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Cloning and expression of 1, 3-propanediol oxidoreductase gene from Clostridium butyricum in Escherichia coli

丁酸梭菌1,3-丙二醇氧化还原酶基因dhaT的克隆及在大肠杆菌中的表达



全 文 :第6卷第1期
2008年1月
生物加工过程
ChineseJournalofBioprocessEngineering
Jan.2008
· 17·
丁酸梭菌1,3一丙二醇氧化还原酶基因dhaT
的克隆及在大肠杆菌中的表达
杨登峰1,韦宇拓2,黄日波1’2
(1.广西科学院 工业生物技术中心,南宁530003;
2.广西大学 生命科学与技术学院,南宁530005)
摘要:以丁酸梭茵(Clostridiumbutyricum)基因组DNA为模板,利用PCR技术扩增得到l,3一丙二醇氧化还原酶基
因dhaT,将它连接到pMD18-T载体上,得到重组质粒pMD—dhaT,对此重组质粒进行序列测定,对其DNA序列分析
表明,妣T基因全长为1158bp。将舭T基因插入表达栽体pSE-380中,构建成重组子pSE一讹T,并在大肠杆茵
JMl09中进行诱导表达。研究表明,以l,3一丙二醇为底物时,基因工程茵在37℃下,以1.0mmoVLWTG诱导14
h,酶活力达到16.28U/mL。比原始菌株提高5.6倍。
关键词:克隆;丁酸梭茵;表达;氧化还原酶;l,3一丙二醇
中图分类号:Q785 文献标识码:A 文章编号:1672—3678(2008)01—0017一04
Cloninga dexpressionof1,3-propanedioloxidoreductasegene
fromClostridiumbutyricuminEscherichiacoli
YANGDeng.fen91,WEIYu.tu02,HUANGRi.b01’2
(1.IndustrialBio—technologyResearchCenter,Guan鲥AcademyofS iences,Nanning530003,China;
2.CollegeofLifeScienceandTechnology,GuangxiUnivers ty,Nanning530005,China)
Abstract:The抛Tgen ncodingl,3-propanedioloxidoreductase(DhaT)wasamplifiedromthege—
nomeofClostridiumbutyricumbypolymerasech inr actionandligatedintopMD18--Ttoobtainrecombi·-
nantplasmidpMD—d耽口T.whichweresentosequence.ItwashownfromDNAsequenceanalysisthat
theopenreadingframeof砒口Twas1 158bp.Theg neofa流oTwaginsertedintoexpressionvectorpSE·
380andtherecombinantpl smidpSE—dhaTw sconstructedandhentransformedintoE.coliJMl09.
TheresultsshowedthathenzymaticctivityofDhaTincrudeextractsreached坤t016.28U/mLwhen
using1.3-propanediolassubstrateundertheinducedonditionof1.0mmol/LIPTGat30℃for14
hours.anditw鼬increased5.6foldcomparedwiththatofwildstrain.
Keywords:cloning;Clostridiumbutyricum;expression;oxidoreduetase;1,3-propanediol
19世纪以来,1,3.丙二醇(1,3-PDO),以其多方
面优越的特性,在化学、酶学、遗传学乃至微生物生
理学中‘1。43成为人们关注的焦点。正因为如此,1,
3-PDO的生产和应用已引起众多世界跨国公司的高
收稿日期:2007-03—14
基金项目:国家863计划课题资助项目(2003AA001039)
作者简介:杨登峰(1979一),男,江苏无锡人,硕士.研究方向:生物工程及酶工程。
联系人:黄日波,教授,博士生导师,E-mail:pribob@gxu.edu.cn
万方数据
· 18· 生物加工过程 第6卷第1期
度重视。
当前世界上生产l,3-PDO的方法有丙烯醛法、
环氧乙烷法、微生物发酵法、羟甲基法、酸氢化法及
山梨糖醇法等,其中,前2种方法是工业化生产的主
要方法,但他们都需要在高温和贵重金属催化剂作
用下进行,副产物多,致使产品分离纯化较困难,生
产成本相应较高。因此,人们已渐渐把目光转移到
生物法生产上,并进行了大量的研究工作。
生物法生产l,3-PDO,无论是使用天然菌株,还
是经过改造的基因工程菌,都必须由3-羟基丙醛(3-
HPA)转化为1,3-PDO,而1,3一丙二醇氧化还原酶正
是起这个作用的。因此,国外,人们较早就开始了
对该酶的研究,而国内,这方面研究相对较少,本文
对最具工业化前景的丁酸梭菌中的1,3一丙二醇氧
化还原酶基因进行了克隆及表达,为进一步研究1,
3-PDO生产过程中各关键酶的关系及提高1,3-PDO
的产量成为可能。
1材料与方法
1.1质粒和菌株
pMD18.T载体购自大连宝生物技术有限公司;
表达质粒pSE一380购自Invitrogen公司;大肠杆菌
JMl09均为本实验室保存。
1.2培养基
LB培养基(酵母浸膏5g/L,胰蛋白胨10∥L,
NaCl10g/L,pH7.0),培养基中加入的氨苄青霉素
终质量浓度为100p,g/mL。
1.3酶和化学试剂
eft,DNA聚合酶、T4DNA连接酶、kDNA/Hind
HIDNAmarker、蛋白质相对分子质量Marker购自
FermentasMBI公司;dNTP、DL2000NAMarker和
限制性内切酶均购自大连宝生物公司;IPTG等其他
分子生物学试剂购自上海生物工程技术服务有限
公司。
1.4分子克隆技术
DNA的操作、重组、大肠杆菌的转化、诱导表
达、SDS—PAGE分析按文献[5]进行。dhaT基因的
PCR引物是根据GenBank中查到的Clostridiumbu—
tyricum(AYll2989)的dhaT基因全序列设计的。
SensePrimer:5一AT丛墨垒!鱼垦翻【-I.clrI’MrGlfl隗Gc—
CTATAA-3(下划线部分为BamHI位点);Antisense
Primerj5-ATACCATGGGAATGTATG爿刀么删G
TAc-3(下划线部分为NcoI位点)。以cbutyri-
cumn总DNA为模板,通过PCR方法扩增出dhaT
基因,将他连接于克隆载体pMD18.T上,用于dhaT
基因序列测定;再将测序正确的dhaT基因用NcoI
和BamHI从质粒pMD.dhaT切出,连接于表达质
粒pSE380的NcoI和BamHI位点处。重组表达质
粒命名为pSE—dhaT,并转化到大肠杆菌EcoliJM
109中进行表达。
1.5序列测定
委托大连宝生物技术有限公司测定。
1.6诱导表达及表达产物的SDS-PAGE凝胶电泳
分析
以空白质粒转入大肠杆菌作为对照,挑取单菌
落工程菌E.coliJM109/pSE—dhaT接种到含Amp
(100p。g/mL)的LB培养液,37℃振荡培养过夜,然
后,按l%接种到新鲜的LB培养液中,37℃培养至
DD鲫约为0.4~0.6时,加入IPTG使终浓度达1
mmoL/L,诱导表达5~15h(220r/rain30℃)。取
lmL菌液,12000r/min离心1min,菌体用1000
斗L重蒸H:O重新洗涤,再离心收集菌体,加入20
斗L重蒸H:0重悬,并加入等量2×上样Buffer,沸水
浴10min立即进行SDS—PAGE凝胶电泳分析。以
10%的凝胶作分离胶,电泳后用考马斯亮蓝R250
染色。
1.7 重组大肠杆菌细胞的破碎处理和抛T酶活测定
按文献[6]进行,以l,3一丙二醇为底物进行酶
活测定。酶活力定义为:pH为7.7时,在25℃条
件下,每分钟催化形成1p。molNADPH所需的酶量
为一个酶活单位(u)。
2结果和分析
2.1 dhaT基因的PCR扩增结果
以C.butyricum基因组DNA为模板,经PCR扩
增得到特异性高的单一条带,大小约1.2kb的DNA
片段,PCR产物在O.8%琼脂糖凝胶上电泳检测扩
增片断,与预期的结果一致(图1)。
2.2重组质粒pMD—dhaT和表达质粒pSE.砒oT的
酶切分析
从重组菌株E.coliJMl09/pMD-dhaT中提取重
组质粒pMD18·T-dhaT,经NcoI和BamHI双酶切
完全后,琼脂糖凝胶电泳分析获得酶切产物为
1.2kb的片段,表明插入片段与PCR扩增产物大小
万方数据
2008年1月杨登峰等:丁酸梭菌1,3一丙二醇氧化还原酶基因dhaT的克隆及在大肠杆菌中的表达 ·19·
一致。同样将表达质粒pSE—dhaT用NcoI和BamH
I双酶切,琼脂糖凝胶电泳分析获得双酶切产物
1。2kb和4.4kb片段(图2)。由于表达载体pSE一
380约4.4kb,说明dhaT基因已连接到表达载体
pSE-380上。
Lanel--PCRproduct;LaneMarker—DNAMarkerDL2000
图1 1。3-丙二醇氧化还原酶基因(dhaT)PCR扩增产物
Hg.1PCRproductofdhaTgene
IAineMl—DNAMarker入/HindI
lamel—pSE-dhaT/NcoI+BamHI
LaneM2一DNAMarkerDL姗
图2 阳性克隆pSE-dhaT双酶切
Fig.2NcolandBamHIdigestofpositiveclonepSE—dhaT
2.3 dhaT基因DNA序列分析
对重组质粒pMD-dhaT上的dhaT基因进行全
序列测定分析,结果表明,从起始密码子ATG至终
止密码子TAA整个开放阅读框为1158bp,编码386
个氨基酸。Blast结果表明,其序列与GenBank上公
布的17.butyricum(AYl12989)的dhaT基因核苷酸
序列同源性为99%,说明克隆到的是dhaT基因。
2.4 dhaT基因表达产物的SDS-PAGE凝胶电泳分析
重组菌株Eco/iJM109/pSE—dhaT,按步骤1.6
进行诱导14h后,进行SDS-PAGE凝胶电泳,结果
显示,和对照菌株相比,重组菌株在大约4.1×104
处出现明显的蛋白质特征带(图3),表达条带位置
相对偏小,主要是由于表达蛋白中小相对分子质量
氨基酸较多。蛋白质相对分子质量与其DNA大小
推测结果相一致,与文献[7—8]报道的相符,表明
dhaT基因在trc启动子带动下得到了表达。
Lane1---recombinantstrainof最coliJM109/pSE-dhaT
Lane2--recombinantstrainofEcoliJM1091pSE-380
LaneM~PIoteinMarker 一
图3 表达产物的SDS.PAGE分析
Fi昏3SDS-PAGEanalysisofthexpressionproducts
2.5 dhaT酶活测定
将重组菌EcoliJMlOg/pSEdhaT置于含Amp
(100I.Lg/mL)的LB培养基中进行培养,以终浓度
为1mmoL/L的IPTG诱导表达4~15h(220r/min.
300C),结果发现,在不含有表达质粒pSE380一dhaT
的对照菌株E coliJMl09中同样检测到微弱的酶
活力,这是由于最coliJMl09是属于E.coliK一12系
列的,而在EcoliK一12基因组中含有YqhD基因,这
是一个氧化还原酶的同工酶,因此,在计算酶活力
时,需使用对照菌株EcoliJMl09/pSE-380。研究
表明,已得到具有1,3一丙二醇氧化还原酶活性的表
达产物,重组菌EcoliJMl09/pSE-d施T的酶活力为
16.28U/mL,比对照菌株C.butyricumn的酶活力提
高5.6倍。可见,Cbutyricum的dhaT基因已经成
功地在大肠杆菌中进行了表达。尽管c.butyricum
万方数据
生物加工过程 第6卷第1期
的d玩r基因在密码子偏好性上并没有进行优化,但
该酶的表达较好,粗酶液较之其他菌中的1,3一丙二
醇氧化还原酶具有相对较高的酶活‘9-10】。其原因:
[3]
一方面可能在于表达元件的不同,另一方面可能在
于各菌种密码子与大肠杆菌密码子偏好性的不同。
3讨论
在微生物代谢甘油生成1,3-PDO的过程中,通
常情况下,发酵法生产1,3-PDO是以甘油作为唯一
碳源和能源,进行厌氧1,3-PDO发酵。其中包括2
步反应,由甘油脱水酶将甘油脱水生成3-HPA,再由
1,3-PDO氧化还原酶将3-HPA还原为1,3-PDO,产
生的1,3-PDO是细胞代谢终产物,可在发酵液中高
度聚集。1,3.丙二醇氧化还原酶基因dhaT编码l,
3一丙二醇氧化还原酶(EC1.1.1.202),该酶是将3.
HPA催化生成l,3-PDO的酶。因此,对产l,3一PD
的不同微生物中dhaT基因功能的研究较为详尽,
如克雷伯氏菌(Klebsiellapneumoniae)、乳酸菌属
(Lactobacillusbrevi )、弗氏柠檬菌(Citrobacterfieun-
dii)、梭菌属的丁酸梭状芽孢杆菌(Clotridiabutyri—
cum)等,这些产1,3-PDO的天然菌株中含有的1。
3一丙二醇氧化还原酶都是以NAD+为辅酶,其相关
基因的克隆和表达也有较多报道【s,11-13]。从另一
个角度,也说明了1,3-PDO氧化还原酶酶在生产1,
3-PDO过程中的重要性。
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