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Genetic diversity analysis of Agropyron germplasm resources by ISSR

冰草属植物种质资源遗传多样性的ISSR分析



全 文 :书冰草属植物种质资源遗传多样性的犐犛犛犚分析
曾亮1,2,袁庆华1,王方1,3,王瑜1
(1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;2.甘肃农业大学草业学院,甘肃 兰州730070;
3.兰州大学草地农业科技学院,甘肃 兰州730020)
摘要:用ISSR标记对来自国内外的33份冰草材料的遗传多样性进行了检测。从93条ISSR引物中共筛出11条
能扩增出清晰条带并具有多态性的引物,33个样品DNA共获得84个扩增位点,其中多态性位点59个,平均每个
引物扩增位点为7.64个。品种间遗传相似系数在0.083~0.706,表现出丰富的遗传多样性。利用 UPGMA聚类
分析,以遗传相似系数0.52为界限,33份材料划分为4类,聚类基本符合地理来源相近的材料聚为一类,呈现出一
定的地域性分布规律。
关键词:冰草;ISSR标记;种质资源;遗传多样性
中图分类号:S543+.903;Q943  文献标识码:A  文章编号:10045759(2013)01026008
  冰草属(犃犵狉狅狆狔狉狅狀)为禾本科(Poaceae)小麦族(Triticeae)多年生牧草,主要分布于欧亚大陆温寒带及沙地
地区,是温带干旱地区最重要的牧草之一[1]。冰草属植物具有很高的饲用价值和经济利用价值,各种营养成分相
对较高,是一种重要的植物资源,其抗旱、抗寒性强,并具有适度的抗盐碱性。作为牲畜四季可口的优质牧草而受
到禾草学家的高度重视。冰草作为重要的小麦(犜狉犻狋犻犮狌犿)野生近缘种,其众多优异基因还可用于小麦的遗传改
良[2]。同时,由于冰草根为须状,密生,具砂套和入土较深等特性,它又是一种良好的水土保持和防风固沙植物,
具有较高的生态价值[3]。
ISSR(intersimplesequencerepeats)简单序列重复区间扩增多态性是由Zietkiewicz等[4]于1994年提出的
一种以PCR(polymerasechainreaction,聚合酶链式反应)扩增为基础的分析标记技术,主要是利用基于SSR
(simplesequencerepeat,简单重复序列)而设计的引物来检测2个SSR之间的DNA序列差异。与SSR相比,
ISSR技术具有简便、不需预先知道序列信息、重复性强等特点,已被广泛应用于居群遗传学、品种鉴定、物种分类
以及物种的遗传多样性研究中[57]。
目前,对冰草属植物遗传多样性的研究多集中在形态学[811]、细胞学[12]和同工酶[13]方面,如李景欣[8]从形态
学角度对14个冰草种群的穗部性状进行了测定分析;兰保祥和李立会[9]应用居群生物学原理对35个蒙古冰草
居群的形态学性状进行了分析;张丽娟[13]对6个不同种群冰草的过氧化物酶进行了检测分析。而在DNA水平
上多采用SSR、RAPD(randomamplifiedpolymorphicDNA,随机扩增多态性DNA标记)等标记,如车永和等[14]
用26个SSR引物对18个沙生冰草居群进行了遗传多样性分析;李景欣和云锦凤[15]对16个冰草种群的352个
单株进行了RAPD多态性检测。但应用ISSR标记对冰草属植物进行遗传多样性研究尚罕见报道。本研究旨在
探索ISSR分子标记法在冰草属品种鉴定、种质资源和遗传多样性研究中的可行性,同时也为有效利用DNA分
子标记开发冰草属植物资源和培育新品种提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 供试材料
材料全部来自于中国农业科学院北京畜牧兽医研究所2009年所采集的新种子,共33份(表1)。于2010年
3月种植于中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牧草试验基地,试验地位于北京市昌平区,属典型的暖温带半湿
260-267
2013年2月
   草 业 学 报   
   ACTAPRATACULTURAESINICA   
第22卷 第1期
Vol.22,No.1
收稿日期:20120113;改回日期:20120319
基金项目:国家科技支撑项目(2011BAD17B01)资助。
作者简介:曾亮(1983),男,甘肃兰州人,在读博士。Email:steve1314@163.com
通讯作者。Email:yuanqinghua@hotmail.com
润大陆性季风气候,年平均气温8~12℃,年降水量600mm以上,土质为砂壤,土壤pH为7.6。于5月份采摘
新鲜幼嫩叶,放入冰盒,带回实验室置于-80℃超低温冰箱保存以备DNA提取。
1.2 DNA提取及定量
每份材料取10~15个植株上的新鲜叶片,采用改进的SDS(sodiumsalt,十二烷基硫酸钠)法,提取结束后,
用0.8%琼脂糖凝胶对DNA质量进行电泳检测,并以一定浓度λDNA作为定量参照标准,根据电泳结果,将
DNA浓度定为10ng/μL,-20℃保存备用。
表1 试验材料及来源
犜犪犫犾犲1 犈狓狆犲狉犻犿犲狀狋犿犪狋犲狉犻犪犾狊犪狀犱狋犺犲犻狉狅狉犻犵犻狀
序号No. 材料编号 Materialnumber 种名Speciesname 来源地 Origin
1 84471 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 伊朗Iran
2 8477 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 伊朗Iran
3 8480 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 伊朗Iran
4 84156 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 土耳其Turkey
5 84157 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 土耳其Turkey
6 84152 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 土耳其Turkey
7 8440 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 苏联Sovietunion
8 8428 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 苏联Sovietunion
9 8429 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 苏联Sovietunion
10 84154 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 苏联Sovietunion
11 8413 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 葡萄牙Portugal
12 84119 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 加拿大Canada
13 8415 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 南斯拉夫Yugaslavia
14 8412 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 西班牙Spain
15 200417 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 山西五台山 WutaiMountain,Shanxi
16 200410 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 新疆塔城Tacheng,Xinjiang
17 2004133 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 立石村Lishivilage
18 2004112 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 郭家山Guojiashan
19 中畜422Zhongxu422 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 黑龙江 Heilongjiang
20 中畜165Zhongxu165 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 古浪县黄羊川 Huangyangchuan,Gulang
21 中畜829Zhongxu829 扁穗冰草犃.犮狉犻狊狋犪狋狌犿 经棚(克旗)Jingpen
22 84168 沙生冰草犃.犱犲狊犲狉狋狅狉狌犿 罗马尼亚Romania
23 84167 沙生冰草犃.犱犲狊犲狉狋狅狉狌犿 英国British
24 84181 沙生冰草犃.犱犲狊犲狉狋狅狉狌犿 苏联Sovietunion
25 84176 沙生冰草犃.犱犲狊犲狉狋狅狉狌犿 苏联Sovietunion
26 84175 沙生冰草犃.犱犲狊犲狉狋狅狉狌犿 苏联Sovietunion
27 84165 沙生冰草犃.犱犲狊犲狉狋狅狉狌犿 加拿大Canada
28 83325 沙生冰草犃.犱犲狊犲狉狋狅狉狌犿 土耳其 Turkey
29 84610 西伯利亚冰草犃.狊犻犫犻狉犻犮狌犿 苏联Sovietunion
30 84611 西伯利亚冰草犃.狊犻犫犻狉犻犮狌犿 苏联Sovietunion
31 84609 西伯利亚冰草犃.狊犻犫犻狉犻犮狌犿 苏联Sovietunion
32 2695 蒙古冰草犃.犿狅犵狅犾犻犮狌犿 苏联Sovietunion
33 9117 兰茎冰草犃.狊犿犻狋犺犻犻 苏联Sovietunion
162第22卷第1期 草业学报2013年
1.3 ISSR-PCR反应体系的建立与优化
在确定最佳反应条件时,参考了地毯草(犃狓狅狀狅狆狌狊犮狅犿狆狉犲狊狊狌狊)[16]、鸭茅(犇犪犮狋狔犾犻狊犵犾狅犿犲狉犪狋犲)[17]及紫花苜
蓿(犕犲犱犻犮犪犵狅狊犪狋犻狏犪)[18]的ISSR扩增程序和反应体系,并进行适当优化。最终确定的反应体系(20μL)如下:40
ng模板DNA,0.2mmol/LdNTP,0.5μmol/LISSR引物,1UTaqDNA聚合酶,2μL10×PCRBuffer,2.5
mmol/LMgCl2。PCR反应程序为:94℃预变性4min,94℃变性30s,60℃(60~58℃)退火45s,72℃延伸1
min45s,共11个循环,每个循环退火温度降1℃;94℃变性30s,50℃(50~48℃)退火45s,共24个循环;72℃
延伸5min,25℃保温。
1.4 ISSR引物的筛选
本试验根据加拿大哥伦比亚大学核酸蛋白服务工作室提供的ISSR引物序列,由上海生物工程公司合成,根
据确定的反应体系的基础上,从93条ISSR引物进行扩增,筛选出能获得清晰条带,反应稳定的引物进行下一步
分析(表1)。
1.5 PCR扩增及电泳
PCR扩增在PTC100TM扩增仪上进行。PCR反应结束后取7.5μLPCR扩增产物与1.5μL6×Loading
Buffer(TaKaRa)混匀,点入含0.5μg/mLEB(ethidiumbromide,溴化乙锭)的2%琼脂糖凝胶中,在5V电场强
度下电泳1~2h,取出凝胶,用凝胶成像仪检测并照相、分析。
1.6 数据统计
多态性带是指在供试品种中,对某一扩增带而言,某些品种有,其他品种没有的条带。多态性比例(%)=(总
谱带数-共有带数)/总谱带数×100。以扩增条带在相对迁移位置的有无,记为“1”或“0”。按Nei和Li[19]的方
法计算材料间的遗传相似系数(GS),计算公式为:犌犛=2犖犻犼/(犖犻+犖犼),式中,犖犻犼为材料犻和犼共有的扩增条
带数,犖犻为材料犻的扩增条带数,犖犼为材料犼的扩增条带数,根据GS值按非加权配对算术平均法(UPGMA)对
冰草种质材料进行遗传相似性聚类。数据使用NTSYSPC2.1进行统计分析。
2 结果与分析
2.1 筛选引物
从93条引物中共筛选出11条多态性好、条带清
晰的引物,用于供试33个材料的PCR扩增。并根据
各引物的特性和具体的扩增反应对照,确定了各引物
的最佳退火温度(表2)。
2.2 扩增产物的多态性
11条引物对33份冰草种质资源进行PCR扩增
(图1),大部分扩增片段大小均在300~1500bp。从
ISSR扩增谱带统计结果(表3)来看,所有材料共获得
84个扩增位点,其中多态性位点59个,每个引物扩增
位点为3~11个,平均7.64个,其中多态性位点1~9
个,平均5.36个,多态性比率为70.2%。这说明供试
冰草属种质资源间存在较大的遗传变异,且ISSR标
记能有效的揭示材料间的多态性。
2.3 遗传相似系数
33份冰草属材料之间的相似系数在0.083~
0.706(表4)。其中,亲缘关系最近的是来源于土耳其
表2 犐犛犛犚分析的引物序列
犜犪犫犾犲2 犘狉犻犿犲狉狊犲狇狌犲狀犮犲狊狌狊犲犱犻狀犐犛犛犚犪狀犪犾狔狊犻狊
引物编号
Numberof
primer
引物序列
Primer
list
退火温度
Annealedtemperature
(℃)
10 AGAGAGAGAGAGAGAGTA 48
14 ACACACACACACACACGT 48
17 AGAGAGAGAGAGAGAGGC 48
18 AGAGAGAGAGAGAGAGGG 48
19 AGAGAGAGAGAGAGAGCA 48
834 AGAGAGAGAGAGAGAGYT 48
836 AGAGAGAGAGAGAGAGYA 48
868 GAAGAAGAAGAAGAAGAA 48
815 CTCTCTCTCTCTCTCTG 50
26 ACACACACACACACACC 52
28 CACACACACACACACARG 52
的扁穗冰草5号材料和6号材料,相似系数为0.706;遗传相似系数最低的是来源于伊朗的扁穗冰草3号材料与
来源于加拿大的沙生冰草27号材料,遗传相似系数为0.083,亲缘关系最远;在33份冰草属种质材料中大多数
来自于相同或相近地理位置的材料间GS值较大,亲缘关系较近。只有小部分材料因采集地地理位置或生境相
262 ACTAPRATACULTURAESINICA(2013) Vol.22,No.1
差较大,从而使得供试材料间整体存在较大的遗传差
异。
2.4 聚类分析
利用UPGMA法对33份冰草属材料进行 UPG
MA聚类分析,绘出树状聚类图(图2)。以遗传相似
系数0.52为界限,将33份冰草属植物的材料划分为
4组:第1类全部为沙生冰草,按地理来源划分为2个
亚类,第1亚类共3份材料,全部来自于苏联;第2亚
类共4份材料,23号来自罗马尼亚,22号来自英国,27
号来自加拿大,28号来自土耳其;第2类共8分材料,
全部是扁穗冰草,除1号材料来自伊朗、11号材料来
自于葡萄牙以外,其余6分材料均来自国内;第3类共
13份材料,均为扁穗冰草,除21号材料来源于国内以
外,其余均来源于国外;第4类共5份材料,其中29,
30,31号为西伯利亚冰草,32与33号分别为蒙古冰草
与兰茎冰草单独为一亚类。聚类结果表明,材料地理
来源对系统聚类结果影响较大,各来源地材料在聚类
图中既有区别又有交叉,说明材料间形态性状变异有
一定的连续性。
表3 33份冰草属植物犐犛犛犚标记扩增结果
犜犪犫犾犲3 犜犺犲狉犲狊狌犾狋狅犳犐犛犛犚犪犿狆犾犻犳犻犮犪狋犻狅狀狅犳33犃犵狉狅狆狔狉狅狀
引物编号
Numberof
primer
多态性位点数
Numberof
polymorphic
bands
总位点数
Numberof
totalbands
多态性百分率
Percentageof
polymorphic
bands(%)
10 4 6 66.7
14 5 7 71.4
17 1 3 33.3
18 9 11 81.8
19 5 9 55.6
834 2 6 33.3
836 8 9 88.9
868 4 7 57.1
815 6 7 85.7
26 4 8 50.0
28 7 11 63.6
总计 Total 59 84 70.2
平均 Mean 5.36 7.64
图1 引物10的冰草扩增图谱
犉犻犵.1 犚犲狊狌犾狋狅犳犘犆犚犪犿狆犾犻犳犻犮犪狋犻狅狀狌狊犻狀犵狆狉犻犿犲狉10狅犳犃犵狉狅狆狔狉狅狀
M为100bpDNAladder,材料编号同表1。M=100bpDNAladder,materialnumberwasshowedinTable1.
362第22卷第1期 草业学报2013年
表4 犐犛犛犚标记的33份供试材料之间的相似系数
犜犪犫犾犲4 犌犲狀犲狋犻犮狊犻犿犻犾犪狉犻狋狔狅犳33犿犪狋犲狉犻犪犾狊犫犪狊犲犱狅狀犐犛犛犚
编号No. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16
2 0.600
3 0.621 0.667
4 0.345 0.444 0.538
5 0.424 0.387 0.467 0.467
6 0.364 0.387 0.267 0.333 0.706
7 0.514 0.364 0.375 0.375 0.556 0.611
8 0.333 0.429 0.222 0.296 0.452 0.452 0.485
9 0.457 0.364 0.563 0.563 0.611 0.389 0.579 0.424
10 0.231 0.250 0.348 0.174 0.444 0.444 0.345 0.500 0.345
11 0.471 0.563 0.645 0.516 0.629 0.514 0.486 0.188 0.649 0.286
12 0.375 0.400 0.345 0.276 0.424 0.545 0.514 0.533 0.229 0.385 0.412
13 0.452 0.621 0.643 0.643 0.563 0.313 0.353 0.345 0.588 0.240 0.606 0.387
14 0.387 0.414 0.286 0.357 0.438 0.625 0.529 0.690 0.294 0.400 0.242 0.645 0.333
15 0.533 0.500 0.444 0.222 0.323 0.258 0.424 0.500 0.485 0.333 0.375 0.200 0.483 0.345
16 0.467 0.429 0.222 0.296 0.387 0.387 0.545 0.429 0.424 0.250 0.438 0.333 0.345 0.276 0.643
17 0.323 0.276 0.429 0.286 0.500 0.375 0.588 0.345 0.647 0.320 0.606 0.387 0.467 0.133 0.483 0.483
18 0.258 0.414 0.357 0.500 0.625 0.563 0.412 0.414 0.529 0.320 0.667 0.516 0.467 0.467 0.207 0.414
19 0.296 0.400 0.333 0.250 0.429 0.500 0.200 0.320 0.400 0.381 0.414 0.444 0.385 0.308 0.240 0.160
20 0.452 0.345 0.214 0.357 0.375 0.500 0.294 0.276 0.412 0.400 0.424 0.387 0.267 0.267 0.345 0.345
21 0.471 0.563 0.516 0.452 0.400 0.514 0.486 0.438 0.378 0.357 0.611 0.706 0.485 0.485 0.375 0.438
22 0.500 0.467 0.483 0.414 0.485 0.424 0.457 0.600 0.457 0.308 0.471 0.438 0.387 0.516 0.533 0.600
23 0.457 0.606 0.563 0.500 0.556 0.500 0.474 0.424 0.421 0.414 0.649 0.629 0.588 0.588 0.364 0.485
24 0.486 0.400 0.471 0.412 0.526 0.421 0.450 0.457 0.550 0.387 0.462 0.541 0.611 0.556 0.457 0.400
25 0.370 0.480 0.417 0.333 0.286 0.357 0.333 0.320 0.533 0.190 0.552 0.296 0.385 0.308 0.400 0.240
26 0.250 0.200 0.276 0.414 0.485 0.485 0.457 0.400 0.629 0.462 0.471 0.438 0.452 0.387 0.333 0.267
27 0.296 0.240 0.083 0.333 0.429 0.429 0.533 0.320 0.267 0.286 0.345 0.444 0.231 0.308 0.160 0.480
28 0.485 0.323 0.333 0.333 0.647 0.588 0.611 0.452 0.444 0.370 0.514 0.545 0.438 0.438 0.387 0.516
29 0.588 0.500 0.516 0.452 0.514 0.571 0.595 0.375 0.703 0.286 0.556 0.235 0.485 0.364 0.563 0.438
30 0.563 0.600 0.552 0.483 0.303 0.364 0.571 0.467 0.400 0.308 0.412 0.500 0.452 0.581 0.600 0.600
31 0.457 0.424 0.438 0.375 0.556 0.444 0.474 0.364 0.526 0.414 0.486 0.457 0.471 0.588 0.424 0.424
32 0.471 0.375 0.452 0.452 0.514 0.457 0.486 0.563 0.486 0.500 0.500 0.647 0.485 0.545 0.313 0.438
33 0.345 0.148 0.231 0.462 0.467 0.333 0.438 0.444 0.500 0.087 0.516 0.483 0.500 0.357 0.296 0.444
编号No. 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32
18 0.533
19 0.462 0.538
20 0.467 0.467 0.615
21 0.364 0.303 0.276 0.424
22 0.387 0.452 0.222 0.323 0.588
23 0.294 0.588 0.333 0.294 0.649 0.629
24 0.444 0.444 0.375 0.389 0.462 0.486 0.650
25 0.462 0.462 0.455 0.462 0.276 0.222 0.267 0.250
26 0.516 0.452 0.296 0.581 0.412 0.313 0.343 0.486 0.593 .
27 0.462 0.462 0.364 0.385 0.345 0.222 0.333 0.250 0.182 0.222
28 0.563 0.500 0.429 0.438 0.571 0.606 0.556 0.526 0.143 0.364 0.500
29 0.485 0.424 0.414 0.485 0.389 0.412 0.324 0.359 0.552 0.471 0.276 0.400
30 0.323 0.387 0.222 0.323 0.588 0.688 0.571 0.432 0.370 0.313 0.222 0.364 0.529
31 0.412 0.471 0.333 0.471 0.486 0.514 0.579 0.700 0.333 0.514 0.400 0.389 0.378 0.514
32 0.424 0.485 0.276 0.424 0.667 0.529 0.649 0.615 0.276 0.529 0.414 0.514 0.167 0.412 0.649
33 0.429 0.429 0.167 0.214 0.516 0.483 0.438 0.412 0.333 0.483 0.417 0.600 0.323 0.207 0.313 0.581
462 ACTAPRATACULTURAESINICA(2013) Vol.22,No.1
图2 基于犐犛犛犚标记的33份冰草资源聚类图
犉犻犵.2 犇犲狀犱狉狅犵狉犪犿狅犳犮犾狌狊狋犲狉犪狀犪犾狔狊犻狊犫犪狊犲犱狅狀犐犛犛犚狅犳33犃犵狉狅狆狔狉狅狀
材料编号同表1。Materialnumberwasshowedintable1.
3 讨论
李景欣和云锦凤[15]对16个天然冰草种群352个单株的基因组DNA进行RAPD多态性检测,聚类分析结
果表明,16个种群大致可以分为4类,生境和表型相近的种群基本聚为一类。卢萍等[20]对内蒙古地区6个种群
的小花棘豆(犗狓狔狋狉狅狆犻狊犵犾犪犫狉犪)进行了ISSR遗传多样性研究,聚类结果表明,生态地理条件相似的种群优先聚
集。本研究基于ISSR标记的聚类结果与以上研究结果相似,从33份冰草材料的聚类图可以看出在GS约为
0.52处将33份材料聚为4类,聚类基本符合地理来源相近的居群聚为一类。但也有地理来源不同的品种被归入
一类,产生这种结果的原因可能有2个方面:1)地理来源相同的材料虽然来自于同一环境,但是由于选择方向的
不同和选用育种材料的错综复杂,也可能形成遗传差异较大的类型,因此出现地理来源相同的品种被归入不同类
群;2)受环境饰变作用的影响,物种在长期适应环境的过程中会出现某些性状趋同的现象,造成不同物种性状间
的交叉。
本研究首次采用ISSR标记对冰草属植物种质资源进行分析,获得了较为满意的结果。ISSR标记是一种快
速、可靠、可以提供有关基因组丰富信息的DNA指纹技术,因而已被广泛的应用于植物遗传多样性的研究中。
冯亮亮等[21]在对甘肃地区红砂(犚犲犪狌犿狌狉犻犪狊狅狅狀犵狅狉犻犮犪)遗传多样性的ISSR分析表明,12条引物检测到69个位
562第22卷第1期 草业学报2013年
点,其中多态性位点60个,多态位点比率达到86.96%,说明ISSR标记具有较高的多态性检测水平。祁建民
等[22]在烟草(犖犻犮狅狋犻犪狀犪狋犪犫犪犮狌犿)上的研究结果表明,ISSR标记比RAPD标记表现出较高的稳定性,在对30份
烟草的ISSR分析中,分子聚类能较好地揭示种间或种内的遗传差异。刘万勃等[23]利用RAPD和ISSR标记对
甜瓜(犆狌犮狌犿犻狊犿犲犾狅)种质遗传多样性研究发现,ISSR比RAPD的多态性检测水平略高,可检测到更高的类型间
遗传变异。侯永翠等[24]利用RAMP(randomamplifiedmicrosatelitepolymorphism,随机扩增微卫星多态性)和
ISSR标记分别对60份大麦(犎狅狉犱犲狌犿狏狌犾犵犪狉犲)种质资源的遗传多样性进行了检测,结果发现这2种标记都能
揭示材料间较高的遗传多样性,而且ISSR标记的多态性又高于RAMP标记。张木清等[25]选用24个ISSR引物
分析我国8省区的30多个斑茅(犛犪犮犮犺犪狉狌犿犪狉狌狀犱犻狀犪犮犲狌犿)种质资源,发现我国斑茅具有丰富的遗传多样性,同
一地区的斑茅基本聚在一起,呈现出一定的地域分布规律。钱韦等[26]利用ISSR标记技术探讨了我国野生稻
(犗狉狔狕犪)的遗传背景,12个引物扩增出122条DNA片段,多态条带比率为72.95%。前人的研究结果均表明IS
SR分子标记技术是一种有效揭示品种遗传多样性的手段。本研究利用11条ISSR引物扩增,获得多态性位点
59个,多态性位点百分率为70.2%,33份材料相似系数为0.083~0.706,平均为0.395,这表明冰草属不同材料
间存在着丰富的多态性,这种多态性对了解冰草属植物的遗传背景、为冰草属资源的开发利用、新品种的选育和
生产提供了理论依据。
4 结论
通过ISSR分子标记技术对来自国内外的33份冰草材料遗传多样性进行分析,结果表明,33个样品DNA共
获得84个扩增位点,其中多态性位点59个,平均每个引物扩增位点7.64个。品种间遗传相似系数在0.083~
0.706,表现出丰富的遗传多样性。利用UPGMA聚类分析,以遗传相似系数0.52为界限,将33份材料划分为4
类,聚类基本符合地理来源相近的材料聚为一类,呈现出一定的地域性分布规律。
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犌犲狀犲狋犻犮犱犻狏犲狉狊犻狋狔犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳犃犵狉狅狆狔狉狅狀犵犲狉犿狆犾犪狊犿狉犲狊狅狌狉犮犲狊犫狔犐犛犛犚
ZENGLiang1,2,YUANQinghua1,WANGFang1,3,WANGYu1
(1.InstituteofAnimalScience,CAAS,Beijing100193,China;2.ColegeofGrasslandScience,
GansuAgriculturalUniversity,Lanzhou730070,China;3.ColegeofPastoralAgriculture
ScienceandTechnology,LanzhouUniversity,
Lanzhou730020,China)
犃犫狊狋狉犪犮狋:Thegeneticdiversityof33犃犵狉狅狆狔狉狅狀materialsfrombothathomeandabroadwasanalyzedbyISSR
(intersimplesequencerepeats)markers.Elevenprimerswereselectedfrom93primerswhichhadclearpoly
morphicbands.Atotalof84bandsofwhich59werepolymorphicwereobtainedfromthe33materials.Onav
erage,eachprimeramplificationsitewas7.64.Thegeneticsimilaritycoefficientofvarietieswasbetween
0.083and0.706,andshowedrichgeneticdiversity.UPGMAclusteranalysisgaveageneticsimilaritycoeffi
cientof0.52forboundariesandthe33materialsweredividedintofourtypes,withbasicclusteringinaccord
withgeographicaloriginandregionaldistribution.
犓犲狔狑狅狉犱狊:犃犵狉狅狆狔狉狅狀;ISSRmark;germplasmresources;geneticdiversity
762第22卷第1期 草业学报2013年