免费文献传递   相关文献

人类3-磷酸甘油醛脱氢酶的原核表达、纯化和鉴定



全 文 :生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2009年第 3期·研究报告·
收稿日期:2008-09-23
基金项目:国家自然科学基金(30771924)
作者简介:李毅(1983-),硕士在读,研究方向:乙肝的临床病毒学
通讯作者:汤华,研究员,Tel:023-68486820,E-mail:tanghua86162003@yahoo.com.cn
GAPDH 单体蛋白具有 330 个氨基酸, 其相对
分子质量约 37 kD, 广泛存在于众多生物体中,并
且具有高度保守序列 [1]。 由于自身的功能多样性,
有报道提出已形成了两种研究机制的重要模型:一
种是研究酶作用机制以及氨基酸序列与蛋白质结
构的相互关系的模型。 在各组织细胞浆的 GAPDH
以四聚体的形式催化 3-磷酸甘油醛成为 1,3-二磷
酸甘油, 是糖酵解反应的关键酶 ; 并且研究表明
GAPDH 有膜融合与膜转运活性 [2],微管蛋白成束活
性 [3],以及磷酸化活性 [4];另一种是研究细胞组成和
人类 3-磷酸甘油醛脱氢酶的原核表达、纯化和鉴定
李毅 万涛 杨琴 蔡雪飞 张文露 汤华
(重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室,重庆 400016)
摘 要: 为了研究 3-磷酸甘油醛脱氧酶(GAPDH)化生物学功能,以 pcDNA3.1-GAPDH 质粒为模板,PCR 方法扩
增 GAPDH 基因,经 BamHI 和 SalI 双酶切后插入相同酶切的 pET32a(+)载体,构建 His-GAPDH 融合蛋白表达质粒
pET32a(+)-GAPDH;转化 JM109感受态细胞,并进行阳性克隆筛选,扩增目的质粒;转化大肠杆菌 BL21菌株,经 IPTG
诱导产生融合蛋白,亲和层析柱纯化后,用 SDS-PAGE和Western blotting检测 GAPDH 蛋白表达情况。结果表明,构建的
人 GAPDH基因表达载体经序列测定证实,与 GenBank数据完全一致;双酶切鉴定证实,克隆基因正确插入 pET32a(+)载
体;表达质粒 pET32a(+)-GAPDH 在大肠杆菌 BL21中成功地诱导表达了可溶性 His-GAPDH 融合蛋白,纯化后 SDS-
PAGE和Western blotting检测证实融合蛋白表达成功。人 GAPDH 原核表达载体的成功构建,及 6His-GAPDH 融合蛋白
的正确表达,为进一步深入研究 GAPDH 的生物学功能奠定了基础。
关键词: 三磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH) 原核表达 SDS-PAGE 免疫印迹
Prokaryotic Expression,Purification and Identification of Human
Glyceraldehyde 3-phosphate Dehydrogenase
Li Yi Wan Tao Yang Qin Cai Xuefei Zhang Wenlu Tang Hua
(Key Laboratory of Molecular Infectious Diseases,Ministry of Education,Chongqing Medical University,Chongqing 400016)
Abstract: The prokaryotic expression vector pET32a(+)-GAPDH and the expression of human glyceraldehyde 3-
phosphate dehydrogenase(GAPDH)in E.coli were investigated. GAPDH gene was amplified by PCR from pcDNA3.1-
GAPDH plasmid and inserted into the plasmid pET32a(+)followed by digestion with BamHI and SalI. The recombinant
plasmid pET32a(+)-GAPDH was transformed into E.coli JM109 and selected with ampicillin. The positive clones
containing the recombinant plasmid pET32a(+)-GAPDH were verified. His-GAPDH fusion protein was expressed in E.
coli BL2l (ED3) by IPTG induction,and was identified by SDS-PAGE and Western bloting. Results showed that the
PCR product of human glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(GAPDH) was identical to the sequence in GenBank
and was accurately inserted into the pET32a(+). SDS-PAGE and Western blotting indicated that the dissoluble fusion
protein successfully expressed in E.coli BL2l(ED3). Therefore,a prokaryotic vector for human GAPDH gene has been
successfully constructed and 6His-GAPDH has been correctly expressed,the stucly of which may facilitate subsequent
research of its biological functions.
Key words: Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(GAPDH) Prokaryotic expression SDS-PAGE Immunoblot
2009年第 3期
遗传信息表达的基因分析模型。存在于细胞膜和细
胞核的 GAPDH 具有参与调节 mRNA 形成 ,tRNA
输出 [5],DNA 复制,DAN 修复 [6]以及参与细胞凋亡 [7],
维持端粒结构 [8]等多种功能。 为辅助 GAPDH 的生
物学活性以及作用机制的进一步研究 , 本试验用
PCR 法扩增 GAPDH 基因,构建了 His-GAPDH 的原
核重组质粒 ,在 BL21(DE3)菌中进行蛋白诱导表
达,并对表达产物进行了亲和层析纯化和鉴定。
1 材料和方法
1.1 材料
原核表达载体 pET32a(+)购自 Novagen 公司 ;
HepG2 细胞、 宿主菌 E. coli JM109 和 BL21(DE3)、
PCR 模 板 质 粒 pcDNA3.1-GAPDH 为 本 室 保 存 ;
SalI、BamHI 限制性内切酶购自 NEB 公司 ;T4 DNA
连接酶购自 Promega 公司 ; 高保真 Taq 酶购自
Takara 公司 ; 质粒提取试剂盒购自 Omega 公司 ;
PCR 产物纯化试剂盒购自 Biofux 公司;所用引物由
上海生工生物工程公司合成;固化 Ni2+层析树脂购
自 Qiagen 公司;抗 His 蛋白抗体购自 Qiagen 公司;
GAPDH-HRP 单克隆抗体购自康成生物公司; 硝酸
纤维膜购自 Millpore 公司; 化学发光试剂购 Pierce
公司 ;蛋白预染 Marker 购自 Fermentas 公司 ;其余
试剂均为国产分析纯。
1.2 方法
1.2.1 His-GAPDH 融合蛋白表达载体 pET32a(+)-
GAPDH 的构建 根据 GenBank 中 GAPDH 基因
ORF 区碱基序列设计引物 (下划线部分为 BamHI,
SalI 的酶切位点),正义:5′-TCTGGATCCTGGGGAA
GGTGAAGGTC-3′,反义:5′- ATATGTCGACGAGGCC
ATGTGGGCCAT-3′。以 pcDNA3.1-GAPDH 为模板用
高保真 Taq 酶 PCR 扩增 GAPDH 基因, 反应条件:
94℃预变性 5 min,94℃ 1 min,58℃ 1 min,72℃ 2 min,
共 35 个循环。 PCR 产物进行琼脂糖凝胶电泳鉴定。
PCR 产物纯化后同表达载体 pET32a(+)用 BamHI,
SalI 酶切。 酶切产物纯化后于 16℃过夜链接,转化
入 E. coli JM109 菌、挑克隆、提取质粒。酶切鉴定大
小正确后测序(ABI 公司 3100 型)。
1.2.2 His-GAPDH 融合蛋白以及 pET32a(+)空质
粒对照蛋白的表达纯化 分别将工程菌菌种以及
BL21-pET32a(+)菌种接种于 2 ml 含 20 μl 100 mg/
ml 氨苄青霉素的 LB 液体培养基(LBA 培养基)中,
37 ℃培养 4~6 h;按 1∶20 比例接种于 10 ml LBA 培
养基中,37 ℃培养 2~3 h;将 10 ml 菌液接种于 250
ml LBA 培养基中 ,37℃培养 2~3 h (此时菌液的
OD600nm 在 0.4~0.6 之间); 加入异丙基-β-D-硫代半
乳糖苷 (IPTG) 至终浓度 0.5 mmol/ L,30℃诱导过
夜。离心收集菌体,PBS 洗涤 1 次,菌体重新悬浮于
20 ml Bingding Buffer(10 mM 咪唑,0.05% Tween20,
pH8.0)中,加入 1 mol/ml 的蛋白酶抑制剂 PSMF 20
μl,冰浴超声波破菌,4℃离心收集上清。 上清装入
已填装好的 Ni2+亲和树脂柱中,流速调整为 10 BV/
h, 然后用 100 倍于填柱树脂体积的 Washing buffer
(20 mM 咪唑,0.05% Tween20,pH8.0)洗涤柱子,再
用 10 ml Elution buffer (250 mM 咪唑,0.05% Tween
20,pH8.0)洗脱结合的蛋白 ,每份 1 ml 分步收集 。
通过 15%SDS-PAGE 电泳,考马斯亮蓝染色来分析
聚组氨酸标签蛋白的分布。
1.2.3 His-GAPDH 融合蛋白的鉴定 按照 Wester-
n blot 方法以及 His-Western blot kit 和抗 GAPDH 蛋
白抗体试剂说明书进行。 蛋白经 12%SDS-PAGE 分
离后电转到硝酸纤维膜上, 室温下用含 5%脱脂奶
粉的 PBS(pH7.4)中封闭 1 h 后于摇床上用 PBS 漂
洗 3 次,10 min/次。 然后用抗 His 蛋白抗体孵育结
合, 再根据抗体试剂说明书配置相应的显色液,于
硝酸纤维膜上显示结果; 或者用抗 GAPDH 蛋白抗
体孵育结合后用化学发光法于 X 光片上显示结果。
2 结果
2.1 pET32a(+)-GAPDH 的构建及鉴定
以 pcDNA3.1-GAPDH 为模板 , 经 PCR 扩增出
全长 GAPDH,长约 1 kb,与预期值相符。 经 BamHI,
SalI 双酶切 pET32a(+)和 PCR 产物(图 1A )。 定向
链接后转化 BL21 菌,经酶切鉴定,筛选出含目的基
因片段的阳性克隆(图 1B)。 序列分析表明插入片
段方向和序列结果与 GenBank 数据完全一致(结果
未显示)。
2.2 His-GAPDH 融合蛋白高表达菌株以及 pET-
32a(+)质粒对照菌株的筛选
随机选取 4 种菌的阳性克隆, 经 IPTG 诱导后
均有不同程度的诱导蛋白表达。诱导空质粒对照蛋
白分子质量大小基本在 21 kD 左右 (图 2B),诱导
李毅等:人类 3-磷酸甘油醛脱氢酶的原核表达、纯化和鉴定 103
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2009年第 3期
的融合蛋白分子质量大小在 58 kD 左右 (GAPDH
单体分子质量约 37 kD,加上标签蛋白共约 58 kD)
(图 2A),与预期一致。图示可见各株克隆菌表达量
均较高,任挑一株菌来大量表达目的蛋白。
2.3 原核表达重组质粒蛋白和空载体蛋白的纯化
按照材料与方法中介绍蛋白的表达纯化方法,
根据初筛结果,选择相应的 BL21(DE3)细菌株进行
大量培养来表达目的及对照蛋白 。 分管收集得到
Ni2+亲和树脂柱纯化后的重组质粒蛋白 (图 3A)和
对照蛋白(图 3B)。
2.4 His-GAPDH 融合蛋白 Western blotting 鉴定
由于 pET32a(+)在多克隆位点上下游均带有
his-tag 标签蛋白编码序列 , 目的蛋白可与对应的
his-tag 抗体结合,因此采用抗 his-tag 单克隆抗体进
行检测,显色后在大约 58 kD 位置有清晰的目的条
带(图 4A-2)。而空载体表达的 TRX 蛋白也带有 his
标签,因此在其对应的大约 21 kD 处也出现了清晰
条带(图 4A-1)。 再用抗 GAPDH 的单克隆抗体进行
检测, 运用化学发光试剂在 X 光片上曝光后同样
大约在 58 kD 位置可见目的蛋白(图 4B-1,2),但空
载体表达的蛋白则无显示(图 4B-3,4)。
3 讨论
GAPDH 作为一个多功能蛋白, 在机体的生理
和病理状态下的作用越来越引起有关学者的关注。
并且核酸与蛋白质之间的特异性结合是很多生物
学过程的基础 [9,10],为进一步研究 GAPDH 与 DNA
修复、RNA 输出等作用机制,本实验进行了 GAPDH
的体外表达 , 且选用含有 His-6 的蛋白标签的
A M.λ-EcoT14 I digest DNA Marker;1.原核表达载体 PET32a
(+ ) 用 BamHI,SalI 限制性内切酶双酶切结果 ;2.PCR 扩增
GAPDH 产物
B 1.PET32a (+)-GAPDH 重组质粒用 BamHI, SalI 限制性内切
酶双酶切结果
图 1 PET32a(+)-GAPDH 重组质粒的构建结果
A His-GAPDH 融合蛋白在 BL21 表达菌中的诱导与表达结果
(1~4.体外诱导 1~4 号克隆菌总蛋白 ;5.未诱导 1 号克隆菌总蛋
白;M.蛋白 Marker)
B 载体质粒在 BL21 表达菌中的诱导与表达 (M.蛋白 Marker;1~
5.体外诱导 1~5 号克隆菌总蛋白;6.未诱导 1 号克隆菌总蛋白 )
图 2 His-GAPDH 融合蛋白在 BL21 表达菌中的
诱导与表达结果
A 诱导克隆 pET32a (+)-GAPDH 菌可溶性总蛋白用 Ni+亲和
层析柱纯化后结果 (M.蛋白 Marker;1.总蛋白与 Ni+亲和树脂
结合后剩余的蛋白 ;2~9:洗脱结合于 Ni+亲和层析柱并分管
收集的蛋白)
B 诱导 pET32a(+)克隆菌可溶性总蛋白用 Ni+亲和层析柱纯
化后结果 (1~5:洗脱结合于 Ni+亲和层析柱并分管收集的蛋
白;M.蛋白 Marker)
图 3 Ni2+亲和树脂柱纯化后结果
A 用抗 his-tag 单克隆抗体进行 Western blotting 鉴定结果
(1. 用 Ni+亲和层析柱纯化的空载体蛋白 ;2.Ni+亲和层析柱
纯化获得的 His-GAPDH 融合蛋白;M.蛋白 Marker)
B 用抗 GAPDH 单克隆抗体进行 Western blotting 鉴定结果
(M. 蛋白 Marker;1,2.Ni +亲和层析柱纯化获得 His-GAPDH
融合蛋白;3,4.用 Ni+亲和层析柱纯化的空载体蛋白 )
图 4 Western blotting 结果
104
2009年第 3期
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
(上接第 101页)
7 魏丽丽,李成华,袁成福,等 .西安交通大学学报(医学版),
2007,28(2):130~133.
8 潘巍巍,赖国旗,等.中国现代医学杂志,2006,16(21):105~108.
pET32a(+)为载体质粒。 重组蛋白可以通过暴露的
标签结合固化的 Ni+树脂, 用适当缓冲液洗除去未
结合蛋白包括大肠杆菌的 GAPDH, 再用可溶的竞
争性螯合剂洗脱回收 His-GAPDH,从而得到较纯的
人源性的 GAPDH。SDS-PAGE 电泳后考马斯亮蓝染
色结果显示存在少量杂蛋白,主要由于大肠杆菌中
存在相似 His-6 的蛋白,也能够部分结合 Ni+树脂。
但经冻融后的蛋白用抗 His 标签的抗体进行 Western
blotting 检测却没有杂带的出现, 说明本试验表达
的目的蛋白具有较好的稳定性。 而且 His-6 的蛋白
标签总分子质量仅约 1 kD,对表达的 GAPDH 蛋白
空间构象结构影响较小,从而确保了表达目的蛋白
的可靠性 。 用抗 GAPDH 的抗体进行 Western blot-
ting 显示 ,提取的目的蛋白不仅表达量高 ,而且具
有很好的抗原性, 可用于 GAPDH 作用机制的进一
步研究。
试验成功地构建了 pET32a(+)-GAPDH 原核表
达重组质粒,在体外得以表达和纯化,并且 Western
blotting 方法验证了靶蛋白 GAPDH 有较高的表达
量以及较好的抗原性, 为今后 GAPDH 的功能研究
提供了原料。
参考文献
1 Steinke D,Hoegg S,Brinkmann H,et al. BMC Biol,2006,4:16.
2 Robbins AR,Ward RD,Oliver C. J Cell Biol,1995,130(5):
1093~1104.
3 Kumagai H,Sakai H. J Biochem,1983,93(5):1259~1269.
4 Duclos-Vallee JC,Capel F,Mabit H,et al. J Gen Virol,1998,79
(7):1665~1670.
5 Singh R,Green MR. Science,1993,259(5093):365~368.
6 Krynetski EY,Krynetskaia NF,Bianchi ME,et al. Cancer Res,
2003,63(1):100~106.
7 Hara MR,Agrawal N,Kim SF,et al. Nat Cell Biol,2005,7(7):
665~674.
8 Sirover MA. J Cell Biochem,2005,95(1):45~52.
9 Draper DE. Annu Rev Biochem,1995,64(7):593~620.
10 Cusack S. Curr Opin Struct Biol,1999,9(1):66~73.
李毅等:人类 3-磷酸甘油醛脱氢酶的原核表达、纯化和鉴定 105