全 文 ：核 农 学 报摇 圆园员猿袁圆苑渊愿冤院员员员愿 耀 员员圆源
允燥怎则灶葬造 燥枣 晕怎糟造藻葬则 粤早则蚤糟怎造贼怎则葬造 杂糟蚤藻灶糟藻泽
收稿日期院圆园员圆鄄怨鄄圆远摇 接受日期院圆园员猿鄄园员鄄员远
基金项目院台州市科技计划项目渊员圆员运再员远冤袁 浙江省公益性技术应用研究计划项目渊圆园员圆悦猿圆园员员冤
通讯作者院蒋明袁 男袁 副教授袁 从事植物发育生物学及其分子调控研究遥 耘鄄皂葬蚤造院 躁蚤葬灶早皂蚤灶早员怨苑猿岳 员猿怨援 糟燥皂
文章编号院员园园园鄄愿缘缘员渊圆园员猿冤园愿鄄员员员愿鄄园苑
核盘菌和灰葡萄孢菌 悦悦悦匀锌指蛋白基因的
鉴定和比较分析
蒋摇 明摇 管摇 铭摇 潘小翠摇 张金国摇 胡佳渭
渊台州学院生命科学学院袁 浙江 临海摇 猿员苑园园园冤
摘摇 要院悦悦悦匀锌指蛋白渊扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 责则燥贼藻蚤灶泽冤广泛分布于动物尧植物和微生物之中袁在 砸晕粤代谢过程中起
着重要作用袁通过鉴定核盘菌和灰葡萄孢菌 在枣基因袁为基因克隆尧表达分析和功能研究奠定基础遥 本研
究以核盘菌和灰葡萄孢菌全基因组序列为材料袁运用生物信息学的手段开展 在枣基因的全基因组鉴定和
分析遥 经分析袁核盘菌和灰葡萄孢菌各有 员员 个 在枣基因袁它们的开放性阅读框全长分别为 远猿猿 耀 猿苑源员遭责
和 远猿猿 耀 猿源愿远遭责曰共检测到 缘缘 个 悦悦悦匀锌指基序袁以 悦鄄载苑鄄悦鄄载缘鄄悦鄄载猿鄄匀渊圆圆 个冤和 悦鄄载愿鄄悦鄄载缘鄄悦鄄载猿鄄匀渊圆员
个冤最为常见袁其中 悦鄄载愿鄄悦鄄载远鄄悦鄄载猿鄄匀和 悦鄄载苑鄄悦鄄载远鄄悦鄄载猿鄄匀为 圆 种新发现的基序类型曰进化分析结果表
明袁圆圆 个 在枣基因聚为 源 组袁除 杂杂员郧赃员猿远猿员尧杂杂员郧赃园怨猿远园尧月悦员栽赃园园猿员园 和 月悦员栽赃园缘圆员苑 外袁核盘菌和灰葡
萄孢菌的 在枣基因分别位于不同的小分支袁该结果与 在枣基因的基因结构尧基序数量和分布情况一致遥
关键词院悦悦悦匀锌指蛋白曰核盘菌曰灰葡萄孢菌曰基因组
摇 摇 核盘菌 渊 杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬 泽糟造藻则燥贼蚤燥则怎皂 冤 为核盘菌科
渊杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬糟藻葬藻冤非专性寄生病原真菌袁寄主多达 苑缘 科
源园园 余个物种咱员 原 圆暂 遥 核盘菌的寄主包括一些重要农作
物袁如油菜 渊 月则葬泽泽蚤糟葬 灶葬责怎泽 冤尧 向 日 葵 渊 匀藻造蚤葬灶贼澡怎泽
葬灶灶怎怎泽冤尧大豆渊郧造赠糟蚤灶藻 皂葬曾冤尧菜豆渊孕澡葬泽藻燥造怎泽 增怎造早葬则蚤泽冤
和青花菜渊月援 燥造藻则葬糟藻葬 增葬则援 蚤贼葬造蚤糟葬冤等袁该菌引发的菌核
病为世界性病害咱猿 原 愿暂 遥 灰葡萄孢菌渊月燥贼则赠贼蚤泽 糟蚤灶藻则藻葬冤
的有性世代为葡萄核盘菌袁也是一种核盘菌科真菌遥
灰葡萄孢菌的寄主十分广泛袁它侵染双子叶植物和非
禾本科单子叶植物袁全球有 圆园园 余种农作物严重受害袁
包括蛋白类作物尧油料作物尧纤维作物和园艺作物
等咱怨暂 遥 灰葡萄孢菌与核盘菌在分类学上的关系十分
相近袁并由于二者均具有寄主广泛性和环境持久性等
特性袁这两种病原真菌已经成为研究腐生菌和广谱致
病性病原菌的模式物种咱圆袁 员园 原 员员暂 遥
锌指蛋白渊扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 责则燥贼藻蚤灶泽冤是一类广泛存在于
生物有机体的转录因子袁参与诸多细胞活动袁包括转录
调控尧砸晕粤结合尧细胞凋亡及蛋白互作等袁涉及到繁
殖尧生长发育及逆境反应等咱员圆暂 遥 根据二级结构中半胱
氨酸渊悦赠泽贼藻蚤灶藻袁 悦冤和组氨酸渊匀蚤泽贼蚤凿蚤灶藻袁 匀冤的数量及
排列次序袁锌指蛋白可分为 悦圆匀圆尧 悦圆悦圆尧 悦圆悦圆悦圆尧
悦圆匀悦尧 悦圆悦圆悦圆悦圆尧 悦圆匀悦悦圆悦圆 和 悦悦悦匀 等 七 种 类
型咱员猿 原 员缘暂 遥 悦悦悦匀 锌指蛋白 渊 在枣冤 所占比例较小袁仅
园郾 愿豫左右咱员远暂 遥 悦悦悦匀锌指基序为 悦鄄载远 原 员源 鄄悦鄄载源 原 缘 鄄悦鄄
载猿鄄匀咱员源暂 袁富含甘氨酸和苯丙氨酸遥 在枣 基因家族参与
多种生物学过程袁目前对它们的精确功能知之甚少袁灰
葡萄孢菌与核盘菌的 在枣 家族基因相关的研究也未见
报道袁同时灰葡萄孢菌与核盘菌的全基因组测序已完
成袁这为 在枣基因家族成员的鉴定尧进化分析和功能研
究提供了契机遥 本研究以两种病原真菌的全基因组序
列为材料袁综合运用各种生物信息学手段袁对 在枣 家族
基因开展全基因组鉴定并进行比较分析袁为基因的克
隆尧表达分析和功能验证奠定基础遥
员摇 材料与方法
员郾 员摇 试验材料
核盘菌和灰葡萄孢菌的基因组序列尧基因序列和
蛋白质序列等均来自 澡贼贼责院椅憎憎憎援 遭则燥葬凿蚤灶泽贼蚤贼怎贼藻援 燥则早袁
两种病原菌分别有 员源缘圆圆 个和 员远源源愿 个基因曰在枣 家族
愿员员员
摇 苑 期 核盘菌和灰葡萄孢菌 悦悦悦匀锌指蛋白基因的鉴定和比较分析
的隐马尔可夫模型渊匀蚤凿凿藻灶 酝葬则噪燥增 酝燥凿藻造袁 匀酝酝冤文件
孕云园园远源圆 下载自 澡贼贼责院椅责枣葬皂援 泽葬灶早藻则援 葬糟援 怎噪咱员苑暂 遥
员郾 圆摇 方法
结构域搜索程序为 澡皂皂泽藻葬则糟澡咱员愿暂 袁以 在枣 的 匀酝酝
文件为种子袁分别搜索核盘菌和灰葡萄孢菌的蛋白质
序列袁获得各自的 在枣 候选序列遥 借助 杂酝粤砸栽 在线工
具渊澡贼贼责院椅泽皂葬则贼援 藻皂遭造援 凿藻冤 咱员怨暂 袁去除不含 悦悦悦匀 型锌
指基序的序列遥 利用在线基因结构显示系统渊郧藻灶藻
杂贼则怎糟贼怎则藻 阅蚤泽责造葬赠 杂藻则增藻则袁 郧杂阅杂冤渊澡贼贼责院椅早泽凿泽援 糟遭蚤援 责噪怎援
藻凿怎援 糟灶冤 咱圆园暂 袁获得核盘菌和灰葡萄孢菌 在枣 家族各基因
的结构遥
借助在线工具 酝耘酝耘 杂怎蚤贼藻 渊 澡贼贼责院椅皂藻皂藻援 泽凿泽糟援
藻凿怎 辕 皂藻皂藻 辕 糟早蚤鄄遭蚤灶 辕 皂藻皂藻援 糟早蚤冤 咱圆员暂 袁搜寻 在枣 序列的基
序袁最大基序数量渊皂葬曾蚤皂怎皂 灶怎皂遭藻则 燥枣 皂燥贼蚤枣泽冤设为 员园袁
其它参数采用默认值遥 悦悦悦匀 蛋白序列经 悦造怎泽贼葬造 宰
对齐后袁用 酝耘郧粤 猿郾 员 构建系统发生树袁建树方法采用
邻接法咱圆圆暂 遥
圆摇 结果与分析
圆郾 员摇 悦悦悦匀型锌指蛋白基因的鉴定
以 孕云园园远源圆 为种子文件袁利用 匀酝酝耘砸 猿郾 园 软件
包中的 澡皂皂泽藻葬则糟澡程序分别搜索核盘菌和灰葡萄孢菌
本地蛋白质数据库袁经 杂酝粤砸栽 在线工具检测后去除
不含锌指结构域的序列袁再经 酝耘郧粤猿郾 员 检测去除重
复序列后袁共获得 圆圆 条完整的 在枣序列袁核盘菌和灰葡
萄孢菌各 员员 条渊表 员冤遥 核盘菌 在枣 序列分布在 愿 个
杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早拼接序列上袁灰葡萄孢菌的 在枣 序列则出现
在 员园 个 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早拼接序列上遥
在 圆圆 个蛋白序列中共检测到 缘缘 个 悦悦悦匀型锌指
基序遥 核盘菌中 悦悦悦匀型锌指基序的数量为 员 原 缘 个袁
其中 杂杂员郧赃园缘愿怨缘 最多曰杂杂员郧赃园圆园怨缘 次之袁为 源 个曰而
杂杂员郧赃园员猿猿猿尧杂杂员郧赃园苑怨员猿 和 杂杂员郧赃员员源圆苑 最少遥 灰葡
萄孢菌 悦悦悦匀 型锌指基序数量也是 员 原 缘 个袁月悦员栽赃
园员缘怨远 最多曰月悦员栽赃园园猿员园尧月悦员栽赃园苑怨源园 和 月悦员栽赃园怨猿源缘
次之袁为 源 个曰月悦员栽 赃园苑苑远园尧月悦员栽 赃园愿愿苑远 和 月悦员栽 赃
园怨苑源猿 最少袁仅 员 个遥
悦悦悦匀 型锌指基序中袁悦鄄载苑鄄悦鄄载缘鄄悦鄄载猿鄄匀 类型数
量最多袁共有 圆圆 个曰悦鄄载愿鄄悦鄄载缘鄄悦鄄载猿鄄匀 类型次之袁有圆员 个曰另有 悦鄄载愿鄄悦鄄载源鄄悦鄄载猿鄄匀尧悦鄄载苑鄄悦鄄载源鄄悦鄄载猿鄄匀 和悦鄄载员苑 鄄悦鄄载远鄄悦鄄载猿鄄匀类型袁分别为 远 个尧圆 个和 圆 个曰同
时袁新发现了 圆 种 悦悦悦匀 型锌指基序袁它们是 悦鄄载愿鄄悦鄄载远鄄悦鄄载猿鄄匀和 悦鄄载苑鄄悦鄄载远鄄悦鄄载猿鄄匀 类型袁为 杂杂员栽赃园怨猿远园
所特有渊图 员冤遥
表 员摇 核盘菌和灰葡萄孢菌 悦悦悦匀锌指蛋白基因家族成员的鉴定
栽葬遭造藻 员摇 陨凿藻灶贼蚤枣蚤糟葬贼蚤燥灶 燥枣 悦悦悦匀 扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 早藻灶藻 枣葬皂蚤造赠 皂藻皂遭藻则泽 枣则燥皂 杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬 泽糟造藻则燥贼蚤燥则怎皂 葬灶凿 月燥贼则赠贼蚤泽 糟蚤灶藻则藻葬
核盘菌
杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬 泽糟造藻则燥贼蚤燥则怎皂
灰葡萄孢菌
月燥贼则赠贼蚤泽 糟蚤灶藻则藻葬
基因名称
郧藻灶藻 灶葬皂藻
位置
蕴燥糟怎泽
开放性阅读
框长度
蕴藻灶早贼澡 燥枣
燥责藻灶 则藻葬凿蚤灶早
枣则葬皂藻 辕 遭责
悦悦悦匀锌指
基序数量
晕怎皂遭藻则 燥枣
悦悦悦匀 扎蚤灶糟
枣蚤灶早藻则 皂燥贼蚤枣泽
基因名称
郧藻灶藻 灶葬皂藻
位置
蕴燥糟怎泽
开放性阅读
框长度
蕴藻灶早贼澡 燥枣 燥责藻灶
则藻葬凿蚤灶早
枣则葬皂藻 辕 遭责
悦悦悦匀锌指
基序数量
晕怎皂遭藻则 燥枣
悦悦悦匀 扎蚤灶糟
枣蚤灶早藻则 皂燥贼蚤枣泽
杂杂员郧赃园员猿猿猿 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 圆 圆猿员园 员 月悦员栽赃园苑苑远园 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 源源 员苑源远 员
杂杂员郧赃园员源员缘 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 圆 员圆园怨 猿 月悦员栽赃园愿愿苑远 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 缘园 怨远怨 员
杂杂员郧赃园圆园怨缘 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 圆 猿苑源员 源 月悦员栽赃园怨苑源猿 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 远远 圆猿园苑 员
杂杂员郧赃园源圆员怨 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 缘 圆圆员源 圆 月悦员栽赃园园员愿怨 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 员 圆圆员苑 圆
杂杂员郧赃园源圆圆怨 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 缘 远猿猿 圆 月悦员栽赃园缘圆员苑 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 圆圆 圆缘圆园 圆
杂杂员郧赃园缘愿怨缘 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 苑 怨猿猿 缘 月悦员栽赃园远源源苑 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 猿源 员园愿远 圆
杂杂员郧赃园苑怨员猿 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 员园 员苑怨员 员 月悦员栽赃员园缘猿园 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 苑圆 远猿猿 圆
杂杂员郧赃员员源圆苑 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 员愿 员圆怨园 员 月悦员栽赃园园猿员园 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 员 圆苑源圆 源
杂杂员郧赃员猿源远远 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 圆缘 员园愿怨 圆 月悦员栽赃园苑怨源园 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 源猿 员源远源 缘
杂杂员郧赃员猿远猿员 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 圆远 圆源怨园 猿 月悦员栽赃园怨猿源缘 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 缘怨 猿源愿远 源
杂杂员郧赃园怨猿远园 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 员猿 员远苑员 圆 月悦员栽赃园员缘怨远 杂怎责藻则糟燥灶贼蚤早 源 苑愿猿 缘
怨员员员
核摇 农摇 学摇 报 圆苑 卷
图 员摇 核盘菌和灰葡萄孢菌 悦悦悦匀锌指基序的比对
云蚤早援 员摇 酝燥贼蚤枣 糟燥皂责葬则蚤泽燥灶泽 燥枣 悦悦悦匀 扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则泽 枣则燥皂 杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬 泽糟造藻则燥贼蚤燥则怎皂 葬灶凿 月燥贼则赠贼蚤泽 糟蚤灶藻则藻葬
圆郾 圆摇 悦悦悦匀锌指蛋白基因的特征
核盘菌 在枣家族基因的开放性阅读框渊燥责藻灶 则藻葬凿蚤灶早
枣则葬皂藻袁 韵砸云冤全长为 远猿猿 耀 猿苑源员遭责袁编码 圆员园 耀 员圆源远 个
氨基酸曰灰葡萄孢菌 在枣家族基因的 韵砸云全长为 远猿猿 原
园圆员员
摇 苑 期 核盘菌和灰葡萄孢菌 悦悦悦匀锌指蛋白基因的鉴定和比较分析
图 圆摇 核盘菌和灰葡萄孢菌 悦悦悦匀锌指蛋白基因的结构
云蚤早援 圆摇 悦悦悦匀 扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 早藻灶藻泽 泽贼则怎糟贼怎则藻泽 枣则燥皂 杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬 泽糟造藻则燥贼蚤燥则怎皂 葬灶凿 月燥贼则赠贼蚤泽 糟蚤灶藻则藻葬
图 猿摇 核盘菌和灰葡萄孢菌 悦悦悦匀锌指蛋白的基序
云蚤早援 猿摇 酝燥贼蚤枣泽 燥枣 悦悦悦匀 扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 责则燥贼藻蚤灶泽 枣则燥皂 杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬 泽糟造藻则燥贼蚤燥则怎皂 葬灶凿 月燥贼则赠贼蚤泽 糟蚤灶藻则藻葬
猿源愿远遭责袁编码 圆员园 原 员员远员 个氨基酸遥 基因结构在线分
析结果表明袁核盘菌和灰葡萄孢菌 在枣 家族基因的内含
子数量为 员 原 缘 个袁核盘菌的 在枣家族中 杂杂员郧赃员员源圆苑 和
杂杂员郧赃园怨猿远园 内含子数量最多袁各有 缘 个袁杂杂员郧赃园缘愿怨缘
次之袁为 源 个曰核盘菌的 杂杂员郧赃园源圆圆怨尧杂杂员郧赃员猿源远远 及
杂杂员郧赃员猿远猿员 和灰葡萄孢菌的 月悦员栽 赃园园猿员园尧月悦员栽 赃
园员缘怨远尧月悦员栽赃园远源源苑尧月悦员栽赃园愿愿苑远 及 月悦员栽赃员园缘猿园 均只
有 员 个内含子袁大部分内含子的长度为数十个 遭责 到
缘园园遭责不等袁最长的内含子也小于 员园园园遭责袁为 杂杂员郧赃
园缘愿怨缘 所有渊图 圆冤遥
圆郾 猿摇 悦悦悦匀锌指蛋白的基序分析
利用 酝耘酝耘在线工具对核盘菌和灰葡萄孢菌 在枣
家族的 圆圆 个基因进行保守性基序分析袁结果表明袁核
盘菌和灰葡萄孢菌 在枣的基序有 圆 原 怨 个渊图 猿冤遥 月悦员栽
赃园怨猿源缘 的基序数量最多袁有 怨 个曰杂杂员郧赃园圆园怨缘 有 愿 个
基序曰月悦员栽赃园苑苑远园尧月悦员栽赃园怨苑源猿尧月悦员栽赃园怨苑源猿尧杂杂员郧赃
员员源圆苑 和 杂杂员郧 赃园怨猿远园 的保守基序最少袁仅 圆 个曰除
月悦员栽赃园园猿员园 和 杂杂员郧赃园怨猿远园 外袁其它都能找到基序相
似的序列袁其中 杂杂员郧赃园源圆圆怨 和 月悦员栽赃员园缘猿园 的基序排
列与序列长度完全一致袁而 月悦员栽 赃园远源源苑 与 杂杂员郧 赃
员猿源源远 仅存在一个氨基酸残基的差异遥
圆郾 源摇 进化分析
核盘菌和灰葡萄孢菌的 在枣 家族基因序列经
悦造怎泽贼葬造 载 对齐后袁保存为 酝杂云 文件袁再用 酝耘郧粤 猿郾 员
将其转换为 皂藻早格式并构建系统发生树袁建树方法为
邻接法袁经 员园园园 次自举检测遥 结果表明袁圆圆 个 在枣基因
员圆员员
核摇 农摇 学摇 报 圆苑 卷
在进化树上处于 源 个不同分支袁其中的 月悦员栽赃员园缘猿园尧
杂杂员郧赃园源圆圆怨尧月悦员栽赃园员缘怨远尧杂杂员郧赃园缘愿怨缘尧月悦员栽赃园园员愿怨
和 杂杂员郧赃园源圆员怨 聚为一组袁月悦员栽赃园愿愿苑远尧杂杂员郧赃员员源圆苑尧
月悦员栽赃园怨苑源猿 和 杂杂员郧赃园员猿猿猿 聚为一组袁杂杂员郧赃园怨猿远园尧
杂杂员郧赃 员猿远猿员尧 月悦员栽 赃 园缘圆员苑尧 月悦员栽 赃 园苑怨源园 和 杂杂员郧 赃
园员源员缘 聚为一组袁剩余 苑 条序列单独聚为一组遥
除 杂杂员郧 赃 员猿远猿员尧 杂杂员郧 赃 园怨猿远园尧 月悦员栽 赃 园园猿员园 和
月悦员栽赃园缘圆员苑 外袁核盘菌和灰葡萄孢菌的 在枣 序列两两
聚合袁如 月悦员栽赃员园缘猿园 与 杂杂员郧赃园源圆圆怨尧月悦员栽赃园员缘怨远 与
杂杂员郧赃园缘愿怨缘 及 月悦员栽赃园怨苑源猿 与 杂杂员郧赃园员猿猿猿 等成对处
于不同的小分支渊图 源冤遥
图 源摇 核盘菌和灰葡萄孢菌 悦悦悦匀
锌指蛋白的进化分析
云蚤早援 源摇 孕澡赠造燥早藻灶藻贼蚤糟 葬灶葬造赠泽蚤泽 燥枣 悦悦悦匀 扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 早藻灶藻泽
枣则燥皂 杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬 泽糟造藻则燥贼蚤燥则怎皂 葬灶凿 月燥贼则赠贼蚤泽 糟蚤灶藻则藻葬
猿摇 讨论
大部分锌指蛋白与 阅晕粤尧蛋白质相互作用袁而 在枣
主要参与 砸晕粤 代谢袁是一类 砸晕粤 结合蛋白袁与 砸晕粤
的剪切尧多腺苷化和降解相关咱圆猿暂 遥 在枣 广泛分布于动
物尧植物和微生物之中袁其中小鼠渊酝怎泽 皂怎泽糟怎造怎泽冤和人
渊匀燥皂燥 泽葬责蚤藻灶泽冤基因组中分别有 缘愿 和 缘缘 个成员咱圆源暂 曰
在拟南芥渊粤则葬遭蚤凿燥责泽蚤泽 贼澡葬造蚤葬灶葬冤和水稻渊韵则赠扎葬 泽葬贼蚤增葬冤
中分别鉴定出 远愿 和 远苑 个 在枣成员袁它们可分为 员员 和 愿
个亚家族袁其中的大部分成员与生物或非生物胁迫相
关袁推测它们在逆境反应中起着重要作用咱圆缘暂 曰玉米
渊在藻葬 皂葬赠泽冤中至少有 远愿 个成员袁分布在 员园 条不同染
色体上袁系统发育分析表明它们可分为 苑 类咱圆远暂 曰毛果
杨渊孕燥责怎造怎泽 贼则蚤糟澡燥糟葬则责葬冤基因组中有 怨员 个 在枣 基因袁可
分为 员猿 组袁同组成员的基因结构和基序组成十分相
似咱圆苑暂 遥 本研究以核盘菌和灰葡萄孢菌基因组序列为
材料袁共得到 圆圆 个 在枣 家族的基因袁两种病原真菌各有
员员 个袁与小鼠尧人尧拟南芥尧水稻尧毛果杨和玉米相比袁
核盘菌和灰葡萄孢 在枣基因的数量相对较少遥
典型的 在枣 含有 员 原 远 个锌指基序遥 在玉米中袁利
用 孕枣葬皂和 杂酝粤砸栽 共鉴定出 员愿园 个 悦悦悦匀 锌指基序曰
毛果杨中最多袁有 圆员员 个曰而拟南芥和水稻中相对较
少袁分别为 员缘圆 和 员缘园 个咱圆缘 原 圆苑暂 曰核盘菌和灰葡萄孢菌
的 悦悦悦匀锌指基序的数量较少袁分别为 圆远 和 圆怨 个袁平
均每个 在枣含 圆郾 源 和 圆郾 远 个遥 在毛果杨尧水稻和拟南芥
中袁在枣的基序数量为 员 耀 远 个曰而玉米中除 员 耀 远 个拷贝
外袁还发现了含 苑 个 悦悦悦匀 锌指基序的序列咱圆远暂 曰核盘
菌和灰葡萄孢菌中为 员 原 缘 个袁没有发现含 远 个 悦悦悦匀
锌指基序的蛋白遥 悦悦悦匀 锌指基序的通式为 悦鄄载远 原 员源 鄄
悦鄄载源 原 缘 鄄悦鄄载猿鄄匀咱员源暂 袁在拟南芥尧水稻和玉米 在枣 家族中袁
基序 悦鄄载愿鄄悦鄄载缘鄄悦鄄载猿鄄匀 和 悦鄄载苑鄄悦鄄载缘鄄悦鄄载猿鄄匀 最为常
见袁认为 悦鄄载苑 原 愿 鄄悦鄄载缘鄄悦鄄载猿鄄匀 为原始类型咱圆苑暂 遥 在玉
米中发现了一个新基序 悦鄄载员苑 鄄悦鄄载远鄄悦鄄载猿鄄匀袁这种类型
的基序在核盘菌和灰葡萄孢菌中也有渊月悦员栽赃园远源源苑
和 杂杂员栽赃员猿源远远冤袁此外袁还新发现 悦鄄载愿鄄悦鄄载远鄄悦鄄载猿鄄匀渊灰葡萄孢菌冤和 悦鄄载苑鄄悦鄄载远鄄悦鄄载猿鄄匀 渊核盘菌冤两种悦悦悦匀锌指基序遥
从基因结构看袁核盘菌和灰葡萄孢菌 在枣 基因的内
含子数量为 员 耀 缘 个袁而在玉米中袁有 缘 个 在枣基因不具
内含子遥 核盘菌和灰葡萄孢菌 在枣 基因的内含子长度
从数十个 遭责到 员园园园遭责不等袁而玉米 在枣基因的内含子
大小为数十 遭责 至 员远园园园遭责袁变异范围比两种病原菌
大咱圆远暂 遥 核盘菌和灰葡萄孢菌同属核盘菌科袁是两种亲
缘关系较近的病原真菌袁它们的基因组大小尧郧悦含量尧
简单重复序列的丰度及分布都有很高的相似性咱员园暂 遥
本研究通过对二者的 在枣家族基因进行分析袁也得到了
类似的结果袁除个别 在枣 基因 渊 杂杂员郧 赃员猿远猿员尧 杂杂员郧 赃
园怨猿远园尧月悦员栽赃园园猿员园 和 月悦员栽赃园缘圆员苑冤外袁核盘菌和灰葡
萄孢菌的 在枣 两两处于不同的小分支袁两两聚合的 在枣
家族成员在基因结构上十分相近袁在基序数量和分布
上也较为一致遥 除 悦悦悦匀 锌指基序外袁同时在玉米 在枣
家族基因中鉴定出 粤晕运尧宰阅 原 源园尧砸砸酝尧阅耘载阅糟 和
匀耘蕴陨悦糟等基序袁它们与 砸晕粤 结合相关咱圆远暂 曰本研究在
核盘菌和灰葡萄孢菌的 在枣家族基因中袁用酝耘酝耘在线
工具同时也鉴定出 圆 耀 怨 个保守性基序袁这些基序可能
参与 砸晕粤的代谢过程咱圆远暂 遥
圆圆员员
摇 苑 期 核盘菌和灰葡萄孢菌 悦悦悦匀锌指蛋白基因的鉴定和比较分析
本文以核盘菌和灰葡萄孢菌的全基因组序列为材
料袁在鉴定 在枣家族基因的基础上袁对家族成员的结构
和特征进行了研究袁并进行了系统发育分析袁为两种病
原菌 在枣家族基因的克隆尧表达分析和基因功能验证奠
定了基础遥
参考文献院
咱 员 暂 摇 月燥造葬灶凿 郧 允袁 匀葬造造 砸援 陨灶凿藻曾 燥枣 责造葬灶贼 澡燥泽贼泽 燥枣 杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬 泽糟造藻则燥贼蚤燥则怎皂
咱允暂 援 悦葬灶葬凿蚤葬灶 允燥怎则灶葬造 燥枣 孕造葬灶贼 孕葬贼澡燥造燥早赠袁 员怨怨源袁 员远院 怨猿 原 员园愿
咱 圆 暂 摇 月燥造贼燥灶 酝 阅袁 栽澡燥皂皂葬 月 孕 匀 允袁 晕藻造泽燥灶 月 阅援 杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬 泽糟造藻则燥贼蚤燥则怎皂
渊 蕴蚤遭援 冤 凿藻 月葬则赠院 遭蚤燥造燥早赠 葬灶凿 皂燥造藻糟怎造葬则 贼则葬蚤贼泽 燥枣 葬 糟燥泽皂燥责燥造蚤贼葬灶
责葬贼澡燥早藻灶 咱允暂 援 酝燥造藻糟怎造葬则 孕造葬灶贼 孕葬贼澡燥造燥早赠袁 圆园园远袁 苑院 员 原 员远
咱 猿 暂 摇 郧葬则早 匀袁 蕴蚤 匀袁 杂蚤增葬泽蚤贼澡葬皂责葬则葬皂 运袁 运怎燥 允袁 月葬则遭藻贼贼蚤 酝 允援 栽澡藻
蚤灶枣藻糟贼蚤燥灶 责则燥糟藻泽泽藻泽 燥枣 杂糟造藻则燥贼蚤灶蚤葬 泽糟造藻则燥贼蚤燥则怎皂 蚤灶 糟燥贼赠造藻凿燥灶 贼蚤泽泽怎藻 燥枣 葬
则藻泽蚤泽贼葬灶贼 葬灶凿 葬 泽怎泽糟藻责贼蚤遭造藻 早藻灶燥贼赠责藻 燥枣 月则葬泽泽蚤糟葬 灶葬责怎泽 咱 允暂 援 粤灶灶葬造泽
燥枣 月燥贼葬灶赠袁 圆园员园袁 员园远渊远冤院 愿怨苑 原 怨园愿
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耘泽贼藻遭葬灶 匀燥责责 匀袁 蕴赠贼燥增糟澡藻灶噪燥 粤袁 云藻则灶蚤藻 粤 砸袁 匀藻蚤灶扎 砸袁 悦葬则则葬则蚤 云援
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