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Expression of CodA gene from Escherichia coli confering a negative selection phenotype on transgenic Artemisia annua

大肠杆菌CodA基因表达赋予转基因青蒿负选择表型



全 文 :·578· 中草药 ChineseTraditionalandHerbalDrugs第36卷第4期2005年4月
药材与资源
大肠杆菌CodA基因表达赋予转基因青蒿负选择表型
冯丽玲,杨瑞仪,杨雪芹,曾庆平
(广州中医药大学热带医学研究所,广东广州 510405)
摘 要:目的 为了验证CodA基因是否适宜作为有效的青蒿基因打靶负选择标记。方法用PCR法扩增大肠杆
菌胞嘧啶脱氨酶基因CodA,经克隆和测序后插入植物基因表达载体pROKⅡ,并导入根癌农杆菌LBA4404
(pAL4404)中。以共培养法转化青蒿叶盘,在添加25pg/mL卡那霉素(Kan)的N6培养基上选择青蒿转化愈伤组
织并再生绿芽。将Kan抗性转基因青蒿芽转植到含有500pg/mL5-氟胞嘧啶(5一FC)和25pg/mLKan的MS培养
基上继续培养2周。结果转基因青蒿芽全部死亡,而未转化青蒿芽仍正常生长,表明导入CodA基因的青蒿细胞
已赋予其预期的负选择表型。经RT—PCR检测,转基因青蒿芽显示CodA阳性扩增带,而未转化青蒿芽无此特异扩
增带。这一结果显示,CodA基因已在青蒿细胞中转录生成相应的mRNA,从而进一步印证了表型检测结果。结论
CodA基因可作为有效的青蒿基因打靶负选择标记。
关键词:青蒿;基因打靶;负选择
中图分类号:R282.12 文献标识码:A 文章编号:0253—2670(2005)04—0578~05
ExpressionofC dAgenefromEscherichiacoliconferingane ative
selectionphenotypeontransgenicArtemisiaannua
FENGLi—ling,YANGRui-yi,YANGXue—qin,ZENGQing—ping
(TropicalMedicineInstitute,GuangzhouUniversityofTraditionalChineseMedicine,Guangzhou510405,China)
Abstract:ObjectiveToexplorethfeasibilityofu ilizingthecytosinedeaminaseA(CodA)geneas
aneffectivenegativeselectablemarkerinArtemisiaannuaforgenetargeting.MethodsThePCRproce—
durewasemployedtoamplifyCodAgenefromEscherichiacol .Afterbeingclonedandsequenced,the
genewasinsertedintoaplantexpressionvector,pROKⅡ,andthenintroducedintoAgrobacteriumume-
/&ciensLBA4404(pAL4404).The1eardisksofA.annuaweretransformedbythCO—cultivationprot eol,
afterwhicht etransformedcalliw reselectedangreenshootsofA.annuawereregeneratedonN6medi—
umsupplementedwith25弘g/mLKanamycin(Kan).ThentheKan—resistanttransgenicshootsweretrans—
plantedontotheMSmediumcontaining500#g/mL5-fluocytosine(5一FC)plus25弘g/mLKanandcontin—
uouslyculturedforuptotwoweeks.ResultsThetransgenicshootshavetotallydiedwhileuntrans——
formedshootsstillkeptnormalgrowth,indicatingthatA.a nuacellsintroducedintotheCodAgenehad
conferredanexpectednegativesel ctionphenotype.WhendetectedbyRT—PCR,thetransgenicshootsdi —
playedaCodA—positiveamplifiedban ,butun ransformedshootsgavenosuchCodA—specificamplified
pattern.ThisresultsuggestedthatCodAgenehadtranscribedintocorrespondingmRNAin .annuacells
withfurtherlyverifyingtheresultofphenotypicassay.ConclusionTheCodAgenecanbeutilizedasan
effectivenegativeselectablemarkerinA.annuaforgenetargeting.
Keywords:ArtemisiaannuaL.;genetargeting;negatives lection
正负双向选择标记的应用已成为植物基因打靶
中富集同源重组体的新策略‘1|。迄今报道的植物正
选择标记多达10余种,主要是抗生素抗性基因,如
赋予卡那霉素(Kan)抗性的新霉素磷酸转移酶
收稿日期:2004—06—27
基金项目:国家自然科学基金新技术探索项目(30271591)、国家中医药管理局基础研究项目(02一03zP43)、广东省自然科学基金重点项
目(020799)、健桥科研基金项目(JQ0205)。
作者简介:冯丽玲(1975一),女,广东广州人,学士,助理研究员,主要从事中药生物工程研究。
Tel:(020)36585422Fax:(0 0)86373516E—mail..fenglilingl@21cn.corn
万方数据
中草药ChineseTraditionalandHerbalDrugs第36卷第4期2005年4月·579·
(NPT1I)基因和赋予潮霉素抗性的潮霉素磷酸转
移酶(HPT)基因等,但负选择标记仅有大肠杆菌胞
嘧啶脱氨酶基因(cytosinedeaminaseA,CodA)[21和
双翅目昆虫毒蛋白基因(diphtheriatoxinA,DT—
A)[31等。细菌CodA基因编码的胞嘧啶脱氨酶可催
化无毒的5一氟胞嘧啶(5-FC)转变成有毒的5一氟尿
嘧啶(5一FU)。在动植物细胞中表达细菌CodA基因
可使其在添加5-FC的培养基上迅速死亡,从而赋
予“自杀”(负选择)表型。
自1993年Perera等H1首次将CodA基因用作
植物负选择标记以来,至今已成功地应用于拟南
芥‘56|、烟草‘7引、大麦‘93和日本黄连‘10|。最近据
Tarada等口玎报道,水稻愈伤组织对5-FU表现较强
的耐受性,因此CodA基因不宜作为转基因水稻中
可靠的负选择标记。为了验证CodA基因是否适宜
作为青蒿的负选择标记,本实验从大肠杆菌中扩增
了CodA基因,并将其与花椰菜花叶病毒(CaMV)
35S启动子融合后插入T—DNA末端内侧,然后通
过根癌农杆菌双元载体介导的共培养转化系统导入
青蒿细胞。经过选择培养,已成功地获得Kan抗性
和5-FU敏感的转基因青蒿芽,并在分子水平上进
行了验证,为进一步在青蒿中实施基因打靶奠定了
基础。
1材料
1.1植物种子:青蒿种子采自四川酉阳地区大田栽
培青蒿,由广州华立健药业有限公司提供。
1.2菌种及质粒:大肠杆菌JMl09菌种由本室保
存;pTarget载体购自Promega公司;根癌农杆菌
LBA4404(pAL4404)菌株及Ti质粒载体pROKⅡ
由中国科学院微生物研究所提供。
1.3抗生素和植物激素:头孢霉素(Cef)、卡那霉素
(Kan)、5-氟胞嘧啶(5一FC)为Sigma公司产品,利福
平(Rif)为广东台山新宁制药厂产品,6一苄氨基嘌呤
(BA)为新华活性材料研究所产品,a一萘乙酸
(NAA)为上海曹杨第二中学化工厂产品。
1.4扩增引物:按文献[12]设计大肠杆菌CodA基
因扩增引物,并委托大连Takara公司合成。末端无
酶切位点的上游引物CodAl的序列为:57一AT—
GTCGAATAACGCTTTA一37;下游引物CodA2的
序列为:57一TCAACGTTTGTAATCGAT一37。末端
有BamHI酶切位点的上游引物CodA—B的序列
为:57一GGATCCATGTCGAATAACGCTTTA;末
端有I@nI酶切位点的下游引物CodA—K的序列
为:57一GGTACCTCAACGTTTGTAATCGAT。
1.5 试剂盒:质粒提取试剂盒、植物DNA提取试
剂盒、植物RNA提取试剂盒购自Omega公司;质
粒DNA纯化试剂盒、DNA片段回收试剂盒购自
LifeTechnologies公司;PCR扩增试剂盒、RT—PCR
扩增试剂盒购自Takara公司。
2方法
2.1 CodA基因扩增、pT—CodA构建和CodA基因
测序:以大肠杆菌JMl09菌液制备的DNA为模板,
利用CodAl和CodA2扩增引物进行PCR扩增,扩
增条件为:94℃、1min,55℃、1min,72℃、3min,
共30个循环。将凝胶回收的PCR产物与pTargeT
载体连接,转化JMl09感受态细胞,涂板,蓝白斑筛
选重组质粒pT—CodA,用T7启动子引物测序。
2.2 pROKⅡ一CodA构建及酶切鉴定:以pT—
CodA重组质粒为模板,利用CodA—B和C0dA—K
扩增引物进行PCR扩增,扩增条件为:94℃、1
min,55℃、1min,72℃、3min,共30个循环。将
BamHI和脚咒I酶切PCR产物后所得片段插入
相同酶切的pROKII载体中,获得中间表达载体
pROKⅡ一CodA。以pROKⅡ一CodA转化JMl09感
受态细胞,挑取单菌落,用BamHI和gpnI进行双
酶切鉴定。
2.3 pROKⅡ一CodA导人根癌农杆菌及青蒿培养细
胞[13|:用pROKⅡ一Coda直接转化根癌农杆菌
LBA4404(pAL4404)感受态细胞,以50肛g/mLRif
和25弘g/mLKan选择转化。选取8~10d叶龄的青
蒿无菌幼苗,将叶片剪成5mm长小块,转入N6培
养基(0.5gg/mLNAA)中,于25℃光照下预培养
2d。将预培养材料用稀释的农杆菌菌液浸泡lmin,
吸去多余菌液后放回N6培养基(o.5Fg/mLNAA)
中,28℃黑暗中培养2d,再转到N6培养基(o.3肛g/
mLNAA)中,25℃光照下培养2d,最后转入含25
弘g/mLKan和500Fg/mLCef的MS培养基(1Fg/
mLBA+0.2Fg/mLNAA)中继续培养。
2.4转基因青蒿的筛选培养:在含1pg/mLBA+
0.2肛g/mLNAA及25Fg/mLKan+500>g/mL
Cef的正选择培养基上筛选Kan抗性转基因青蒿
芽,转入含1弘g/mLBA+0.2弘g/mLNAA及500
gg/mL5-FC、25gg/mLKan和500弘g/mLCef的
正负双向选择培养基上继续培养,同时用未转化的
正常青蒿芽作为对照。
2.5转基因青蒿RNA提取与RT—PCR扩增:将转
基因青蒿芽和未转化的正常青蒿芽放入液氮冻于
后,按RNA纯化试剂盒说明书提取总RNA。将
万方数据
·580· 中草药ChineseTraditionalandHerbalDrugs第36卷第4期2005年4月
RNA用DNA酶消化,经抽提和沉淀后进行RT—PCR
PCR扩增,扩增条件为:50℃、30min一85℃、
1rain,45℃、1min,72℃、1min,共30个循环。
3结果与讨论
3.1 目的基因的扩增、克隆和测序:大肠杆菌
JMl09菌株DNA经CodA基因特异PCR扩增和
凝胶电泳,可检测到长度约为1.3kb的特异扩增区
带(图1)。该扩增带的大小与大肠杆菌CodA基因
的实际长度(1284bp)相符[1引,表明其为CodA基
因的阳性扩增产物。


劬I+BamHI I
35S一花椰菜花叶病毒届动子Ter一胭脂碱合成酶基因终止子
35S——CaMVpromoterT —-NOSpolyAsignalsite
图2中间表达载体的构建
Fig.2Constructionofintermediatevector
1一^DNA/HindⅢ相对分子质量标准2-PCR产物
1一XDNA/HindⅢmarkers2一PCRamplicon
图1大肠杆菌CodA基因PCR扩增产物
Fig.1PCRampliconofCodAgenefromE.coli
将扩增产物克隆后进行序列分析,结果与已发
表的大肠杆菌CodA基因序列(GenBank登记号
$56903)相同,进一步证实该扩增序列为CodA基
因。本研究测得的CodA基因序列已被GenBank收
录(GenBank登记号AY552602)。
3·2 中间表达载体的构建与鉴定:将携带BamHI 1一pROKⅡ(B。HI+Kp。I)双酶切产物
和脚竹I酶切位点的CodA基因PCR扩增产物与 2-pROKⅡ一C。dA(B。。HI+酗 I)双酶切产物
pROKⅡ同时用KbnI和BamHI消化,然后经T4 3一xDNA/EcoRI+Hindm相对分子质量标准
DNA连接酶连接而获得重组质粒pROKⅡ一CodA 1一PRoK“(B—H1+印n
1’
c蚴。 2-。p汕RONKAI嚣,‘僦1兰。二’
将pROKⅡ一C。dA与pROKⅡ用BamHI和
图3 pRoKⅡ一CodA的酶切鉴定
劫以I进行双酶切,结果pROKⅡ一CodA可产生大 Fig.3IdentificationofpROKⅡ一CodA
小2个片段,其中小片段的长度为1.3kb,pROK“ byenzymecI avage
只产生1个片段(图3)。这一结果显示,CodA基因白化现象(图4b),而转基因青蒿芽则出现发白和变
已被成功克隆到中间表达载体中。 枯等现象(图4c),2周后全部死亡(图4d)。
3.3青蒿的转化与选择培养:经共培养转化的青蒿 以上结果表明,外源NPTⅡ基因和CodA基因
叶盘在加有Kan的正选择培养基上生长4~6d后, 都已在转基因青蒿芽中表达,使其对Kan具有抗
叶盘周边长出颗粒状愈伤组织,并不断膨大,14~21性,而对5一FC表现敏感;相反,未转化青蒿芽中因
d开始出现绿芽分化,继续培养并淘汰白化芽及畸 无CodA基因而不受5一FC的影响。Perera等‘43发
形芽后,可获得生长及形态正常的Kan抗性转基因 现,由于重复基因诱导的基因沉默,某些含有多拷贝
青蒿芽(图4a),转化率为15%。将转基因青蒿芽与CodA基因的转基因拟南芥仅有低水平的CodA基
未转化青蒿芽转植在含有500弘g/mL5-FC的负选因表达,故对5-FC不甚敏感。本研究尚未对CodA
择培养基上培养1周后,未转化青蒿芽生长正常,无 基因整合的拷贝数进行分析。
万方数据
中草药ChineseTraditionalandHerbalDrugs第36卷第4期2005年4月·581·
3.4转基因青蒿芽的RT—PCR检测:以DNA酶消
化的转基因绿芽RNA为材料进行RT—PCR扩增,
同时设置对照,检测CodA基因是否已在青蒿细胞
中表达,结果如图5所示。
无DNA的转基因青蒿芽总RNA经RT—PCR
扩增后,可见约1.3kb的扩增产物(3泳道),这与
CodA基因的大小一致(2泳道)。无DNA的转基因
青蒿芽总RNA经PCR扩增后,未检测到相应的扩
产物(4泳道),表明青蒿基因组中的CodA基因
已被DNA酶消化。未转化青蒿芽总RNA中因无可
扩增CodA基因模板而无扩增产物(5泳道)。这一
结果表明,CodA基因在青蒿细胞中已转录生成相
应的mRNA,而对照细胞无扩增信号,表明其中无
CodA对应的基因拷贝及转录产物。
a未加5一FC的转基因青蒿芽b一加5-FC的未转化青蒿芽c一加5一FC的转基因青蒿芽(1周)d一加5一FC的转基因青蒿芽(2周)
a—transgenicshootsofA.annuanotby5一FCb-untransgenicshootsofA.御2n“nby5一FCc—transgenicshootsofA.annua
by5-FC(oneweek)d-transgenicshootsofA.annunby5一FC(twoweeks)
图4转基因青蒿芽的筛选
Fig.4ScreeningoftransgenicshootsofA.annua
常罕见[14|。因此,通常植物基因打靶的效率非常低,
一般在10q~10_5L15|,而且成功的报道很少,目前
仅见3例[11,16,173。为了富集植物基因打靶中的同源
重组体,常用的策略是利用正负双向选择标记区分
同源重组与非同源重组,其中正选择标记位于同源
序列以内,用于筛选全部整合体,包括定点整合与随
机整合;负选择标记位于同源序列以外,用于淘汰随
机整合体。以大肠杆菌CodA基因作为负选择标记
的筛选技术已在少数几种植物中建立[3“⋯,本研究
1 100bp梯度分子量标准2-pROKⅡ一CodA质粒的PCR产物首次应用CodA基因作为负选择标记进行转基因青
3_转基因芽总RNA经DNA酶消化并去蛋白后的RTPCR产物 蒿芽的快速筛选,将为下一步实施青蒿基因工程改
4一转基因芽总RNA经DNA酶消化并去蛋白后的PCR产物造打下良好的基础。
5一未转基因芽总RNA经DNA酶消化并去蛋白后的RT—PCR产物
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整合方式均以“非同源末端连接”(non—homologoussetectionandT—DNAstabilityinArabidoD5istran formation
endjoining,NHEJ)即随机整合为主,而同源重组E6]导蠹冀nHt,Mvoli州BioJl,F1,9E991“,3d99:。8A3-,9三a1.P0si。i。 。gative
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荒漠肉苁蓉茎腐病的初步研究
程齐来1,陈君h,于晶1,刘杏忠2,孙炳达2,程惠珍1
(1.中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所,北京100094;2.中国科学院微生物研究所
真菌地衣系统学重点实验室,北京 100080)
摘 要:目的 分离和鉴定肉苁蓉茎腐病病原菌,研究其生物学特性,并室内筛选对该病原菌有效的杀菌剂。方法
组织分离法和菌丝尖端纯化法得到主要病原菌,通过测量不同营养条件下菌落生长直径研究其生物学特性,平皿
菌丝生长抑制法进行杀菌剂的生物测定。结果 接骨木镰刀菌Fusariumsambucinum是肉苁蓉茎腐病的主要病原
菌,为首次记录;适合其生长的培养基为PSA培养基,对碳和氮的吸收主要以蔗糖和蛋白胨为主,适宜生长温度为
lo~30℃,适宜生长pH为6~8;多菌灵、菌线威、绿享二号在室内可以有效地抑制病原菌。结论该病原菌的分离
鉴定可以为该病害原的防治提供理论依据。

关键词:肉苁蓉;茎腐病;接骨木镰刀菌;杀菌剂
中图分类号:R282.2 文献标识码:A 文章编号:0253—2670(2005)04—0582一05
StemrotofCistanchedeserticola
CHENGQi—lail,CHENJunl,YUJin91。LIUXing—zhon92,SUNBing—da2,CHENGHui—zhenl
(1.InstituteofMedicinalPl nt,ChineseAcademyofMedicalSciencesandPekingUnionMedicalCollege,
Beijing100094,China;2.KeyLaboratoryofSystematicMycologyandLichenology,Institute
ofMicrobiology,ChineseAcademyofSciences,Beijing100080,China)
Abstract:ObjectiveToisolatendidentifypathogenofCistanchedeserticolastemrot,studyitsbio~
logicalharacteristics,andselecttheffectivefungicidesagainstthepathogenicbacteria.MethodsThe
mainpathogencanbegainedbytissueisolationandmyceliumcusppurification,thebiologicalcharacteris~
ticscanbestudiedbymeasuringthegrowthdiameterunderdifferentnutrientconditionsandseededthehy~
phaediskatthecentreofagarplatecontainingchemicalstodofungicideb oassay.ResultsFusariumam~
bucinumwasthemainpathogenicbacteriaonC.deserticolastemrotwhichwasfirstrecorded;itssu able
mediumwasPSAculturemedium;amongthecarbona dnitrogensourcessupplied,saccharoseandpep~
toneweremostavailable:thetemp raturerangeofitsgrowthwas1O一3O oCanditgrewbestbetween6—
8pHvalue.Duojunling(carbendazim),Junxianwei(1.5%methanedithiocyanate),LijxiangNo.2(80%
收稿日期:2004—09—11
基金项目:国家科技部西部专项(2002BA901A32)
*通讯作者Tel:(010)62899731
万方数据
大肠杆菌CodA基因表达赋予转基因青蒿负选择表型
作者: 冯丽玲, 杨瑞仪, 杨雪芹, 曾庆平, FENG Li-ling, YANG Rui-yi, YANG Xue-qin,
ZENG Qing-ping
作者单位: 广州中医药大学热带医学研究所,广东,广州,510405
刊名: 中草药
英文刊名: CHINESE TRADITIONAL AND HERBAL DRUGS
年,卷(期): 2005,36(4)
被引用次数: 1次

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