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Expression of Vitreoscilla hemoglobin gene to enhance poly-γ-glutamic acid biosynthesis in Bacillus subtilis NX-2

通过透明颤菌血红蛋白基因表达提高γ-聚谷氨酸的生物合成



全 文 :第 14卷第 2期
2016年 3月
生  物  加  工  过  程
Chinese Journal of Bioprocess Engineering
Vol􀆰 14 No􀆰 2
Mar􀆰 2016
doi:10􀆰 3969 / j􀆰 issn􀆰 1672-3678􀆰 2016􀆰 02􀆰 001
收稿日期:2015-03-10
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)重大项目(2013AA020301);普通高校研究生科研创新计划项目(KYLX15_0811)
作者简介:汤  宝(1987—),男,安徽桐城人,博士研究生,研究方向:发酵工程;徐  虹(联系人),教授, E⁃mail:xuh@ njtech.edu.cn
通过透明颤菌血红蛋白基因表达提高
γ 聚谷氨酸的生物合成
汤  宝,冯小海,张  丹,许宗奇,姜永翔,李  莎,徐  虹
(南京工业大学 食品与轻工学院,江苏 南京 211800)
摘  要:γ 聚谷氨酸(γ PGA)的微生物合成是高消耗氧的生物过程,采取基因工程手段改造 γ PGA 生产菌株
Bacillus subtilis NX 2,以提高细胞利用氧的能力。 利用重叠 PCR 方法将 P43 强启动子与透明颤菌血红蛋白
(VHb)基因 vgb拼接,插入大肠杆菌 枯草芽胞杆菌穿梭质粒 pMA5上,得到重组质粒 pMA5 P43 vgb,并将其转
化至 B. subtilis NX 2中,从而获得重组菌 B.subtilis NX 2(vgb+)。 经 SDS PAGE分析和 CO差光谱法证明 VHb
能在 γ PGA生产菌株中成功表达,且具有生理活性,大小约为 1􀆰 6×104。 在 7􀆰 5 L 发酵罐上对重组菌 B. subtilis
NX 2(vgb+)进行发酵性能考察,结果显示:重组菌比出发菌的生物量提高了 41􀆰 2%,γ PGA 的产量提高了
7􀆰 5%,传代多次表明重组菌具有良好的发酵稳定性。 该研究为 γ PGA的进一步工业化生产奠定了基础。
关键词:Bacillus subtilis;透明颤菌血红蛋白;γ 聚谷氨酸
中图分类号:TB324        文献标志码:A        文章编号:1672-3678(2016)02-0001-06
Expression of Vitreoscilla hemoglobin gene to enhance poly⁃γ⁃glutamic
acid biosynthesis in Bacillus subtilis NX⁃2
TANG Bao,FENG Xiaohai,ZHANG Dan,XU Zongqi,JIANG Yongxiang,LI Sha,XU Hong
(College of Food Science and Light Industry,Nanjing Tech University,Nanjing 211800,China)
Abstract:Biosynthesis of poly⁃γ⁃glutamic acid is an aerobic process. Therefore we tried to transform the
strain by genetic engineering to improve its ability of using oxygen. First,the recombinant plasmid pMA5⁃
P43⁃vgb was constructed with the overlapping PCR method connecting Bacillus subtilis P43 promoter to
Vitreoscilla hemoglobin gene vgb, then transformed into Bacillus subtilis NX⁃2, to obtain a recombinant
strain B.subtilis NX⁃2(vgb+).The molecular size of hemoglobin VHb in recombinant strain B. subtilis NX⁃
2(vgb+)was 1􀆰 6 × 104 by SDS⁃PAGE. Further,the carbon monoxide difference spectra verified that the
target protein had a physiological activity in B. subtilis NX⁃2 ( vgb+ ). The experiments in the 7􀆰 5⁃L
fermentor showed that the recombinant strain increased the biomass 41􀆰 2% and the γ⁃PGA production
7􀆰 5% than the original strain. The research lay a foundation for the γ⁃PGA industrial production.
Keywords:Bacillus subtilis;Vitreoscilla hemoglobin;poly⁃γ⁃glutamic acid
    γ 聚谷氨酸(γ PGA)是由微生物合成的细胞
外氨基酸聚合物,由 D 型和 L 型谷氨酸通过 γ 酰
胺键连接而成[1]。 具有保湿性和生物可降解性等
理化和生物学特性,在环境、医药、食品和化妆品等
领域具有广泛的应用前景[2 3],是不可降解的合成
高分子材料(如塑料和水凝胶等)优良的替代品。
因此,开发该产品有利于加快我国高分子产业和产
品结构向绿色化、功能化方向发展。
透明颤菌血红蛋白(VHb)是透明颤菌中的氧
调节蛋白,能够在极低的溶氧环境条件下大量合
成,使得菌体在恶劣的贫氧环境中也能较好地生
存。 科学家们利用 VHb 的这一功能,首次将血红
蛋白基因( vgb)在大肠杆菌中进行克隆表达,发现
VHb的导入可以在细胞水平上改善 O2的供应,提
高氧化磷酸化水平和 ATP 再生能力,从而加快细
胞的生长和代谢[4] 。 自从 VHb在大肠杆菌中成功
表达以来,该蛋白已被广泛应用于耗氧量大、溶氧
易成为限制因素的工业微生物生产领域。 Kallio
等[5]将 vgb基因在产 α 淀粉酶的枯草芽胞杆菌中
进行表达,提高了菌体生长和产酶能力;郭晓军
等[6]将 vgb基因成功导入黄单胞杆菌,极大地提高
了黄原胶的产量; VHb 还被用于抗生素工业,
Demodena等[7]通过在枝顶青霉菌种中表达该蛋白
提高了头孢菌素 C 的产量,Brunker 等[8]也应用该
蛋白的表达来促进糖多孢红霉素菌产红霉素的含
量。 但 VHb应用于 γ PGA 发酵生产的未见报
道。 因此,为了提高 γ PGA生产菌在低溶氧环境
条件下对氧的利用能力,构建 VHb 表达的基因工
程菌是一种有效的策略。
本研究中,笔者以 Bacillus subtilis NX 2 为研
究对象,将强启动子 P43与 vgb基因连接,构建到大
肠杆菌 枯草芽胞杆菌穿梭质粒 pMA5 上,并将构建
的血红蛋白基因重组表达载体转化到 B. subtilis
NX 2,考察 VHb表达对 γ PGA 合成及菌体生长
的影响。
1  材料和方法
1􀆰 1  材料
1􀆰 1􀆰 1  菌株及质粒
大肠杆菌 E. coli JM109、枯草芽胞杆菌 B.
subtilis 168、枯草芽胞杆菌 B. subtilis NX 2、大肠杆
菌 枯草芽胞杆菌穿梭质粒 pMA5 均保存于笔者所
在实验室,携带透明颤菌血红蛋白基因 vgb 的质粒
pOK12为中国科学院上海生化研究所惠赠。
1􀆰 1􀆰 2  工具酶及试剂
限制性内切酶、连接酶、 Ex Taq 等酶均为
TaKaRa公司产品,引物合成、测序由南京金斯瑞公
司完成,其余试剂为进口或国产市售分析纯。
1􀆰 1􀆰 3  培养基及培养条件
大肠杆菌和枯草芽胞杆菌分子实验中均采用 LB
培养基(g / L):NaCl 10,蛋白胨 10,酵母粉 5。 大肠杆
菌抗性培养基中各个抗生素的质量浓度(μg / mL):氨
苄青霉素 50,氯霉素 25,卡那霉素 25,四环素 40。 枯
草芽胞杆菌抗性培养基中各个抗生素的质量浓度
(μg / mL):氯霉素 10,卡那霉素 25,四环素 5。
B. subtilis NX 2发酵培养基(g / L):葡萄糖 60,
酵母膏 5,谷氨酸钠 50,K2HPO4·3H2O 8,MgSO4 0􀆰 25;
pH 7􀆰 0。
种子液培养:接一环菌于装有 80 mL种子培养液
的 500 mL三角瓶中,220 r / min、32􀆰 5 ℃培养 16 h。
发酵罐培养:7􀆰 5 L发酵罐,装液量 4 L,配两档
圆盘透平桨,罐径与桨径长度比为 2 ∶ 1,121 ℃灭菌
15 min,接种量 2%,发酵温度 32􀆰 5 ℃,搅拌转速 400
r / min,通气量 1􀆰 2 L / min。
1􀆰 1􀆰 4  引物
本实验所用引物如表 1所示。
表 1  本实验所用引物
Table 1  Primers used in this experiment
引物名称 引物序列(5′ 3′) 酶切位点
产物长
度 / bp
P43 F GGAATCCCATATGTGATAGGTGGTATGTTTTCGC Nde I
P43 R TGAGGGTCTTCCTTAGTGCAGCTGAGGCATGT
387
vgb F ACATGCCTCAGCTGCACTAAGGAAGACCCTCA
vgb R CCGGGATCCTTATTCAACCGCTTGAG BamH I
468
1􀆰 2  实验方法
基因组提取、质粒提取、酶切、连接、SDS PAGE
分析以及大肠杆菌转化等分子生物学技术均参照文
献[9]的方法。
2 生  物  加  工  过  程    第 14卷 
1􀆰 2􀆰 1  重叠 PCR连接启动子 P43和 vgb基因
重叠 PCR分两步进行。 第一步反应体系如下:
含 10×PCR buffer 2􀆰 5 μL、Mg2+ 2 μL、dNTP 2 μL、模
板 P43和 vgb各 2 μL、Ex Taq DNA聚合酶 0􀆰 5 μL,
加重蒸水至反应液总体积为 25 μL。 扩增程序如
下:95 ℃预变性 4 min;94 ℃变性 55 s,65 ℃ 退火
40 s,72 ℃ 延伸 1 min,循环 5次;72 ℃ 延长 2 min。
第二步在第一步基础上再加入 25 μL 反应物质,体
系如下:10×PCR buffer 5 μL,Mg2+2 μL,dNTP 4 μL,
待重叠片段模板 P43上游引物和模板 vgb 下游引物
各 2 μL,Ex Taq DNA 聚合酶 1 μL,加重蒸水至反应
液总体积为 50 μL。 扩增程序如下:95 ℃ 退火 4
min;94 ℃变性 50 s,55~60 ℃退火 40 s,72 ℃ 延伸
1 min,循环 30次;72 ℃ 延长 10 min。
1􀆰 2􀆰 2  重组表达质粒 pMA5 P43 vgb的构建 
质粒构建流程如图 1 所示,将 PCR 得到的
P43 和 vgb 基因片段回收,经过重叠 PCR 扩增与
穿梭质粒 pMA5 经过 Nde I和 BamH I 双酶切后过
夜连接, 获得重组表达载体 pMA5 P43 vgb,转
化大肠杆菌 JM109,挑选单克隆,经菌体 PCR、质
粒双酶切验证。
图 1  重组表达质粒 pMA5 P43 vgb的构建流程
Fig􀆰 1  Construction of recombinant plasmid
pMA5⁃P43⁃vgb
1􀆰 2􀆰 3  重组表达质粒 pMA5 P43 vgb 转化枯草
芽胞杆菌
重组表达质粒 pMA5 P43 vgb 转化枯草芽胞
杆菌参照电转化方法[10]。
1􀆰 2􀆰 4  检测方法
CO差光光谱法检测透明颤菌血红蛋白 VHb 的
表达活性,参照文献[11]。
细胞生长的测定:将发酵液稀释 25倍后通过分
光光度计于 660 nm处读取吸光值。
γ PGA含量的测定参照文献[12]。
2  结果与讨论
2􀆰 1  启动子 P43和透明颤菌血红蛋白基因 vgb 的
扩增以及重叠 PCR连接
    根据表 1 中引物,分别以 B. subtilis 168 基因
组、pOK12 质粒为模板,PCR 扩增得到 P43 启动子
片段、含有自身启动子序列的 vgb 基因片段。 所获
得的 PCR产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定,结果如图 2
和图 3 所示。 由图 2 和图 3 可知:大小约 400、470
bp,与预期结果一致。 将上述 P43 启动子片段及
vgb 基因切胶回收作为重叠模板,以 P43 F及 vgb
R作为引物进行重叠 PCR。 重叠片段经切胶回收后
如图 4所示。 由图 4可知:条带大小约为 850 bp,表
明已将 P43启动子与 vgb基因连接。
M—DNA标准品;1~2—P43启动子片段
图 2  P43启动子片段的 PCR扩增电泳
Fig􀆰 2  PCR amplification of the promoter P43
M—DNA标准品;1~2—vgb基因片段
图 3  vgb基因的 PCR扩增电泳
Fig􀆰 3  PCR amplification of the vgb gene
3  第 2期 汤  宝等:通过透明颤菌血红蛋白基因表达提高 γ 聚谷氨酸的生物合成
M—DNA标准品;1~2—P43 vgb重叠片段
图 4  重叠 PCR扩增的 P43 vgb片段
Fig􀆰 4  Over⁃lapping PCR amplification of the
P43⁃vgb products
2􀆰 2  重组表达质粒 pMA5 P43 vgb 的构建及
验证
    重叠片段测序结果表明 P43 启动子序列与 vgb
基因序列没有发生碱基的缺失和改变。 将该重叠
片段与 pMA5 质粒用 Nde I 和 BamH I 进行双酶切
后连接,按照图 1中流程构建重组表达质粒 pMA5
P43 vgb,转化 E. coli JM109,挑取阳性克隆进行菌
液 PCR验证,结果见图 5。 再将 PCR 验证有正确条
带的转化子提取质粒进行双酶切验证,结果如图 6
所示。 图 5、图 6 结果表明重组载体 pMA5 P43
vgb构建成功。
M—DNA标准品;1~4—菌液 PCR验证 P43 vgb片段
图 5  重组质粒 pMA5 P43 vgb的 PCR验证
Fig􀆰 5  Colony PCR profile of recombinant
plasmid pMA5⁃P43⁃vgb
2􀆰 3  VHb在 B. subtilis NX 2中的表达及鉴定
2􀆰 3􀆰 1  pMA5 P43 vgb 转化 B. subtilis NX 2
采用电转化方法将 pMA5 P43 vgb 重组质粒
转化 B. subtilis NX 2,在卡那霉素抗性平板上进行
筛选,挑取 3个转化子。 将这 3株重组菌全部挑取至
含有卡那霉素抗性的液体培养基中,提取质粒验证,
M—DNA标准品;1~2—Nde I和 BamH I双酶切 pMA5 P43 vgb
图 6  重组质粒 pMA5 P43 vgb的酶切验证
Fig􀆰 6  Restriction analysis of recombinant
plasmid pMA5⁃P43⁃vgb
结果如图 7 所示。 由图 7 可知:泳道 1 为出发菌 B.
subtilis NX 2提取质粒结果,表示宿主菌中不存在质
粒;泳道 2、3、4分别是 3株重组菌提取质粒的结果,
表明 3株重组菌中均有质粒转入。 为进一步验证质
粒是否是重组载体 pMA5 P43 vgb,分别用Nde I和
BamH I 对这 3个质粒进行双酶切,结果如图 7的泳
道 5、6和 7所示,均有 7 500 bp 和 850 bp 的条带,说
明 pMA5 P43 vgb已经成功转入 B. subtilis NX 2,
将重组菌命名为 B. subtilis NX 2(vgb+)。
M—DNA标准品;1—B􀆰 subtilis NX 2质粒提取结果;
2~4—重组菌质粒提取结果;5~7—Nde I和 BamH I双酶切
重组菌质粒 pMA5 P43 vgb
图 7  重组菌 B. subtilis NX 2(vgb+)的验证
Fig􀆰 7  Confirmation of recombinant B. subtilis NX⁃2(vgb+)
2􀆰 3􀆰 2  SDS PAGE检测重组菌株的血红蛋白 VHb
的表达
通过 SDS PAGE 检测重组菌 B. subtilis NX 2
(vgb+)中 VHb的表达,结果如图 8所示。 由图 8可知:
与原始菌 B. subtilis NX 2 相比,重组菌 B. subtilis
NX 2(vgb+)成功表达了相对分子质量约 1􀆰 6×104的蛋
4 生  物  加  工  过  程    第 14卷 
白条带,即血红蛋白 VHb,与文献报道大小一致[13]。
M—蛋白标准品;1—B. subtilis NX 2(vgb+)总蛋白;
2—B. subtilis NX 2总蛋白
图 8  VHb在重组菌 B. subtilis NX 2(vgb+)的表达
Fig􀆰 8  VHb protein from recombinant B. subtilis
NX⁃2(vgb+) by SDS⁃PAGE analysis
2􀆰 3􀆰 3  CO差光谱法检测重组菌 VHb的表达活性
透明颤菌血红蛋白在不同的环境条件下可呈
现 3种不同的状态,即氧化态、还原态、氧合态,并可
以相互转化,其中还原态是生理活性态,而氧合态
则是富氧条件下的表现形式[14]。 若向溶液中鼓入
CO气体,则可形成血红蛋白 CO复合物,在 419 nm
处呈现特征吸收峰。 通过 CO 差光谱法检测,结果
如图 9所示。 由图 9 可知:重组菌 B. subtilis NX 2
(vgb+)在 419 nm处有明显的特殊吸收峰,而原始菌
B. subtilis NX 2没有相应的吸收峰,表明重组菌表
达了有生理活性的血红蛋白。
图 9  重组菌 B. subtilis NX 2(vgb+)的 CO差光光谱分析
Fig􀆰 9  CO⁃difference spectra analysis of recombinant
B. subtilis NX⁃2(vgb+)
2􀆰 4  VHb表达对 B􀆰 subtilis NX 2发酵的影响
2􀆰 4􀆰 1  VHb对发酵生产 γ PGA的影响
在 7􀆰 5 L 罐中考察 B. subtilis NX 2 与 B.
subtilis NX 2( vgb+ )分批发酵合成 γ PGA 的过
程,结果如图 10所示。 由图 10可知:VHb的表达极
大地促进了菌体生长,并且比原始菌提早进入对数
期,最终生物量(DCW)达到(6􀆰 89±0􀆰 20) g / L,比原
始菌增加了 41􀆰 2%。 VHb 的表达也加快了底物葡
萄糖和L 谷氨酸的消耗,但底物的消耗更多地用于
菌体生长,对 γ PGA的合成没有明显的促进作用。
B. subtilis NX 2(vgb+)发酵合成 γ PGA 产量的最
高值为(34􀆰 4±0􀆰 38) g / L,较原始菌提高了 7􀆰 5%。
或许因为 pMA5 P43 vgb 作为外源质粒转 B.
subtilis NX 2,表达效率不高。 另外,在发酵过程
中,重组菌株的发酵液颜色由微红色逐渐加深,发
酵结束时呈现为土黄色。 在有氧发酵过程中,由于
VHb的表达导致发酵液颜色改变的现象已有报
道[12],或许在长时间的发酵过程中,表达质粒会有
少量的丢失,并且血红蛋白呈现的红色与枯草芽胞
杆菌的代谢产物长时间混合在一起导致了发酵体
系颜色的变化。 Kallio 等[15]研究发现 VHb 的表达
可以增加细胞中氧的利用效率,使呼吸链末端氧化
酶的活性发生改变,提高细菌中 ATP 的水平,从而
提高细胞对氧的利用能力。
图 10  VHb的表达对 γ PGA分批发酵过程的影响
Fig􀆰 10  Effect of VHb expression on the batch
fermentation of γ⁃PGA
2􀆰 4􀆰 2  重组菌 B. subtilis NX 2(vgb+)的发酵稳定性
质粒稳定性是影响基因工程菌外源蛋白表达
的重要因素,同时外源蛋白的表达又影响着质粒的
稳定性。 特别在组成型表达系统中,由于外源蛋白
的持续表达,导致细胞代谢负担加重,质粒稳定性
的控制比较困难。 为考察重组菌 B. subtilis NX 2
(vgb+)的发酵稳定性,分别将重组菌在含有卡那霉
素抗性及无抗性选择压力情况下传代多次,同时以
原始菌 B. subtilis NX 2 在无抗性条件下传代作为
对照。 随机选取 3 种培养条件下的第 2、4、6、8 和
10代进行摇瓶发酵,结果见表 2。 由表 2 可知: 含
有卡那霉素抗性选择压力的重组菌传代培养有较
5  第 2期 汤  宝等:通过透明颤菌血红蛋白基因表达提高 γ 聚谷氨酸的生物合成
好的发酵稳定性,γ PGA 产量未有明显下降,且均
优于原始菌的发酵结果。 而不含有抗性选择压力
的重组菌传代培养在第 6代之后已没有明显的发酵
优势,甚至其 γ PGA 产量还低于原始菌,可能原因
是多次无压力的传代培养造成了质粒的丢失,对细
胞内微环境造成了不利的影响。 由于笔者在保存
及活化重组菌过程中都是在含有卡那霉素抗性选
择压力的条件下进行的,因此,可以保证质粒的稳
定性,不会明显影响 VHb表达对 γ PGA 发酵的作
用效果。
表 2  B. subtilis NX 2(vgb+)的发酵稳定性
Table 2  The fermentation stability of bacteria B. subtilis NX⁃2(vgb+)
菌株
ρ(γ PGA) / (g·L-1)
第 2代 第 4代 第 6代 第 8代 第 10代
B. subtilis NX 2 30􀆰 5±0􀆰 20 30􀆰 3±0􀆰 18 30􀆰 0±0􀆰 19 30􀆰 1±0􀆰 16 30􀆰 3±0􀆰 17
B. subtilis NX 2(vgb+)(Kmr+) 35􀆰 1±0􀆰 22 35􀆰 2±0􀆰 21 35􀆰 0±0􀆰 20 34􀆰 9±0􀆰 19 34􀆰 8±0􀆰 15
B. subtilis NX 2(vgb+)(Kmr-) 35􀆰 0±0􀆰 21 34􀆰 8±0􀆰 15 30􀆰 3±0􀆰 18 29􀆰 8±0􀆰 21 28􀆰 1±0􀆰 18
3  结论
通过在 B. subtilis NX 2 中外源表达透明颤菌
血红蛋白基因 vgb,从分子水平上提高细胞自身对
溶氧的利用能力,最终重组菌的细胞量达到(6􀆰 89±
0􀆰 20) g / L、γ PGA产量为(34􀆰 4±0􀆰 38) g / L,相比
原始菌分别提高了 41􀆰 2%、7􀆰 5%。 因此,在保持现
有设备和能耗压力不变的情况下,该策略为解决工
业微生物在发酵过程中的供氧不足问题提供了一
条新的途径。
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(责任编辑  管  珺)
6 生  物  加  工  过  程    第 14卷