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ESTABLISHMENT OF DNA FINGERPRINTING DATABASE FOR PARENTAL LINES OF HYBRID RICE

杂交水稻亲本分子身份证及SSR指纹数据库的建立



全 文 :摇 核 农 学 报摇 圆园员圆袁圆远渊远冤院园愿缘猿 耀 园愿远员允燥怎则灶葬造 燥枣 晕怎糟造藻葬则 粤早则蚤糟怎造贼怎则葬造 杂糟蚤藻灶糟藻泽
收稿日期院圆园员员鄄员圆鄄园愿摇 接受日期院圆园员圆鄄园远鄄园苑
基金项目院国家科技支撑计划渊圆园员圆月粤阅园苑月园员冤
作者简介院陆徐忠渊员怨苑圆鄄冤袁男袁安徽天长人袁博士袁副研究员袁主要从事农作物品种 阅晕粤 鉴定研究遥 栽藻造院 园缘缘员鄄缘员远园缘猿缘曰耘鄄皂葬蚤造院造怎曾怎扎澡燥灶早岳 赠葬澡燥燥援
糟燥皂援 糟灶
通讯作者院杨剑波渊员怨缘苑鄄冤袁男袁安徽太和人袁博士生导师袁研究员袁主要从事农业生物技术研究遥 栽藻造院 园缘缘员 原 圆员远园圆员圆曰 耘鄄皂葬蚤造院 赠躁蚤葬灶遭燥岳 圆远猿援 灶藻贼
文章编号院员园园园鄄愿缘缘员渊圆园员圆冤园远鄄园愿缘猿鄄园怨
杂交水稻亲本分子身份证及 杂杂砸指纹数据库的建立
陆徐忠摇 从夕汉摇 刘海珍摇 倪金龙摇 马摇 琳摇 李摇 莉摇 倪大虎摇 杨剑波
渊安徽省农业科学院水稻研究所袁安徽 合肥摇 圆猿园园猿员冤
摘摇 要院本研究利用 郧月 辕 栽圆园猿怨远 原 圆园园远 推荐的 源愿 对 杂杂砸核心标记袁对 员猿猿 份杂交水稻亲本渊包括部分常
规品种冤进行 杂杂砸分析袁根据引物在 员猿猿 份材料中扩增的片段大小袁构建了各品种的分子身份证和指纹
图谱袁该身份证由 源愿 位数字或数字与字母组合组成袁代表了 源愿 对引物在该品种中的扩增情况遥 将品种
的身份证信息与品种的形态学特征特性等信息相结合袁构建了具查询功能的 杂杂砸 指纹网络数据库遥 该
杂杂砸指纹数据库除具有品种基本信息查询尧品种分子身份证查询尧品种间相似率查询和身份证核对等基
本功能外袁还可指导杂交水稻品种真实性和纯度鉴定袁分析亲本间遗传相似性袁为杂交稻新组合的选育
提供亲本选配的参考遥 该数据库的建立袁不仅为检测单位和育种工作者提供了一个便利的网络数据交
换和共享平台袁也为品种的选育尧试验尧管理尧评价尧仲裁提供技术支撑和科学参考遥
关键词院杂交水稻曰亲本曰杂杂砸标记曰分子身份证曰指纹数据库
耘杂栽粤月蕴陨杂匀酝耘晕栽 韵云 阅晕粤 云陨晕郧耘砸孕砸陨晕栽陨晕郧 阅粤栽粤月粤杂耘 云韵砸
孕粤砸耘晕栽粤蕴 蕴陨晕耘杂 韵云 匀再月砸陨阅 砸陨悦耘
蕴哉 载怎鄄扎澡燥灶早摇 悦韵晕郧 载蚤鄄澡葬灶摇 蕴陨哉 匀葬蚤鄄扎澡藻灶摇 晕陨 允蚤灶鄄造燥灶早摇 酝粤 蕴蚤灶摇 蕴陨 蕴蚤摇 晕陨 阅葬鄄澡怎摇 再粤晕郧 允蚤葬灶鄄遭燥
渊砸蚤糟藻 砸藻泽藻葬则糟澡 陨灶泽贼蚤贼怎贼藻袁粤灶澡怎蚤 粤糟葬凿藻皂赠 燥枣 粤早则蚤糟怎造贼怎则葬造 杂糟蚤藻灶糟藻泽袁匀藻枣藻蚤袁粤灶澡怎蚤摇 圆猿园园猿员冤
粤遭泽贼则葬糟贼院陨灶 贼澡蚤泽 泽贼怎凿赠袁 憎藻 责藻则枣燥则皂藻凿 杂杂砸 渊泽蚤皂责造藻 泽藻择怎藻灶糟藻 则藻责藻葬贼泽冤 葬灶葬造赠泽蚤泽 燥枣 员猿猿 澡赠遭则蚤凿 责葬则藻灶贼葬造 则蚤糟藻 增葬则蚤藻贼蚤藻泽 憎蚤贼澡
源愿 杂杂砸 糟燥则藻 责则蚤皂藻则 责葬蚤则泽 则藻糟燥皂皂藻灶凿 遭赠 郧月 辕 栽圆园猿怨远 原 圆园园远援 月葬泽藻凿 燥灶 责燥造赠皂燥则责澡蚤泽皂 葬皂燥灶早 贼澡藻 皂葬贼藻则蚤葬造泽袁 憎藻 遭怎蚤造贼
皂燥造藻糟怎造葬则 陨阅 葬灶凿 枣蚤灶早藻则责则蚤灶贼 枣燥则 藻葬糟澡 增葬则蚤藻贼赠援 栽澡藻 陨阅 憎葬泽 糟燥灶泽贼则怎糟贼藻凿 遭赠 源愿 凿蚤早蚤贼 灶怎皂遭藻则泽 葬灶凿 造藻贼贼藻则泽袁 憎澡蚤糟澡 则藻责则藻泽藻灶贼
贼澡藻 凿藻贼葬蚤造 责燥造赠皂燥则责澡蚤泽皂 燥灶 糟藻则贼葬蚤灶 增葬则蚤藻贼赠援 悦燥皂遭蚤灶藻凿 贼澡藻 杂杂砸 责燥造赠皂燥则责澡蚤泽皂 葬灶凿 葬灶葬贼燥皂蚤糟葬造 蚤灶枣燥则皂葬贼蚤燥灶袁 葬 泽藻葬则糟澡葬遭造藻
杂杂砸 枣蚤灶早藻则责则蚤灶贼蚤灶早 凿葬贼葬遭葬泽藻 憎葬泽 遭怎蚤造贼援 栽澡蚤泽 凿葬贼葬遭葬泽藻 糟燥怎造凿 遭藻 怎泽藻凿 贼燥 蚤凿藻灶贼蚤枣赠 贼澡藻 遭葬泽蚤糟 蚤灶枣燥则皂葬贼蚤燥灶袁 皂燥造藻糟怎造葬则 陨阅 葬灶凿
泽蚤皂蚤造葬则蚤贼赠 燥枣 增葬则蚤藻贼蚤藻泽援 云怎则贼澡藻则皂燥则藻袁 蚤贼 葬造泽燥 糟燥怎造凿 遭藻 葬责责造蚤藻凿 蚤灶 泽藻藻凿 责怎则蚤贼赠 藻曾葬皂蚤灶蚤灶早袁 责葬则藻灶贼葬造 泽蚤皂蚤造葬则蚤贼赠 贼藻泽贼蚤灶早 贼燥
泽怎责责燥则贼 贼澡藻 则蚤糟藻 澡赠遭则蚤凿 遭则藻藻凿蚤灶早援 栽澡蚤泽 凿葬贼葬遭葬泽藻 灶燥贼 燥灶造赠 泽藻贼泽 葬 泽澡葬则蚤灶早 责造葬贼枣燥则皂 枣燥则 藻曾葬皂蚤灶葬贼蚤燥灶 蚤灶泽贼蚤贼怎贼藻泽 燥则 遭则藻藻凿藻则泽袁
遭怎贼 葬造泽燥 贼藻糟澡灶蚤糟葬造造赠 泽怎责责燥则贼泽 贼澡藻 遭则藻藻凿蚤灶早袁 贼藻泽贼蚤灶早袁 皂葬灶葬早蚤灶早 葬灶凿 躁怎凿早蚤灶早 燥灶 则蚤糟藻 增葬则蚤藻贼蚤藻泽援
运藻赠 憎燥则凿泽院澡赠遭则蚤凿 则蚤糟藻曰 责葬则藻灶贼泽 造蚤灶藻泽曰 杂杂砸曰 皂燥造藻糟怎造葬则 陨阅曰 杂杂砸 枣蚤灶早藻则责则蚤灶贼蚤灶早 凿葬贼葬遭葬泽藻
摇 摇 品种间形态差异和特征特性的不同袁本质上是由
基因的差异所致遥 利用 阅晕粤 分子标记鉴别不同品种
基因型的差异是目前区别品种较为有效尧快捷的方法遥
其中 杂杂砸标记具有操作简便快捷尧多态性高和稳定性
好等特点咱员暂 袁能够准确揭示不同品种间同一位点的
杂杂砸多态性袁并已广泛应用于遗传图谱的构建尧比较基
因组研究尧遗传多样性分析尧系统学研究以及品种纯度
与真实性的鉴定咱圆 耀 缘暂 遥 将若干位点上渊本文使用了 源愿
个位点冤的 杂杂砸电泳结果按一定规则制成类似人指纹
的图谱就称之为 杂杂砸指纹图谱袁对其进行数字化即可
猿缘愿
核摇 农摇 学摇 报 圆远 卷
构成各品种分子身份证袁具有高度的个体特异性和遗
传稳定性遥 以 杂杂砸标记为基础的番茄咱远暂 尧小麦咱苑暂和玉
米咱愿袁怨暂主栽品种 阅晕粤 指纹数据库构建已开始遥 水稻
品种 阅晕粤 指纹库构建研究工作也已起步袁李进波
等咱员园暂初步建立两系杂交稻亲本 杂杂砸指纹图谱袁并探讨
了其在种子纯度鉴定中的应用袁肖小余等咱员员暂利用 杂杂砸
标记对四川省 源圆 份主推杂交水稻亲本进行 阅晕粤指纹
库构建研究曰庄杰云等咱员圆暂初步构建了我国主栽水稻品
种的微卫星标记数据库曰张彦等咱员猿暂利用 员园 对 杂杂砸 引
物构建 圆员 个水稻材料的 杂杂砸 指纹图谱袁 利用计算机
软件构建数据库袁并引入了分子身份证的概念曰程本义
等咱员源暂构建了 圆苑怨 个水稻品种 伊 员圆 个微卫星标记的
阅晕粤指纹数据库袁并利用该数据库对品种的特异性及
区试续试品种年度间的一致性进行了鉴定曰颜静宛咱员缘暂
等利用 圆源 个多态性好的 杂杂砸 标记构建了 员猿苑 份水稻
材料分子身份证指纹图谱数据库遥
当前水稻的分子身份证及指纹数据库构建工作主
要集中在杂交种上袁而亲本的选择和利用是选育优势
杂交组合的关键袁因此建立杂交水稻亲本分子身份证
及 杂杂砸指纹数据库袁是鉴别杂交水稻亲本尧组合及研
究子代与亲本遗传关系的有力工具袁有助于对杂交水
稻骨干亲本的科学评价尧合理利用袁并可对其杂交组合
的预测和鉴定提供支持遥 同时对优异杂交水稻品种或
材料实施产权保护亦具有十分重大的意义遥 本研究依
据相关的国家和行业技术标准所推荐的 杂杂砸 核心引
物和规定的技术方法咱员远袁员苑暂 袁对来自全国各地的 员猿猿 个
水稻亲本逐一进行 杂杂砸分析袁构建了由 源愿 位数字渊或
字母冤组成的我国主要杂交水稻亲本分子身份证及指
纹数据库遥 通过该数据库可以了解不同亲本的遗传相
似性袁为杂交稻新组合的选育尧选配提供科学参考袁为
水稻种子质量检测尧品种权管理提供技术支撑遥
员摇 材料与方法
员郾 员摇 试验材料
用于构建分子身份证的 员猿猿 个杂交水稻亲本渊含
部分常规品种冤包括 员缘 个籼型三系不育系尧员愿 个籼型
两系不育系尧苑园 个籼型恢复系及品种尧缘 个粳型三系不
育系尧圆 个粳型两系不育系尧圆猿 个粳型恢复系及品种遥
员郾 圆摇 亲本材料的田间种植
样品种子由相关育种单位提供袁收集后系统编号袁
于海南省陵水县渊安徽省农业科学院水稻研究所南繁
育种基地冤隔离繁殖袁严格去杂后收获种子袁正季于合
肥渊安徽省农业科学院水稻研究所岗集试验基地冤统
一种植袁每个品种栽插 缘 行袁每行 员员 株袁分蘖盛期剪取
幼嫩叶片袁用于提取基因组 阅晕粤袁成株期对单株形态
拍照记录遥
员郾 猿摇 亲本材料 杂杂砸分析
源愿 对 杂杂砸核心引物的详细信息见表 圆袁水稻叶片
阅晕粤提取尧杂杂砸扩增和扩增产物的电泳检测均按标准
规定的方法进行咱员远袁员苑暂 袁电泳结果经统计分析软件
晕栽杂再杂 原 圆郾 员园 利用非加权类平均法渊哉孕郧酝粤冤进行聚
类分析咱员愿暂 遥
员郾 源摇 杂杂砸指纹数据库构建
根据 源愿 对核心引物在 员猿猿 个水稻亲本材料中的
扩增结果袁排定每对引物扩增产物分子量梯度袁依照
源愿 对引物扩增产物分子量梯度袁构建各品种材料的分
子身份证渊由 源愿 位数字或数字与字母组成冤袁并以坐
标图的形式显示品种指纹图谱袁最后以亲本材料的分
子身份证尧指纹图谱尧主要农艺性状及单株照片等信息
为基础袁构建具有查找和比对功能的杂交水稻亲本材
料 杂杂砸指纹数据库遥
圆摇 结果与分析
圆郾 员摇 水稻材料 杂杂砸分析及其多态性表现
源愿 对引物在 员猿猿 份水稻材料中扩增片段大小范
围在 愿园 耀 猿园园遭责袁多态性片段数为 圆 耀 员猿 个渊表 员冤袁多
态信息含量 孕陨悦 值为 园郾 猿缘圆远 耀 园郾 愿源猿愿袁平均 园郾 远圆员愿遥
对 员猿猿 份水稻材料进行聚类分析渊图 员冤袁结果表明袁品
种间遗传相似系数为 园郾 苑远 耀 园郾 怨愿袁遗传变异较小袁表
明水稻亲本品种遗传相似性较高袁遗传基础较为狭窄遥
以相似系数 园郾 苑愿 为阈值袁可以将 员猿猿 个供试品种分为
圆 个类群袁第玉类群主要为籼稻品种袁包括 员园愿 个品
种袁第域类群主要为粳稻品种袁包括 圆缘 个品种遥 玉类
群在遗传相似系数为 园郾 愿猿 处袁可分为 源 个亚群院玉粤
亚群主要为籼型三系不育系袁玉月 亚群主要为籼型两
系不育系袁玉悦 亚群主要为籼型恢复系及籼型常规品
种袁玉阅亚群主要为籼稻中的偏粳类型与粳稻中的偏
籼类型遥 第域类群在相似系数为 园郾 愿源 处袁可分为 圆 个
亚群袁域月亚群为粳稻常规品种袁其余粳稻品种归为域
粤亚群遥 表明 源愿 对 杂杂砸 核心引物在 员猿猿 份材料中表
现出较高的区分能力遥
源缘愿
摇 远 期 杂交水稻亲本分子身份证及 杂杂砸指纹数据库的建立
表 员摇 源愿 对 杂杂砸核心引物扩增片段信息
栽葬遭造藻 员摇 粤造造藻造藻 葬灶凿 孕陨悦 燥枣 源愿 责葬蚤则泽 责则蚤皂藻则泽
序号
晕燥援
位点
造燥糟蚤
染色体
糟澡则援
多态性
片段数
晕燥援 燥枣
葬造造藻造藻泽
多样性
指数
凿蚤增藻则泽蚤贼赠
蚤灶凿藻曾
孕陨悦值
孕陨悦
增葬造怎藻
序号
晕燥援
位点
造燥糟蚤
染色体
糟澡则援
多态性
片段数
晕燥援 燥枣
葬造造藻造藻泽
多样性
指数
凿蚤增藻则泽蚤贼赠
蚤灶凿藻曾
孕陨悦值
孕陨悦
增葬造怎藻
员 砸酝员 员 愿 园郾 怨源怨员 园郾 源缘苑远 圆缘 砸酝员怨园 远 愿 员郾 远怨园愿 园郾 苑愿怨源
圆 砸酝怨 员 怨 员郾 源缘员苑 园郾 远苑愿圆 圆远 砸酝圆缘猿 远 缘 园郾 愿猿怨员 园郾 缘园园员
猿 砸酝圆怨苑 员 苑 员郾 猿圆园园 园郾 远圆怨苑 圆苑 砸酝猿源远 苑 缘 园郾 苑圆圆怨 园郾 猿猿怨猿
源 砸酝员员怨缘 员 苑 员郾 缘愿圆怨 园郾 苑苑员远 圆愿 砸酝猿猿远 苑 员园 员郾 苑缘圆源 园郾 苑苑源园
缘 砸酝远 圆 缘 员郾 猿圆怨怨 园郾 远苑圆愿 圆怨 砸酝员愿 苑 源 园郾 怨怨源苑 园郾 缘苑圆猿
远 砸酝员猿愿缘 圆 苑 员郾 员远缘 园郾 缘苑缘源 猿园 砸酝员缘圆 愿 苑 员郾 猿缘员圆 园郾 苑苑缘源
苑 砸酝圆园愿 圆 苑 员郾 源源愿源 园郾 苑园缘远 猿员 砸酝圆远源 愿 员员 员郾 远苑源怨 园郾 苑苑源猿
愿 砸酝苑员 圆 苑 员郾 源员怨愿 园郾 苑圆员圆 猿圆 砸酝苑圆 愿 员员 员郾 缘怨园园 园郾 远缘怨缘
怨 砸酝愿圆园怨 猿 猿 园郾 愿怨园愿 园郾 缘圆缘员 猿猿 砸酝圆园员 怨 员园 员郾 猿猿园员 园郾 缘苑怨怨
员园 砸酝愿圆苑苑 猿 苑 员郾 猿缘缘猿 园郾 远源怨猿 猿源 韵杂砸圆愿 怨 远 员郾 员缘怨愿 园郾 缘苑园缘
员员 砸酝苑猿愿怨 猿 愿 员郾 猿园愿园 园郾 远源圆园 猿缘 砸酝圆员怨 怨 员园 员郾 愿猿怨猿 园郾 愿员圆缘
员圆 砸酝员远 猿 源 园郾 怨员猿员 园郾 源愿远园 猿远 砸酝圆苑愿 怨 猿 员郾 园苑员远 园郾 远源愿园
员猿 砸酝愿缘 猿 缘 园郾 愿猿圆源 园郾 源缘愿远 猿苑 砸酝缘怨园 员园 源 园郾 远远远缘 园郾 猿猿缘圆
员源 砸酝圆源员 源 苑 员郾 圆猿园园 园郾 远员源圆 猿愿 砸酝缘园怨缘 员园 员猿 圆郾 园怨愿苑 园郾 愿猿苑缘
员缘 砸酝缘源苑猿 源 愿 员郾 园愿苑苑 园郾 缘远怨远 猿怨 砸酝圆圆愿 员园 苑 员郾 缘圆怨远 园郾 苑员源远
员远 砸酝猿园苑 源 愿 员郾 缘源猿源 园郾 苑圆缘源 源园 砸酝圆圆源 员员 苑 员郾 圆愿源园 园郾 远愿猿圆
员苑 砸酝缘源员源 源 愿 员郾 圆怨怨园 园郾 远源员怨 源员 砸酝圆员 员员 员员 员郾 怨圆愿源 园郾 愿员愿缘
员愿 砸酝缘怨愿 缘 源 园郾 怨愿猿愿 园郾 缘圆圆怨 源圆 砸酝猿员猿猿 员员 愿 员郾 园圆苑苑 园郾 源愿源愿
员怨 砸酝源员猿 缘 远 园郾 怨远园猿 园郾 源猿园苑 源猿 砸酝苑员园圆 员圆 缘 员郾 园缘缘圆 园郾 缘远怨愿
圆园 砸酝猿愿猿愿 缘 愿 员郾 源愿缘远 园郾 苑园怨员 源源 砸酝员苑 员圆 缘 员郾 园员猿缘 园郾 缘愿圆圆
圆员 砸酝圆苑源 缘 圆 园郾 远怨员愿 园郾 源怨愿远 源缘 砸酝猿猿猿员 员圆 员园 员郾 缘愿远猿 园郾 苑园怨源
圆圆 砸酝圆远苑 缘 缘 员郾 缘圆愿圆 园郾 苑远苑猿 源远 砸酝缘源苑怨 员圆 员园 员郾 怨怨圆员 园郾 愿源猿愿
圆猿 砸酝猿远圆愿 远 愿 员郾 圆怨苑园 园郾 远猿猿缘 源苑 砸酝圆苑苑 员圆 源 园郾 愿猿猿怨 园郾 源源苑员
圆源 砸酝缘愿远 远 猿 园郾 缘远远愿 园郾 猿缘圆远 源愿 砸酝员怨 员圆 缘 员郾 园缘缘苑 园郾 缘愿猿愿
圆郾 圆摇 标记引物扩增产物分子量梯度编序
根据标记引物扩增片段与分子量标准的相对迁移
率袁记录每个引物在 员猿猿 份材料中扩增的等位基因数
和片段大小袁并按分子量排成阶梯图渊图 圆冤袁从大到小
以阿拉伯数字 员尧圆尧猿尧源尧噎噎尧怨 标注袁怨 个以上的等位
基因袁以大写英文字母 粤尧月尧悦尧噎噎尧在标注遥
圆郾 猿摇 水稻品种分子身份证构建
每个水稻亲本用一组 源愿 位数字或数字与字母的
组合来表示其对核心引物的扩增结果袁作为该品种的
分子身份证袁表 圆 列出了 源愿 对引物在 苑 个不育系上扩
增的特征条带即分子身份证袁如域 原 猿圆粤 的分子身份
证即可表示为院远源员苑 圆远苑苑 圆源圆圆 员缘源源 缘圆源圆 员猿猿员 苑猿圆缘
源苑员愿 缘圆猿猿 猿苑猿员 圆源员缘 员苑圆圆袁该分子身份证的第 员 位数
字野远冶表示域 原猿圆粤在 员 号引物 砸酝员渊表 员冤上扩增出
在分子量梯度图中渊图 圆冤排第 远 位的片段曰第 圆 位数
字野源冶表示域 原猿圆粤在 圆 号引物 砸酝怨 上扩增出在分子
量梯度图中排第 源 位的片段袁其余 源远 位以此类推遥
员猿猿 份杂交水稻亲本材料的分子身份证具体见表 圆遥
圆郾 源摇 指纹图谱的显示
员猿猿 份水稻品种的指纹图谱均采用坐标图的形式
表示袁横坐标表示所使用的 源愿 对核心引物袁纵坐标表
示等位基因分子量梯度渊与 圆郾 圆 中含义描述相同冤袁以
数字渊或字母冤表示袁指纹图左上角标识品种名称袁图 猿
以野域 原猿圆粤冶为例遥
圆郾 缘摇 杂交水稻亲本 杂杂砸指纹数据库的构建
以杂交水稻的亲本分子身份证信息尧指纹图谱尧主
要农艺性状及单株照片等信息为基础袁以品种名称尧核
心标记尧分子身份证为基本要素袁构建具有查询和比对
功能的野水稻亲本 阅晕粤 指纹及性状数据库冶 渊澡贼贼责院 辕 辕
憎憎憎援 早皂燥糟澡藻糟噪援 糟灶院愿园愿园 辕 则蚤糟藻凿遭择遭援 灶泽枣冤遥
圆郾 远摇 杂交水稻亲本 杂杂砸指纹数据库的功能
杂杂砸指纹数据库具有品种基本信息查询尧分子身
份证查询尧品种间相似率查询和身份证核对等基本功
能及其他拓展功能遥
圆郾 远郾 员摇 品种基本信息查询功能摇 输入品种名称袁即可
显示该品种的基本信息袁包括品种名称尧品种类型尧选
育单位尧亲本来源尧特征特性尧应用情况尧品种图片尧分
缘缘愿
核摇 农摇 学摇 报 圆远 卷
悦燥藻枣枣蚤糟蚤藻灶贼 燥枣 泽蚤皂蚤造葬则蚤贼赠图 员摇 员猿猿 份杂交水稻亲本的聚类图
云蚤早援 员摇 阅藻灶凿则燥早则葬皂 燥枣 早藻灶藻贼蚤糟 泽蚤皂蚤造葬则蚤贼赠 葬皂燥灶早 员猿猿 则蚤糟藻
子身份证和指纹图谱等遥
圆郾 远郾 圆摇 品种分子身份证查询功能摇 输入品种 源愿 位分
子身份证袁系统提示具该身份证的品种是否在库袁同时
给出相似度最高的 缘 个品种遥 如果输入受检新品种的
系统检测资料渊按国标推荐的引物和方法冤袁可自动生
成其相应的 源愿 位分子身份证袁并提示该品种是否在
库袁同时给出与其相似度最高的 缘 个品种遥
圆郾 远郾 猿摇 两品种间相似率查询和身份证核对功能摇 输
入 圆 个在库品种名称袁可查询品种间分子身份证相似
率或进行品种分子身份证核对遥
远缘愿
摇 远 期 杂交水稻亲本分子身份证及 杂杂砸指纹数据库的建立
图 圆摇 部分标记引物扩增多态性片段梯度图
云蚤早援 圆摇 郧则葬凿蚤藻灶贼 燥枣 杂杂砸 葬皂责造蚤枣蚤糟葬贼蚤燥灶
表 圆摇 员猿猿 份水稻材料的分子身份证
栽葬遭造藻 圆摇 酝燥造藻糟怎造葬则 陨阅 燥枣 员猿猿 则蚤糟藻 增藻则蚤贼赠
品种 增葬则蚤藻贼赠 类型鄢贼赠责藻鄢 分子身份证 皂燥造藻糟怎造葬则 陨阅
陨陨 原 猿圆粤 粤 远源员苑 圆远苑苑 圆源圆圆 员缘源源 缘圆源圆 员猿猿员 苑猿圆缘 源苑员愿 缘圆猿猿 猿苑猿员 圆源员缘 员苑圆圆
博 粤 月燥 粤 粤 远缘苑苑 圆远苑苑 圆源圆圆 员缘苑源 缘圆源源 员猿猿员 苑猿圆源 源圆猿怨 猿缘猿员 猿苑苑源 圆源员圆 苑缘圆圆
珞红 猿粤 蕴怎燥澡燥灶早 猿粤 粤 圆圆苑苑 圆远猿猿 圆源圆圆 员缘源圆 缘圆源源 员猿猿员 苑缘圆缘 源苑猿愿 猿缘员圆 猿苑苑员 猿源圆圆 苑猿圆圆
川香 圆怨粤 悦澡怎葬灶曾蚤葬灶早 圆怨粤 粤 圆源员苑 圆远苑苑 圆远圆员 员圆源源 源圆源源 员猿猿员 苑猿圆缘 源苑员愿 猿圆猿猿 猿苑苑员 圆源圆缘 苑圆圆员
冈 源远粤 郧葬灶早 源远粤 粤 远源员源 圆远苑苑 员源圆圆 员缘源源 源圆源源 员猿源员 苑猿圆缘 源圆员愿 缘远猿员 源苑猿源 猿源员缘 远苑圆圆
金 圆猿粤 允蚤灶 圆猿粤 粤 愿源缘源 圆远苑苑 员源圆员 员圆愿苑 源圆源源 员猿猿员 苑猿圆缘 源圆员愿 源远猿员 源苑猿员 猿源圆圆 苑怨圆员
秋 粤 匝蚤怎 粤 粤 猿源员源 圆远圆猿 员源圆圆 员圆源远 缘圆源源 员圆源员 苑猿圆远 源苑猿愿 猿远员员猿粤苑员 员源圆缘 远员员圆
龙特浦 蕴燥灶早贼藻责怎 粤 愿猿员苑 圆远圆猿 员源愿圆 圆缘源苑 缘圆源源 员员猿员 苑员圆缘 源苑员愿 猿缘猿员猿粤猿源 猿远员圆 远怨圆圆
天丰 粤 栽蚤葬灶枣藻灶早粤 粤 远源苑苑 圆远圆远 圆远圆圆 员缘源源 源圆员源 员员猿员 苑猿圆缘 源圆员愿 缘圆猿圆 猿圆圆员 员源员缘 员远圆圆
五丰 粤 宰怎枣藻灶早 粤 粤 远源苑苑 圆远圆远 圆远圆圆 员缘源源 源圆员员 员员猿员 猿猿圆缘 源圆员愿 缘圆猿圆 猿圆圆员 员源员缘 员远圆圆
珍汕 怨苑粤 在澡藻灶早泽澡葬灶 怨苑粤 粤 远源员苑 圆远苑苑 员源圆圆 员缘源源 缘圆源源 员圆猿员 苑猿圆源 源圆员愿 缘猿猿猿 源苑猿员 圆源员缘 员远圆员
猿缘员粤 粤 圆源苑源 圆圆苑苑 员源圆员 员缘源圆 源圆源源 员圆圆圆 苑员圆缘 源苑员愿 猿缘猿员 源苑苑员 猿源员缘 苑远圆员
协青早 粤 载蚤藻择蚤灶早扎葬燥早粤 粤 圆源苑苑 圆远苑远 圆远缘圆 员圆源圆 缘圆员源 员员源员 苑猿圆缘 源苑员愿 源远猿员 猿苑猿源 圆远圆缘 苑远圆圆
运员苑粤 粤 苑源缘缘 圆猿苑猿 圆远苑员 员苑缘远 猿源圆缘 员源愿员 愿猿圆猿 源源员月 缘远缘员 源猿猿圆 缘源员圆 愿怨圆员
泸香 远员愿粤 蕴怎曾蚤葬灶早远员愿粤 粤 远源苑远 圆远圆猿 员源圆圆 员缘源源 缘圆源源 员员猿员 源员圆员 源圆猿愿 猿缘员员猿粤远员 猿源员圆 苑猿圆员
圆猿园员杂 月 圆源苑源 圆远苑猿 员源缘员 源缘苑源 圆圆源源 圆源远员 苑员圆缘 源苑源愿 猿缘愿员猿苑苑员 粤圆圆圆 苑猿圆圆
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矮占 源猿杂 粤蚤扎澡葬灶 源猿杂 月 远圆苑源 员远苑猿 圆苑圆员 员圆源圆 圆圆源源 圆猿愿员 猿猿圆缘 源缘圆愿 猿缘远圆 猿猿圆员 月源圆圆 远远圆员
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品种 增葬则蚤藻贼赠 类型鄢贼赠责藻鄢 分子身份证 皂燥造藻糟怎造葬则 陨阅
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四喜占 杂蚤曾蚤扎澡葬灶 悦 圆源苑缘 员缘圆猿 员源圆圆 员圆苑猿 缘圆源苑 员源猿员 源员圆员 圆缘源愿 猿缘员员 猿苑苑员 月源员圆 苑怨圆圆
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皖稻 苑苑 宰葬灶凿葬燥苑苑 悦 圆缘苑苑 员缘苑远 员源缘圆 员圆苑圆 圆员源苑 圆源猿员 源员圆缘 圆缘圆远 猿缘源员 猿苑苑员 猿源圆圆 苑源圆圆
中籼 圆缘园猿 在澡燥灶早曾蚤葬灶 圆缘园猿 悦 圆源员苑 源远缘苑 员源圆圆 缘圆苑圆 猿圆猿源 圆缘苑员 源猿圆缘 员苑缘圆 猿缘缘猿猿粤缘圆 缘缘圆缘 猿怨圆缘
中籼 猿缘圆 在澡燥灶早曾蚤葬灶猿缘圆 悦 圆源苑缘 员缘苑远 员源圆圆 员圆苑圆 缘圆源源 圆源猿员 源员圆员 圆缘猿愿 猿缘愿员猿粤猿圆 月源圆缘 苑猿圆圆
镇籼 怨远 在澡藻灶曾蚤葬灶怨远 悦 圆源苑缘 猿缘苑远 员源圆圆 员圆苑圆 缘圆源圆 员员猿员 愿员圆缘 圆缘员愿 猿缘员员 猿苑猿员 猿源圆圆 苑源圆圆
扬辐糯 源 号 再葬灶早枣怎灶怎燥 源 悦 圆缘苑苑 圆远圆苑 猿源圆圆 员圆苑圆 圆圆远圆 圆员猿员 愿员圆员 圆缘猿愿 猿远员圆 猿月苑源 月源圆圆 苑苑圆圆
中早 圆圆 在澡燥灶早扎葬燥圆圆 悦 圆源缘缘 圆猿源苑 员源圆圆 员圆源远 缘圆源源 员员远员 苑员圆远 源圆源远 猿缘员员 猿月猿员 猿源圆缘 源圆圆圆
泰国籼 栽葬蚤早怎燥曾蚤葬灶 悦 圆源苑苑 圆远圆苑 员苑愿圆 员缘源圆 缘圆源苑 员源源员 苑员圆缘 圆缘源愿 猿远员员猿粤苑员 月源圆员 苑怨圆圆
中香 远 号 在澡燥灶早曾蚤葬灶早远 悦 圆源苑苑 圆远圆缘 猿源缘圆 员圆源圆 缘圆圆苑 圆圆猿员 苑员圆缘 源缘源愿 猿缘愿员 猿苑猿员 员源圆圆 苑猿圆圆
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宜恢 员缘苑苑 再蚤澡怎蚤员缘苑苑 悦 圆缘苑缘 猿远圆猿 员源缘圆 员圆源源 缘圆源源 圆圆猿员 苑员圆缘 源缘缘愿 猿缘愿员 猿月苑圆 猿源圆缘 苑苑圆圆
愿园 原 源粤 阅 远缘员源 缘圆苑苑 员圆缘源 源猿源源 圆猿源猿 圆缘猿圆 源猿猿远 员源苑源 怨源远源 猿阅源缘 缘缘猿猿 源远源缘
怨圆园员粤 阅 愿圆员猿 缘圆苑苑 员圆缘源 源猿缘源 圆猿源猿 圆员猿圆 源猿猿远 圆源苑源 怨源远源 猿阅源员 圆缘猿猿 缘苑源缘
双九 粤 杂澡怎葬灶早躁蚤怎粤 阅 远圆员远 圆源苑苑 员圆源源 源圆源缘 圆圆猿源 圆缘远员猿圆猿粤 员苑猿源 缘猿远猿 源阅缘苑 苑缘圆缘 猿愿猿缘
圆缘粤 阅 缘圆员猿 缘圆远苑 员圆缘源 源猿苑源 圆猿源源 圆员猿圆 猿猿源猿 圆猿愿圆 怨圆远猿 猿怨源缘 源缘猿缘 源苑源缘
宰粤 阅 远圆员源 缘缘远苑 员源缘源 源猿源源 愿猿源猿 圆缘猿圆 远猿源远 圆猿愿猿 怨圆远源 猿怨苑缘 远缘猿缘 缘苑源缘
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源员愿猿 云 圆圆苑苑 源员苑猿 圆苑圆源 圆员苑缘 圆圆猿源 圆源愿员 源猿猿缘 圆缘源愿 缘猿缘猿 猿怨远苑 猿源圆圆 苑怨猿缘
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广恢 员园圆 原 猿猿远 郧怎葬灶早澡怎蚤员园圆 原 猿猿远 云 圆员员猿 缘缘苑猿 猿苑缘源 源圆苑员 远猿源源 员员猿圆 圆猿圆远圆员员粤 圆源员源 猿怨圆员 猿源圆缘 缘苑猿员
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凡 苑 云葬灶苑 云 远圆员苑 缘员缘猿 员圆缘源 源缘源源 苑猿源源 员缘猿圆 圆猿圆圆员猿苑猿 粤源愿源 猿怨源员 猿源缘缘 源苑源缘
砸怨员愿 云 圆怨苑猿 员远缘苑 员源猿圆 员圆苑源 远猿圆圆 圆员愿员 员员圆远源员员粤 苑源怨源 员愿苑圆 愿源猿圆 愿猿源缘
砸怨员缘怨 云 圆愿苑猿 缘缘缘猿 员源猿猿 源圆缘缘 远猿员圆 圆员猿圆 圆猿源愿 圆员苑猿 苑源远源 猿怨源源 猿源圆缘 缘苑源缘
匀园圆 云 缘圆员源 缘圆远苑 员圆缘源 源猿源缘 远猿源源 员缘源圆 圆猿猿缘 圆猿员猿 远圆远源 猿怨源缘 圆远猿源 源苑源缘
皖恢 怨愿 宰葬灶澡怎蚤怨愿 云 圆缘员远 圆远苑苑 员源远圆 源猿苑员 远员源愿 员员猿圆 圆猿圆远 圆员员远 怨源员源 圆愿苑员 员源圆圆 愿猿源缘
悦源员愿 云 圆圆员猿 缘缘缘源 员源缘猿 源猿苑源 远猿源猿 圆缘猿圆 圆猿源愿 猿员员员 怨源远源 员怨苑源 猿源圆缘 缘苑源缘
匀孕员圆员 云 缘圆圆缘 缘圆苑苑 员缘缘源 源源源源 愿猿远猿 圆缘猿圆 源猿员缘 圆猿员愿 怨源怨源员悦猿猿 猿源猿猿 缘苑源缘
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制 员 在澡蚤员 云 远圆员猿 缘远苑苑 员源缘源 源猿苑源 圆圆源源 圆员猿圆 圆猿源愿圆猿远粤 怨源远猿 猿怨源员 猿源源缘 怨愿源缘
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酝猿员员圆 云 愿苑猿猿 缘圆苑苑 员猿缘源 源远苑源 圆猿源猿 圆缘猿圆 圆猿猿远 猿猿苑源 远圆远猿 猿阅缘缘 缘缘猿猿 源远源缘
新 员圆员 载蚤灶员圆员 云 缘圆圆缘 缘圆苑苑 员缘缘源 源源源源 愿猿远猿 圆缘猿圆 远猿员缘 圆猿苑猿 怨源怨猿员悦猿猿 苑源猿缘 缘愿源缘
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注院 粤院籼型三系不育系曰月院籼型两系不育系曰悦院籼型恢复系曰阅院粳型三系不育系曰耘院 粳型两系不育系曰云院粳型恢复系遥
晕燥贼藻院粤院摇 悦酝杂 燥枣 陨灶凿蚤糟葬曰 月院 孕酝杂 辕 栽酝杂 燥枣 陨灶凿蚤糟葬曰 悦院 砸藻泽贼燥则藻 造蚤灶藻 燥枣 陨灶凿蚤糟葬曰 阅院 悦酝杂 燥枣 允葬责燥灶蚤糟葬曰 耘院 孕酝杂 辕 栽酝杂 燥枣 允葬责燥灶蚤糟葬曰 云院 砸藻泽贼燥则藻 造蚤灶藻 燥枣 允葬责燥灶蚤糟葬
怨缘愿
核摇 农摇 学摇 报 圆远 卷
图 猿摇 域 原猿圆粤的指纹图谱
云蚤早援 猿摇 云蚤灶早藻则责则蚤灶贼 燥枣 域 原猿圆粤
摇 摇 本研究构建的杂交水稻亲本指纹数据库可用于水
稻品种真实性和纯度的分子鉴定院通过将受检亲本样
品与标准亲本的指纹图谱比对袁进行杂交水稻亲本的
真实性鉴定遥 将本数据库不育系与恢复系的分子身份
证相加袁可推导出其组合的理论杂交稻分子身份证曰同
理袁通过杂交稻组合中的杂合带型与其任一亲本的分
子身份证相减袁可得到另一亲本的分子身份证袁通过指
纹图谱比对袁即可进行水稻杂交种纯度尧真实性及亲子
鉴定遥 另外袁通过不同亲本品种间的指纹图谱分析与
比较袁了解其遗传相似性袁可为杂交稻新组合的选育提
供亲本选配的参考遥
猿摇 讨论
农作物品种分子身份证不仅要区分品种袁而且要
求非常高的可重复性和简便性遥 由于 杂杂砸 标记方法
具有操作简便快捷尧多态性高和稳定性好等特性袁非常
适合于构建农作物品种分子身份证遥 本研究利用 源愿
对核心标记袁对 员猿猿 份水稻亲本材料进行遗传多样性
分析袁聚类结果较好地反映了品种间的亲缘关系袁籼稻
与粳稻聚类于不同的类群袁品种间有较大的遗传差异曰
不育系与恢复系渊常规品种冤又聚类于不同的亚群袁品
种间表现了较小的遗传差异袁这与前人的研究结果相
一致咱员圆袁员怨 耀 圆圆暂 袁说明选用的 源愿 对核心标记对水稻亲本
具较好的区分能力袁利用这 源愿 对标记构建指纹数据库
是科学尧可靠的袁也是国内外位数最多的分子指纹数据
库咱员猿袁员源暂 袁另外袁源愿 个标记来源于国家技术标准袁构建的
分子身份证和数据库袁具有更高的通用性遥 该数据库
的建成袁将为水稻种子质量检测尧品种权管理提供科
学尧有效的技术支撑袁为水稻品种选育等提供一定的参
考遥
本研究建立的指纹数据库袁是依据杂交水稻亲本
材料的 杂杂砸扩增产物在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
基础上获得的袁引物扩增产物等位分子量梯度主要依
靠人工比对获得遥 随着分析检测技术的进步和普及袁
杂杂砸扩增产物的片段大小可以借助基因分析仪进行直
接读取咱愿袁怨暂 袁从而构建出更为精确的指纹数据库遥 此
外袁随着新品种的不断涌现袁需要不断增加数据库中的
品种数量袁从而使数据库及时更新袁以满足实际需要遥
利用 杂杂砸 标记构建品种分子身份证虽有诸多优
点袁但也不乏缺点遥 首先袁对于近等基因系或代换系品
种等亲缘关系非常近的种质难以区分遥 近年来袁育种
实践中少量骨干亲本的重复使用袁使遗传同质化日益
严重袁加剧了这一情况曰其次袁品种是育种工作的产物袁
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是农业生产资料袁具有商品属性咱圆猿暂 袁单纯遗传学意义
的分子身份证并不能完全表示一个品种包含的所有信
息袁应结合其重要的商品学尧社会学属性袁构建更加完
备的品种分子身份证袁从而更加准确定位尧描述一个品
种遥
致谢院本研究的水稻材料收集过程中袁得到了相关育种
单位和专家的大力支持袁在此一并致谢遥
参考文献院
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咱 愿 暂 摇 王凤格袁赵久然袁戴景瑞袁郭景伦袁原亚萍袁王 璐袁易红梅袁孙世
贤袁吕 波援玉米品种 阅晕粤指纹数据库构建的标准化规范咱 允暂 援分
子植物育种袁圆园园苑袁缘渊员冤院员圆愿 原 员猿圆
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王摇 璐援我国玉米 阅晕粤指纹数据库管理系统的建立咱允暂 援玉米科
学袁圆园员园袁员愿渊圆冤院源员 原 源源袁源怨
咱员园暂摇 李进波袁方宣均袁杨国才袁费震江袁戚华雄援 两系杂交稻亲本 杂杂砸
指纹图谱的建立及其在种子纯度鉴定中的应用咱 允暂 援 杂交水稻袁
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咱员员暂摇 肖小余袁王玉平袁张建勇袁李仕贵袁荣廷昭援 四川主要杂交稻亲本
的 杂杂砸多态性分析和指纹图谱的构建与应用咱 允暂 援 中国水稻科
学袁圆园园远袁圆园渊员冤院员 原 苑
咱员圆暂摇 庄杰云袁施勇峰袁应杰政袁鄂志国袁曾瑞珍袁陈 洁袁朱智伟援中国主
栽水稻品种微卫星标记数据库的初步构建咱 允暂 援 中国水稻科学袁
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咱员猿暂摇 张 彦袁郭士伟袁何 冰袁高东迎援 利用 杂杂砸标记建立杂交水稻分子
指纹图谱数据库咱允暂 援江苏农业学报袁圆园园远袁圆圆渊圆冤院员愿员 原 员愿猿
咱员源暂摇 程本义袁吴 伟袁夏俊辉袁刘 鑫袁庄杰云袁杨仕华援 浙江省水稻品种
阅晕粤指纹数据库的初步构建及其应用 咱 允暂 援 浙江农业学报袁
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咱员缘暂摇 颜静宛袁田大刚袁许 彦袁王 锋援杂交稻主要亲本的 杂杂砸 分子身份
证数据库的构建咱允暂 援福建农业学报袁 圆远渊圆冤院员源愿 原 员缘圆袁圆园员员
咱员远暂摇 杨剑波袁姚 剑袁陆徐忠袁倪金龙袁张 萍袁陈雪娇袁郑海松袁从夕汉袁
刘海珍袁张小娟袁马 琳援 两系水稻品种真实性与纯度鉴定 阅晕粤
分析法渊报批稿冤咱杂暂援国家质量监督检验检疫总局
咱员苑暂摇 杨剑波袁赵 伟袁陈 萍袁李 莉袁汪秀峰袁宋丰顺袁宣 云袁张士胜袁易成
新袁孔令传袁盛海平袁王春生袁向太和援 三系杂交水稻及亲本真实
性和品种纯度鉴定 阅晕粤 分析方法渊郧月 辕 栽圆园猿怨远 原 圆园园远冤咱杂暂援 国
家质量监督检验检疫总局袁圆园园远
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缘远 个杂交水稻骨干亲本 杂杂砸 指纹图谱的构建及遗传相似性分
析咱允暂 援生物学杂志袁圆园员园袁圆苑渊员冤院愿苑 原 怨员
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杂杂砸标记分析部分粳稻品种的遗传多样性咱 允暂 援核农学报袁圆园园苑袁
圆员渊猿冤院圆员苑 原 圆圆园
咱圆园暂摇 华摇 蕾袁袁筱萍袁余汉勇袁王一平袁徐 摇 群袁汤圣祥袁魏兴华援 我国
水稻主栽品种 杂杂砸多样性的比较分析咱允暂 援中国水稻科学袁圆园园苑袁
圆员渊圆冤院员缘园 原 员缘源
咱圆员暂摇 程本义袁夏俊辉袁沈伟峰袁庄杰云袁杨仕华援 微卫星标记分析我国
南方常规水稻品种的遗传差异咱允暂 援核农学报袁圆园园怨袁圆猿渊员冤院苑 原
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咱圆圆暂摇 李红宇袁张龙海袁刘梦红袁司 洋袁王海泽袁徐正进袁赵明辉袁徐 海袁
王嘉宇援东北地区水稻品种与日本引进北地区水稻品种遗传多
样性比较咱允暂 援核农学报袁圆园员员袁圆缘渊远冤院员园愿圆 原 员园愿苑
咱圆猿暂摇 盖树鹏袁王日新袁黄进勇援 山东省玉米骨干自交系和杂交种的
杂杂砸指纹图谱构建咱允暂 援中国农学通报袁圆园员员袁圆苑渊圆源冤院源园 原 源源
渊责任编辑摇 王媛媛冤
员远愿