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Cloning,Prokaryotic Expression of Sorghum bicolor SbGABA-Ts

高粱SbGABA-Ts基因的克隆、原核表达及纯化



全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2015, 31(5):93-99
作为粮饲能兼用的作物,高粱[Sorghum bicolor
(L.)Moench]对全球农业生态系统的贡献日益显
现[1]。按年产量计算,高粱是世界上第五大重要的
谷类作物,仅次于玉米、小麦、水稻和大麦(http://
www.fao.org)。更值得注意的是,高粱具有其他作物
无法比拟的多重抗逆性,在雨水稀少的美国南部平
原和非洲东北部,以及中国东北和新疆广阔的干旱
收稿日期 : 2015-01-29
基金项目 :国家自然科学基金项目(31271790,31471558)
作者简介 :杨泽伟,男,硕士研究生,研究方向 :植物抗逆机理 ;E-mail :yangzewei555@sina.com
通讯作者 :朱莉,女,副研究员,硕士生导师,研究方向 :植物抗逆分子生物学 ;E-mail :zhuli01@caas.cn
高粱 SbGABA-Ts 基因的克隆、原核表达及纯化
杨泽伟1,2  王龙海1,2  朱莉2  汪海2  黄大昉2  郎志宏2
(1. 西南科技大学生命科学与工程学院,绵阳 621010 ;2. 中国农业科学院生物技术研究所,北京 100081)
摘 要 : 植物中 GABA(γ-氨基丁酸)代谢与植物生长发育、信号传递及逆境响应等过程密切相关,而参与 GABA 代谢的关
键酶 GABA-T(γ-氨基丁酸转氨酶)在重要农艺作物中的研究相对滞后。利用同源性分析在高粱基因组数据库中获得两个 γ-氨基丁
酸转氨酶(SbGABA-T)基因,RT-PCR 方法进行基因克隆,并连入原核表达载体 pET28a(+),转化 E. coli BL21(DE3)进行基因
异源表达分析。结果表明,包含 SbGABA-T 编码区全长的融合蛋白主要在包涵体中表达,而去除了 SbGABA-T N 端信号肽的融合蛋
白以部分可溶的形式存在。进一步优化表达条件,IPTG 浓度为 1 mmol/L 时,16℃低温诱导 18 h,即可获得大量可溶性融合蛋白。
用带 His 标签的镍柱对融合蛋白进行了纯化。
关键词 : 高粱 GABA-T ;原核表达 ;纯化 ;信号肽
DOI :10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.05.015
Cloning,Prokaryotic Expression of Sorghum bicolor SbGABA-Ts
Yang Zewei1,2 Wang Longhai1,2 Zhu Li2 Wang Hai2 Huang Dafang2 Lang Zhihong2
(1. Southwest University of Science and Technology,School of Life Science and Engineering,Mianyang 621010 ;2. Biotechnology Research
Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081)
Abstract: GABA is a ubiquitous four-carbon,non-protein amino acid,and has been associated with growth and development,
signaling transduction,and stress response in plants. GABA transaminase(GABA-T),the enzyme responsible for the catabolism of GABA,
has not been fully explored,especially in several important crops. Two putative GABA transaminase genes(GABA-T)from Sorghum bicolor
were obtained based on homology analysis with the identified GABA-Ts of other plants and RT-PCR. Subsequently,the two SbGABA-T genes
and corresponding N-terminal truncated SbGABA-Ts were inserted into pET28a(+)vector and individually imported into E. coli strain
BL21(pLysS,DE3). Percentage improvement of soluble recombinant proteins were showed when removing the targeting peptide sequence
of SbGABA-Ts. The fusion proteins were expressed partially in soluble form after incubating for 18 h at 16℃ by adding 1 mmol/L IPTG,and
purified through nickel-affinity chromatography column.
Key words: Sorghum bicolor GABA-T ;prokaryotic expression ;purification ;signal peptide
盐碱地都有广泛的种植。目前,已完成对美国优良
高粱自交系 BTx623 的测序[2]。高粱基因组的高密
度遗传图谱、表达图谱及基因功能鉴定等研究[3],
为玉米、小麦、大麦等禾谷类作物基因组研究提供
极有价值的信息,是禾谷类作物的一个模式基因组。
γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)是一
种四碳非蛋白质氨基酸,广泛存在于动植物和各种
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.594
微生物体内,其合成与代谢通过 TCA 循环的一个旁
路,即 GABA 旁路进行[4]。研究表明,GABA 旁路
途径能通过调节胞质 pH、碳氮代谢、蛋白质降解、
激素合成、活性氧形成、多胺代谢、信号传递等重
要生理过程,继而影响植物的生长发育、形态建成
及胁迫应答[5-7]。
γ-氨基丁酸转氨酶(GABA-T)是 GABA 分解代
谢中的第一步关键酶。较之哺乳动物和微生物,植
物中 GABA-T 基因的研究相对滞后。最近几年,相
继从拟南芥、番茄、水稻中克隆到 GABA-T 基因,
这些研究表明,GABA-T 基因在亚型数量、亚细胞定
位、组织发育丰度等各方面,随植物种类的变化而
表现出较大的差异,对胁迫的响应也不尽相同[8-10]。
干 扰 GABA-T 基 因 的 表 达, 拟 南 芥 gaba-t/pop2 突
变体花粉管发育异常、种子产量降低,对盐胁迫
的耐受力下降[11];番茄(Solanum lycopersicum L.)
SlGABA-T RNAi 转基因植株后代出现严重的矮化和不
育[12];利用 GABA-T 专一性抑制剂 vinyl-GABA(VGB)
处理甘蓝幼苗,其主根长度减少了约 44%[13],这表
明 GABA-T 对于保障 GABA 的正常代谢,从而维持
植株正常的生长发育和胁迫应答至关重要。
目前为止,有关 GABA 积累的确切生理学意
义,及 GABA 旁路与其他生理进程间相互作用的分
子机制仍不清楚,需要对 GABA 旁路途径中关键基
因及关键环节作进一步解析。相关的报道也多集中
在拟南芥和烟草等模式植物中,在重要农作物尤其
是高粱中的研究还属空白,关键的基因尚未得到克
隆和鉴定,更不清楚 GABA 途径是否在高粱多重抗
逆性中扮演关键角色。本研究通过序列相似性比对
和 RT-PCR 方法,首次从高粱基因组中克隆得到两
个候选 SbGABA-T 基因,将其在大肠杆菌 BL21(DE3)
中进行诱导表达,并利用镍柱对融合蛋白进行纯化,
旨为高粱 SbGABA-T 蛋白的底物活性、催化机制的
研究,以及进一步相关抗体的制备及免疫学方法的
考察等奠定基础,也为其他禾谷类作物相关基因的
研究提供借鉴意义。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料 高粱[Sorghum bicolor(L.)Moe-
nch]自交系 BTx623,由中国科学院植物所景海春课
题组馈赠。
1.1.2 表达菌株及质粒载体 本研究所用菌株 E.
coli DH5α、BL21(DE3)pLysS、 克 隆 载 体 T-easy
blunt 购于北京全式金生物技术有限公司。表达载体
pET28a(+)购于 Novagen 公司。
1.1.3 工具酶及生化试剂 RNA 提取所用的 Trizol
试剂购于 Invitrogen 公司 ;限制性内切酶、T4 DNA
连接酶、Phusion 高保真酶等购自 NEB 公司 ;反转
录试剂盒为 Fermentas 公司产品 ;胶回收试剂盒、质
粒提取试剂盒、DNA Marker(DL5000)、Ni-Agarose
His 标签蛋白纯化试剂盒等均购自北京康为世纪生
物科技有限公司 ;IPTG 及其他生化试剂等购自于
Sigma 公司 ;引物合成及测序由北京中美泰和公司
完成。
1.2 方法
1.2.1 SbGABA-T 基因的 cDNA 扩增 以拟南芥(Ar-
abidopsis)的 GABA-T 基因序列(GenBank Accession
No.At3g22200)[14]在高粱全基因组数据库(NC_01-
2876)中进行比对,选取序列同源性较高的基因,
在 线 分 析 程 序 NEW PLACE(https ://sogo.d n a.affrc.
go.jp/)、TargetP(http ://www.cbs.dtu.dk/serv ices/
TargetP/)、PSORT(http ://psort.hgc.jp/ form.ht m l ) 分
析其信号肽序列[15]。利用 Primer Premier 5.0 软件分
别设计开放阅读框(ORF)全长引物(SbGABA-T 表
示)及去除 N 端信号肽后剩余区域(SbGABA-ΔT 表示)
的引物(下划线为限制酶酶切位点):
SbGABA-T1 :F 5-CGGGATCCATGATCGCACA-
AGGCCTCCGC-3,R 5-CGAGCTCCTAATTCTTCCT-
GGATTTCAGTT-3 ;
SbGABA-T2 :F 5-CGGGATCCATGATCGCGCG-
ACGCCTG-3,R 5-CGAGCTCCTAGTTCTTCTTGGA-
TTTCAGGG-3 ;
SbGABA-ΔT1 :F 5-CGGGATCCAGTTCTGAACC-
TTCACTTCAGG-3,R 5-CGAGCTCCTAATTCTTCC-
TGGATTTCAGTT-3 ;
SbGABA-ΔT2 :F 5-CGGGATCCTTTAGTTCAGCT-
CCATCTGCAC-3,R 5-CGAGCTCCTAGTTCTTCTT-
GGATTTCAGGG-3。
2015,31(5) 95杨泽伟等:高粱 SbGABA-Ts基因的克隆、原核表达及纯化
利用 Trizol 试剂提取高粱 BTx623 幼苗总 RNA,
并反转录生成 cDNA,以 cDNA 为模板进行 PCR 扩
增。扩增条件为 :98℃预变性 30 s ;98℃ 变性 10 s,
58℃退火 20 s ;72℃延伸 1 min,循环 33 次 ;72℃
延伸 5 min。扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,切胶回
收所需大小的条带,连接至克隆载体 T-easy blunt,
并转化到大肠杆菌 DH5α 中,选取阳性转化子送公
司测序。
1.2.2 原核表达载体的构建 提取阳性转化子质粒,
BamH I 和 Sac I 双酶切处理,所得片段连入相同酶
切的 pET28a(+)质粒,并转化到大肠杆菌 DH5α 中,
涂布含卡那霉素(终浓度为 50 mg/L)的 LB 平板。
选取 PCR 阳性的克隆提取质粒进行酶切验证,同时
送公司测序。鉴定正确的转化子提取质粒,转化到
表达菌株 BL21(DE3)pLysS 中。
1.2.3 重 组 质 粒 的 诱 导 表 达 挑 取 BL21(DE3)
pLysS 阳性单菌落,接种至含卡那霉素(终浓度为 50
mg/L)的液体 LB 培养基中,37℃,200 r/min 培养过
夜,所得培养物按 1% 接种至新鲜培养基 ;37℃、
200 r/min 培 养 至 OD600 约 0.6, 加 入 IPTG 溶 液,
16℃、200 r/min 进行诱导表达[16,17]。设定 IPTG 诱
导浓度梯度(终浓度):0、0.25、0.5、1.0 mmol/L ;
及诱导时长梯度 :10、14、18、22、34 h。分别取
样进行 SDS-PAGE 分析,以确定合适的诱导表达
条件。
按确定的优化条件进行诱导表达,离心收集
菌 体, 用 PBS 溶 液(140 mmol/L NaCl,2.7 mmol/L
KCl,10 mmol/L Na2HPO4,1.8 mmol/L KH2PO4,2
mmol/L PMSF,1% Triton-X-100)重悬,超声波间歇
处理破碎菌体。离心后,菌液上清与沉淀分别取样
进行 SDS-PAGE 电泳检测。
1.2.4 融合蛋白的纯化 按 Ni-Agarose His 标签蛋
白纯化试剂盒说明书填充好镍柱,平衡柱子后负载
上样(菌液上清),收集流穿液 ;依次用不同梯度
的咪唑缓冲液进行目的蛋白的洗涤和洗脱,分别
收集洗涤液和洗脱液。缓冲液成分为 :20 mmol/L
Tris-HCl(pH7.9),0.5 mol/L NaCl,10 -500 mmol/L
咪唑。收集的液体分别取样进行 SDS-PAGE 电泳
检测。
2 结果
2.1 高粱SbGABA-T基因的cDNA克隆
根据已知的拟南芥 AtGABA-T 基因(GenBank
Accession No.At3g22200) 序 列, 在 高 粱 基 因 组 中
数 据 库(NC_012876) 中 进 行 Blast, 获 得 两 个 候
选 GABA-T 基 因 亚 型(hypothetical protein, 未 注
释),本研究将其分别命名为 SbGABA-T1(GenBank
Accession No.XM_002445162)、SbGABA-T2(GenBank
Accession No.XM_002 447046),其中,SbGABA-T1 位
于高粱基因组第 7 号染色体上,编码 509 个氨基酸;
SbGABA-T2 则位于高粱基因组第 6 号染色体上,编
码 511 个 氨 基 酸。SbGABA-T1、SbGABA-T2 与 拟 南
芥 AtGABA-T 的氨基酸序列相似性分别为 73.11%
和 72.51%,两亚型间的相似性为 78.78%,且可变
区域多集中在序列 N 端。进一步分析可知,其前
端信号肽剪接位点分别在第 30 和第 31 位氨基酸位
置。据此设计引物,以高粱 BTx623 品种 cDNA 为
模板,分别克隆基因全长序列及截去 N 端信号肽后
剩余部分序列,如图 1 琼脂糖凝胶电泳所示,基因
全长大小约为 1 500 bp,截去 N 端信号肽后大小约
为 1 400 bp,与预期的片段大小相符。将 PCR 产物
连入克隆载体并测序,测序结果与公开数据库中的
相关序列一致,表明高粱 BTx623 基因组中确实存在
SbGABA-T1、SbGABA-T2 两个转录本。保守功能域分
析(http ://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.
cgi)表明,SbGABA-T1、SbGABA-T2 均隶属于乙酰
鸟氨酸转氨酶(AAT _ Ⅰ)超家族,而 γ-氨基丁酸
转氨酶是该家族成员之一。
5000
bp
M 1 2 3 4
1500
1000
500
M :DL5000 Marker ;1-4 :SbGABA-T1 基因
图 1 RT-PCR 克隆高粱 SbGABA-T 基因
2.2 重组质粒pET28a(+)-SbGABA-Ts的构建
分别将 SbGABA-T1、SbGABA-T2、SbGABA-ΔT1、
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.596
SbGABA-ΔT2 四个片段构建到带有 His 标签的原核
表达载体 pET28a(+)上(图 2-A)。相应的重组质
粒 pET28a(+)-SbGABA-Ts 经 过 BamH Ⅰ 和 Sac Ⅰ
双酶切鉴定,结果如图 2-B 所示,酶切后表达载体
大小约为 5 300 bp,目的片段大小约为 1 500 bp 和
1 400 bp,符合预期。进一步测序结果表明目的基
因均位于正确的读码框中,表明重组质粒 pET28a
(+)-SbGABA-Ts 构建正确。
照组,加有 IPTG 诱导的实验组在 55 kD 附近新增了
一条蛋白条带(图 3 箭头指示),与预期融合蛋白的
分子量相符。
5000
bp
M 1 2 3 4
1500
1000
500
A
B
pET28a +
5 369 bp
BamH I Sac I
SbGABA-T1
SbGABA-T2
SbGABA-ΔT1
SbGABA-ΔT2
3000
2000
4000
5000
1000
T4 term
inator
T4 tag
T7 pronoter
locl prom
oter
(A)重组质粒 pET28a(+)-SbGABA-Ts 构建示意图 ;(B)重组质粒 pET28a
(+)-SbGABA-Ts 双酶切验证电泳图 ;M :DL5000 Marker ;1-4 :分别为重组
质粒 pET28a(+)-SbGABA-T1、T2、△T1、△T2 双酶切片段
图 2 重组质粒 pET28a(+)-GABA-Ts 的构建
2.3 重组蛋白pET28a(+)-SbGABA-Ts诱导表达
条件
将构建正确的重组表达载体利用热激法转入表
达菌株 E. coli BL21(DE3)pLysS 后,进行融合蛋白
的诱导表达。实验中发现,无论如何优化诱导表达
条件,如 IPTG 浓度、诱导时长等,SbGABA-Ts 全
长融合的目的蛋白表达量均非常少,且多集中在包
涵体中,无法满足下一步研究需要 ;而截去 N 端信
号肽后的 SbGABA-△T 的融合蛋白,成功实现在可
溶性组分中高效表达(图 3)。较之未加 IPTG 的对
170
kD M 1 2 3 4 5 6 7 8
100
55
40
35
25
M:蛋白 Marker;1-4:BL21(DE3)/pET28a(+)-SbGABA-T1 总蛋白;5-8:
BL21(DE3)/pET28a(+)-SbGABA-△T1 总蛋白 ;其中 1、2、5、6 为上清
总蛋白,3、4、7、8 为沉淀总蛋白 ;1、3、5、7 未加 IPTG 诱导,2、4、6、
8 加入 IPTG 诱导
图 3 重组蛋白 pET28a(+)-SbGABA-T1/ △ T1 的诱导
表达
进一步优化表达条件,以转化 pET28a(+)-
SbGABA-T1 重组质粒的菌株进行 IPTG 诱导浓度和
诱导时长的探索,结果如图 4 所示。加有 IPTG 的
实验组均成功实现重组蛋白的表达,尽管融合蛋白
在包涵体中分布较多,但菌体破碎上清中仍有明显
目的蛋白的产生(图 4-A)。不同浓度 IPTG 作用下,
融合蛋白表达量的差别并不明显,表明融合蛋白的
表达量受 IPTG 诱导浓度的影响有限。相对来说,1
mmol/L IPTG 诱导下的目的蛋白表达量在可溶性组分
中分布最多,相应地在包涵体中分布较少,表明 1
mmol/L IPTG 可以作为比较合适的诱导浓度。图 4-B
表明,pET28a(+)-SbGABA-△T1 重组蛋白表达量
随诱导时间的延长而增加,但增加幅度有限,考虑
到诱导时间过长可能影响融合蛋白的结构功能,选
择表达量相对较高的 18 h 作为最适的诱导时长。
2.4 重组蛋白pET28a(+)-SbGABA-△T的纯化
根据优化的诱导表达条件对重组菌 BL21(DE3)/
pET28a(+)-SbGABA-△T1/△T2 进行融合蛋白的大
量诱导表达,并利用带 His 标签的镍柱进行目的蛋
白的纯化。如图 5-A、B 所示,流穿液中目的蛋白的
量明显减少,表明目的蛋白已结合到镍柱上,经过
梯度浓度的咪唑缓冲液洗涤后,杂蛋白被除去,最
2015,31(5) 97杨泽伟等:高粱 SbGABA-Ts基因的克隆、原核表达及纯化
170
kD
A
B
M 1 2 3 4 5 6 7 8
100
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40
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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
(A)不同浓度 IPTG 诱导下 BL21(DE3)/pET28a(+)-SbGABA-△T1 蛋白表达;
M :蛋白 Marker ;1-4 :分别为 IPTG 浓度 0、0.25、0.5、1.0 mmol/L 诱导下
的上清总蛋白 ;5-8 :分别为 IPTG 浓度 0、0.25、0.5、1.0 mmol/L 诱导下的
沉淀总蛋白;(B)不同诱导时间下 BL21(DE3)/pET28a(+)-SbGABA-△T1
蛋白表达 ;1-5 :诱导时长 10、14、18、22、34 h 下的上清总蛋白 ;6-10 :
诱导时长 10、14、18、22、34 h 下的沉淀总蛋白
图 4 不同 IPTG 浓度及不同诱导时间下重组蛋白 pET28a
(+)-SbGABA-△T1 的表达
终目的蛋白在咪唑浓度为 250 mmol/L 时被洗脱下来,
相应的 SDS-PAGE 图表明,纯化的目的蛋白条带单
一,且浓度较高,能够满足进一步实验的需要。
3 讨论
植物受各种逆境胁迫而快速积累 GABA 的现象
已广为人知[4-6],近年的研究进一步表明,GABA 途
径在植物胞质 pH 调节、碳 / 氮源平衡、环境胁迫应答、
植株生长发育及形态建成等方面都发挥着重要的作
用[5-7]。作为 GABA 分解代谢的关键基因,GABA-T
对于维持 GABA 途径的正常运转具有重要意义,而
植物中相关的研究一直比较滞后。近年来,随着拟
南芥、水稻、番茄等作物中 GABA-T 基因相继被克隆,
GABA-T 在植物生长发育和胁迫应答中的作用才日益
清晰[8-10]。本研究首次对高粱 SbGABA-Ts 基因进行
了分离及原核表达分析。研究发现,不同于拟南芥
中 GABA-T 基因的单拷贝,高粱中存在两个 GABA-T
基因亚型,与番茄(Solanum lycopersicum L.)中相
关基因亚型数量一致。GABA-T 基因以基因家族形式
存在,一定程度上有助于植物在干热环境下光呼吸
作用积累的乙醛酸的代谢,是植物适应环境压力的
表现[8]。
多 序 列 比 对 和 保 守 结 构 域 分 析 表 明, 高 粱
SbGABA-T 基因与已知的植物 GABA-T 基因的氨基酸
序列相似性达到 71%-88%,而且均隶属于乙酰鸟氨
酸转氨酶(AAT_ Ⅰ)超家族。但以往的研究证实,
植物中 GABA-T 基因各亚型间的时空表达模式、亚
细胞定位、蛋白酶活性等不尽相同,预示着植物中
GABA-T 基因各亚型间生理功能上的差异[8-10]。这
种结构与功能上的保守性和差异性,确保了 GABA-T
基因各亚型间在各种生理过程中既能“相互协作”,
又能“各司其职”,体现了植物相关代谢调控的灵活
和巧妙[18]。
GABA-T 酶活的考察是 GABA-T 基因原核表达后
重要的研究内容之一。植物中 GABA-T 蛋白酶底物
特异性的研究仍存在争议。早期研究发现,哺乳动
物、真菌、原核生物中的 GABA-T 多以 α-酮戊二酸
作为氨基受体[13],而植物体内 GABA-T 则表现出丙
酮酸和 α-酮戊二酸两种活性[19]。但植物体内酶活的
研究不可避免的受到诸多因素的影响,如目标蛋白
170
kD
A
B
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9
100
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170
kD
100
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40
35
25
(A)重组蛋白 pET28(a)-SbGABA-△T1 的纯化 ;(B)重组蛋白 pET28(a)-
SbGABA-△T2 的纯化 ; M :蛋白 Marker ;1 :未加 IPTG 的对照组 ;2 :加
有 IPTG 的实验组 ;3 :流穿液 ;4-9 :分别为 10、20、50、100、250、500
mmol/L 咪唑浓度洗脱液
图 5 重组蛋白 pET28a(+)-SbGABA-△T1/△T2 的纯化
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.598
酶提取效率低、分离困难、其他蛋白酶的干扰等[20]。
对目的蛋白进行异源表达是研究蛋白结构和功能的
有效手段。近期,Clark 等[8]通过对拟南芥 GABA-T
体外重组表达分析发现,拟南芥中 GABA-T 主要以
丙酮酸和乙醛酸为氨基酸受体,而非 α-酮戊二酸,
类似的结果也相继出现在番茄、水稻 GABA-T 的研
究中[8-10]。植物中 GABA-T 酶具有乙醛酸底物活性
的发现,进一步开拓了人们关于 GABA 途径的传统
认知。乙醛酸作为植物光呼吸途径的主要产物,表
明 GABA 途径可能与植物光呼吸途径联系[21],由
此推测,GABA-T 能直接利用异柠檬酸降解而来的
乙醛酸形成甘氨酸和第二个琥珀酸分子(GABA 旁
路中琥珀酸脱氢酶作用形成一分子琥珀酸),补充至
TCA 循环中,这有助于维持受胁迫植物在碳源不足
的状态下的能量供应[22]。
本研究通过序列相似性比对和 RT-PCR 方法成
功 克 隆 到 高 粱 两 个 GABA-T 基 因, 并 利 用 pET28a
(+)原核表达系统进行基因的异源表达分析,最终
获得了大量高质量纯化的重组蛋白,蛋白浓度分别
达到 965.46 ng/μL 和 893.09 ng/μL。值得注意的是,
GABA-T 基因编码区全长融合的目的蛋白与去除了 N
端信号肽的目的蛋白在原核表达系统中的差异非常
显著,前者存在于包涵体中,且表达量有限 ;而后
者虽然在包涵体中也有大量分布,但在可溶性组分
中也有明显的表达。一种解释是原核细胞中缺乏相
关的机制对诱导的蛋白质前体进行进一步加工,而
去除了 N 端信号肽的 GABA-△T 是一种更接近于植
物体内成熟的 GABA-T 的存在形式,这对于目的蛋
白在原核表达系统中表达量和可溶性的提高更为有
益[8]。重组蛋白以可溶性形式存在,使后续的蛋白
纯化过程可以在无变性剂的相对温和条件下进行,
纯化后的蛋白可以最大限度地保持其空间构象与功
能,这为今后高粱 GABA-T 酶活的分析、相应抗体
的制备及通过免疫学方法的深入研究奠定了基础,
也为其他禾谷类作物相关基因的研究提供了参考和
借鉴。
4 结论
通过序列相似性比对和 RT-PCR 方法首次克隆
得到高粱两个 GABA-T 基因,保守结构域分析表明
该基因均隶属于乙酰鸟氨酸转氨酶(AAT _ Ⅰ)超
家族。利用 pET28a(+)原核表达系统进行基因的
异源表达,表明 SbGABA-T 编码区全长的融合蛋白
主要在包涵体中表达,而去除了其 N 端信号肽的融
合蛋白以部分可溶的形式存在,且在 1 mmol/L IPTG
(终浓度)、16℃诱导条件下高效表达。经 Ni 亲和层
析柱纯化,250 mmol/L 咪唑溶液洗脱,即可得到纯
化的融合蛋白。
参 考 文 献
[1]王海莲 , 管延安 , 张华文 , 等 . 高粱基因组学研究进展[J]. 基
因组学与应用生物学 , 2009(3):549-556.
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(责任编辑 李楠)