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Genetic Diversity Analysis of Salvia Miltiorrhiza Bge from Different Habitats by EST-SSR Markers

EST-SSR分析不同产地丹参的遗传多样性



全 文 :摇 核 农 学 报摇 圆园员源袁圆愿渊圆冤院园员怨猿 耀 园员怨怨允燥怎则灶葬造 燥枣 晕怎糟造藻葬则 粤早则蚤糟怎造贼怎则葬造 杂糟蚤藻灶糟藻泽
收稿日期院圆园员猿鄄园猿鄄园愿摇 接受日期院圆园员猿鄄园远鄄圆苑
基金项目院国家自然科学基金 渊愿员园园员远园猿袁愿员圆苑源园员圆冤袁山东省自然基金渊在砸圆园员员匀匝园园苑冤
作者简介院宋振巧袁女袁副教授袁主要从事药用植物遗传育种与生物技术应用研究遥 耘鄄皂葬蚤造院泽扎择泽凿葬怎岳 员远猿援 糟燥皂
通讯作者院王建华袁男袁教授袁主要从事中药资源与开发研究遥 耘鄄皂葬蚤造院泽凿葬怎憎葬灶早躁澡岳 赠葬澡燥燥援 糟灶
文章编号院员园园园鄄愿缘缘员渊圆园员源冤园圆鄄园员怨猿鄄园苑
耘杂栽鄄杂杂砸分析不同产地丹参的遗传多样性
宋振巧员袁圆 摇 王建华员袁圆 摇 陈为序员 摇 朱海玥员
渊员 山东农业大学农学院袁山东 泰安摇 圆苑员园员愿曰圆 作物生物学国家重点实验室袁山东 泰安摇 圆苑员园员愿冤
摘摇 要院对来源于陕西商洛尧河南内乡尧四川中江尧山东泰安 源 个产地共 愿园 个丹参株系种质资源进行
耘杂栽鄄杂杂砸分析袁旨在探讨栽培丹参资源的多样性水平和产地间的遗传分化程度遥 结果表明袁栽培丹参
晕藻蚤基因多样度为 园郾 圆圆源缘袁揭示出具有丰富的遗传多样性袁且各产地丹参遗传分化程度低袁遗传变异主
要存在于产地内部曰源 个产地相比较袁四川产地明显较低遥 哉孕郧酝粤聚类分析结果表明袁山东产丹参是相
对独立的群体袁但 源 个产地来源丹参的遗传距离与地理距离相关性未达到显著水平遥 栽培丹参具有较
高的多样性以及产地间遗传分化程度较低袁其异花授粉习性和产地内采用种子有性繁殖方式以及稍加
人为选择的生产方法可能是其栽培丹参多样性高和产地间分化低的主要原因遥
关键词院丹参曰遗传多样性曰耘杂栽鄄杂杂砸
阅韵陨院员园援 员员愿远怨 辕 躁援 蚤泽泽灶援 员园园鄄愿缘缘员郾 圆园员源郾 园圆援 园员怨猿
摇 摇 丹参为唇形科鼠尾草属多年生草本植物丹参
渊杂葬造增蚤葬 皂蚤造贼蚤燥则则澡蚤扎葬 月早藻冤的根及根茎咱员暂 袁在我国已有
圆园园园多年的临床应用历史遥 由于丹参对心血管疾病的
显著疗效和其它广泛的药理活性咱圆暂 袁药用量巨大袁 年需
求量超过 圆万多吨袁丹参类药物的年销售额超过 员园 亿
元袁丹参是我国十大常用大宗药材之一咱猿暂 遥 随着使用量
的逐年增加袁丹参野生资源的数量逐年减少袁栽培面积
逐年增大袁中药丹参主要依赖于栽培品遥 目前丹参的种
植主要集中于陕西尧山东尧河南尧河北尧四川等省袁其中陕
西商洛尧四川中江尧河南内乡尧山东日照尧山东泰安等市
县已经成为我国丹参的主要产地咱源暂 遥 在多数产区主要
利用当地野生资源驯化栽培袁并长期通过种子繁殖方式
栽植袁以此方式保存种质资源袁但少数地区如四川中江
因种子量少袁主要采用根段无性繁殖的方式保存着当地
的主要资源袁丹参栽培产地的繁殖方式和种植方式是否
影响其资源多样性的保存袁在野生资源减少和优良品种
缺少的情况下袁栽培丹参的遗传多样性水平和不同地区
间的遗传差异研究十分必要袁该研究也可为当地资源的
开发尧利用和保护等策略等提供参考遥
近年来袁分子标记技术发展迅速袁已被广泛应用于
植物遗传多样性分析尧基因定位与克隆等诸多方面遥
目前用于丹参种质资源研究的 阅晕粤 标记已有不少报
道袁主要为 砸粤孕阅尧粤云蕴孕尧陨杂杂砸尧杂砸粤孕 和 陨栽杂咱缘 原 员圆暂 遥 这
些分子标记在丹参上的广泛使用为了解丹参资源的遗
传特点奠定了重要基础遥 但它们在操作难易尧结果可
靠性等方面却存在着很大差异遥 近年来袁从表达序列
标签渊耘杂栽冤查找微卫星渊杂杂砸冤设计获得的 耘杂栽鄄杂杂砸 标
记在作物遗传图谱构建尧基因定位与克隆尧遗传多样性
分析尧分子标记辅助选择等方面得到广泛应用咱员猿 原 员苑暂 遥
在药用植物领域的应用才刚刚起步遥 在 晕悦月陨 的公共
数据库中具有上万条的丹参 耘杂栽 序列袁这为丹参共显
性分子标记 耘杂栽鄄杂杂砸 的设计提供了良好的条件咱员愿暂 遥
研究发现袁丹参 耘杂栽鄄杂杂砸 的出现频率高咱员怨暂 袁邓科军
等咱圆园暂利用已有的丹参 耘杂栽设计开发了 愿猿 对 耘杂栽鄄杂杂砸
引物袁而且有效用于区分丹参及其他同属植物袁但在丹
参栽培资源中的利用研究还少有报道袁本文将运用
耘杂栽鄄杂杂砸标记对不同产地的栽培丹参资源进行遗传多
样性评价袁旨在分析各地栽培丹参的多样性水平和不
同产地间的遗传距离袁以及种植方式对多样性的影响袁
该研究可为丹参资源的收集保存尧开发利用等奠定基
础袁对解决当前丹参种质资源混杂和指导丹参品种选
育具有重要的意义遥
猿怨员
核摇 农摇 学摇 报 圆愿 卷
员摇 材料与方法
员郾 员摇 材料
本试验所用的材料包括陕西商洛渊员园怨毅怨园忆猿猿义耘袁
猿猿毅愿园忆晕冤尧河南内乡渊员员员毅愿猿忆猿猿义耘袁 猿猿毅园缘忆猿猿义晕冤尧四川
中江渊员园源毅远愿忆猿猿义耘袁猿员毅园远忆远苑义晕冤尧山东泰安渊员员苑毅员猿忆
猿猿义耘袁猿远毅员愿忆猿猿义晕冤源 个产地共 愿园 个株系为试料遥 材料
种植于山东农业大学药用植物园遥 每个材料取适量幼
嫩叶片渊约 员 耀 圆 片冤袁低温下带回实验室袁冷冻于 原
圆园益冰箱中备用遥
表 员摇 耘杂栽鄄杂杂砸上尧下引物序列
栽葬遭造藻 员摇 云燥则憎葬则凿 责则蚤皂藻则泽 葬灶凿 则藻增藻则泽藻 责则蚤皂藻则泽 怎泽藻凿 蚤灶 耘杂栽鄄杂杂砸 泽贼怎凿赠
编号 晕燥援 上游引物 云燥则憎葬则凿 责则蚤皂藻则摇 摇 摇 摇 下游引物 砸藻增藻则泽藻 责则蚤皂藻则摇 摇
阅杂园园员 郧粤郧郧悦栽粤悦栽栽悦郧栽郧郧粤郧郧 郧粤粤粤悦栽粤粤粤郧悦粤粤悦粤粤粤悦悦悦
阅杂园园圆 悦悦郧栽郧郧栽郧栽栽悦悦悦栽悦栽栽栽 栽郧悦悦郧粤栽栽悦栽粤粤悦悦栽郧栽粤栽郧
阅杂园园猿 粤郧粤郧郧悦栽郧悦栽郧悦栽栽悦粤栽栽 栽悦粤粤郧栽悦粤栽粤郧郧悦郧栽郧郧悦
阅杂园园源 粤郧郧悦粤郧粤悦粤郧粤悦悦栽悦粤栽粤 悦栽栽悦悦悦粤悦悦粤粤粤栽粤粤悦栽悦
阅杂园园缘 悦栽悦粤郧悦粤悦悦栽粤悦栽粤悦悦粤悦粤栽 悦栽栽粤栽悦悦悦粤粤悦粤悦栽栽悦栽栽悦栽
阅杂园园远 粤粤粤悦粤郧粤郧悦郧粤悦郧粤粤郧悦粤郧 悦粤悦悦粤悦悦粤栽悦粤悦栽悦粤粤郧粤悦郧
阅杂园园苑 悦栽悦悦郧悦栽栽悦郧悦栽悦悦栽悦栽栽 栽郧悦栽悦郧悦栽栽悦郧栽悦郧栽悦栽栽
阅杂园园愿 粤郧郧栽栽粤悦栽粤悦悦郧粤栽郧粤粤郧悦粤郧 粤郧栽栽郧粤郧栽郧郧栽郧粤栽郧郧粤粤郧粤栽
阅杂园园怨 郧粤悦栽栽栽郧郧粤栽郧悦悦栽郧悦栽悦 郧粤悦郧悦悦郧悦栽粤悦栽栽栽悦栽粤栽
阅杂园员园 粤粤栽粤粤郧郧悦粤粤栽粤悦粤郧郧郧栽悦 悦栽栽栽粤悦粤悦郧悦粤栽粤粤悦粤悦郧
阅杂园员员 粤粤悦栽栽郧郧悦粤粤栽郧栽栽悦郧悦栽粤栽 郧悦栽栽郧栽栽悦栽栽郧粤悦粤郧郧悦栽栽悦
阅杂园员圆 郧郧栽悦悦粤栽栽悦悦栽悦栽栽粤栽栽栽悦悦 郧悦悦粤栽悦粤粤郧栽郧郧栽悦郧栽悦栽
阅杂园员猿 悦粤郧栽悦悦粤粤悦粤郧悦悦悦郧粤悦悦粤郧 粤栽悦粤栽悦粤栽悦郧悦悦粤郧悦粤栽悦悦悦
员郾 圆摇 方法
员郾 圆郾 员摇 阅晕粤 的提取 摇 基因组 阅晕粤 的提取与纯化参
照文献咱圆员暂的 悦栽粤月方法并稍加改进遥
员郾 圆郾 圆摇 耘杂栽鄄杂杂砸扩增摇 根据参考文献咱员怨暂设计 员猿 对
耘杂栽鄄杂杂砸引物袁由上海生工生物工程有限公司合成渊表
员冤遥 扩增反应在 月陨韵鄄砸粤阅 型基因扩增仪上进行遥 丹
参的 耘杂栽鄄杂杂砸 孕悦砸 反应优化体系如下院在总体积
圆缘滋蕴 的反应体系中袁 凿凿匀圆韵 员缘郾 愿滋蕴曰 员园 伊 月怎枣枣藻则
圆郾 缘滋蕴曰酝早圆 垣 渊圆缘皂皂燥造窑蕴 原员冤圆滋蕴曰凿晕栽孕渊圆郾 缘皂皂燥造窑蕴 原员冤
圆滋蕴曰栽葬择耘渊缘哉窑滋蕴 原员 冤园郾 圆滋蕴曰上下游引物渊圆郾 缘皂皂燥造窑
蕴 原员冤各 园郾 苑缘滋蕴曰阅晕粤渊猿园灶早窑滋蕴 原员 冤员滋蕴遥 孕悦砸 扩增程
序为院怨源益预变性 苑皂蚤灶曰怨源益变性 猿园泽袁缘猿益退火 源缘泽袁
苑圆益延伸 远园泽袁源园 个循环曰苑圆益延伸 苑皂蚤灶遥 员园益保存备
用遥 孕悦砸扩增产物中加入适量的溴酚兰渊灾 辕 灾 越 缘 颐
员冤袁混匀袁用 阅蕴圆园园园 阅晕粤 酝葬则噪藻则 作对照袁用 远 豫的聚
丙烯酰胺凝胶电泳遥 电泳条件院缘 伊 栽月耘 缓冲液和
员圆园灾的电压电泳分离袁采用硝酸银染色遥
员郾 圆郾 猿摇 数据分析 摇 在特定的 耘杂栽鄄杂杂砸 位点上袁测定
每一供试样品的等位位点组成遥 电泳资料采用 园尧员 二
维数据矩阵的方法录入电脑袁有带记录为 员袁无带记为
园遥 数据分析采用 晕栽杂再杂责糟 原 圆郾 员园藻渊耘曾藻贼藻则 杂燥枣贼憎葬则藻袁
杂藻贼葬怎噪藻贼袁 晕援 再援 冤尧孕韵孕郧耘晕耘 增藻则泽蚤燥灶 员郾 猿圆 软件遥 引物
多态性信息用多态性带数和多态性带数百分数估计遥
遗传多样性信息用 晕藻蚤基因多样度 匀 估计和 杂澡葬灶灶燥灶
信息指数 陨遥 产地间的遗传分化采用遗传分化系数 郧泽贼
和基因流 晕皂 越 渊员 原 郧泽贼冤 辕 圆郧泽贼来估算遥 根据 晕藻蚤 的遗
传距离 阅和遗传一致度 陨晕袁采用非加权算术平均聚类
法渊哉孕郧酝粤冤进行不同丹参产地的聚类分析遥 利用产
地间的 晕藻蚤遗传距离 阅和地理距离进行 酝葬灶贼藻造 贼藻泽贼 检
验两者之间的相关性遥 丹参株系聚类是根据 杂酝 相似
系数矩阵采用 哉孕郧酝粤聚类法进行的聚类分析遥
圆摇 结果与分析
圆郾 员摇 耘杂栽鄄杂杂砸 引物在丹参中的扩增多态性
从 员猿 对 耘杂栽鄄杂杂砸引物中选出 员园 对扩增产物多态
性好尧谱带清晰的引物袁利用选出的 员园 对引物对 愿园 个
丹参样本的基因组 阅晕粤进行扩增袁获得了较好的扩增
结果渊图 员袁表 圆冤遥
表 圆 显示不同的引物扩增的总带数明显不同袁员园
个引物扩增的总带数范围从 源 到 圆员 条不等袁其中
源怨员
摇 圆 期 耘杂栽鄄杂杂砸分析不同产地丹参的遗传多样性
阅杂园园员 引物扩增的多态性条带最多为 圆员 条袁阅杂园员园 引
物扩增的多态性条带数最少为 源 条袁平均扩增带数为
员圆郾 猿 条袁平均多态性带数为 员员郾 苑 条遥 多态位点百分
比在 怨圆郾 猿员豫 耀 员园园豫之间袁平均达到 怨远郾 员缘豫 遥 可见袁
利用 耘杂栽鄄杂杂砸可有效检测丹参种质资源遗传多样性遥
圆郾 圆摇 栽培丹参的遗传多样性和遗传分化
利用 孕韵孕郧耘晕耘 增藻则泽蚤燥灶 员郾 猿圆 软件对多样性分析数
据进行各项参数的统计分析袁结果见表 猿遥 表 猿 显示袁
栽培丹参种级水平多态性位点数目为 员员愿 个袁多态性
位点百分比达到 怨缘郾 员远 豫 袁晕藻蚤 基因多样度为 园郾 圆圆源缘袁
杂澡葬灶灶燥灶信息指数为 园郾 猿远员怨袁各项参数均高于各产地袁
显示出栽培丹参具有较为丰富的遗传多样性遥 四个栽
培产地相比较袁河南 晕藻蚤基因多样度渊园郾 圆员缘源冤最高袁其
次为山东 渊 园郾 圆员园园 冤袁 陕西 渊 园郾 员远苑猿 冤 略低袁 四川
渊园郾 员猿愿怨冤最低且明显低于上述三者遥 其它参数也显
示出相同的结果遥
利用 孕韵孕郧耘晕耘 增藻则泽蚤燥灶 员郾 猿圆 软件分析袁丹参栽培
群体遗传分化系数 郧泽贼 越园郾 员远缘猿袁表明产地间的遗传变
异占总变异的 员远郾 缘猿 豫 袁产地间的遗传距离较小袁大部
表 圆摇 员园 对 耘杂栽鄄杂杂砸引物的扩增多态性
栽葬遭造藻 圆摇 孕燥造赠皂燥则责澡蚤泽皂 燥枣 员园 耘杂栽鄄杂杂砸 责则蚤皂藻则泽
燥遭贼葬蚤灶藻凿 遭赠 泽藻造藻糟贼蚤增藻 葬皂责造蚤枣蚤糟葬贼蚤燥灶
引物名称
孕则蚤皂藻则 灶葬皂藻
总带数
栽燥贼葬造 葬皂责造蚤枣蚤藻凿
遭葬灶凿泽
多态性带数
栽澡藻 灶怎皂遭藻则
责燥造赠皂燥则责澡蚤糟
遭葬灶凿泽
多态性带
百分数
栽澡藻 责藻则糟藻灶贼葬早藻 燥枣
责燥造赠皂燥则责澡蚤糟 遭葬灶凿泽 辕 豫
阅杂园园员 圆圆 圆员 怨缘郾 源缘
阅杂园园圆 员园 员园 员园园
阅杂园园猿 员愿 员苑 怨源郾 源源
阅杂园园源 员远 员缘 怨猿郾 苑缘
阅杂园园缘 员源 员猿 怨圆郾 愿远
阅杂园园远 员圆 员员 怨员郾 远苑
阅杂园园苑 苑 苑 员园园
阅杂园园愿 员源 员猿 怨圆郾 猿员
阅杂园园怨 苑 苑 员园园
阅杂园员园 源 源 员园园
平均 粤增藻则葬早藻 员圆郾 猿园 员员郾 苑 怨远郾 员缘
注院泳道从左到右院酝院酝葬则噪藻则曰员 原 圆园院山东泰安丹参 员 原 圆园 号株系曰圆员 原 圆愿院陕西商洛丹参 员 原 愿 号遥
晕燥贼藻院栽澡藻 造葬灶藻泽 枣则燥皂 造藻枣贼 贼燥 则蚤早澡贼院 酝院 阅晕粤 酝葬则噪藻则曰 员 原 圆园院 杂澡葬灶凿燥灶早员 原 圆园曰 圆员 原 圆愿院 杂澡葬灶早造怎燥员 原 愿援
图 员摇 耘杂栽鄄杂杂砸引物 阅杂园园猿 对部分丹参的扩增图谱
云蚤早援 员摇 耘杂栽鄄杂杂砸 粤皂责造蚤枣蚤藻凿 则藻泽怎造贼 燥枣 杂葬造增蚤葬 皂蚤造贼蚤燥则则澡蚤扎葬 早藻灶燥皂藻 阅晕粤 遭赠 责则蚤皂藻则 阅杂园园猿
表 猿摇 不同丹参产地的遗传多样性
栽葬遭造藻 猿摇 郧藻灶藻贼蚤糟 凿蚤增藻则泽蚤贼赠 燥枣 杂葬造增蚤葬 皂蚤造贼蚤燥则则澡蚤扎葬 澡葬遭蚤贼葬贼泽
种群 匀葬遭蚤贼葬贼 样本数栽澡藻 灶怎皂遭藻则 燥枣 泽葬皂责造藻泽
多态性位点数目
栽澡藻 灶怎皂遭藻则 燥枣
责燥造赠皂燥则责澡蚤糟 造燥糟蚤
多态性位点百分比
栽澡藻 责藻则糟藻灶贼葬早藻 燥枣
责燥造赠皂燥则责澡蚤糟 造燥糟蚤 辕 豫
晕藻蚤基因多样度
晕藻蚤爷泽 早藻灶藻 凿蚤增藻则泽蚤贼赠
杂澡葬灶灶燥灶信息指数
杂澡葬灶灶燥灶爷泽
陨灶枣燥则皂葬贼蚤燥灶 蚤灶凿藻曾
四川 杂蚤糟澡怎葬灶 圆园 远员 源怨郾 员怨 园郾 员猿愿怨 园郾 圆员怨愿
陕西 杂澡葬灶曾蚤 圆园 苑怨 远猿郾 苑员 园郾 员远苑猿 园郾 圆远远远
河南 匀藻灶葬灶 圆园 怨苑 苑愿郾 圆猿 园郾 圆员缘源 园郾 猿源员苑
山东 杂澡葬灶凿燥灶早 圆园 怨园 苑圆郾 缘愿 园郾 圆员园园 园郾 猿圆远员
平均 粤增藻则葬早藻 圆园 愿员郾 苑缘 远缘郾 怨猿 园郾 员愿圆怨 园郾 圆愿愿远
种级水平 杂责藻糟蚤藻泽 造藻增藻造 愿园 员员愿 怨缘郾 员远 园郾 圆圆源缘 园郾 猿远员怨
缘怨员
核摇 农摇 学摇 报 圆愿 卷
分变异存在于产地内部袁占总变异的 愿猿郾 源苑 豫 遥 基因
流 晕皂 根据 郧泽贼计算为 圆郾 缘圆源愿遥
圆郾 猿摇 不同丹参产地间的遗传一致度和遗传距离
为了进一步分析群体间的遗传分化程度袁计算了
晕藻蚤的遗传一致度 陨晕和遗传距离 阅渊表 猿郾 猿冤袁群体的遗
传一致度在 园郾 怨源愿源 耀 园郾 怨怨园园 之间袁遗传距离在 园郾 园员园员
耀园郾 园缘猿园 之间袁平均为 园郾 园源缘圆苑袁进一步反映出丹参各
产地间的遗传相似程度较高袁遗传距离较小遥
表 源摇 丹参产地的 晕藻蚤遗传一致度和遗传距离的无偏估计
栽葬遭造藻 源摇 晕藻蚤爷泽 哉灶遭蚤葬泽藻凿 酝藻葬泽怎则藻泽 燥枣 郧藻灶藻贼蚤糟 陨凿藻灶贼蚤贼赠 葬灶凿
郧藻灶藻贼蚤糟 凿蚤泽贼葬灶糟藻 燥枣 杂葬造增蚤葬 皂蚤造贼蚤燥则则澡蚤扎葬 澡葬遭蚤贼葬贼泽
群体
孕燥责 陨阅
四川
杂蚤糟澡怎葬灶
陕西
杂澡葬葬灶曾蚤
河南
匀藻灶葬灶
山东
杂澡葬灶凿燥灶早
四川 杂蚤糟澡怎葬灶 鄢鄢鄢鄢 园郾 怨苑怨苑 园郾 怨远缘源 园郾 怨圆圆缘
陕西 杂澡葬葬灶曾蚤 园郾 园圆园缘 鄢鄢鄢鄢 园郾 怨怨园园 园郾 怨猿园源
河南 匀藻灶葬灶 园郾 园猿缘圆 园郾 园员园员 鄢鄢鄢鄢 园郾 怨源愿源
山东 杂澡葬灶凿燥灶早 园郾 园愿园苑 园郾 园苑圆员 园郾 园缘猿园 鄢鄢鄢鄢
摇 摇 注院对角线上方为 晕藻蚤遗传一致度袁对角线下方为 晕藻蚤遗传距离遥
晕燥贼藻院 晕藻蚤爷 泽 早藻灶藻贼蚤糟 蚤凿藻灶贼蚤贼赠 渊 怎责责藻则 贼则蚤葬灶早造藻冤 葬灶凿 早藻灶藻贼蚤糟 凿蚤泽贼葬灶糟藻
渊怎灶凿藻则 贼则蚤葬灶早造藻冤 援
摇 摇 采用 晕藻蚤遗传距离无偏估计法阐明产地之间的遗
传关系袁对得到的距离矩阵采用 哉孕郧酝粤 法进行聚类
分析袁得到树状图渊图 猿冤遥 该树状图显示陕西和河南
两大产地遗传距离最近渊阅 越 园郾 园员园员冤遥 其次是陕西与
四川的遗传距离为 园郾 园圆园缘袁河南与四川的遗传距离渊阅
越园郾 园猿缘圆冤较远遥 三产地可聚为一类袁而山东与其它 猿
个产地的距离最远袁是相对独立的群体遥 另外袁用丹参
产地间的 晕藻蚤 遗传距离与各产地的地理距离进行
酝藻灶贼葬造相关性分析袁相关系数为 则 越 园郾 愿源苑猿远 渊 孕 越
园郾 愿猿愿园袁灶 越远冤袁结果显示出两者相关性不显著遥
圆郾 源摇 栽培丹参不同株系的聚类图
使用 晕栽杂再杂责糟 原 圆郾 员园藻软件袁利用 哉孕郧酝粤 聚类法
对 愿园 个株系进行聚类分析袁结果见图 猿遥 在相似性为
园郾 苑园 左右处展开袁所有株系被分成 远 类袁泰安的 源 号
和河南 员愿 材料聚为第玉类袁泰安 员圆 号材料单独为第
域类袁河南 猿 号材料单独为第芋类袁第郁类中有 怨 个材
料包括 苑 个来自陕西商洛的材料和 圆 个来自河南的材
料曰第吁类包括 员圆 个材料即 员园 个来自河南材料和 圆
个来自陕西商洛材料袁剩余材料都聚在第遇类中遥 在
相似性为 园郾 苑圆 左右处袁可将第遇类材料分成 猿 个亚
类袁除泰安 圆 号材料单独一类外袁泰安另外 员猿 个材料
单独聚为一个亚类袁其它材料聚为另一亚类袁这一亚类
图 圆摇 利用 哉孕郧酝粤距离法根据 晕藻蚤遗传
距离对四个丹参产地聚类分析
云蚤早援 圆摇 阅藻灶凿则燥早则葬皂 燥遭贼葬蚤灶藻凿 遭赠 哉孕郧酝粤 糟造怎泽贼藻则
葬灶葬造赠泽蚤泽 遭葬泽藻凿 燥灶 凿葬贼葬 枣则燥皂 耘杂栽鄄杂杂砸 皂葬则噪藻则
涵盖了所有居群的不同材料袁如四川全部 圆园 个材料袁
以及 员员 个陕西商洛材料和 远 个河南丹参材料以及 源
个山东泰安材料袁可见陕西尧河南卢氏尧泰安者三个居
群多样性较丰富袁而且所有居群间存在基因交流遥
猿摇 讨论
猿郾 员摇 耘杂栽鄄杂杂砸技术在丹参种质资源研究中的应用
近年来各类分子标记在丹参的应用研究已有不少
报 道 渊 表 源 冤袁 如 砸粤孕阅咱缘暂 尧 粤云蕴孕咱苑暂 尧 陨杂杂砸咱愿暂 尧
杂砸粤孕咱怨 原 员园暂 尧悦燥砸粤孕咱员员暂等用于分析丹参种质资源的遗
传多样性袁如 悦燥砸粤孕标记在丹参中检测到多态性位点
百分比仅为 愿郾 愿豫 袁采用 砸粤孕阅 标记检测到的多态性
位点百分比为 圆园郾 怨豫 耀 缘缘豫 咱缘暂 袁李廷春等咱怨暂利用 猿远
对多态性 杂砸粤孕引物组合共产生 苑愿圆 条多态性条带袁
平均每个引物组合产生 圆员郾 苑 条多态性条带袁 多态性
条带比例达到 缘圆郾 远远豫 袁显示了较高的多态性袁王冰
等咱苑暂采用 粤云蕴孕分子标记检测到的多态性位点比例达
到 怨园郾 员缘豫 遥 耘杂栽鄄杂杂砸 标记技术袁作为一种新型分子
标记技术已在作物遗传多样性分析尧遗传图谱构建尧基
因定位与克隆尧分子标记辅助选择等诸多方面广泛应
用遥 本研究用 员园 个 耘杂栽鄄杂杂砸 引物对四个栽培产地的
丹参资源进行了多态性检测袁每个引物平均可扩增
员圆郾 猿 条袁多态位点占 怨圆郾 猿员 豫 耀 员园园 豫之间遥 与上述
其它标记的相比袁耘杂栽鄄杂杂砸 标记也具有较高的多态位
点百分比袁耘杂栽鄄杂杂砸在丹参资源材料的识别和区分上
表现出较高的分辨率袁在用于丹参种内分类尧鉴定尧多
样性分析等研究方面将具有更大的利用价值遥 另外
远怨员
摇 圆 期 耘杂栽鄄杂杂砸分析不同产地丹参的遗传多样性
图 猿摇 基于 耘杂栽鄄杂杂砸数据的栽培丹参 哉孕郧酝粤 聚类图
云蚤早援 猿摇 哉孕郧酝粤 凿藻灶凿则燥早则葬皂 怎泽蚤灶早 杂酝 泽造蚤皂蚤造赠 糟燥藻枣枣蚤糟蚤藻灶贼 遭葬泽藻凿 燥灶 耘杂栽鄄杂杂砸 凿葬贼藻 燥枣 杂援 皂蚤造贼蚤燥则则澡蚤扎葬 皂葬贼藻则蚤葬造泽
耘杂栽鄄杂杂砸标记是一种共显性标记袁可为丹参重要性状
标记和定位尧图谱构建等深入研究提供新的有效标记遥
猿郾 圆摇 栽培丹参的遗传多样性和遗传分化
丹参是我国传统的大宗药材袁但其野生资源被大
量挖掘而遭到破坏遥 虽然 圆园 世纪 苑园 年代后丹参人工
栽培技术迅速发展袁但野生资源的减少使丹参种质资
源的遗传多样性受到威胁遥 现在丹参药材来源主要依
靠栽培品种袁了解目前各栽培产区的丹参遗传多样性
是对丹参进行合理保护尧利用和遗传改良的基础遥 本
文研究表明栽培丹参资源的 匀泽 为 园郾 圆圆源缘袁表现出较
高的多样性水平遥 由于丹参具有异花授粉习性咱圆圆 原 圆猿暂 袁
天然异交率较高袁一般异交率高的植物其多样性丰
富咱圆源暂 曰丹参适应性强袁我国大部分省份分布丹参野生
资源袁目前在丹参的主要产地如陕西商洛尧河南内乡尧
山东日照尧山东泰安等市县主要利用当地野生资源驯
化栽培袁并长期通过种子繁殖方式栽植袁对其后代基本
不加以人工选择袁后代植株表现出丰富的多样性形态
特征袁因此人工驯化的丹参栽培群体仍保留着较为丰
富的多样性遥 但少数地区如四川中江因种子量少主要
采用根段无性繁殖的方式保存当地的主要资源遥 虽然
本文研究表明栽培丹参资源的多样性 匀泽 为 园郾 圆圆源缘袁
低于野生资源的遗传多样性 匀泽 为 园郾 圆远咱苑暂 袁但这可能
由于所用材料和试验方法不同所致遥 各产地的 晕藻蚤 基
因多样度反映出不同产地具有的遗传变异程度不同袁
河南和山东产地的遗传多样性略高于陕西产地袁四川
产地最低遥 近年来四川丹参的栽培面积逐渐扩大袁成
为丹参的重要产区袁当地丹参栽培技术比较成熟袁人为
选择压力较大袁导致其产地内遗传一致性较高袁多样性
较低遥 另外四川丹参主要利用根段进行无性繁殖袁这
也是四川丹参多样性较低一个重要原因遥
本文检测到各丹参产地间的遗传分化程度低渊郧泽贼
越 园郾 员远缘猿冤袁遗传变异主要在产地内部袁产地间差异较
苑怨员
核摇 农摇 学摇 报 圆愿 卷
小遥 结合田间植株性状和株系间的遗传聚类可以看
出袁四川丹参群体内各单株差异很小袁主要性状表现
为袁叶近圆形尧叶色深绿尧开花期较晚尧花枝较短等特征
特性遥 除了四川丹参较为整齐一致外袁其它产地内植
株性状差异较大袁反映在叶形尧叶片大小尧分支多少尧花
枝长短等方面袁陕西商洛和河南内乡两地丹参比较相
似袁山东丹参除了上述性状的差异外袁还发现在花色方
面具有紫色深浅尧花朵大小等方面的区别袁猿 个产地很
难发现其独特的特征特性袁三产地的丹参株系未能单
独聚为一类袁各产地间差异不明显遥 利用 砸粤孕阅 标记
研究丹参产地间的遗传关系袁反映出各产地间的遗传
差异很小袁遗传分化程度较低咱缘暂 袁与本研究结果一致遥
丹参产地间遗传分化低可能与其自然繁殖方式和栽培
方法有密切的关系袁由花粉或种子携带基因的繁殖方
式会导致植物种质间的基因流较高咱圆源暂 袁另外各地间相
互引种近年来也比较频繁袁也会导致各地间差异变小遥
本文采用 耘杂栽鄄杂杂砸 标记检测到 源 个产地来源丹
参的遗传距离与地理距离相关性未达到显著水平袁王
冰等咱苑暂对全国不同省间居群的聚类研究表明不同丹
参居群间遗传距离与空间距离之间的关系较为复杂遥
徐红等咱愿暂利用 陨杂杂砸引物认为 员员 个不同产地的丹参遗
传分化与地理关系没有表现出相关性遥 不同研究者所
得结论不同袁可能由于所采用的材料类型尧数量和研究
方法不同所致袁此内容还有待于深入分析遥
猿郾 猿摇 丹参种质资源研究有待深入
丹参染色体小袁基因组小袁基因组测序已经完成袁
具有重要的药用价值袁药理研究深入袁因此有报道认为
应将丹参作为药用植物中的一种模式植物加以研
究咱猿暂 袁但在其资源特性方面了解较少尧对重要性状定
位等遗传分析方面还非常薄弱遥 本研究结果显示我国
目前栽培丹参还是一个混杂群体袁 为了保证丹参产量
和质量的均一和稳定袁 有必要急需对现有栽培群体进
行分离纯化袁另一方面丰富的变异类型为品种选育提
供了广泛的基因资源袁 有望从中培育出符合人们需要
的优良品种遥
源摇 结论
耘杂栽鄄杂杂砸分析显示袁来源于陕西商洛尧河南内乡尧
四川中江尧山东泰安等 源 个产地的栽培丹参 晕藻蚤 基因
多样度为 园郾 圆圆源缘袁揭示出丰富的遗传多样性袁但四川
产地多样性较低遥
源 个丹参产地间遗传分化程度低袁遗传变异主要
存在于产地内部曰栽培丹参具有较高的多样性以及产
地间遗传分化程度较低袁其主要原因是丹参的异花授
粉习性和种子为材料的有性繁殖方式以及稍加人为选
择的生产方法遥
哉孕郧酝粤聚类分析表明袁所有材料可被分成 远 类袁
其中山东产丹参属于相对独立的群体袁但 源 个产地来
源丹参的遗传距离与地理距离相关性未达到显著水
平遥
参考文献院
咱 员 暂摇 卫生部药典委员会援中国药典一部咱酝暂援北京院化学工业出版社袁
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咱 猿 暂 摇 王庆浩袁陈爱华袁张伯礼援 丹参院一种中药研究的模式生物咱 允暂 援
中医药学报袁 圆园园怨袁 猿苑渊源冤院员 原 源
咱 源 暂摇 赵魁袁郭晓恒袁宋杰袁王睿婷袁杨新杰袁林贵兵袁严铸云援 全国丹参
生产现状的调查和分析咱 允暂 援 时珍国医国药袁圆园员园袁圆员渊怨冤院圆猿园苑
原 圆猿员园
咱 缘 暂摇 郭宝林袁林生袁冯毓秀援丹参主要居群的遗传关系及药材道地性
的初步研究咱允暂 援中草药袁 圆园园圆袁 猿猿渊员圆冤院 员员员猿 原 员员员远
咱 远 暂摇 汪红袁王强援 丹参及鼠尾草属植物的 则阅晕粤鄄陨栽杂 序列分析咱 允暂 援中
草药袁 圆园园缘袁猿远渊怨冤院 员猿愿员 原 员猿愿缘
咱 苑 暂摇 王冰袁张勇袁陈成彬袁李秀兰袁陈瑞阳袁陈力援中国不同地理产地丹
参遗传多样性分析咱允暂 援中国中药杂志袁 圆园园苑袁 猿圆渊员怨冤院 员怨愿愿 原
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咱 愿 暂 摇 徐红袁王燕燕袁魏丹红袁王峥涛袁胡之璧援 不同产地丹参药材的
陨杂杂砸分析与鉴别咱 允暂 援 中药新药与临床药理袁圆园园苑袁员愿渊远冤院 源缘源
原 源缘苑
咱 怨 暂 摇 李廷春袁樊洪泓袁高正良袁周应兵袁杨华应援 丹参遗传多样性的
杂砸粤孕标记分析咱允暂 援 核农学报袁圆园园愿袁圆圆渊缘冤院缘苑远 原 缘愿园
咱员园暂摇 王维婷袁单成钢袁倪大鹏袁王志芬援卫星搭载处理丹参种子 杂孕圆 代
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咱员远暂摇 董媛媛袁俞咪娜袁李小白袁徐攀峰袁崔海瑞袁张明龙援 耘杂栽鄄杂杂砸 和
砸粤孕阅 标记检测油菜渊月则葬泽泽蚤糟葬 灶葬责怎泽冤遗传多样性咱 允暂 援 核农学
报袁圆园园愿袁圆圆渊园缘冤院远员员 原 远员远袁远远园
咱员苑暂摇 许云峰袁蒋方山袁郭营袁李瑞军袁李斯深援 耘酝杂 诱导小麦品种烟农
员缘 突变体的鉴定和 耘杂栽鄄杂杂砸分析咱允暂 援核农学报袁圆园园愿袁圆圆渊园源冤院
源员园 原 源员源
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咱员怨暂摇 宋杰袁严铸云袁张琦袁陈新袁马云桐袁王菁袁杨新杰援 丹参 耘杂栽 序列
中 杂杂砸 信息的分析及分子标记的建立咱 允暂 援 世界科学技术一中
医药现代化袁圆园园怨袁员员渊员冤院缘愿 原 远猿
咱圆园暂摇 邓科君袁张勇袁熊丙全袁彭金华袁张韬袁赵晓楠袁任正隆援 药用植物
丹参 耘杂栽鄄杂杂砸标记的鉴定咱允暂 援 药学学报袁 圆园园怨袁 源源 渊员园冤院 员员远缘
原 员员苑圆
咱圆员暂摇 宋振巧袁王明明袁王建华袁王洪刚援 丹参 阅晕粤 提取方法的比较援
野生植物资源学报袁圆园园愿袁圆苑渊员冤院缘源 原 缘苑
咱圆圆暂摇 李今援 药用植物丹参传粉因子的研究咱允暂 援 首都师范大学学报袁
圆园园员袁 圆圆渊圆冤院 缘愿 原 远员
咱圆猿暂摇 宋振巧袁王建华袁王洪刚袁赵夫娟袁郝力武援 药用植物丹参开花生
物学与繁育特性研究咱允暂 援园艺学报袁圆园园怨袁猿远渊远冤院怨园缘 原 怨员园
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怨怨员