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DREB Gene Expression in Leaves of Broussonetia papyrifera Seedlings under Salt Stress Detected by Real-Time Fluorescent Quantitative PCR

盐胁迫下构树DREB转录因子基因表达的实时荧光定量PCR分析


Real-time fluorescent quantitative PCR was used to datect DREB genes‘ expression levels in leaves of Broussonetia papyrifera seedlings at 0, 6, 12 and 24 h after treatments with 100, 200 and 300 mmol·L-1 NaCl. The results showed that BpDREB1 and BpDREB2 genes were induced by 100 and 200 mmol·L-1 NaCl to increase their expression levels. But the levels decreased at later stage by the salt stress. Treatment with 300 mmol·L-1 NaCl caused reduced expression levels of the two genes. The experiment verified that the transcriptional expression of DREB genes in B. papyrifera was able to be induced by salt stress, which might be involved in signalling pathways in response to the salt stress. But the genes were prohibited by higher salt concentration or longer duration of NaCl stress.


全 文 :第 !" 卷 第 ! 期
# $ % $ 年 ! 月
林 业 科 学
&’()*+(, &(-.,) &(*(’,)
./01 !",*/1 !
,234,# $ % $
盐胁迫下构树 !"#$转录因子基因表达的
实时荧光定量 %&"分析"
杨 5 帆%,# 5 丁 5 菲# 5 杜天真#
(%1 湖州师范学院生命科学学院 5 湖州 6%6$$$;5 #1 江西农业大学园林与艺术学院 5 南昌 66$$!7)
关键词:5 实时荧光定量 8’9;构树;:9); 转录因子;!+ 值;盐胁迫
中图分类号:&<%=1 !";&<%=1 !65 5 5 文献标识码:,5 5 5 文章编号:%$$% > $%!" > $7
收稿日期:#$$? > $% > $?。
基金项目:国家林业局重点研究项目“构树种质资源及多目标利用营林技术研究”(#$$" > #!)和教育部高等学校博士点专项基金“构树特
殊抗逆性的生理及分子机理研究”(#$$"$!%$$$#)。
"杜天真为通讯作者 。
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4169 49,(-- !(9(:9(5 ;< "(16=>.?( @68/,(-:()9 A81)9.919.2( %&"
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B;-9,1:9:5 9FA0JKELF M0G/3FNOFBK PGABKEKAKEQF 8’9 RAN GNFS K/ SAKFOK :9); CFBFNT FU23FNNE/B 0FQF0N EB 0FAQFN /M
>3".,,"+$7(2 ?2?<3(&$32 NFFS0EBCN AK $,",%# ABS #! I AMKF3 K3FAKLFBKN REKI %$$,#$$ ABS 6$$ LL/0·- > % *A’04 +IF
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NK3FNN
5 5 转录因子是指那些专一性地结合于 :*, 特定序
列上、能激活或抑制其他基因转录的蛋白质(王少峡
等,#$$!)。 :9);( SFIWS3AKE/B 3FN2/BNEQF F0FLFBK
VEBSEBC 23/KFEB)转录因子是一种特异性的转录因子,
当植物在干旱、低温及盐等逆境胁迫下,:9); 转录
因子被诱导表达,与 :9) 元件特异结合,启动下游与
抗逆性相关的功能基因的表达,导致基因产物的累
积,调节植物体内各种生理生化反应,最终使植物对
环境胁迫的抗逆性得到提高(孙静文,#$$")。由于植
物的抗逆性属于复杂的数量性状,是多种调控机制共
同作用的结果,因此用单一的功能基因转化植物其效
果往往有限(秦红霞等,#$$")。相比之下,转录因子
基因可以通过与 :*, 元件的结合调控下游一系列基
因的表达,因此寻找植物抗逆过程中起重要作用的转
录因子基因,探究其作用范围及机制之后将其用于植
物抗逆基因工程中,预期能获得更为理想的效果。目
前,关于 :9); 转录因子基因的研究主要集中在草本
植物中,有关木本植物的 :9); 转录因子基因的克隆
及表达的研究较少。
构树( >3".,,"+$7(2 ?2?<3(&$32)具有良好的生态
和经济效益,它分布广,适应性强,整株均有利用价
值。构树叶是很好的动物饲料;树皮纤维洁白细长,
强度高、韧性好,是制备木浆的高级原料;根和种子
均可入药;树液可治皮肤病;果实富含氨基酸等有效
成分。构树耐干旱、耐贫瘠、抗盐碱,是迅速绿化荒
山、荒坡、荒滩和盐碱地的优良树种之一。同时,由
于其良好的适应性,还可作为研究木本植物应答环
境逆境信号途径的一种植物材料。在人口、粮食和
土地的矛盾日益加剧的今天,对这些适应性强且具
有较高经济价值的植物进行逆境的生理及分子机制
的研究十分必要。
实时荧光定量 8’9 技术是在常规 8’9 基础上
! 第 " 期 杨 ! 帆等:盐胁迫下构树 #$%& 转录因子基因表达的实时荧光定量 ’($ 分析
发展起来的可用于基因表达分析的核酸定量技术,
于 )**+ 年由美国 ,--./01 &/23435063 公司推出(袁
亚男等,7889),具有精确、操作简单、成本适中、可
以实现高通量的优势。实时荧光定量 ’($ 技术在
同一密闭试管中,同时进行 ’($ 扩增与靶核苷酸探
针杂交,与其他检测目的基因 6$:, 表达水平的方
法,如杂交、$;<’($ 相比,其污染可能是最低的,检
测需要的时间更短,灵敏度高(王明旭等,788=)。
操作相对简单,不需要跑胶和手工收集数据,影响因
素大大减少,也不需后期处理。基因芯片技术是分
析大量基因表达的良好方法,但与此技术相比,操作
过程繁杂,成本也高,且具有一定的假阳性。目前,
该技术在生物医学领域有着广泛的应用,近年来也
被逐渐运用于农作物的转基因检测和基因差异表达
研究上,如转基因玉米(!"# $#%&)(陈颖等,788")
和棉花( ’(&&%)*+$)(刘娜等,788>)的检测;水稻
(,-%.# &#/*0#),&1234(余舜武等,788>),’56(魏敏
等,788+),789:(赵森等,7889)等基因以及玉米中
的水分胁迫诱导基因(张中保等,788>)的表达,但
在林业上的运用还未见报道。
目前最常用的实时定量 ’($ 方法有染料
(?@&$ AB00C D)法和 ;EFGEC 探针法 7 种,本研究选
择探针法。?@&$ AB00C 荧光染料为双链 #:, 特异
性染色,它不仅和靶基因的扩增产物结合,也会同非
特异性 ’($ 产物结合,所以特异性不如探针法(@/C
"/ #;H,788);?IJ6/55K0C "/ #;H,7888),需要熔解曲线
判断 ’($ 扩增反应是否特异。探针法除了 ) 对特
异性引物,增加了 ) 条和模板互补的基因特异性探
针,探针上 =L端和 ML端分别标记了 ) 个报告荧光基
团(供体)和 ) 个猝灭荧光基团(受体),可提高定量
’($ 的专一性。每扩增 ) 个特异产物只释放 ) 个分
子的荧光染料,仪器检测的是特异扩增的结果,非特
异产物对检测信号没有影响,有效提高了检测的特
异性,不需要用到熔解曲线,但探针设计有一定
难度。
本文应用实时荧光定量 ’($ 技术研究了构树
幼苗叶片中 7 个 #$%& 转录因子基因在不同程度盐
胁迫下的表达差异,以此进一步验证它们与构树抗
盐性的关系,初步探讨盐胁迫下 #$%& 转录因子的
分子机制,为利用 #$%& 转录因子改良植物抗逆性
的基因工程技术提供线索。
!" 材料与方法
)N )! 材料 ! 来源于同一株健康母树的构树种子播
于装有洗净石英砂的培养皿中,待幼苗长至 7 片真
叶时,移栽于装有相同质量洁净砂的塑料钵中,每钵
种植 ) 株,用 ) O 7P2EK.EC1 营养液培养,尽量控制每
钵水分和养分一致,至株高 )8 I6 左右开始 :E(. 处
理。:E(. 溶液以营养液配制,设 M 个梯度,分别是
)88,788 和 M88 662.·Q R ),每梯度 M 个重复。分别
剪取未经 :E(. 处理和处理后 +,)7,7" J 的幼苗叶
片,立即投入液氮中,用于 $:, 抽提。
)N 7! 引物和探针 ! 选择已从构树中克隆到的编码
#$%& 类转录因子的 7 个 3)21<3 基因(A0C&ECS
的序列号分别为 #T7))9M+ 和 %U8*+=7>,下文中分
别称为 3)21<34 和 3)21<3:)作为目标基因进行
分析,以已发表的构树 7=/*> 基因(李岩等,788>)作
内标。引物运用 ’$DG%$ =N 8 软件设计,探针及引
物由上海生工提供(表 ))。
表 !" 引物和探针
#$%& !" ’()*+(, $-. /(0%+,
基因 A0C03 引物 ’B/60B3 探针 ’B2V03
3)21<34
!
W:=L<;(;A,A(,A,(;AA;;(;;;,AA(;B:=L=L3)21<3:
!
W:=L<(,(,,,(A,AAA,;;,;,,,,A;;AB:=L=L7=/*>
!
W:=L<(((,,;((,,A,A,AA;,;((;;,(B:=L=L)N M! 试验方法 ! ))$:, 抽提、纯化 ! ;B/X2. 试剂
( DCY/5B2K0C)提取总 $:,,#CE30(;EZE$E)酶解可能
混杂的基因组 #:,,用适量的 #%’( 水溶解 $:,,
用紫外分光光度计测定 $:, 的浓度和纯度,琼脂糖
凝脉电泳评价 $:, 质量。
7)I#:, 合成 ! 取各样品总 $:, 7 !K 分别进
行反转录,加入 ) !Q [./K2 15( DCY/5B2K0C),#CE30 抑
制剂(;EZE$E)8N = !Q,补 #%’( 水至终体积 )8 !Q。
轻轻混匀并在微量离心机低速将混合液收集在底
部。每个反应管中顺序加入 = \ $; &]WW0B " !Q,
>")
林 业 科 学 !" 卷 #
$%&’ ()*(+, --./·0 1 + 2345)( &67686)+ !0,
9%3:2 抑制剂( &3;393),< = !0,>?’@ 水 A< = !0,
((0B(+,, CD)E:·!0 1 +)( FDG)EH.I2D)+ !0。!J K空
气浴孵育 + 5,LL K = -)D,! K保存。
A)荧光定量 ’@9 分析 # 反应体系 A, !0,包括
(3:E2H (FM JN< = !0,上、下游引物(上海生工)各
,< " !0,探针(上海生工),< A !0,4>%O 模板 + !0。
反应于 8).P93$ F4Q4/2H 荧光定量 ’@9 仪上进行,每
个样品做 A 次平行反应,反应条件为:L= K预变性 A
-)D,L= K J, :,", K J, :,循环 !, 次。电脑自动分
析,直接读出 !& 值。
!)基因表达差异的分析(;2DD2E5 "# $%R,J,,+)
分析方法的确立:以不同处理的 4>%O 模板混合样
进行梯度稀释,对于每一个稀释样本,用目标基因和
内标基因的荧光探针及引物进行扩增。计算出它们
的平均 !& 值以及+!& 值,通过 4>%O 浓度梯度的
/I 值对+!& 值作图,如果所得直线斜率接近于 ,,说
明反应优化较好,目标基因和内标基因的扩增效率
相同,可以通过比较 !& 值的方法进行相对定量,分
析基因表达的差异。另外,运用 J+!S&[+!S& T !&(参
照)1 !&(处理)]分析作为内标的 &’#() 基因的相对
表达量,以判断该基因的表达受试验处理的影响,确
定其作为内标的有效性。
基因表达相对定量分析:当反应条件优化较
好,将参照样本的基因表达设为 +,那么处理样本中
的基因表达量变化的倍数可以用 J++!&来表示,其
中++!& T +!&(参照)1 +!&(处理),+!& T
!&(目标基因)1 !&(内标基因)。
!" 结果与分析
J< +# 9%O 抽提质量 # 提取总 9%O 经分光光度计
检测,6> J", U JV, 在 +< V W J< + 之间。经 +X琼脂糖
变性凝胶电泳显示(图 +),条带清晰,无明显降解,
可用于反转录反应。
J< J# 扩增效率分析 # 不同处理所得的 4>%O 模板
混合样进行 +, 倍 V 个梯度的稀释。根据 +< A 所述
的方法,对于每一个稀释样本,用目标基因和内标基
因的荧光探针及引物进行扩增,通过 4>%O 浓度梯
度的 /I 值对+!& 值作图,得到图 J。所得直线斜率
分别为 ,< ,JA A 和 ,< ,A+,均接近于 ,,说明反应优化
较好,>9?8 转录因子基因和 &’#() 基因的扩增效率
相同,因此,可以通过比较 !& 值的方法,运用 J
++!&
公式进行相对定量,参照样本为 %3@/ 处理前的
叶片。
J< A# 实时 ’@9 反应的可靠性 # 每样品每基因均
图 +# 9%O 电泳图
Y)IR +# 9%O 2/24EH.Z5.H2IH3-
图 J# 目标基因与内标基因的扩增效率分析
Y)IR J# OD3/Q:): .[ 3-Z/)[)43E).D 2[[)4)2D4Q .[
E3HI2E I2D2 3D$ )DE2HD3/ I2D2
*:4>%O 稀释倍数 4>%O $)/CE).DR
按照 A 孔平行试验,得出 A 个基因 !& 值的标准偏差
均小于 ,< A(表 J),说明试验建立的定量 ’@9 反应
具有较强的准确性和可重复性。此外,运用J+!S&计
算作为内标的 &’#() 基因的相对表达量,得出 +,,,
J,, 和 A,, --./·0 1 + %3@/ 胁迫处理过程中它的相
对表达量均稳定在 + 左右,变幅很小。方差分析得
到 + 值分别为 ,< J,= ",,< A=+ ! 和 ,< +L" N,说明胁
迫处理时间对 &’#() 基因表达的影响也很小。因此,
&’#() 基因在这里作为内标是合适的。
J< !# 盐胁迫下构树 ,-./ 基因表达的变化 # 从
图 AO可 以 看 到,/0,-./1 基 因 在 +,, 和 J,,
--./·0 1 + %3@/ 胁迫下都能被显著诱导表达。其
中,在 +,, --./·0 1 + %3@/ 胁迫下,",+J 5 时均被诱
导上调,表达量分别比未胁迫的参照样本增加了
J< =,N< A 倍,而后又表现为下调趋势,到 J! 5 时,表
达量比对照下降一半。在 J,, --./·0 1 +的 %3@/ 胁
V!+
! 第 " 期 杨 ! 帆等:盐胁迫下构树 #$%& 转录因子基因表达的实时荧光定量 ’($ 分析
! ! ! ! ! 表 !" 不同浓度 #$%& 胁迫下构树叶片 !"#$%! 和 &’()* 基因实时 ’%( 反应 +) 值
)$*+ !" +) ,$&-. /0 1.$&2345. ’%( 1.$634/7 /0 !"#$%! $78 &’()* 9.7. 47 &.$,.: /0
!, "-"./)01/- -78.1 8400.1.73 #$%& 31.$35.73:
基因
)*+*
,-(. 处理
/0*-12*+13 4
(225.·6 7 8)
处理时间
/92* 4
:
!/
重复 8
$*;*-1 8
重复 <
$*;*-1 <
重复 =
$*;*-1 =
标准差
>#
平均值
?*-+
"#$%&"’ 8@@ @ <"A B= <"A =C <"A C8 @A 8D <"A EC
B <=A 8@ <8< <8A CE <8A BD <8A =D @A <@ <8A B@
<" <@@ @ B 8< <=A F< <=A CC <=A B= @A 8E <=A CC
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B <=A "B <=A 8E <=A EF @A <= <=A "@
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8< <8A 8E <@A B< <8A @@ @A <" <8A EB <8A 8= <8A <@@ @ 8FA D@ <@A B <@A 8< <@A BE <@A <8 <@A E@ @A << <@A "E
<" <@A CB <@A =@@ @ <
B <=A 8B <8< <<" <=A 8B <迫下,胁迫 B : 表达量被诱导上调达对照的 8A < 倍,
8< : 时高达 EA < 倍,而后又表现为下降趋势,但在
<" : 时它的表达量仍然高于对照,为对照的 8A B 倍;
而在 =@@ 225.·6 7 8 ,-(. 胁迫下,"#$%&"’ 基因的
表达量却始终低于未经盐胁迫处理的。
! ! 如图 =& 所示,"#$%&"( 基因在 8@@ 225.·6 7 8
,-(. 胁迫下的相对表达量先被强烈诱导升高而后
又逐渐下降。在 8@@ 225.·6 7 8 ,-(. 胁迫 B : 时表
达量上调到对照的 =@A C 倍,8< : 时为对照的 倍,而后继续下降并且下降幅度明显增大,<" : 时
降至对照的 8A = 倍。在 <@@ 225.·6 7 8 ,-(. 胁迫 B,
8< : 时表达量均低于对照,然后缓慢上升,到 <" :
时表达量达对照的
胁迫下,"#$%&"( 基因的表达量始终小于对照,说
明它未被 ,-(. 胁迫诱导。
;" 结论
试验 表 明,"#$%&"’ 基 因 能 被 8@@, <@@
225.·6 7 8 ,-(. 胁迫所诱导,"#$%&"( 基因能被
8@@ 225.·6 7 8,-(. 胁迫所诱导,对盐胁迫做出表达
水平增高的应答,但超过一段时间之后表达量又逐
渐下降。后期表达量的下降可能有 < 种解释:一是
#$%& 转录因子被诱导表达后启动下游与抗逆性相
关的功能基因的表达,调节植物体内各种生理生化
反应,使构树对盐胁迫的抗逆性得到提高,已经对胁
迫环境产生了适应,盐胁迫不再诱导 #$%& 转录因
子基因的表达上调;二是 #$%& 转录因子的诱导会
受到胁迫时间的限制,超过一定的时间,表达逐渐受
F"8
林 业 科 学 !" 卷 #
图 $# 不同浓度 %&’( 胁迫下 !"#$%!& 和
!"#$%!’ 基因相对表达差异
)*+, $# -.(&/*0. .123.44*56 57 !"#$%!& &68 !"#$%!’
968.3 8*77.3.6/ :56:.6/3&/*564 57 %&’( 4/3.44
到抑制,植物对逆境的耐受性也逐渐降低。以上推
断还需要进一步深入的试验加以论证。!"#$%!’
基因也能被 ;<< ==5(·> ? @ %&’( 胁迫所诱导表达量
升高,但是在表达量升高之前的一段时间里它的表
达被抑制,可能是在中度盐胁迫下,!"#$%!’ 基因
要经历一个启动期才能被诱导表达。!"#$%!’ 基
因在 @<< ==5(·> ? @%&’( 胁迫下比 !"#$%!& 基因的
表达量大,可能暗示着较 低 程 度 的 盐 胁 迫 对
!"#$%!’ 基因的诱导影响更大,在低盐胁迫下它的
抗逆作用更强。当 %&’( 浓度达到 $<< ==5(·> ? @,
!"#$%!& 和 !"#$%!’ 基因对胁迫的应答均表现为
表达水平的降低,也就是说它们的表达被抑制。结
合对植株外部形态的观察,经 $<< ==5(·> ? @ %&’( 胁
迫处理的构树幼苗,在胁迫 " A 之后就陆续出现叶
片失绿枯萎等症状,;! A 左右开始陆续有植株死
亡,推断在 ;! A 之后不可能出现 !"#$%! 基因表达
量被诱导升高的情况。
构树幼苗叶片中 #$%! 基因的转录表达受盐胁
迫因子所诱导,它可能参与构树应答盐胁迫逆境的
信号传递途径,但超过一定的胁迫时间和程度此类
基因可被阻遏。
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