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RAPD Analysis of genetic diversity of Notopterygium incisum in Sichuan

川产羌活种质遗传多样性的RAPD分析



全 文 :中草菊 ChineseTraditionalandHerbalDrugs第39卷第9期2008年9月·1387·
·药材与资源·
川产羌活种质遗传多样性的RAPD分析
唐学芳1,蒋舜媛¨,孙辉1,陈铁柱2,周毅2,马小军3
(1.四川大学环境科学与工程系,四川I成都610065,2.四川省中医药科学院,四川成都610041,
3.中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所,北京100094)
摘要:目的 考察羌活Notopterygiuminc sum的遗传特征,探讨不同产地且有形态变异的羌活种质资源的遗传
多样性、遗传分化及与环境因子的相关性。方法用RAPD方法选择15个随机引物对四JII西部4个居群33株个体
叶片DNA进行扩增,从个体间遗传关系及居群间遗传分化方面对羌活的遗传结构进行分析。结果RAPD共检测
到185条谱带,其中128个位点为多态位点,多态性百分率为69.19%,Nei’s基因多样性为0.2237,Shannon’s信息
指数为0.3375;壤塘和九龙居群聚为一类,理县和泸定居群聚为一类;茎秆颜色花纹性状与遗传差异间未表现明显
相关性,不同性状的羌活个体仍主要按居群,即产地来源聚类;羌活居群内和居群间的变异分别占总变异的
74.67%和25.33%;羌活居群问的遗传距离与地理距离问没有明显相关性(r=一0.1105,P=0.585),羌活4个居
群遗传多样性大小与年均温负相关,未达到显著水平(r--一0.771,P=0.229);与年均降雨量正相关.但相关不显
著(r一0.291,尸一0.709)。结论本研究表明羌活遗传多样性水平较高;羌活的遗传变异主要分布在居群内,但居
群间已形成一定的遗传分化;壤塘和九龙羌活个体间的遗传距离较小,各自遗传背景较为相似。产地差异对遗传变
异的影响大于因其茎秆颜色花纹不同所造成的影响。
关键词:羌活;RAPD}遗传多样性;环境因子
中图分类号:R282.7 文献标识码:A 文章编号:0253—2670(2008)09—1387—06
RAPDAnalysisofgeneticd versityofNotopterygiuminc suminSichuan
TANGXue—fan91,JIANGShun—yuan2,SUNHuil,CHENTie—zhu2,ZHOUYi2,MAXiao—jun3
(1.DepartmentofEnvironmentalScienceandEngineering,SichuanUniversity,Chengdu610065,China;2.Sichuan
AcademyofTraditionalChineseMedicaineSci nces,Chengdu610041,China,3.InstituteofMedicinalPlant,
ChineseAcademyofMedicalSciencesandPekingUnionMedicalCo lege,Beijing100094,China)
Abstract:ObjectiveNotopt rygiumincisumisanendangeredspeciesendemictoChinaandisoneof
theChineseandTibetanraditionalmedicinalpl nts.Thegeneticd versityofgermplasmresourceswith
morphologicalvariationofN.incisumfromdifferenthabitatswainvestigatedusingRAPDmarkersand
therelationofgeneticd fferentiationothe nvironmentalfactorswasalsoanalyzed.MethodsThirty-
threesamplesoffourpopulationscollectedfromLuding(LD),Jiulong(JL),Lixian(LX),andRangtang
(RT)inwestSiehuanwereDNAamplifiedw th15randomprimersselectedbyRAPDmethod.Results
Fifteenrandomprimersdetected185sitesofwhich128werepolymorphic.Thepercentagepolymorphic
loci(PPB)was69.19%,Nei7Sgenediversity(^)was0.2237,andShannon
7
Si formationindex(日)
was0.3375atthespeciesl vel.TheRTandJLforacategory,LXandLDwereclusteredtogether.
ThereiSnoobviouscorrelationbetweenthestemcharacterandthegeneticd versity.N.incisumw th
differentcharactersiSoneclusteraccordingtothedifferentorigin.Nestedanalysishowedvariations
withinpopulationsandamongpopulationsofN.incisumwere74.67%and25.33%.Nei
7
sunbiased
geneticd stancematrixcomparedwithacorrespondinggeographicdistancematrixshowedthetwomatrices
werenotsignificantlyorrelated(r=一0.1105,P=0.585>0.05).Thenegativecorrelationbetween
thegeneticd versityandtheaveragennualtemperaturewasnotuptosignificantlevels atistically(,.=
收稿日期:2007-12—10
基金项目:国家科技基础条件平台项目。药用植物种质资源标准化整理、整合及共享试点”(2005DKA2l004)I国家环保总局“中国重点药
用生物资源调查”项目资助
作者简介:唐学芳(198l一),女,四川雅安人,四川I大学2005级硕士研究生,从事环境生态和种质资源研究.
E—mail:tangxuefangl23@163.corn
-通讯作者蒋舜嫒Tell(028)66816644E—mail:jsy007@rip.sirra.com
万方数据
·1388· 中草菊ChineseTraditionalandHerbalDrugs第39卷第9期2008年9月
一0.771,P=0.229);Thepositivecorrelationbetweeng eticd versityandtheaveragennualrainfall
wasrelated。butnotsignificantlyorrelated(,.=0.291,P=0.709).ConclusionTheprimaryresult
showedthatN.incisumpopulationsarecharacterizedbyhighgeneticdiversity.Thoughthereare
obviouslygeneticvariationsbetweenpopulations,geneticvariabilityprincipallyexistedwithin
populations.GeneticdistancesamongtheindividualsofRTandJLwithsimilargeneticbackgroundare
verysmall.Theinfluenceofhabitatwhereitgrowsonitsgeneticd versityisgreaterhantheinfluence
causedbythedifferencecolourandfigureofitstem.
Keywords:NotopterygiumincisumTingexH.T.Chang;RAPD;geneticdiv rsity;environmental
factorS
羌活NotopterygiumincisTingexH.T.
Chang为伞形科羌活属多年生草本植物,我国特有
种[1’2],分布于川西高山峡谷和川西北高原、青海东
南部、甘肃南部及西藏东南部等区域,生长在海拔
2500~4000m的林缘、林窗、疏林、沟谷草丛和灌
丛下,以海拔3000~3700m较集中,生长环境土壤
有机质量较高,一般有枯枝落叶层和深厚腐殖质层,
通透性良好,土质较疏松[3]。羌活是常用中药羌活基
源植物之一,以干燥根茎和根入药,具散寒祛风、除
湿止痛之功效,用于风寒感冒头痛、风湿麻痹、肩背
酸痛等症H]。由于长期依赖采挖,野生资源及其生境
速的分子标记技术,近年来广泛应用于植物自然群
体的遗传多样性研究[6】。先前几乎所有的相关文献
对羌活植物形态的描述均为茎秆(花茎)紫色,但笔
者在进行羌活种质资源收集整理中观察到相同生境
下,同时还存在花秆绿色,及绿色带紫纹的过渡性特
征且性状稳定。为此,本研究利用RAPD分子标记
技术,在进行川产羌活种质遗传多样性分析的同时,
探讨开花植株花茎颜色这一表现型与基因型之间的
关系,为良种选育与质量评价提供一定的遗传背景
参考。
1材料
破坏严重,传统道地产区资源已近枯竭,1987年即 2004和2006年在四川甘孜州泸定、九龙和阿坝
被国务院《中国野生药材资源保护管理条例》列为I 州的理县壤塘分单株采集羌活当年萌发的新鲜幼嫩
级保护物种,2005年又载人《中国物种红色名叶片,用硅胶快速干燥,编号备用,并按花茎颜色的
录》[5]。目前,羌活植物化学、药理、地理分布、形态 显著差异分为10个类群,见表1。居群LX和LD为
学、孢粉学、分类学、环境土壤学、核型和驯化栽培等 原产地根茎移栽收集在种质资源圃通过无性繁殖的
方面的研究比较多,但从DNA分子水平上对羌活群 植株,其余为野生居群,野生采样个体距离在1m以
体遗传结构、遗传分化及多样性等方面的研究,至今 上,以确保同一基因型不被重复采样。采样正值羌活
尚未见报道。RAPD分子标记技术作为一种简便快开花期,资源圃的植株物候期均早于野生居群。
表1羌活样品的来源
Table1 SourceofN.incisumpopulations
居群 来 源 地理位置 采集时间 年均温/℃ 年降水量/mm
LX 理县米亚罗 102。44’E 2006—07 儿.4 590
31。52’N
海拔3740m
LD 泸定县 102。12’E 2006—07 12.4 636
29。63’N
海拔3600m
JL 九龙县洪坝乡 101。53’E 2006—08 8.8 892
29。017N
海拔3200m
RT 壤塘县阿斯玛乡 101。07’E 2004—09 4.7 756
32。4l7N
海拔3379m
个体 茎颜色 性状类群
1~2 紫纹
3~4 绿色
5~6 紫色
7~9 紫色
10~11 绿色
12~16 紫色
17~20 绿色
21~23 紫纹
24~28 紫色
29~33 绿色
2方法
2.1 羌活基因组总DNA的提取:采用改良CTAB
法提取羌活基因组总DNAc7。。在研磨过程de/JnA适
量PVP,加入提取缓冲液(一CTAB)冰浴10min,7
000r/min、4℃离心10min,收集沉淀,加入提取液,
65℃恒温水浴30min,氯仿一异戊醇溶液抽提两次,
万方数据
中草菊 ChineseTraditionalandHerbalDrugs第39卷第9期2008年9月·1389·
纯化过程加入Rnase37℃温浴1h,加入1/2体积4
mol/LNaCI,获得的DNA溶于适量0.1XTE缓冲
液(10ng/vL),用0.8%琼脂糖凝胶电泳(0.5X
TBE)检测总DNA大小和完整性,用k-HindI
量浓度稀释至3~10ng//uL,4℃保存备用。
2.2 RAPD扩增:引物筛选出15个扩增良好、条带
清晰、稳定性和重复性好且相对较多条带的引物(由
上海生工生物工程技术服务有限公司合成)用于全
digest(TaKaRa)作为相对分子质量标记,将样品质部DNA样品的RAPD扩增(表2)。
表2 15个随机引物序列及扩增结果
Table2 Sequenceandamplificationof15ramdomprimers
反应在PTC一200ThermocyclerPCR仪(MJ
Research公司)上进行,重复一次。RAPD—PCR反
应体系经比较和优化确定为:20肛L体系中含10~
30ng模板DNA,20pL10×PCRbuffer(-M92+),
2.0mmol/LMgCl2,0.15mmol/LdNTPs,引物
0.05vmol/L,1UTaqDNA聚合酶。扩增程序:94
℃预变性4min,94℃变性45s,36℃退火30S,72
℃延伸2min,循环35次,72℃最后延伸5rain,4℃
保温,终止反应。扩增产物检测:PCR扩增产物用
1.4%的琼脂糖凝胶于4V/cm的电压下电泳,电泳
缓冲液为0.5XTBE或1×TAE,0.5vg//-L溴化乙
锭(EB)中染色30min,用DL2000和Markeri(清
华天为时代)作为标准相对分子量标记,在Gene
geniusBioimagingSystem凝胶成像系统
(SYNGENE)上拍照记录。
2.3数据分析
2.3.1RAPD多样性表型带计数:用DL2000和
Marker1做相对分子质量标记,对照反应产物在凝
胶上的位置,电泳图谱的每1条带记为1个位点,只
记录可辨认、两次扩增结果一致的条带。用“1”和
“O”记录同一位点的“有”和“无”,得到0/1矩阵输入
计算机。
2.3.2遗传结构分析:①用POPGENEVersion
1.32[8]软件对羌活居群进行遗传参数分析,分别计
算多态位点比率(PPB)、观测等位基因数(Ⅳ。)、有效
等位基因数(M)、总的基因多样度(日,)、居群内基
因多样度(H,)、Shannon多样性指数H(在物种水平
上为H彬在居群水平上为日砷,)、Nei7S基因多样性
指数(^)、Nei7s遗传分化系数[G。=(H;一E)/日。]
和基因流[以一(1一G。)/2G。]、Nei7s遗传距离(D)
和遗传相似性(J)。②个体间遗传关系分析:根据表
征矩阵,用SPSSl3.0软件计算各样品问的Jaccard
相似系数,然后使用Withingroupslinkage进行聚
类分析。③居群间遗传分化程度考察:由Shannon7s
居群分化系数[(日,,一日印,)/H,,]来估测居群间的
遗传变异;同时运用AMOVAprep1.01(Miller.
1998)[93对RAPD表型数据矩阵进行计算,得到表型
间的距离系数,组成WINAMOVA所需要的距离系
数(艿2)矩阵文件,即距离文件(.dis),用
WINAMOVAl55(Exeoffier.1993)[10]进行分子方
差分析(AMOVA),计算居群内和居群间的变异方
差分布,并利用Nei
7
s(1972)计算各居群间遗传距
离并按UPGMA聚类分析。
2.3.3 用TFPGA1.3(Miller.1997)[1妇软件的
Mantel检验(置换3000次)分析4个居群间的遗传
距离和地理距离的相关性。
2.3.4环境参数(年均温、年降水量)与遗传多样性
(Shannon7s多样性指数)相关性分析及显著性检验
用SPSSl3.0统计软件进行分析。
万方数据
·1390· 中草黄 ChineseTraditionalandHerbalDrugs第39卷第9期2008年9月
3结果与讨论 在居群水平上,各个居群的PPB相差不大
3.1羌活种内多态性水平:RAPD共检测到185条(40.54%~49.73%),平均多样性水平的多态条带
谱带,扩增片断长度介于300~2000bp,其中128个比率为45.oo%;各个居群的日为0.2307~O.2495,
为多态性位点,羌活多态性百分率PPB为69.19%,平均值H加,为0.2419,Shannon
7s信息指数显示各
H,p为0.3375,h为0.2237(表3)。各项多态性指标居群的遗传变异由高到低依次为:RT>LX>JL>
表明羌活的遗传多样性水平较高。图1为引物(S30)LD;Nei7s基因多样性指数的变化规律为:LX>
的扩增结果。本实验结果表明,利用RAPD标记检RT>JL>LD。LX和RT居群的基因多样性相对较
测到的羌活种质资源多态性水平,与其他濒危,狭 高,甘孜LD居群的遗传多样性最低(PPB=
域、特有种相比[12u5I,处于中等偏上水平。 40.54%,M=I.2769,^=0.1569,H_--0.2307)。
表3羌活遗传多样性统计
Table3 Patternsofgeneticd versityforN.incisum
LD 75 40.54 1.4076 1.2769 0.1569 0.2307
JL 87 47.03 1.4703 1.2849 0.1630 0.2426
RT 92 49.73 1.4973 1.2898 0.1663 0.2495
平均 83.3 45.00 1.4517 I.2862 0.1632 0.2419
物种水平 128 69.19 1.69I9 1.3814 0.2237 0.3375
M—DNA分子量标准(DL2000和MarkerI)图中1~33顺序与表1中个体编号顺序对应
M—DNAmarker(DL2000andMarkerI)No.1~33correspondingtoorderofindividualNo.inTable1
图1引物$30的扩增结果
Fig.1Amplifiedproductsofprimer$30from3Individuals
3.2 羌活居群间的遗传分化:在假设遗传平衡时,计 异的74.67%和25.33%,羌活遗传变异主要存在居
算出的遗传变异结果表明羌活居群间存在一定的遗传 群内(表4)。此结果略低于POPGENE的分析结果。
分化。4个羌活居群总的遗传多样性日。=o.2073,居 尽管3种方法分析的结果在数值上有差异,但
群内的遗传多样性H,=0.1625,居群间的遗传多样度 所揭示的羌活居群间遗传分化的趋势是一致的,都
(D。一日,一日,)为0.0448,Nei7S遗传分化系数G。= 表明遗传变异主要存在于居群内,居群内的遗传分
0.2158,表明有21.58%的变异来自居群间,78.42%化大于居群间的遗传分化。
的遗传变异存在于居群内。居群间基因流估计值(Ⅳ,) 3.3羌活个体和居群间的遗传关系:根据羌活个体
为1.8170,表明羌活居群之间的基因流水平较高。 表4羌活居群RAPD数据的分子变异嵌套分析
根据Shannon7S多样性指数的分析结果(物种
水平上H,,一0.3375,居群水平上H加p=0.2419)
(表3),计算出Shannon7s居群分化系数为0.2833,
即有28.33%的遗传变异存在于居群间,71.67%的
遗传变异存在于居群内部。此结果略低于
POPGENE的分析结果。
利用AMOVA软件,计算居群内和居群间的变
异方差。结果表明,居群内和居群间变异分别占总变
Table4 Nestedanalysisofmolecularvariance
forN.incisumbasedonRAPDdata
变异来源自由度方差和平均方差变异组分总变异百分率/% 尸
居群问 3 185-6861.89 5.70 25.33 <0.001
居群内 29 486.8716.79 16.79 74.67 <0.001
P值表示比观测值的变异大的概率,这个概宰是通过把居群中的样本经
过1000次随机丰|列改变计算得到的
P—valuesareprobabilitiesofhavingamoreextremevariancecomponent
thanobservedaluesalone,probabilitieswerecalculatedbyl 000random
permutationsof ndividualsacro spopulations
万方数据
中草菊ChineseTraditionalandHerbalDrugs第39卷第9期2008年9月·1391·
间的Jaccard相似系数,用Withingroupslinkage进
行聚类(图2),结果显示,RT居群除32号个体外,其
余9个羌活个体聚为一类;JL居群除22、23号个体,
其余10个羌活个体聚为一类,表明直接从野外采样
的壤塘和九龙羌活居群内部个体间的遗传距离较
小,遗传背景较为相似。LX和LD居群的多个个体
没有分别聚为一类,可能经长时间移栽到同一地方
后,其居群内个体发生了较大的遗传变异。虽然4个
居群羌活有紫秆、绿秆或紫纹的性状,但不同性状的
羌活类群仍主要按居群,即产地来源聚为一类。本实
验所用引物尚未能有效显示出茎秆颜色花纹性状与
遗传差异的相关性,类似的结果在川白芷的研究中
也有报道[16|。
Nu。2 j 12 1{ 挚 三
17
18
21
14
15
20
16
19
13
12
ll
8
22
23
32
9
lO
3
6
4
29
3I
30
26
24
27
28
25
33
l
2
7
6
图2基于Jaccard系数及组内均联法的羌活个体RAPD
扩增多态性聚类图
Fig.2RAPDDendrogramofamplification
polymorphismbasedonJaccard
coefficientofN.incisumIndividuals
bymethodwithingroupslinkage
羌活居群间的遗传距离(D)和遗传相似度(,)
见表5。泸定(LD)和理县(LX)的遗传相似度最高
(,=0.9143),遗传距离最近(D=0.0896);壤塘
(RT)和理县(LX)的遗传相似度较低(I=
0.889),遗传距离较远(D=0.1166)。4个居群的
遗传相似度相差不大且较高,平均为0.8994。表明
居群间遗传分化较小。
利用Nei7S计算各类群间遗传距离并按UPGMA
聚类的结果显示(图3),LX祝D两个居群的关系较近,
聚为一类,JL和RT居群聚为一类。但对羌活4个居群的
表5羌活4个居群的遗传距离和遗传相似度
Table5 Nei7Sgeneticd stance(belowdiagonal)
andgeneticidentity(abovediagonal)
amongfourpopulationsofN.incisum
0.150 0.100 0.050 0.000
图3羌活4居群Nei’S(1972)遗传距离的UPGMA聚类图
Fig.3UPGMADendrogrameforfourpopulations
ofN.incisumbasedonNei’S(1972)
geneticd stance
遗传距离和地理距离矩阵间的关系进行Mantel检验
的结果显示,居群间的遗传距离与地理距离之间没有
相关性(,.=一0.1105,P=0.585,3000次置换)。
3.4羌活遗传多样性与环境参数的相关性分析:基
于Shannon
7S信息指数的4个羌活居群的遗传多样
性与环境参数的相关性分析显示,居群遗传多样性
大小与年均温呈负相关,但未达到显著水平
(,.=一0.771,P=0.229);而与年均降雨量正相关,
相关性也不显著(r一0.291,P=0.709)。羌活的居
群遗传多样性与海拔、日照、积温以及植被、土壤类
型等其他生态环境参数之间是否具有相关性,尚待
进一步研究,以期为羌活种质资源的保护和引种选
育提供理论依据。
致谢:本实验工作得到了四川大学生命科学学
院孙群副教授的帮助。
参考文献:
E1]溥发鼎,王萍莉,郑中华,等,重订羌活属的分类[J].植物
分类学报,2000,38(5)t430—436.
[z]王幼平.溥发鼎,王萍莉,等.中国特有属一羌活属的系统
分类研究[J].云南植物研究,1996,18(4):424—430.
[3]蒋舜嫒,孙辉,黄雪菊,等.羌活和宽叶羌活的环境土壤
学研究[J].中草药,2005,36(6):917—921.
[43中国药典Is].一部.2005.
[53汪松,解焱.中国物种红色名录[M].第~卷.北京:高
等教育出版社,2004.
[6]汪小全,邹喻苹,张大明,等.RAPD应用于遗传多样性和
系统学研究中的问题[J].植物学报,1996,38(12);964.
962.
[73邹喻苹,葛颂,王晓东.系统与进化植物学中的分子标记

m


万方数据
.1392· 中草菊ChineseTraditionalandHerbalDrugs第39卷第9期2008年9月
E8]
[93
[103
[11]
、ehFCtYangRC.BoyleTBJ.dal.PoPGENEVersion
1.31.theUser一研endbSharewarefoPopulationGenetic
Analysis[M].Edmonton:MolecularBi logyandBiotechno-
logyCenter,UniversityofAlberta,1997.
MillerMP.AProgramforthePreparation毋AMOvA
InputFt£csfromDominant—markerRawDate[MJ.
Flagstaffl NorthernArizormUniversity,1998.
ExcoffierL.AnalysisofMolecularvariance(A^牝)1,A)
rM].Geneva:UniversityofGeneva,1993.
MiIlerMP.ToD如forP pulationGenetic$Analysis
(TFPGA)[M].Flagstaff:NorthernArizonaU ive sity,
1997.
[12]
[a33
043
[15]
[163
张颖娟,杨 持.中国特有种四合木种群遗传多样性的
RAPD分析[J].生态学报,2002,22(11):1917-1922.
刘登义,储 玲,杨月红,等.珍稀濒危植物天目木兰
(Magnoliaamoena)遗传多样性的RAPD分析[J].应用生态
学报,Z004,15(7):1139—1142.
苏何玲,唐绍清.濒危植物资源冷杉遗传多样性研究[刀.广
西植物,2004.24(5):414—417.
张志勇.李德铢.极度濒危植物五针白皮松的保护遗传学研
究[J].云南植物研究,2003,25(5):544-550.
马逾英,熊英,贾敏如。等.川自芷种质的RAPD遗传标
记研究[J].世界科学技术一中医药现代化,2004,6(2):76—
79.
采用ISSR分子标记进行草珊瑚8个种源的遗传多样性分析
倪开诚1,闵 芳1,郭卫东h,斯金平2,张真真1,李欢津p
(1.浙江师范大学化学与生命科学学院,浙江金华321004;2.浙江林学院,浙江临安311300)
摘要:目的研究草珊瑚的遗传多样性及不同种源之间的遗传关系,为保护种质资源莫定基础。方法采用ISSR
分子标记对8个种源共51个草珊瑚样品进行了DNA分子水平的分析评价,用Popgen32软件计算遗传多样性和遗
传距离,通过UPCMA法进行聚类分析。结果筛选出10条多态性ISSR引物用于草珊瑚不同样品的ISSR—PCR,检
测得到111个位点,其中106个为多态性位点,约占95.50%。草珊瑚不同种源间遗传距离在0.0347~0.1850。8个
种源总遗传多样性主要来自种源内遗传变异,种源间分化指数G。=0.3403。结论 8个草珊瑚种源大体可以分成
2大类群。且根据遗传距离与产地海拔高度的关系,可以将其划分为较高海拔类群(800~900m)、较低海拔类群
(250~300m)、中等海拔类群(600m)。
关键词:草珊瑚;ISSR;遗传多样性;聚类分析
中图分类号:R282.7 文献标识码:A 文章编号:0253—2670(2008)09—1392—05
Analysisongeneticd versityofSarcandraglabracollectedfromeightprovenance
basedonISSRmarkers
NIKai—chen91,MINFan91,GUOWei—don91,SIJin—pin92,ZHANGZhen-zhenl,LIHuan—jinl
(1.CollegeofChemistryandLifeScience,ZhejiangNormalU iversity,Jinhua321004,China
2.ZhejiangForestryUniversity,Lin’an,311300,China)
Abstract:ObjectiveSarcandraglabrais widely—usedChinesemedicinalherb,butthewild
germplasmresourcesweredecreasing.Inordertoprotectthegermplasmresources,thegeneticd versity
andgeneticrelationshipamongthevariousprovenancesshouldbeanalyzed.MethodsISSRMolecular
markerswereusedtoanalyzethgeneticd versityofS.glabracollectedfromeightprovenances.The
geneticdiversity,geneticdistan e,andclusteranalysiswereperformedbyPopgen32softwarend
UPCMAmethod.ResultsTenscreenedpolymorphicprimerswereusedinISSR—PCRand111bandswere
amplified,amongthemincluding106polymorphiebandsthatwereabout95.50%.Geneticdistanceof
eightdifferentprovenanceswerrangedfrom0.0347一O.1850.Theg neticd versityofS.glabramainly
camefromtheinteriorva iationofeveryprovenance,forG“=0.3403.ConclusionPr venancesofS.
glabracanbedividedintotwogroupsandbasedontherelationshipofgeneticd stanceandaltitude,the
provenancescanbediviededasfollows:correspondin91yhigheraltitudegroup(800—900m);
correspondinglyloweraltitudegroup(250一300m);middlinga tituderoup(600m).
Keywords:Sarcandraglabra(Thunb.)Nakai;ISSR;geneticdiversity;clusteranalysis
收稿日期:2007—12-11
基金项目:浙江省科技计划项目(2006C23008)
作童简介:.倪开域(1982一),男,浙江永康,现为浙江师范大学生化学院植物生物技术方向在读研究生.E—mail:nkcl982@163.corn
-通讯作者郭卫东 E—mail:gwdzjnu.cn
万方数据
川产羌活种质遗传多样性的RAPD分析
作者: 唐学芳, 蒋舜媛, 孙辉, 陈铁柱, 周毅, 马小军, TANG Xue-fang, JIANG Shun-
yuan, SUN Hui, CHEN Tie-zhu, ZHOU Yi, MA Xiao-jun
作者单位: 唐学芳,孙辉,TANG Xue-fang,SUN Hui(四川大学环境科学与工程系,四川,成都,610065),
蒋舜媛,陈铁柱,周毅,JIANG Shun-yuan,CHEN Tie-zhu,ZHOU Yi(四川省中医药科学院,四川
,成都,610041), 马小军,MA Xiao-jun(中国医学科学院中国协和医科大学,药用植物研究所
,北京,100094)
刊名: 中草药
英文刊名: CHINESE TRADITIONAL AND HERBAL DRUGS
年,卷(期): 2008,39(9)
被引用次数: 2次

参考文献(16条)
1.溥发鼎.王萍莉.郑中华 重订羌活属的分类[期刊论文]-植物分类学报 2000(05)
2.王幼平.溥发鼎.王萍莉 中国特有属一羌活属的系统分类研究[期刊论文]-云南植物研究 1996(04)
3.蒋舜嫒.孙辉.黄雪菊 羌活和宽叶羌活的环境土壤学研究[期刊论文]-中草药 2005(06)
4.中华人民共和国药典(一部) 2005
5.汪松.解焱 中国物种红色名录 2004
6.汪小全.邹喻苹.张大明 RAPD应用于遗传多样性和系统学研究中的问题 1996(12)
7.邹喻苹.葛颂.王晓东 系统与进化植物学中的分子标记 2001
8.Yeh FC.YangRC.Boyle T B J POPGENE Version 1.31.the User-friendly Shareware for Population Genetic
Analysis 1997
9.Miller M P A Program for the Preparation of AMOV A Input Files from Dominant-marker Raw Date 1998
10.Excoffier L Analysis of Molecular variance(AMOVA) 1993
11.MiIhr M P Tools for Population Genetics Analysis (TFPGA) 1997
12.张颖娟.杨持 中国特有种四合木种群遗传多样性的RAPD分析[期刊论文]-生态学报 2002(11)
13.刘登义.储玲.杨月红 珍稀濒危植物天目木兰(Magnolia amoena)遗传多样性的RAPD分析[期刊论文]-应用生态学
报 2004(07)
14.苏何玲.唐绍清 濒危植物资源冷杉遗传多样性研究[期刊论文]-广西植物 2004(05)
15.张志勇.李德铢 极度濒危植物五针白皮松的保护遗传学研究[期刊论文]-云南植物研究 2003(05)
16.马逾英.熊英.贾敏如 川白芷种质的RAPD遗传标记研究[期刊论文]-世界科学技术-中医药现代化 2004(02)

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1. 史静.蒋舜媛.马小军.孙辉.周毅.SHI Jing.JIANG Shun-yuan.MA Xiao-jun.SUN Hui.ZHOU Yi 羌活种子发芽及
实生苗生长发育的研究[期刊论文]-中国中药杂志2007,32(18)
2. 周鹤峰.张桂彬.邵敏.唐历波.李官成 羌活基因组DNA提取方法[期刊论文]-安徽农业科学2008,36(10)
3. 古松.蒋舜媛.唐学芳.孙辉.杨志荣.孙群.GU Song.JIANG Shun-yuan.TANG Xue-fang.SUN Hui.YANG Zhi-tong.
SUN Qun 羌活和宽叶羌活简单重复序列区间扩增反应体系的正交优化[期刊论文]-时珍国医国药2007,18(12)
4. 周毅.蒋舜媛.马小军.孙辉.溥发鼎.吴锐 羌活资源危机和保护[期刊论文]-中草药2003,34(10)
5. 丁平.刘瑾.仰铁锤.邱金英.DING Ping.LIU Jin.YANG Tie-chui.QIU Jin-ying 巴戟天遗传多样性的RAPD研究
[期刊论文]-中草药2008,39(12)
6. 刘志刚.李发美.LIU Zhi-gang.LI Fa-mei 羌活的HPLC指纹图谱[期刊论文]-华西药学杂志2008,23(1)
7. 不同套种作物对宽叶羌活生长的影响[期刊论文]-安徽农业科学2009,37(29)
8. 史静.马小军.蒋舜媛.赵鑫.陈震.SHI Jing.MA Xiao-jun.JIANG Shun-yuan.ZHAO Xin.CHEN Zhen 羌活种胚后熟
过程中内源激素的动态变化[期刊论文]-中草药2006,37(2)
9. 杨新杰 太白羌活的质量标准研究[学位论文]2007
10. 蒋舜媛.孙辉.黄雪菊.周毅.马小军.杨志荣.JIANG Shun-yuan.SUN Hui.HUANG Xue-ju.ZHOU Yi.MA Xiao-jun.
YANG Zhi-rong 羌活和宽叶羌活的环境土壤学研究[期刊论文]-中草药2005,36(6)

引证文献(2条)
1.曹亮.李顺祥.魏宝阳.黄丹.徐菲.佟志远 吴茱萸RAPD体系构建及道地性遗传背景研究[期刊论文]-中草药
2010(6)
2.石张燕.陈千良.赵宇玮.孙文基.赵桂仿 陕西产秦艽质量变异与遗传多样性研究[期刊论文]-中草药 2010(10)


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