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Expression pattern analysis of FaGR gene of strawberry leaves under stress of different low temperatures

不同低温胁迫下草莓叶片FaGR基因表达分析



全 文 :书广 西 植 物 Guihaia Feb.2015,35(1):99-104           http://journal.gxzw.gxib.cn 
DOI:10.11931/guihaia.gxzw201307024
林源秀,顾欣昕,于定群,等.不同低温胁迫下草莓叶片FaGR基因表达分析[J].广西植物,2015,35(1):99-104
Lin YX,Gu XX,Yu DQ,et al.Expression pattern analysis of FaGRgene of strawberry leaves under stress of different low temperatures[J].Guihaia,
2015,35(1):99-104
不同低温胁迫下草莓叶片FaGR 基因表达分析
林源秀,顾欣昕,于定群,余昊唯,陈 清,汤浩茹*
(四川农业大学 园艺学院,四川 雅安625014)
摘 要:为进一步探明草莓谷胱甘肽还原酶 (glutathione reductase,GR)基因在低温胁迫下的表达调控模
式,以揭示其作用机理和抗逆机制,该研究以草莓栽培品种‘丰香’植株为对象,分别用0、2、4、6、8、10℃低温胁
迫以及室温(25℃)作为对照处理24h,从处理植株的新鲜幼嫩叶片中提取总RNA并反转录成cDNA,采用
半定量PCR及荧光定量PCR两种定量方法,分析FaGR 基因在不同低温胁迫下的表达差异。结果表明:半
定量PCR方法与荧光定量PCR方法的结果基本一致。FaGR 的相对表达量受到不同低温胁迫和不同程度的
诱导,在8℃和10℃低温胁迫下表达量上调,均高于对照水平,且在8℃低温胁迫下相对表达量最高;当温度
为6℃时,FaGR 表达量急剧下降,当温度低于6℃时,FaGR 表达量随着温度的降低而逐渐降低,并低于对照
水平;在0℃相对表达量时降至最低水平,约为最大表达量的一半。这说明半定量PCR结果准确可靠,可广
泛应用于基因表达研究,而且FaGR 表达量受到低温诱导,但不同低温处理对FaGR 的表达量诱导程度不同。
FaGR 相对表达量在一定范围内的低温胁迫下增加,但在此低温范围外的低温胁迫下则降低,该研究表明6
℃低温为临界值。以上结果为进一步调控该基因表达提供了科学依据,同时为提高植物抗逆能力提供了基础
资料。
关键词:草莓;低温胁迫;半定量PCR;荧光定量PCR
中图分类号:Q945.78;S663  文献标识码:A  文章编号:1000-3142(2015)01-0099-06
Expression patern analysis of FaGRgene of strawberry
leaves under stress of different low temperatures
LIN Yuan-Xiu,GU Xin-Xin,YU Ding-Qun,YU Hao-Wei,
CHEN Qing,TANG Hao-Ru*
(College of Horticulture,Sichuan Agricultural University,Ya’an 625014,China)
Abstract:In order to investigate the expression pattern of glutathione reductase from strawberry under low tempera-
ture stress,so as to further reveal its function in defensing stresses and the molecular mechanism of cold-resistant in
plants.We treated strawberry plants(Fragaria×ananassa‘Toyonaka’)with different low temperatures including
0,2,4,6,8and 10℃in artificial chamber for 24hrespectively,and we also treated plants with 25℃for 24has con-
trol.Subsequently,total RNA samples were extracted from the treated fresh young leaves,and cDNA first strand for
PCR reactions was synthesized using these RNA samples.When al cDNA samples were done,we also chose two
methods including semi-quantitative PCR and real-time quantitative PCR to detect the expression differences of FaGR
between different low temperature treatments.We chose two different methods to determine the expression of
收稿日期:2014-03-28  修回日期:2014-08-29
基金项目:国家级大学生创新性实验项目(091062617)
作者简介:林源秀(1989-),女,四川宜宾人,在读硕士研究生,主要从事生物技术在果树上的应用研究,(E-mail)yuanxiulin1989@gmail.com。
*通讯作者:汤浩茹,博士,教授,主要从事果树遗传育种和生物技术研究,(E-mail)htang@sicau.edu.cn。
FaGR,on one hand to make sure the differences of expression between samples were exactly due to the different tem-
peratures,not because of the different methods;on the other hand,it was expected to see whether semi-quantitative
PCR was reliable as we thought for gene expression research.At last we combined the results came from two meth-
ods and analyzed the expression differences of FaGRgene between samples treated with different temperatures.The
results were described as below:the result of semi-quantitative PCR was generaly consistent with that of real-time
quantitative PCR,both of them showed that the relative expression of FaGRwas greatly modified in diverse grades by
different low temperatures.Furthermore,the relative expression levels of FaGRunder low temperature at 8and 10
℃increased compared to the control which was at 25℃,and the highest relative expression level of FaGRwas de-
tected at 8℃.However,thereafter,the relative expression level at 6℃dropped dramaticaly to a level which was
slightly lower than the control at 25℃.When the temperature was below 6℃,the relative expression level of FaGR
decreased accompanied with the decreasing of temperatures,each of the expression level at temperature below 6℃
was lower than that at 25℃.The lowest relative expression level was detected at 0℃,which was almost only the
half amount of the maximum expression at 8℃.These results supported that semi-quantitative PCR was exactly re-
liable and it could be widely used for gene expression research.Also,these results indicated that FaGRgene was defi-
nitely induced by chiling stress but within a certain range of temperature,and the degree of changes under different
low temperatures was also different.In a certain range,FaGRwas up-regulated by low temperature,however it was
slightly suppressed by low temperature out of this range,and 6℃ was showed as the critical value in this research.
What’s meaningful,these results would provide a scientific basis for the further regulation of the gene expression,as
wel as some basic data to improve the ability of plants to resistant stresses.
Key words:strawberry;low temperature stress;semi-quantitative PCR;real-time quantitative PCR
  谷胱甘肽还原酶(GR)是植物抗氧化酶系统中
的一个重要酶,主要生理功能是利用NADPH作为
电子供体,催化氧化型谷胱甘肽(GSSG)还原生成
还原型谷胱甘肽(GSH),从而对维持细胞内高
GSH/GSSG以及GSH 的含量有重要作用(Meister
et al.,1983;Alscher,1989)。GR通过参与植物抗
坏血酸—谷胱甘肽循环(AsA-GSH Cycle),与该循
环中的其他抗氧化酶类如抗坏血酸过氧化酶
(APX)、以及超氧化物歧化酶(SOD)和磷酸戊糖途
径的关键酶葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)相互作
用(图1),对清除植物体内活性氧(ROS)有重要作
用(于定群等,2012;Foyer et al.,1976)。另外,GR
催化反应的产物GSH,不仅是植物体内主要的低分
子量巯基化合物,对清除ROS、外源性有害物质以
及抵抗重金属胁迫有重要作用(Meister et al.,
1983);而且还是哺乳动物细胞中主要的非蛋白巯基
库,对维持细胞内氧化还原平衡必不可少(Lu,
1999,2009)。在许多胁迫条件下,GSH均能保护蛋
白巯基免受氧化,防止蛋白的变性(Foyer et al.,
1976)。此外,GSH 还通过植物 AsA-GSH 循环为
脱氢抗坏血酸还原酶(DHAR)提供还原力,将脱氢
抗坏血酸(Dehydroascorbic Acid,DHA)还原生成
抗坏血酸(AsA)。因此,GR对植物体内另一种重
要的抗氧化剂———AsA 的再 生 也 有 重 要 作 用
(Foyer et al.,1976;Yousuf et al.,2012)。
GR 的表达受到逆境条件如低温(Esterbauer et
al.,1978)、干旱与盐胁迫(Kaminaka et al.,1998;
Kimet al.,2007)、重金属(Xiang et al.,1998)等的
诱导。Kaminaka et al.(1998)研究表明,水稻GR
表达量在ABA胁迫及其引起的胁迫条件下明显增
加;束德峰等(2011)研究发现,转入GR 反义链的番
茄植株对低温胁迫的敏感性明显增强;将拟南芥
GR 基因转入金丝桃中,使其过量表达,转基因植株
对低温胁迫的抵抗能力明显增加(Yousuf et al.,
2012),而GR 表达对低温胁迫的响应可能是通过某
条能被NO调控的信号转导途径来实现(Liu et al.,
2012)。但GR 在不同低温胁迫下的表达情况及其
作用机理仍不清楚。因此,分析GR 在不同低温胁
迫下的表达差异对进一步揭示GR 在低温胁迫下的
作 用 机 制 有 重 要 意 义。 草 莓 (Fragaria ×
ananassa)是目前水果保护地生产中种植面积最大
的一个种类,由于多种原因导致草莓在栽培过程中
受到偶发性的短时低温伤害,从而给草莓生产带来
巨大损失。本研究以草莓栽培品种‘丰香’为材料,
对草莓植株进行不同低温处理,通过半定量PCR以
及荧光定量PCR(qPCR)两种定量方法对其叶片中
GR 在不同低温胁迫下的表达差异进行检测,以期
进一步阐明其作用机理与抗逆机制,为将来利用该
001 广 西 植 物                  35卷
基因增强草莓与其它园艺植物的抗逆性及遗传改良
提供基础资料。
图1 植物GR在植物清除ROS中的作用示意图
引自林源秀等(2013),有改动。
Fig.1 Role of GR in scavengingreactive oxygen species
in plants Quoted from Lin Yuan-xiu et al.(2013),changed.
1 材料与方法
1.1供试材料
草莓栽培品种‘丰香’(Fragaria×ananassa
cv.Toyonaka)栽植于四川农业大学教学科研园区,
取新生匍匐茎移栽至盆栽中,带回实验室备用。待
存活后,放入人工气候箱中,分别设置温度0、2、4、
6、8、10℃以及室温(25℃)作为对照,每个温度处
理24h。
反转录试剂盒购自北京赛百盛基因技术有限公
司,DNaseⅠ,PCRmix,SYBR Green荧光染料均购
自TaKaRa公司,其他试剂均为进口或国产分析纯,
PCR引物和序列测定由上海生工生物公司完成。
1.2总RNA的提取及反转录
选取新鲜幼嫩的叶片,参照改良 CTAB 法
(Chen et al.,2012)提取其总RNA,用DNaseⅠ处
理后放于-80℃超低温冰箱备用。将总RNA样品
调整至相同浓度后,参照RevertAidTM First Strand
cDNA Synthesis Kit说明书操作合成cDNA,cDNA
合成后立即保存于-20℃冰箱待用。
1.3引物设计与合成
根据GenBank中已提交的FaGR(JQ339738)
基因序列,同时选择FaGAPDH 作为内参,利用
NCBI核酸数据库中(http://www.ncbi.nlm.nih.
gov/)已登录的FaGAPDH(AB363963)基因序列,
搜索草莓基因组数据库(http://www.rosaceae.
org/),找到目标FaGAPDH 序列,利用Primer 5.0
软件和 Beacon designer 7.0软件设计半定量PCR
引 物 (FaGAPDH-F1,FaGAPDH-R1;GRP3,
GRP4)以及qPCR引物(FaGAPDH-F2,FaGAP-
DH-R2;GR-F,GR-R),引物序列见表1。引物合成
后,进行PCR扩增,以检测所得片段是否为目的序
列,扩增时采用20μL体系,其中PCRmix 10μL,上
下游引物(10μmol/L)各1μL 模板cDNA 1μL,
灭菌的ddH2O补足20μL,扩增产物采用1%琼脂
糖凝胶电泳检测。
表1 用于半定量PCR及qPCR的引物
Table 1 Primers for semi-quantitative PCR and
real-time quantitative PCR reactions
引物名称
Primer
引物序列 (5′-3′)
Sequence(5′-3′)
扩增产物长度
Product
length(bp)
GRP3 CTCAGCGACCTGGTATTCCT
GRP4 ATCCGTCTCAGCATCAACAAC
764
FaGAPDH-F1 ATCCATTCATCACCACCGACTA
FaGAPDH-R1 TCATTCACACCAACAACGAACA
313
GR-F  GTG AAG GTG GAT GAG TAT
GR-R  TAGAGC AAC AGG TGT AAG
93
FaGAPDH-F2 GAGTCT ACT GGA GTG TTC A
FaGAPDH-R2 CTT GTA TTC GTG CTC ATT CA
135
1.4半定量表达分析
半定量PCR扩增采用20μL反应体系,其中
PCRmix 10μL,cDNA 1μL,上游和下游引物(2
μmol·L-
1)各1μL,ddH2O补足至20μL。反应条
件为94℃5min,94℃50s,57℃20s,72℃1
min,共29个循环,72℃10min,12℃保存。扩增
内参基因片段,调整所用各cDNA浓度及用量使扩
增所得的片段条带亮度相同(图2:A),并按照梯度
循环数为29、32、35、38、41、44、47,分别扩增FaGR
基因片段和内参基因片段(图2:B),采用 Quantity
one软件对各循环数下扩增条带的光密度值进行分
析,做出循环数与光密度的曲线图(图3),选取处于
对数扩增期的循环数用于表达研究,本研究最终确
定为37个循环。
扩增产物统一取5μL,1.5%琼脂糖凝胶,在1
×TAE电泳缓冲液中,100V恒压电泳进行检测。
电泳完后,EB染色15min,紫外灯下用G-BOX公
司凝胶成像系统Gene Snap成像。用Quantity one
软件对扩增条带光密度值进行分析,Sigmaplot 12.0
软件计算相对表达量并做柱状图。各个低温下的相
1011期         林源秀等:不同低温胁迫下草莓叶片FaGR 基因表达分析
图2 半定量PCR中亮度调整及循环数筛选 A.调整
cDNA浓度及用量使内参扩增条带亮度一致;B.FaGR以及内参在
不同循环数下扩增电泳图。
Fig.2 Intensity control and cycle number screened in
semi-quantitative PCR A.Adjusting the dosage and concentra-
tion of template cDNA to make the band of each PCR production
sample equal intensity,the PCR primers were housekeeping gene
specific primers:FaGAPDH-F1and FaGAPDH-R1;B.Using the
appropriate cDNA dosage as the template for the FaGRand house-
keeping gene PCR amplification of 29,32,35,41,44,47cycles in
order to find the suitable cycle number.
对表达量用相应低温下FaGR 与FaGAPDH 基因
扩增条带的光密度值的比值表示。
1.5qPCR表达分析
采用CFX96(Bio-Rad,美国)进行qPCR检测,
用20μL体系:SYBR Green 10μL,上下游引物(10
μmol/L)各0.6μL,cDNA 2μL,用已灭菌的ddH2
O补足20μL。以不加模板cDNA为对照,每个样
品三孔重复。反应条件:95℃30s,40个循环(95
℃10s,57℃20s),每个循环结束后采集荧光信
号。反应结束后,插入熔解曲线:95℃保温10s,降
温到60℃维持30s,65℃开始以0.5℃每步升温,
并维持5s采集荧光信号至95℃结束反应。采用
2-Δct法处理数据,以确定基因的相对表达量,Sigma-
plot 12.0做柱形图。
2 结果与分析
2.1总RNA的提取
所提取的总RNA经1.5%的琼脂糖凝胶电泳
检测(图4),28S和18S条带清晰完整,经核酸蛋
图3 循环数与条带光密度的曲线图
Fig.3 Cycle-IOD graph constructed by the quantity one
software to make sure that the cycle we chose(37)for
amplification was under linear phase
图4 不同温度下所提取的草莓叶片总RNA电泳图
Fig.4 Total RNA from strawberry leaves
under different temperatures
白分析仪测定OD260nm/280nm均为1.8~2.1之间,表明
所提的草莓叶片各总RNA样品的完整性和纯度均
较高。
2.2目标基因的扩增
分别用FaGR 和FaGAPDH 引物进行目的基
因及内参基因PCR扩增,结果均得到预期大小的条
带(图5),并经测序确认为目标序列。
2.3半定量表达差异检测
调整总RNA及cDNA浓度基本一致后,利用
半定量PCR检测FaGR 在不同低温下的表达差
异,目标基因(FaGR)与内参基因(FaGAPDH)扩
增条带的光密度比值表示FaGR 的相对表达量。
结果(图6,图7)表明:FaGR 在不同低温胁迫下表
达差异较大,室温(25℃)的时候有较高的表达量;
在10℃低温胁迫下,FaGR 相对表达量增加至略高
于对照;在8℃低温胁迫时达到最大;而当处于6℃
低温胁迫下时,相对表达量急剧下降至较对照略低
的状态,并且相对表达量随着温度的逐渐降低而降
低;在0℃的低温胁迫下降至最低,且最低表达量仅
约为最高表达量的一半。说明在一定温度范围内,
201 广 西 植 物                  35卷
图5 半定量PCR及qPCR引物扩增结果 A.用2.5%
琼脂糖凝胶电泳检测的半定量PCR引物扩增结果;B.用聚丙
烯酰胺凝胶电泳检测的qPCR引物扩增结果;M.分子量标准;
1.FaGR 扩增结果;2.FaGAPDH 扩增结果。
Fig.5 Results of PCR amplifications using semi-quantitative
primers and real-time quantitative PCR primers 
A.Result of semi-quantitative PCR amplification detected by 2.5%
agarose gel electrophoresis;B.Result of real-time quantitative PCR
amplification detected by polyacrylamide gel electrophoresis;M.Molecular
standard;Lane 1.Result of FaGRamplification;
Lane 2.Result of FaGAPDHamplification.
低温胁迫促进FaGR 的相对表达量增加,当超出这
个温度范围后,FaGR 的相对表达量较对照降低。
推测是由于在低温应急阶段,低温会促使植物体内
受低温诱导基因(FaGR)的表达,而在增强耐受阶
段,过度的低温胁迫引起植物体内一系列生理生化
变化造成FaGR 表达受到一定的抑制,而此时植物
可能通过其他各种逆境响应途径使自身的抗性增强
而不至受到低温伤害。
2.4定量表达分析
qPCR表达结果总体变化趋势与半定量表达结
果基本一致(图8):FaGR 基因在室温(25℃)的时
候有一定的表达量,在低温胁迫下,相对表达量迅速
上升。在10℃低温下,FaGR 相对表达上升至明显
高于对照水平,在8℃低温时达到最大,而后随着温
度降低至6℃,相对表达量急剧下降至较对照略低
的水平,而在4℃低温下,相对表达量有所回升,但
仍略低于对照水平,随后表达量又逐渐降低,在0℃
的低温下降至最低。从相对表达量来看,FaGR 基
因在不同低温胁迫下的表达水平存在较大差异,0
℃下的最低表达量仅为8℃最高时的一半。
3 讨论
低温胁迫下,植物体内不仅活性氧水平急剧增
图6 用Sigmaplot 12.0软件计算的
FaGR 相对表达量柱形图
Fig.6 Histogram of relative expression of FaGR
under different low temperature stresses
calculated by Sigmaplot 12.0software
图7 FaGR 与内参基因表达差异电泳图
Fig.7 Electrophotogram of expression difference
between FaGRand FaGAPDH
图8 qPCR表达结果 每个柱子表示FaGR 在不同温度
下的相对表达量。实验3孔重复,标准误差在图中标出。
Fig.8 Results of real-time quantitative PCR reactions 
Columnar diagram represents the relative expression levels of FaGR
in different temperatures.Each experiment was repeated three times
and standard errors of the analysis are indicated by the vertical bars.
加,而且植物自身的抗氧化系统也会被诱发启动,从
而保护植物不受伤害。GR是植物抗氧化酶系统中
的关键酶,其基因表达水平受多种逆境因子如低温、
干旱、高盐、重金属等诱导。Baek et al.(2003)的研
3011期         林源秀等:不同低温胁迫下草莓叶片FaGR 基因表达分析
究表明,在低温驯化的小麦植株中,GR 转录水平显
著增加;丁顺华等(2012)利用RNAi技术干扰烟草
植株的GR 基因表达,发现被干扰植株叶绿体内
H2O2大量积累,对低温敏感性大大增强。说明GR
对低温胁迫的响应与植物抗逆性密切相关。本研究
结果表明,在8℃和10℃低温胁迫下,FaGR 表达
量增加,在8℃低温条件下表达量最高,这与Kami-
naka et al.(1998)和Romero-Puertas et al.(2006)
的研究结果一致。说明FaGR 的表达水平受到低
温胁迫诱导,且其表达水平在不同低温胁迫下存在
较大差异。在一定温度范围内,低温诱导会使
FaGR 基因的相对表达量增加,当超出这个温度范
围后,由于低温引起植物体内一系列生理生化变化
造成FaGR 表达有所下降,此时植物通过其他各种
逆境响应途径使自身的抗性增强而不受到低温
伤害。
植物对低温胁迫的响应可分为低温应急阶段及
增强耐受阶段,在适度的低温胁迫下,植物自身抗氧
化系统被激发,通过增加抗氧化酶如GR的酶活力
水平及其受低温诱导的基因的表达水平增加植物对
逆境的抵抗能力。本研究结果中FaGR 在8℃和
10℃低温胁迫下表达量上升,而当温度低于6℃
时,FaGR 表达量急剧下降至低于对照水平。说明
在植物的低温应急阶段,FaGR 的表达受到低温的
诱导而增加;随着低温胁迫的加重,植物体内活性氧
水平持续增加,从而导致植物体自身发生一系列生
理生化变化在一定程度上抑制了FaGR 的表达水
平,使其表达量低于对照,且6℃为临界值。
半定量PCR是一种研究基因转录水平的有效
手段,因其具有成本低、灵敏度高等特点被广泛运用
于基因表达研究。本研究在利用半定量PCR方法
进行表达研究时,首先调整cDNA浓度及用量使内
参基因扩增的条带亮度一致,并且设置了不同的循
环梯度,保证了起始模板量相同及在线性扩增期进
行表达分析,结果更为准确可靠。而结果表明,半定
量PCR与qPCR两种定量方法的结果基本一致,均
显示FaGR 表达量在8℃以及10℃低温胁迫下增
加,而在低于6℃低温胁迫时,FaGR 表达量下降,0
℃时表达量最低。再次证实了半定量PCR方法结
果与qPCR结果差异不明显,其结果准确可靠。
本研究仅对GR 基因在低温胁迫下的表达模式
进行了初步研究,但高温也会诱导GR 基因表达水
平以及 GR 酶活性水平发生变化(Pang et al.,
2010)。Lu et al.(2008)研究发现,在对低温敏感型
的飞机草进行热处理后,GR酶活性明显增加但是
在低温胁迫下并没有增加;并且有研究表明,叶绿体
GR 基因会被高温所抑制(Romero-Puertas et al.,
2006)。这些结果说明,GR 对逆境胁迫的响应与物
种、逆境种类以及GR 类型等有关,而对于GR 基因
在高温及其他胁迫下的表达模式及GR酶在逆境下
的作用机制,不同类型的GR 是否存在着对逆境胁
迫的专一性等问题,有待进一步研究。
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(下转第35页Continue on page 35)
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分蒸腾的重要结构,与光合作用和蒸腾作用直接相
关。本研究对厚壁毛竹与毛竹叶的气孔密度及其轴
向长度进行观察,发现厚壁毛竹的气孔轴向长度略
大于毛竹,但气孔密度显著低于毛竹。气孔大小对
于叶片光合作用及蒸腾作用的影响在一定程度上大
于气孔的密度。竹类植物叶解剖结构变化对竿壁物
质形成积累的影响值得深入研究,为此才能为揭示
厚壁形成的机理提供理论依据。
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