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Cloning of McCHI Gene of Malus Crabapple and Its Expression Analysis in the Cultivars with Different Type Foliar Color

苹果属观赏海棠McCHI基因的克隆及不同叶色品种间表达差异分析


以苹果属观赏海棠品种‘王族’叶片提取的总RNA为模板,通过RT-PCR与RACE扩增,获得1条660 bp的查尔酮异构酶(CHI)基因的全长cDNA序列,编码219个氨基酸,命名为McCHI。该基因DNA序列全长1 180 bp,由3个内含子和4个外显子组成,具有CHI基因的典型结构。采用实时荧光定量PCR和紫外可见光分光光度计法,对3类不同叶色类型的观赏海棠品种‘火焰’(绿色类叶片)、‘绚丽’(新叶有色类红色叶片)、‘高原之火’(新叶有色类红色叶片)和‘王族’(常色叶类紫色叶片)幼叶和功能叶中的McCHI表达及其花色苷含量进行测定分析,结果表明: McCHI在4个品种的幼叶和功能叶中均有表达,其表达量与花色苷积累随品种不同和叶龄不同表现出明显差异。

With the total RNA from leaves of Malus crabapple ‘Royalty’ as the template,a full cDNA of CHI(chalcone isomerase) gene (660 bp) was cloned by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and rapid-amplification of cDNA ends (RACE). The gene was named McCHI, encoding a protein of 219 amino acids. The corresponding DNA sequence is 1 180 bp,containing 3 introns and 4 exons,and has a typical structure of CHI gene. The expression of McCHI and the content of anthocyanin were determined by real-time quantitative PCR and spectrophotometer respectively in the mature and young leaves of M.‘Flame’ (green young and mature leaf), M.‘Radiant’ (red young leaf and green mature leaf), M.‘Prairifire’ (red young leaf and green mature leaf), M.‘Royalty’ (purple young and mature leaf). The results showed that McCHI was expressed in both mature leaves and young leaves of the above four cultivars,but the expression levels was greatly different at different leaf ages and between cultivars.


全 文 :第 !" 卷 第 #$ 期
% $ # $ 年 #$ 月
林 业 科 学
&’()*+(, &(-.,) &(*(’,)
./01!"!*/1#$
2345!% $ # $
苹果属观赏海棠 H&1V(基因的克隆及
不同叶色品种间表达差异分析!
耿6慧6沈红香6姚允聪6田6佶6宋婷婷
"北京农学院植物科技学院6北京 #$%%$"#
摘6要!6以苹果属观赏海棠品种.王族/叶片提取的总 I*,为模板!通过 I+Y:’I与 I,’)扩增!获得 # 条 ""$ TR
的查尔酮异构酶"’\(#基因的全长 3D*,序列!编码 %#7 个氨基酸!命名为 H&1V($ 该基因 D*,序列全长 # #@$
TR!由 8 个内含子和 ! 个外显子组成!具有 1V(基因的典型结构$ 采用实时荧光定量 :’I和紫外可见光分光光度
计法!对 8 类不同叶色类型的观赏海棠品种 .火焰/ "绿色类叶片#(.绚丽/ "新叶有色类红色叶片#(.高原之火/
"新叶有色类红色叶片#和.王族/"常色叶类紫色叶片#幼叶和功能叶中的 H&1V(表达及其花色苷含量进行测定分
析!结果表明% H&1V(在 ! 个品种的幼叶和功能叶中均有表达!其表达量与花色苷积累随品种不同和叶龄不同表现
出明显差异$
关键词%6苹果属观赏海棠& 叶片& H&1V(& 基因表达& 花色苷含量
中图分类号! &?#@1!"’ B7!81%666文献标识码!,666文章编号!#$$# =?!@@"%$#$##$ =$$!% =$@
收稿日期% %$$7 =$@ =%!& 修回日期% %$$7 =$7 =%!$
基金项目% 国家自然科学基金项目"8#$?#?@A# & 北京市人才强教+++拔尖创新人才计划项目":mX%$$?s$#!%$?s$!!A"$# & 北京市农业科
技项目"%$$?$#$## & 北京市科技新星人才培养项目"%$$"F%A# $
!姚允聪为通讯作者$
I*#/-/9 #40%!:;X(/(#40"#)*I5&,&%%*(&/32’$QU%5($$-#/;/&*0$-$-/
’"(I+*’-K&5$>-’"Y-44(5(/’B0%(Z#*-&5I#*#5
WMN<\JH6&LMN \/N"J6$)*F&+")&"$)? U"&’)-6-501-6"5"!3"+4+)5 I)+G"%#+*0-.25%+&,6*,%"63"+4+)5 #$%%$"#
;,$’5&<’%6iH4L 4LM4/490I*,>S/;0M9[MP/>H$6,#3S9T9RR0M.I/V904V/ 9P4LM4M;R094M!9>J03D*,/>1V("3L903/NM
HP/;MS9PM# 9;R0H>H394H/N />3D*,MNUP"I,’)#5+LM%#7 9;HN/93HUP5+LM
3/SSMPR/NUHN1V(MQRSMPPH/N />H&1V(9NU 4LM3/N4MN4/>9N4L/3V9NHN ZMSMUM4MS;HNMU TVSM90Y4H;M]J9N4H494H[M:’I9NU PRM34S/RL/4/;M4MS
SMPRM34H[M0VHN 4LM;94JSM9NU V/JN<0M9[MP/>HM.a09;M/ "#! HM.I9UH9N4/ "SMU V/JN<0M9>
9NU #! HM.:S9HSH>HSM/ "SMU V/JN<0M9>9NU #! HM.I/V904V/ " RJSR0MV/JN<9NU ;94JSM
0M9>#5+LMSMPJ04PPL/ZMU 4L94H&1V(Z9PMQRSMPPMU HN T/4L ;94JSM0M9[MP9NU V/JN<0M9[MP/>4LM9T/[M>/JS3J04H[9SP!
TJ44LMMQRSMPPH/N 0M[M0PZ9PMSMN494UH>MSMN40M9>9=(0 >#53$%6 H$6,#3S9T9RR0MP& 0M9>& H&1V(&66蔷薇科 "I/P93M9M#苹果属 "H$6,##观赏海棠
"H$6,#3S9T9RR0M#!是由起源于中国的山荆子 "HM
8$&&$*$#(多花海棠 "HM.6-%+8,)?$ #(海棠花 "HM
#:"&*$8+6+##等和起源于北美的奥涅海棠"HM.,#&$#(
草原海棠"HM+-")#+##(野香海棠 "HM&-%-)$%+$#等
为亲本选育而成$ 其树形紧凑(叶花果色彩多样(部
分品种冬果宿存!抗逆性强!是一类极具观赏价值的
园林植物资源!其叶色有绿色类(新叶有色类和常色
紫叶类 8 大类品种资源$ 研究表明!植物的色泽发
育和植物类黄酮代谢及花青素合成紧密相关"韩科
厅等!%$$@ #$ 查尔酮异构酶 "3L903/NMHP/;MS9PM!
’\(# 是 类 黄 酮 代 谢 途 径 中 继 查 尔 酮 合 成 酶
"3L903/NMPV4L9PM!’\&#后的第 % 个关键酶!它催化
黄色的苯基苯乙烯酮 " TMNKV0HUMNM93M4/RLMN/NM#转
变成无色的黄烷酮">09[9N/NM#!进而衍生出该途径
中所有的类黄酮化合物$ XMLUV等 "#7@?#采用抗
体技术从法国豌豆"T+&+$ )$%8-)")#+##中分离出 1V(
基因$ [9N +JNMN 等"#7@@#以相同的方法在矮牵牛
6第 #$ 期 耿6慧等% 苹果属观赏海棠 H&1V(基因的克隆及不同叶色品种间表达差异分析
"J"*,)+$ ’08%+?$#中得到 1V($ 后来!研究者用同源
克隆的方法相继在拟南芥"2%$8+?-:#+#*’$6+$)$#(菜
豆"J’$#"-6,#G,65$%+## "i//U "*$65! #77! #(苜蓿
"H"?+&$5-#$*+G$#(翠菊 "1$6+#*":’,#&’+)")#+##(橙
"1+*%,##+)")#+##(烟草 "Y+&-*+$)$ *$8$&,9#和玉米
"["$ 9$0##等多种植物中克隆得到该基因的全长序
列!并对其结构特征和表达特性进行了研究 "吴冰
等!%$$@#$ 然而!在多色型观赏海棠植物中还未见
到该基因的相关报道$ 本文在克隆获得苹果属观赏
海棠叶片查尔酮合成酶"H&1VF#(黄烷酮 8 "羟化
酶"H&/8V#和花色素合成酶"H&2YF#基因的基础
上"WMNF9N^ 登陆号分别为% aG@#?!@A!aG@#?!@" 和
aG@#?!@@ #! 拟从常色紫叶类品种 .王族 / "H5
.I/V904V/#中克隆获得查尔酮异构酶基因!并对该
基因及其编码蛋白序列进行分析!同时!采用实时荧
光定量 :’I技术和分光光度计技术分别对不同叶
色类型品种叶片中查尔酮异构酶基因表达量和花色
苷含量进行检测和分析!以期为苹果属观赏海棠叶
色形成的分子机制研究提供理论基础$
#6材料与方法
?@?A试验材料
以苹果属观赏海棠品种中具有典型叶色的 ! 个
品种为试验材料!叶片为绿色类的 .火焰 / "H5
.a09;M/#& 幼叶红色(功能叶为绿色的新叶有色类
.绚 丽 / "H M.I9UH9N4/# 和 .高 原 之 火 / " H5
.:S9HSH>HSM/#& 叶片为紫色的常色叶类.王族/$ 这 !
个品种均是从美国直接引进的品种!其亲本不详$
于 %$$@ 年春季!选取树势和生长势相似的植株!采
枝条顶端萌芽后 ? 天的幼叶和枝条 A+" 节处萌芽
A$ 天的功能叶!液氮速冻后! =@$ d条件下保存
备用$
?@DA总 1];的提取及 用改良热硼酸法"陆旺金等!%$$8#提取.王族/
幼叶 总 I*,! 以 提 取 的 总 I*, 为 模 板! 利 用
’0/N4M3L &X,I++X-HTS9SV试剂盒 "购自 ’0/N4M3L 生
物有限公司#合成 8/I,’)和 A/I,’)3D*,第 #
链$ 采用 ’+,F法"iH0H9;P/N "*$65!#77!#提取.王
族/叶片总 D*,$
?@EA观赏海棠 0%!:;基因序列的克隆
以上述提取得到的.王族/叶片 3D*,为模板!
根据 WMNT9N^ 上登录的近缘植物查尔酮异构酶基因
保守区段序列!设计 8 /端引物 ’\(:#% ’,’’WWW
OW’’+’+,++’+!扩增 H&1V(基因的 8/端序列& 设
计 A / 端引物 ’\(:%% ’,+++,’,’’’W++’,,+,
W++W!扩增 H&1V(基因的 A/端序列$ b:X通用引
物由 I,’)试剂盒提供!根据试剂盒说明!转录产物
的 8/末端用 ’\(a8 和 b:X引物扩增!其 :’I反应
条件为% 7! d预变性 A ;HN& 7! d变性 # ;HN!AA d
退火 8$ P!?% d延伸 % ;HN!8$ 个循环& ?% d延伸
A ;HN$ 转录产物的 A/末端使用 ’\(I8 和 b:X引
物扩增!其 :’I反应条件为% 7! d预变性 A ;HN&
7! d变性 # ;HN!AA d退火 8$ P!?% d延伸 # ;HN!
8$ 个循环& ?% d延伸 A ;HN$ :’I产物经回收(纯
化!与 RXD#7Y+.M34/S"购自宝生物工程公司#连
接!转化 D\A4感受态细胞!蓝白斑筛选后测序"上
海生 工 生 物 工 程 技 术 服 务 有 限 公 司 #$ 用
D*,X,*A1%1% 软件拼接以上序列得到苹果属观赏
海棠查尔酮异构酶基因全长 3D*,序列$
?@FA观赏海棠 0%!:;基因 列的获得
设计全长引物 ’\(a% ,+WW’+’’,’’,’’,+
’W’+和 ’\(I% +’,+++,’,’’’W++’,,+,W++W
WW!以上述提取得到的 .王族/叶片 3D*,和 D*,
为模板! 扩 增查 尔酮 异 构酶 基因 的 全 长 序 列
"X3EL9NN "*$65!#77!#$ :’I反应条件为% 7! d预
变性 A ;HN& 7! d变性 # ;HN!"# d退火 8$ P!?% d
延伸 % ;HN!8$ 个循环& ?% d延伸 A ;HN$ :’I产物
经回收(纯化!与 RXD#7Y+.M34/S"购自宝生物工程
公司#连接!转化 D\A4感受态细胞!蓝白斑筛选后
测序"上海生工生物工程技术服务有限公司#$
?@GA实时荧光定量 !I1分析
分别提取 .绚丽/( .火焰/( .高原之火/( .王
族/ ! 个品种的幼叶和功能叶 I*,"陆旺金等!
%$$8#!使用 XYXJ-.aHSP43D*,&VN4LMPHPEH4"购自
:S/;M<9公司#合成第 # 链 3D*,备用$
按照 IM90X9P4MSXHQ"&OFIWSMMN# :’I试剂
盒"购自天根生化科技有限公司#操作指南!采用实
时荧光定量 :’I"SM90Y4H;M]J9N4H494H[M:’I!I+Y
]:’I#的方法!检测基因的相对表达量$ 扩增目标
基因 H&1V(引 物 为 ’\(Ya% ’’W++’,,+,W++W
WW,+,,和 ’\(YI% +’’+,,,WW,+’,’+’,’W!预
测产物 长度 是 #@# TR& 以 H$6,#?-9"#*+&$ #@&
%+8-#-9$6!Y2基因"WMNF9N^ 序列号%DB8!#8@%#作
为内 参 基 因! 其 引 物 #@&IYa% ,’,’WWWW,WW
+,W+W,’,, 和 #@&IYI% ’’+’’,,+WW,+’’+’
W++,!预测产物长度是 @$ TR$
对反转录所得的 3D*,按体积分别进行 A 个梯
度稀释"#!#h#$!#h#$$!#h# $$$!#h#$ $$$#!实施荧
光定量反应!然后绘制相对标准曲线$ H&1V(基因
8!
林 业 科 学 !" 卷6
I+Y]:’I扩增的反应体系为 %$ 5-!包括%7 5-IM90
X9P4MSXHQ混合液!% 5-3D*,!# 5-a8\Ya" #$
5;/0’-=# #! # 5-a8\YI " #$ 5;/0’-=# #! ? 5-
UU\%2$ 反应程序为% 7! d预变性 % ;HN&7! d变
性 %$ P!A$ d退火 8$ P!?% d延伸 8$ P!!$ 次循环!
每次循环第 8 步进行荧光采集& 最后 7A d变性
# ;HN!退火至 AA d"每隔 #$ P上升 $1#A d#后保温
# ;HN$ 接着检测其荧光值!绘制熔点曲线$ 内参基
因的 #@& SI*,:’I扩增的反应体系为 %$ 5-!包
括% 7 5-IM90X9P4MSXHQ混合液!% 5-3D*,!# 5-
#@&IYa"#$ 5;/0’-=# #!# 5-#@&IYI " #$ 5;/0’
-=##!? 5-UU\%2$ 其反应程序同 H&1V(基因的反
应程序相同$ 标准品 3D*,和待测样品均设置 8 次
重复$
?@SA花色苷含量测定
花色苷相对含量的提取根据何亦昆等"#77A#的
方法略有改动$ 称取 #1$ <叶片剪碎"% ‘8 ;;#!置
于 A$ ;-离心管中!加入 #$ ;-# #的盐酸甲醇!常
温下浸泡 %$ L$ 取上清液!以提取液作空白!采用
b*(’2b.Y%#$$ 型紫外可见分光光度计在 A8$ N;
处测定吸光度$ 以每克鲜质量叶片的提取液的光密
度变化值 2DA8$ f$1# 作为 # 个花色苷单位$
%6结果与分析
D@?A0%!:;基因的克隆与序列比较
依据得到的保守片断设计 A / 和 8 / 末端的
I,’)引物$ 用引物对 b:Xh’\(:% 进行 H&1V(的
A/末端的扩增反应!在琼脂糖凝胶电泳中显现出
8$$ TR 和 AA$ TR 左右 % 条目的条带"图 #,!右#!将
AA$ TR 左右的条带回收(测序!获得 # 条 ’\(的 A/
3D*,末端$ Ao端 I,’)出现长度多态性现象主要
是由于转录起始位点多态性造成的$ 用引物 b:Xh
’\(:# 进行 H&1V(的 8 / 末端扩增!获得 # 条约
8$$ TR的带"图 #,!左#!克隆入 +=载体!挑选 " 个
长度有代表性单克隆测序!获得到 # 条 1V(的 8/
3D*,末端$ 以上述片断进行 F09P4分析!确认其与
其他植物 1V(基因同源$ 根据 8/I,’)和 A/I,’)
测序结果拼读出苹果属观赏海棠查尔酮异构酶基
因!全长序列为 ""$ TR!命名该基因为 H&1V("登陆
号 aG@#?!@A#$
基因组扩增得到约 # %$$ TR 的条带!拼接后得
到全长序列 # #@$ TR "图 #F#$ 分析发现!H&1V(存
在 8 个内含子!结果与大多数物种一致"图 #’#$ 将
起始 密 码 子 ,+W 定 义 为 C# 位! 分 别 位 于
C#$? TR ‘C%#$ TR"内含子 ##! C8?" ‘C?$! TR
"内含子 %#! C7%7 ‘C# $$7 TR"内含子 8#$ 内含
子 =外显子边界均符合)W+=,W*规则$ 第 # 个内
含子中没有任何重复序列& 第 % 个内含子中存在 !
个直接重复序列和 # 个镜像重复序列& 第 8 个内含
子同样没有任何重复序列!但是第 8 个内含子与大
豆">60&+)"9$=#的内含子有较高的同源性!而其他
内含子却保持了较高的物种特异性$
图 #6H&1V(基因的扩增结果及结构分析
aH<5#6+LM:’ISMPJ04P9NU P4SJ34JSM9N90VPHP/>H&1V(
,1H&1V(基因的 8/I,’)和 A/I,’):’I扩增结果& F1H&1V(基因 3D*,和 D*,全长 :’I扩增结果& ’1H&1V(基因 D*,序列的结构$
,1+LM:’ISMPJ04P/>8/I,’)9NU A/I,’)>/SH&1V(& F1+LM:’ISMPJ04P/>3D*,9NU D*,>J00MN<4L >/SH&1V(& ’1+LMD*,PM]JMN3M
P4SJ34JSM/>H&1V(5
66对该基因的序列进行分析表明!其含有 # 个编
码 %#7 个氨基酸的完整阅读框架!包括起始密码子
和终 止 密 码 子$ 利 用 D*,X,*A1%1% 软 件! 对
H&1V(编码的氨基酸序列分析!认为该基因具有起
始密码子",+W#和终止密码子"+W,#!是苹果属观
赏海棠查尔酮异构酶基因的 2Ia序列"图 %#$
根据 (N4MS:S/&39N 和 &X,I+在线软件对编码
氨基酸分子量(编码蛋白的结构域和功能位点进行
分析 表 明! H&1V(2Ia编 码 的 %#7 个 氨 基 酸
"R(A1AA#的分子量约为 %81! ^J!其编码的蛋白具有
典型的 ’\(蛋白保守结构域% 第 # 个是生物素和维
生素 F# 合成相关结构域"从 &MS?7到 :S/#!@ #$ 生物
!!
6第 #$ 期 耿6慧等% 苹果属观赏海棠 H&1V(基因的克隆及不同叶色品种间表达差异分析
素合成酶是一种同型二聚体!能促进生物素生物合
成途径中的最后一步反应!而硫胺素合成同样是一
个复杂的过程!涉及 U’+/F>V(U’+(和 U’+e等 " 个基
因产物$ 推测这 % 种反应可能由共同因素制约!在
1V(的这一相关结构域可能参与共同影响因子结合
或二聚作用$ 第 % 个是染色体结合区域"从 ,PN#@%
到 -MJ%#A#!发现这一区域是不同的核蛋白质参与染
色体组织活动的 D*,结合结构域$ 第 8 个是螺
旋 =发夹 =螺 旋 D*, 结 合 区 域 " 从 W0J#7# 到
,S<%#$#!该区域是原核和真核非序列特异性 D*,结
合蛋白中的 # 个约 %$ 个氨基酸结构域!尽管氨基酸
序列相似!但其螺旋结构是不同$ 螺旋 =发夹 =螺
旋结构之间的差异也反映在这一结构域的功能级别
上!其不同点可能主要表现在基因调控蛋白与 D*,
序列结合的具体方式上$
图 %6苹果属观赏海棠 H&1V(基因 3D*,的核苷酸序列及推测的氨基酸序列
aH<5%6+LM3/;R0M4M3D*,PM]JMN3M/>H&1V(9NU H4PRSMUH34MU 9;HN/93HU PM]JMN3M
起始密码子和终止密码子用下划线表示!阴影和黑框表示保守域$ +LM4S9NP094H/N P49S4
3/U/N 9NU 4LMP4/R 3/U/N 9SMHNUH394MU HN JNUMS0HNM& +LMPL9U/Z9NU T093^ T/Q9SM>JN34H/N90
U/;9HN5
66用 &2:X,对 X3’\(蛋白的二级结构预测表
明!X3’\(蛋白也主要由4=螺旋"4YLM0HQ#(随机卷
曲 "S9NU/; 3/H0#( 6=转 角 "6Y4JSN # 和 延 伸 链
"MQ4MNUMU P4S9NU#组成"图 8#$ 在二级结构中!4=
螺旋均匀分布于蛋白的中部和 ’=端$ X3’\(蛋白
由 !858@_的 4=螺旋(%$1AA_的延伸链("1@A_的
6=转角和 %71%%_的随机卷曲组成$ 而已知结构
和功能的葡萄 "T+*+#G+)+."%$#’\(蛋白 .[’\(的二
级结构 " &2:X,显示 # 由 !!5@?_的 4=螺旋(
%$1A#_的延伸链("1@!_的 6=转角和 %?1?@_的
随机卷曲组成$ 由此可见!X3’\(与 .[’\(蛋白的
二级结构十分类似$
以 .[’\("m:s$$%%@%#$@ # 为模型!用 &ZHPPY
X/UM0对 X3’\(蛋白进行三级结构的同源建模!所
得到的结果都与已知结构和功能的葡萄 ’\(蛋白
的三级结构很类似"图 !#$ X3’\(蛋白的结构符合
%2WYaM((s2QV氧化酶的特征结构$ 二级结构预测
的结果支持三级结构的预测!*=末端及其中部的
多个 4=螺旋组成)果冻*结构的重要骨架!而延伸
链则主要位于内部!组成缺口的表面$ 由结构的相
似性可以推知 X3’\(可能具有与 .[’\(相似的生
物学功能$
D@DA苹果属观赏海棠 0%!:;的同源性及进化
分析
利用 D*,X,*A1%1% 软件进行多重序列比对
"图 !#发现!1V(基因的 2Ia有一定的特异性!但
功能结构域也高度保守!显示了查尔酮异构酶进化
的保守性$ 利用 X)W,!5$ 软件!对 H&1V(编码蛋
白与已知植物 ’\(结构域蛋白进行进化树"图 A#分
析!可以看出 H&1V(编码的氨基酸序列与其他物种
A!
林 业 科 学 !" 卷6
图 86X3’\(蛋白结构
aH<58 +LMRS/4MHN P4SJ34JSM/>X3’\(
4% 4=螺旋 4YLM0HQ& 6% 6=转角 6Y4JSN& )% 延伸链 )Q4MNUMU P4S9NU& I% 随机卷曲 I9NU/;3/H0& !’% 碳终端 ’Y4MS;HN94H/N& *% 氮终端 *Y
4MS;HN94H/N5,5预测的 X3’\(和 .[’\(二级结构% 4=螺旋(延伸链(6=转角和随机卷曲在图中分别用长(中长(短和最短竖线表示$ F5预
测的 X3’\(蛋白三级结构和 .[’\(蛋白结构% 4=螺旋(6=转角(随机卷曲(延伸链分别用红色(蓝色(灰色(黄色表示$ ,1&M3/NU9SVP4SJ34JSM
/>X3’\(9NU .[’\(RSMUH34MU% a/JS^ HNUP/>4LMT9SPHN UMP3MNUHNSMPRM34H[M0V5F1+LM4LSMMYUH;MNPH/N90;/UM0P/>.[’\(9NU 4LMUMUJ3MU X3’\(% 4YLM0HQHPHNUH394MU HN SMU!6Y4JSN HN T0JM!S9NU/;3/H0HN MQ4MNUMU P4S9NU HN VM0/Z5
图 !6苹果属观赏海棠 H&1V(基因中央编码区的氨基酸序列的多重比对分析
aH<5!6,0H4LMRSMUH34MU 9;HN/93HU PM]JMN3MP/>H&1V(;9HN 2IaHN H$6,#3S9T9RR0MP9NU 4L/PM/>PM[MS90/4LMSR09N4P
#1矮牵牛 J"*,)+$ p’08%+?$& %1草莓 /%$5$%+$ p$)$)$##$& 81茶 1$9"6+$ #+)")#+#& !1月季 !-#$ ’08%+?$& A1番薯 (:-9-"$ 8$*$*$#& "1观赏海棠
H$6,#3S9T9RR0M& ?1毛果杨 J-:,6,#*%+&’-&$%:$& @1杜鹃 !’-?-?")?%-) #+9#+& 71菊花 @")?%$)*’"9$ 9-%+.-6+,9& #$1萝卜 !$:’$),##$*+G,#& ##1
棉花>-##0:+,9’+%#,*,9& #%1拟南芥2%$8+?-:#+#*’$6+$)$& #81茄子 F-6$),99"6-)5")$& #!1水母雪莲 F$,##,%"$ 9"?,#$& #A1甜橙1+*%,##+)")#+#&
#"1向日葵 V"6+$)*’,#$)),,#5
"!
6第 #$ 期 耿6慧等% 苹果属观赏海棠 H&1V(基因的克隆及不同叶色品种间表达差异分析
具有 较 高 相 似 性$ 其 与 茶 " 1$9"6+$ #+)")#+#!
DB#%$A%##(番薯 "(:-9-"$ 8$*$*$#! ,F$@$?"@#(甜
橙 "(*%,##+)")#+#! ,F$##?7! # 和矮牵牛 "J"*,)+$
=’08%+?$! ,a%88"8? # 的 ’\(的 相 似 性 分 别 为
"71#8_! "#1?8_! ?$1!$_和 "$1A@_$
图 A6苹果属观赏海棠 X3’\(氨基酸序列与不同来源 ’\(氨基酸序列的系统进化树
aH<5A6:LV0/’\(>S/;[9SH/JPPRM3HMPHN30JUHND@EA0%!:;基因在不同叶色品种中的表达分析
由 H’V30MSHB+X自动测出的苹果属内参基因
_aF %!Y2的回归方程(:’I扩增效率和相关系数分
别为% X f=81!$7KC8A1@A?!7"1AR和 $177?! &
测出的苹果属 H&1V(的回归方程(:’I扩增效率和
相关系数分别为% Xf=$1%7AKC#1A7%!7717R和
$177"! $ 说明该试验具有良好的重复性和较高扩
增效率$ 熔点曲线分析出的 _aF %!Y2和 H&1V(均
有 # 个 U;值!分别为 @@ d和 @" d!表明 _aF %!Y2
和 H&1V(所用引物具有高度特异性!其 :’I扩增产
物均为目的片段!不含引物二聚体$
H&1V(基因在 ! 个苹果属观赏海棠品种叶片中
表达模式如图 "$ 以表达量最高的.火焰/幼叶的表
达量定为)#*$ 按照相对定量公式 % =7714作图$ 由
图 " 可以看出!H&1V(基因在 ! 个观赏海棠品种的
幼叶和功能叶中均有表达$ 就不同叶色类型品种而
言!绿色叶类品种 .火焰/幼叶的 H&1V(表达量最
高!而花色苷积累量最低& 常色叶类紫色叶品种的
花色苷含量始终较高!而 H&1V(的表达量却始终处
于中间状态& 新叶有色类品种.高原之火/幼叶花色
苷含量最高!而 H&1V(的表达量虽然高于常色叶类
紫色叶品种 .王族/!但却低于绿色叶类品种 .火
焰/$ 就不同发育时期的叶片而言!在绿色叶类品
种.火焰/的幼叶中 H&1V(表达量高于功能叶& 在
常色叶类紫色叶品种.王族/幼叶中其表达量相对
高于功能叶! 而花色苷积累则低于功能叶& 在新叶
有色类.绚丽/的幼叶中 H&1V(表达量相对低于功
能叶!花色苷积累无差别& 而.高原之火/幼叶基因
图 "6苹果属观赏海棠叶片中 H&1V(
相对表达量及对应花色苷的含量
aH<5"6IM094H[M3/RVNJ;TMSP/>H&1V(MQRSMPPH/N 0M[M0P
9NU 3L9N9N4L/3V9NHN HN 4LM0M9[MP/>
UH>MSMN4HM3S9T9RR0M3J04H[9SP
#1.火焰/幼叶 O/JN<0M9>/>HM.a09;M/ & %5.绚丽/幼叶 O/JN<
0M9>/>HM.I9UH9N4/ & 85.高原之火 / 幼叶 O/JN<0M9>/>HM
.:S9HSH>HSM/ & !5.王族/幼叶 O/JN<0M9>/>HM.I/V904V/ & A5.火
焰/功能叶 X94JSM0M9>/>HM.a09;M/ & "5.绚丽/功能叶 X94JSM
0M9>/>HM.I9UH9N4/ & ?5.高原之火/功能叶 X94JSM0M9>/>HM
.:S9HSH>HSM/ & @5.王族/功能叶 X94JSM0M9>/>HM.I/V904V/5
表达量近似于功能叶!花色苷积累无明显变化$ 这
?!
林 业 科 学 !" 卷6
说明 H&1V(表达量与花色苷积累随品种不同和叶
龄不同表现出较大差异!同时其基因表达量与花色
苷积累无明显对应关系$
86结论与讨论
在类黄酮代谢途径中!查尔酮合成酶 ’\& 催化
合成反应的第 # 步& 查尔酮异构酶 ’\(催化第 % 步
反应!即由 # 个香豆酰辅酶 ,和 8 个丙二酰辅酶 ,
在 ’\& 的作用下生成查尔酮$ 查尔酮再经过 ’\(
的作用形成二氢黄酮$ 二氢黄酮在 a8\等酶的催
化下转化为其他各种颜色类型的黄烷酮化合物$
1V(在植物中表达与否及表达量的高低都会影响黄
酮代谢的量!进而影响到植物器官色泽的形成
"X3^L9NN "*$65!#77!#$ 如缺乏’\(的玉米突变体!
查尔酮会出现积累!玉米粒呈古铜色"\MS0MP"*$65!
%$$!#$ 黄酮化合物的产量也受各种环境因子的影
响!如温度与金属离子会影响植物花色苷的积累&
增施镁盐可以预防温度提升和 ’\(活性下降!使植
物花色增强"-MM"*$65!%$$%& 李雪梅等!%$$!& 丛浦
珠等!%$$%& X9P9UM!#7?"#$ 这说明 ’\(在植物色
泽形成中具有关键的作用$
利用同源扩增和 I,’)方法!本研究克隆获得
了苹果属观赏海棠查尔酮异构酶基因 H&1V($ 图 "
表明 H&1V(基因在 ! 个观赏海棠品种的幼叶和功
能叶中均有表达$ 但对不同品种花色苷数据和
H&1V(表达量进行分析发现!叶色越红的品种!其花
色苷含量越高!而 H&1V(表达量却不一定高$ 绿色
叶类品种.火焰/幼叶的 H&1V(表达量最高!而花色
苷积累量最低& 新叶有色类品种.高原之火/幼叶花
色苷含量最高!而其 H&1V(表达量却低于.火焰/$
这表明 H&1V(表达量与花色苷积累随品种着色类
型不同表现出较大差异$ 就不同发育时期的叶片而
言!在绿色叶类品种.火焰/的幼叶中 H&1V(表达量
高于功能叶& 而在新叶有色类品种.绚丽/和.高原
之火/中!其幼叶中 H&1V(表达量相对低于功能叶$
这说明品种着色类型不同(叶片发育时期不同!
H&1V(表达量与花色苷积累量的对应关系各异$ 这
与苹果上的结果类似!虽然 1V(基因在花色苷代谢
中有着较为重要的作用 "于晓南等!%$$%#!但是其
与花色苷代谢的对应关系不明显$
纵观近几年来对 1V(的研究可以发现!对酶催
化机制方面的研究比较深入!而对 1V(基因的研究
主要集中在草本植物的花色代谢调控这一领域$ 将
矮牵牛 1V(基因转入番茄并获得了转基因番茄!表
达分析显示在其果皮中黄酮类含量比对照增加了
?@ 倍(果肉中黄烷醇增加了 %# 倍!而在其表现型上
和对照相比没有什么差别"XJHS"*$65!%$$##$ 由 IH
质粒介导将水母雪莲 " F$,##,%"$ 9"?,#$#1V(基因
转入雪莲花 " F$,##,%"$ +)G-6,&%$*$#!诱导雪莲花发
根!在转 1V(基因雪莲花发根中芹菜素含量比对照
组提高了 #% 倍!总黄酮量提高 ! 倍"-H"*$65!%$$"&
&LH;9U9"*$65!%$$8#$ 这些结果表明!应用基因工
程技术将 1V(基因导入到植物中!其表达产物可以
促进有益于人体健康的黄酮类化合物的生物合成$
运用植物组织培养(分子生物学等技术将 1V(等目
标酶基因在植物中过量表达来提高植物中黄酮含
量!已成为目前植物学及药学领域中重点研究内容
之一$ 将 1VF 和 1V(基因导入矮牵牛并获得了超
表达!转基因植株花的颜色发生了改变 "祝钦泷!
%$$!#$ 应用直接导入外源基因 1V(或者利用共抑
制和反义抑制的技术来改变植物花色!可以大大提
高花卉的观赏性$ 1V(基因的应用前景已经被逐渐
认识!将会得到越来越广泛的应用$
由于目前对 1V(基因表达调控机制(’\(的活
性基团(稳定性(环境影响因子以及合成途径中各种
酶之间相互协同或抑制等方面还缺乏全面的认识!
所以!1V(基因的相对表达量在整个叶片的发育过
程中对花色苷积累的作用及其机制以及对叶色形成
的作用有待于大量的研究去证实$
参 考 文 献
丛浦珠!李笋玉5%$$%5天然有机质谱学5北京% 中国医药科技出版
社!?@8 =7$$5
韩科厅!胡6可!戴思兰5%$$@5观赏植物花色的分子设计5分子植
物育种!""## % #" =%!5
何亦昆!代庆阳!苏学辉5#77A5雁来红叶色转变与超微结构及色素
含 量 的 关 系5 四 川 师 范 学 院 学 报% 自 然 科 学 版!
#""8# % #7A =#7?5
李雪梅!周6谨!张晓龙5%$$!5超临界 ’2% 流体萃取与常规提取方
法制备芹菜籽油的比较5精细化工!%# "@# % A@# =A@A5
陆旺金!蒋跃明5%$$85荔枝果实两个膨大素基因的克隆与序列分
析5中国农业科学!8" "#%# % #A%A =#A%75
吴6冰!祝钦泷!郭余龙!等5%$$@5查尔酮异构酶基因的分子特征及
其在基因工程中的应用5植物生理学通讯!!$"## % #?A =#@#5
于晓南!张启翔5%$$%5观赏植物的花色素苷与花色5林业科学!
8@"8# % #!? =#A85
祝钦泷5%$$!5转查尔酮异构酶"1V(#基因矮牵牛花色改变及其花
器官变异的研究5西南农业大学硕士学位论文5
\MS0MP’!FS9JNM,!F09J4X5%$$!5aHSP4T934MSH903L903/NMHP/;MS9PM
HP/094MU >S/; <,8$&*"%+,9 %$9,6,#5 ,S3L XH3S/TH/0!
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@!
6第 #$ 期 耿6慧等% 苹果属观赏海棠 H&1V(基因的克隆及不同叶色品种间表达差异分析
8?% # =#"5
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F$,##,%"$ 9"?,#$ 3L903/NMHP/;MS9PMS//4 3J04JSMP MNL9N3MP 4LMHS TH/PVN4LMPHP /> 9RH:LV4/3LM;HP4SV!"?""# % AA8 =A"$5
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09[/N/HUP9NU 0MH3AYUM/QV"HP/# >09[/N/HUPHN
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9!责任编辑6徐6红"
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