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Genetic Diversity and Genetic Relationship of Pomegranate(Punica granatum) in Sichuan and Yunnan Evaluated by AFLP Markers

川滇石榴品种遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析


For better exploiting pomegranate resources in Sichuan and Yunnan, we analysed the DNA polymorphism of 42 pomegranate cultivars by AFLP markers.NTSYSpc-2.10 software was used to analyze and the result indicated that the genetic similarity coefficient (Sg) ranged from 0.712 7 to 0.925 4 with an average of 0.814 2; An analysis with PopGen32 software revealed that 362 bands amplified by 5 pairs of polymorphic AFLP primers had 235 polymorphic loci,the percentage of polymorphic bands was 65.66%. The effective number of alleles per locus (Ne),Neis gene diversity (H),Shannon information index (I) were respectively 1.260 7,0.160 3,0.253 1,suggesting that there was relative great genetic diversity among pomegranate germplasm in Sichuan and Yunnan cultivars.UPGMA method was used to construct a phylogenetic tree. The 42 cultivars were isolated completely by 5 pairs of AFLP primers, with genetic similarity coefficient (Sg) 0.82 for the threshold value,and the 42 pomegranate cultivars in Sichuan and Yunnan were divided into four taxa,which showed genetic relationship among the 42 pomegranate cultivars in Sichuan and Yunnan at molecular level and would be helpful for future research and utilization of the pomegranate germplasm. Additionally, 18 specific bands were detected,which would be used as referential identification tags for the relevant 13 pomegranate cultivars.


全 文 :第 !" 卷 第 ## 期
$ % # % 年 ## 月
林 业 科 学
&’()*+(, &(-.,) &(*(’,)
./01!"!*/1##
*/23!$ % # %
川滇石榴品种遗传多样性及亲缘关系的 ,@-k分析!
赵丽华#!$4李名扬#4王先磊#
"#1西南大学园艺园林学院 重庆市花卉工程技术研究中心4重庆 !%%:#8#
$1西昌学院农业科学学院4西昌 "#8%#5$
关键词’4 石榴# ,@-k# 遗传多样性# 亲缘关系# 四川# 云南
中图分类号! &:#71!"" &:#71!6444文献标识码!,444文章编号!#%%# >:!77#$%#%$## >%#"7 >%"
收稿日期’ $%#% >%8 >#5# 修回日期’ $%#% >%6 >$#&
基金项目’ 四川省教育厅科研基金"%7‘R%#!$ ! 西昌学院课题"B\&,%"#8$ &
!李名扬为通讯作者&
L.).’(-E(A.,/(’: &)@(-+$&)&)<]$))&)GA&%$&’.<8: 7KJ!3&,V.,/
H=G/-D=EG#!$4-D]DIJNGIJ#4LGIJ[DGI0MD#
"#I@$%)6)$&9$(+4"5%+5()/01 ./01*"/2)3("#4+)"+5()!!$5+#Q)*+7048)(*4+,4@#$06D406 ’%$Q)(<0640))(406 F)"#0$%$6,K)*)/("#
@)0+)(4@#$06D406 !%%:#8# $I!"#$$%$&36(4"5%+5(/%!"4)0")*! C4"#/06 @$%)6)4C4"#/06 "#8%#5$
78/’,&-’’4@/VZMTMVM_S0/DTDIJS/;MJVGIGTMVMW/EVRMWDI &DR=EGI GIU BEIIGI! YMGIG0NWMU T=MK*,S/0N;/VS=DW;/X
!$ S/;MJVGIGTMRE0TD2GVWZN,@-k;GVdMVW3*+&B&SR^$3#% W/XTYGVMYGWEWMU T/GIG0N‘MGIU T=MVMWE0TDIUDRGTMU T=GTT=M
JMIMTDRWD;D0GVDTNR/MXDRDMIT" !J$ VGIJMU XV/; %1:#$ : T/%16$8 ! YDT= GI G2MVGJM/X%17#! $# ,I GIG0NWDWYDT=
k/SOMI5$ W/XTYGVMVM2MG0MU T=GT5"$ ZGIUWG;S0DXDMU ZN8 SGDVW/XS/0N;/VS=DR,@-kSVD;MVW=GU $58 S/0N;/VS=DR0/RD!
T=MSMVRMITGJM/XS/0N;/VS=DRZGIUWYGW"81""a3+=MMXMRTD2MIE;ZMV/XG0M0MWSMV0/REW"OM$!*MD(WJMIMUD2MVWDTN
"9$!&=GII/I DIX/V;GTD/I DIUM_">$ YMVMVMWSMRTD2M0N#1$"% :!%1#"% 5!%1$85 #!WEJJMWTDIJT=GTT=MVMYGWVM0GTD2MJVMGT
JMIMTDRUD2MVWDTNG;/IJS/;MJVGIGTMJMV;S0GW;DI &DR=EGI GIU BEIIGI RE0TD2GVW3pkO],;MT=/U YGWEWMU T/R/IWTVERTG
S=N0/JMIMTDRTVMM3+=M!$ RE0TD2GVWYMVMDW/0GTMU R/;S0MTM0NZN8 SGDVW/X,@-kSVD;MVW! YDT= JMIMTDRWD;D0GVDTNR/MXDRDMIT
" !J$ %17$ X/VT=MT=VMW=/0U 2G0EM!GIU T=M!$ S/;MJVGIGTMRE0TD2GVWDI &DR=EGI GIU BEIIGI YMVMUD2DUMU DIT/X/EVTG_G!
Y=DR= W=/YMU JMIMTDRVM0GTD/IW=DS G;/IJT=M!$ S/;MJVGIGTMRE0TD2GVWDI &DR=EGI GIU BEIIGI GT;/0MRE0GV0M2M0GIU
Y/E0U ZM=M0SXE0X/VXETEVMVMWMGVR= GIU ETD0D‘GTD/I /XT=MS/;MJVGIGTMJMV;S0GW;3,UUDTD/IG0N! #7 WSMRDXDRZGIUWYMVM
UMTMRTMU!Y=DR= Y/E0U ZMEWMU GWVMXMVMITDG0DUMITDXDRGTD/I TGJWX/VT=MVM0M2GIT#5 S/;MJVGIGTMRE0TD2GVW3
9.: ;",44石榴"?504"/ 6(/0/+5=$为石榴科"kEIDRGRMGM$
石榴属"?504"/$落叶灌木或小乔木!原产伊朗%阿富
汗等中亚一带!从西汉张骞出使西域将涂林安石榴
引入我国!石榴作为水果和观赏树木在我国已有
$ %%%多年的栽培历史& 经长期天然杂交和基因突
变!以及采用实生%分株%嫁接等多种繁殖方法!产生
了复杂而多样的品种和类型!据不完全统计!我国现
有石榴品种资源 $%% 多个!遍及南北各地 $% 多个省
区!形成了山东枣庄%新疆叶城%陕西临潼%安徽怀
远%河南开封%云南蒙自和四川会理等著名的栽培区
"汪小飞!$%%:$& 近年来!随着石榴的营养及药用
价值的发掘!国内外对石榴品种资源的调查和分类
研究也越来越多!除应用形态学%细胞学和生化水平
的品种分类外 "汪小飞!$%%:$!也有学者应用分子
标记对石榴品种资源进行调查和分类研究!如应用
A,kK标记对中国及突尼斯部分石榴品种进行了研
究"杨荣萍等!$%%:# 热娜(卡司木等!$%%7# 卢龙斗
等!$%%:# 巩雪梅!$%%!# ’/4dEI )+/%1! $%%7$!应用
&A,k标记对中国部分石榴品种及印度部分石榴品
种进行了研究 "张四普等! $%%7# AGIGUM)+/%I!
$%%6$!应用 ,@-k标记分别对中国"其中包括 8 个
川滇石榴品种$和突尼斯部分石榴品种进行了研究
"苑兆和等!$%%7# \ZDV)+/%I! $%%7$!为石榴种资资
源的研究提供了分子依据&
,@-k技术以其准确%高效的特点在植物的亲
缘关系%遗传图谱构建%抗病性研究等方面的应用已
4第 ## 期 赵丽华等’ 川滇石榴品种遗传多样性及亲缘关系的 ,@-k分析
十分广泛"乔勇等!$%%6# 闵会等!$%%6# 臧德奎等!
$%%6# 韩远记等!$%%7# 陈良华等!$%%6# 马庆华等!
$%%6$& 石榴在云南引种栽培后!形成 !% 余个地方
品种!在四川引种栽培后!形成 #% 余个地方品种!这
些品种间的亲缘关系和系统演化并不清楚!且目前
尚未有针对川滇石榴品种利用 ,@-k技术进行研究
的报道!为了明确四川%云南石榴品种间的遗传多样
性和亲缘关系!本研究利用 ,@-k标记技术对四川%
云南石榴的遗传多样性与亲缘关系进行分析!以期
为石榴种下分类提供分子依据!为更合理地保护四
川%云南石榴资源及选育新品种提供遗传信息&
#4材料与方法
#3#4材料4供试 !$ 个石榴品种于 $%%7 年 ! 月采
自云南蒙自县石榴研究所石榴品种资源圃%会泽县
果园!四川会理县农业局石榴品种资源圃%攀枝花市
果园"表 #$& 每个品种选 5 98 株健壮%无病虫害石
榴树采 5% 98% 片嫩叶!装于自封口塑料袋中!用冰
壶运回!于 >:% j冰箱保存&
#3$4试验方法4#$K*,提取及检测4采用改良
’+,C法从石榴幼叶中提取基因组 K*,"赵丽华等!
$%%6$!并稍加改进’ ’+,C裂解液加入硼砂终浓度为
%1%#8 ;/0(->#!"8 j水浴 # =& %17a"Qi8$的琼脂糖
凝胶电泳检测 K*,纯度!ZD/WSMR^;DIDK*,iA*,i
SV/TMDI 核酸蛋白分析仪测定 K*,含量!最后稀释为
#%% IJ(-->#工作液!放入 >$% j冰箱里备用&
$$,@-k分析4酶切’H*)#%<"$A#内切酶购
自 *)C公司& $% --酶切体系为’ K*,模板 5 --
"#%% IJ(--># $! H*)#及 <"$A#各 8 p!C&,"#%%
-J(;-># $%1$ --!*)CEXMV$ 为 $ --!加 UUF$o至
$% --混匀后! 5: j 恒温酶切 " =! "8 j 灭活
$% ;DI&
表 =>石榴品种的编号%名称%原产地
2&8?=>N"?& )&F.& &)<",(6()"0#"F.6,&)&’.#*$/&0" 5)"/"-$.$ -$%’(A&,/
编号
*/3
名称
*G;M
原产地
oVDJDI
编号
*/3
名称
*G;M
原产地
oVDJDI
# ,红皮白籽- ,F/IJSDZGD‘D- 云南禄丰 -EXMIJ!BEIIGI $$ ,莹皮- ,BDIJSD- 云南会泽 FED‘M!BEIIGI
$ ,红皮红籽- ,F/IJSD=/IJ‘D- 云南禄丰 -EXMIJ!BEIIGI $5 ,绿皮酸- ,-2SDWEGI- 云南会泽 FED‘M!BEIIGI
5 ,大铁壳红- ,KGTDMdM=/IJ- 云南禄丰 -EXMIJ!BEIIGI $! ,红袍- ,F/IJSG/- 云南会泽 FED‘M!BEIIGI
! ,铁壳白籽- ,+DMdMZGD‘D- 云南禄丰 -EXMIJ!BEIIGI $8 ,糯石榴- ,*E/W=D0DE- 云南会泽 FED‘M!BEIIGI
8 ,青皮白籽- ,?DIJSDZGD‘D- 云南禄丰 -EXMIJ!BEIIGI $" ,铜壳石榴- ,+/IJdMW=D0DE- 云南巧家 ?DG/PDG!BEIIGI
" ,汤碗石榴- ,+GIJYGIW=D0DE- 云南开远 lGDNEGI!BEIIGI $: ,红壳石榴- ,F/IJdMW=D0DE- 云南巧家 ?DG/PDG!BEIIGI
:
,永丰早白石榴-
,B/IJXMIJ‘G/ZGDW=D0DE-
云南开远 lGDNEGI!BEIIGI $7 ,青壳石榴- ,?DIJdMW=D0DE- 云南巧家 ?DG/PDG!BEIIGI
7 ,青皮石榴- ,?DIJSDW=D0DE- 云南蒙自 ]MIJ‘D!BEIIGI $6 ,大籽酸石榴- ,KG‘DWEGIW=D0DE- 云南建水 \DGIW=ED!BEIIGI
6 ,厚皮甜砂籽- ,F/ESDTDGIW=G‘D- 云南蒙自 ]MIJ‘D!BEIIGI 5% ,细籽酸石榴- ,[D‘DWEGIW=D0DE- 云南建水 \DGIW=ED!BEIIGI
#% ,甜绿籽- ,+DGI02‘D- 云南蒙自 ]MIJ‘D!BEIIGI 5# ,酸甜石榴- , &EGITDGIW=D0DE- 云南建水 \DGIW=ED!BEIIGI
## ,白花甜石榴- ,CGD=EGTDGIW=D0DE- 云南蒙自 ]MIJ‘D!BEIIGI 5$ ,黑皮石榴- ,FMDSDW=D0DE- 云南建水 \DGIW=ED!BEIIGI
#$ ,甜光颜- ,+DGIJEGIJNGI- 云南蒙自 ]MIJ‘D!BEIIGI 55 ,姜驿石榴- ,\DGIJNDW=D0DE- 云南元谋 BEGI;/E!BEIIGI
#5 ,酸绿籽- , &EGI02‘D- 云南蒙自 ]MIJ‘D!BEIIGI 5! ,黄皮甜- ,FEGIJSDTDGI- 四川会理 FED0D!&DR=EGI
#! ,乍甸酸石榴- ,H=GUDGIWEGIW=D0DE- 云南蒙自 ]MIJ‘D!BEIIGI 58 ,黄皮酸- ,FEGIJSDWEGI- 四川会理 FED0D!&DR=EGI
#8 ,酸光颜- , &EGIJEGIJNGI- 云南蒙自 ]MIJ‘D!BEIIGI 5" ,软核酸石榴- ,AEGI=MWEGIW=D0DE- 四川会理 FED0D!&DR=EGI
#" ,火石榴- ,FE/W=D0DE- 云南蒙自 ]MIJ‘D!BEIIGI 5: ,白皮石榴- ,CGDSDW=D0DE- 四川会理 FED0D!&DR=EGI
#: ,绿皮甜- ,-2SDTDGI- 云南会泽 FED‘M!BEIIGI 57 ,会理红皮- ,FED0D=/IJSD- 四川会理 FED0D!&DR=EGI
#7 ,花红皮- ,FEG=/IJSD- 云南会泽 FED‘M!BEIIGI 56 ,青皮软籽- ,?DIJSDVEGI‘D- 四川会理 FED0D!&DR=EGI
#6 ,火炮石榴- ,FE/SG/W=D0DE- 云南会泽 FED‘M!BEIIGI !% ,大绿籽- ,KG02‘D- 四川攀枝花 kGI‘=D=EG!&DR=EGI
$% ,红皮酸- ,F/IJSDWEGI- 云南会泽 FED‘M!BEIIGI !# ,水晶石榴- , &=EDPDIJW=D0DE- 四川攀枝花 kGI‘=D=EG!&DR=EGI
$# ,白花石榴- ,CGD=EGW=D0DE- 云南会泽 FED‘M!BEIIGI !$ ,青皮石榴- ,?DIJSDW=D0DE- 四川攀枝花 kGI‘=D=EG!&DR=EGI
44连接’ +! K*,连接酶购自 *)C公司!H*)#接
头%<"$A#接头%预扩和选扩引物序列参照周延清
"$%%8$报道!由上海英骏生物技术有限公司合成&
$% --连接体系’ H*)#和 <"$A#接头 "$% ;;/0(
->#$各 %18 --!+! K*,连接酶 $ p!+! K*,连接
酶缓冲液 $ --!酶切过的 K*,样品 #8 --!加
UUF$o至 $% --! #" j恒温 5 = 以上&
预扩增’ F/DK*,聚合酶购自宝生物工程有限
公司& $8 --预扩增反应体系’ 连接产物作预扩模
板取 $ --! ]J$ q "$8 ;;/0(-># $ #18 --! U*+kW
"$18 ;;/0(-># $ #18 --! H*)# ’^和 <"$A# ,^预
扩引物 "#% ;;/0(-># $各 # --!F/DK*,聚合酶 #
p!#% mk’ACEXMV$18 --!加 UUF$o至 $8 --混
匀& 预扩程序’ 6! j $ ;DI# 6! j 5% W!8" j 5% W!
6"#
林 业 科 学 !" 卷4
:$ j 7% W!5% 个循环# :$ j " ;DI!! j保存& 预扩
增产物在 #a琼脂糖凝胶上电泳检测&
选择性扩增’ 预扩增产物稀释 #% 倍作选择性
扩增的模板!取 $ --! ]J$ q"$8 ;;/0(->#$#18 --!
U*+kW"$18 ;;/0(-># $#18 --! H*)#和 <"$A#选
扩引物"#% ;;/0(->#$# --"表 $$!F/DK*,聚合酶
# p!#% mk’ACEXMV为 $18 --!加 UUF$o至 $8 --!
混匀& 选扩程序为 6! j $ ;DI# 6! j 5% W!"8 j 5%
W!:$ j 7% W!共 #$ 个循环!退火温度每循环下降
%1: j# 6! j 5% W!88 j 5% W!:$ j 7% W!共 $5 个
循环# :$ j " ;DI!最后 ! j保存& 选扩产物在 #a
琼脂糖凝胶上电泳检测& 每对引物重复 # 次&
电泳及银染’选扩增产物加 8 --上样缓冲液
"67a甲酰胺! #% ;;/0(-># )K+,!SF71%!%1$8a
二甲苯氰!%1$8a溴酚蓝$!经 68 j变性 #% ;DI 后!
置于冰上备用& 制备 "a的变性聚丙烯酰胺凝胶!
预电泳"电压 # 7%% .$至胶板温度为 !% j以上!上
样选扩产物 7 --继续电泳!$18 = 后停止电泳& 凝
胶采用银染方法显带!银染法按宋国立等"#666$的
方法进行!干燥后!拍照保存&
#154数据处理4采用 ’V/WW’=MRdMV^$16# 版软件对
$ 次重复试验中稳定出现的条带进行统计!在相同
迁移位置上有带记录为 #!无带记录为 %!统计各对
引物的扩增位点!建立 *%!# +二元数据矩阵& 用
k/SOMI5$ 软件计算等位基因数 "OG$%有效等位基
因数"OM$%*MD(W基因多样性"9$%&=GII/I 信息指数
">$%多态位点百分率"?$& 用 *+&B&SR^$1#% 版软
件计算 !$ 个石榴品种间遗传相似系数 " !J$!用
pkO],法构建亲缘关系聚类树状图&
$4结果及分析
$1#4K*,检测4由琼脂糖凝胶电泳检测所提
K*,!结果显示’ 点样孔干净!K*,主带清晰!无弥
散现象# 由核酸蛋白仪检测结果显示’ oK$"% ioK$7%
值在 #17%8 9#177! 之间!oK$"% ioK$5%值大于 $1%&
结果表明!所提石榴基因组 K*,符合 ,@-k标记的
要求&
$1$4,@-k扩增产物多态性4从 "! 对 <"$A#i
H*)#引物中筛选出多态性好的 8 对引物"表 $$对
!$ 个石榴品种进行 ,@-k扩增!由琼脂糖凝胶电泳
可见预扩增及选择性扩增产物"图 #$呈弥散状!片
段集中于 8% 9:8% ZS& "a变性聚丙烯酰胺凝胶电
泳分离 8 对选扩引物产物!共统计到 5"$ 条 K*,条
带! 平均每对引物扩增条带数为 :$1! 条!其中多态
性条带为 $58 条!平均每对引物扩增多态性条带为
!: 条!多态性条带比率为 "81""a&
利用 k/SOMI5$ 软件对石榴选择性扩增的 K*,
条带进行分析"表 $$!8 对引物扩增产物多态性百
分率 在 8818"a 9:8165a 之 间& 其 中 引 物 对
)^,,Oi]^’,,扩增条带数最少!为 8! 条!但多态性
条带比率最高 " :8165a$# 引物对 )^,’,i]’^+’
扩增条带数最多!为 6! 条!但多态性比率较低
""%1"!a$& 结果表明!采用不同的引物对进行石
榴选择性扩增!扩增出的谱带数差异较大!但多态性
谱带的比例差异不大& 每个位点的等位基因数
"OG$ 为 #1888 " 9#1:86 5! 平均 #1"8" "# 有效
等 位 基 因 数 " OM$ 为 #1$## # 9#15#% 7! 平 均
#1$"% :# *MD|W基 因 多 样 性 " 9$ 为 %1#5$ % 9
4444表 B>四川%云南石榴遗传多样性的 7KJ!分析!
2&8?B>7KJ!6.).’(-<(A.,/(’: "0#"F.6,&)&’.()@(-+$&)&)<]$))&)!,"A()-.
引物
kVD;MV
O 3S ?aa OW
OG
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OM
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9
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平均 ]MGI :$1! !: "81"" 51" #1"8" " #1$"% : %1#"% 5 %1$85 #
44.O’ 扩增条带数 +/TG0IE;ZMV/XZGIUW# 3S ’ 多态性带数 *E;ZMV/XS/0N;/VS=DRZGIUW# ?’ 多态性位点百分率 kMVRMITGJM/XS/0N;/VS=DR
0/RD# OW’ 特异性条带数 *E;ZMV/XWSMRDXDRZGIUW# OG’ 等位基因数 oZWMV2MU IE;ZMV/XG0M0MW# OM’ 有效等位基因数 )XMRTD2MIE;ZMV/XG0M0MW#
9’ *MD-W遗传多样性 *MD-WJMIMUD2MVWDTN# >’ &=GII/I 信息指数 &=GII/I|WDIX/V;GTD/I DIUM_3括号内数值为标准差 +=M2G0EMWDI T=MZVGRdMTWGVM
WTGIUGVU UM2DGTD/IW3
%:#
4第 ## 期 赵丽华等’ 川滇石榴品种遗传多样性及亲缘关系的 ,@-k分析
图 #4预扩增及选择性扩增产物电泳图
@DJ3#4)0MRTV/S=/VMWDW/XSVM^M_SGIUMU GIU WM0MRTD2MG;S0DXDRGTD/I SV/UERT
,’ 预扩产物电泳图 )0MRTV/S=/VMWDW/XSVM^G;S0DXDRGTD/I SV/UERT# C’ 选扩产物电泳图
)0MRTV/S=/VMWDW/XWM0MRTD2MG;S0DXDRGTD/I SV/UERT3’l’ 阴性对照 *MJGTD2MR/ITV/0# ]’ K-$%%%3
图 $4引物对 )^,,Oi] ’^+O的 ,@-k扩增结果
@DJ3$4,@-kG;S0DXDRGTD/I VMWE0TZNSVD;MVW)^,,Oi]’^+O
# >!$ 编号同表 #!箭头所指为独特或缺失条带& # >!$ R/UMWVMXMVT/T=MWG;S0MW
0DWTMU DI +GZ3#! GIU GVV/YWT/EIDQEM/VGZWMITZGIUW3]’ K-$%%%3
%1#6! #!平均 %1#"% 5# &=GII/I 信息指数 ">$ 为
%1$#% $ 9%15%5 7!平均%1$85 ## 多态性条带比率
为 "81""a& 结果表明!四川%云南石榴品种资源间
存在较丰富的遗传多样性&
$354K*,指纹图谱4相同的 ,@-k引物对于不同
石榴品种扩增出带数及带型都不同! !$ 个四川%云
南石榴品种检测到 #7 条品种特异性条带 "表 $$’
)^,OOi]’^,,引物对于会泽,花红皮- $%% ZS 左右
有 # 条独特 K*,条带!巧家,红壳石榴-#%% ZS 左
右有 # 条独特 K*,条带# )^,,Oi]^’,,引物对于
开远,汤碗石榴-5%% ZS 及 $8% ZS 左右各有 # 条独
特 K*,条带!蒙自,厚皮甜砂籽-$7% ZS 左右缺失 #
条 K*,条带# )^,’,i]^’+’引物对于会泽 ,白花
石榴-:%% ZS 左右有 # 条独特 K*,条带!会理 ,软
核酸石榴-"%% ZS 左右有 # 条独特 K*,条带!会理
,青皮软籽 - $8% ZS 左右缺失 # 条 K*,条带#
)^,OOi]^’+O引物对于会泽,白花石榴-:%% ZS 左
右有 # 条独特 K*,条带!元谋 ,姜驿石榴- "8% ZS
左右有 # 条独特 K*,条带!会泽 ,花红皮- 8%% ZS
左右有 # 条独特 K*,条带!蒙自,青皮石榴-#8% ZS
左右有 # 条独特 K*,条带# )^,,Oi]’^+O引物
"图 $$对于蒙自,甜光颜-:8% ZS 及 "5% ZS 左右各
有 # 条独特 K*,条带!禄丰,红皮白籽-57% ZS 左
右有 # 条独特 K*,条带!蒙自,白花甜石榴-#!% ZS
左右 有 # 条 独 特 K*, 条 带! 会 泽 ,绿 皮 酸 -
"!% ZS 左右缺失 $ 条 K*,条带& 此 #! 条独特及 !
条缺失特异性 K*,条带可作为石榴品种的特征带!
用于鉴定供试石榴品种中这 #5 个石榴品种的分子
依据&
#:#
林 业 科 学 !" 卷4
$1!4聚类分析4!$ 个石榴品种的遗传相似系数
"!J$为%1:#$ : 9%16$8 !!平均为%17#! $# 其中会
泽,莹皮-和建水,酸甜石榴-与开远,汤碗石榴-遗
传相似系数最小!为%1:#$ :!表明前二者与后者间
亲缘关系最远# 攀枝花 ,大绿籽-为会理 ,青皮软
籽-芽变品种"先开泽!#666$!遗传相似系数最大!
为%16$8 !!表明二者亲缘关系最近&
利用 pkO],法!根据 !J构建 !$ 个石榴品种遗
传关系聚类图"图 5$& 从图 5 可以看出!8 对引物
能将 !$ 个石榴品种完全区分开!以 !J%17$% %为阀
值!供试的 !$ 个石榴品种可分为 ! 类’ ,红皮白
籽-%,大铁壳红-%,红皮酸-% ,大籽酸石榴-% ,莹
皮-%,酸甜石榴-%,汤碗石榴-%,白皮石榴-%,铜壳
石榴-%,黑皮石榴-% ,厚皮甜砂籽-% ,花红皮 -%
,红壳石榴-%,会理红皮-%,青壳石榴-%,白花石
榴-%,糯石榴-%,永丰早白石榴-聚为第#类# ,红
皮红籽-% ,甜绿籽-% ,黄皮甜-% ,青皮石榴- "蒙
自$%,青皮白籽-%,火炮石榴-%,软核酸石榴-%,青
皮软籽-%,大绿籽-%,甜光颜-%,酸绿籽-%,火石
榴-%,绿皮酸-聚为第!类# ,铁壳白籽-%,青皮石
榴-"攀枝花$%,黄皮酸-聚为第 (((类# ,白花甜石
榴-%,酸光颜-%,红袍-%,姜驿石榴-%,水晶石榴-%
,细籽酸石榴-%,乍甸酸石榴-%,绿皮甜酸-聚为第
%类& 蒙自,青皮石榴-与攀枝花,青皮石榴-遗传
相似系数为 %1:68 8!且分别居于第!类与$类!应
为同名异物&
图 54!$ 个石榴品种遗传相似系数 pkO],聚类图
@DJ354pkO],UMIUV/JVG;/X!$ S/;MJVGIGTMRE0TD2GVWZGWMU /I JMIMTDRWD;D0GVDTNR/MXDRDMITW
# >!$ 编号同表 #& # >!$ R/UMWVMXMVT/T=MWG;S0MW0DWTMU DI +GZ3#3
54讨论
多态带百分率"?$%有效等位基因数"OM$%*MD|W
基因多样性"9$与 &=GII/I 信息指数">$是度量遗
传多样性常用指标"]GVTDIW)+/%1!$%%6# 张青林等!
$%%!$& 本研究结果显示!!$ 个四川%云南石榴品种
间遗传相似系数" !J$变异范围在%1:#$ : 9%16$8 !
之间!变幅较大! ?!等位基因数"OG$!OM!9!>分别
为 "81""a!#1"8" "!#1$"% :!%1#"% 5!%1$85 #!表
明四川%云南石榴品种在遗传进化过程中基因组
K*,发生了较大变异!构成较丰富的遗传多样性&
本试验的结果高于 BEGI 等"$%%:$用 ,@-k对四川%
云南石榴群体的分析结果 "?! OG!OM!9!>分别为
$!15#a!#1$!5 #!#1#56 :!%1%7$ #!%1#$5 6$!这可
能是由于其在研究中仅选取四川%云南 8 个主栽品
种进行分析!不能完全代表四川%云南石榴品种间的
遗传多样性!致使多样性分析结果偏低& 本研究中
四川%云南的 !$ 个品种多态带百分率为 "81""a!
低于 BEGI 等"$%%:$用 ,@-k对中国石榴品种分析
所得多态位点百分率 ":$1:%a$!及 \ZDV等 "$%%7$
$:#
4第 ## 期 赵丽华等’ 川滇石榴品种遗传多样性及亲缘关系的 ,@-k分析
用 ,@-k对突尼斯栽培石榴品种分析所得多态带百
分率"6!1:a$& 表明石榴在四川%云南经多年的实
生繁殖%人工选育及基因突变的积累!虽然产生了较
大的遗传变异!构成了较丰富的石榴资源基因库!对
石榴优良品种的选育是极为有利的!但其遗传多样
性低于突尼斯及全国石榴的遗传多样性!为了进一
步丰富四川%云南的石榴资源基因库!可从我国其他
地区或国外引种石榴品种&
目前!我国对石榴品种资源的分类还没有统一
的方法!生产上多以用途%花色%风味%果型大小%果
皮色泽%籽粒口感%成熟期等进行分类"汪小飞等!
$%%:$& 从本研究利用 ,@-k标记技术对 !$ 个四
川%云南石榴品种聚类的结果"图 5$看!与传统分类
的结果相差较远& 从风味看!! 类都有甜味和酸味
石榴# 从果皮颜色看!果皮为青色的巧家 ,青壳石
榴-聚于第#类!禄丰 ,青皮白籽-%蒙自 ,青皮石
榴-%会泽,绿皮酸-%会理 ,青皮软籽-%攀枝花 ,大
绿籽-聚于第!类!攀枝花,青皮石榴-聚于第$类!
会泽,绿皮甜-聚于第%类# 而且这些石榴品种也没
有按照地域分布分类& 本文结果与卢龙斗等
"$%%:$%’/4dEI 等 "$%%7 $%\ZDV等 "$%%7 $%廖毅等
"$%%6$利用分子标记聚类分析结果一致!即 ,@-k
分类与形态和地理起源分类不一致& 这可能是基因
突变的重演性!在不同地区同种生物的不同个体中
发生相同的基因突变 "朱军!$%%$$!导致石榴品种
间表现相同某一性状!并稳定遗传!而这些品种间遗
传相似系数却较低!不能聚为一类# 由于四川%云南
各石榴栽培区域地理位置接近!彼此频繁引种!不同
生态类型%地域间基因交流广泛!及环境对数量性状
的巨大影响!有些品种分子标记结果遗传相似系数
较高!聚为一类!但形态特征%地理来源却差异较大&
传统的分类法仅依据可见差异进行分类!对一些不
可见的差异无法进行检测分析!分析不全面!因此!
单纯依据植物的形态和地理起源分类!已经不能真
实反映石榴品种间的遗传背景和遗传差异# 而
,@-k标记技术能从 K*,水平上揭示遗传变异!反
映遗传背景差异& 对石榴种质资源进行深入研究
时!应在形态学基础上!应用分子标记技术进行分
析!才能更好地为石榴种质资源保存%利用及品种改
良等提供科学依据&
参 考 文 献
陈良华!胡庭兴!张4帆3$%%63四川干旱干热河谷核桃资源遗传多样
性分析3果树学报!$""#$ ’ !7 >8!3
巩雪梅3$%%!3石榴品种资源遗传变异分子标记研究3安徽农业大学
硕士学位论文3
韩远记!董美芳!袁王俊!等3$%%73部分桂花栽培品种的 ,@-k分析3
园艺学报!58"0$ ’ #5: >#!$3
廖4毅!孙保娟!黎振兴!等3$%%63茄子及其近缘野生种遗传多样性
及亲缘关系的 ,@-k分析3热带作物学报!5%""$ ’ :7# >:7:3
卢龙斗!刘素霞!邓传良!等3$%%:3A,kK技术在石榴品种分类上的
应用3果树学报!$!"8$ ’ "5! >"563
马庆华!续九如!王贵禧! 等3$%%63河北和山东冬枣果实品质评价及
,@-k分子标记的研究3林业科学研究!$$"#$ ’ !7 >8!3
闵4会!程诗明!康志雄!等3$%%63香榧天然群体遗传多样性的 ,@-k
分析3林业科学研究!$$"5$ ’ 5": >5:$3
乔4勇!赵4锦!杨海旭!等3$%%63$# 个枣品种"系$的 ,@-k指纹分
析3植物遗传资源学报!#%"$$ ’ $%8 >$#%3
热娜(卡司木! 帕丽达(阿不力孜! 朱4焱3$%%73新疆石榴品种的
A,kK分析3西北植物学报!$7"#$$ ’ $!!: >$!8%3
宋国立!张春庆!贾继曾!等3#6663棉花 ,@-k银染技术及品种指纹
图谱应用初报3棉花学报!##""$ ’ $7# >$753
汪小飞3$%%:3石榴品种分类研究3南京林业大学博士学位论文3
汪小飞!向其柏!尤传楷!等3$%%:3石榴品种分类研究进展3果树学
报!$!"#$ ’ 6! >6:3
先开泽3#6663青皮软籽石榴芽变)))大绿子选种初报3中国南方果
树!$7""$ ’ !#3
杨荣萍!龙雯虹!张4宏!等3$%%:3云南 $8 份石榴资源的 A,kK分
析3果树学报!$!"$$ ’ $$" >$$63
苑兆和!尹燕雷!朱丽琴!等3$%%73山东石榴品种遗传多样性与亲缘
关系的荧光 ,@-k分析3园艺学报!58"0$ ’ #%: >##$3
臧德奎!陈4红!郑4林!等3$%%63木瓜属优良品种亲缘关系的 ,@-k
分析3林业科学!!8"7$ ’ 56 >!53
张青林!罗正荣3$%%!3(&&A及其在果树上的应用3果树学报!$#"#$ ’
8! >873
张四普!汪良驹!曹尚银!等3$%%73$5 个石榴基因型遗传多样性的
&A,k分析3果树学报!$8"8$ ’ "# >""3
赵丽华!王先磊3$%%63成熟石榴叶片 K*,提取方法研究3安徽农业
科学!5:"5#$ ’ #8#!# >#8#!83
周延清3$%%83K*,分子标记技术在植物研究中的应用3北京’ 化学
工业出版社!#"" >#"73
朱4军3$%%$3遗传学3北京’ 中国农业出版社!$!6 >$8!3
’/4dEI K!]EWTGXG!‘=GI €! )+/%I$%%73]/0MRE0GVGIU S/;/0/JDRG0
UD2MVWDTNG;/IJS/;MJVGIGTM"?504"/ 6(/0/+5= -3$ RE0TD2GVWDI
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CD/TMR=I/0/JN!: "6$ ’ #$6! >#5%#3
\ZDVA!FGWIG/ED*!]GVW]!)+/%3$%%73’=GVGRTMVD‘GTD/I /X+EIDWDGI
S/;MJVGIGTM " ?504"/ 6(/0/+5= -3$ RE0TD2GVW EWDIJ G;S0DXDMU
XVGJ;MIT0MIJT= S/0N;/VS=DW;GIG0NWDW3&RDMITDGF/VTDRE0TEVGM!##8
"#$ ’ $5# >$5:3
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AGIGUM& ,! AGIG+&!*GV‘GVNK3$%%63&k,A SV/XD0MWGIU JMIMTDR
UD2MVWDTNG;/IJWTS/;MJVGIGTM"?504"/ 6(/0/+5=-3$ JMI/TNSMW3
k=NWD/0]/0CD/0k0GITW!#8"#$ ’ "# >:%3
BEGI H=G/=M! BDI BGI0MD! ?E \DGI0E! )+/%3$%%:3k/SE0GTD/I JMIMTDR
UD2MVWDTNDI ’=DIMWMS/;MJVGIGTM"?504"/ 6(/0/+5=-3$ RE0TD2GVW
VM2MG0MU ZNX0E/VMWRMIT^,@-k;GVdMVW3\/EVIG0/XOMIMTDRWGIU
OMI/;DRW!5! "#$$ ’ #%"# >#%:#3
!责任编辑4徐4红"
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