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Cloning and Analysis of a cDNA Encoding Key Enzyme Gene(hmgr)of the MVA Pathway in Medicinal Plant Euphorbia pekinensis

大戟甲羟戊酸途径关键酶基因hmgr的克隆与分析



全 文 :武汉植物学研究 2007,25(2):123~126
Jouma/at"Wulum Botanical Research
大戟甲羟戊酸途径关键酶基因 hmgr的克隆与分析
曹小迎 ,蒋继宏 ,刘群 ,戴传超 ,陈凤美
(1.徐州师范大学江苏省药用植物生物技术重点实验室,江苏徐州 221 1 16;2.南京师范大学生命科学学院,南京 210097)
摘 要 :通过 比较 6种植物 8条甲羟戊酸途径关键酶3一羟基-3.-甲基戊二酰辅酶 A还原酶 (HMGR)基因同源区域,
设计简并引物,利用 RT-PCR技术成功地从大戟(Euphorbia pekinensi~)叶中扩增出458 bp的基因片段。通过 BlastP
比较,所推断 的大戟 HMGR蛋 白序列与杜仲 Eucomm/a u/mok/~s(AAV54051)、穿心莲 Andrographi5 paniculata
(AAP14352)、胡黄连P/crorh/za kl/,rrooa(ABC/4565)、橡胶树Hevea brasiliensis(AAU08214)、海岛棉Gossypium barba-
dense(ABC71314)、龙胆草 Gent/ana lutea(BAE9273o)的一致性分别达到 9O%、86%、86%、92%、87%和 88%。蛋
白质保守区、特征区以及进化树分析,初步证实该基因为hmgr基因,这是首次报道从药用植物大戟中克隆到甲羟
戊酸途径关键酶 HMGR的基因片段。
关键词:大戟;3-羟基-3.甲基戊二酰辅酶A还原酶;基因克隆
中图分类号:q781 文献标识码:A 文章编号 :1000—470X(2007)02—0123—04
Cloning and Analysis of a cDNA Encoding Key Enzyme Gene(hmgr)
of the M VA Pathway in M edicinal Plant Euphorbia pekinensis
CAO Xiao—Ying ,JIANG Ji—Hong ’,LIU Qua ,DAI Chuan—Chao ,CHEN Feng—Mei
(1.XudaouNormal Unh~rdty,Key Labom~ryo,Bioteehno/ogyforMeal/e/ha/P/ant,Xuzhou,Jiangsu 221116,China;
2.Colege D,Life Sciences,Nanii.g Normal ,Nanjing 210097,China)
Abstract:Based on the design of degenerated oligonucleotides according to the conservative regions of
eight 3-hydroxy-3-·methylglutaryl-·CoA reductasos from six plants an d total RNA extracted from Euphorbia
pekinensis,a 458 bp fragment of hmgr was obtained using reverse transcription PCR strategy.Thmugh se—
quence analysis by BlastP online.the resulting protein showed high homology to 3-hydroxy一3一methylgluta—
ryl—CoA reductase,with 90% identifcation compared with Eucommia ulmoides(AAV5405 1),86% with
Andrographispaniculata(AAP14352),86% with Picrorhiza kurrooa(ABC74565),92% with Hevea bra—
siliensis(AAU08214),87% with Gosypium barbadense(ABC71314)and 88% with Gent/ana lutea
(BAE92730).Deduced amino acid sequence were also analyzed by PROSITE,ClustalX and Phylogenic
tree,an d data present evidence for the existence of 3-hydroxy一3一methylghtaryl—CoA reductase in E.peki—
nensis,which is the first report of the hmgr gene isolated from E.pekinensis.
Key words:Euphorbia pekinensis;3-hydroxy-3一methyl—glutaryl—coenzyme A reductase(HMGR);Gene
cloning
许多植物萜类化合物(如抗肿瘤药物紫杉醇和
抗疟药青蒿素)都具有很好的药理活性,为解决当
前西药毒副作用及治疗癌症、艾滋病等疑难疾病提
供了一条新的药物来源,因此植物萜类化合物引起
了人们浓厚的兴趣。随着植物基因工程的飞速发
展,植物萜类代谢途径的研究取得了突破性的进展,
人们通过对关键酶基因的分离克隆,表达调控进而
对萜类次生代谢的合成途径和调控机制有了更为深
入的了解 ¨ 。现代研究认为萜类在植物体中的合
成是分为两部分的,一部分是甲羟戊酸途径,在细胞
质中进行 ,产生倍半萜和三萜 ¨;另一部分是非 甲
羟戊酸途径,在细胞的质体中进行,产生单萜、二萜
和四萜 。在甲羟戊酸途径中 3一羟基-3一甲基戊二
酰辅酶 A还原酶(3-hydroxy-3一methylglutaryl CoA re—
ductase,HMGR)是主要的关键酶之一。目前,hmgr
基因已先后从苹果 】、红豆杉 及甜瓜[6 等植物中
得到分离克隆。
药用植物大戟 (Euphorbia pekinensis)又名龙虎
收藕日期:2006—10—19,修回日期:2006—12—14。
基金项 目:徐州师范大学科研重点项 目(04XLA14)资助。
作者简介:曹小迎(1975一),女,江苏通州人 ,博士研究生,主要从事药用植物生物技术的研究工作。
· 通讯作者(E-mail:jhjiang~xznu.edu.cn)。
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武 汉 植 物 学 研 究 第25卷
草、将军草、九头狮子等,在植物分类学上属大戟科,
为多年生草本植物。全株含乳汁。现代医学研究发
现,药用植物大戟的根具有多种药理作用,如致泻、
利尿、降压等。临床一般用于治疗急、慢性肾炎水肿
及晚期血吸虫病腹水或其他肝硬变腹水。研究发现,
药用植物大戟根含三萜类成分大戟甙、生物碱、大戟
色素体 A、B、c,另含树胶、树脂等 。若能通过基
因工程手段来调控萜类代谢途径的关键酶如 HlVIGR
等继而促进萜类活性代谢产物的合成积累将是一件
十分有意义的事件。但迄今为止,国内外尚未见到
有关大戟萜类物质代谢合成途径及其关键酶基因如
hrngr等的研究报道。此外,从不同物种中分离克隆
hrngr基因,从而进一步研究 hrngr基因的结构特征、
分子进化以其生物学功能都是非常有意义的。我们
首次克隆了药用植物大戟hmgr基因的eDNA片段,
并用生物信息学手段对其序列进行了分析。
1 材料与方法
1.1 材料
大戟(Euphorb/a pekinenais)原植物采自安徽省
琅琊山森林公园,经安徽师范大学生命科学学院周
守标教授鉴定。
1.2 总 RNA的提取
大戟总RNA提取参照庄军平等[8 报道的方法
略加改动,可以概括为:取1 g大戟的幼嫩叶片,液氮
速冻后研磨成粉末,移人50 mL离心管。加人10 mL
65~C预热的抽提缓冲液[2% (IV/V)CTAB(十六烷
基三甲基溴化铵),100 mmol/L Tris/HCl(pH 7.4),
2 mol/L NaCI,25 mmol/L EDTA(乙二胺四乙酸),
2% (W/V)PVPP(交联聚 乙烯 吡咯烷酮)和 4%
(WV)B一巯基乙醇]。剧烈震荡 1 rain后65~C温育
10 min。冷却至室温后加入等体积的氯仿/异戊醇
(24:1),混匀后于 11 000×g 4~C离心 15 min。取上
清液,加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),混
匀后于 11000×g4~C离心 15 min。取上清液,加人
2倍体积的无水乙醇和 1/10体积的3 mol/L醋酸钠
(pH 5.2),一80℃沉淀 1 h。取出后于 11 000×g
4~C离心 15 min。沉淀用 3 mol/L醋酸钠(pH 5.6)
淋洗后于 15 000×g 4"C离心 10 min。沉淀溶于
500 IL DEPC水中。继续再用氯仿/异戊醇抽提一
次。取上清液,加人2倍体积的乙醇和 1/10体积的
3 mol/L醋酸钠(pH 5.2),一80~C沉淀 1 h后离心,
用 70%乙醇洗涤沉淀并溶于 500 IL DEPC(焦碳酸
二乙酯)水中,然后再加入 2/3体积的8 mol/L氯化
锂溶液,4~C存放过夜。第 2天取出后 15 000×g
4℃离心 30 min。沉淀再用 70%乙醇洗 2次后溶于
DEPC水中,一80~C冰箱中保存,备用。
1.3 引物的设计与合成
引物的设计依据 6种植物的8条 HIGRs保守
序列设计(Genbank中的序列号为:CAU72145、CM—
CHMGCOAR、 AB021862、 ATHHMG1、 AY352338、
AF429388、1AU43711)。上游引物序列为:5’一GG
[G/C/T]GATGC[A/T/C]ATGGGf G/A]ATGAA
[C/T]ATG,下游引物序列为:5’一AC[A/T/C]GT
[A/C/G]CC[A/C]ACCTCAATNGA f A/T/G]
GGCAT-3’。由北京奥科生物技术有限公司合成。
1.4 eDNA克隆及序列分析
以大戟总 RNA为模板,用 RACE试剂盒(Clon—
teeh)并按试剂盒操作步骤反转录合成 5’RACE
eDNA,以合成的5’RACE eDNA为模板,用两个上
下游引物进行 PCR扩增。PCR扩增体系为:5O L
体系中含2 ILL5’RACE eDNA,兼并引物各25 pmol,
dNTPs 10 t~rnol,Ex PCR bufer 5 ILL.Ex Taq Polyme—
mse 5U。PCR反应条件为 94℃ 3 min,1个循环;
94℃ 1 min,60cI=1 min,72oC 2 min,35个循环;72℃
10 min,1个循环。用 1%琼脂糖电泳分离 PCR产
物,回收目的条带并纯化,pGEN.T Easy载体连接,
转化 DH5ot大肠杆菌。在 LB/AMP/IPTG/x—Gal平
板上筛选阳性克隆,然后随机挑选经 PCR和EcoR I
酶切确认的重组质粒并测序,测序工作由北京奥科
生物技术有限公司完成。将所测定的序列结果通过
BLASTP或 BLASTX搜索 National Center for Biotech—
nology Information(NCBI)的核苷酸和蛋白质数据
库,将所测序列通过 Dnarnan软件翻译成氨基酸序
列并寻找最大读码框,用Prosite软件在线分析该蛋
白质的基本结构域,并通过 ClustalX分析软件与其
它植物 hrngr的氨基酸序列进行多重比较,用 IEGA
方法构建系统进化树。
2 结果与分析
2.1 RNA提取
大戟总 RNA的甲醛变性凝胶的电泳结果见图
1,从图1中可以清晰地看出 rRNA的2条条带(18S
rRNA、28S rRNA),其中28S rRNA条带的亮度大约
为 18S rRNA的2倍,说明总 RNA有良好的完整性。
在紫外分光光度计上测得吸光值,A猢/A 舳比值为
1.996,说明所提取的 RNA质量较好,酚类、蛋白质
和无机盐等杂质已基本排除。此 RNA提取方法适
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126 武 汉 植 物 学 研 究 第25卷
Picrorhiza kurrooa(植物)ABC74565
Andrographis paniculata(植物)AAPI4352
Eucommia ulmoides(植物)AAV5405 l
Morus alba(植物)AAD03789
Nicotiana tabacum (植物)AAL54878
Cucumis melo(植物)BAA3629l
Hevea brasiliensis(植物)BAA3629l
Arabidopsis thaliana(植物)AAG51957
Euphorbiapekinensi(植物)
Dendroctonusjefreyi(昆虫)AFI59136
/ps pini(昆虫)AAL0935l
B.germanica(昆虫 )BGHMGCOA
Tribolium caslaneum (昆虫 )XP 973160
Xenopus laevis(动物)XELHMGCOA
Dicentrarchus labrax(动物)AAR02862
Sus scrofa(动物)ABD96089
Mesocricetus auratus(动物)CAA25l89
Saccharomyces cerevisiae(真菌)AAB67527
Penicilium citrinum (真菌)BAC20567
Aspergilus fumigatus(真菌)CAE47850
图 4 20个物种 HMGR蛋白在进化上的关系
Fig.4 Phylogentie relationship among HMGR proteins in 20 diferent species
杆细胞中组胺释放的抑制率为 87.3%,对拟巨噬细
胞株 RAW264.7中 NO产生的抑制率为 50.7%。
除此之外对大戟的萜类化学成分及活性成分的研究
几乎未见报道。对大戟萜类化合物的生物合成及其
分子调控更是知之甚少。
近每一,研究发现 HMGR是甲羟戊酸途径中的
一 个关键酶。3一羟基-3一甲基戊二酸单酰辅酶 A在
HMGR的作用下生成甲羟戊酸(MVA)。由于该反
应是一个不可逆过程,因此 HMGR被认为是该合成
途径中第一个最关键的限速酶【1¨。HMGR对细胞
质中萜类物质的代谢起重要调控作用,作为早期酶
类 ,它决定“碳流”的流向。利用转基因技术将 hmgr
基因导人目标植物来提高有效成分的含量有许多成
功的报道 引。本文实验结果首次成功地从大戟中
扩增出甲羟戊酸途径的关键酶基因 hmgr,通过同源
性比较、保守性区域比较以及蛋白特征性位点分析,
发现与前人所报道的 HMGR蛋白特性非常相似,因
此可以推断克隆得到的片段就是药用植物大戟
HMGR的 eDNA片段。为从大戟中克隆 HMGR的
全长基因进而通过基因工程手段提高大戟中的萜类
化合物的研究和应用作了必要的前期准备。
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