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Expression of a Xylanase Gene Originated from Rumen Anaerobic Fungi Neocallimastix frontalis in Pichia pastoris

来源于瘤胃厌氧真菌Neocallimastix frontalis木聚糖酶在毕赤酵母中的表达



全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2015, 31(5):186-193
反刍动物瘤胃是一个降解植物纤维的高效厌氧
发酵罐,微生物包括细菌、真菌和原虫等[1]。对瘤
胃厌氧真菌的研究发现瘤胃厌氧真菌的纤维素酶和
木聚糖酶活性比瘤胃纤维素分解细菌、原虫以及工
业用产酶微生物木霉菌等分泌的酶活性都高,如其
纤维素分解酶活性是瘤胃纤维素分解细菌产生的酶
收稿日期 :2014-09-01
基金项目 :新疆维吾尔自治区高技术研究发展项目(201211104),新疆研究生科研创新项目(XJGRI2013112)
作者简介 :汪艳,女,硕士研究生,研究方向 :酶的基因工程 ;E-mail :312577269@qq.com ;李晓为共同第一作者
通讯作者 :陈勇,男,教授,研究方向 :饲用酶制剂 ;E-mail :xjaucy@hotmail.com
来源于瘤胃厌氧真菌 Neocallimastix frontalis 木聚糖酶
在毕赤酵母中的表达
汪艳1  李晓1,2  陈勇1  武运2
(1. 新疆农业大学动物科学学院,乌鲁木齐 830052 ;2. 新疆农业大学食品科学与药学学院,乌鲁木齐 830052)
摘 要 : 厌氧真菌 Neocallimastix frontalis 是瘤胃中降解木聚糖和纤维素的主要微生物之一,其木聚糖酶具有潜在的应用价
值。对来源于 Neocallimastix frontalis 木聚糖酶基因 Xyn11B 进行密码子优化 ;通过全基因合成优化后的木聚糖酶基因 Xyn11Bm,构
建该基因的酵母表达载体 pPIC9K-Xyn11Bm,并在毕赤酵母 GS115 中诱导表达。摇瓶水平时,重组 Xyn11Bm 酶活性最高为 4 874.8
U/mL。在 10 L 发酵罐中诱导 96 h 后,重组 Xyn11Bm 的酶活性为 5 139.7 U/mL,菌体湿重和干重达到 216.7 g/L 和 117.3 g/L。酶学
性质分析表明,重组 Xyn11Bm 的最适反应温度为 50℃,最适反应 pH 为 5.0。在 pH5.0-8.0 时该酶具有较好的稳定性,但温度稳定
性较差。底物特异性分析表明,重组 Xyn11Bm 可水解燕麦木聚糖、桦木木聚糖和可溶性木聚糖 4-O-Me-D-glucurono-D-xylan,但不
降解地衣多糖和大麦 β-葡聚糖。结果表明重组 Xyn11Bm 具有潜在的应用价值。
关键词 : Neocallimastix frontalis ;木聚糖酶 ;毕赤酵母 ;密码子优化 ;酶学性质
DOI :10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.05.029
Expression of a Xylanase Gene Originated from Rumen Anaerobic
Fungi Neocallimastix frontalis in Pichia pastoris
Wang Yan1 Li Xiao1,2 Chen Yong1 Wu Yun2
(1. College of Animal Science,Xinjiang Agricultural University,Urumqi 830052 ;2. College of Food Science and Pharmacy,Xinjiang
Agricultural University,Urumqi 830052)
Abstract: The anaerobic fungus Neocallimastix frontalis is one of main microorganisms in the rumen degrading xylan and cellulose and
its xylanase has the potential application value. In this study, a xylanase gene Xyn11B originated from N. frontalis was codon optimized, and
the optimized gene Xyn11Bm was synthesized. Based on the gene engineering technology, the yeast expression vector pPIC9K-Xyn11Bm was
constructed, and the xylanase was induced and expressed in Pichia pastoris GS115. In shake flask level, enzyme activity of the recombinant
Xyn11Bm reached the maximum up to 4874.8 U/mL. In 10 L fermentor, at 96 h after induction, the activity of recombinant enzyme was 5139.7
U/mL, cell wet weight and dry weight were 216.7 g/L and 117.3 g/L. Enzymatic properties analysis showed that the optimum reaction temperature
and pH of Xyn11Bm were 50℃ and 5.0. In pH5.0-8.0, the enzyme had sound stability, but poor temperature stability. Substrate specificity
analysis showed that recombinant Xyn11Bm could hydrolyze oat spelt xylan, birch xylan and soluble xylan 4-O-Me-D-glucurono-D-xylan, but not
degrade lichenin and barley β-glucan. This indicated that the recombinant Xyn11Bm had potential application value.
Key words: Neocallimastix frontalis ;xylanase ;Pichia pastoris ;codon optimization ;enzymatic properties
2015,31(5) 187汪艳等:来源于瘤胃厌氧真菌 Neocallimastix frontalis 木聚糖酶在毕赤酵母中的表达
活性的 5 倍[2]。基因工程技术为利用瘤胃微生物基
因资源提供了可能。通过构建真核和原核工程菌,
一些瘤胃微生物木聚糖酶基因实现了异源表达。如
厌氧真菌 Neocallimastix patriciarum 的木聚糖酶基因
XynA 在大肠杆菌中表达的水平最高为 672 U/mg ;经
截短表达后,其中的一个克隆表达的木聚糖酶活性
达到 1 229 U/mg[3]。另一个来源于 N. patriciarum 的
木聚糖酶基因 Xynsk1-9 在大肠杆菌中表达后,纯
化的木聚糖酶比活性达到 10 371.04 U/mg[4]。来源
于 Orpinomyces sp. PC6 的 Xyn1 基因在毕赤酵母、链
霉菌和芽孢杆菌均获得了表达,最大反应速度达到
1 770 μmol/(min·mg)[5]。Neocallimastix frontalis
与 Neocallimastix patriciarum 相 似, 均 为 单 中 心 菌
体厌氧真菌,由其产生的木聚糖酶在植物细胞壁的
降解中起着重要作用[6]。Xyn11B 是 Neocallimastix
frontalis 木聚糖酶基因簇中的一员,属于糖苷水解
酶第 11 家族成员。研究发现,糖苷水解酶第 11 家
族中的木聚糖酶较其它家族木聚糖酶活力更高[7]。
Xyn11B 是否是值得开发的一种基因资源,目前还不
确定。
密码子优化是提高蛋白质异源表达水平的重要
途径。有关源于 Neocallimastix frontalis 的 Xyn11B 基
因优化及其在毕赤酵母中的表达还未见报道。本研
究以瘤胃厌氧真菌 Neocallimastix frontalis 木聚糖酶
基因 Xyn11B 为基础,在不改变氨基酸序列的情况
下,根据密码子的偏爱性等对该基因进行密码子优
化,构建毕赤酵母表达载体并在毕赤酵母 GS115 中
进行诱导表达,对重组木聚糖酶的酶学性质进行研
究,以期获得具有工业应用价值的重组木聚糖酶的
基因工程菌。
1 材料与方法
1.1 材料
分泌型表达载体 pPIC9K 及其宿主菌毕赤酵母
(Pichia pastoris)GS115 购自 Invitrogen 公司 ;大肠杆
菌 DH5α 为本实验室保存。
1.2 方法
1.2.1 瘤胃厌氧真菌 Neocallimastix frontalis 木聚糖
酶 Xyn11B 基因的优化与合成 在 GenBank 中检索
出厌氧真菌 Neocallimastix frontalis 木聚糖酶 Xyn11B
基因序列(登录号 :AY131336.1),根据酵母密码子
偏爱性对 Xyn11B 的密码子进行初步替换 ;为便于后
续基因克隆和重组质粒线性化,采用 Oligo 6.0 分析
替换后基因序列中的限制性内切酶切割位点,通过
密码子调整,消除基因序列中的 Bgl II、Sac I、Sal I、
EcoR I 和 Not I 的切割位点 ;为提高 mRNA 的稳定性
和表达水平,采用 BioEdit 7.0 分析调整后基因序列
中 mRNA 隐蔽剪接位点,并再次对密码子进行调整,
以消除其中的隐蔽剪接位点 GGTAAG、GGTGAT、
AATAAA、ATTTA、PolyT 和 PolyA。采用 RNA Stru-
cture 3.2 对 mRNA 二级结构的自由能进行分析,筛
选获得自由能最低的序列,并命名为 Xyn11Bm。以
JCat 程序计算优化前后的相对优化度值(CAI)。将
优化后的核苷酸序列送交上海生工生物工程有限公
司进行全基因合成。
1.2.2 重组 Xyn11Bm 毕赤酵母工程菌的构建与筛选
合成的 Xyn11Bm 用 EcoR I 和 Not I(大连 TaKaRa
公司)双酶切,并重组至经同样限制性内切酶酶
切的毕赤酵母表达载体 pPIC9K(美国 Invitrogen 公
司)上,转化大肠杆菌 DH5α,经 DNA 测序鉴定
无 误 的 重 组 载 体 命 名 为 pPIC9K-Xyn11Bm。 用 Sal
I 对 pPIC9K-Xyn11Bm 线 性 化, 以 ECM399 电 转 化
仪(美国 BTX 公司)电击转化毕赤酵母 GS115(美
国 Invitrogen 公司)感受态细胞,将转化后的菌液涂
布在最小葡萄糖培养基(Minimal dextrose medium,
MD)平板上,于 30℃培养约 48 h 至出现克隆子。
挑选生长正常的菌落进行甲醇利用表型鉴定,对甲
醇利用表型正确的克隆通过遗传霉素 G418 硫酸盐
筛选获得含高拷贝目的基因的重组酵母工程菌。
1.2.3 重 组 Xyn11Bm 毕 赤 酵 母 木 聚 糖 酶 活 性 初
筛 将筛选获得的抗 4 mg/mL 遗传霉素 G418 的 7
个菌株分别接种于含有 5 mL 缓冲复合甘油培养基
(Buffered minimal glycerol-complex medium,BMGY)
的 50 mL 试管中,29℃振荡培养 24 h 后离心用缓冲
复合甲醇培养基(Buffered minimal methanol-complex
medium,BMMY)重悬,每隔 24 h 加入甲醇,共培
养 48 h,甲醇最终浓度为 0.5%。培养结束后离心收
集上清,以燕麦木聚糖为底物测定酶活性。活性最
高的菌株送中国微生物菌种保藏管理委员会普通微
生物中心保藏。
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.5188
1.2.4 重组 Xyn11Bm 毕赤酵母的 PCR 鉴定 取 1 mL
菌液参考唐天乐等[8]的方法提取酵母染色体 DNA。
以 5AOX1(5-GACTGGTTCCAATTGACAAGC-
3)/3AOX1(5-GCAAATGGCATTCTGACATCC-3)
为上下游引物进行 PCR 鉴定。PCR 体系为 dNTP 2.0
μL、10×PCR buffer 2.5 μL、5AOX1 2 μL、3AOX1 2
μL、Taq 酶 1.0 μL、DNA 2.0 μL、ddH2O 13.5 μL,总
体积 25.0 μL。PCR 反应条件为 :95℃预变性 5 min ;
94 ℃ 45 s,65 ℃ 45 s,72 ℃ 45 s, 共 30 个 循 环 ;
72℃延伸 5 min。取 5 μL PCR 产物用 1% 琼脂糖凝
胶电泳检测。
1.2.5 重组 Xyn11Bm 酶活性的测定 采用二硝基
水杨酸法测定木聚糖酶活性[9]。取适当稀释的酶液
200 μL,1.0% 的桦木木聚糖 400 μL,于 50℃反应 5-
10 min,立即加入 1 mL 二硝基水杨酸溶液,振荡混
匀后于 95℃水浴 5 min 显色。冷却后加入 3.4 mL 去
离子水,振荡混匀后于 540 nm 处测定吸光度。
1.2.6 Xyn11Bm-12 在摇瓶水平条件下的表达 选
取在初筛时酶活性最高的重组菌 Xyn11Bm-12,按
照 pPIC9K 产品说明在 250 mL 三角瓶中诱导表达。
分别取诱导培养前和诱导培养后 12、24、36、48、
60、72、84 和 96 h 的样品进行 SDS-PAGE 电泳。取
96 h 的样品上清用平板刚果红法定性判断木聚糖酶
的活性[10]。
1.2.7 Xyn11Bm-12 在 10 L 发酵罐中的高效表达 参
考杨玉霞等[11]的方法利用 10 L 自动发酵罐进行液
体深层发酵,持续诱导 144 h。每 12 h 取样 10 mL 用
于测定酶活性、上清蛋白质浓度、菌体湿重和干重。
1.2.8 重组 Xyn11Bm 的纯化 发酵产物经离心后
取 6 mL 上清以 Vivaspin 6(美国 Millipore 公司)超
滤浓缩至 1 mL,浓缩后的上清用 G-75 葡聚糖凝胶
(美国 Bio-Rad 公司)进行层析纯化,每管收集 1
mL。以 GeneQuant 核酸蛋白检测仪(美国 Anersham
Biosciences 公司)测定层析液 OD280,根据 OD280 值
将处于同一吸收峰的样品等量混合,并测定合并样
品的酶活性。
1.2.9 重组 Xyn11Bm 的酶学性质
1.2.9.1 最适反应温度及热稳定性 最适反应温度
的测定 :取纯化酶液分别在 20、30、37、40、50、
60、70、80 和 90℃条件下测定酶活性。热稳定性的
测定 :取纯化酶液分别在 30、37、40、50、60、70
和 80℃条件下保持 30 min,在最适温度及 pH 值条
件下测定其剩余酶活性。
1.2.9.2 最适反应 pH 值及 pH 值的稳定性 最适反
应 pH 值的测定 :取纯化酶液分别在 pH 为 2.2、3、
4、5、6、7、8、9、10 和 10.6 下在最适温度条件下
测定酶活性。pH 值稳定性的测定 :取纯化酶液分别
在 pH 为 2.2、3、4、5、6、7、8、9、10 和 10.6 下
保持 30 min,在最适温度及 pH 值条件下测定其剩
余酶活性。
1.2.9.3 底物特异性 取适量纯化后酶液,分别以
大麦 β-葡聚糖、地衣多糖、燕麦木聚糖、桦木木聚
糖和可溶性木聚糖 4-O-Me-D-glucurono-D-xylan(美
国 Sigma 公司)为底物在最适温度及 pH 值条件下测
定酶活性。
2 结果
2.1 瘤胃厌氧真菌Neocallimastix frontalis木聚糖酶
Xyn11B基因的优化
优化前后序列比对如图 1 所示。经 Jcat 软件计
算,优化后的核苷酸序列 CAI 由 0.31 提高到 0.90,
G+C 含 量 由 44.1% 下 降 到 42.2%。 优 化 后 序 列 与
优化前序列的相似性为 85.07%。与优化前序列相
比,优化后序列中共对 121 个氨基酸残基的密码子
进行了优化,有 151 个核苷酸被替换。利用 RNA
Structure 5.3 软件对优化前后的最低自由能进行分析
表明,优化对 mRNA 的最低自由能影响不大,优化
前最低自由能为 -286.60 KJ/mol,优化后为 -277.90
KJ/mol。
2.2 重组Xyn11Bm毕赤酵母工程菌的筛选、活性
测定和PCR鉴定
通过 G418 硫酸的筛选,共获得抗 4 mg/mL 的
菌 株 7 个。 酶 活 性( 图 2) 显 示,7 个 菌 株 都 具
有 木 聚 糖 酶 活 力, 其 中 最 高 的 是 12 号( 命 名 为
Xyn11Bm-12),为 2 541 U/mL。该菌株送交中国微
生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心后获得保
藏号为 CGMCC No.9398。图 3 显示,Xyn11Bm-12 工
程菌在 2 000 bp 处出现两条 DNA 条带,其中分子量
大的为 AOX1 基因的 PCR 产物,分子量小的为目的
基因相关产物。这表明 Xyn11Bm 基因已插入毕赤酵
2015,31(5) 189汪艳等:来源于瘤胃厌氧真菌 Neocallimastix frontalis 木聚糖酶在毕赤酵母中的表达ՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾՈॆࡽՈॆਾ
1
1
61
61
121
121
181
181
241
241
301
301
361
361
421
421
481
481
541
541
601
601
661
661
721
721
781
781
841
841
901
901
961
961
图 1 瘤胃厌氧真菌 Neocallimastix frontalis 木聚糖酶 Xyn11B 基因的原始序列和优化序列的比较
母 GS115 染色体 DNA 中。
2.3 重组Xyn11Bm基因在毕赤酵母中的表达
2.3.1 Xyn11Bm-12 在摇瓶水平条件下的表达 如
图 4 所示,随着诱导时间的延长,木聚糖酶活性
逐渐提高,到诱导后 84 h 时,酶活性达到最大值,
为 4 874.8 U/mL。图 5 显示,酵母菌 GS115 和转化
空表达载体 pPIC9K 的酵母菌在培养 96 h 后没有产
生透明圈,说明其培养上清液无木聚糖酶活性。而
Xyn11Bm-12 在诱导 96 h 后的培养上清液产生了清
晰可见的透明圈,进一步表明 Xyn11Bm 基因在毕赤
酵母 GS115 中获得了表达,并且具有木聚糖酶活性。
SDS-PAGE 分析(图 6)表明,随着诱导时间的延长
培养上清液中出现了一条分子量约为 44.3 kD 的蛋
白质条带。在本试验中,该酶蛋白由 339 个氨基酸
组成,理论分子量为 37.02 kD。从 SDS-PAGE 电泳
图谱可以看出,在毕赤酵母中表达的瘤胃厌氧真菌
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.5190
Neocallimastix frontalis 木聚糖酶的分子量比理论分子
量稍微大一些,可能是因为蛋白质糖基化的结果。
似的变化规律。随着诱导时间的延长,木聚糖酶活
性不断增加,在诱导第 96 h 时发酵液的酶活性最高
为 5 139.7 U/mL,之后逐渐下降。在诱导 144 h 结束
时仅为 3 577.2 U/mL。
3000
2000
1000



/ U·mL-1
500
0
2 4 6 7 12 15 19㧼Ṛ㕆ਧ15002500
图 2 7 个重组 Xyn11Bm 酵母菌株酶活性的比较
2000
bp
M 1 2 3
1000
750
500
250
100
M :DNA Marker ;1 :GS115-pPIC9K ;2 :pPIC9K ;3 :Xyn11Bm-12
图 3 重组 Xyn11Bm 毕赤酵母的 PCR 鉴定
6000
5000
4000
3000䞦⍫ᙗ/ U·mL-1 2000
1000
0
0 12 24 36 48 60 72 84 96䈡ሬᰦ䰤h
图 4 重组木聚糖酶 Xyn11Bm 在摇瓶水平时的酶活性变化
2.3.2 Xyn11Bm-12 在 10 L 发酵罐中的高效表达
图 7 显示,随着诱导时间的延长,发酵物湿重和干
重含量逐渐增加,在诱导 96 h 时菌体湿重和干重达
到最大值,分别为 216.7 g/L 和 117.3 g/L,之后逐渐
下降。到发酵结束时,菌体湿重和干重为 160.7 g/L
和 67.5 g/L。图 8 显示,木聚糖酶活性和比活性呈相
1
2
3
1 :Xyn11Bm-12 诱导 96 h ;2 :酵母菌 GS115 ;
3 :转空表达载体 GS115-pPIC9K
图 5 平板刚果红法鉴定重组木葡聚糖酶 Xyn11Bm 的活性
Xyn11Bm
99.2
kD M 1 2 3 4 5 6 7 8 9
66.4
44.3
29.0
20.1
14.3
M :蛋白质分子量标准 ;1-9 :分别为诱导前、诱导后 12、24、36、48、
60、72、84 和 96 h 的培养上清液
图 6 Xyn11Bm-12 培养上清的 SDS-PAGE 电泳图谱
250
200
150㧼փ䍘䟿/ g·L-1 100
50
0
0 12 24 36 48 60 72 84 96 108 120 132 144䈡ሬᰦ䰤h㧼փ⒯䟽㧼փᒢ䟽
图 7 Xyn11Bm-12 在 10 L 发酵罐中菌体湿重和干重含量
的变化
2015,31(5) 191汪艳等:来源于瘤胃厌氧真菌 Neocallimastix frontalis 木聚糖酶在毕赤酵母中的表达
2.4 重组Xyn11Bm的酶学性质
2.4.1 重组 Xyn11Bm 的最适温度和热稳定性 图 9
显示,在 20-50℃之间,随着温度的升高,相对酶
活性逐渐提高,超过 50℃后,酶活性逐渐下降,表
明该酶的最适反应温度为 50℃。热稳定性试验表明,
重组木聚糖酶 Xyn11Bm 在 20-40℃左右的条件下具
有较好的稳定性。但是当温度超过 40℃后,酶活性
迅速下降,升到 70℃时已基本无活性,表明重组
Xyn11Bm 不耐受高温。
麦木聚糖、桦木木聚糖和可溶性木聚糖,相对活性
分别为 15%、100% 和 175% ;但该酶不降解地衣多
糖和大麦 β-葡聚糖。
6000
5000
4000
3000䞦⍫ᙗ/ U·mL-1 ∄⍫ᙗ / U·mg-1 2000
1000
0
0 12 24 36 48 60 72 84 96 108 120 132 144
0
200
400
600
800
1000
1200
1400
1600䈡ሬᰦ䰤h䞦⍫ᙗ∄⍫ᙗ
图 8 Xyn11Bm-12 在 10 L 发酵罐中酶活性的变化
2.4.2 重组 Xyn11Bm 的最适 pH 和 pH 稳定性 如
图 10 所示,重组 Xyn11Bm 的最适反应 pH 为 5.0,
并且在 pH6.0-10.6 条件下也有较高活力,在 pH10.6
时相对酶活性为 96.95%。Xyn11Bm 酶在 pH5.0-8.0
的条件下具有较好的稳定性,剩余的活力在 80% 以
上,表明重组 Xyn11Bm 具有一定的耐酸碱性。
2.5 重组木聚糖酶的底物特异性
图 11 显示,重组木聚糖酶 Xyn11Bm 可水解燕
120
100
80
60⴨ሩ䞦⍫ᙗ/% 40
20
0
0 20 40 60 80 100৽ᓄ⑙ᓖć ᴰ䘲৽ᓄ⑙ᓖ✝っᇊᙗ
图 9 重组 Xyn11Bm 的最适温度和热稳定性
120
100
80
60䞦⍫ᙗ/ U·mL-1 40
20
0
-20
0 2 4 6 8 10 12
pH٬ᴰ䘲pHpHっᇊᙗ
图 10 重组 Xyn11Bm 的最适 pH 和 pH 稳定性
3 讨论
木聚糖水解酶系主要包括主链上的水解酶 β-D-
1,4 内 切 木 聚 糖 酶(EC 3.2.1.8, 简 称 木 聚 糖 酶 )、
β-D-1,4 外切木糖苷酶和侧链上的水解酶 α-L-阿拉伯
呋喃糖苷酶、α-葡萄糖醛酸酶以及乙酰木聚糖酯酶
等。在这些酶中,β-D-1,4 内切木聚糖酶对木聚糖降
解起主要作用[12]。厌氧真菌 Neocallimastix frontalis
是 瘤 胃 中 降 解 木 聚 糖 和 纤 维 素 的 主 要 微 生 物 之
一,研究者先后从中分离获得了 Xyn11A、Xyn11B、
Xynsk 等多个木聚糖酶基因并在大肠杆菌中获得
表达,并且 Xyn11B 的比酶活性最高,达到 3 794
U/mg[13]。虽然大肠杆菌表达系统由于其培养成本廉
价以及操作过程简单,常被作为外源基因表达的首
选。但是,木聚糖酶在大肠杆菌中表达后往往表达
0 ਟⓦᙗᵘ㚊㌆ ẖᵘᵘ㚊㌆ ⠅哖ᵘ㚊㌆ བྷ哖β-㪑㚊㌆ ൠ㺓ཊ㌆ᓅ⢙50100150⴨ሩ䞦⍫ᙗ% 200
图 11 重组 Xyn11Bm 的的底物特异性
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.5192
水平较低甚至没有活性。这主要是因为稀有密码子
的存在和翻译后需后续进一步加工的缘故,如形成
二硫键和糖基化。木聚糖酶通常需要 N-糖基化,而
大肠杆菌对表达的外源蛋白只具有 O-糖基化作用[5]。
与大肠杆菌相比,酵母表达系统更具优势 :具有翻
译后的修饰、可高密度发酵、将外源蛋白分泌到培
养基便于纯化、不含大肠杆菌毒素更易于在食品中
应用等[14]。因此,本研究首选利用毕赤酵母 GS115
表达 Xyn11B 基因。
提高外源基因在宿主中的表达的途径之一是对
外源基因的密码子进行优化。当外源基因中含有稀
有密码子时将严重制约其在宿主中的表达[15]。在
对外源基因密码子优化时,主要应考虑稀有密码子
的替换、消除 AT 富集区和 G+C 含量的调整。除此
以外,本研究还考虑了 mRNA 隐蔽剪接位点和自
由能。通过对外源基因密码子优化后,大量外源基
因在毕赤酵母中得到了高水平表达。如纤维素酶基
因优化后酶活性提高 1.24 倍[15],外切葡聚糖酶基
因优化后表达水平提高了 25%[11]。Tsai 等[16]利用
酿酒酵母和毕赤酵母分别表达了源于瘤胃厌氧真菌
Neocallimastix frontalis 的一个木聚糖酶基因,在诱导
10 d 后木聚糖酶活性分别达到 5 400 U/mL 和 6 200
U/mL。在本试验中,优化后的 Xyn11Bm 基因在毕
赤酵母中诱导表达 96 h 时酶活性最高达到 5 139.7
U/mL。这说明,该基因工程菌具有一定的应用价值。
培养基是影响酵母生长的重要因素之一。在利
用 毕 赤 酵 母 GS115 进 行 高 密 度 发 酵 时,Invitrogen
推 荐 基 础 盐 培 养 基(Basal salts medium,BSM) 和
PMT1 微量元素溶液搭配使用[17]。但近期的研究发
现,毕赤酵母在 BSM 中生长时延滞期较长,因此宿
主菌要达到对数生长期所需的时间也较长[18]。毕赤
酵母在高密度发酵时菌体干重一般在 75-100 g/L[19]。
菌体湿重和干重是反映高密度发酵的重要指标,提
高受体酵母菌的生长速度有利于外源基因的表达。
本研究采用了 FM22/PMT4 培养基,在诱导培养 96 h
时发酵液中菌体湿重和干重分别达到了 274.6 g/L 和
123.6 g/L。本研究结果表明,FM22/PMT4 培养基更
有利于毕赤酵母的生长,因此,可能也更有利外源
基因的表达。
范志恒[20]报道,以不同底物评价黑曲霉木聚
糖酶活性时,以小麦木聚糖为底物时的酶活最高,
其次是燕麦木聚糖,再次是山毛榉木聚糖,以桦木
木聚糖为底物时的酶活最低。本研究中表达的重组
木聚糖酶可以水解燕麦木聚糖、桦木木聚糖和可溶
性木聚糖,并且酶活性有较大差别。燕麦木聚糖属
于水不溶性木聚糖,桦木木聚糖属于部分水不溶性
木聚糖,木聚糖酶通过内切方式作用于木聚糖主链
内部的 β-1,4 木糖苷键,降低木聚糖的聚合度[21]。
溶解率大的聚糖,其结构支链多或聚合度小,因此
更易于分解。此外,不同来源的木聚糖在分子结构,
尤其在侧链构成上存在差异,并影响木聚糖酶的结
合与水解[22]。这可能是导致不同底物表现出不同酶
活性的原因之一。
4 结论
本研究实现了 Neocallimastix frontalis 木聚糖酶
基因 Xyn11Bm 在毕赤酵母中的高密度发酵,最高酶
活性为 5 139.7 U/mL,最适反应温度为 50℃,最适
反应 pH 为 5.0。该酶在 pH5.0-8.0 之间具有较好的
稳定性,可水解燕麦木聚糖、桦木木聚糖和可溶性
木聚糖,但不降解地衣多糖和大麦 β-葡聚糖。
参 考 文 献
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(责任编辑 马鑫)