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生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2015, 31(3):70-81
随着经济全球化和人口总量的急剧扩增,极大
增加了人们对工业生产和能源的需求。从 21 世纪
起,能源已是影响人类文明进步的重要因素。据报
道,2050 年全球能源需求将会翻一番,目前,全球
大约 80% 的能源来自化石燃料,包括石油、天然气
等。它们作为一种不可再生能源,全球储量越用越
少,已经成为影响地区稳定、经济发展的主要原因。
与此同时,化石燃料的大量使用还引起了气候变暖、
环境污染等一系列问题。当今社会进入新经济时代,
发展低碳经济,使用可再生、低污染的新型可替代
能源已经成为当务之急。现在,生物柴油已被各国
认为是理想的可再生能源,其主要成分脂肪酸甲酯
(fatty acid methyl ester,FAME)是以可再生资源为
原料通过酯交换制备而成,具备与石化柴油相近的
性能。其优势如下:是一种可持续供应的可再生资源;
具有高度生物降解性,毒性小 ;基本不会增加环境
收稿日期 :2014-08-03
基金项目 :国家自然科学基金项目(41176106,31000162 和 31070323),深圳市科技计划项目(CXB201104210005A,JCYJ201206131125-
12654,JSGG20130411160539208)
作者简介 :李逸,女,硕士研究生,研究方向 :藻分子生物学 ;E-mail :811054831@qq.com
通讯作者 :王潮岗,男,博士,研究方向 :藻类学 ;E-mail :charlesw@szu.edu.cn
利用基因工程技术提高微藻油脂含量的研究进展
李逸 王潮岗 胡章立
(深圳大学生命科学学院 深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室,深圳 518060)
摘 要 : 利用微藻油脂制备生物柴油因具有重要的战略意义而受到世界各国的重视,成为近年来的研究热点。利用微藻制
备生物柴油具有生长周期短、易于大规模培养、能大量吸收 CO2 及不占用耕地等优点。但是,由于对藻类油脂合成代谢中的调节
机制了解不多,导致微藻基因组研究相对滞后,极大地限制了微藻生物能源的大规模开发和利用。随着现代生物技术的发展,通
过基因工程、代谢工程等方法调控微藻脂类的合成代谢,提高藻类含油量和生物量已成为可能。概述了微藻中油脂的合成代谢,
归纳总结利用基因工程技术提高微藻油脂含量的研究进展,为获得含油量高的工程微藻及微藻制备生物柴油提供技术储备。
关键词 : 微藻 ;基因工程 ;生物柴油 ;油脂
DOI :10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.04.010
Research Advances of Genetic Engineering of Microalgae for
Improving Lipid Production
Li Yi Wang Chaogang Hu Zhangli
(Shenzhen Key Laboratory of Marine Bioresources and Ecology,College of Life Sciences,Shenzhen University,Shenzhen 518060)
Abstract: In recent years, microalgae oil biodiesel has become a hot spot because of its strategic importance. Microalgae are a promising
feedstock for biodiesel due to their short growth cycle, easy to mass culture, ability to absorb CO2 and no taking farmland, etc. However, large-
scale development and utilization of microalgae biomass energy is limited by less knowledge about metabolic mechanisms of lipid synthesis and
lagging research of genome in microalgae. With the development of modern biotechnology, improving lipid content and biomass of microalgae
may achieve through genetic engineering and metabolic engineering methods. This review describes recent efforts to metabolic mechanisms
on lipid biosynthesis and genetic engineering techniques on increasing lipid content, which provide technical reserves for attaining high lipid
transgenic microalgae and producing microalgae biodiesel.
Key words: microalgae ;genetic engineering ;biodiesel ;lipid
2015,31(3) 71李逸等:利用基因工程技术提高微藻油脂含量的研究进展
污染物的排放 ;有较高的氧含量,比从石油中提炼
出的柴油有更大的燃烧值 ;能逐步缓解对进口资源
的依赖性 ;生物柴油来源于植物的光合作用,可以
缓解生物柴油燃烧所生成的 CO2,所以无论是生产
还是使用生物柴油都可以有效的减少温室效应[1,2]。
生物柴油的发展历程主要分为 3 个阶段 :第一
代生物柴油的原料主要是油菜、大豆、棕榈油和向
日葵。第二代生物柴油的原料主要是麻风树、麻花、
烟草种子、三文鱼油、废烹调油、餐厅油脂和动物
脂肪等。第三代生物柴油的原料主要是微藻。第一
代和第二代原料因为存在与人争地、来源有限、原
料的效率低和可持续性差等问题,无法满足人们
的需求,逐渐被第三代原料的微藻所取代[3]。利
用微藻生产生物燃料的概念早在 50 多年前就已提
出,它具有其他绿色油脂植物所不具备的优点 :生
长周期短、繁殖速度快、易于大规模培养、能大量
吸收 CO2、不占用耕地、单位生物量微藻产油量高
于一般油料作物等[2,3]。据国内外报道,油脂含量
较高的微藻主要集中在绿藻、金藻和硅藻等真核微
藻中,常见的高产油微藻有绿藻中的葡萄藻、小球
藻和杜氏盐藻 ;硅藻中的三角褐指藻等[2]。这些微
藻可以储存大量的高能化合物,如三酰甘油和淀粉,
这些化合物可直接用于生产生物柴油和酒精等生物
燃料[1,3,4]。
利用微藻中的油脂生产生物柴油因为具有重要
的战略意义而受到世界各国的关注,成为近年来的
研究热点。然而,应用微藻制备生物柴油存在以下
两方面的问题 :获得油脂含量高的工程藻株以及降
低后续生产成本,这是微藻制备生物燃料能否工业
化生产的关键,特别是获得油脂含量高的基因工程
藻株,对微藻制备生物燃料的下游生产工艺具有巨
大的影响[5-7]。在本篇综述中,我们将重点阐述通
过基因工程构建高产油藻的途径,归纳总结近年来
微藻产油的研究进展,为获得含油量高的工程微藻
及微藻制备生物燃料提供技术储备[8]。
1 微藻油脂合成路径的探究
人们对于植物脂肪酸的代谢路径了解较多,如
拟南芥、油菜等,其产油路径已有报道。但是,对
于藻类的脂肪酸代谢路径了解还不够准确。图 1 是
根据植物脂肪酸合成路径及近年来的研究推导出的
藻类脂肪酸合成路径图。
微藻中油脂的合成路径主要分为两个部分,包
括自由脂肪酸的合成和三酰甘油的合成(即 Kennedy
路径),两个路径分别发生在质体和细胞质中,其
中的质体为叶绿体,在叶绿体中生成自由脂肪酸
Glu
CO2
3-PG
glycolysis
PEP Pyr
RuBisCo
plastid
Acetyl-CoA
Malonyl-CoA
Malonyl-ACP
Free-FA
TCAᗚ⧟oxaloacetatepepc PDHACCase
MAT
FAS
menberane
TAG
DAGAT
LPAT
Diacylglycerol
phosphatidic
acid
LPAAT
lysophosphatidic
acid
GPAT
G-3-P
Acyl-CoA
CoA
Cyt
oso1
Free-FA
图 1 微藻脂代谢路径图
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.372
后,被转运到质体外进行三酰甘油(triacylglycerol,
TAG)的组装合成。藻细胞中的糖酵解路径为脂
肪 酸 合 成 提 供 原 材 料 乙 酰 辅 酶 A(Acetyl-CoA),
乙 酰 辅 酶 A 在 乙 酰 辅 酶 A 羧 化 酶(Acetyl-CoA
carboxylase,ACCase)的催化下生成丙二酸单酰辅
酶 A(Malonyl-CoA),这步反应是不可逆的,是脂肪
酸合成的关键步骤。经脂肪酸合酶的催化生成自由
脂肪酸,并从质体中进入细胞质的内质网上开始三
酰甘油的组装。Kennedy 路径主要是由 3 种酰基转移
酶包括甘油 3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphate
acyltransferase,GPAT)、 溶 血 磷 脂 酸 酰 基 转 移 酶
(lysophosphatidic acid acyltransferase,LPAAT) 和 二
酰 甘 油 酰 基 转 移 酶(diacylglycerol acyltransferase,
DAGAT)起作用,最终合成 TAG。
2 三酰甘油合成路径的改造
对于微藻基因组的研究在近几十年已有很大进
步,建立了表达序列标签(EST)数据库,一些微藻
的核、线粒体和叶绿体基因组也已经测序完毕。目
前总基因组测序完毕的有莱茵衣藻(Chlamydomo-nas
reinhardtii)、 三 角 褐 指 藻(Phaeodactylum tricornu-
tum)、假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)、红
藻(Cyanidioschyzon merolae)及绿色鞭毛藻(Ostre-
ococcus lucimarinus)等[9,10]。
2.1 微藻中CO2的固定
在工业化培养的光生物反应器和农业化培养的
开放池中培养藻时,提高太阳能利用率很重要,不
仅在微藻中,在现代化农业生产中,如何提高农作
物光合效率也成为研究重点[11,12]。改造的关键在
于叶绿体,大多数叶绿体的基因组可以进行高效同
源重组,微藻叶绿体转化技术也相对成熟,如基因
枪的应用和筛选标记的开发。通过基因工程方法改
造微藻叶绿体基因,提高其光合效率,可以促进微
藻对环境中二氧化碳的利用。研究发现,利用基因
工程将莱茵衣藻中的叶绿体基因组导入酵母细胞中,
实现了二氧化碳固定效率和光合效率的提高[13]。
二磷酸核酮糖羧化酶(RuBisCO)是一种初级
二氧化碳固定酶,属于光合作用 C3 路径中的重要羧
化酶。微藻细胞在进行光合作用时,利用核酮糖 -1,
5-二磷酸羧化酶 / 加氧酶(Ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase,RuBisCO) 将 CO2 催 化 生 成
3-磷酸 - 甘油酸。尽管研究人员已经通过不同的试
验在植物和藻类中证明了 RuBisCO 的功能,且它
在所有的光合有机体中含量最多,但它的效率是最
低的[14]。对 RuBisCO 进行改造可以提高其固碳率,
增加光合效率,从而增加微藻的产量。近年来一些
文献报道,RuBisCO 在促进脂肪酸合成的同时也发
挥一定的作用。研究发现,在油菜种子中 RuBisCO
的活性与油脂的形成有关,同时可以促进种子中乙
酰辅酶 A 的含量提升。由此推测,RuBisCO 活性的
增加可以使更多的碳源流向后续反应,从而影响油
脂的代谢,微藻中 RuBisCO 的研究并没有太多报道,
还需要更多的研究去证实[1,9]。
与 固 碳 作 用 有 关 的 另 外 一 种 酶 是 碳 酸 酐 酶
(carbonic anhydrase,CA)。 在 微 藻 中, 碳 酸 酐
酶 可 以 催 化 CO2 和 HCO3
-之 间 的 转 换[15]。 碳 酸
酐 酶 分 为 α 型、β 型 和 γ 型 3 种, 已 经 在 蓝 细 菌
(Cyanobacteria)中发现了类似 CA 功能的蛋白,莱
茵衣藻(Chlamydomonas rerhardtii)中存在的是 α 型
和 β 型,涉及到的基因有 12 个。Sinetova 等[16]在
2012 年发现,莱茵衣藻的 CA 缺陷株与野生型相比,
在二氧化碳浓度增加的条件下,细胞膜上多不饱和
脂肪酸含量增加幅度较小,因此推测碳酸酐酶与微
藻的产油量存在一定关系。
2.2 自由脂肪酸合成路径的改造
最早关于微藻脂肪酸合成相关酶的研究是乙酰
辅酶 A 羧化酶(ACCase),它是脂肪酸合成过程中
的关键酶,负责催化脂肪酸合成的第一步反应,将
乙酰辅酶 A 催化成丙酮酸辅酶 A。ACCase 分为 2 类,
即异质型和同质型[17-19]。
在酵母和其他高等真核生物中 ACCase 的活性
和表达量与脂肪酸含量有密切关系,Shi 等[20]发现
在酿酒酵母(S. cerevisiae)中过量表达改造后酶活
性提高的 ACCase 时,酿酒酵母油脂含量最多增加
65%。大肠杆菌中(Escherichia coli)中 ACCase 的过
量表达使得总脂含量增加为原来的 6 倍[21]。但是,
通过增加 ACCase 的表达量促进脂肪酸合成在微藻中
并不成功。Dunahay 等[22]增加硅藻(C. cryptica 和
N. saprophila)中 ACCase 的表达量,尽管 ACCase 的
2015,31(3) 73李逸等:利用基因工程技术提高微藻油脂含量的研究进展
表达量增加 2-3 倍,但脂肪酸含量无明显增加。在
隐秘小环藻(Cyclotella cryptica)、舟形藻(Navicula
saprophila)中过量表达 ACCase 均未导致脂类含量
明显增加。存在的原因可能有两个,一是 ACCase
酶结构复杂,碱基数多,对其改造难度较大 ;二是
ACCase 虽然是限速酶,但与终产物三酰甘油的距离
较远,加上微藻中还存在反馈抑制的调控,这大大
减弱了 ACCase 的作用。
脂肪酸合酶(fatty acid synthase,FAS)是一个
多亚基多酶复合体,脂肪酸合酶以丙二酰辅酶 A 为
底物,每进行一个循环增加 2 个碳原子,最后形成
16 碳的软脂酰 -ACP 和 18 碳的硬脂酰 -ACP,再形
成二十二碳六烯酸(docosahexaenois,DHA)和花
生四烯酸(arachidonic acid,ARA)等长链多不饱和
脂肪酸[1,23],很多藻的 FAS 已经被发现。FAS 作
为一个多酶复合体,它的底物通常有多个酶结合位
点,产物的合成由多个酶调节。因此,单一的改变
其中一种酶活性,只能改变某一种油脂成分的含量,
对脂肪酸总量的影响不大。2001 年,Dehesh 等[23]
克隆了菠菜中 3-酮脂酰 - 酰基载体蛋白合成酶 III
(KASIII)的 cDNA 序列,分别在烟草细胞、橄榄型
油菜和拟南芥中进行过表达,结果增加了这 3 种植
物中饱和脂肪酸(16∶0)的含量,总脂的合成率没
有明显提高。以上研究说明,FAS 多亚基、多调控
机制的特性导致人们不能通过单一的酶基因改变来
提高总的脂肪酸含量(表 1)。
表 1 部分基因在提高脂肪酸含量中的应用
Gene 基因来源 基因表达品种 方法 脂肪酸的变化 参考文献
accase Escherichia coli Escherichia coli overproduction 6-fold increase in the rate of fatty acid
synthesis
[21]
Kas Ⅲ Spinacia oleracea Nicotiana tabacum Agrobacterium-mediated
transformation
18% to 24% increase of 160 in leaves [23]
g3pdh Saccharomyces cerevisiae Brassica napus L. electroporation 40% increase of lipid content in seeds [30]
gpat Gene spgpat of safflower Arabidopsis thaliana floral dip method 22% increase of lipid content in seeds [32]
lpaat California bay laurel and coconut Brassica napus electroporation above 50 mol% further increase [34]
dgat Arabidopsis yeast and tobacco Agrobacterium tumefaciens 9 fold incerase of TAG [41]
pepc miRNA Chlamydomonas reinhardtii glass beads 28% increase of TAG [43]
cis miRNA Chlamydomonas reinhardtii glass beads 169.5% increase of TAG [52]
2.3 TAG组装路径(Kennedy路径)的改造
TAG 路径是指三酰甘油的形成路径,脂肪酸在
质体中形成后,被运送到细胞质的内质网上,与甘
油进行组装,主要包括 :3-磷酸甘油脱氢酶(glyce-
rol-3-phosphate dehydrogenase,G3PDH)、 甘 油 -3-磷
酸 酰 基 转 移 酶(glycerol-3-phosphate acyltransferase,
GPAT)、溶血磷脂酸酰基转移酶和二酰甘油酰基转
移酶[24]。在胁迫条件下,TAG 合成量的显著增加
就是与 4 种酶有密切的关系,它们是合成 TAG 的关
键酶。目前,关于这些酶的研究主要集中在拟南芥、
油菜等高等植物,在大肠杆菌、酵母和微藻中也有
少量研究[25]。在不同的物种中酰基转移酶的存在形
式是不同的。如图 2,为三酰甘油主要合成过程。
2.3.1 甘油 -3-磷酸脱氢酶(G3PDH,EC1.1.1.8)
G3PDH 负责将磷酸二羟基丙酮(dihydroxyaceto-
neph-osphate,DHAP)催化形成甘油 -3-磷酸(glycerol-
3-phosphate,G-3-P),反应公式如图 2 所示,该反应
是甘油代谢途径中的限速步骤,在还原态烟酰胺腺
嘌呤二核苷酸 NADH 的参与下催化 DHAP 生成 3-磷
酸甘油,它决定了甘油合成量的多少[26]。这步反应
严格说虽不算 Kennedy 途径,但为 Kennedy 路径提
供前体物质,决定了目标产物的产量。
在哺乳动物中,G3PDH 与脂肪酸含量的关系
研究较多,早在 1979 年就已经确定,在小鼠的 3T3
细胞脂肪转换时,G3PDH 可以作为晚期分化的重要
标志[27]。2014 年,Kim 等[28]发现用药物处理小鼠
的前脂肪细胞时,前脂肪细胞的分化被抑制,同时
G3PDH 的酶活被抑制。与之相似,Yi 等[29]发现用
脂肪酸结合蛋白 3(H-FABP,FABP3)刺激小鼠脂
肪细胞,三酰甘油总量提高的同时,g3pdh 基因的
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.374
表达量明显升高,这说明哺乳动物中 G3PDH 的酶活
与脂肪细胞密切相关。
G3PDH 在 植 物 和 藻 类 中 的 研 究 报 道 较 少。
Vigeolas 等[30]将一种胞质酵母的甘油 -3-磷酸脱氢
酶基因 gpd1 转化到油菜种子中,结果发现油菜种子
中的含油量增加了 40%,因为微藻中与脂代谢相关
的大部分基因序列与陆生植物的同源性较高。由此
推测,G3PDH 的过表达或酶活性提高对微藻的油脂
量变化有影响,目前本实验室已根据莱茵衣藻密码
子偏好性合成该基因,并转入了莱茵衣藻中进行功
能分析,获得了一些有意义的结果。
2.3.2 甘油 -3-磷酸酰基转移酶(GPAT,EC 2.3.1.15)
GPAT 是 Kennedy 路径的第一个酰基转移酶,负
责催化脂肪酰基转移到 3-磷酸甘油的 sn-1 位上,生
成 1-酰基 -3-磷酸甘油。目前,多种高等植物和藻类
的 GPAT 基因序列已经分离出来。Jain 等[32]在研究
莱茵衣藻膜脂代谢时发现,在光刺激条件下,莱茵
衣藻膜脂代谢增加的同时,GPAT 的酶活性提高至
少 10 倍。由此推测微藻中脂产量与 GPAT 的活性有
密切关系。通过分子生物学手段将大肠杆菌和红花
(safflower)的 GPAT 基因转移到拟南芥中,可以增
加种子的含油量和重量,使得拟南芥油脂含量分别
提高了 15% 和 22%。Misra 等[31]对 7 种藻类和 3 种
高等植物质体中的 GPAT 进行了序列结构分析,研
究 GPAT 的进化过程发现,莱茵衣藻、拟南芥和大
豆的 GPAT 序列虽然不同,但都有保守的拓扑结构
14α 螺旋和 9β 折叠。这些研究为利用 gpat 构建基因
工程藻提供了重要依据。
2.3.3 溶血磷脂酸酰基转移酶(LPAAT,EC 2.3.1.51)
LPAAT 负责催化脂酰 -CoA 上的脂肪酸酰基转移
到溶血磷脂酸的 sn-2 位,生成磷脂酸(PA)。对高
等植物中的研究主要集中在花生、拟南芥和油菜中,
它提高产油量的效果显著。将一个酵母的 sn-2 酰基
转移酶(SLC1-1)转入到基因缺陷型的酵母中,证
明该基因编码的酶可以催化 sn-1 位溶血磷脂酸,转
入拟南芥后,它能使种子中的油脂含量提高 8%-
48% 不等,其中超长链脂肪酸所占比例明显增多[33]。
Knutzon 等[34]将来自椰子中的 lpaat 基因和福尼亚
月桂树中的硫酯酶基因共同转入油菜中,使得月桂
酸产量提高,除了出现在固定位置 sn-1 和 sn-3 积累
外,在 sn-2 位上也有积累,菜籽油中的月桂酸含量
增加了 50%。
研究发现,莱茵衣藻在胁迫条件下脂肪酸含量
增加时,lpaat 等基因的表达量也相应升高,利用
H2C
H2C OPO3
-2 OPO3
-2
OPO3
-2
H2O H3PO4
R2
R2
R1
R1
R1
R1
R1
R2
H2C
H2C
H2C
H2C
H2C
H2C
H2C
H2C
R1COH
CH
CH
OH
CHCHHO HOG-3-P
GPAT
LPAAT
DGAT
TAG
DAG
PtdOH
lyso-PtdOHPAP
CH
O
O
O
O
O
O
C
O
O
O
O
O
O
O
O
O
SCoA HSCoA
SCoA HSCoA
SCoA HSCoA
O
O
O
O
C
C
C
C
C
C
C
R1C
R1C
图 2 TAG 合成公式
2015,31(3) 75李逸等:利用基因工程技术提高微藻油脂含量的研究进展
基因敲除技术减少 lpaat 表达量后,中性脂含量降
低了 20%[35],由此推测,调节 lpaat 基因的表达量
或者增加 LPAAT 酶的活性可以增加藻类脂肪酸含
量。最近的研究表明,LPAAT 酶等作用下生成的磷
脂对人类疾病,如 Chanarin-Dorfman 综合征、癌症、
过渡肥胖和二十二碳六烯酸(docosahexaenoic acid,
DHA,22∶6)的产量等均有影响[36,37]。
2.3.4 甘油二酯酰基转移酶(DGAT,EC 2.3.1.20)
甘油二酯酰基基转移酶(diacylglycerol acyltransfer-
ase,DGAT)是三酰甘油合成的最后一个酶,催化
二酰甘油(DAG)生成三酰甘油,同时也可以催
化磷脂酸生成二酰甘油,使其进入油脂生物合成
路径,是 TAG 合成反应的重要限速酶。DGAT 主
要 分 为 4 种 类 型 :DGAT1、DGAT2、Cyto DGAT 和
WS/DGAT。DGAT1 和 DGAT2 蛋白主要结合在内质
网膜上,是微粒体酶 ;Cyto DGAT 和 WS/DGAT 是近
年发现的新类型。
DGAT 的过表达已经在酵母、哺乳动物、植物
和昆虫中实现[38-40],证实对于脂肪酸含量都有影
响。最早关于 DGAT 影响产油量的报道是在 2001 年,
Jako 等[41] 将 DGAT 的 cDNA 导 入 野 生 型 拟 南 芥
中进行过量表达,结果 DGAT 的活性增加了 10%-
70%,种子含油量也有所增加。将拟南芥的 dgat 基
因分别在酵母和烟草中进行过量表达,使得酵母中
DGAT 活性增加了 200-600 倍,TAG 含量提高为原
来的 3-9 倍,烟草中 TAG 含量提高 7 倍。Zhang 等[2]
用特异性 hpRNA 沉默烟草中的 DGAT1 基因,烟草
种子的含油量下降了 9%-49%。过量表达 DGAT 使
得脂肪酸含量显著提高,这可能是因为 DGAT 催化
两条相关代谢步骤,使得更多的二酰甘油生成 TAG。
莱茵衣藻因其培养简单、背景清晰、转化技
术成熟成为微藻研究领域的模式生物,也是研究
脂肪酸合成代谢最好的试验材料。Lv 等[35]在对莱
茵衣藻积累脂肪酸时的转录进行分析时发现,超
过 2 500 种基因的上调,lpaat 和 dgat 被抑制后,脂
肪酸产量下降。本实验室目前将经过密码子优化
的 lpaat 和 gpd1 基因转入莱茵衣藻中,研究其基因
表达量和脂肪酸含量提高程度,取得了较好的研究
结果,为获得油脂含量高的基因工程藻提供了新
思路。
3 旁路代谢路径的调控
旁路代谢路径是指除脂肪酸代谢路径之外的其
他代谢路径,如三羧酸循环等。这些路径分担了部
分碳流,使得流向脂肪酸合成的碳源变少,所以对
于这些代谢路径中关键酶的调节通常会影响到脂肪
酸的含量。
3.1 磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(PEPC,EC4.1.1.31)
磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate
carboxylase,PEPC)是一种在有机体中广泛存在的
细胞质酶,主要存在于古细菌、细菌、单细胞绿藻
和维管束植物等有机体中[42]。在 C4 植物和景天酸
代谢(crassulacean acid metabolism,CAM)植物中,
PEPC 在 CO2 固定过程中起到重要作用 ;在 C3 植物
和非光合组织中,PEPC 在柠檬酸反应中催化不可逆
反应,使得磷酸烯醇式丙酮酸盐(PEP)生成草酰
乙酸盐(OAA)。所以,PEPC 是碳源是否流向脂肪
酸合成链的关键酶。
在对磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的研究中,可以
利用 RNA 沉默技术抑制 pepc 的表达。1999 年 Chen
等[3]发现,油菜籽中的 pepc 沉默后,其产油量提
高了 6.4%-18%,表明脂肪酸含量与 PEPC 酶活性
为负相关,同样的研究结果也出现在微藻中。在莱
茵衣藻和三角褐指藻中,利用 RNAi 技术使 pepc1 和
pepc2 基因沉默后,莱茵衣藻(C. reinhardtii)的油
脂含量分别提高了 14%-28% 和 20%[43]。另外,通
过抑制 PEPC 酶活性,同样可以显著提高微藻(如
绿藻,硅藻等)的脂含量[44,45]。
3.2 柠檬酸合成酶(CIS,E.C. 2.3.3.1)
柠檬酸合成酶是三羧酸反应循环的第一步,有
多种同工酶,存在各种亚细胞结构中,在多种生理
代谢路径中起作用,位于线粒体中的柠檬酸合成酶
在三羧酸循环中起到限制性酶的作用,负责将乙酰
辅酶 A 催化成柠檬酸。
在对植物和动物的研究中发现,柠檬酸合成酶
的作用主要集中在如下 3 方面 :(1)该基因的过表
达可以促进农作物分泌柠檬酸,促进磷在土壤中的
溶解,增加土壤中磷的利用率[46,47];(2)增加细胞
对铝毒素的抵抗作用[48];(3)CIS 基因的表达与水
果成熟过程中有机酸的积累有关。Zhang 等[49,50]发
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.376
现,在松子果成熟期间,柠檬酸含量与 CIS 的活性
有关。
早在 1973 年,Taylor 等[51]研究了 4 种蓝藻的
CIS 活性发现,在胁迫条件下更多的碳原子进行脂
肪酸合成时,CIS 活性下降。Deng 等[52]最近研究
了莱茵衣藻中的 CrCIS 与脂肪酸含量的关系,利用
RNAi 抑制 CrCIS 的活性,使得莱茵衣藻中的 TAG
含量增加了 169.5%,结果表明莱茵衣藻中柠檬酸合
成酶的活性可以影响脂肪酸的积累代谢。
近年来,RNA 干扰技术逐渐被 microRNA 技术
所代替,microRNA 是一类长度很短的非编码调控单
链小分子 RNA,由一段具有茎环结构的长度为 70-
80 nt 的单链 RNA 前体经过 Dicer 加工之后的一类非
编码的小 RNA 分子(约 21-23 个核苷酸),在动物
和植物中广泛表达,是一类新型的调控基因表达的
小分子 RNA,它作为基因表达的负调控因子,在转
录后水平调节靶基因的表达。因此,利用 microRNA
技术调控的专一性更强,表达也更稳定,可控性
更好[45,53]。
4 脂肪酸分解代谢路径
脂肪酸和 TAG 合成相关基因的激活或者脂肪酸
β-氧化酶对应基因的失活,都可以增加脂肪酸产量。
在提高微藻脂肪酸产量的策略中,减少脂肪酸的分
解代谢也是重要的方法之一。脂肪酸的分解代谢路
径主要是 β-氧化,具体的脂肪酸分解路径,如图 3,
它存在于真核生物的线粒体基质和原核生物的细胞
溶胶中,现阶段该方法多在高等植物和酵母中实验
成功。
在一些情况下,细胞依靠脂肪酸 β 氧化提供能
量,敲除脂肪酸分解代谢对应基因后,在增加脂肪
酸储存量的同时也会影响细胞的生长和增值。例如,
在拟南芥中,将过氧化物酶长链乙酰辅酶 A 合成酶
抑制后,同工酶 LACS6 和 LACS7 失活,虽然种子的
油脂含量增加了,但是种子由于碳源的缺失使得生
长速度受到抑制[17]。Germain 等[18]还将 3-酮脂酰
-CoA 硫解酶(KAT2)失活,结果也是相同的。
脂肪酸氧化有多个酶共同参与,完全抑制这个
过程的难度较大。拟南芥中含有短链乙酰辅酶 A 氧
化酶,包括 ACX3 和 ACX4,如果只是突变其中一个
基因,拟南芥种子的生长和脂肪酸的代谢并未受到
影响,如果两个基因同时突变会导致拟南芥死亡[19]。
通过基因工程技术敲除酿酒酵母(S. cerevisiae)中
的 β 氧化酶基因,不仅使得内源性脂肪酸含量增加,
还可以促进脂肪酸的胞外分泌[14,54,55]。
Acetyl-CoA
Thiolase
CoASH Cleavage
shortened by two carbons
Fatty acy1-CoA
Fatty acy1-CoA
FAD
Acyl-CoA dehydrogenase
FADH2
Oxidation
Successive cycles
Hydration
Enoy1-CoA hydratase
L-β-Hydroxyacyl-CoA
β-Ketoacyl-CoA
Oxidation
NAD+
NADH + H+
L-Hydroxyacyl-CoA
dehydrogenase
H2O
trans-Δ2-Enoyl-CoA
图 3 脂肪酸分解代谢路径图
2015,31(3) 77李逸等:利用基因工程技术提高微藻油脂含量的研究进展
5 诱发突变
突变在自然界中广泛存在,实验中用到的多为
诱发突变,即人为条件下诱发产生的基因突变。通
过基因突变改造微藻,使其产油量提高,也是一种
可行性较高的方法。诱发突变的方法常用的有紫外
诱变、抗性基因插入等,这些方法适用范围广,且
便于操作。还可以通过抑制其他化合物代谢路径(如
淀粉合成路径)来增加脂肪酸合成。研究显示,利
用插入突变得到莱茵衣藻的两个淀粉合成缺陷株
sta6 和 sta7,发现其 ADP-葡糖焦磷酸化酶基因异淀
粉 酶 基 因 功 能 受 损[1]。2006 年,Ramazanov 等[56]
通 过 紫 外 诱 变 获 得 小 球 藻(Chlorella pyrenoidosa)
的淀粉突变株,它的不饱和脂肪酸含量有所提高。
2013 年,刘飞飞等[57]将博来霉素抗性基因 ble 随机
插入三角褐指藻基因组中,构建突变体文库,筛选
得到含油量显著变化的突变株。但是,利用诱发突
变筛选突变株的不确定性高,目的性不强,筛选工
作量大。
6 分泌型藻株
利用微藻制备生物柴油需要通过大规模的培养
获得足够多的微藻来提取油脂,微藻由于体积微小
导致后续收集成本较高,除了步骤繁琐,花费也比
较大。例如,利用静置沉淀或者絮凝沉淀等收集藻
细胞可以节约成本,但存在耗时长、需要进一步脱
水处理等问题。目前可替代的方法是离心法和过滤
法,其优点是耗时短,但成本较高。大多数产油微
藻有坚硬的细胞壁,这使得提取油脂难度加大。有
一种解决方法是改造微藻细胞,使其将油脂自动分
泌到培养液中,通过油水分离可以获得藻细胞中合
成的油脂。
6.1 酵母中自由脂肪酸的分泌
如上所述,在脂代谢中,β-氧化酶基因的失活
在某些情况下会导致脂肪酸分泌,通过对缺陷型酵
母的研究,确定了这些基因在脂肪酸分泌中有重要
作 用[14,54]。 酿 酒 酵 母(S. cerevisiae) 中 有 5 种 基
因与脂肪酸乙酰辅酶 A 合成酶活性有关,包括编码
FAA1 和 FAA4 的基因。FAA1 和 FAA4 同时失活或
者 FAA1 和乙酰辅酶 A 氧化酶同时失活都会导致细
胞内自由脂肪酸的累积和分泌,但脂肪酸的分泌往
往会减少细胞数目[14],原因是脂肪酸的分泌主要发
生在酵母的对数生长期,而脂肪酸的积累则发生在
细胞的平台期[55]。酵母中 TAG 或者自由脂肪酸分
泌的机制尚不清晰。根据研究可知,任何使得酵母
细胞积累高水平自由脂肪酸的机制都可以使自由脂
肪酸从细胞中分泌出来。Roessler 等[58]通过合成基
因组学研究发现了蓝细菌也存在类似的脂肪酸分泌
机制。
6.2 脂肪酸和相关化合物的分泌机制
目前,一些亲脂性化合物的分泌路径已明确,
包括从肝细胞分泌的含有 TAG 的极低密度脂(VL-
DL)小泡、从乳腺分泌的含 TAG 小泡和由多种碳氢
化合物组成的植物蜡的 ABC 转运机制[59,60]。除了
细胞输出路径,还有许多细胞内不同细胞器之间的
脂肪酸运输也已经了解清楚,如脂肪酸进入线粒体
和过氧物酶体进行 β 氧化,或许可以利用这些机制
将脂肪酸运输到细胞外。这些路径中一些主要的基
因已经明确,ABC 转运体(transporters)的转基因
表达已经应用于药物运输。然而,这些成功的转基
因表达和脂肪酸分泌路径的改造是否适合生物燃料
的生产,有待进一步证实[61,62],明确的分泌机制也
有待进一步探索。
目前,促进微藻分泌脂肪酸最直接的方法就是
利用 ABC 转运体。ABC 转运体可以介导植物细胞
中蜡质的分泌,也可以将长链脂肪酸运输到过氧化
物酶体中进行 β-氧化。拟南芥(A. thaliana)中已经
发现超过 120 种不同的 ABC 转运体,它们除了转运
超长链脂肪酸外,还可以转运其他次级代谢产物,
如萜类化合物。研究发现,拟南芥中的 Desperado/
AtWBC11 转运体和 Cer5/AtWBC12 转运体能够促进
蜡分泌到植物表层[63,64]。另外,ABC 转运系统相
关酶基因的转基因表达可以增加卡那霉素、胆固醇
和固醇等化合物的输出[65-67]。
总之,利用微藻制备生物柴油尚处于试验阶段,
通过基因工程技术促进脂肪酸分泌到培养系统,并
利用油水分离收集脂肪酸,其成本较传统的生产工
艺低很多,但是脂肪酸的分泌量还很难达到工业化
生产的需要,需要人们对脂肪酸分泌机制了解更多,
最终实现可应用的脂肪酸分泌系统和技术[68,69]。
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.378
7 展望
随着陆地资源的减少,海洋资源的开发逐渐被
人们关注,其中,微藻能源的开发就是研究的重点。
微藻是多样化的有机体,具有许多独特的代谢特性:
高光合传递速率、快速的生物量生产速率、适应多
种环境和可以生产多种类的生物柴油等特点。基于
微藻制备生物燃料的战略意义,多国包括中国投入
了大量的人力、物力,已经取得了阶段性的成果。
许多藻类的基因组序列已经测序完毕,如莱茵衣藻、
三角褐指藻和小球藻等。微藻的遗传转化体系也日
渐完善,莱茵衣藻、小球藻、盐藻和硅藻等已建立
了高效的表达体系。另外,微藻积累脂肪酸的机制、
脂肪酸合成相关基因的克隆及功能研究也已经完
成,对其合成调控机制有了初步认识。同时,利用
基因工程手段提高脂肪酸合成相关酶基因的转录及
表达水平的研究也表现出不同的效果,某些 FAS 酶
和 TAG 组装酶对油脂合成的影响较明显,Kennedy
路径中任何一种酰基转移酶的表达量增加都会导致
TAG 含量增加[1]。生物体内的代谢路径相互联系、
相互影响,对于其他代谢路径,如三羧酸循环和磷
脂酸合成路径的调节均会影响到脂肪酸含量的变化。
如用反义 RNA 技术对 pepc 基因进行调控,使得微
藻莱茵衣藻的脂肪酸含量提高了 20%[44]。以上研究
也说明微藻中脂肪酸代谢体系比较复杂,是一个多
酶参加的生物合成过程,受到多种因素的影响,还
有未知的调控机制在起作用。因此,也有人试图通
过转录因子来调控脂肪酸的合成代谢,它不只是调
控一种酶而是对应着多个基因,效果会更明显,这
也是未来微藻油脂合成调控研究的重要方向。
尽管微藻产油存在多种优势,但相比陆地植物
来说,其大规模培养仍然受限,尚有许多问题需要
解决,如脂肪酸代谢路径、密码子偏好性、高表达
载体等方面。微藻大规模培养技术及获得油脂含量
达到商业开发水平的工程藻仍是整个生产环节的关
键。微藻的培养和收集模式以及后期脂肪酸提取方
法的革新都可能会降低生产成本。未来关于基因工
程藻的研究可能集中在如下几个方向 :(1)Kennedy
路径中各个酰基转移酶的改造 ;(2)利用转录因子
综合调控脂类代谢过程 ;(3)研究脂肪酸自动分泌
的相关基因,以减少脂肪酸的提取成本。
参 考 文 献
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(责任编辑 狄艳红)