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The Cis-elements of Responsing Jasmonates in Plant

植物中响应茉莉素应答的顺式作用元件



全 文 :·综述与专论· 2013年第4期
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
收稿日期 :2012-12-05
基金项目 : 国家自然科学基金项目(31000536),中国博士后科学基金项目(2011M501273),湖南省博士后科研资助专项计划项目
(2011RS4009),湖南省优秀博士学位论文获奖作者科研资助项目,湖南省教育厅重点项目(09A038)
作者简介 :黄诗玮,女,硕士研究生,研究方向 :植物分子生物学 ;E-mail :522379172@qq.com
通讯作者 : 田云,男,博士,副研究员,研究方向 :植物生物化学与分子生物学 ;E-mail :tianyun79616@163.com
卢向阳,男,博士,教授,研究方向 :植物生物化学与分子生物学 ;E-mail :xiangyangcn@163.com
茉莉素(jasmonates,JAs)是一类基本的植物
激素,包括茉莉酸(jasmonate,JA)\ 茉莉酸甲酯(methyl
jasmonates,MeJA) 及其 他 衍 生 物。 早 在 1971 年,
茉莉酸就已被人们分离出来,但直到 1980 年,Ueda
等[1]开始研究这类化合物的生物活性。研究表明,
茉莉素由 α- 亚麻酸通过 ODPA 途径合成,广泛存在
于植物的幼嫩组织、花和正在发育的生殖器官中,
参与调节植物的生长发育。如抑制根的生长、种子
萌发、诱导导管形成、腺毛形成、花发育、花粉发
育和开裂,促进雌性器官的发育、雌蕊的伸长及植
株衰老等[2],同时,JAs 作为激发子、病虫害和机
械伤害等胁迫诱导植物防卫基因表达的信号分子在
植物抵抗环境胁迫方面起重要作用[3]。
目前,从植物中已克隆出大量受茉莉素诱导的
植物中响应茉莉素应答的顺式作用元件
黄诗玮  马述  田云  卢向阳
(1. 湖南省农业生物工程研究所,长沙 410128 ;2. 湖南农业大学生物科学技术学院,长沙 410128)
摘 要 : 茉莉素是一类基本的植物激素,广泛存在于生物体内,它作为信号分子在植物的发育、衰老以及胁迫信号响应过
程中发挥重要的作用。启动子是位于基因 5 端 ATG 上游负责调控基因转录的一段 DNA 序列。目前,已在植物启动子中鉴定出许
多与诱导表达相关的顺式作用元件。着重介绍植物启动子中响应茉莉素应答的顺式作用元件的研究进展。
关键词 : 植物启动子 顺式作用元件 茉莉素
The Cis-elements of Responsing Jasmonates in Plant
Huang Shiwei Ma Shu Tian Yun Lu Xiangyang
(1. Hunan Agriculture Bioengineering Research Institute,Changsha 410128 ;2. College of Bioscience and Biotechnology,Hunan Agriculture
University,Changsha 410128)
Abstract:  Jasmonates is a kind of basic plant hormone, widely exists in living organisms, as a signal molecule, it plays an important role
in the process of the plant development, senescence and stress signal response. The promoter a DNA sequence which is located in gene 5end
ATG upstream and responsible for the regulation of gene transcription. At present, a lot of induced expression related cis-elements has been
identified. This paper mainly introduces the research progress of the of plant promoter’s cis-elements which is responsing jasmonates.
Key words:  Plant promoter Cis-elements Jasmonates
基因,包括防御相关的基因,如拟南芥的 PDF1.2、
Thi2.1、Pin Ⅱ、AtVSP[4,5]、 烟 草 的 gln2、PBR-1b
和 osmotin 等[6,7]。次生代谢产物合成相关基因,如
腐胺 -N- 甲基转移酶、鸟氨酸脱梭酶等尼古丁和吲
哚生物碱 TIAs 生物合成酶的基因[8,9],还有一些
JAs 自身合成相关基因,如 AOC、OPR、LOX2、AOS
及 JMT 等[10]。Shetty 等[11] 在 研 究 茄 子 多 酚 氧 化
酶基因 SmePPO1 对外源 MeJA 和 SA 响应差异时发
现, 其 家 族 基 因 SmePPO1、SmePPO2、SmePPO3、
SmePPO4、SmePPO5 和 SmePPO6 均 受 到 MeJA 的
调控。Lu 等[12]利用生物信息学的方法分离得到两
个新的聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(Polygalacturonase-
inhibiting proteins,PGIPs)基因 Ospgip6 和 Ospgip7,
PGIPs 能够抑制真菌病原菌对植物细胞壁的破坏,
2013年第4期 9黄诗玮等 :植物中响应茉莉素应答的顺式作用元件
在植物防御真菌侵染中起重要作用,荧光定量试
验表明,在 JA 处理水稻后,Ospgip6 的表达下调,
而 和 Ospgip7 的 表 达 上 调。Duan 等[13] 从 橡 胶 中
分离了大量的橡胶合成相关基因,其中 HbSAUR、
HbACR、 HbCAS2、 HbCIPK和HbGP受到 MeJA 的上调,
而 HbCOI1、HbMYB,、HbChi 和 HbDef 受到 MeJA 的
下调。在植物防御反应中,有大量转录因子的参与,
大部分情况下,这些转录因子本身也受到激素和刺
激子的诱导。Miyamoto 等[14]在水稻中找到一个与
茉莉酸积累紧密相关的转录因子 RERJ1,在植物受
到伤害后,JA 的积累会诱导伤害周围大量 RERJ1
的生成,Miyamoto 等认为 RERJ1 可作为一个标记基
因研究 JA 的定位。Ryu 等[15]采用 Northern blot 的
方法对水稻 WRKY 家族 85 个基因进行了研究发现,
WRKY10、WRKY30、WRKY82、WRKY83 和 WRKY85
受 MeJA 的调控较明显,而在拟南芥中 WRKY62 转
录因子在 NPR1(non-expresser of pathogenesis-related
PR gene 1)下游负调控 JA 响应基因的表达,但它本
身却受到 MeJA 的诱导[16]。茉莉素不能直接作用于
DNA,需要受体蛋白的参与,进而启动一系列反应,
启动子作为启动基因表达的关键元件是如何参与其
中的,这涉及到启动子中的顺式作用元件,转录因
子能特异性识别并结合启动子中的顺式作用元件进
而启动基因的表达。
1 植物启动子中响应茉莉素诱导的顺式作用
元件
到目前为止,对茉莉素的研究已有 30 多年历史,
茉莉素作为内源信号分子参与植物一系列的抗逆反
应,诱导大量与抗逆相关的基因表达,已鉴定响
应茉莉素应答相关的顺式作用元件有 G-box、GCC-
box、13-bp motif、JASE1、JASE2、W-box、E-box、
as-1-type 和 GAGTA 元件等(表 1)。
表 1 响应茉莉酸类化合物诱导的顺式作用元件
Cis-element 基因 Source 核心序列 参考文献
G-box PIN Ⅱ Solanum tuberosum CACGTGG [17]
VspB Glycine max CACGTG [19]
PIN Ⅱ Lycopersicon esculentum CACGTG [18]
NtPMT1a Nicotiana tabacum GCACGTTG [20]
G-box-like Vsp1 Arabidopsis thaliana AACGTG [22]
LAP Lycopersicon esculentum AACGTG [18]
ORCA3 Catharanthus roseus AAACGTGC [22]
BjCHI1 Brassica juncea AACGTG [25]
ORCA3 Arabidopsis thaliana AAACGTGC [24]
GCC-box PDF1.2 Arabidopsis thaliana GCCGCC [26]
[27]
GCC-box-like NtPMT1a Nicotiana tabacum TGCGCCC [20]
Str Catharanthus roseus TTAGACCGCCTT [9]
JASE1 OPR1 Arabidopsis thaliana 5’CGTCAATGAA3’ [28]
JASE2 OPR1 Arabidopsis thaliana 5’CATACGTCGTCAA3’ [28]
13-bp-type Tto1 Nicotiana tabacum TGGTAGGTGAGAT [30]
as-1 LOX1 Hordeum vulgare TGACG/CGTCA [34]
Nos Nicotiana tabacum TGACGT [33]
CaMV35S promoter Nicotiana tabacum TGACG [32]
W-box PtDrl02 Populus tomentosa TTGACT/A [35]
E-box Oschia4a Oryza sativa CANNTG [36]
GAGTA LAP Arabidopsis thaliana GAGTA [18]
1.1 G-box和G-box-like
G-box 是目前研究得较多的植物启动子顺式作
用元件,它不但能对伤害、光作出应答反应,而且
能对茉莉酸类化合物作出应答。G-box 的核心序列是
CACGTG。
马铃薯的蛋白酶抑制剂基因 PIN Ⅱ启动子序列
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2013年第4期10
中含有响应 MeJA 的顺式作用元件,Kim 等[17] 将
不同长度的 PIN Ⅱ基因启动子序列片段与氯霉素乙
酰转移酶(CAT)报告基因融合转至烟草中进行表
达。研究发现,-573/-574 区是响应 MeJA 的关键区
域,此区域含有一个 G-Box 序列(CACGTGG)。同
样,Boter 等[18]在研究番茄时发现,番茄的 PIN Ⅱ
基因启动子中也有响应 MeJA 的顺式作用元件 G-box
(CACGTG)。黄豆 VspB 基因编码高度表达的植物贮
藏蛋白酸性磷酸酶,它的表达受到糖和 MeJA 的诱导。
Mason 等[19]通过启动子功能分析试验发现,MeJA
的应答区域是在 -535 到 -585 之间,经鉴定,此区域
中含有一个 G-box(CACGTG)和一个 C-rich 序列[CC
(C/A)TA(G/C)AAC(C/T)],二者共同作用调控
植物响应 JA。烟草的 PMT 基因编码催化尼古丁生
物合成的第一个关键酶——1,4- 丁二胺 - 氮 - 甲基
转移酶。研究发现,NtPMT 家族成员基因均受 MeJA
的诱导,但受诱导程度不同。通过 NtPMT1a 的缺失
试验验证位于转录起始位点上游 -103 到 -96 的保守
序列 G-box(GCACGTTG)是响应 MeJA 的关键顺式
作用元件,G-box 的删除或者突变可导致响应完全消
失。与此同时,研究发现,除 G-box 外,-80 到 -69
的 T-A rich 区和 -62 到 -56 的 GCC 序列(TGCGCCC)
也 是 必 不 可 少 的, 它 们 共 同 作 用 使 NtPMT1a 受
MeJA 的诱导程度达到最大[20]。参照 Fouster[21]文
章的介绍,Xu 等[20]研究得到的序列应该是 T/G-box,
是由 T-box 和 G-box 的部分序列组合而成的。
另外,研究者们发现一些基因启动子中响应
MeJA 的顺式作用元件的核心序列为 AACGTG,类似
于 G-box(CACGTG),统称为 G-box-like 或 T/G-box,
它们都含有序列 ACGT。拟南芥 vsp1 基因编码一种
贮藏蛋白,瞬时表达试验证明,MeJA 可诱导 vsp1
基因的表达。进一步研究该基因启动子发现,TATA
盒上游 150 bp 处有一段 41 bp 的关键区域,对其中
的 CAAT-box-like 进行缺失试验,并未影响 MeJA 对
基因 vsp1 的诱导作用。相反,序列 AACGTG 的突变
导致诱导作用完全消除。因此,G-box-like(AACGTG)
序列才是 vsp1 基因响应 MeJA 应答的关键顺式作用
元件[22]。
Vom 等[23]在对长春花 AP2(APETALA2-domain)
类转录因子 ORCA3 的研究中发现,ORCA3 基因的
表达受 JA 的诱导,缺失试验确定 ORCA3 基因启动
子中含有一个自发的茉莉酸应答元件(Jasmonate
responsiveelement,JRE)。这一元件有两部分组成 :
G-box-like 元 件, 核 心 序 列 为 AAACGTGC, 保 证
ORCA3 基因高水平表达 ;另一部分为富含 A/T 序列
(CAATAAAATATT)作为开关调控 ORCA3 的表达。
酵母单杂交试验表明,A/T-hook 蛋白家族中的一个
成员能与富含 A/T 的 DNA 序列结合,可能在决定
ORCA3 基因响应茉莉酸表达水平上起重要作用。随
后,Montiel 等[24]的研究也发现,拟南芥的 ORCA3
基因启动子中也含有一个 JRE 元件,由一个 G-box-
like 元件和富含 A/T 序列组成,同时发现体内体外
都能与 JRE 作用的 bHLH 转录因子 AtMYC,这对研
究茉莉酸信号通路具有重大意义。Wu 等[25]在芥菜
BjCHI1 基因的启动子中也找到了响应 MeJA 的 T/G-
box(AACGTG),这是第一次确定在几丁质酶基因
启动子中含有 T/G-box 元件。
1.2 GCC-box和GCC-box-like
GCC-box 由 GCC 序列串联而成,核心序列为
GCCGCC。GCC-box 是一类乙烯应答的顺式作用元件,
存在于众多与防御相关的 PR 基因的启动子序列中,
在植物生长发育和抵抗胁迫上具有重要的调控作用。
PDF1.2 是编码防御蛋白的基因,其体内表达
受到 MeJA 的诱导,Brown 等[26] 在拟南芥 PDF1.2
基因启动子中找到了响应茉莉酸的顺式作用元件
GCC-box,其核心序列为 GCCGCC。点突变试验表明,
GCC-box 是应答茉莉酸反应必要的顺式作用元件,
其下游序列中可能也存在部分作用元件参与到茉莉
酸应答反应中。AtERF2 是乙烯应答因子,但它也
响应 MeJA 的诱导,AtERF2 可能通过与 GCC-box 的
相互作用参与调控受茉莉酸诱导的基因表达。Zhang
等[27]进一步证实,关键作用碱基为第一个 G 和第
四个 G 及第六个 C。
Str 基因是长春花中次生代谢产物合成基因,它
能合成萜类吲哚生物碱,受诱导子的诱导需要 JA
作为第二信使。Str 基因启动子一个 42 bp 的区域是
响应 JA 和诱导子所必须的,这一区域中含有一个
GCC-box-like 元 件, 核 心 序 列 为 TTAGACCGCCTT。
Menke 等[9]用酵母单杂交的方法鉴定出两个能与
2013年第4期 11黄诗玮等 :植物中响应茉莉素应答的顺式作用元件
JERE(JA- and elicitor-responsive element) 结 合 的
AP2 类蛋白 ORCA1 和 ORCA2。试验表明,ORCA2
受到 JA 和诱导子诱导进而激活 str 启动子启动转录。
1.3 JASE1和JASE2
He 和 Gan[28]从拟南芥中扩增得到一个编码防
御蛋白的 OPR1 基因,在衰老的情况下或者 JA 处理
导致 OPR1 基因表达的上调。OPR1 基因启动子中
两个顺式作用元件 JASE1(5CGTCAATGAA3)和
JASE2(5CATACGTCGTCAA3) 同 时 响 应 JA 的 诱
导。JASE2 中包含一个 A/C box-like 序列(TACGTC),
而 JASE1 是一个未曾报道过的新元件。研究表明,
JASE1 和 JASE2 对叶片衰老和 JA 诱导的 OPR1 基因
表达上调是必须的,由此猜测,叶片衰老和 JA 诱导
OPR1 表达可能是共同的分子机制。
1.4 13-bp-type
烟草基因 Tto1 是一种反转录转座子,反转录转
座子是以 RNA 为中介,反转录成 DNA 后进行转座
的可动元件。一般根据 DNA 分子两端是否含有长末
端重复序列(long terminal repeat sequence,LTR)可
分为两类。Tto1 含有 LTR,转基因烟草试验表明,
Tto1 受到 MeJA 的诱导表达上调[29],深入研究 Tto1
的启动子发现,一个 13 bp 的序列在 LTR 区响应伤
害和 MeJA 的诱导,13 bp 序列(TGGTAGGTGAGAT)
包含有一个保守的 Box L(也称为 AC-I 或 H-box-like
序列)[30]。
1.5 as-1(activation sequence-1)
as-1 序列广泛存在于与防御相关的基因的启动
子中,它的核心序列为 TGACG。as-1 由两个 TGACG
序列串联重复组成,第一次被确定是在烟草花叶病
毒 CaMV 的 35s 启动子中[31],Xiang 等[32]也对烟草
花叶病毒 35s 启动子中响应 MeJA 的顺式作用元件
TGACG 进行了验证。Kim 等[33]在对 PI Ⅱ基因进行
研究时意外发现,nos 基因对 MeJA 和 SA 的响应作
用,于是研究 nos 基因的启动子,寻找参与调控的
关键顺式作用元件。缺失试验表明,胭脂氨合酶基
因 nos 响应 SA 和 MeJA 的区域在基因转录起始位点
上游 -119 和 -112 之间,此区域包含序列 TGACG。
因缺失 -112 到 -101 之间的 CAAT 盒人们发现,nos
基因受 MeJA 的诱导水平有所下降,而受 SA 的诱导
水平无显著改变。结合这些研究结果可知,nos 基
因上游包含有 TGACG 的区域是响应 MeJA 的必须区
域,而紧接其下游的 CAAT 盒可以保证受 MeJA 诱
导的程度达到最大。大麦的脂氧合酶基因 LOX1 受
到 MeJA 和伤害的诱导,启动子缺失实验表明响应
MeJA 的关键区域是在 -328 到 -291 之间,这 36 bp
的序列包括 TGACG 及其反向重复序列 CGTCA,具
体为(-328CAATCGTCATGAATGAAGTCATGTGACGG-
CTACACA-293)。定点突变试验进一步证明了 TGACG
为 响 应 MeJA 的 关 键 顺 式 作 用 元 件。 由 此 猜 想,
TGACG 和反向重复序列 CGTCA 所构建的空间结构
可能作为转录因子的结合位点参与调控 MeJA 应答
反应[34]。
1.6 W-box
W-box 的核心序列 TTGACC,作为响应真菌诱
导和乙烯诱导的顺式作用元件研究较为广泛,而关
于其受 MeJA 诱导的研究是较少的。Zheng 等[35]在
对白毛杨 PtDrl02 基因启动子的研究中有所展现。
PtDrl02 基因属于 TIR-NBS 基因家族,其表达具有
组织特异性,启动子缺失实验表明,转录起始位点
上游 -669 到 -467 含有响应伤害和 MeJA 的顺式作用
元件。根据在线软件预测分析 -669 到 -467 可能含
有两个响应 MeJA 的顺式作用元件 W-box(TTGACT/
TTGACA),但有待进一步的试验验证。
1.7 E-box
几丁质酶基因 OsChia4a 参与水稻的防卫反应,
可抑制真菌的孢子萌发与菌丝生长。Miyamoto 等[36]
通过寡核苷酸微阵列技术分析发现,经 JA 诱导的
水稻悬浮培养细胞中的 OsChia4a 基因的表达明显上
调,超过常规的一些防卫基因的上调水平。通过启
动子缺失和点突变试验确定在 ATG 转录起始位点上
游 -515 到 -265 之间存在一个 E-box(CANNTG)响
应 JA 的诱导。
1.8 GAGAT
番茄中,亮氨酸氨肽酶 LAP 是参与防御反应的
一个重要的蛋白。LAP 基因受到 JA 的诱导,Boter 等[18]
确定响应 JA 的元件位于启动子区 -317 到 -78 之间。
通过酵母单杂的方法分离到两个 bHLH- 亮氨酸拉链
蛋白 JAMYC2 和 JAMYC10,它们能特异识别 -317
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2013年第4期12
到 -78 之间的 T/G-box(AACGTT),但对 T/G-box 突
变发现启动子的 JA 诱导活性降低,但未完全消失。
通过足迹印记法发现,在 T/G-box 邻近区域有一段
GAGTA 序列,GAGTA 的突变使启动子 JA 诱导活性
丧失,说明 GAGTA 是启动子响应 JA 必须的。T/G-box
和 GAGTA 共同作用,响应 JA 的诱导,调控 LAP 基
因的表达。
2 展望
茉莉素对植物防御和生长发育起重要作用,茉
莉素调控相关基因的表达重点在于基因的启动子,
特别是诱导表达型和组织特异型的启动子,这是目
前国内外研究的热点之一。虽然,通过对启动子的
研究已经从多种植物中鉴定出了 JA 信号传导途径
中一些重要的组分和相关的转录因子,但具体的分
子机制还不清楚。采用基因芯片高通量的方法发现,
受 JA 诱导的基因启动子中目前尚未鉴定出的大量的
顺式作用元件,可极大促进 JA 信号通路的研究。从
上述中可以看到,虽然是同一类顺式作用元件,但
在不同基因的启动子中对不同种刺激的响应却不同,
即便是同一种刺激,响应程度也不相同,这是否与
顺式作用元件的具体结构有关,还有待深一步研究。
顺式作用元件作为响应环境胁迫的关键作用元件,
在基因工程育种方面有很大的利用价值,将顺式作
用元件与某些功能基因构建融合载体转至植株中,
获得的转基因植株可能表现出对环境胁迫的高抗性。
另外,相关研究表明,茉莉酸信号途径与其他信号
途径存在一定程度的交互作用,其中有很多转录因
子的参与,研究 JA 诱导基因启动子有利于开展对相
关转录因子的研究,进而明确相关转录因子连接不
同信号通路的具体机制,使整个信号网络系统更加
明朗,这对研究植物如何对生物和非生物胁迫作出
响应具有重要指导意义。
参 考 文 献
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(责任编辑 狄艳红)