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ANALYSIS OF GENETIC RELATIONSHIP OF BETULA AMONG SPECIES USING RAPD MARKER

利用RAPD标记技术对桦树种间亲缘关系的分析


RAPD technique was used to detect the genetic relationship among seven Betula species.233 loci in total were amplified by using 14 random primers.The percentage of polymorphic loci varied from 12.02% to 36.91%,in which B.costata had the highest variation level.The dendrogram of genetic relationship was constructed on the basis of the genetic distances among species.According to genetic distance in more than 1.22,six species were clustered into two groups,where B.fruticosal was one group and others,including B.davurica,B.pendula,B.platyphylla,B.schmidtii and B.costata, were grouped together.It indicated that the result of genetic relationship obtained by RAPD technique was closely consistent with that classified by traditional morphological classification.The analysis of genetic relationship among Betula species would validly guide the parental selection and interspecies crossing for Betula species.


全 文 :第 v{卷 第 t期
u s s u年 t 月
林 业 科 学
≥≤Œ∞‘׌„ ≥Œ∂ „∞ ≥Œ‘Œ≤„∞
∂²¯1v{ o‘²1t
¤±qou s s u
利用 • „°⁄标记技术对桦树种间亲缘关系的分析
姜 静 杨传平 刘桂丰 刘玉喜 任旭琴
k东北林业大学 哈尔滨 txsswsl
关键词 } • „°⁄o桦树 o种间 o亲缘关系 o杂交育种
收稿日期 }usss2s|2ux ∀
ΑΝΑΛΨΣΙΣ ΟΦ ΓΕΝΕΤΙΧ ΡΕΛΑΤΙΟΝΣΗΙΠ ΟΦ ΒΕΤΥΛΑ ΑΜΟΝΓ
ΣΠΕΧΙΕΣ ΥΣΙΝΓ ΡΑΠ∆ ΜΑΡ ΚΕΡ
¬¤±ª¬±ª ≠¤±ª≤«∏¤±³¬±ª ¬∏Š∏¬©¨ ±ª ¬∏≠∏¬¬ • ±¨ ÷∏´¬±
k Νορτηεαστ Φορεστρψ Υνιϖερσιτψ Ηαρβιν txsswsl
Αβστραχτ } • „°⁄·¨¦«±¬´∏¨ º¤¶∏¶¨§·²§¨·¨¦··«¨ ª¨ ±¨·¬¦µ¨ ¤¯·¬²±¶«¬³¤°²±ª¶¨√¨ ± Βετυλᶳ¨¦¬¨¶quvv ²¯¦¬¬±·²·¤¯ º¨ µ¨
¤°³¯¬©¬¨§¥¼ ∏¶¬±ªtw µ¤±§²° ³µ¬°¨ µ¶q׫¨ ³¨µ¦¨±·¤ª¨ ²©³²¯¼°²µ³«¬¦ ²¯¦¬√¤µ¬¨§©µ²° tu qsu h ·²vy q|t h o¬± º«¬¦« Βq
χοστατα «¤§·«¨ «¬ª«¨¶·√¤µ¬¤·¬²±¯¨ √¨ ¯q׫¨ §¨±§µ²ªµ¤° ²©ª¨ ±¨·¬¦µ¨ ¤¯·¬²±¶«¬³ º¤¶¦²±¶·µ∏¦·¨§²±·«¨ ¥¤¶¬¶²©·«¨ ª¨ ±¨ ·¬¦
§¬¶·¤±¦¨¶¤°²±ª¶³¨¦¬¨¶q„¦¦²µ§¬±ª·²ª¨ ±¨·¬¦§¬¶·¤±¦¨ ¬± °²µ¨·«¤±t quu o¶¬¬¶³¨¦¬¨¶º¨ µ¨ ¦¯∏¶·¨µ¨§¬±·²·º²ªµ²∏³¶oº«¨µ¨
Βqφρυτιχοσαλ º¤¶²±¨ ªµ²∏³¤±§²·«¨µ¶o¬±¦¯∏§¬±ª ΒqδαϖυριχαoΒqπενδυλαoΒqπλατψπηψλλαoΒqσχηµιδτιι ¤±§ Βqχοσταταo
º¨ µ¨ ªµ²∏³¨§·²ª¨·«¨µqŒ·¬±§¬¦¤·¨§·«¤··«¨ µ¨¶∏¯·²©ª¨ ±¨·¬¦µ¨ ¤¯·¬²±¶«¬³²¥·¤¬±¨ §¥¼ • „°⁄·¨¦«±¬´∏¨ º¤¶¦¯²¶¨ ¼¯ ¦²±¶¬¶·¨±·
º¬·«·«¤·¦¯¤¶¶¬©¬¨§¥¼ ·µ¤§¬·¬²±¤¯ °²µ³«²¯²ª¬¦¤¯ ¦¯¤¶¶¬©¬¦¤·¬²±q׫¨ ¤±¤¯¼¶¬¶²© ª¨ ±¨·¬¦µ¨ ¤¯·¬²±¶«¬³¤°²±ª Βετυλα ¶³¨¦¬¨¶
º²∏¯§√¤¯¬§¯¼ ª∏¬§¨ ·«¨ ³¤µ¨±·¤¯ ¶¨¯¨ ¦·¬²± ¤±§¬±·¨µ¶³¨¦¬¨¶¦µ²¶¶¬±ª©²µΒετυλᶳ¨¦¬¨¶q
Κεψ ωορδσ} • „°⁄o ΒετυλαoŒ±·¨µ¶³¨¦¬¨¶o Š¨ ±¨·¬¦µ¨ ¤¯·¬²±¶«¬³o≤µ²¶¶2¥µ¨ §¨¬±ª
桦木属k Βετυλαl在我国约有 vs种 o主要分布于东北 !华北 !华中 !西南以及西北等广大地区 ∀其中能
被开发利用的乔木有 uv种 o这些树种的生长特性 !抗性及木材物理性质差异很大 o每一树种各有其优缺
点k中国植物志第十一卷 ot|z|l ∀如果开展杂交育种研究 o可以综合两个或多个树种的优良特性 ∀由于
种间杂交更容易发生在亲缘关系较近的种间 o为此 o对桦树种间亲缘关系的分析 o是进行种间杂交的前
提k王明庥 ot|{{l ∀本文应用 • „°⁄技术 o在 ⁄‘„水平上鉴定几种桦树的亲缘关系 o为开展种间杂交亲
本的选配 o充分挖掘基因资源提供科学依据 ∀
表 1 桦树样品来源
Ταβ .1 Τηεσουρχεσ οφσαµπλεσ οφ Βετυλα
树种
≥³¨¦¬¨¶
采集地
°µ²√ ±¨¤±¦¨¶
个体数
‘²q²©¬±§¬√¬§∏¤¯¶
枫桦 Β qχοστατα 帽儿山 ¤²¨µ¶«¤± {
赛黑桦 Β qσχηµιδτιι 新滨县 ÷¬±¥¬± ≤²∏±·¼ |
黑桦 Β qδαϖυριχα 哈尔滨植物园 ‹¤µ¥¬± „µ¥²µ¨·∏° y
柴桦 Β qφρυτιχοσαλ 哈尔滨植物园 ‹¤µ¥¬± „µ¥²µ¨·∏° x
白桦 Β qπλατψπηψλλα 帽儿山 ¤²¨µ¶«¤± |
欧洲白桦 Β qπενδυλα 芬兰 ƒ¬±¯¤±§ tt
1 材料与方法
t1t 试验材料 欧洲白桦k Β qπενδυλαl
k由芬兰林木育种基金会提供l !枫桦
k Β qχοσταταl !赛黑桦k Β qσχηµιδτιιl !白桦
k Β qπλατψπηψλλαl的种子 o于 t||{ ) sx 播
种于塑料大棚中 oy月中旬采集幼叶k p
zs ε 冰箱中保存备用 ∀黑桦k Β qδαϖυρι2
χαql !柴桦k Β qφρυτιχοσαλl试材于 t||{年
早春分别采自哈尔滨市植物园k表 tl ∀
t1u 总 ⁄‘„提取与浓度的测定 ≤ׄ…法提取总 ⁄‘„ o利用美国 °∞• ŽŒ‘∞∞• 公司生产的 ˜∂Π∂t≥
≥³¨¦·µ²°¨ ·¨µ¤°¥§¤ …¬²ts测定所提 ⁄‘„的含量和纯度 ∀
t1v 引物筛选 参阅国内外有关研究文献 o参照 ’³¨µ²±公司的引物序列 o在 פŽ¤•¤公司合成了 zx个
ts碱基长度的寡核苷酸引物 o分别扩增桦树 u个 ⁄‘„样品 o筛选出扩增性强 !重复性好 !多态性高的 tw
个引物k表 ul o用于全部桦树 ⁄‘„样品的扩增 ∀
表 2 14 个随机引物序列
Ταβ .2 Σεθυενχεσ οφ 14 αρβιτραρψ πριµερσ
引物名称
‘¤°¨ ²©³µ¬° µ¨¶
序列 xχ2vχ
≥¨ ∏´¨ ±¦¨¶xχ2vχ
引物名称
‘¤°¨²©³µ¬°¨ µ¶
序列 xχ2vχ
≥¨ ∏´¨ ±¦¨¶xχ2vχ
’°„ ) su ׊≤≤Š„Š≤׊ ’°± ) sx ≤≤Š≤Š×≤×׊
’°„ ) tw ×≤׊׊≤׊Š ’°± ) tt ×≤×≤≤Š≤„„≤
’°„ ) t| ≤„„„≤Š×≤ŠŠ ’°± ) sz ≤≤≤≤Š„׊Š×
’°„ ) s| ŠŠŠ×„„≤Š≤≤ ’°‘) sz ≤„Š≤≤≤„Š„Š
’°… ) sz ŠŠ×Š„≤Š≤„Š ’°Ž) su Š×≤×≤≤Š≤„„
’°… ) tz „ŠŠŠ„„≤Š„Š ’°Ž) tz ≤≤≤„Š≤׊׊
’°≤ ) tu ׊×≤„×≤≤≤≤ ’°≤ ) tw ׊≤Š×Š≤×׊
t1w °≤• 扩增及产物的鉴定 • „°⁄2
°≤• 扩增是在 °¨ µ®¬±2∞¯ °¨ µ|yss扩增仪
上进行 o每 us ˏ反应体积中含 ws ±ª
⁄‘„模板 ovs ±ª引物 os1u °°²¯Πw ≅
§‘×°k≥¤±ª²± 产品l ot ≅ 缓冲液 ot˜
פ´ ⁄‘„聚合酶k°µ²°¨ ª¤产品l ∀扩增程
序为 }|w ε 加热 v °¬±o使模板 ⁄‘„变性 o
然后进入下列温度循环 }|w ε 变性 t
°¬± !vz ε 退火 t °¬± !zu ε 延伸 u °¬±o共
计 ws个循环 ∀循环结束后在 zu ε 延伸
z °¬±o以保证 ⁄‘„延伸彻底 ∀
°≤• 扩增反应结束后 o采用 t ≅ ׄ∞电泳缓冲液 o在 t1x h的琼脂糖凝胶中k含 ∞…s1x Λª#°ptl电泳
分离扩增产物 o同时 o在适当的位置上加上一个已知分子量的 ⁄‘„ 标准样品ktss¥³ ⁄‘„ ¤§§¨µ购自
…Œ公司l o电泳结束后在 ˜∂°凝胶成像系统下观察照相 ∀
t1x 数据统计与分析 电泳图谱中的每一条带均代表了引物与模板 ⁄‘„互补的一对结合位点 o可记
为一个分子标记 o根据分子量标准对照反应产物在胶上的对应位置 o估计扩增产物的分子量大小 o有带
的记为 t o无带的记为 s o形成 sΠt矩阵图输入计算机 ∀
采用 • „°⁄¬¶·¤±¦¨ 软件包 o用 ∞¬¦²©©¬¨µετ αλqkt||ul遗传距离公式计算个体间的遗传距离 o用 ‘¨¬ª«2
¥²µ) ²¬±¬±ª方法构建个体间树状聚类图 ∀与 „’∂ „分析软件连用 o计算种间的遗传距离 o应用 ≥ׄ2
׌≥׌≤„分析软件 o构建了供试桦树的亲缘关系聚类图 ∀
2 结果与分析
u1t 多态位点比率 多态位点百分率可作为度量遗传变异水平高低的指标 o对 y种桦树 w{个个体进
行了 • „°⁄分析 ∀共检测到 uvv个位点 o位点范围在 uxs ∗ usss¥³之间k图 t !ul o多态位点百分率在
tu1su h ∗ vy1|t h之间 o多态位点比率由大到小依次为枫桦 !欧洲白桦 !白桦 !赛黑桦 !黑桦和柴桦k表
vl o结果表明 }枫桦的遗传变异水平最高 o柴桦的遗传变异水平较低 ∀
图 t 引物 ’°Ž2su扩增的电泳图谱
ƒ¬ªqt °µ²©¬¯¨ ³µ²§∏¦¨§¥¼·«¨ ³µ¬°¨ µ’°Ž2su
t ∗ |赛黑桦 t ∗ | Βqσχηµιδτιι ots ∗ tu柴桦 ts ∗ tu Βqφρυτιχοσαλo
tv分子量标准 tv ²¯ ¦¨∏¯¤µº¨ ¬ª«·°¤µ®¨µktss¥³⁄‘„ ¤¯§§¨µl q

图 u 引物 ’°±2sx扩增的电泳图谱
ƒ¬ªqu °µ²©¬¯¨ ³µ²§∏¦¨§¥¼ ³µ¬°¨ µ’°±2sx
t ∗ |白桦 t ∗ | Βqπλατψπηψλλαots ∗ tu黑桦 ts ∗ tu Βqδαϖυριχαo
tv分子量标准 tv ²¯ ¦¨∏¯¤µº¨ ¬ª«·°¤µ®¨µktss¥³⁄‘„ ¤¯§§¨µl q
u1u 遗传距离聚类分析 利用 „’∂ „软件分析了桦树的 • „°⁄扩增数据 o得到种间的遗传距离矩阵
k表 wl o将遗传距离矩阵输入 ≥ׄ׌≥׌≤„软件分析 o构建了供试桦树的亲缘关系聚类图k图 vl o结果显
xxt 第 t期 姜 静等 }利用 • „°⁄标记技术对桦树种间亲缘关系的分析
表 3 桦树多态位点百分率
Ταβ .3 Τηε περχενταγε οφ πολψµορπηιχ λοχι οφ Βετυλα
树种
≥³¨¦¬¨¶
个体数
‘²q²©¬±§¬√¬§∏¤¯¶
位点总数
ײ·¤¯ ²¯¦¬
多态位点数
‘²q²©³²¯¼°²µ³«¬¦ ²¯¦¬
多态位点比率
°°k h l
枫桦 Β qχοστατα { uvv {y vy1|t
赛黑桦 Β qσχηµιδτιι | uvv yz u{1zy
黑桦 Β qδαϖυριχα y uvv vs tu1{{
柴桦 Β qφρυτιχοσαλ x uvv u{ tu1su
白桦 Β qπλατψπηψλλα | uvv z{ vv1w{
欧洲白桦 Β qπενδυλα tt uvv {s vw1vv
示 }在 t1uu的遗传距离上 y种
桦树分为两大类群 o即柴桦单
独为 t类 o其它聚为 t类 ∀第
二类群中 o在 t1us的遗传距离
上又分为两个亚群 o即黑桦 !欧
洲白桦 !白桦聚为 t亚群 o赛黑
桦和枫桦聚为另 t亚群 ∀
3 讨论
v1t 桦树遗传变异的分析
桦树在我国的分布极广泛 o遍布十几个省区 ∀由于桦树分布区内气候和地理条件的多样性造成了种间
遗传变异的复杂性 ∀在所分析的几种桦树中枫桦是桦树中最耐阴者k周以良 ot||wl o其遗传变异水平最
高 o因而具有较大的选择潜力 o对这一基因资源需要充分挖掘 !合理利用 ∀
表 4 桦树间的遗传距离矩阵
Ταβ .4 Ματριξ οφ γενετιχ διστανχεσ βετωεεν Βετυλα σπεχιεσ
枫桦
Β qχοστατα
赛黑桦
Β qσχηµιδτιι
白桦
Β qπλατψπηψλλα
欧洲白桦
Β qπενδυλα
黑桦
Β qδαϖυριχα
柴桦
Β qφρυτιχοσαλ
枫桦 Β qχοστατα s1ssss s1ssss s1ssss s1ssss s1ssss s1ssss
赛黑桦 Β qσχηµιδτιι s1|yxx s1ssss s1ssss s1ssss s1ssss s1ssss
白桦 Β qπλατψπηψλλα s1xx|z t1tyws s1ssss s1ssss s1ssss s1ssss
欧洲白桦 Β qπενδυλα s1{zz{ t1uzs{ s1|xw| s1ssss s1ssss s1ssss
黑桦 Β qδαϖυριχα s1{vzw t1vsux s1||su t1uttx s1ssss s1ssss
柴桦 Β qφρυτιχοσαλ s1y|yv t1uu|| s1|s{w t1s|u{ t1vzvz s1ssss
图 v 桦树种间遗传距离聚类图
ƒ¬ªqv ⁄¨ ±§µ²ªµ¤° ¤°²±ª Βετυλᶳ¨¦¬¨¶¥¤¶¨§²±·«¨
ª¨ ±¨ ·¬¦§¬¶·¤±¦¨¶ª¨ ±¨ µ¤·¨§¥¼ ≥ׄ׌≥׌≤„
t柴桦 Β qφρυτιχοσα ou黑桦 Β qδαϖυριχα ov 欧洲白桦 Β qπενδυλα o
w白桦 Β qπλατψπηψλλαox赛黑桦 Β qσχηµιδτιι oy枫桦 Β qχοστατ q
v1u 几种桦树种间亲缘关系的比较 经典的分类方
法将桦木属分为西桦组k Σεχτ qΒετυλαστερl和桦木组
kΣεχτ qΒετυλαl o本实验分析的桦树均属于桦木组k郑
万钧 ot|{xl o应用 • „°⁄标记技术对几种桦树亲缘关
系的分析结果与传统的形态分类结果基本一致 o只是
枫桦和赛黑桦在经典分类中亲缘关系较远 o而利用
• „°⁄技术分析则亲缘关系很近 ∀
v1v 开展桦树种间杂交的建议 研究表明 o杂交更
容易发生在亲缘关系较近的种间 ∀本实验利用 • „°⁄
分子标记技术对几种桦树亲缘关系的分析结果是 o亲
缘关系较近的有 u组 o即黑桦 !欧洲白桦与白桦组 o赛
黑桦与枫桦组 ∀在杂交育种研究中建议首先选定这
u组进行杂交可配性试验 o进行桦树种间杂交尝试 o
同时应考虑亲本双方的优缺点能互补 o亲本的优良性
状要突出 o才有希望达到育种目标 ∀
参 考 文 献
王明庥主编 q林木育种学概论 1北京 }中国林业出版社 ot|{{
郑万钧 1中国树木志 q北京 }中国林业出版社 ot|{x
中国植物志第十一卷 q中国科学院中国植物志编辑委员会 q北京 }科学出版社 ot|z|
周以良 1中国小兴安岭植被 q北京 }科学出版社 ot||w
yxt 林 业 科 学 v{卷