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Advances of NDR1 Gene Determined Broad-spectrum Disease Resistance in Arabidopsis

拟南芥NDR1基因介导的广谱抗病性研究进展



全 文 :·综述与专论· 2014年第6期
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
植物在生长发育过程中会经常受到细菌、真菌
和病毒等病原体的侵袭,其结果表现为抗病或感病。
在与病原体长期的相互作用与进化过程中,植物逐
渐形成了复杂的防御机制。一般认为,植物通过抗
性(R)基因与病原体无毒基因(Avr 基因)的互作,
激活植物的防御反应[1,2]。大多数植物的 R 蛋白具
有 核 苷 酸 结 合 位 点(Nucleotide-binding site,NBS)
和富亮氨酸重复序列(Leucine-rich repeat,LRR)的
结 构 特 点。NBS 具 有 ATP 或 GTP 结 合 活 性,LRR
结构域调节蛋白质-蛋白质相互作用,起着确定基因
对基因间互作的直接特异性[3]。NBS-LRR 类 R 基因,
根据其 N 端的结构域特点,可进一步分为卷曲螺旋
结构域(CC)NBS-LRR 类与果蝇 Toll 蛋白和哺乳动
物白细胞介素 I 受体同源域(TIR)NBS-LRR 类[4]。
虽然 R 蛋白在感知病原体后的激活抗性过程
收稿日期 :2013-12-03
基金项目 :国家转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08001-002)
作者简介 :龚前园,男,硕士研究生,研究方向 :植物分子生物学与基因工程 ;E-mail :gqyscnc@sina.cn
通讯作者 :张永强,男,研究员,研究方向 :植物分子生物学 ;E-mail :zhangyongq@sina.com
拟南芥 NDR1 基因介导的广谱抗病性研究进展
龚前园  张超  李为民  张永强
(中国农业科学院生物技术研究所,北京 100081)
摘 要 : 抗病基因的研究是抗病育种及防治植物病害的基础。拟南芥 NDR1(Non-race-specific disease resistance 1)基因,编
码一个质膜定位蛋白,在 R 基因介导的抗性中具有重要作用。NDR1 能与 CC-NB-LRR(卷曲螺旋核酸结合或富亮氨酸重复)类抗
病蛋白相互作用。以拟南芥抗病基因 NDR1 及其蛋白结构的研究进展为基础,综述了 NDR1 的广谱抗病性和抗病分子机理。
关键词 : 抗病基因 NDR1 CC-NB/LRR
Advances of NDR1 Gene Determined Broad-spectrum Disease
Resistance in Arabidopsis
Gong Qianyuan Zhang Chao Li Weimin Zhang Yongqiang
(Biotechnology Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081)
Abstract:  The research of resistance genes is the basis of disease resistance breeding and plant diseases controlling. Arabidopsis NDR1
(non-race-specific disease resistance 1)gene, encoding a plasma membrane protein, plays an important role in the R gene mediated disease
resistance, by interacting with CC-NB-LRR(nucleic acid binding or coiled-coil leucine-rich repeat)class of antiviral proteins. Here, we
summarized the latest progresses of Arabidopsis NDR1 gene and the broad-spectrum disease resistance of NDR1.
Key words:  Disease resistance gene NDR1 CC-NB-LRR
中发挥着核心作用,但单靠 R 蛋白启动抗性是不
够的。因此,作为抗性共激活因子的众多辅助蛋白
和 伴 侣 蛋 白 也 已 被 确 定。 例 如,Enhanced disease
susceptibility 1(EDS1) 通 过 激 活 R 蛋 白 的 TIR 结
构 域 调 控 防 御 信 号, 而 Non-race-specific disease
resistance 1(NDR1)是含有 CC 结构域的 R 蛋白激
活所必需的[5-9]。但也有例外,几个 CC-NB-LRR 类
R 蛋白对卵菌纲病原菌 Hyaloperonospora arabidopsidis
的特异抗性独立于 NDR1 之外起作用[10,11]。因此,
虽然 EDS1 和 NDR1 依靠 R 蛋白的结构特异性、功
能和激活信号似乎是保守的,但这些途径相关的完
整机制仍不清楚。
激活 R 蛋白介导的抗性所需的两个主要信号元
件中,EDS1 研究的比较清楚。EDS1 作为涉及生物
和氧化应激信号的核心调控蛋白[12]。细菌感染植
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2014年第6期30
物后,EDS1 通过与植保素缺陷蛋白 4(Phytoalexin-
deficient 4)和衰老相关基因 101(Senescence-associ-
ated gene101)的互作,诱发超敏反应(HR)[13,14]。
EDS1 也被证明在阻止非致病真菌侵入增长以及运作
氧化应激信号中起作用[12]。相反,NDR1 在 CC-NB-
LRR 类的信号转导通路中的功能尚不清楚。故笔者
着重对近年来对 NDR1 基因的研究进展进行综述。
1 NDR1 基因的结构
Century 等[6]在研究拟南芥与丁香假单胞菌(Pst)
之间的互作时,发现了一个可能涉及拟南芥抗病途
径的基因,由于其具有非小种专化抗病性,故命
名为 NDR1。NDR1 基因位于拟南芥第 3 条染色体
上,限制性片段长度多态性(RFLP)标记出其位于
g6220 与 g4711 之间的 8.5 厘摩(cM)[6]。NDR1 蛋
白是一个质膜蛋白,它经历了几个翻译后修饰,包
括羧基末端处理和氨基端糖基化[7,8]。基因组 DNA
序列分析显示,NDR1 含有一个单一的 660 个碱基
对的开放阅读框(ORF)[7]。
2 NDR1 蛋白的结构
Coppinger 等[8]通过序列分析预测 NDR1 是一
个 C 末端糖基肌醇(GPI)锚定蛋白,并通过选择离
子监测质谱法(SIM-MS)得到验证。NDR1 蛋白的
结构如图 1 所示,其中 ω 位点、断裂位点和疏水尾
巴为 GPI 锚定蛋白的基本特点。Knepper 等[16]通过
的 3 个氨基酸的 α-螺旋结构(图 2-B),他们确定了
在溶剂中暴露的氨基酸 178-180 位置存在的一个类
似整合素蛋白 Arg-Gly-Asp(RGD)的 NGD 结构域
(Asn-Gly-Asp)。在宿主-真菌互作中,防御信号中
的 NGD 域是一个潜在的配体结合位点,该位点涉及
胞壁质膜黏附[18,19]。此外,据推测 NGD 位点也是
病原菌效应蛋白和分泌系统的靶标,大概是为了通
过破坏细胞壁质膜黏着斑而方便病原体进入[20]。
Ӣ≤४ฏ 䭊ᇊ४
48aaⲴᯝ㻲ս⛩ ⮿≤ቮᐤ
18aa 20aa 156aa
D S
ω ω+1 ω+2
6aa 15aa
S R COOHNH2
D :天冬氨酸 ;S :丝氨酸 ;R :精氨酸
图 1 NDR1 的结构[8]
与整合素蛋白 LEA14 进行同源建模,预测了 NDR1
蛋白的高级结构(图 2)。对预测结果进行进一步分
析发现该蛋白与涉及信号感知和先天免疫反应的哺
乳动物整合素蛋白具有几个惊人的相似之处。例如,
大量的 β 折叠的圆环(图 2-A 蓝色箭头)类似于Ⅲ
型纤连蛋白的核心结构。进一步的模拟表明 NDR1
的主要核心结构与膜结合亚单位(即纤连蛋白域)
FNIII 具有很强的相似性,NDR1 和整合的假定跨膜
结构域都连接到一个大的单一 β 片上[17]。根据相邻
A
N
N
B C
A :预测的 NDR1 ;B :LEA14 的结构 ;C :NDR1 与 LEA14 拧到一起,以突
出同源性(PHYRE 分析同源精度为 95%,E 值 0.008)(颜色标识见电子版)
图 2 NDR1 蛋白的高级结构[16]
3 NDR1 在抗病信号转导中的作用方式
通过突变体删除试验表明,NDR1 是一个重要
的诱导防御反应的抗性基因,并具有非小种专化抗
病性[6]。在过去的 10 多年中,通过阐明 NDR1 参
与的遗传相互作用,发现 NDR1 参与了植物防御信
号,并作为防御信号激活所需的核心元件,激活
CC-NB-LRR 类 R 蛋白[9]。拟南芥突变体 ndr1-1 植
株中,由细菌引起的水杨酸(Salicylic acid,SA)或
通过 UV-C 光或缺氧产生的活性氧(Reactive oxygen
species,ROS)都被减弱了,并且在由细菌或 ROS
诱导的 SAR 也受损,但 BTH 诱导的 SAR 不受影响。
从而表明,NDR1 在 ROS 的下游和 SA 的上游发挥
功能[21]。 结合以上分析,Shapiro 等[21]总结了抗
病信号转导模型,明确了 NDR1 在抗病信号转导中
的作用位置,如图 3 所示。
4 NDR1 基因的抗病性
4.1 拟南芥NDR1的抗病性
通过突变体 ndr1-1 的感病性检测,NDR1 对携
带 无 毒 基 因 avrB、avrRpm1、avrRpt2 和 avrPph3 中
任何一个的丁香假单胞菌具有抗性[6]。同时,NDR1
2014年第6期 31龚前园等 :拟南芥 NDR1 基因介导的广谱抗病性研究进展
的 突 变 严 重 削 弱 了 拟 南 芥 在 响 应 携 带 无 毒 基 因
avrRpt2 的丁香假单胞菌时 HR 和 SAR 的诱导能力,
也降低了突变体植株 PR1 基因的表达水平[21]。
Coppinger 等[8]研究转基因拟南芥的 ndr1-1 补
充突变体发现,该基因开放读码框上游的一个 1.3
kb 区域,足以驱动 NDR1 基因的表达。在这个 1.3
kb‘NDR1 本地启动子’的启动下,能稳定地在转
基因拟南芥 ndr1-1 突变体中表达 NDR1,从而实现
在拟南芥中过量表达 NDR1。其结果是,可以增强
拟南芥对一些细菌的抗病能力,如番茄丁香假单胞
菌,但对非细菌性病原菌的抗性增强不明显,如芜
菁皱缩病毒和白粉病。通过抗病基因工程研究 NDR1
的功能也有报道。窦道龙等[22]利用农杆菌介导法,
将从拟南芥 Wassilewskija 生态型中克隆到的 NDR1
基因转到烟草中发现,部分转基因苗(约 30%)对
赤星病和晚疫病的抗性明显增强。人们在拟南芥中
发现了 45 个与 NDR1 和 HIN1(烟草中与 NDR1 序
列相似的抗病基因)相关的基因,它们属于 NHL(似
NDR1/HIN1)大家族[23, 24]。这些基因不同程度地参
与了植物防御途径,如 NHL10 在黄瓜花叶病毒引起
的过敏反应中被诱导表达[24]。
因此,NDR1 基因确实参与了植物的抗病反应,
而且与 NDR1 序列相似的基因也可能具有抗病性,
这为广泛克隆并研究植物抗病基因奠定了基础。
4.2 其他植物NDR1基因的抗病性
近年来,人们对其他植物中的 NDR1 同源基因
的抗病性也做了一定的研究。例如,Cacas 等[25]从
咖啡中克隆到了与拟南芥 NDR1 功能上同源的基因
CaNDR1a,它能恢复 ndr1-1 对丁香假单胞菌的抗性。
同时,他们还通过瞬时表达系统,确定 CaNDR1a 蛋
白和拟南芥 NDR1 蛋白一样也通过 C 末端处理定位
于质膜上,且与类似 RIN4 的蛋白互作,从而证明
了 NDR1 蛋白在咖啡和拟南芥之间的功能上和生化
特性上的保守性。Lu 等[26]克隆了柑橘中的 NDR1
同源基因,即 CsNDR1,并证实过表达 CsNDR1 能弥
补拟南芥突变体 ndr1-1 对丁香假单胞菌的抗性,也
能增强对卵菌纲病原体 Hyaloperonospora arabidopsidis
的抗性。这种过表达与 SA 产物的增加和防御标记
蛋白 PATHOGENESIS RELATED 1(PR1)的表达正
相关,这说明 CsNDR1 的过表达可激活 SA 介导的
防御信号,从而导致广谱抗病性的产生。此外,他
们还发现,在感染与柑橘火龙病相关的细菌病原
体 Candidatus Liberibacter 的柑橘中,能诱导温和的
PR1 的表达和 SA 的积累,从而进一步证实 CsNDR1
是拟南芥 NDR1 的一个功能性同源基因。
总之,NDR1 基因介导了植物的广谱抗病性,
并且它在一些植物的防御途径之间是保守的。因此
我们可以通过克隆一些抗病植物的 NDR1 同源基因,
通过基因工程的方法将 NDR1 基因转化到其他经济
植物中,以提高目标植物的抗病性。
4.3 NDR1的抗病分子机理
人们广泛认为,R 蛋白介导的植物对细菌抗性
的分子遗传基础,涉及直接或间接的识别来源于病
原体的毒力效应器,从而诱发植物的抗病性[27,28]。
细菌 III 型效应蛋白通过 III 型分泌系统进入植物细
胞质,识别寄主植物并激活防御信号形成抗性。当
效应蛋白被寄主植物识别时,就会产生基因对基因
的抗性,从而启动抗病反应。
Coppinger 等[8]通过抗原标记 NDR1 转化到拟
南芥 ndr1-1 中,再利用免疫印迹证实 NDR1 通过 C
末端糖基肌醇(GPI)锚定到质膜上,GPI 可能在膜
的外表面修饰 NDR1,从而使 NDR1 与外源病原体
信号直接或间接相互作用。Knepper 等[16]通过同源
建模,预测 NDR1 与拟南芥胚胎发育晚期富集蛋白
14(与非生物胁迫响应有关的蛋白)的结构高度相似。
NO
avr/Rสഐ׍䎆ؑਧ
ӗ⭏⍫ᙗ≗
Āᕅਁഐᆀā
PRสഐ表达
SAR
npr1
SA
ndr1
SA
㓶㜎↫ӑ
(HR)
图 3 抗病信号转导模型[21]
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2014年第6期32
特定的蛋白质超二级结构也表明 NDR1 与哺乳动物
整合素具有惊人的相似性,整合素能调节细胞外基
质和胁迫信号之间的相互作用。ndr1-1 突变体植物
感染病原体后,与野生型 Col-0 相比,表现出较高
的电解液泄漏。 此外,还观察到质壁分离的表型改
变,这表明 NDR1 能通过调节在环境压力下发生的
细胞液损失,从而保持细胞壁质膜的粘连。
NDR1 是一个质膜定位、GPI 锚定的蛋白质,能
够形成同型二聚体。 NDR1 包含一个位于该蛋白质
外体的 NGD 结构域(Asn-Gly-Asp),该结构域能通
过直接或间接的相互作用将细胞壁和质膜连接在一
起(图 4 中小标 1,2)。通过鉴定 NDR1 与 RIN4 的
相互作用,人们进一步认识了 NDR1 在效应器触发
免疫(Effector-triggered immunity,ETI)中的作用 :
NDR1 通过与 RIN4 的互作及随后 R 蛋白的负调节
作用,至少部分地,正向调节了抗性反应[29]。目前
尚不清楚介导 NDR1 与 ETI 联系的其他细胞元件。
RIN4 能与 R 蛋白 RPS2 互作,并通过 RIN4 的分开
来识别丁香假单胞菌 DC3000 的效应蛋白 AvrRpt2,
随后被 RPS2 识别并激活 ETI。最近发现,NDR1 能
激活丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein
kinase,MAPK)途径和 PTI。NDR1 与 PTI 上游的具
体互作元件仍未确定(图 4 中小标 3)。
5 展望
NDR1 通过 C 末端锚定到质膜上,在细胞质内
通过与抗病蛋白 RPS2 及负调节蛋白 RIN4 的相互作
用参与抗病信号转导,从而使抗病信号从细胞外空间
转导到细胞内[29]。同时,HR 过程中产生的 ROS 也
作用于 NDR1[21]。抗病信号进一步传递,产生 SA,
促进病程相关基因的表达。NDR1 基因介导了植物
的广谱抗病性,并且它在防御途径中的功能在很多
植物之间是保守的。因此可以通过对保守序列的分
析,克隆一些抗病植物的 NDR1 同源基因或与 NDR1
序列相似的基因,然后通过基因工程的方法将这些
基因转移到其他植物中,并实现稳定表达,从而提
高目标植物对各种病原菌的广谱抗性。
目前虽然已经确定 NDR1 参与抗病信号转导,
并对拟南芥 NDR1 的抗病性做了一定的研究。但对
NDR1 在信号转导通路中的功能及其抗病分子机理
的研究不多,而且大多处于推论阶段,需要进一步
的试验技术来证明。鉴于 NDR1 基因的广谱抗病性,
其在作物广谱抗病基因工程中具有较大的应用前景。
参 考 文 献
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ETI
MPK3/6
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RPS2
NGD NGD
Apoplast
Cell wall
Plasma membrane
AvrRpt2
图 4 NDR1 在细胞生理和病原体防御信号中扮演的角色[30]
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(责任编辑 狄艳红)