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Cloning and expression of the GGPP synthase gene from the paclitaxel-producing endophytic fungus (Penicillium aurantiogriseum)in Corylus avellana

榛子产紫杉醇内生真菌Penicillium aurantiogriseum中GGPP合酶基因的克隆与表达



全 文 :  Guihaia  Apr. 2016ꎬ 36(4):456-461
http: / / journal.gxzw.gxib.cn
http: / / www.guihaia-journal.com
DOI: 10.11931 / guihaia.gxzw201410011
刘洪伟ꎬ杨艳芳ꎬ李艳艳ꎬ等. 榛子产紫杉醇内生真菌 Penicillium aurantiogriseum中 GGPP 合酶基因的克隆与表达[J] . 广西植物ꎬ 2016ꎬ 36(4):
456-461
LIU HWꎬYANG YFꎬLI YYꎬet al. Cloning and expression of the GGPP synthase gene from the paclitaxel ̄producing endophytic fungus (Penicillium auran ̄
tiogriseum) in Corylus avellana[J] . Guihaiaꎬ 2016ꎬ 36(4):456-461
榛子产紫杉醇内生真菌 Penicillium aurantiogriseum
中 GGPP合酶基因的克隆与表达
刘洪伟ꎬ 杨艳芳ꎬ 李艳艳ꎬ 王  帅ꎬ 邱德有∗
( 林木遗传育种国家重点实验室ꎬ 中国林业科学研究院林业研究所ꎬ 北京 100091 )
摘  要: 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶是产紫杉醇内生真菌紫杉醇合成下游途径中的关键步骤之一ꎬ在榛子
产紫杉醇内生真菌中进行紫杉醇生物合成研究时首先要确认 GGPP 合酶的存在ꎮ 该研究通过 RT-PCR 方法
克隆得到了榛子产紫杉醇内生真菌 Penicillium aurantiogriseum中 GGPP 合酶基因 PaGGPPS (GenBank 登录号
为 KM881430)的 cDNA 开放阅读框 (Open reading frameꎬ ORF)ꎮ 利用生物信息学方法ꎬ我们分析了该基因的
序列ꎬ并对其编码的氨基酸序列进行了预测ꎮ 结果发现该基因 ORF长度为 1 113 bpꎬ预计蛋白分子量为 40.98
kDꎬ等电点为 6.168ꎬ 表明该蛋白呈酸性ꎮ 对其进行亲疏水性分析发现肽链整体呈现为亲水性ꎮ PaGGPPS 的
主要二级结构元件为 α-螺旋ꎬ并且包含一个异戊二烯类化合物合酶功能域ꎮ 对榛子产紫杉醇内生真菌与其
他物种的 GGPPS进行氨基酸同源性分析ꎬ发现其与娄地青霉、曲霉菌和费氏新萨托菌的一致性较高ꎬ分别为
94%、76%和 76%ꎮ 进化树分析表明来自动物、真菌和酵母的 GGPPS聚为一类ꎬ来自植物的 GGPPS聚为一类ꎬ
其中榛子产紫杉醇内生真菌的 GGPPS和青霉菌的进化关系最近ꎬ与植物的 GGPPS的进化关系最远ꎮ 对其进
行基础生物信息学分析后ꎬ我们构建了原核表达载体ꎬ成功诱导其表达并得到可溶性蛋白ꎮ 该研究结果为下
一步深入研究 GGPPS基因在内生真菌 Penicillium aurantiogriseum紫杉醇合成途径中的作用及和构建高产紫杉
醇基因工程菌株奠定了一定的基础ꎮ
关键词: 内生真菌ꎬ GGPP 合酶ꎬ 原核表达ꎬ 基因克隆ꎬ 紫杉醇
中图分类号: Q943.2    文献标识码: A    文章编号: 1000 ̄3142(2016)04 ̄0456 ̄06
Cloning and expression of the GGPP synthase gene
from the paclitaxel ̄producing endophytic fungus
(Penicillium aurantiogriseum) in Corylus avellana
LIU Hong ̄Weiꎬ YANG Yan ̄Fangꎬ LI Yan ̄Yanꎬ WANG Shuaiꎬ QIU De ̄You∗
( State Key Laboratory of Tree Genetics and Breedingꎬ Research Institute of Forestryꎬ
Chinese Academy of Forestryꎬ Beijing 100091ꎬ China )
Abstract: Geranylgeranyl diphosphate synthase is one of the key enzymes in taxol synthesis pathway in paclitaxel ̄produ ̄
cing endophytic fungus. To study taxol synthesis in paclitaxel ̄producing endophytic fungusꎬ we need to identify the exist ̄
ence of GGPP synthase in the first place. With RT ̄PCR methodꎬ we cloned the ORF fragment of PaGGPPS (GenBank
收稿日期: 2014 ̄10 ̄09    修回日期: 2014 ̄12 ̄03
基金项目: 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(RIF2014 ̄01ꎬCAFYBB2012 ̄042)[Supported by the Basic Research Fund for Non ̄profit Re ̄
search Institutes at the Central Levels(RIF2014 ̄01ꎬCAFYBB2012 ̄042)]ꎮ
作者简介: 刘洪伟(1987 ̄ )ꎬ男ꎬ山东日照人ꎬ在读博士ꎬ主要从事紫杉醇相关分子生物学方面的研究ꎬ(E ̄mail)lhwei1987@ 126.comꎮ
∗通讯作者: 邱德有ꎬ博士ꎬ研究员ꎬ主要从事次生代谢方面的研究ꎬ(E ̄mail)qiudy@ caf.ac.cnꎮ
accession number: KM881430) from the paclitaxel ̄producing endophytic fungus Penicillium aurantiogriseum in Corylus
avellana. The bioinformatics methods were employed to analyze and predict the composition of nucleic acid and amino
acid sequence of this gene. The results showed that the length of ORF was 1 113 bpꎬ the molecular weight of the protein
was 40.98 kDꎬ and the theoretical isoelectric point was 6.168ꎬ which suggested that PaGGPPS protein was acidic. The
hydrophilicity analysis found that PaGGPPS was a hydrophilic protien. The α ̄helix was the dominant secondary structure
constructional element of the protein which contained one tpolyprenyl_synt function domain. The identity alignment of
GGPPS nucleic acid sequences of taxol producing endophytic fungi in hazelnut and other species showed that the identity
were highest between Penicillium roquefortiꎬ Aspergillus clavatus and Neosartorya fischeriꎬ respectively 94%ꎬ 76% and
76%. The homologous alignment of Amino acids showed that GGPPS genes were divided into two groups. The GGPPS
genes from animalꎬ fungal and yeast were clustered in one groupꎬ the GGPPS genes from plant were in the other
group. The homologous alignment of nucleic acid sequences showed that the homologous were the highest between GG ̄
PPSs in paclitaxel ̄producing endophytic fungus (Penicillium aurantiogriseum) in Corylus avellana and in Penicillium ro ̄
quefortiꎬ and GGPPSs in paclitaxel ̄producing endophytic fungus and plant have the longest distance in the phylogenetic
tree. After the bioinformatics analysisꎬ we constructed a pET30a prokaryotic expression vector of PaGGPPS. The protein
of PaGGPPS was successfully expressed in the soluble state in Escherichia coli. All the experiments we had done can pro ̄
vide some information for the further research.
Key words: endophytic fungus ( Penicillium aurantiogriseum )ꎬ GGPP synthaseꎬ prokaryotic expressionꎬ gene
cloningꎬ taxol
    紫杉醇是 Wall(1971)从短叶红豆杉(Taxus bre ̄
vifolia)中分离到的二萜ꎬ它对乳腺癌等多重癌症具
显著疗效ꎬ已被广泛应用在临床上 ( Craag et alꎬ
1993)ꎮ 红豆杉生长缓慢ꎬ资源有限ꎬ紫杉醇含量低
(占树皮干重的 0.01%~0.02%)ꎬ所以资源与开发的
矛盾相当突出ꎮ Strobel et al(1993)从短叶红豆杉分
离到产紫杉醇的内生真菌 Taxomyces andreanaeꎬ并
证明它能合成纳克级的紫杉醇ꎮ 此后ꎬ人们陆续从
西藏红豆杉、东北红豆杉等红豆杉中分离到产紫杉
醇内生真菌 ( Metz et alꎬ 2000ꎻ Kumaran & Hurꎬ
2009ꎻSreekanth et alꎬ 2009ꎻLiu et alꎬ 2009ꎻZhang et
alꎬ 2009)ꎬ也有从内生真菌中发现其他抗癌物质
(李良群等ꎬ 2011)ꎮ 还有从松树 Wollemia nobilis
(Strobel et alꎬ 1997)、榛子 Corylus avellana(Hoffman
et alꎬ 1998)、落羽杉 Taxodium distichum( Li et alꎬ
1996)、罗汉松 Podocarpus forrestii(孙端方等ꎬ2008)、
香橼 Citrus medica(Kumaran et alꎬ 2008)等植物中分
离到产紫杉醇内生真菌ꎮ 它们分属青霉属(Penicil ̄
lium)、镰刀菌属(Fusarium)、拟盘多毛孢属(Pestalo ̄
tiopsis)、树状多节孢(Noduzisporium)、链格孢菌(Al ̄
ternaria)、曲霉属(Aspergillus)、黑孢霉属(Periconia
sp.)、茎点霉属(Phomopsis)、瘤座菌属(Tubercularia
sp.)等ꎮ 这些产紫杉醇内生真菌的发现为紫杉醇的
生产又提供了一条途径ꎮ 在多种紫杉醇生产途径
中ꎬ最佳的选择是进行植物细胞和内生真菌大规模
培养ꎬ但至今植物细胞中紫杉醇产量不高且不稳定
(Tabataꎬ 2004ꎻPan et alꎬ 2000)ꎮ 与红豆杉培养细
胞相比ꎬ内生真菌大规模培养的优势更为明显ꎬ但内
生真菌紫杉醇产量还不高ꎬ仍需从优化发酵条件和
改造紫杉醇合成通路等方面进一步提高(康冀川
等ꎬ2013)ꎮ
红豆杉细胞紫杉醇生物合成基因已有报道
(Walker & Croteauꎬ 2001)ꎮ 从 FPP 和 IPP 开始到
紫杉醇是由 20 个蛋白所催化完成ꎬ通路第一步在
GGPP 合酶催化下完成ꎮ GGPP 合酶即牻牛儿基牻
牛儿基焦磷酸合酶 ( Geranylgeranyl pyrophosphate
synthaseꎬ geranylgeranyl diphosphate synthaseꎬ
GGPPS )ꎬ又称香叶基香叶基焦磷酸合酶(化文平
等ꎬ2014)ꎮ 它的主要功能为催化 3分子异戊烯基焦
磷酸 (Isopentenyl diphosphateꎬ IPP ) 和 1分子法尼
基焦磷酸(Farnesyl diphosphateꎬ FPP )缩合生成 20
碳的牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸(Geranylgeranyl pyro ̄
phosphateꎬ GGPP )ꎬ可以为赤霉素类、二萜类等物
质骨架结构的合成提供起始前体物(Kojima et alꎬ
2000)ꎮ 目前已在多个物种中开展了该基因的克隆
和功能分析(化文平等ꎬ2014ꎻ王歆等ꎬ2012)ꎮ 与红
豆杉相比ꎬ内生真菌紫杉醇生物合成的研究还很少ꎮ
在内生真菌中ꎬGGPP 合酶作为紫杉醇合成途径下
游的第一个酶ꎬ有必要最先鉴定阐明ꎮ 本研究以从
榛子中分离到的产紫杉醇内生真菌 Penicillium au ̄
7544期    刘洪伟等:榛子产紫杉醇内生真菌 Penicillium aurantiogriseum中 GGPP合酶基因的克隆与表达
rantiogriseum为材料ꎬ在对其基因组测序 (Yang et
alꎬ 2014)得到的数据基础上ꎬ展开了该内生真菌
GGPPS基因 cDNA 的克隆、原核表达及纯化的研
究ꎬ为下一步深入研究该内生真菌 GGPPS 基因的作
用和构建高产紫杉醇基因工程菌株提供了基础ꎮ
1  材料与方法
1.1 材料
内生 真 菌 Penicillium aurantiogriseum NRRL
62431是由 Angela Hoffman 教授从美国俄勒冈州的
奥罗拉市的榛子(Corylus avellana)中分离得到并赠
送的ꎮ 克隆载体 pUC ̄19ꎬ及大肠杆菌 DH5α 和
BL21(DE3)plysS 均是从康为世纪购得ꎮ 表达载体
pET30a是由山东省果树研究所院陈新老师赠送ꎮ
1.2 真菌 RNA的提取
在 PDA培养基平板上接种真菌菌种ꎬ1 周后从
平板上挑菌接种到 200 mL PDA 液体培养基中ꎬ并
在 28 ℃摇床中 200 r􀅰min ̄1培养 3 dꎬ8 000 × g离心
收集菌丝ꎬ液氮保存ꎮ
使用天恩泽公司的真菌 RNAout 试剂盒ꎬ并按
照其说明书步骤提取真菌总 RNAꎮ 然后使用
TAKARA 公司的 PrimeScriptTM II 1st Strand cDNA
Synthesis Kit按照其说明书进行 cDNA合成ꎮ
1.3 基因全长克隆与序列分析
通过对真菌基因组(Yang et alꎬ2014)进行分
析ꎬ比对找到 GGPPS基因的 DNA序列ꎬ通过和其他
GGPPS序列进行比较找出其 ORFꎬ并设计上游引物
PaGGPPS1 ̄1:ATGAATTCAAACCCCTTTCAACꎬ和下
游 引 物 PaGGPPS2 ̄1: CTAGTGCGCATTGGAATC ̄
CGACꎬ交由中美泰和公司合成ꎮ 使用 KAPA 公司
的 HIFI 热启动高保真酶进行扩增ꎬPCR 条件如下:
95 ℃预变性 3 minꎻ 98 ℃ 20 sꎬ65 ℃ 15 sꎬ 72 ℃
1 minꎬ共 32 个循环ꎻ 72 ℃ 10 minꎮ
将 PCR得到的片段进行胶回收ꎬ然后连接到
pUC ̄19 克隆载体上送到中美泰和公司进行测序验
证ꎮ 利用 EditSeq 软件对序列进行初步分析ꎬ之后
使用在线分析软件 ProtScale ( http: / / www. expasy.
ch / tools / protscale. html ) 和 SMART ( http: / / smart.
embl ̄heidelberg.de / smart / set_mode.cgi? GENOMIC =
1)和 SOPMA(http: / / npsa ̄pbil.ibcp.fr / cgi ̄bin / npsa_
automat. pl? page / NPSA / npsa_sopma. html)对序列
进行进一步分析ꎮ
1.4 同源性分析和系统进化树的构建
使用 NCBI 的 blastx 对 PaGGPPS 进行比对ꎬ找
出同源性高的序列ꎮ 用 GenBank数据库进行 PaGG ̄
PPS氨基酸序列搜索ꎬ找到斑马鱼(Danio rerioꎬ NP_
956329. 1 )、 果 蝇 ( Drosophila melanogasterꎬ NP _
523958.2)、小鼠(Mus musculusꎬ NP_034412.1)、人类
(Homo sapiensꎬ NP_001032354.1)、乳酸克鲁维酵母
(Kluyveromyces lactisꎬ XP_455003.1)、酿酒酵母(Sac ̄
charomyces cerevisiaeꎬ NP _ 015256. 1 )、 棉 病 囊 菌
(Ashbya gossypiiꎬ NP_984623.1)、稻瘟病菌(Magna ̄
porthe oryzaeꎬ XP_003718242.1)、脉孢菌(Neurospora
crassaꎬ XP_960695.2)、青霉菌(Penicillium roquefortiꎬ
CDM28596.1)、玉米(Zea maysꎬ ABQ85646.1)、拟南芥
(Arabidopsis lyrataꎬ XP_002884145.1)、曼地亚红豆杉
(Taxus×mediaꎬ AAS67008.1)和银杏(Ginkgo bilobaꎬ
AAQ72786.1)14 个物种的 GGPPS 的氨基酸序列ꎬ使
用软件 ClustalX和 MEGA4.1对这 15个 GGPPS 进行
多序列比对并构建分子进化树ꎮ
1.5 表达引物的设计和载体构建
使用软件 Primer 5分析克隆到的 GGPPS基因序
列的以及原核表达载体 pET30a 的酶切位点ꎬ分别选
用 Kpn I和 Not I 两个酶切位点(下划线处标出)ꎬ并
设计引物ꎬ上游引物为 G ̄ pET  ̄1 ̄1:CGGGGTACCAT ̄
GAATTCAAACCCCTTTCAACꎻ下游引物为G ̄pET ̄2 ̄1:
TTGCGGCCGCCTAGTGCGCATTGGAATCCGACꎮ
以含有 GGPPS 的 pUC ̄19 质粒为模板ꎬ使用
KAPA公司的 HIFI 热启动高保真酶进行 PCR 扩
增ꎬPCR条件如下:95 ℃预变性 3 minꎻ 98 ℃ 20 sꎬ
65 ℃ 15 sꎬ 72 ℃ 1 minꎬ共 5 个循环ꎻ98 ℃ 20 sꎬ68
℃ 15 sꎬ 72 ℃ 1 minꎬ共 28个循环ꎻ 72 ℃ 10 minꎮ
将得到的 PCR 产物(用 Axygen 公司的 PCR 产
物回收试剂盒进行回收)ꎬ和表达载体分别使用
NEB公司的酶进行 Kpn I和 Not I双酶切ꎮ 酶切 2 h
后进行纯化ꎬ并用 NEB 的 T4 DNA 连接酶 16 ℃连
接 6 hꎮ 转化大肠杆菌 DH5αꎬ倒置 37 ℃过夜培养ꎬ
菌落 PCR筛选阳性菌株ꎮ 将阳性菌株送中美泰和
公司测序验证ꎬ并将阳性菌株扩大培养ꎬ使用
Axygen质粒小提试剂盒提取质粒ꎬ进行双酶切
鉴定ꎮ
1.6 重组蛋白的原核表达
将酶切鉴定的重组质粒转化到大肠杆菌 BL21
(DE3) plysS 菌株ꎮ 筛选出阳性菌株进行扩大培
养ꎬ并保存部分菌株ꎮ
854 广  西  植  物                                  36卷
取新鲜菌液 1 mL 到 50 mL LB 液体培养基中ꎬ
37 ℃摇床在 200 r􀅰min ̄1下培养 3 h 至菌液 OD 为
0.5~0.6时ꎬ再调至 20 ℃继续培养 1 hꎮ 向菌液中
加 IPTG至终浓度为 0.2 mmol􀅰L ̄1ꎬ进行诱导表达ꎬ
继续在 20 ℃培养 8 hꎮ 收集菌液ꎬ4 000×g 离心 10
min 收集菌体ꎮ 加入 5 mL 康为世纪公司的细菌蛋
白提取试剂ꎬ充分混匀后 500 W 超声 2 min 裂解细
菌ꎬ直至菌液清亮ꎮ 12 000×g离心 10 minꎬ收集上清
并进行 SDS ̄PAGE电泳ꎬ鉴定蛋白表达是否可溶ꎮ
1.7 重组蛋白的纯化
使用康为世纪公司的 Ni ̄Agarose His 标签蛋白
纯化试剂盒(可溶型蛋白)进行重组蛋白的纯化ꎬ主
要步骤按照其说明书进行ꎬ在清洗杂蛋白过程中ꎬ添
加一次 10柱体积的 50 mmol􀅰L ̄1咪唑洗脱一次ꎬ后
续步骤和说明书相同ꎮ 最后将纯化的蛋白进行
SDS ̄PAGE电泳进行鉴定ꎮ
2  结果与分析
2.1 PaGGPPS基因的克隆和序列分析
以真菌的 cDNA 为模版ꎬ通过 PCR 得到一段
1 113 bp的 ORF片段(图 1)ꎬ并将该片段提交 Gen ̄
Bankꎬ得到登录号:KM881430ꎮ 命名该基因为 PaG ̄
GPPSꎮ
用 EditSeq软件分析发现 ORF可编码 370 个氨
基酸ꎬ预计表达蛋白分子量约为 40.98 kDꎬ预测蛋白
等电点为 6.168ꎮ 使用在线预测软件 ProtScal (Kyce
& Doolittleꎬ 1982)ꎬ设定参数为默认ꎬ分析该蛋白的
亲疏水性ꎬ预测结果显示其整体为亲水性蛋白ꎮ 用
结构域预测工具 SMART (Schultz et alꎬ 1998)对其
氨基酸序列分析发现ꎬ该基因包含类异戊二烯类化
合物合酶特有的一个 polyprenyl_synt 特征结构域ꎮ
用在线软件 SOPMA (Geourjon & Deléageꎬ 1995)进
行二级结构预测ꎬ结果显示该 GGPPS蛋白由 185 个
氨基酸组成的 20个 α ̄ 螺旋ꎬ23 个氨基酸组成的 8
延伸链ꎬ18个氨基酸组成的 10 个 β ̄转角和 144 个
氨基酸组成的 20 个随意卷曲构成ꎬ它们分别占
50%、6.22%、4.86%和 38.92%ꎮ
2.2 同源性及系统演化分析
通过 NCBI的 blastx对 PaGGPPS氨基酸序列在
NCBI上进行同源性比对ꎬ 结果表明榛子内生真菌
的 PaGGPPS氨基酸序列与娄地青霉(Penicillium ro ̄
queforti)、曲霉菌(Aspergillus clavatus)、费氏新萨托
图 1  榛子内生真菌 Penicillium aurantiogriseum
NRRL 62431 GGPPS基因的 PCR电泳图 
M. DL 5 000 分子标记ꎻ 1. PCR产物ꎮ 下同ꎮ
Fig. 1  Agarose gel electrophoresis analysis of PaGGPPS gene
fragment in Penicillium aurantiogriseum NRRL 62431
M. DL 5 000 Markerꎻ 1. PCR product. The same below.
菌 ( Neosartorya fischeri)、丝衣霉菌 ( Byssochlamys
spectabilis)、黄丝曲霉菌(Talaromyces stipitatus)、副
球孢子菌(Paracoccidioides)、夹膜组织胞浆菌(Ajel ̄
lomyces capsulatus)、巴西芽生菌 ( Paracoccidioides
brasiliensis)和球孢子菌(Coccidioides immitis)等菌的
GGPPS氨基酸序列有较高的同源性ꎬ 分别为 94%、
76%、76%、76%、71%、71%、71%、71%、70%ꎮ 我们
从 NCBI上下载了一些物种的 GGPPSꎬ并用 ClustalX
(Thompson et alꎬ1997) 和 MEGA 4.1 (Tamura et alꎬ
2007) 对榛子内生真菌的和下载的 PaGGPPS 氨基
酸序列进行多序列比对ꎬ 构建系统进化树ꎬ采用 de ̄
fault 参数ꎬ 自检举 1 000 次ꎬ 结果如图 2 所示ꎮ 从
进化树中可以看出ꎬ榛子内生真菌的 GGPPS和青霉
菌的进化关系最近ꎻ几种真菌的 GGPPS 和动物的
GGPPS的进化关系比酵母的更近ꎬ而与几种植物的
GGPPS的进化关系最远ꎮ
2.3 表达载体 pET ̄30a ̄PaGGPPS的构建及鉴定
将转化 pET ̄30a ̄PaGGPPS 表达载体的菌株进
行 PCR 鉴定ꎬ鉴定结果为阳性ꎮ 比对测序结果表
明ꎬPaGGPPS 基因片段已成功连接到表达载体ꎮ
Kpn I和 Not I双酶切鉴定重组质粒ꎬ重组质粒可以
成功切出一个 1 100 bp左右的插入片段和一个大于
5 000 bp的载体片段ꎬ如图 3所示ꎮ
2.4 重组蛋白的可溶性鉴定
重组菌株在 20 ℃经 0.2 mmol􀅰L ̄1 IPTG 诱导
9544期    刘洪伟等:榛子产紫杉醇内生真菌 Penicillium aurantiogriseum中 GGPP合酶基因的克隆与表达
图 2  GGPPS蛋白系统进化分析 
Fig. 2  Phylogenetic analysis of GGPPS proteins 
图 3  重组质粒 pET ̄30a ̄PaGGPPS的双酶切鉴定
Fig. 3  Double digested identification of recombinant
plasmid pET ̄30a ̄PaGGPPS
表达 8 h 后ꎬ收集菌体并裂解ꎬ上清液进行 SDS ̄
PAGE电泳验证ꎬ结果发现重组蛋白在 51 kD 左右
得到表达ꎬ并得到了良好的可溶性表达ꎬ如图 4
所示ꎮ
2.5 重组蛋白纯化结果
经试剂盒纯化后ꎬ得到了较高纯度的重组
GGPPS蛋白ꎮ 经 SDS ̄PAGE检测显示ꎬ重组 GGPPS
蛋白纯化的效果良好ꎬ得到较高浓度的单一条带ꎬ如
图 5所示ꎮ
3  讨论
目前已从不同的宿主植物中分离出了大量的产
图 4  PaGGPPS 在大肠杆菌中表达 
M. 蛋白分子量标准ꎻ 1. PaGGPPS重组菌裂解后上清ꎻ
2. PaGGPPS 重组菌裂解后沉淀ꎮ
Fig. 4  PaGGPPS express in Escherichia coli 
M. Protein Marker standardꎻ 1. Products of recombinant bacteria
of PaGGPPS protein in supernatantꎻ 2. Products of recombinant
bacteria of PaGGPPS protein in precipitate.
图 5  重组 PaGGPPS 蛋白纯化产物
Fig. 5  Purification product of PaGGPPS recombine protein
紫杉醇的内生真菌(马玉超等ꎬ2003)ꎬ但对这些内
生真菌的紫杉醇合成通路研究并不多见ꎮ GGPP 是
二萜类化合物合成的前体物质ꎬ而 GGPPS 催化 IPP
和 FPP 缩合成 GGPPꎬ是 GGPP 合成途径中的关键
酶ꎬ在植物次生代谢中ꎬ处于代谢分支点前体的代谢
方向受其调控 ( Croteauꎬ 1998 )ꎮ Aharoni et al
(2003)和 Han et al(2006)通过在拟南芥细胞中过
表达 GGPPS发现ꎬ拟南芥细胞中 GGPP 的量制约着
萜类在其细胞内的合成ꎬ GGPP 合成所需要的
GGPPS在初级水平上对二萜类化合物的合成起着
调节作用ꎮ 因此ꎬ要提高内生真菌生产紫杉醇的能
力ꎬ在合成通路上ꎬ最先需要研究 GGPPSꎮ 本研究
的 GGPPS和青霉菌的进化关系最近ꎬ与其他真菌的
064 广  西  植  物                                  36卷
进化关系也很近ꎬ可能是真菌类的 GGPPS进化很保
守ꎻ而与植物和动物的 GGPPS 分别属于不同的亚
类ꎬ可以初步判断真菌和植物之间没有 GGPPS 基因
的水平基因转移ꎬ植物和真菌的萜类合酶是否也是
不同进化来源? 榛子(或红豆杉)与其内生真菌的
紫杉烷类化合物的合成能力是否分别进化得到? 这
些都为后续需要研究的问题ꎮ
本研究完整克隆出内生真菌 Penicillium auran ̄
tiogriseum NRRL 62431 的 GGPPS 基因的完整 ORF
序列ꎬ并用生物信息学预测和分析了 PaGGPPS的氨
基酸序列、理化性质、疏水性 /亲水性、功能结构域和
二级结构ꎬ这为后面的原核表达提供了一定的理论
参考依据ꎮ 通过预测ꎬPaGGPPS 蛋白的等电点为
6.168ꎬ在进行原核表达时ꎬ调节培养基的 pH值使其
和重组蛋白的等电点不同ꎬ从而可以增加表达的重
组蛋白的可溶性ꎮ 成功构建原核表达载体后ꎬ转化
大肠杆菌进行诱导表达ꎬ通过低温诱导ꎬ成功表达出
可溶性的蛋白ꎬ并通过试剂盒进行了纯化ꎮ 这些工
作都为下一步深入研究该内生真菌的紫杉醇合成途
径中此基因的作用和构建高产紫杉醇基因工程菌株
提供了一定的基础ꎮ
参考文献:
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1644期    刘洪伟等:榛子产紫杉醇内生真菌 Penicillium aurantiogriseum中 GGPP合酶基因的克隆与表达