA 文库中以 58℃作为退火温度扩增
TRAF6 基因片段,PCR 扩增产物经 1% 琼脂糖凝胶
电泳检测,在预期的位置(1 569 bp)上出现一条特
异带(图 1)。
2014年第8期 185张西轩等 :一种从大肠杆菌包涵体中分离纯化 GST-TRAF6 融合蛋白的方法
2.2 pGEX-6P-2-TRAF6 重组克隆质粒的构建
以限制性核酸内切酶 BamH Ⅰ和 Xho Ⅰ对重组
质粒进行双酶切后得到一条与预期条带大小一致的
DNA 片 段(1 533 bp)( 图 2), 表 明 pGEX-6P-2 载
体上成功插入了 TRAF6 目标基因片段,初步推断质
粒构建成功。经 DNA 测序鉴定后挑取测序正确的阳
性 pGEX-6P-2-TRAF6 质粒转化至大肠杆菌表达菌株
BL21(DE3)中。
在上清和沉淀中均含有表达的 GST-TRAF6 融合蛋
白(图 3 泳道 3 和泳道 4),但是通过比较上清和沉
淀样品中 GST-TRAF6 融合蛋白的条带粗细情况可以
看出,上清液中 GST-TRAF6 融合蛋白的含量远远低
于包涵体中 GST-TRAF6 融合蛋白的含量,大部分的
GST-TRAF6 融合蛋白在沉淀中以包涵体的形式存在
(图 3 泳道 4),仅有少量的蛋白可溶性地存在于离
心后的上清溶液中(图 3 泳道 3)。
bp
M 1
bp
2000
1569
1000
750
500
250
100
M :DNA Marker ;1 :TRAF6 扩增片段
图 1 TRAF6 基因 PCR 扩增产物琼脂糖凝胶电泳结果
2.3 GST-TRAF6融合蛋白的诱导表达以及可溶性
检测
在 20℃温度条件下利用 IPTG 诱导重组菌表达
后发现与未诱导的大肠杆菌相比,0.5 mmol/L IPTG
处理诱导了一条分子量介于 72-96 kD 间的蛋白质的
表达,该诱导蛋白的分子量与预期的 GST-TRAF6 融
合蛋白的分子量(26 kD+62 kD)相近(图 3 泳道 1
和泳道 2)。据此推测,利用 0.5 mmol/L IPTG 成功
诱导了 GST-TRAF6 融合蛋白在大肠杆菌中的表达。
将大肠杆菌进行超声破碎后,分别取上清和沉淀进
行 SDS-PAGE 电泳,考马斯亮蓝染色、脱色后发现
bp
M 1
bp
2000 1533
1000
750
M :DNA Marker ;1 :pGEX-6P-2-TRAF6
图 2 双酶切鉴定重组质粒 pGEX-6P-2-TRAF6
kD
M 1 2 3 4
170
GST-TRAF6
130
96
72
55
43
34
26
17
M :Protein Marker ;1 :诱导前 ;2 :0.5 mmol/L IPTG 诱导后 ;3 :破菌后上清 ;
4 :破菌后沉淀
图 3 GST-TRAF6 融合蛋白的诱导表达以及可溶性检测的
SDS-PAGE 电泳
2.4 包涵体中GST-TRAF6融合蛋白的变性、复性
与纯化
通过对大肠杆菌包涵体利用洗涤液洗涤后进
行 SDS-PAGE 电泳(图 4 泳道 1)检测发现,GST-
TRAF6 融合蛋白含量约占包涵体中总蛋白含量的
75% 以上。将溶解后的包涵体溶液利用复性液以 2
倍的梯度进行缓慢稀释复性,稀释的过程中肉眼可
以观察到没有蛋白质沉淀析出,当该蛋白溶液被复
性液稀释至尿素终浓度为 0.5 mol/L(相当于稀释 16
倍)的浓度时,GST-TRAF6 融合蛋白仍然保持可溶。
将复性后的溶液进一步利用截留分子量为 3 kD 的超
滤浓缩管浓缩 10 倍后进行 SDS-PAGE 电泳检测,结
果(图 4 泳道 2)显示,虽然有部分 GST-TRAF6 融
合蛋白发生降解,但是仍有大量结构完整的 GST-
TRAF6 融合蛋白。
将浓缩后的 GST-TRAF6 融合蛋白利用谷胱甘肽
琼脂糖树脂进行亲和层析纯化,润洗去除杂蛋白后
最终用 10 mmol/L 还原型谷胱甘肽溶液进行目标蛋
白的洗脱,将洗脱后的蛋白进行 SDS-PAGE 电泳检
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2014年第8期186
测,结果(图 4 泳道 3)显示,成功纯化到了预期
的目标蛋白,仅有一条微弱的杂带存在,纯化蛋白
纯度达到 90% 以上。表明利用亲和层析法成功纯化
得到目标蛋白,通过对纯化蛋白的浓度进行测定后
发现,纯化得到的目标蛋白的浓度达到 396 ng/μL。
TRAF6 融合蛋白的泛素连接酶活性。泛素化反应结
果(图 6)显示,与 0 min 未发生反应的泛素底物(Ub1)
相比,体外泛素化反应进行 5、10 及 20 min 时均催
化了自由泛素链的生成,包括泛素二聚体(Ub2)、
泛素三聚体(Ub3)、泛素四聚体(Ub4)以及泛素多
聚体(Ubn)。而且从图 6 中可以看出,泛素化反应
进行 5、10 及 20 min 时自由泛素链的生成情况基本
一致,表明 17 ng/μL 浓度的 GST-TRAF6 融合蛋白在
5 min 内即迅速完成了自由泛素链的生成。
kD
M 1 2 3
170
GST-TRAF6
130
96
72
55
M :Protein Marker ;1 :8 mol/L 尿素溶解后包涵体全蛋白 ;2 :梯度稀释复性
后经 3 kD 浓缩管浓缩后的全蛋白 ;3 :谷胱甘肽琼脂糖树脂纯化后的 GST-
TRAF6 融合蛋白
图 4 纯化后的 GST-TRAF6 融合蛋白 SDS-PAGE 电泳结果
2.5 GST-TRAF6融合蛋白的Western blot检测
为了进一步验证纯化的蛋白确为 GST-TRAF6 融
合蛋白,将纯化得到的蛋白稀释至 10 ng/μL 后,取
5 μL 进行 Western blot 分析,同时利用等量的 GST
蛋白作为对照。结果(图 5)显示,利用 GST 抗体
作为一抗成功地将作为对照的 GST 蛋白以及纯化的
目标蛋白检测出来,表明本研究中纯化的蛋白确为
目标 GST-TRAF6 融合蛋白。
kD 1 2
GST-TRAF6
GST
α-GST
130
96
72
55
43
34
26
1 :GST ;2 :GST-TRAF6
图 5 GST-TRAF6 融合蛋白 Western blot 检测
kD 1 2 3 4
170
Ub n 1309672
55
43
34
26
17
10
α-Ub
Ub4
Ub3
Ub2
Ub1
1-4 :泛素化时间分别为 0、5、10 和 20 min
图 6 GST-TRAF6 融合蛋白催化自由泛素链生成的
Western blot 检测
2.6 GST-TRAF6融合蛋白泛素连接酶活性检测
为了验证包涵体中的 GST-TRAF6 融合蛋白经
过变性、复性步骤后是否具有与天然蛋白一致的酶
催化活性,本研究通过体外泛素化反应检测 GST-
3 讨论
孙利等[10]曾利用 pGEX-4T-2 质粒作为表达载
体在大肠杆菌中表达 GST-TRAF6 融合蛋白,将大肠
杆菌超声破碎后在可溶性上清中纯化该融合蛋白。
与本研究的结果相类似,孙利等[10]的研究结果表
明在大肠杆菌中表达的 GST-TRAF6 融合蛋白只有少
部分以可溶的形式存在,大部分的融合蛋白以不溶
的形式存在于破菌后的沉淀即包涵体中。基于此,
本试验在该研究的基础上,利用 pGEX-6P-2 作为表
达载体在大肠杆菌中表达,并在大肠杆菌包涵体中
分离纯化 GST-TRAF6 融合蛋白的方法。
众所周知,在大肠杆菌中表达重组蛋白的过程
中由于缺乏某些蛋白质折叠的辅助因子或环境不适,
无法形成正确的次级键等原因容易导致包涵体的形
成[11]。虽然凝集在包涵体中的蛋白没有活性,但是
在包涵体中表达的蛋白占总蛋白的 50% 以上,如果
能成功对表达的目标蛋白进行溶解和复性将大大提
高纯化蛋白的总量以及纯度,并减少了细菌的蛋白
酶对目标蛋白的降解作用。本研究结果表明,利用
2014年第8期 187张西轩等 :一种从大肠杆菌包涵体中分离纯化 GST-TRAF6 融合蛋白的方法
尿素变性、梯度稀释复性结合谷胱甘肽琼脂糖树脂
亲和层析 3 个步骤在大肠杆菌包涵体中成功地纯化
到浓度达到 396 ng/μL、纯度超过 90%、具有高泛素
连接酶活性的 GST-TRAF6 融合蛋白。包涵体表达
的 GST-TRAF6 融合蛋白分离纯化成功的关键是高浓
度尿素溶解后包涵体蛋白的复性。在以往的研究中,
包涵体蛋白复性的手段主要包括 :(1)氧化-还原转
换系统的加入,例如在复性缓冲液中需加入还原型
及氧化型谷胱甘肽、半胱氨酸、半胱胺等给复性蛋
白质提供一个氧化还原环境,促进二硫键的正确行
成 ;(2)聚乙二醇能够减少一些蛋白质的聚集 ;(3)
分子伴侣和折叠酶等可在体外促进蛋白质的折叠复
性等[12];(4)柱层析法对包涵体蛋白进行复性[13]。
与以往报道的蛋白质复性技术相比较,本研究报道
的 GST-TRAF6 融合蛋白成功复性的创新之处主要包
括两点 :其一是复性液的构成。本研究中的复性液
除了最适宜蛋白质复性的 pH8.0 外,还含有 5% 的
甘油,一定浓度甘油的加入在一定程度上改变了溶
液的极性和渗透压有利于 GST-TRAF6 的复性。同时
复性液中含有少量的 DTT,改变溶液的氧化还原系
统进而提高了正确配对的二硫键的产率,利用该复
性液我们曾经成功复性过酿酒酵母 PTC6 蛋白[14]。
其二是复性的过程采用的是梯度逐级稀释的方法,
该稀释方法为蛋白质的复性提供了缓慢变化的蛋白
质溶液外环境以及更充分的复性时间。当我们利用
复性液作为透析液对尿素溶解后的包涵体溶液直接
进行透析复性时发现,可能由于尿素去除的速度太
快导致大量的蛋白从溶液中析出,出现絮状沉淀(结
果未列),表明缓慢稀释复性对于 GST-TRAF6 融合
蛋白的复性是更具可行性的方法。
由于泛素连接酶的酶活性检测均为基于 Western
blot 的方法,无法测定其活力与比活力。为此,分
析了前人在研究中利用 TRAF6 蛋白催化体外泛素化
反应的浓度。Zhang 等[15]发现,在 20 μL 的泛素化
反应体系中加入了 0.3 μg TRAF6 蛋白进行泛素化反
应,该浓度相当于 15 ng/μL,与本研究中的 17 ng/μL
的 TRAF6 蛋白浓度相近。Xia 等[16]进行 TRAF6 催
化的自由泛素链生成的体外反应中,TRAF6 蛋白的
浓度为 0.4 μmol/L,而本研究中 17 ng/μL 的 TRAF6
蛋白的浓度经过换算后摩尔浓度为 0.2 μmol/L,即相
当于 Xia 等[16]的体外泛素化反应体系中 TRAF6 蛋
白浓度的一半。以上结果表明,包涵体表达的 GST-
TRAF6 蛋白经变性、复性恢复了较高的生物学活性。
从包涵体中纯化蛋白是生物制药领域常用的而
且成本较低的纯化手段[17],本研究在获得成功复性
的 GST-TRAF6 融合蛋白的基础上,同时提供了一种
能够广泛用于包涵体蛋白分离纯化的复性技术和手
段,为大规模低成本纯化蛋白提供了一种新的手段
和方法。
4 结论
本研究利用 8 mol/L 尿素溶液变性、梯度稀释复
性和谷胱甘肽琼脂糖亲和层析 3 个步骤从大肠杆菌
包涵体中成功分离纯化得到纯度达 90% 以上、浓度
为 396 ng/μL 的 GST-TRAF6 蛋白质溶液。进一步利
用体外泛素化反应分析其活性发现,17 ng/μL 浓度
的 GST-TRAF6 蛋白能够以泛素分子为底物在 5 min
内快速催化自由泛素链的生成,达到文献中所报道
的 TRAF6 的酶催化活性水平,为从大肠杆菌包涵体
中大规模分离纯化蛋白质提供了一种新的复性方法。
参 考 文 献
[1] Muzio M, Natoli G, Saccani S, et al. The human toll signaling
pathway :divergence of nuclear factor kappaB and JNK/SAPK
activation upstream of tumor necrosis factor receptor-associated
factor 6(TRAF6)[J]. J Exp Med, 1998, 187(12):2097-2101.
[2] Rauta PR, Samanta M, Dash HR, et al. Toll-like receptors(TLRs)
in aquatic animals :Signaling pathways, expressions and immune
responses[J]. Immunol Lett, 2013, 158(1-2):14-24.
[3] Xie P. TRAF molecules in cell signaling and in human diseases[J].
J Mol Signal, 2013, 8 :7.
[4] Chapard C, Hohl D, Huber M. The role of the TRAF-interacting
protein in proliferation and differentiation[J]. Exp Dermatol,
2012, 21(5):321-326.
[5] Lin XW, Xu WC, Luo JG, et al. WW domain containing E3 ubiquitin
protein ligase 1(WWP1)negatively regulates TLR4-mediated
TNF-α and IL-6 production by proteasomal degradation of TNF
receptor associated factor 6(TRAF6)[J]. PLoS One, 2013, 8(6):
e67633.
[6] Wei J, Yuan Y, Jin C, et al. The ubiquitin ligase TRAF6 negatively
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2014年第8期188
regulates the JAK-STAT signaling pathway by binding to STAT3
and mediating its ubiquitination[J]. PLoS One, 2012, 7(11):
e49567.
[7] Yang WL, Wang J, Chan CH, et al. The E3 ligase TRAF6 regulates
Akt ubiquitination and activation[J]. Science, 2009, 325(5944):
1134-1138.
[8] Yin Q, Lin SC, Lamothe B, et al. E2 interaction and dimerization in
the crystal structure of TRAF6[J]. Nat Struct Mol Biol, 2009, 16
(6):658-666.
[9] Peng Z, Shuangzhu Y, Yongjie J, et al. TNF receptor-associated
factor 6 regulates proliferation, apoptosis, and invasion of glioma
cells[J]. Mol Cell Biochem, 2013, 377(1-2):87-96.
[10] 孙利 , 王晓辉 , 关薇 , 等 . TRAF6-GST 融合蛋白在大肠杆菌中
的表达及纯化[J]. 生物技术通讯 , 2011, 22(5):679-682.
[11] 白东亭 , 许丽锋 . 重组大肠杆菌的包涵体[J]. 中国生物制品
学杂志 , 1996, 9(4):188-191.
[12] 罗惠霞 , 李敏 , 王玉炯 . 包涵体蛋白复性的几种方法[J]. 生
物技术通报 , 2007(5):96-98.
[13] 张少恩 , 孙晗笑 , 张光 , 等 . 大肠杆菌表达的 vMIP- Ⅱ包涵体
的纯化与复性研究[J]. 中国生物制品学杂志 , 2005, 18(3):
247-251.
[14] Ruan H, Yan Z, Sun H, et al. The YCR079w gene confers a
rapamycin-resistant function and encodes the sixth type 2C protein
phosphatase in Saccharomyces cerevisiae[J]. FEMS Yeast Res,
2007, 7(2):209-215.
[15] Zhang L, Ding X, Cui J, et al. Cysteine methylation disrupts
ubiquitin-chain sensing in NF-κB activation[J]. Nature, 2011,
481(7380):204-208.
[16] Xia ZP, Sun L, Chen X, et al. Direct activation of protein kinases by
unanchored polyubiquitin chains[J]. Nature, 2009, 461(7260):
114-119.
[17] 李校堃 , 袁辉 . 药物蛋白质分离纯化技术[M]. 北京 :化学
工业出版社 , 2005 :86-113.
(责任编辑 马鑫)