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作 者 ：庄静  熊爱生  乔玉山  章镇  姚泉洪

期 刊 ：西北植物学报 2008年 8期

关键词：转录因子；AP2/ERF-B4亚族；RT-PCR；生物信息学；甘蓝型油菜；沪油15；

Keywords:Transcription factor, AP2/ERF-B4 subfamily, RT-PCR, Bioinformatics, Brassica napus, Huyou15,

摘 要 ：利用油菜UniGene数据库,以拟南芥转录因子保守序列为探针,通过电子克隆方法分离得到一个UniGene库Bna.17538,进一步序列拼接得到一个油菜AP2/ERF-B4亚族的转录因子BnaERFB4-1,长度为672 bp,并进行了相关的生物信息学分析.结果显示BnaERFB4-1是亲水性蛋白,蛋白质三级结构与拟南芥RAP2.6L非常相似,蛋白质无序化程度大于拟南芥RAP2.6L.设计引物通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型油菜沪油15幼苗的DNA和cDNA中分离了BnaERFB4-1基因,命名为BnaERFB4-1-Hy15.序列测定和分析显示,来源于沪油15的BnaERFB4-1-Hy15基因与电子克隆的基因序列差异很小,有3个氨基酸位点不同,存在一个内含子.将BnaERFB4-1-Hy15基因通过BamHⅠ和SacⅠ酶切后分别插入酵母表达载体YK3302和植物双元表达载体pYF1404的相应位置,构建了BnaERFB4-1-Hy15基因的酵母体内结合和植物转化载体,为深入研究该基因在油菜抗逆调控中的作用奠定了基础.

Abstract:One AP2/ERF family transcriptional regulators(Named BnaERFB4-1) was isolated from B.napus by in silico cloning method using the conserved domain amino acid sequence of A.thaliana ERF-B4 subfamily as probe.Then,cDNA and deduced amino acid sequence,composit

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