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UV-A特异诱导的CHS家族基因在芜菁花青素合成途径的表达特性


查儿酮合成酶基因(CHS)为花青素合成代谢的关键酶基因,其表达受光环境的影响,但是在很多植物中CHS以多基因家族成员存在。为了明确UV-A对芜菁CHS家族成员的诱导表达特性,研究CHS家族各成员与花青素合成的相关性,以期获得对CHS家族基因更全面的、深入的认识,这对理解花色素的合成代谢及UV-A诱导的光信号途径具有重要的理论意义。以依光型花青素合成的‘津田’芜菁为试材,利用改良CTAB法提取总DNA,合成保守探针,Southern检测CHS家族基因成员数。用Trizol法提取UVA诱导的幼苗下胚轴以及膨大下胚轴表皮总RNA,同源PCR克隆以及RACE PCR合成CHS家族成员基因,并利用生物信息学方法对其序列进行分析。利用获得的相关序列设计CHS成员特异性引物,Real time PCR分析CHS各成员基因在UV-A、蓝光诱导以及各组织部位的表达特性。

从‘津田’芜菁中获得了CHS 6个家族成员基因,分别命名为BrCHS1-6。序列分析表明CHS 6个家族成员基因均由1个内含子和2个外显子组成,编码序列与其它植物CHS序列有较高的相似性。同时Southern检测表明在‘津田’芜菁中至少存在6个CHS家族成员基因。Real time PCR结果表明BrCHS2,3,6在叶子、下胚轴表皮、幼苗下胚轴中的转录水平很低,而且它们在幼苗下胚轴中的表达不受蓝光以及UV-A的诱导;而BrCHS1,4,5在膨大红色下胚轴表皮以及UV-A诱导的幼苗下胚轴中大量表达,尤其是BrCHS5受UV-A诱导表达量最高,且受组织特异性影响,BrCHS1,4,5受UV-A诱导,且在幼苗下胚轴中下部表达最高。蓝光虽也可少量诱导BrCHS1,4,5的表达,但只限于幼苗下胚轴上部靠近子叶的部位。因此,在‘津田’芜菁6个CHS家族成员基因中,BrCHS1,4,5可能参与UV-A特异诱导的花青素合成代谢途径。