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Species Identification and Genetic Relationship Assessment of Pinus (Sect. Pinus) Related Species Based on Morphological and Molecular Markers

松属近缘种形态和分子鉴定及其亲缘关系探讨


松属(油松组)树种是我国重要的造林树种,但其种子和幼苗难以区分。通过比较种子的千粒质量、种子形状、颜色、幼苗子叶数、幼苗下胚轴颜色和苗高,结合ISSR和SSR标记技术,鉴定松属(油松组)11个近缘种,并对其亲缘关系进行探讨。研究结果表明:通过种子和幼苗的形态比较鉴定,可准确鉴定油松和加勒比松;ISSR和SSR标记则可把油松组的11个树种中的10个准确鉴定出来,仅有高山松由于遗传背景的复杂性没有发现种特异性引物(位点)。利用5对SSR引物获得的41个种间多态性位点构建的10个树种的近缘种亲缘关系与传统的研究结果基本一致。系统聚类分析在相似系数0.60处将10个树种分为3个类群:马尾松和赤松聚为第1个类群;云南松、思茅松、高山松、油松聚成一小类,和另一小类即黑松、樟子松聚成第2个类群;第3类群为火炬松和加勒比松,它与前2个类群亲缘关系较远,相似系数仅为0.42。

Many pine trees of Sect. Pinus are distributed throughout China, and are important species for afforestation in China. Seeds and seedlings of these closely related species are similar in morphological characters. It is difficult to identify them according to their morphology. Seeds and seedlings from 11 pine species were identified by integrating their different morphological characters of seeds (1 000-seeds weight, seeds shape and color) and seedlings (number of cotyledon, color of hypocotyls and seedling height), with their ISSR and SSR markers. At the same time, genetic relationship between those closely related species was assessed based on information from SSR markers. The results showed that P. tabulaeformis and P. caribaea were easily distinguished from 11 pine species according to morphological differences of seeds and seedlings, and 10 of 11 species were identified accurately based on ISSR and SSR markers. However, no species-specific primer (loci) was found to recognize P. densata because of its complicated genetic background. Genetic relationship between 10 pine species based on 41 polymorphic loci amplified by 5 pairs SSR primers was similar with relationship of traditional taxonomic groups. UPGMA dendrogram demonstrated that 3 taxonomical groups were clustered at the similarity coefficient of 0.6. The first group consisted of P. massoniana and P. densiflora . The second group had 6 species which further were divided into two sub-groups, with one sub-group including P. yunnanensis , P. kesiya , P. densata and P. tabulaeformis ; the other sub-group including P. thunbergii and P. sylvestris . The last group contained P. taeda and P. caribaea , and they had relatively distant relationship from other two groups, with the similarity coefficient of 0.42.


全 文 :第 !" 卷 第 #$ 期
% $ # # 年 #$ 月
林 业 科 学
&’()*+(, &(-.,) &(*(’,)
./01!"!*/1#$
2345!% $ # #
松属近缘种形态和分子鉴定及其亲缘关系探讨
洑香香6赵6虎6王6玉
"南京林业大学森林资源与环境学院6南京 %#$$7"$
摘6要!6松属"油松组$树种是我国重要的造林树种!但其种子和幼苗难以区分& 通过比较种子的千粒质量%种子
形状%颜色%幼苗子叶数%幼苗下胚轴颜色和苗高!结合 (&&k和 &&k标记技术!鉴定松属"油松组$## 个近缘种!并
对其亲缘关系进行探讨& 研究结果表明’通过种子和幼苗的形态比较鉴定!可准确鉴定油松和加勒比松#(&&k和
&&k标记则可把油松组的 ## 个树种中的 #$ 个准确鉴定出来!仅有高山松由于遗传背景的复杂性没有发现种特异
性引物"位点$& 利用 9 对 &&k引物获得的 !# 个种间多态性位点构建的 #$ 个树种的近缘种亲缘关系与传统的研
究结果基本一致& 系统聚类分析在相似系数 $18$ 处将 #$ 个树种分为 7 个类群’马尾松和赤松聚为第 # 个类群#云
南松%思茅松%高山松%油松聚成一小类!和另一小类即黑松%樟子松聚成第 % 个类群#第 7 类群为火炬松和加勒比
松!它与前 % 个类群亲缘关系较远!相似系数仅为 $1!%&
关键词’6松属#形态标记#(&&k#&&k#鉴定#系统进化
中图分类号! &"#:1!;%&"#:1!8666文献标识码!,666文章编号!#$$# A"!::"%$####$ A$$9# A$:
收稿日期’%$#$ A#% A#9#修回日期’%$## A$# A%8&
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Q*&#$*(!"*:%*/1#/*(,’D,-";,&,4%:#&#’(D,&*:<&#-D#-_*-/
QP LDIFE_DIFE6n?I/TP6RIFEOP
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=2/$-#:$’6fIFWKDFN4CNNV/X&N345@-20&ICNUDV4CDYP4NU 4?C/PE?/P4’?DFI! IFU ICND@K/C4IF4VKN3DNVX/CIX/CNV4I4D/F DF
’?DFI5&NNUVIFU VNNU0DFEV/X4?NVN30/VN0WCN0I4NU VKN3DNVICNVD@D0ICDF @/CK?/0/ED3I03?ICI34NCV5(4DVUDXD3P044/DUNF4DXW
4?N@I33/CUDFE4/4?NDC@/CK?/0/EW5&NNUVIFU VNNU0DFEVXC/@## KDFNVKN3DNVMNCNDUNF4DXDNU YWDF4NECI4DFE4?NDCUDXNCNF4
@/CK?/0/ED3I03?ICI34NCV/XVNNUV"# $$$‘VNNUVMNDE?4! VNNUVV?IKNIFU 3/0/C$ IFU VNNU0DFEV"FP@YNC/X3/4W0NU/F! 3/0/C/X
?WK/3/4W0VIFU VNNU0DFE?NDE?4$! MD4? 4?NDC(&&kIFU &&k@ICZNCV5,44?NVI@N4D@N! ENFN4D3CN0I4D/FV?DK YN4MNNF 4?/VN
30/VN0WCN0I4NU VKN3DNVMIVIVVNVVNU YIVNU /F DFX/C@I4D/F XC/@&&k@ICZNCV5+?NCNVP04VV?/MNU 4?I4@!’1:0*1%;#$G-&IFU
@!.1$-:1%1 MNCNNIVD0WUDV4DFEPDV?NU XC/@## KDFNVKN3DNVI33/CUDFE4/@/CK?/0/ED3I0UDXNCNF3NV/XVNNUVIFU VNNU0DFEV! IFU
#$ /X## VKN3DNVMNCNDUNF4DXDNU I33PCI4N0WYIVNU /F (&&kIFU &&k@ICZNCV5T/MN[NC! F/VKN3DNV‘VKN3DXD3KCD@NC"0/3D$ MIV
X/PFU 4/CN3/EFD^N@!A%2&1’1 YN3IPVN/XD4V3/@K0D3I4NU ENFN4D3YI3ZEC/PFU5hNFN4D3CN0I4D/FV?DK YN4MNNF #$ KDFNVKN3DNV
YIVNU /F !# K/0W@/CK?D30/3DI@K0DXDNU YW9 KIDCV&&kKCD@NCVMIVVD@D0ICMD4? CN0I4D/FV?DK /X4CIUD4D/FI04I_/F/@D3EC/PKV5
qShf,UNFUC/ECI@UN@/FV4CI4NU 4?I47 4I_/F/@D3I0EC/PKVMNCN30PV4NCNU I44?NVD@D0ICD4W3/NXD3DNF4/X$181+?NXDCV4
EC/PK 3/FVDV4NU /X@!G1&-121 IFU @!A%2&-;*#$15+?NVN3/FU EC/PK ?IU 8 VKN3DNVM?D3? XPC4?NCMNCNUD[DUNU DF4/4M/
VPY‘EC/PKV! MD4? /FNVPY‘EC/PK DF30PUDFE@!(02212%2&-&! @!O%&-(1! @!A%2&1’1 IFU @!’1:0*1%;#$G-&# 4?N/4?NCVPY‘EC/PK
DF30PUDFE@!’/02:%$+-IFU @!&(*5%&’$-&5+?N0IV4EC/PK 3/F4IDFNU @!’1%A1 IFU @!.1$-:1%1! IFU 4?NW?IU CN0I4D[N0WUDV4IF4
CN0I4D/FV?DK XC/@/4?NC4M/EC/PKV! MD4? 4?NVD@D0ICD4W3/NXD3DNF4/X$1!%5
>*9 ?,-(/’6@-20&# @/CK?/0/ED3I03?ICI34NC# (&&k# &&k# DUNF4DXD3I4D/F# ENFN4D3CN0I4D/FV?DK
66松属"@-20&$树种分布于北半球!我国有 %% 种!
其中大部分为重要的造林树种!如马尾松 "@!
G1&-121$% 黑 松 "@!’/02:%$+-$% 云 南 松 "@!
(02212%2&-&$等& 国内外研究均表明松属树种表型
上存在广泛的变异!因此传统种的划分主要根据形
态特征进行分类& 但形态特征在一些近缘种甚至属
间种的区分上并不十分可靠 "f/CENFV4NCF %’1*5!
#;8!# fIF0NW! #;"#$!主要表现在’ 一些种天然分
布上存在重叠区域!而生殖上不存在隔离!同时种内
的遗传变异较大"Q/M0NC%’1*5! #;::$!如黄山松"@!
/K12+&/12%2&-&$和马尾松"邢有华等! #;;%$# 而有
些种间杂种分布于 % 个亲本的中间区域!如高山松
林 业 科 学 !" 卷6
"@!A%2&1’1 $是云南松与油松"@!’1:0*1%;#$G-&$的
杂交种!位于亲本都不能生长的青藏东南缘 % "$$ c
! %$$ @的高海拔地带"kDNVNYNCE! #;;"$!其形态和
解剖性状介于 % 个亲本之间"QP %’1*5! #;;;$# 还有
些松树种内群体形态性状的变异较大!在不同的立
地条件下!形态上产生显著的变异!如云南松在高山
贫瘠的地区!主干不明显!形成*地盘松+!而在云南
南部温湿度较高的地区形成*细叶云南松+ "虞泓!
#;;8$# 还有的种间性状差异仅在一定的生长发育
阶段才表现出来"H/F/E?PN%’1*5! #;;%$& 这些都限
制了表型性状在种质鉴定上的可靠性 "h/CU/F!
#;"8# Q/M0NC%’1*5! #;::$&
分子标记为遗传背景一致的种质鉴别提供了成
熟可靠的技术& 研究结果表明!基因的进化可以反
映物种的进化!并且不同的基因由于变异频率不同!
从而在不同分类等级上具有一定的保守性"’?IVN%’
1*5! #;;7# J/?FV/F %’1*5! #;;9# 汪小全等! #;;"$&
同时由于生殖隔离%地理隔离或生态位上的差异!不
同种在进化过程中固定了不同的基因!其中一些被
固定的基因在种的水平上具有高度的保守性!这些
差异可以通过 H*,指纹技术被发现"QPC@IF %’1*5!
#;;"$& 利用分子标记对种质进行鉴别!要求获得
的标记位点在进化上具有一定的保守性!同时具有
一定的变异速率!即在种间具有多态性而在种内具
有高度的保守性& 在过去的二十多年间!H*,标记
为植物分类和种质鉴定提供了有效而又准确的依据
"QPC@IF %’1*5! #;;"# &PF %’1*5! %$$9# k/VV‘HI[DV%’
1*5! %$$:# B/3%’1*5! %$$;$&
在各 类 分 子 标 记 中! 微 卫 星 标 记 " VD@K0N
VNlPNF3NCNKNI4! &&k$具有共显性遗传%重复性与稳
定性好%多态性高等优点!缺点是需设计特异性引
物!引物开发成本高# 而 (&&k"DF4NC‘VD@K0NVNlPNF3N
CNKNI4$技术是在 &&k基础上开发的!大部分 (&&k
标记为显性标记!既具 &&k标记的优点!又克服了
其 缺 点& 二 者 的 稳 定 性 优 于 k,SH" CIFU/@
I@K0DXDNU K/0W@/CK?D3H*,$!在处理大批量的样品
时 比 ,Q-SV " I@K0DXDNU XCIE@NF4 0NFE4?
K/0W@/CK?DV@V$更经济!因此 &&k和 (&&k标记目前
广泛应用于近缘种及杂种的种质鉴定及种质的遗传
多样性评价"TI/%’1*5! %$$%# GI0IVICI[IFIF %’1*5!
%$$9# 吴学尉等! %$$;# 张红莲等! %$#$$&
松属造林树种在生产中主要采用播种育苗或直
播造林& 一些亲缘关系较近的种!如油松组树种!种
间种内的表型多样性使得种质鉴定困难!其种子和
幼苗在表型上更是难以区分!这给林业生产带来很
大的困扰& 近年来随着林权制度改革和林业经济的
发展!对松属种苗的需求增加!种苗的调拨频繁!真
假混杂的种子和苗木对林业生产的影响深远& 因此
亟待开发一套实用%快速%准确的松属种子和幼苗的
鉴别方法& 本研究利用种子和幼苗的形态特征结合
分子标记方法"(&&k和 &&k$对松属"油松组$近缘
种进行早期鉴定!为林业生产中树种的正确使用提
供科学依据&
#6材料与方法
@F@A材料
#1#1#6植物材料6## 个松属"油松组$树种的种子
来源见表 #& 种子在 %9 d光照培养箱中萌发至子
叶脱壳!每个种批收集 7$ 株新鲜幼苗!于 A%$ d冰
箱中保存待用&
表 @A松属树种种子来源!
)#2B@A!**(/,<-:*/,0"%’*$-**/
树种 &KN3DNV 种子来源 &NNU V/PC3NV
火炬松 @!’1%A1 美国 ,@NCD3I"%$
湿地松 @!%*-#’- 美国 ,@NCD3I"#$ # 广东 hPIFEU/FE"#$
加勒比松 @!.1$-:1%1 古巴 ’PYI"#$
马尾松 @!G1&-121 广西 hPIFE_D"7$ # 浙江 n?N\DIFE"%$ # 贵州 hPD^?/P"%$ # 福建 QP\DIF"%$
黑松 @!’/02:%$+- 山东日照 kD^?I/!&?IFU/FE"#$ # 山东枣庄 nI/^?PIFE!&?IFU/FE"#$
赤松 @!A%2&-;*#$1 山东枣庄 nI/^?PIFE! &?IFU/FE"#$
油松 @!’1:0*1%;#$G-& 陕西隆化 -/FE?PI! &?IIF_D"%$
高山松 @!A%2&1’1 云南腾冲 +NFE3?/FE! OPFFIF"#$ # 四川 &D3?PIF"#$
云南松 @!(02212%2&-& 云南弥渡 fDUP! OPFFIF"%$
思茅松 @!O%&-(1 [IC5*12+:-12%2&-& 云南大理 HI0D! OPFFIF"%$
樟子松 @!&(*5%&’$-&[IC5G#2+#*-.1 黑龙江 TND0/FE\DIFE"#$
66!种子来源括号内数字指的是种子样品数& *P@YNCDF YCI3ZN4DF 3/0P@F /XVNNU V/PC3NV@NIFVFP@YNC/XVNNU VI@K0NV5
#1#1%6引物来源6&&k引物分别来自松属树种的
%8% 对核 &&k和 #! 对叶绿体 &&k"3K &&k$!包括黑
松".NFUCI@DF %’1*5! #;;8 $%火炬松 ")0VDZ %’1*5!
%$$$# n?/P %’1*5! %$$% $%北美乔松 "@!&’$#:0&$
%9
6第 #$ 期 洑香香等’ 松属近缘种形态和分子鉴定及其亲缘关系探讨
")3?4%’1*5! #;;8$%海岸松"@!=-21&’%$$和地中海松
"@!/1*%=%2&-&$ "h/F p^0N^ %’1*5! %$$%$%小干松"@!
.#2’#$’1 [IC5*1’-;#*-1$ "TD3ZV%’1*5! #;;:$等& (&&k
引物序列是加拿大哥伦比亚大学"qG’$设计并公
布的 #$$ 条单引物 " ?4K’aaMMM5YD/4N3?5PY353Ia
VNC[D3NVaFIKVaKCD@NCVaSCD@NCV5KUX$&
@FCA试验方法
#1%1#6形态性状观察与测定6根据 hG%""% A
#;;;-林木种子检验规程.测定种子的千粒质量!记
录种子的形状%颜色%幼苗下胚轴颜色!萌发结束时
随机测定 7$ 株幼苗子叶数和苗高&
#1%1%6分子检测6用 %>’+,G和微量提取法
"HN0IK/C4I%’1*!#;:7$提取幼苗基因组总 H*,!每
个种批随机取样 7$ 株分别提取个体 H*,!并分别
制备种源和种的混合基因池& #>琼脂糖凝胶电泳
检测并稀释备用&
利用分群法 " YP0ZNU VNECNEI4NIFI0WVDV!G&,$
"fD3?N0@/CN%’1*5! #;;8$筛选 &&k和 (&&k引物&
&&k扩增体系 "#$ $-$为’ %$ c9$ FE的 H*,
模板!U*+S各 $1% @@/0)-A#!%19 @@/0)-A# fE% j!
正反引物各 $19 $@/0)-A#!$1%9 qJ1S酶"+IBIkI!
+Il+f$ 和 # e GPXNC" #$ @@/0)-A# +CDV‘’0#
9$ @@/0)-A# B’0$&扩增采用 4/P3?U/MF S’k程序’
;! d 9 @DF# ;9 d 7$ V%9: d 7$ V"$19 d$a3W30N
至9$ d$%"$ d 7$ V!#8 3W30NV# 当退火温度降至 9$
d时!再运行 %! 循环# "$ d 9 @DF& 扩增产物用
8>变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离!银染检测&
(&&k扩增体系"%9 $-$为’ %$ FEH*,!U*+S
$1%9 @@/0)-A# ! J1S酶 $19 q! # eGPXNC! %1$
@@/0)-A# fE% j! $1: $@/0)-A# 引物& 扩增程序
为’ ;! d " @DF# ;! d 7$ V!98 d !9 V!"% d %
@DF!!$ 个循环# "% d " @DF& #>琼脂糖凝胶电泳
检测&
@FEA数据分析
统计清晰%再现性强的电泳条带!并按 #a$ 形式
进行数据转换& 采用 *+&O& %1#"k/?0X! %$$$$软件
计算 &f相似指数并进行聚类 qShf," PFMNDE?4NU
KIDCEC/PK @N4?/U ICD4?@N4D3I[NCIENV$ 分析&
%6结果与分析
CF@A种子形态和幼苗表型性状的特异性
## 个树种种子及幼苗的形态特征描述见表 %&
油松组树种的种子从形态上很难区分& 从表 % 可
知!只有加勒比松"@!.1$-:1%1$和油松种子的形状
和颜色较易分辨!可以作为鉴定的依据# 而其他树
种基本形状为椭圆形!颜色有黄%灰%黑色!或者一个
种批内混杂着几种颜色!或同种不同种源间颜色差
异也十分显著!因此难以作为鉴定依据&
种子千粒质量是衡量种子大小的重要指标!尽
管不同种源和不同年份的种批千粒质量差异较大!
但其变异不足以影响种间差异& 从表 % 可知!油松%
火炬松%湿地松和加勒比松的千粒质量均在 %$ E以
上!其他树种则在 %$ E以下& 由此可根据千粒质量
"%$ E为界$把 ## 个松属树种分为 % 大类’ 大粒类
种子包括油松%火炬松%湿地松和加勒比松# 小粒类
种子有马尾松%黑松%云南松%高山松%思茅松 "@!
O%&-(1 [IC5*12+:-12%2&-&$%赤松"@!A%2&-;*#$1$和樟
子松"@!&(*5%&’$-&[IC5G#2+#*-.1$&
从幼苗的特性看!各种间差异主要体现在胚轴
的颜色%子叶数及苗高&
松属树种种子萌发初期幼苗下胚轴颜色存在差
异& 观察发现下胚轴颜色为绿色的树种有加勒比
松%马尾松%黑松和赤松# 其余的均表现为红色!并
在整个萌发期间颜色不变&
与被子植物不同的是裸子植物的子叶数在种
内并不是一定的!种内个体间变异很大& 观察表
明!油松的子叶数目变异范围和平均值最大!分别
达到" c#%和 ;1$!可明显区别于其他种# 其次是
火炬松和湿地松!其均值都达到 :1$ 以上& 而且!
各树种不同子叶数个体所占的比例也有明显差异
"图 #,$ &
幼苗高度在种间也差异明显!在种内不同种源
间则受到种子千粒质量的影响& 从表 % 中可以看
出!尽管种内个体间的变异很大!但种群的平均水平
在种间存在明显差异& 火炬松%湿地松和加勒比松
"均值分别为 8179!"1:;!81$: 3@$!明显高于油松
"均值为 91$" 3@$# 而分布于高海拔地区的云南松
和高山松的苗高平均值分别为 71;" 3@和 71:" 3@!
明显区别于其他树种"表 %$& 各树种的苗高分布情
况差异也较大"图 #G$!如火炬松和湿地松苗高达 8
3@以上的个体达 "$>以上!其群体明显高于其他
种# 其他树种有 :$>左右的植株苗高在 !1$ c81$
3@之间&
综合种子和幼苗形态!可将 ## 种松属树种中的
油松%加勒比松鉴定出来& 油松种子大%椭圆形a棕
黄色%子叶数平均高达 ; 个!但其苗高在大粒类种子
中最小# 加勒比松种子大%三角形%暗灰色!大粒类
种子中只有其幼苗的下胚轴呈绿色&
79
林 业 科 学 !" 卷6
表 CA各树种种子及幼苗特性!
)#2BCA3;#-#:$*-/,0/**(/#’(/**(&%’4/,07#-%,树种 &KN3DNV
种子 &NNU 子叶数"个$*P@YNC/X3/4W0NU/F
千粒质量
#$$$‘VNNU MNDE?4aE
形状a颜色
&?IKNa’/0/C
变异范围
kIFEN
均值
fNIF
下胚轴颜色
’/0/C/X?WK/3/4W0
苗高
TNDE?4/XVNNU0DFEa3@
变异范围
kIFEN
均值
fNIF
火炬松@!’1%A1 %% c7% 宽卵圆a暗灰RDUN/[I4NaUICZ ECNW " c; :1$ 红色 kNU 91! c"19 8179
湿地松@!%*-#’- %# c!7 宽卵圆a黄%灰RDUN/[I4NaWN0/M! ECNW " c#$ :17 红色kNU 919 c;1: "1:;
加勒比松@!.1$-:1%1 %% c7" 卵圆a暗灰2[I4NaUICZ ECNW 9 c; 817 绿色hCNNF !1: c817 81$:
马尾松@!G1&-121 : c#! 椭圆a黄)0DKVNaWN0/M 9 c: "1# 绿色hCNNF 718 c91! !17:
黑松@!’/02:%$+- #8 c%$ 椭圆a灰黄)0DKVNaECNWWN0/M 8 c; "19 绿色hCNNF !1% c81% 91#$
赤松@!A%2&-;*#$1 ## c%# 椭圆a灰)0DKVNaECNW " c#$ "19 绿色hCNNF !17 c"1% 91#"
油松@!’1:0*1%;#$G-& 7% c9$ 卵圆a棕黄)0DKVNaYC/MF WN0/M " c#% ;1$ 红色kNU !1% c819 91$"
高山松@!A%2&1’1 ## c%8 椭圆a灰)0DKVNaECNW 8 c; "1$ 红色kNU 71! c!1: 71;"
云南松@!(02212%2&-& ## c#: 椭圆a灰)0DKVNaECNW 9 c: 819 红色kNU 71% c91# 71:"
思茅松 @!O%&-(1 [IC5
*12+:-12%2&-& #7 c%#
椭圆a灰
)0DKVNaECNW 8 c; 81; 红色kNU !17 c"19 9199
樟子松 @!&(*5%&’$-&[IC5
G#2+#*-.1 9 c#$
椭圆a暗灰
)0DKVNaUICZ ECNW 9 c; 81% 红色kNU 71! c91$ !1%8
66!种子千粒质量引自-中国木本植物种子. "国家林业局国有林场和林木种苗工作总站!%$$#$和-+?NR//UWS0IF4&NNU fIFPI0. "G/FFNC%’
1*5! %$$:$ & HI4I/X# $$$‘VNNU MNDE?43D4NU XC/@ - &NNUV/XR//UWS0IF4VDF ’?DFI. "hNFNCI0,U@DFDV4CI4D/F /X&4I4NQ/CNV4QIC@V! +CNN&NNUVIFU
&NNU0DFEV/X&4I4NQ/CNV4CW,U@DFDV4CI4D/F! %$$#$ IFU-+?NR//UWS0IF4&NNU fIFPI0. "G/FFNC%’1*5! %$$:$5
图 #6各树种不同子叶数和苗高植株的数量分布
QDE5#6SNC3NF4IEN/XVNNU0DFEVMD4? UDXNCNF4FP@YNC/X3/4W0NU/F IFU ?NDE?4
T2’ 火炬松 @!’1%A1# &T’ 湿地松 @!%*-#’-# J’ 加勒比松 @!.1$-:1%1# f’ 马尾松 @!G1&-121# T’ 黑松 @!’/02:%$+-# ’’ 赤松 @!
A%2&-;*#$1# O’ 油松@!’1:0*1%;#$G-&# h’ 高山松@!A%2&1’1# O*’ 云南松@!(02212%2&-&# &’ 思茅松@!O%&-(1 [IC5*12+:-12%2&-&# nT’ 樟子松@!
&(*5%&’$-&[IC5G#2+#*-.15下同& +?NVI@NYN0/M5
!9
6第 #$ 期 洑香香等’ 松属近缘种形态和分子鉴定及其亲缘关系探讨
CFCA分子检测
%1%1#6引物筛选6利用分群法"G&,$筛选获得种
内保守%种间有变异的 9 对 &&k和 9 条 (&&k引物
"表 7$&
表 EA用于分析的 !!Q引物和 S!!Q引物!
)#2BEA);*&%/$,0!!Q"-%+*-/#’(S!!Q"-%+*-/&&k (&&k
引物
SCD@NC
引物序列
&NlPNF3N
来源
kNXNCNF3N
引物
SCD@NC
引物序列
&NlPNF3N
S+!9$$%
Q$ ,,h++hh,++++,’’’,hh+h
k$ h,,’,,h,hh,++++++’+’,+,’,
黑松 @!’/02:%$+-3K&&k
".NFUCI@DF %’1*!#;;8$
qG’:%7 "+’$ :’
S4+L7$#7
Q$ h’++’+’’,++,,’+,,++’+,$
k$ +’,,,,++h++’h+,,,,’’+’ 火炬松
@!’1%A1")0VDZ %’1*!%$$$$ qG’:79 ",h$ :O’
S4+L!$;%
Q$ hh+,h,+,’+++’’,+h,h++,hh
k$ +’+,h+’’,h,+’++hh+’’,’ 火炬松
@!’1%A1 "n?/P %’1*!%$$%$ qG’:!$ "h,$ :O+
S4+L!$;:
Q$ h+hhh,’’’’,,h’,’+
k$ ,++h’’+’’+’+++,h+’,+’+’,
qG’:!# "h,$ :O’
kS$
Q$ h+hhh,’’’’,,h’,’+
k$ ,++h’’+’’+’+++,h+’,+’+’, 北美乔松
@!&’$#:0&")3?4%’1*!#;;8$ qG’:99 ",’$ :O+
66!(&&k引物序列中*O+代表*’+或*++ # k代表 ,或 h& *O+ DF VNlPNF3NV/X(&&kKCD@NCNKCNVNF4V*’+ /C*++ ! IFU *k+ CNKCNVNF4V*,+ /C
*h+5
%1%1%6利用 &&k和(&&k联合鉴定松属树种6根据
种质鉴定的要求!只对在种内保守而在种间有变异
的特异性引物进行扩增鉴定"图 %!图 7$& 利用 9 对
&&k引物和 9 条 (&&k引物对混合基因池和个体基
因组的扩增检测!其中有 ; 个树种获得了特异性扩
增产物!火炬松需 % 个引物的 % 个特异性条带可联
合鉴定出来!仅有高山松没有获得特异性产物 "表
!$&
图 %6&&k引物 S4+L!$;: 鉴定部分松属树种
QDE5%6@-20&VKN3DNVDUNF4DXDNU PVDFE&&kKCD@NCS4+L!$;:
每 8 个泳道为同一树种的 8 个个体& )[NCW8 0IFNVMNCN8 VNNU0DFEVXC/@VI@NVKN3DNV5
图 76(&&k引物 qG’‘:99 对部分松属树种的鉴定
QDE576@-20&VKN3DNVDUNF4DXDNU PVDFE(&&kKCD@NCqG’‘:99
每个泳道为 # 个种源的混合基因池& )I3? 0IFNCNXNCV@D_NU ENFNK//0XC/@/FNKC/[NFIF3N/XVI@NVKN3DNV5
CFEA基于 !!Q标记的松属"油松组#亲缘关系分析
通过 9 对 &&k引物对所有材料的扩增产物分析!
共获得 !: 个等位基因!其中种内保守%种间多态性位
点有 !# 个!多态性比例为 :91!>& 利用 *+&O& %1$
计算 #$ 个松属树种间的相似系数!用qShf,法对其
进行系统聚类"图 !$分析!在相似系数 $18$ 处将 #$
个树种分为 7 个类群& 从图 ! 中可知!马尾松和赤松
聚为第 # 个类群# 亲缘关系较近的云南松%思茅松%
99
林 业 科 学 !" 卷6
高山松%油松聚成一小类!和另一小类即黑松%樟子松
聚成第 % 个类群!它与第 # 类群关系较近又相对独
立# 第 7 类群为火炬松和加勒比松!它与前 % 个类群
亲缘关系较远!其相似系数仅为 $1!%&
表 GA用于鉴别的种特异性引物和片段!
)#2BGA!"*:%*/P/"*:%0%:"-%+*-/#’(0-#4+*’$/树种 &KN3DNV 标记类型 fICZNC4WKN 鉴定引物 SCD@NC 片段大小 QCIE@NF4VD^NaYK
火炬松 @!’1%A1 &&k S4+L!$;: jS4+L7$#7! #;% j#79!
湿地松 @!%*-#’- (&&k qG’:!$! qG’:!# 7:$! # $:$
加勒比松 @!.1$-:1%1 &&k S4+L7$#7 #79
马尾松 @!G1&-121 &&k S4+L7$#7! kS$ ##$! #7$ a#9$
黑松 @!’/02:%$+- (&&k qG’:%7 # #$$
赤松 @!A%2&-;*#$1 (&&k qG’:99 !#$
油松 @!’1:0*1%;#$G-& (&&k qG’:!# # !9$
云南松 @!(02212%2&-& &&k S4+L!$;:! S4+L!$;% %!9! ;9
思茅松 @!O%&-(1 [IC5*12+:-12%2&-& (&&k qG’:79! qG’:!$ # !9$! 89$
樟子松 @!&(*5%&’$-&[IC5G#2+#*-.1 &&k S+!9$$%! S4+L!$;% #!$! #9$
66!!!% 个引物联合鉴定& ! CNXNCV4?I4VKN3DNVMIV\/DF4DUNF4DXDNU PVDFE4M/KCD@NCV5
图 !6基于 &&k标记构建的 #$ 个松属树种亲缘关系
QDE5!6qShf,UNFUC/ECI@V?/MDFE4?NK?W0/ENFN4D3
CN0I4D/FV?DK I@/FE#$ KDFN4CNNVYIVNU /F &&k@ICZNCV
76讨论
EF@A松属"油松组#树种鉴定
松属"油松组$大部分树种为我国的主要造林
树种!具有很高的生态和经济价值!如马尾松%油松%
湿地松等& 但由于松属树种进化历史相同且伴随广
泛的基因交流!近缘种的短期隔离不足以产生基因
库的显著分化"GP33D%’1*5! #;;:$!因而许多种间的
系统学关系模糊不清& 松属许多种的种子%幼苗和
成年树的形态特征高度相似# 细胞水平上!松属"油
松组$树种具有相同的染色体数目 %2 i%! 和极其
相似的核型"吴若菁等! #;;!$!因而无论从形态还
是细胞水平上进行种质鉴定都存在一定的困难&
形态鉴定之难在于种间的差异较小!或者由于
种间分布区重叠!种间发生着不同程度的基因渐渗
杂交"虞泓等! %$$$# -D%’1*5! %$#$$!从而使得种间
的分类界限模糊!分类鉴定困难# 同时有些树种分
布范围广!种内常因种源%立地条件%不同年份气象
因子而产生更大的差异 "虞泓等! %$$$# kN?XN0U4!
#;;#$!这也使得一些种或变异类型的分类学地位
长时间处于混乱状态!如高山松和巴山松 "@!
/%2$(-$"杨雪等! %$$"$& 本研究发现!## 个松属树
种的种子和幼苗形态存在一些差异!结合种子形状%
颜色%千粒质量和幼苗子叶数%下胚轴颜色%苗高!仅
可把油松%加勒比松鉴定出来!其余的树种由于没有
特异的形态特征!难以鉴定&
鉴于形态鉴定的困难!利用分子技术从基因组
水平上进行鉴定被广泛接受!如 k,SH可区分马尾
松和黄山松!,Q-S鉴定油松%云南松%黄山松和黑
松"李淑娴等! %$$7$& 但这些研究所涉及的树种
少!同时没有真正找到种特有性引物或种特异性位
点来进行快速有效的鉴定&
利用 &&k标记鉴定近缘种及杂种具准确%快
速%简单的优点!现已被广泛接受 "张红莲等!
%$#$$!但其引物大部分来源于近缘种& &&k引物的
通用性取决于近缘分类群之间微卫星侧翼序列的保
守性和进化过程中微卫星的稳定性& 遗传距离近的
物种 &&k引物的通用性更高!近 ;$>的亚属间转移
都获得成功!但其通用率的高低仍是较大的困惑&
h/F p^0N^‘fIC4oFN^等"%$$!$研究发现油松组的通用
率为 78> c9;>!稍高于亚组 @-2%1%和 @21&’%$
7%> c!9># T/UEN4V等"%$$#$利用白云杉"@-.%1
+*10.1$的 9 对引物验证在属内的通用率较高!但在
松属中无扩增产物& 本研究结果表明!尽管来自于
松属树种的 &&k引物在油松组的通用率不高!但仍
有 9 对引物符合种内保守种间存在变异的要求%同
时在 #$ 个树种中获得扩增产物"其中湿地松由于
在种内变异大!研究时放弃了该树种$!并产生 ; 个
种特异性位点!可有效鉴定出马尾松%火炬松%加勒
比松%云南松%樟子松# 结合 9 个 (&&k引物扩增出
的 " 个种特异性位点!可鉴定出湿地松%黑松%赤松%
89
6第 #$ 期 洑香香等’ 松属近缘种形态和分子鉴定及其亲缘关系探讨
思茅松%油松& 综合 % 种标记方法!可把 ## 个松属
树种中的 #$ 个鉴定出来!仅有高山松没有获得种特
异性位点!这可能与高山松复杂的遗传背景有关&
&/FE等 " %$$%# %$$7 $ 通过对父系遗传的叶绿体
H*,和母系遗传的线粒体 H*,的对比分析!发现
高山松有些居群的起源是以油松为母本云南松为父
本的组合!有的则正好相反# 或是由于高山松与同
一分布区内云南松和思茅松发生了基因渐渗杂交所
致"虞泓等! %$$$$!其种子的形状%颜色%千粒质量
和苗高与云南松相似!而幼苗的子叶数则介于油松
和云南松之间& 因此从分子水平上难以鉴定&
EFCA松属"油松组#树种亲缘关系探讨
随着分子生物学的发展!H*,序列变异越来越
多地应用于研究物种的进化关系!因为它直接反映
了遗传物质的变异& 利用 3KH*,和 @4H*,进行系
统发育的研究结果和传统的形态分类基本一致
")3ZNC4%’1*5! %$$8# hNIUI-{KN^%’1*5! %$$%# 卢孟
柱等! #;;;$&
本研究首次利用松属树种开发的 &&k引物!对
松属"油松组$树种进行了系统发育的研究& 利用 9
对 &&k引物获得的 !# 个多态性位点构建的 #$ 个树
种的系统进化关系与传统的分类地位比较一致& 其
中云南松%思茅松%高山松和油松表现出亲缘关系很
近!聚为一小类& 来自形态学%解剖学%等位酶%
3KH*,的证据都表明高山松是云南松和油松的天然
杂种 "管中天! #;:## RIFE%’1*5! #;;$I# #;;$Y#
#;;!$# 大量研究表明云南松%油松%高山松和思茅松
的遗传距离很小"虞泓等! %$$$# 卢孟柱等! #;;;#
)3ZNC4%’1*5! %$$8$!说明其遗传分化并不明显!其原
因在于它们在地理位置上的相互交错!且存在着广泛
的基因渗入& 从 #$ 个松属种的系统发育关系来看!
马尾松和赤松占据中间类型!它们可能是几个近缘种
中分化较早的原始类型!但进化缓慢# 而进化较快的
油松类群则是近# $$$万年内物种扩散%生态隔离的
结果")3ZNC4%’1*5! %$$8$# 火炬松和加勒比松成为独
立的类群!与二者起源于北美东南部密切相关!也与
)3ZNC4等"%$$8$的研究结果一致& 但本文的研究结
果显示赤松和马尾松亲缘关系较近!而与樟子松的关
系较远!这与)3ZNC4等"%$$8$的结果存在差异& 研究
认为樟子松为欧洲赤松分布至远东的地理变种!因此
赤松与樟子松的关系应更近& 这可能是由于本研究
的种子只来源于山东!而其主要分布区则在东北地
区!因而结果存在一定的偏差# 同时分子标记类型也
可能产生一定的影响&
用于研究生物系统进化的 H*,序列大都为相
对比较保守的 3KH*,!@4H*,和 FCH*,序列!而
&&k较少用于种的亲缘关系探讨!一是它在种内就
存在很高的变异!二是在种间的通用率较低& 本研
究通过大量筛选!仅获得 9 对 &&k引物!但分析结
果与文献报道结果基本一致!表明种内保守种间有
变异的 &&k引物可应用于系统进化分析& 但需要
注意的是每个种要尽可能涵盖所有的地理种源!进
行全面的居群遗传学研究!在了解种间基因交流及
物种的生态隔离机制之后!才能正确阐明松属 "油
松组$树种的系统进化规律和亲缘关系&
参 考 文 献
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卢孟柱! & @^DU4,)5#;;;1松属线粒体基因序列变异研究5林业科
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学报! 78"9$ ’ "!; A"9!5
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"(&&k$5+CNNS?WVD/0/EW! %9"#$$ ’ #%;9 A#7$%5
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GP33Dh! ,F D^UNDf! fIUIE?DN0N,! %’1*5#;;:1HN4N34D/F /X?IK0/4WKD3
[ICDI4D/F IFU FI4PCI0?WYCDUD^I4D/F DF ?I0NKNFVDV‘3/@K0N_ KDFN
VKN3DNVPVDFE3?0/C/K0IV4VD@K0NVNlPNF3NCNKNI4" &&k$ @ICZNCV5
f/0N3P0IC)3/0/EW! ""#%$ ’ #877 A#8!75
’?IVNfR! &/04DVH)! 20@V4NIU kh! %’1*5#;;71S?W0/ENFN4D3V/X
VNNU K0IF4V’ IF IFI0WVDV/XFP30N/4DUNVNlPNF3NVXC/@ 4?NK0IV4DU
ENFN$:.95,FFI0V/X4?NfDVV/PCDG/4IFD3I0hICUNF! :$"7$ ’ 9%: A
"9
林 业 科 学 !" 卷6
9:$5
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H/F/E?PNfJ! &IFUNCV/F fJ5#;;%1+?NVPD4IYD0D4W/X@/0N3P0ICIFU
@/CK?/0/ED3I0N[DUNF3NDF CN3/FV4CP34DFEK0IF4K?W0/ENFWaa&/04DVS
&! &/04DVH)! H/W0NJJ5f/0N3P0ICVWV4N@I4D3V/XK0IF4V5*NM
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@D3C/VI4N0D4N@ICZNCVDF NIV4NCF M?D4NKDFN5hNF/@N! 7;"8$ ’ ##$%
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)3ZNC4,J! TI0GH5%$$81S?W0/ENFW! ?DV4/CD3I0YD/EN/ECIK?W! IFU
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)0VDZ ’h! fDFD?IF .+! TI0& )! %’1*5%$$$1-/M‘3/KW@D3C/VI4N0D4N
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’?DFI5&3DNF3NSCNVV! GND\DFE# fDVV/PCDG/4IFD3I0hICUNF SCNVV! &4
-/PDV! ## A%95
hNIUI-{KN^ h! BI@DWIB! TICIUIB5%$$%1S?W0/ENFN4D3CN0I4D/FV?DKV
/XHDK0/_W0/F KDFNV"VPYENFPV@-20&$ YIVNU /F K0IV4DU VNlPNF3N
UI4I5(F4NCFI4D/FI0J/PCFI0/XS0IF4&3DNF3NV! #87"9$ ’ "7" A"!"5
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CN0I4D/FV?DK 4/@-.%1 G1$-1215’IFIUDIF J/PCFI0/XG/4IFW! 9!";$ ’
":# A:#75
h/F p^0N^‘fIC4oFN^ & ’! hNCYNC&! ’NC[NCIf+! %’1*5%$$%1&NNU ENFN
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=-21&’%$,D45$ PVDFEFP30NIC@D3C/VI4N0D4N@ICZNCV5+?N/CN4D3I0IFU
,KK0DNU hNFN4D3V! #$!":$ ’ #%;$ A#%;"5
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#$7 A###5
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I@/FEVKN3DNV/XB/CNIF 3*-0GVN345,1..0*-;%$0G ",0DI3NIN$ IFU
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0DFZNU 4/UDVNIVNCNVDV4IF4ENFNYWYP0ZNU VNECNEI4D/F K/KP0I4D/F5
SC/3NNUDFEV/X*I4D/FI0,3IUN@W&3DNF3NV! ::"%#$ ’ ;:%: A;:7%5
f/CENFV4NCF )B! QICCICJ-5#;8!1(F4C/ECNVVD[N?WYCDUD^I4D/F DF CNU
VKCP3NIFU Y0I3Z VKCP3N5 +N3?FD3I0kNK/C4*/5 !1 +/C/F4/!
2F4ICD/’ QI3P04W/XQ/CNV4CW! qFD[NCVD4W/X+/C/F4/! # A!85
kN?XN0U4)h5#;;#1, @/UN0/XENFN4D3[ICDI4D/F KI4NCF /X@-20&
=#2A%$#&1 IFU D4VIKK0D3I4D/F DF ENFN CNV/PC3NV@IFIEN@NF45
’IFIUDIF J/PCFI0/XQ/CNV4kNVNIC3?! %#"#$$ ’ #!;# A#9$$5
kDNVNYNCE-T5#;;"1TWYCDU /CDEDFV/XK0IF4VKN3DNV5,FFPI0kN[DNM/X
)3/0/EWIFU &WV4N@I4D3V! %:"#$ ’ 79; A7:;5
k/?0XQJ5%$$$1*+&O&‘S’! FP@NCD3I04I_/F/@WIFU @P04D[ICDI4N
IFI0WVDVVWV4N@5.NCVD/F %1#$N5*NMO/CZ! q&,’ )_N4NC&/X4MICN!
&N4IPZN45
k/VV‘HI[DV,! TPIFEn! f3BNFFIJ! %’1*5%$$:1f/CK?/0/ED3I0IFU
@/0N3P0IC@N4?/UV4/DUNF4DXWYP4NCFP4" X0+*12&.-2%$%1 $ IFU
YP4NCFP4?WYCDUV’ CN0N[IF3N 4/ YP4NCFP4 3/FVNC[I4D/F5 +CNN
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!责任编辑6徐6红"
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