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ISSR Analysis on genetic diversity of Panax ginseng landraces

人参农家类型遗传多样性的ISSR分析



全 文 :中草荡ChineseTraditionalandHerbalDrugs第38卷第9期2007年9月
综合以上结果,从试管苗的生长状况来看,
I/2MS培养基优于MS培养基,Ms培养基中的无
机盐如钾盐、铵盐及硝酸盐量均较高,微量元素种类
较全,浓度也较高,是植物组织培养中常用的基本培
养基。可见,怀地黄试管苗对大量元素的需求不高,
1/2MS中大量元素的量足以满足其生长的需要,因
此,可以用l/2Ms培养基取代MS培养基“]。
添加蒸馏水明显优于添加自来水,试管苗在添
加自来水的培养基中的生长状况远不如添加蒸馏水
的。这一点与张春华等[s1对马铃薯、菊花和满天星进
行规模化生产时的研究结果不同。主要原因可能是
本地区(新乡)自来水水质较硬(Ca”和M92+量较
高),pH值偏高,在配制过程中虽已对培养基的pH
值进行调定,但仍比用蒸馏水配制的附加等量冷凝
脂的培养基硬度大。由此认为,培养基过硬也可对试
管苗的生长造成不利影响。所以在怀地黄试管苗的
快速繁殖中,不提倡使用自来水。可以考虑将自来水
煮沸以降低其中Ca”、Mg”的离子浓度“],从而用
自来水代替蒸馏水。
在大规模生产时,为了降低成本,常采用白砂糖
作为碳源代替蔗糖口”】,本实验中两种碳源除叶绿
素外对试管苗的生长影响不大,因此,白砂糖可以取
代蔗糖。
3结论
本实验的结果表明,在怀地黄试管苗的快速繁
殖过程中。1/2Ms培养基优于MS培养基,白砂糖
与蔗糖差别不大,而自来水不利于试管苗的生长。因
此,在怀地黄的规模化生产中,可以1/2MS培养基
取代MS培养基,以市售白砂糖取代分析纯蔗糖。从
生产成本看,每株试管苗可降低成本约0.05元。由
此可见,在怀地黄试管苗的生产中,适当调节培养基
成分,可以降低生产成本。
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人参农家类型遗传多样性的ISSR分析
李靖1,程舟“,扬晓伶1,李珊1,顾然其1,万树文2,张文驹3
(1.同济大学生命科学与技术学院,上海200092;2.上海雷允上药业有限公司,上海200002l3.教育部生物多样性
与生态工程重点实验室,复旦大学生命科学学院生物多样性科学研究所,上海200433)
摘要:目的探讨人参农家类型的遗传多样性和亲缘关系,为人参的栽培和选育种提供遗传学依据。方法采用
ISSR分子标记分析5种人参农家类型7个居群120个样本的遗传多样性。结果人参农家类型有较丰富的遗传多
样性.平均多态位点百分率为48.85“}不同农家类型的遗传多样性水平有差异,和其他农家类型相比,长脖和竹节
芦的遗传变异较小,且两者之问的相似性系数高达97%l不同产地的同一人参农家类型阔也存在很大的遗传差异。
结论研究表明人参农家类型的遗传差异主要存在于各类型内部t而且可能更多地存在于同一类型的不同居群内
部。为促进人参新品种的选育,有必要在现有的栽培群体中补充不同产地的同一类型的种质辞滔。
关譬词:人参浓家类型‘遗传多样性;1SSR .
中圈分类号:R282.2 文葡标识码:A 文章缩号:0253—2670(2007)09—1392—04
警霎是智:竺饕帚备墨中药现代化专项(03Dzl9547.04Dzl9834)
尊耋景荏孑掌‘舟1981_Tehl:乳(021圳)6嗽5985滋人185’{麓麓’从ngz事ho撼瓣器盔嬲研究口
万方数据
中革t ChlneseTraditionalandHerbalDrugs第38卷第9期2007年9月
ISSRAnalysisongeneticd versityofPanaxginsenglandraces
LIJin91.CHENGZhoul,YANGXiao-lin91,L/Shanl,GURan—qil,WANShu-wen2,ZHANGWen—ju。
(1.SchoolofLifeScienceandTechnology,TongjiUniversity,Shanghai200092,ChinaI2.ShahghaiLei=ytm-‘hang
MedicineCo.,Ltd.,Shanghai200002,China3.KeyLaboratoryofBiodiversityandEc0109icat
EngineeringtMinistryofEducation,InstituteofBiodiversityScience,School
ofL豳Science。FudanUniversity,Shanghai200433,China)
Abstract:ObjectiveTodiscussthegeneticd versityandrelationshipofPanax—nsenglandracesnd
providegeneticreferencesforginsengcultivation.selectionandbreeding.MethodsThegeneticd versity
Of120individualsfromsevenpopulations,representingfiveP.ginsenglandraees,wasanalyzedbyinter—
simplesequencerepeat(ISSR)markers.ResultsP.gins ngla dracesheldhighergeneticd versityand
theaveragepercentageofpolymorphiclociwas48.85%·Geneticdiversitylevelswereverydifferentamong
variouslandraces.ThelandraeesofZhujieluandChangbosh wedrelativelylOWgeneticvariationas
comparedwiththeothersandtheirsimilaritycoefficientWaSuptO97%.Alargeneticvariationexisted
inthesamelandracesbutcultivatedindifferenthabitats.ConclusionThisstudyindicatesthatthelarge
geneticvariationsmainlyexistswithineachlandrace,butvenmorevariationsmightexistwithind fferent
populationsfroma amerace.Forpromotinghebreedinga dselectingofP·ginsengvarieties,iti
necessarytosupplygermplasmofthesameracefromdifferenthabitatstOthecurrentlycu tivated
populations-

Keywords:Panaxgi sengC.A.Meyer;landraeefgeneticd versity;ISSR
人参PanaxginsnegC.A.Meyer系五加科
(Araliaceae)多年生植物,栽培的又称“园参”,是我
国著名的传统中药材o]。人参在我国栽培历史悠久,
经过长期的自然变异和人工选育,人参栽培群体中
已形成一些性状稳定的变异类型,如大马牙、二马
牙、长脖、圆芦等,常被称为农家类型[2】。这些人参农
家类型在各地的栽培群体中混杂分布,对人参的选
育种工作和GAP生产均有一定的影响。研究人参
不同农家类型的遗传差异、多样性水平及亲缘关系
对提高人参的栽培及选育种水平具有重要意义。为
此,赵寿经等[33对人参农家类型的农艺性状进行了
遗传分析}马小军等应用RAPD和AFLP等方法对
野山参与栽培参、栽培参不同栽培群体、不同农家类
型问的遗传关系进行了系统的研究“。1}邵爱娟等“1
用RAPD法分析了人参农家类型大马牙和二马牙
不同品系闻的遗传关系。而对人参各农家类型内的
遗传变异尚缺乏了解。
简单序列重复区间扩增多态性(inter—simple
sequencerepeat,ISSR)口3是利用生物基因组中常
出现的简单序列重复SSR设计引物,检测多态性的
一种分子标记。ISSR分子标记技术具有操作简单,
无需预先知道DNA序列,比RAPD标记更为灵敏、
稳定且实验重现性好等优点,已成功应用于如罗汉
果‘”、水稻[”、山药m1等植物的遗传多样性研究,但
还未见该方法用于人参种质资源研究的报道。本研
究采用ISSR方法分析5种人参农家类型的遗传多
样性,明确各农家类型内和类型问的遗传差异、多样
性水平及各居群间的亲缘关系,为人参的栽培生产
和育种提供理论依据。
1材料与方法
1.1材料:实验材料均为人参干燥根,包括5个农
家类型的7个居群。大马牙采自吉林省通化市,二马
牙分别采自吉林省通化市、辽宁省新宾县和集安市,
圆芦、长脖和竹节芦均采白辽宁省集安市。除长脖和
竹节芦采集10个个体外,其余5个居群均采集20
个个体。 、
1.2基因组DNA的提取:采用改进的高盐SDS
法‘113提取人参总DNA。
1.3 ISSR引物筛选及PCR扩增:从100条ISSR
引物[TheUniversityofBritishColumbia(uBC
SSRPrimer(RAPD)SynthesisProjectOligo-
nueletideSet100/9)3中筛选出6个扩增条带清晰、
多态性带明显、反应稳定的引物用于全部120份
DNA样品的扩增(表1)。ISSR—PCR反应体系经优
化确定为20pL的PCR反应液内台:2mmol/L
MgCl2、0.25mmol/LdNTPs、0.2/zmol/L引物、lO
ng摸板、1×buffer和0.75UExTaqDNA聚合酶
(TaKaRa)。扩增条件为94℃预变性5rain;40个循
万方数据
中草番ChineseTraditionalandHerbalDrugs第38卷第9期2007年9月
环;94℃变性45s,51.5~54℃退火458(各引物的
退火温度见表1),72℃延伸45s;最后72℃延伸
10min。扩增产物在1.5%琼脂糖凝胶中电泳分离
(以100V恒压电泳60min),以100bpDNA
LadderPlus作为相对分子质量标准,用1pg/mL
溴化乙锭染色后于紫外成像仪中拍照、观察、记录并
保存电泳图片。
裹1 ISSR引袖爱其对人参农家粪型120份样品的
PeR扩增结果
Table1 Numberoffrngmentamplifiedw thISSRprimers
for120individualsofPr#nsenglandraces
826ACACACACACACACACC54
842GAGAGAGAGAGAGAGAYG51.5
856ACACACACACACACACYA52
859TGTGTGTGTGTGTGTGRC52
873GACAGACAGAcAGACA52
总计
100
100
100
100
100
989
1.4统计方法:根据ISSR扩增条带的有无分别用
“1”和“0”表示,构建原始数据表征矩阵。用
Popgene32软件计算遗传多样性参数和相似性系
数““,根据相似性系数采用NTSYS—pcNumerical
TaxonomySystem分析软件进行UPGMA法聚类
分析并绘制系统树状图[1”。
2结果
2.1 人参农家类型的遗传多样性分析:从100条
ISSR引物中筛选出扩增条带清晰、重现性好的6条
引物,以5个人参农家类型的7居群共计120个样
品的扩增结果见表1和图1。5个人参农家类型的
ISSR指纹图谱在类型间和类型(居群)内存在差异。
6条引物共扩增出93条重现性高、清晰的条带,多
态性条带92条,多态率为98.9%。平均每个引物扩
增条带数为15.5条。人参农家类型的Shannon多
样性指数在0.1859~0.2798,平均为0.2362,其
中以长脖(cB)和竹节芦(ZJ)最小(表2)。人参各农
家类型的等位基因数和有效等位基因数也有相同的
变化趋势。人参农家类型居群内多态性位点数从39
(CB)至52(XR新宾二马牙)不等,各居群的多态位
点数平均为45,各居群多态位点百分率平均为
48.85%(表2)。居群内基因多样性占总的基因多样
性的68.14%,而居群(类群)问的基因多样性仅占
总的基因多样性的31.86%。居群间基因流为
1.0691,表明各居群间存在一定的基因交流。
图1新寡二马牙居群(XR20个个体)的ISSR指纹幽谱
(引袖873)
Fig,1ISSRBandingpatternofemayapopulation
fromXinbin.Liaoning(XR.20ndlvIduals。
primer873)
衰2人参农家类型7个居群的遗传多样性参数
Table2 Geneticd versityparametersof|leven
populationsofP.∥nsenglandraces
XR 0.2686 1,559l1.297Z 52 55.9l
Tit 0.2383 1.4946 1.2678 16 4946
YL 0.2445 1.4839 I.2767 45 48.39
JR 0.2363 1.4839 1.2654 45 {8.39
TD 0.2798 l,54B4 1.3232 5l 54.84
zJ 仉2002 1.43011+2155 40 43.01
CB 0.1859 1.4194 1.1921 39 41.94
平均02362 1.4885 1 2626 45 4885
一TR
万方数据
中革蠢cMne舯TradtUoualandHerbalDrugs第鹅卷第9期2007年9月
3讨论
人参为典型的异花授粉多年生草本植物““,人
参栽培群体为存在着各种变异的混杂群体““。对5
个人参农家类型7个居群的120个个体的ISSR分
析也证明了人参农家类型有较丰富的遗传多样性,平
均多态位点百分率为48.85%。同时人参农家类型的
遗传多样性主要存在于各类型(居群)内,而类型(居
群)间的遗传变异相对较小。该结果与国内研究者采
用RAPD、AFLP法研究人参不同农家类型或不同栽
,培品系所得的研究结果相吻合o“】。因此,要获得鉴别
人参农家类型的特异性分子标记有难度。
人参农家类型是由野山参驯化后经由人工选育
而来的,一般是根据其根的形态特征来划分的。虽然
且前人参农家类型已经形成了各自相对稳定的性状
特征,但不同农家类型的遗传多样性水平是不同的。
有报道认为长脖类型具有一定的特殊性,其内部变
异量最高。基于本研究的ISSR数据分析,长脖和竹
节芦两个农家类型的遗传多样性指数较低,表明这
两个类型的遗传变异较小,可能和它们比较容易区
分的形态特征有关。同时长脖和竹节芦类型之间的
遗传相似性系数高达97%,说明这两个类型的人参
在分子水平上没有多大的差异,而且在聚类树状图
上和其他农家类型的遗传关系较远。
人参农家类型的聚类分析结果中如果将通化二
马牙和新宾二马牙两个居群排除在外讨论,那么5
个农家类型的遗传关系与以往的相关研究报道一
致,即二马牙与大马牙、长脖与圆芦之间的关系较
近[1“。但本研究中同为二马牙的不同产地的3个居
群,集安二马牙、通化二马牙和新宾二马牙却有着相
对较远的遗传关系。马小军等”3认为遗传因素在人
参形态上的作用可能小于环境因素。同时鉴于人参
的异花授粉特性、各地生长环境和种质来源及参农
的栽种习惯等因索,可以认为人参农家类型的遗传
差异不仅主要存在于各类型内部,可能更多地存在
于同一类型的不同居群内部。从居群间基因流来看,
各居群间的基因交流偏少。因此,在人参选育种过程
中,除以个体选择为主外,有必要在现有的栽培群体
中补充不同产地的同一类型的种质资源。
致谢:辽宁省新宾满旌自治县药材公司和吉棒
省集安市医药药材岔司为本研宛的样品采集提供的
大力支持。
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万方数据
人参农家类型遗传多样性的ISSR分析
作者: 李靖, 程舟, 杨晓伶, 李珊, 顾然其, 万树文, 张文驹, LI Jing, CHENG Zhou,
YANG Xiao-ling, LI Shan, GU Ran-qi, WAN Shu-wen, ZHANG Wen-ju
作者单位: 李靖,程舟,杨晓伶,李珊,顾然其,LI Jing,CHENG Zhou,YANG Xiao-ling,LI Shan,GU Ran-
qi(同济大学生命科学与技术学院,上海,200092), 万树文,WAN Shu-wen(上海雷允上药业有
限公司,上海,200002), 张文驹,ZHANG Wen-ju(教育部生物多样性与生态工程重点实验室
,复旦大学生命科学学院生物多样性科学研究所,上海,200433)
刊名: 中草药
英文刊名: CHINESE TRADITIONAL AND HERBAL DRUGS
年,卷(期): 2007,38(9)
被引用次数: 14次

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