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,2016,36(5):0916-0922
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犻狀犡犻狀犼犻犪狀犵犝狊犻狀犵犛犚犃犘犕犪狉犽犲狉狊
CHENYun1,2,WANGJilian1,2,DINGXiaoli1,MALiufeng1,2
(1ColegeofBiologyandGeographyScience,KashgarUniversity,Kashgar,Xinjiang,844006,China;2TheKeyLaboratoryof
EcologyandBiologicalResourceinYarkantOasisatColeges& UniversitiesundertheDepartmentofEducationofXinjiang
UygurAutonomousRegion,Kashgar,Xinjiang,844006,China)
犃犫狊狋狉犪犮狋:Sequencerelatedamplifiedpolymorphismtechniquewasadoptedtoanalyze21pomegranateacces
sions.Sixteenprimercombinationswithclearbandpatternsandpolymorphismwereselectedfromthirty
sixprimercombinations.271lociweredetectedbysixteenpairsofSRAPprimers.Amongthem194were
polymorphic,thepolymorphicratewas71.59%,anaverageof16.94lociand12.13polymorphiclociwere
amplifiedbyeachprimerpair.Thegeneticsimilaritycoefficientof21pomegranateaccessionsrangedfrom
0.63to0.89,withanaverageof0.77.Anunweightedpairgroupmethodwitharithmeticmean(UPG
MA)treeestablishedfromJaccardsimilaritycoefficientssuggestedthat21pomegranateaccessionswere
clusteredintofivesubgroups.Theaveragevalueofobservednumberofaleles,effectivenumberofaleles,
Neisgenediversityindex,Shannonsinformationindexare1.7122,1.3528,0.1999and0.3105,re
spectively.TherewasrichgeneticdiversityamongthepomegranateaccessionsinKashiPrefecture.The
clusteringresultsusingSRAPmarkerswereconsistentwiththephenotypiccharacteristicsofpomegranate.
Sequencerelatedamplifiedpolymorphism(SRAP)isasimpleandeffectivemethodtoresearchongenetic
diversityofpomegranate.
犓犲狔狑狅狉犱狊:犘狌狀犻犮犪犵狉犪狀犪狋狌犿L.;SRAP;geneticdiversity
pq(犘狌狀犻犮犪犵狉犪狀犪狋狌犿 L.)pq1(Épq
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Table1 Namesandoriginsof21pomegranateaccessions
Code
K
Name
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Region
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Mainmorphologicalcharacteristics
Ks1 4pqSweetpomegranate
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Baishikeranmutownship,Kashgar
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,
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,
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Singleredflower,redfruit,pricklystems,redgrains
Ks2 ¼4pqSweetandsourpomegranate
STY.ST*5T6<Í7
Baishikeranmutownship,Kashgar
ji
,
Å8
,
¦U
,
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,
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,
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Singleredflower,bigredfruit,fewerprickle,redgrains
Ks3 ¼pqSourpomegranate
STY.ST*5T6<Í7
Baishikeranmutownship,Kashgar
ji
,
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,
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,
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Singleredflower,redfruit,fewerprickle,pinkgrains
Ks4 4pqSweetpomegranate
STY.ST*Ô@x7
Awatitownship,Kashgar
ji
,
Å8
,
:;R
,
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,
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Singleredflower,fewerprickle,darkredfruit,pinkgrains
Ks5 ¼pqSourpomegranate
STY.ST*Ô@x7
Awatitownship,Kashgar
jAi
,
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,
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,
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,
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Singlelightredflower,fewerprickle,yelowandwhitefruit
Ks6 ®DpqOrnamentalpomegranate
STY.ST*
Kashgar,KashiPrefecture
ji
,
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,
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,
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,
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Singleredflower,redfruit,pricklystems,youngleafgreen
Yc1 ¼pqSourpomegranate
STY.\FGH67
Luoketownship,Yarkent,Kashi
ji
,
Å8
,
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,
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,
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Singleredflower,pricklystems,yelowandredfruit,redgrains
Yc2 H6ÀLuokeyihao
STY.\FGH67
Luoketownship,Yarkent,Kashi
ji
,
Å8
,
:;u
,
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,
<=i
Singleredflower,pricklystems,roseredfruit,brightredgrains
Yc3 4pqSweetpomegranate
STY.\FGK!L67
Baixireketownship,Yarkent,Kashi
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,
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,
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,
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,
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Singlejacinthflower,pricklystems,roseredfruit,brightredgrains
Yc4 ¼pqSourpomegranate
STY.\FGK!L67
Baixireketownship,Yarkent,Kashi
ji
,
Å8
,
:;R
,
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,
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Singleredflower,fewerprickle,redfruit,pinkgrains
Yc5 U<4pqBigseedsweetpomegranate
STY.\FGK!L67
Baixireketownship,Yarkent,Kashi
jAi
,
Å8
,
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,
<=UÂNJOi
Singlelightredflower,darkredfruit,bigroseredgrains
Ps1 ¼pqSourpomegranate
PY.9QG9RST7
Piyalematownship,Hotan
ji
,
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,
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Singleredflower,stingless,dulredfruit,darkredgrains
Ps2 9RVÀPiyamanyihao
PY.9QG9RST7
Piyalematownship,Hotan
ji
,
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,
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Singleredflower,bigredfruit,darkredgrains,pricklystems
Ps3 9RVWPiyamanerhao
PY.9QG9RST7
Piyalematownship,Hotan
ji
,
Å8
,
¦9i
,
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,
:;u
Singleredflower,redfruit,darkredgrains,pricklystems
Ps4 4pqSweetpomegranate
PY.9QGXY7
Zangguitownship,Hotan
ji
,
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,
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Singleredflower,pricklystems,yelowandredfruit,redgrains
Cl1 ZPY.[SG\]7
Tuopatownship,CeleCounty,Hotan
ji
,
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,
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,
¦9Ui
,
<=^
Singleredflower,stingless,dulredfruit,browngrains
Cl2 _`aSainingmeng
PY.[SG\]7
Tuopatownship,CeleCounty,Hotan
ji
,
Å8
,
:;R
,
¦9Ji
,
<=^
Singleredflower,fewerprickle,roseredfruit,browngrains
Hm1 4pqSweetpomegranate
b¥Y.c#de
Taranchi,HamiPrefecture
ji
,
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,
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,
¦9ïi
,
<=JOi
Singleredflower,fewerprickle,darkredfruit,roseredgrains
Hm2 U\®DpqBigleafornamentalpomegranate
b¥Y.c#de
Taranchi,HamiPrefecture
ji
,
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,
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,
E\^
Doubleredflower,redfruit,youngleafgreen
Hm3 Ï\®DpqSmalleafornamentalpomegranate
b¥Y.c#de
Taranchi,HamiPrefecture
ji
,
c8
,
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,
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,
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Doubleredflower,redfruit,youngleafaubergine,smalleaf
Ats1 ®DpqOrnamentalpomegranate
6gShi+6g,-jÔþT*
Atushi,KizilsuAutonomousPrefecture
ji
,
Å8
,
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,
E\fi
,
:;u
Singleredflower,redfruit,youngleafaubergine,pricklystems
b2 hiA犛犚犃犘MjAk]lm
Table2 ThesequencesofSRAPprimersusedinthestudy
kl$Forwardprimer äl$Reverseprimer
K Name ]^Sequence K Name ]^Sequence
Me1 TGAGTCCAAACCGGATA Em1 GACTGCGTACGAATTAAT
Me2 TGAGTCCAAACCGGAGC Em2 GACTGCGTACGAATTTGC
Me3 TGAGTCCAAACCGGAAT Em3 GACTGCGTACGAATTGAC
Me4 TGAGTCCAAACCGGAAA Em4 GACTGCGTACGAATTGCA
Me5 TGAGTCCAAACCGGTGT Em5 GACTGCGTACGAATTAAC
Me6 TGAGTCCAAACCGGTAG Em6 GACTGCGTACGAATTGGT
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b3 犛犚犃犘k]VrZ[67,UV犇犖犃A>stu`
Table3 ThenumberofpolymorphiclociamplifiedbySRAPprimers
$
Primer
åd¢
Totalnumber
ofloci
u`d¢
Polymorphic
loci
u`
Rateof
polymorphic
loci/%
$
Primer
åd¢
Totalnumber
ofloci
u`d¢
Polymorphic
loci
u`
Rateof
polymorphic
loci/%
me1em5 16 14 87.50 me4em6 18 12 66.67
me1em6 14 13 92.86 me5em1 10 8 80.00
me2em1 16 12 75.00 me5em6 13 11 84.62
me2em3 16 10 62.50 me6em1 17 13 76.47
me3em2 10 8 80.00 me6em4 18 13 72.22
me4em1 9 5 55.56 me6em5 25 17 68.00
me4em2 19 12 63.16 me6em6 25 15 60.00
me4em3 22 14 63.64 å3Total 271 194 71.59
me4em5 23 17 73.91 Mean 16.94 12.13 71.59
M.DL2000;1~21E:21opqvr,u]I·1
þ1 $me6me6t²¦
M.DL2000;1-21.Pomegranatesamples,theorderissameasTable1
Fig.1 PCRamplifiedpatternsbyprimerme6em6
91953 5 6,°:(pqssabABuvwtSRAP?~
2.3 456789:;AvKBC
ßFSRAPjkÑÒþÿ,iNTSYSpc2.10e
*+n21opq|}£¤?~,¥¦¶þ2。
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NumberofsamplesarethesameasTable1
Fig.2 Dendrogramof21pomegranateaccessions
basedonSRAP
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Table4 GeneticdiversityindexbasedonSRAPmarkers
fordifferentareasofpomegranate
Y.Region 犖犪 犖犲 犎 犐
STY.KashiPrefecture1.57201.30060.1823 0.2780
PY. HotanPrefecture1.53511.30240.1797 0.2722
b¥Y. HamiPrefecture1.33211.22160.1280 0.1892
å Total 1.71221.35280.1999 0.3105
3
3.1 犛犚犃犘Mj<=>?@|i@BC
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