免费文献传递   相关文献

Isolation and identification of fungal endophytes from Ophiopogon japonicus and their antimicrobial activities

川麦冬内生真菌分离和鉴定及抑菌活性初步研究



全 文 :中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 8 期 2016 年 4 月

• 1382 •
川麦冬内生真菌分离和鉴定及抑菌活性初步研究
刘 雷 1,潘 峰 2,杨远兵 1,姜立春 1,邓 伶 1,邓 珍 1,刘 群 1
1. 绵阳师范学院生命科学与技术学院,四川 绵阳 621000
2. 四川农业大学农学院,四川 温江 611130
摘 要:目的 深入研究川麦冬内生真菌分布的多样性和特异性,并考察其抑菌活性。方法 分别对野生川麦冬和大田栽培
川麦冬的根部和叶部利用组织块法分别进行分离纯化,利用形态学和 ITS 序列聚类分析等分子生物学方法对所得内生真菌进
行鉴定,利用菌饼法对其抑菌活性进行初步研究。结果 从川麦冬中共分离得到 27 株内生真菌,其中野生麦冬内生真菌(22
株)明显较大田栽培麦冬内生真菌(5 株)丰富,根部内生真菌(17 株)明显较叶部内生真菌(10 株)丰富。此外镰刀菌
属和曲霉菌属为麦冬优势菌属,且镰刀菌属有根部专一定植特性,曲霉菌属却广泛分布于根部和叶部。同时,40%的麦冬内
生真菌对白色念珠菌具有抑制活性,对金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌和粪肠球菌抑制菌株较少。结论 川麦
冬具有丰富的内生真菌多样性,并且其内生真菌分布具有明显的环境和部位特异性。所分离的内生真菌具有一定的抑菌活性,
其中 H5、031p 和 H8 3 株菌表现出较强抑菌活性,值得进一步研究。
关键词:川麦冬;内生真菌;分离鉴定;镰刀菌属;曲霉菌属;抑菌活性
中图分类号:R282.5 文献标志码:A 文章编号:0253 - 2670(2016)08 - 1382 - 10
DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.08.023
Isolation and identification of fungal endophytes from Ophiopogon japonicus and
their antimicrobial activities
LIU Lei1, PAN Feng2, YANG Yuan-bing1, JIANG Li-chun1, DENG Ling1, DENG Zhen1, LIU Qun1
1. College of Life Science & Biotechnology, Mianyang Normol University, Mianyang 621000, China
2. College of Agriculture, Sichuan Agricultural University, Wenjiang 611130, China
Abstract: Objective To explore the resource diversity and specificity of fungal endophytes from the Ophiopogon japonicas and their
antimicrobial activities. Methods Fungal endophytes were isolated from roots and leaves of wild and cultivated O. japonicas by tissue
block method. Those fungal endophytes were identified by morphological methods and phylogenetic analysis of ITS sequences. And
the antimicrobial activities of those fungal endophytes were estimated by agar disk containing mycelium method. Results
Twenty-seven fungal endophytes strains were isolated from O. japonicas. There was more fungal endophytes diversity in wild plants
(22 strains) than cultivated plants (5 strains). Likewise, there was more fungal endophytes diversity in roots of O. japonicas (17 strains)
than the leaves (10 strains). And Fusarium and Aspergillus were the dominant genus in O. japonicas. The F. spp. fungal endophytes
only isolated from roots while A. spp. from both roots and leaves. In addition, 40% fungal endophytes displayed potent inhibition of
Moniliaalbican. Only one or two fungal endophytes strains showed obvious inhibition of Staphyloccocus aureus, Escherichia coli,
Pseudomonas aeruginosa and Enterococcus faecalis. Conclusion O. japonicas is rich in fungal endophytes and those fungi
distributed with relative specificity characteristics on environment and space. Those fungal endophytes display the antimicrobial activities,
especially stain H5, 031p, and H8 with potent inhibition activity are worthy of further research, development, and application.
Key words: Ophiopogon japonicas (L. f.) Ker-Gawl; fungal endophytes; isolation and identification; Fusarium; Pergillus; antimicrobial activity

植物内生真菌是指在植物体内定植,但不引起
植物明显病害的一类真菌[1]。内生真菌与宿主植物
具有非常复杂的关系,其能够产生激素促进植物生
长[2],也能够产生拒食素帮助宿主抵御生物取食[3],
还能够产生药用成分[4]以及众多具有生物活性的产
物[5-6]等。内生真菌分布广泛,种类丰富,而且众

收稿日期:2015-12-19
基金项目:四川省科技厅科技支撑计划项目(2016NZ0058);四川省教育厅重点科研项目(16ZA0323);四川省大学生创新创业训练计划项目
(201510639086)
作者简介:刘 雷(1980—),男,讲师,主要从事植物资源的评价与利用方面的研究。Tel: 13990177957 E-mail: 33020897@qq.com
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 8 期 2016 年 4 月

• 1383 •
多菌株能够产生各式各样的活性天然产物 [7]。据
统计在 2012 年前的几十年里,约一半新发现的真菌
天然产物来源于内生真菌[8],其中包括大量的具有
抗菌活性的天然化合物[5,9]。
川麦冬 Ophiopogon japonicus (L. f.) Ker-Gawl,又
称涪城麦冬、绵麦冬,为百合科沿阶草属植物麦冬,
是中国名贵传统中药材之一,已有 500 多年的种植历
史。它具有养阴润肺、清热除烦、益胃生津、凉血止
血等功效。2006 年,国家质检总局批准对涪城麦冬实
施地理标志产品保护。药用植物内生真菌目前研究的
重点是药用植物资源的充分利用,同时也是获取具有
重要研究价值菌株的基础[6,10]。目前程东庆等[11]观察
到麦冬根部存在丰富的菌丝,陈宜涛等[12]也对江浙地
区的麦冬根部内生真菌做了初步研究,Liang 等[13]对
重庆地区的麦冬内生真菌的抗菌活性进行研究,并发
现其提取物表现出良好的抗菌活性。但是四川地区作
为川麦冬的主产区,关于其内生真菌的研究却未见报
道,而且关于麦冬叶部内生真菌也未见报道。为此,
本实验收集了野生和大田栽培川麦冬,利用组织块法
对其根部和叶部的内生真菌进行了分离纯化,并结合
形态学和分子生物学手段,对所得内生真菌的分类地
位进行了鉴定,此外利用金黄色葡萄球菌、大肠埃希
菌、铜绿假单胞菌、粪肠球菌和白色念珠菌共 5 种病
原菌为指示剂,对其抗菌活性进行了初步研究,以期
明确川麦冬内生真菌分布的多样性和特异性,同时筛
选出具有良好抑菌活性的内生真菌,为进一步获得抗
菌活性成分奠定基础。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
1.1.1 供试植株 供试植株于2015年3月采自四川
省绵阳市三台县花园镇的野生型和大田栽培型川麦
冬全株。野生型的生长环境为土质疏松、肥沃、排
水良好的沙质土壤中,大田栽培型为本地农民长期
种植的川麦冬品种。所采样品经绵阳师范学院生命
科学与技术学院罗明华教授鉴定为百合科植物川麦
冬 Ophiopogon japonicus (L. f.) Ker-Gawl。
1.1.2 指示菌株 金黄色葡萄球菌 Staphyloccocus
aureus Rosenbach(革兰阳性菌),大肠埃希菌
Escherichia coli (Migula) Castellani & Chalmers(革
兰阴性短杆菌),铜绿假单胞菌 Pseudomonas
aeruginosa (Schroeter) Migula(革兰阴性杆菌),粪
肠 球 菌 Enterococcus faecalis Schleifer &
Kilpper-Bälz(革兰阳性菌),白色念珠菌 Candida
albicans (C. P. Robin) Berkhout(真菌)由四川农业
大学农学院提供。
1.1.3 试剂 DNA 提取试剂盒(Fungus DNA
Isolation Kit,Cat. No. LB1235)和 2×Pfu PCR 预混
液(2×Pfu PCR Mix,Cat. No. LB2003)购于成都
兰博生物科技有限公司。DNA-Marker 购于上海天
根生物公司。引物 ITS1(5’-TCCGTAGGTGAACC-
TGCGG-3’)和 ITS4(5’-TCCTCCGCTTATTGATA-
TGC-3’)由北京擎科新业生物技术有限公司合成。
其余试剂均为分析纯。
1.2 内生真菌分离纯化与保存
分别除去川麦冬的地下茎和地上部分,依次按
以下程序消毒:清水冲洗 3~4 次,75%乙醇漂洗
30 min,无菌水冲洗 3~5 次,0.1%升汞消毒 3~5
min,无菌水冲洗 5~8 次。用无菌刀片将材料切成 5
mm×5 mm 的小块贴于 PDA 培养基上,置 28 ℃恒
温箱中培养 5~7 d,并设置超净工作台空气对照,
并参考陈鹊所述“印三法”来检查消毒是否彻底[14]。
待植物组织周围长出菌丝后,挑少许菌丝到 PDA
平板上反复纯化 4~6 代,然后保存菌种。
1.3 内生真菌形态学鉴定
将菌丝接种于 PDA 培养基平板上左右各 1 个,
放入恒温培养箱培养(黄石市恒丰医疗器械有限公
司生产,型号 SKP-02B)至菌丝长出,再将灭菌的
盖玻片插入菌丝边缘,待菌丝爬上玻片约 2/5 处后,
用无菌镊子取出玻片,自然干燥后,放在干净的滴
有蒸馏水的载玻片上,利用数码双筒显微镜进行观
察,并记录形态特征。
1.4 内生真菌分子生物学鉴定
取川麦冬全株发酵后离心,取菌丝冷冻干燥。
取(80±5)mg 菌丝于 2 mL EP 管内按照 DNA 提
取试剂盒说明书的步骤采用 CTAB 法提取内生真菌
DNA。按照表 1 所示反应体系,以 ITS1 和 ITS4 进
表 1 PCR 反应体系
Table 1 PCR amplification system
物质名称 加入量/μL
2×Pfu PCR Mix 12.5
ITS1 0.5
ITS4 0.5
DNA 1.5
超纯水 10.0
总量 25.0
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 8 期 2016 年 4 月

• 1384 •
行 PCR 反应,95 ℃、5 min,95 ℃、45 s,52 ℃、
30 s,72 ℃、3 min,35 个循环,72 ℃、15 min 扩
增 ITS1-5.8S rDNA-ITS2 序列。对 PCR 反应产物利
用 1%的凝胶于 120 V 电泳 30 min,根据 Marker 判
断是否存在 400~800 bp 大小片段。对于成功扩增
目的片段的样品送交北京擎科新业生物技术有限公
司进行电泳切胶纯化测序。
1.5 内生真菌抑菌活性
1.5.1 制备菌悬液 将病原菌金黄色葡萄球菌、大肠
埃希菌、铜绿假单胞菌和粪肠球菌接种于牛肉膏蛋白
胨平板培养基上,白色念珠菌接种于 PDA 平板培养
基上,放入 35 ℃恒温培养箱培养,待其完全长出备
用。准备 6 个离心管(50 mL),其中 5 管中加入 10 mL
的生理盐水,另一管加入 9 mL 的生理盐水,放入灭
菌锅中灭菌 20 min 后,取出,待冷却备用。先将 4
种细菌接种到灭菌后的 10 mL 生理盐水的离心管中,
选择浓度为 0.1 CFU/mL,轻轻振荡,使其充分混匀。
将真菌病原菌(白色念珠菌)接种到 10 mL 生理盐水
的离心管中,轻轻振荡混匀,再用移液枪吸取 1 mL
转入到装有 9 mL 生理盐水中,浓度定为 0.01
CFU/mL,振荡混匀。将制备好的菌悬液涂布到 PDA
培养基的平板上,并用涂布棒涂布均匀。
1.5.2 抑菌测试 用无菌小试管,在长有内生菌菌
落的平板上,打孔 10 个,将打好的菌饼接种到涂有
病原菌的平板上,每个平板放 2 个菌饼。同时将氨
苄青霉素钠和硫酸链霉素分别配制成 1.0 mg/mL 和
1.5 mg/mL 溶液,取无菌培养基饼(大小和上述菌
饼相同)置于培养基中浸泡 24 h 后,作为阳性对照。
以无浸泡培养基菌饼作为阴性对照。每个处理重复
3 次,放入 28 ℃的恒温箱中培养,随时观察并记录
结果。将得到的抑菌圈,采用十字交叉法进行测定
抑菌圈直径大小,最后取 3 个平板的平均值作为最
后测量值。
2 结果与分析
2.1 麦冬内生真菌的分离
采用组织块法共分离得到 27 株内生真菌。从野
生型川麦冬中分离到 22 株内生真菌,其中来源于根
部的有 14 株,来源于叶部的有 8 株,分别为分离菌
株数量的 51.85%和 29.63%。从大田栽培川麦冬中得
到 5 株,其中来源于根部的有 3 株,来源于叶部的有
2 株,分别为分离菌株数量的 11.11%和 7.41%。可见
野生型川麦冬内生真菌明显高于大田栽培植株,而且
根部内生真菌的数量也明显多于叶部内生真菌,可见
内生真菌的分布受环境影响明显,并且具有组织偏
好。也说明不同环境下内生真菌丰富,在长期的接触
中,有更大概率侵入到植物体内,这与杨明俊等[15]
对水仙内生真菌的研究结果一致。此外,空白对照培
养基上未长出菌落,说明无环境污染,并且接触表面
消毒后材料表面的培养基上也无菌落长出,说明消毒
完全,表明所得菌株为来自植物体内真菌。
2.2 内生真菌的形态学研究
通过菌落形态和显微结构可以看出(表 2),麦
冬内生真菌在生长状态、菌落形态和显微结构上存
在较多差异,具有较为丰富的形态多样性,这也预
示着其分类地位存在差异,并具有一定的多样性。
而且产色素方面也存在较多差异,有产红色素、紫
表 2 麦冬内生真菌形态描述
Table 2 Morphology characteristics of fungal endophytes isolated from O. japonicas
编号 来源 菌落特征 显微形态特征
003/004 叶(野生) 气生菌丝,菌落初为白色,渐变为墨绿色,棉
絮状,3~4 d 完全长出
分生孢子梗从菌丝上垂直长出,顶端排列成扫帚状孢子穗,
分生孢子串生,无色,球形,菌丝体可见螺旋状
032b 叶(栽培) 气生菌丝,菌落边缘白色,基中间浅褐色,菌
丝直立生长且疏松,生长速度较快,2 d 完
全长出
菌丝无隔膜,较粗,内有较多分生孢子,孢囊梗略弯曲或
直立,菌丝可见带状折叠
037 根(栽培) 气生菌丝,起初为白色,后来菌落边缘白色,
中部墨绿色凸起,呈地毯状,质地絮状,4~
5 d 完全长出
无隔膜,分枝发达,分枝顶端有分生孢子串,呈链状分散
排列,孢囊梗直立或弯曲,有匍匐菌丝,主枝与侧枝呈
直角
031p 根(栽培) 气生菌丝,菌落淡紫色,气生菌丝绒毛状,3~
4 d 完全长出
菌丝较发达,分枝处略缢束,离此不远处形成隔膜,小型
分生孢子椭圆形或纺锤形
032a 叶(栽培) 气生菌丝,菌落背面为灰白色,正面颗粒状“小
黑点”呈蜘蛛网状,反面淡黄色,基内菌丝,
低矮,生长速度较快,2~3 d 完全长出
菌丝有隔膜,分生孢子梗顶端膨大成为顶囊,呈球形,胞
壁较厚,个别孢子呈暗红色,大多数为黑色,顶端孢子
囊可形成“孢子穗”
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 8 期 2016 年 4 月

• 1385 •
续表 2
编号 来源 菌落特征 显微形态特征
008 叶(野生) 营养菌丝,菌落开始为白色之后边缘及中心黑色,
其余白色,菌丝稀疏,絮状,正反面颜色一致,
生长较缓慢,5~6 d完全长出
无孢子囊,无接合孢子,有隔膜,锁状联合在菌丝横隔上方,以
菌丝和菌核的形成存在,菌核较小,菌丝体较细
031r 根(栽培)气生菌丝,正面菌丝为白色,反面为深红色,放射
状,菌丝疏松呈地毯状,3~4 d完全长出
主枝与侧枝成锐角,有横隔,分生孢子呈梭性
029 根(野生) 气生菌丝,菌落粉红色,菌丝疏松,3~4 d完全
长出
有横隔,假菌丝,横隔上有锁状联合,分生芽孢子较突出
011 叶(野生) 起初菌落边缘白色,中间军绿色,最后正面整个菌
落为绿色,反面为黑墨色,菌丝呈地毯状,2~3
d完全长出
横隔明显,呈竹节状,假二叉分枝,孢子囊球形或近球形,有分
枝的分生孢子梗,孢子囊簇生
001 叶(野生) 营养菌丝,菌落边缘白色轮文,中部凸起,正面绿
色,局部生长缓慢,背面浅棕色,4~5 d完全
长出
菌丝较细,分枝发达,有隔膜,侧生顶端孢子囊球形,菌丝分枝
繁茂,孢囊梗侧生分枝上产生多个无囊轴小型孢子囊,菌丝可
见瘤状突起,分生孢子为球形或近球形
022 叶(野生) 营养菌丝,菌落初白色,渐变为军绿色,地毯状,
3~4 d完全长出
菌丝体较粗壮,孢囊梗长,直立,侧枝顶端孢子囊球形,匍匐菌
丝发达,隔膜较少,主枝有隔,分枝无隔
033 根(野生) 营养菌丝,菌落墨绿色,棉絮状,3~4 d完全长出 孢子簇生成孢子囊,有隔膜,分枝呈链状或螺旋状,有囊托,孢
子囊单生
M1 根(野生) 气生菌丝,反面灰白色,菌丝疏松发达,呈蜘蛛网
状,生长速度较快,2 d完全长出
孢子囊有喙状,哑铃状等,游动孢子卵圆形,孢囊梗发达,菌丝
较粗,无隔膜,无分枝,相互缠绕
J7 根(野生) 气生菌丝,正面白色,反面淡紫色,菌丝疏松,呈
柔毛状向四周放射,3 d完全长出
菌丝竹节状,有隔膜,分生孢子单生或成链,分枝与主枝成锐角,
分生孢子梗对生或单生
Z9 叶(野生) 菌落背面为灰白色,正面颗粒状“小黑点”呈蜘蛛
网状,反面淡黄色,基内菌丝,低矮,2 d完全
长出
菌丝有隔,孢子串生,或贴梗生长,孢子无色,球形
H1/H14 根(野生) 气生菌丝致密,呈毛毡状状,浅而疏松,正反面淡
黄色,3 d完全长出
大型分生孢子弯曲似镰刀形,多核,菌丝有隔膜,无孢子囊,小
型分生孢子为不对称的拟纺锤形,有厚垣孢子
H19/H18 根(野生) 菌丝疏松繁密,正反面白色,反面基质略点淡黄色,
呈放射状生长,3~4 d完全长出
游动孢子单生,卵圆形或卵圆形,菌丝较细,无隔膜,有接合孢
子、厚垣孢子
H2 叶(野生) 正面绿色,背面青绿色,边缘为白色,气生菌丝絮
状,3~4 d完全长出
菌丝有隔膜,分生孢子穗圆筒形,部分孢子呈浅绿色,仅上半部
产生孢子,顶囊烧瓶状
H9 根(野生) 正面深绿色,背面青绿色,有一层绿色孢子粉,气
生菌丝棉絮状,3~4 d完全长出
菌丝有隔膜,分生孢子穗圆筒形,生孢子无色或浅绿色,仅上半
部产生孢子,顶囊烧瓶状
H5 根(野生) 正面和反面起初均为橘黄色,后来背面变为棕黄
色,菌丝为毛毡状,浓密,3~4 d完全长出
无孢子囊,菌丝平滑较粗,有隔,竹节状,分枝顶端膨大或呈乳
头状突起,可见结合孢子
H15 根(野生) 营养菌丝匍匐生长,正面白色,棉絮状,反面带淡
黄色,3~4 d完全长出
菌丝有隔,无孢子囊,有结合孢子和孢子,侧枝可见分生芽孢子
或分生节孢子,小型分生孢子呈纺锤形
H12 根(野生) 营养菌丝匍匐,略带浅黄色,棉絮状,气生菌丝白
色,3~4 d完全长出
游动孢子卵圆形无色,或椭圆形,有的有隔膜或无,菌丝分枝旺
盛,可见芽孢子和厚垣孢子
H7 根(野生) 营养菌丝或气生菌丝,菌丝蔓延生长,正反面白色,
疏松,棉絮状,3~4 d完全长出
横隔发达,侧生芽孢子,或节孢子,顶生孢子,圆形或球形
H8 根(野生) 正反面均为白色,菌丝疏松呈棉絮状,基质略带淡
黄色,3~4 d完全长出
分生孢子椭圆形或卵圆形,多核,有隔膜,较少,分生芽孢子球
形至卵形,无色,单细胞或呈链,存在顶生孢子

中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 8 期 2016 年 4 月

• 1386 •
色素、绿色素、黄色素等,而部分真菌仅为白色。
此外部分真菌未观察到孢子,既可能其为不产孢真
菌,也有可能与培养条件有关。
2.3 内生真菌分子生物学鉴定和聚类分析
2.3.1 ITS 序列 PCR 扩增 通过对川麦冬内生
真菌的 DNA 提取,PCR 扩增后对扩增产物进行
电泳检测可以发现,所有菌株均扩增出明亮的
450~700 bp 的目的条带,专一性较好(图 1),
表明所用的提取方法,PCR 反应体系和反应条件
均较合适。对目的条带进行纯化并测序,并将所
有序列在 NCBI 数据库中进行 BLAST 比对,并
将最高匹配度菌株列于表 3 中。并且将所有测序
序列提交到 NCBI 数据,其 NCBI 序列登录号如
表 3 所示。

图 1 利用 PCR 技术扩增出的麦冬内生真菌 ITS1-5.8 S rDNA-ITS2 片段凝胶电泳条带
Fig. 1 PCR amplification results of ITS1-5.8 S rDNA-ITS2 of fungal endophytes using ITS1 and ITS4 primers
表 3 与 NCBI 数据库中匹配度高的可培养内生真菌
Table 3 Culturable endophytic fungal closely matching to genbank sequences
菌株
编号 分离菌株来源
菌株基因
编号 NCBI 上匹配度最大菌株 匹配菌株来源 相似度/%
匹配菌株
NCBI 编号
037 根(栽培) KU321543 Aspergillus sydowii strain NRRL 254 美国辛辛那提 99 AY373869.1
031p 根(栽培) KU321541 Fusarium oxysporum isolate K9 中国哈尔滨 99 JF807396.1
031r 根(栽培) KU321542 Fusarium oxysporum isolate K9 中国哈尔滨 99 JF807396.1
029 根(野生) KU321544 Fusarium oxysporum strain FUS 印度新德里 99 HQ384394.1
033 根(野生) KU321545 Aspergillus fumigatus isolate LR7 中国南昌 99 KM520022.1
H1 根(野生) KU321546 Fusarium solani strain CS11785 中国北京 99 JX406517.1
H12 根(野生) KU321551 Fusarium sp. LD-11 中国哈尔滨 100 EU336986.1
H14 根(野生) KU321553 Fusarium solani strain WS11793 中国北京 99 JX406509.1
H15 根(野生) KU321552 Fusarium chlamydosporum strain C 瑞士纽沙特 99 KT634074.1
H18 根(野生) KU321554 Fusarium oxysporum strain FOCCB-1 中国长春 99 HQ451888.1
H19 根(野生) KU321555 Fusarium oxysporum isolate Fol-km 中国昆明 99 GU371875.1
H5 根(野生) KU321547 Fusarium chlamydosporum strain Sz5_2H 匈牙利塞格德 99 KJ584541.1
H7 根(野生) KU321548 Fusarium oxysporum isolate GIFUUHFA12 印度帕兰波 100 GQ121293.1
H8 根(野生) KU321549 Fusarium oxysporum strain GIFOZ-UHF 印度帕兰波 99 KJ938022.1
H9 根(野生) KU321550 Aspergillus fumigatus strain IHEM 19376 澳大利亚悉尼 99 KP131567.1
J7 根(野生) KU321556 Fusarium oxysporum isolate GIFUUHFA12 印度帕兰波 99 GQ121293.1
M1 根(野生) KU321557 Mucor circinelloides strain SX16 中国西安 99 KC329629.1
032a 叶(栽培) KU321558 Aspergillus flavus strain meijun3 中国北京 99 KR076750.1
032b 叶(栽培) KU321559 Mucor circinelloides strain KUC30062 韩国首尔 100 KT207745.1
001 叶(野生) KU321560 Aspergillus sp. HA11-KHI 巴基斯坦卡拉奇 99 KF964033.1
003 叶(野生) KU321561 Aspergillus fumigatus isolate LR7 中国南昌 99 KM520022.1
004 叶(野生) KU321562 Aspergillus fumigatus isolate LR7 中国南昌 99 KM520022.1
008 叶(野生) KU321563 Colletotrichum dracaenophilumisolate DMM 170 巴西 98 KJ396954.1
011 叶(野生) KU321564 Cladosporium sphaerospermum isolate PKU F16 中国深圳 99 KC113297.1
022 叶(野生) KU321565 Aspergillus fumigatus strain SX14 中国西安 99 KC329627.1
H2 叶(野生) KU321566 Aspergillus fumigatus isolate LR7 中国南昌 100 KM520022.1
Z9 叶(野生) KU321567 Aspergillus niger strain KQ7 中国贵阳 100 KJ639036.1

2 000 bp
1 000 bp
750 bp
500 bp
200 bp
100 bp

2 000 bp
1 000 bp
750 bp
500 bp
200 bp
100 bp

H7 H5 H1 H1 J7 H2 022 008 Marker 001 037 031p 031r Z9 032b H15
004 011 Marker 032a 033 003 Marker 029 H19 H18 H14 H12 H9 H8
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 8 期 2016 年 4 月

• 1387 •
2.3.2 聚类分析 将比对后获得的相似度最高且具有代
表性的 2~4 菌株序列与本研究所得序列一起利用
MEGA 5.1软件进行聚类分析,并用NJ法构建系统发育
树(图2~5)。由图2和图3比较可见,分离自栽培型内
生真菌不仅数量少,其种类相对单一,但是根部和叶部
来源的内生真菌均未有相同属的菌株。根部来源的菌株
031p和031r根据比对结果和聚类分析结果,同时参考形
态学特征被鉴定为尖孢镰刀菌Fusarium oxysporum;菌株
037被鉴定为聚多曲霉Aspergillus sydowii。分离自栽培型
叶部的内生真菌 032a,其 ITS 序列比对和聚类分析
结果并不完全一致,但是同为 Aspergillus 属,参考
形态特征也只能鉴定为聚多曲酶 Aspergillus sp.。而
菌株 032b 被鉴定为 Mucor circinelloides。

图 2 栽培川麦冬根部内生真菌 ITS 和 5.8 S rDNA 序列聚
类分析图 (NJ 法构建)
Fig. 2 NJanalysis of ITS and 5.8 S rDNA sequences of
fungal endophytes isolated from the roots of cultivated O.
japonicas

图 3 栽培川麦冬叶部内生真菌 ITS 和 5.8 S rDNA 序列聚
类分析图 (NJ 法构建)
Fig. 3 NJ analysis of ITS and 5.8 S rDNA sequences of
fungal endophytes isolated from leaves of cultivated O.
japonicas

图 4 野生麦冬根部内生真菌 ITS 和 5.8 S rDNA 序列聚类
分析图 (NJ 法构建)
Fig. 4 Neighbour-joining analysis of ITS and 5.8 S rDNA
sequences of fungal endophytes isolated from roots of wild O.
japonicas
Fusarium oxysporum striain(KF998987.1)
F. oxysporum strain(KJ540102.1)


F. oxysporum isolate(JX853767.1)


031p(KU321541)


037(KU321543)



F. oxysporum isolate(JF807396.1)


F. oxysporum isolate (GQ121293.1)



F. oxysporum strain(KJ938022.1)


F. oxysporum isolate(GQ121297.1)


031r(KU321542)



Aspergillus sydowii strain(AY373869.1)


A. sydowii isolate (EF652451.1)



A. sydowii strain(AM883157.1)


A. sydowii strain (AM883154.1)


A. sydowii strain(KP329840.1)

0.05
A.sydowii
F. oxysporui
Aspergillus niger strain (KJ173525.1)

A. niger strain(KT173525.1)


032a(KU321558)


A. niger strain(KJ639036.1)

A. niger strain(JN676125.1)

A. tubingensis strain(EF094824.1)


032b(KU321559)


Mucor circinelloides f . circinelloides isolate (JQ683248.1)

M. circinelloides strain(JQ683248.1)


M. circinelloides strain(KT207745.1)

0.05
A.sp.
M. circinelloides
Fusarium oxysporum strain(Q301898.1)
H8(KU321549)
H12(KU321551)
F. oxysporum isolate(HQ907948.1)
F. oxysporum isolate(KF941285.1)
F. oxysporum isolate (GQ121286.1)
H18(KU321554)
F. oxysporum isolate (GQ121299.1)
H19(KU321555)
F. oxysporum strain (HQ384394.1)
F. oxysporum strain (KJ938022.1)
F. oxysporum isolate (GQ121293.1)
H7(KU321548)
J7(KU321556)
029(KU321544)
F. chlamydosporum strain (KJ584541.1)
F. chlamydosporum isolate(FJ426391.1)
H5(KU321547)
H15(KU321552)
H1(KU321546)
F. solani strain(JX406517.1)
F. solani isolate (KM203607.1)
F. solani strain (KF887120.1)
H14(KU321553)
Aspergillus fumigatus strain (KP131566.1)
A. fumigatus isolate (JQ082499.1)
A. fumigatus isolate(gb JF815073.1)
033(KU321545)
H9(KU321550)
Mucor circinelloides strain(KC329629.1)
M1(KU321557)
M. circinelloides strain(JX241658.1)
M. circinelloides isolate (JQ683248.1)
0.05
A. fumigatus










A. niger




A. sp.




C. sphaerospermum




C. sp.


中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 8 期 2016 年 4 月

• 1388 •

图 5 野生川麦冬叶部内生真菌 ITS 和 5.8 S rDNA 序列聚
类分析图 (NJ 法构建)
Fig. 5 NJ analysis of ITS and 5.8 S rDNA sequences of
fungal endophytes isolated from leaves of wild Ophiopogon
japonicas
根据形态学特征、Blast 比对结果和聚类分析,
基本上可以将所有来源于野生川麦冬的内生真菌鉴
定到种(图 4、5),但是分离自野生川麦冬根部的
菌株 H5 和 H15,分离自野生川麦冬叶部的菌株 001
和 008 只鉴定到属(图 4、5)。由图 4 可见,野生
川麦冬根部内生真菌可以分为 5 个分类群,主要为
镰刀菌属 Fusarium ex Fr.、曲霉菌属 Aspergillus
Mich. ex Link: Fr. 和毛霉属 Mucor Fresenius,其中
以镰刀菌占比最大,可见镰刀菌属为其优势菌属,
镰刀菌菌株的数量占野生麦冬根部内生真菌的
78.57%,而占所有分离得到的菌株比例为 40.74%。
其次就是曲霉菌属,从野生川麦冬根部分离得到 2
株本属内生真菌。由图 5 可见,从野生川麦冬叶部
分离得到的内生真菌也分为 5 个分类群,主要为曲
霉属、炭疽菌属 Colletotrichum Cda. 和枝孢属
Cladosporium Link。其中以曲霉属占比最大,表明
曲霉属内生真菌为野生麦冬叶部的优势菌属。曲霉
属菌株的数量占野生麦冬叶部内生真菌的 75.00%,
而占所有分离得到的菌株比例为 22.22%。可见,根
部优势菌属与叶优势菌属并不一致,这可能是由根
与叶不同的周边环境及其组织特异性所致。就野生
麦冬整体内生真菌来说,镰刀菌所占比例最大,为
优势均属,而曲霉属其次。
就整体而言,麦冬具有较为丰富的内生真菌,
野生型无论是在种类还是在数量上都较大田栽培的
麦冬具有更为丰富的内生真菌。可见药用植物麦冬
的内生真菌分布同时受宿主植物、植物部位和环境
等多方面的因素影响。此外也可能是植物与环境长
期相互影响,在野生环境下受人为因素干扰较小,
而在栽培条件下,化肥和农药的使用都会影响内生
真菌的数量和分布。
2.4 川麦冬内生真菌抗菌活性
由表 4 可知,有 11 株菌对白色念珠菌具有抑菌
活性,占整个内生真菌数目的 40.74%。有 2 株菌对大
肠埃希菌具有明显抑菌活性,占整个内生真菌数目的
7.40%。分别有 1 株对金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞
菌和粪肠球菌具有明显抑菌活性,其均占 3.70%。此
外所有内生真菌均表现出只对单一指示菌具有明显
抑制作用,表现出明显的抑菌专一性。依据《中药药
理学》规定的抑菌能力判断标准:抑菌圈直径<10 mm
为低敏,10~14 mm 为中敏,15~19 mm 为高敏,>
20 mm 为极敏。可见在所有所得内生真菌中,H5、031p
和 H8 的抑菌圈均大于 20 mm,表现出相对较强的抑
制活性,值得进一步研究。
3 讨论
内生真菌广泛存在于植物体内,其种类和数量
与宿主植物种类、部位、生长状况,自然环境等密
切相关。其与植物长期共生,除受到植物的影响外,
在一定程度上也影响植物的生长发育,抗逆境胁迫,
与宿主形成互利互惠的共生关系[2,16-18]。大量研究表
明其存在广泛的生物多样性,作为重要的微生物资
源,不仅在生态学上,在医学,农业等方面具有重
要的价值[19]。程东庆等[11]通过对麦冬根部切片染色
观察的方法发现麦冬根部具有丰富的内生真菌菌丝
体。本实验中从野生和大田栽培的麦冬根和叶部位
分离得到 27 株内生真菌,在空间分布上不仅具有营
养部位特异性,而且还具有生长环境特异性。在野
生麦冬体内分布上无论是数量还是种类都明显较大
田栽培丰富,而且根部内生真菌数量也明显多于叶
部。杨明俊等[15]在研究水仙内生真菌时也发现水仙
根部内生真菌数量远多于其鳞茎,毕江涛等[20]研究
桃儿七内生真菌时也发现同样的规律。这可能有多
方面的原因,首先是野生环境受到生物或非生物胁
迫相对较多,内生真菌具有帮助宿主抵御逆境胁迫
Aspergillus fumigatus strain (KM207771.1)
A. fumigatus isolate (KM520022.1)
A. fumigatus strain(KJ939430.1)
A. fumigatus isolate(AB976024.1)
A. fumigatus isolate(KF638652.1)
A. fumigatus strain(KC119200.1)
A. fumigatus strain (JX092088.1)
A. fumigatus isolate (JQ082499.1)
A. fumigatus strain (HQ285554.1)
022(KU321565)
004(KU321562)
003(KU321562)
H2(KU321562)
A. niger isolate(JN227039.1)
A. niger strain(KJ639036.1)
Z9(KU321567)
A. sp.(HM535364.1)
A. sp. (JQ717323.1)
A. sydowii isolate(KC795923.1)
001KU321560)
C. sphaerospermum isolate (KC113297.1)
C. sp. (KC790536.1)
C. sp. HDN13-337 isolate (KC790536.1)
011(KU321564)
008(KU321563)
C. dracaenophilum isolate (KJ396954.1)
C. dracaenophilum strain (DQ286211.1)
0.05
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 8 期 2016 年 4 月

• 1389 •
表 4 麦冬内生真菌对金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、粪肠球菌和白色念珠菌的抗菌活性
Table 4 Antimicrobial activity of fungal endophytes isolated from O. japonicas against Staphyloccocus aureus, Escherichia coli,
Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis, and Moniliaalbican
抑菌圈直径/mm
内生真菌编号
金黄色葡萄球菌 大肠埃希菌 铜绿假单胞菌 粪肠球菌 白色念珠菌
32b 无 无 无 无 无
H9 无 无 无 无 18.2±0.2
H18 无 无 无 无 16.8±0.4
M1 无 无 无 无 无
H19 无 无 无 无 16.5±0.6
H2 无 无 无 无 16.1±0.7
033 无 无 无 无 19.0±0.3
H5 34.2±0.1 无 无 无 无
031p 无 无 42.0±0.7 无 无
022 无 无 无 无 无
Z9 无 无 无 无 无
H8 无 无 无 无 23.0±0.7
H14 无 无 无 无 无
J7 无 无 无 无 17.5±0.4
H1 无 无 无 无 无
32a 无 无 无 无 无
003 无 无 无 无 18.5±0.3
004 无 无 无 无 18.3±0.4
H12 无 无 无 无 16.7±1.5
029 无 无 无 无 无
011 无 无 无 无 无
037 无 无 无 无 11.8±0.5
008 无 12.3±0.5 无 无 无
031r 无 18.5±0.5 无 无 无
001 无 无 无 14.0±0.2 无
H15 无 无 无 无 无
H7 无 无 无 无 无
硫酸链霉素 — 17.2±0.6 35.0±0.8 — —
氨苄青霉素钠 33.6±0.78 — — 0.0±0.0 —
阴性对照 0.0±0.0 0.0±0.0 0.0±0.0 0.0±0.0 0.0±0.0
“—”未获取相应数据
“—” unknown the corresponding data
的能力,那些具有丰富内生真菌的植株更易生活下
去[21-22]。其次就是在野生环境条件下,其生态群落
相对复杂,环境真菌多样性更为丰富,且受人为影
响较少(如施用农药),在长期植物与环境、植物
与植物间的相互作用必然影响植物内环境[23-24],
从而导致野生麦冬较大田栽培麦冬内生真菌更为丰
富,同时也导致根部较叶部内生真菌内生真菌更为
丰富。另一方面,镰刀菌属和曲霉菌属内生真菌为
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 8 期 2016 年 4 月

• 1390 •
麦冬内生真菌的优势菌株在大田和野生麦冬中均
有获得,但是镰刀菌属内生真菌均只在麦冬的根
部获得,而曲霉菌属在根部和叶部均有获得。可
见不同种类内生真菌在麦冬不同部位分布具有一
定特异性。陈宜涛等[12]曾从麦冬根部内生真菌中
随机选出 4 株进行鉴定发现,其均为镰刀菌,进
一步印证镰刀菌为麦冬根部的优势菌群。这也进
一步印证了内生真菌的类群具有组织特异性和分
布广泛性[25-27]。
Liang 等[13]研究表明麦冬内生真菌对金黄色
酿脓葡萄球菌 Staphylococcus aureus 和新型隐球
菌 Cryptococcus neoformans 具有良好的抑制活
性,但是对大肠杆菌没有抑制作用。本研究利用
5 种病原菌作为指示菌研究显示,尽管均有对 5
种病原菌具有抑制活性的菌株存在,但是对大肠
埃希菌、铜绿假单胞菌和粪肠球菌抑制的菌株数
量极少,而对白色念珠菌具有抑制活性的菌株相
对较多,占整个菌株数的 40.74%。一方面表明麦
冬内生真菌对如大肠埃希菌等普遍抑制活性较
低,也表明内生真菌的抑菌谱也具有专一性,且
后续研究选择更多供试病原菌种类进行抑菌试验
研究,将更有利于了解麦冬内生真菌抗菌活性特
点。麦冬内生真菌作为麦冬植物内部重要的微生
物资源,具有丰富的多样性,而且也具有良好的
抑菌活性。其中菌株 H5、031p 和 H8 具有很强的
抑菌活性,具有从中挖掘较强抗菌活性成分的潜
力,这也是进一步工作的重点之一。
参考文献
[1] 郭良栋 . 内生真菌研究进展 [J]. 菌物系统 , 2001,
20(1): 148-152.
[2] Khan A L, Hamayun M, Kang S, et al. Endophytic fungal
association via gibberellins and indole acetic acid can
improve plant growth under abiotic stress: an example of
Paecilomyces formosus LHL10 [J]. BMC Micro, 2012,
doi: 10.1186/1471-2180-12-3.
[3] 李春杰, 南志标, 张昌吉, 等. 醉马草内生真菌对家兔
的影响 [J]. 中国农业科技导报, 2009, 11(2): 84-90.
[4] Pan F, Su X, Hu B, et al. Fusarium redolens 6WBY3, an
endophytic fungus isolated from Fritillaria unibracteata var.
wabuensis, produces peimisine and imperialine-3β-D-glucoside
[J]. Fitoterapia, 2015, 103: 213-221.
[5] Mousa W K, Raizada M N. The diversity of anti-microbial
secondary metabolites produced by fungal endophytes: an
interdisciplinary perspective [J]. Front Microbiol, 2013,
doi:10.3389/fmicb.2013.00065.
[6] Wiyakrutta S, Sriubolmas N, Panphut W, et al.
Endophytic fungi with anti-microbial, anti-cancer and
anti-malarial activities isolated from Thai medicinal
plants [J]. World J Micro Biot, 2004, 20(3): 265-272.
[7] Kumar S, Kaushik N. Metabolites of endophytic fungi as
novel source of biofungicide: a review [J]. Phyto Rev,
2012, 11(4): 507-522.
[8] Bérdy J. Thoughts and facts about antibiotics: where we
are now and where we are heading [J]. J Antibioti, 2012,
65(8): 385-395.
[9] Stierle A A, Stierle D B. Bioactive secondary metabolites
produced by the fungal endophytes of conifers [J]. Nat prod
communicat, 2015, 10(10): 1671-1682.
[10] Xiang L, Gong S, Yang L, et al. Biocontrol potential of
endophytic fungi in medicinal plants from Wuhan
Botanical Garden in China [J]. Biol Control, 2016, 94:
47-55.
[11] 程东庆, 余志仁, 潘佩蕾, 等. 麦冬内生真菌与麦冬生
长周期 [J]. 中药材, 2006, 29(3): 205-206.
[12] 陈宜涛, 丁立孝, 程东庆, 等. 麦冬内生真菌镰刀菌的
分离鉴定 [J]. 莱阳农学院学报, 2006, 23(1): 13-16.
[13] Liang H, Xing Y, Chen J, et al. Antimicrobial activities of
endophytic fungi isolated from Ophiopogon japonicus
(Liliaceae) [J]. BMC Compl Alter Med, 2012, 12(1): 1-6.
[14] 陈 鹊. 川贝母内生真菌及其次生代谢产物的研究
[D]. 成都: 四川农业大学农学院, 2012.
[15] 杨明俊, 李 娟, 王永刚, 等. 水仙内生真菌的分离鉴
定及聚类分析 [J]. 中草药, 2014, 45(11): 1625-1630.
[16] Zhang H W, Song Y C, Tan R X. Biology and chemistry
of endophytes [J]. Nat Prod Reports, 2006, 23(5):
753-771.
[17] Rodriguez R J, White Jr J F, Arnold A E, et al. Fungal
endophytes: diversity and functional roles [J]. New
Phytol, 2009, 182(2): 314-330.
[18] Shoresh M, Harman G E, Mastouri F. Induced systemic
resistance and plant responses to fungal biocontrol agents
[J]. Ann Rev Phyto, 2010, 48: 21-43.
[19] 文才艺, 吴元华, 田秀玲. 植物内生菌研究进展及其存
在的问题 [J]. 生态学杂志, 2004, 23(2): 86-91.
[20] 毕江涛, 何 萍, 吕 雯, 等. 桃儿七内生真菌分离及
其抑菌活性初步研究 [J]. 中草药 , 2013, 44(12):
1667-1672.
[21] Khan A L, Hussain J, Al-Harrasi A, et al. Endophytic
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 8 期 2016 年 4 月

• 1391 •
fungi: resource for gibberellins and crop abiotic stress
resistance [J]. Criti Rev Biotechnol, 2013, 35(1): 62-74.
[22] Rodriguez R, Redman R. More than 400 million years of
evolution and some plants still cant make it on their own:
plant stress tolerance via fungal symbiosis [J]. J Exper
Bot, 2008, 59(5): 1109-1114.
[23] 杜 峰, 梁宗锁, 胡莉娟. 植物竞争研究综述 3 [J]. 生
态学杂志, 2004, 23(4): 157-163.
[24] 孔垂华, 徐 涛, 胡 飞, 等. 环境胁迫下植物的化感
作用及其诱导机制 [J]. 生态学报 , 2000, 20(5):
849-854.
[25] 王 涛, 游 玲, 崔晓龙, 等. 四川宜宾三种乔木内生
真菌的多样性 [J]. 微生物学通报 , 2009, 36(3):
339-344.
[26] Dong Y, Iniguez A L, Ahmer B M, et al. Kinetics and
strain specificity of rhizosphere and endophytic
colonization by enteric bacteria on seedlings of Medicago
sativa and Medicago truncatula [J]. Appl Environ Micro,
2003, 69(3): 1783-1790.
[27] 俞晓平, 陈列忠, 申屠旭萍. 植物内生菌及其代谢物在
生物农药创制中的应用 [J]. 浙江农业学报 , 2006,
18(5): 289- 293.