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葛枣猕猴桃叶片蛋白质双向电泳体系的研究



全 文 :葛枣猕猴桃叶片蛋白质双向电泳体系的研究
许培磊,秦红艳,刘迎雪,王振兴,范书田,杨义明,艾 军* (中国农业科学院特产研究所,吉林长春 130112)
摘要 [目的]建立葛枣猕猴桃叶片蛋白质双向电泳体系。[方法]通过对不同的蛋白质提取方法、裂解液配方及 IPG胶条的探索,建
立适应于葛枣猕猴桃叶片双向电泳技术体系。[结果]TCA/丙酮法 +配制裂解液较适用于葛枣猕猴桃叶片蛋白质组分析。最终可获
得蛋白质点丰富、分辨率高的双向电泳图谱,可以检测出 450个清晰的蛋白质点。[结论]该研究为在蛋白质组水平揭示叶片颜色变化
的调控机制奠定基础。
关键词 葛枣猕猴桃;叶片;蛋白质提取;双向电泳
中图分类号 S663. 4 文献标识码 A 文章编号 0517 -6611(2014)22 -07307 -03
Study of Two-dimensional Electrophoresis Platform for Actinidia polygama Leaf Proteomic
XU Pei-lei,AI Jun et al (Institute of Special Wild Economic Animal and Plant Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences,
Changchun,Jilin 130112)
Abstract [Objective]The aim was to establish the two-dimensional electrophoresis platform of Actinidia polygama leaf. [Method]Different
protein extraction method,cracking fluid formulation and length of the gel strips were tested. [Result]The result showed that the manual con-
fect cracking fluid formulation was suitable for the leaf protein dissolution than the sequential extraction kit. 450 protein spots were detected
and the high-resolution two-dimensional electrophoresis map was got. [Conclusion]The study laid foundation for revealing regulatory mecha-
nism of leaf color changes in proteomics level.
Key words Actinidia Polygama;Leaf;Protein extraction;Two-dimensional gel electrophoresis
基金项目 公益性行业(农业)科研专项(20110337);吉林省科技发展
计划项目(20140204034NY)。
作者简介 许培磊(1984 -),女,吉林扶余人,助理研究员,硕士,从事
野生果树蛋白质组分析。* 通讯作者,研究员,博士,从事
野生果树资源收集、评价与利用研究。
收稿日期 2014-06-27
葛枣猕猴桃[Actinidia polygama (Sieb. et Zucc.)Max-
im]系猕猴桃科猕猴桃属多年生藤本植物,其果实多汁,酸甜
适口,风味独特,主要含有多糖、有机酸、氨基酸、黄酮、多种
维生素等,还含有较丰富的超氧化物歧化酶[1],主要分布于
我国东北、华北,朝鲜、日本及苏联远东地区[2]。葛枣醇具有
较高的药用价值[3],在韩国一直用作治疗风湿性关节炎的民
间药物[4]。
目前,研究者对葛枣猕猴桃的研究多集中在有效化学成
分研究、无性繁殖技术、杂交育种研究、采后生理及产品开发
研究等[5 -8],尚未见关于葛枣猕猴桃彩叶机理的研究。在其
他植物上,研究者通过色素组成、叶绿体和细胞核等方面对
叶片出现异色的番茄、玉米、小麦等进行了研究[9 -11],结果发
现,异色叶组织的叶肉细胞出现了差异[12],超微结构显示,
红檵木叶片由红色变为红绿再变为绿色的过程中叶绿体、基
粒及淀粉均发生了变化[13]。研究者对于叶色变化机制的研
究往往集中在生理生态学上,蛋白质组学应用于分析葛枣猕
猴桃叶色变化机制的研究尚未见报道。笔者以葛枣猕猴桃
不同颜色部分为试验材料,通过对不同蛋白质提取方法、裂
解液配方及 IPG胶条的探索,建立适应于葛枣猕猴桃叶片双
向电泳技术体系,旨在为蛋白质组水平揭示叶片颜色变化的
调控机制奠定基础。
1 材料与方法
1. 1 材料 试验材料采自中国农业科学院特产研究所猕
猴桃圃,于 6月下旬采集部分变为白色的叶片,分别切取白
色与绿色部分,去除主叶脉,作为白色叶片样品与绿色叶片
样品,速冻于液氮中带回实验室,保存在 -80 ℃冰箱中待用。
1. 2 主要试剂 IPG 胶条、SDS、N,N’-甲叉双丙烯酰胺、
TEMED、AP、DTT、TBP、PMSF、载体两性电解质(bio - lyte)、
CHAPS、β -巯基乙醇、矿物油 、低熔点琼脂糖、尿素等试剂、
顺序提取试剂盒购自美国 Bio - Rad 公司。碘乙酰胺、硫脲
购自 Sigma公司。PVPP、丙烯酰胺为进口分装。抗坏血酸、甘
氨酸、三氯乙酸、蔗糖、Tris - base、苯酚、EDTA 以及其他常用
试剂均为分析纯。所用水均为 MilliQ 水。
1. 3 主要仪器 分光光度计,PROTEAN IEF Cell 等电聚焦
系统,Mini-PROTEAN 3 和 PROTEANⅡxi Cell 垂直电泳系统,
PDQuest 凝胶图像分析软件均购自美国 Bio - Rad 公司。
PowerLook 2100XL 扫描仪购自美国 UMAX 公司。
1. 4 葛枣猕猴桃叶片蛋白质提取方法
1. 4. 1 酚提取法。称取 1 g 叶片迅速液氮研磨,加 0. 1 g
PVPP继续研磨成细粉,向研钵中加入 10 ml 酚提取液(0. 7
mol /L蔗糖,100 mmol /L KCl,50 mmol /L EDTA,50 mmol /L
抗坏血酸,1%PMSF和 2%巯基乙醇 ),化冻后继续研磨成均
浆,转移到 50 ml离心管中,冰上振荡 10 min,加入 10 ml Tris
-饱和酚,冰上振荡 25 min,静置 5 min后,9 500 r /min、4 ℃
离心 30 min。取上清加入等体积的酚提取液,冰上振荡 25
min,静置 5 min后,9 500 r /min、4 ℃离心 30 min,此步骤重复
3次后取上清加入 5倍体积的预冷乙酸铵甲醇溶液,- 20 ℃
过夜。离心后弃上清,沉淀用 10 ml 冷甲醇洗 4 遍,后用 10
ml冷丙酮洗 4遍,在 -20 ℃挥干备用。
1. 4. 2 TCA/丙酮法。称取 1 g叶片迅速液氮研磨,加 0. 1 g
PVPP继续研磨成细粉,向研钵中加入 10 ml 含 0. 07%巯基乙
醇的 10%TCA冷丙酮溶液继续研磨成匀浆,-20 ℃放置 2 h,
期间振荡数次,9 500 r /min、4 ℃离心30 min,弃上清,悬浮于10
ml含 0. 07%巯基乙醇的冷丙酮中,-20 ℃放置 1 h,期间振荡
数次,9 500 r /min、4 ℃离心30 min,重复悬浮步骤4次,-20 ℃
安徽农业科学,Journal of Anhui Agri. Sci. 2014,42(22):7307 - 7309,7350 责任编辑 李占东 责任校对 况玲玲
DOI:10.13989/j.cnki.0517-6611.2014.22.002
过夜。离心后弃上清,悬浮于 80%冷丙酮中,-20 ℃放置 1 h,
9 500 r /min、4 ℃离心 30 min,沉淀挥干备用。
1. 5 蛋白质裂解方法
1. 5. 1 顺序提取试剂盒。称取 0. 1 g蛋白质粉末于 1. 5 ml
离心管中,加入 100 μl 提取液Ⅰ,搅匀,振荡 10 min后 13 000
r /min、10 ℃离心10 min,上清即为提取液Ⅰ。向第1步沉淀中
加入 100 μl提取液Ⅱ,搅匀,振荡 10 min,13 000 r /min、10 ℃
离心10 min,上清即为提取液Ⅱ。向第2步沉淀中加入100 μl
提取液Ⅲ,搅匀,振荡 10 min,13 000 r /min、10 ℃离心 10 min,
上清即为提取液Ⅲ。
1. 5. 2 配制裂解液。称取蛋白质粉末 0. 1 g于 1. 5 ml离心
管中,加入配好的蛋白质裂解液(7 mol /L 尿素,2 mol /L 硫
脲,4%CHAPS,65 mmol /L DTT,0. 2% Biolyte),搅匀,振荡 10
min,13 000 r /min、10 ℃离心 10 min,取上清备用。
1. 6 蛋白质定量方法 参照考马斯亮蓝染料结合法检测
蛋白质浓度。
1. 6. 1 Bradford 储备液。称取 175 g G250 溶解在 50 ml
95%乙醇中,再与 100 ml 88%的磷酸混合。
1. 6. 2 Bradford工作液。将 42. 5 ml水、1. 5 ml 95%乙醇、3
ml 88%磷酸和 3 ml Bradford储备液混合,过滤,室温下保存。
在 10 ml水中溶解 10 mg BSA,分装后保存于 -20 ℃冰箱中。
按表 1配制相应浓度的 BSA溶液,测定时取 20 μl样品加入
1 ml Bradford工作液,摇匀后室温下放置 5 min,A595测定吸
光度值。
表 1 牛血清白蛋白标准溶液配制
浓度∥mg /ml BSA∥mg H2O∥ml
0 0 20
0. 2 4 16
0. 4 8 12
0. 6 12 8
0. 8 16 4
1. 0 20 0
1. 7 聚焦方法
1. 7. 1 IPG 7 cm胶条。蛋白质经过定量之后,取 200 μg,用
水化液稀释到 150 μl,加入到 7 cm聚焦盘中,将胶条胶面朝
下慢慢下压,至胶条完全覆盖在蛋白质溶液中,注意不要产
生气泡。放在聚焦仪上被动聚焦 20 ℃,1 h后加入矿物油,
主动水化 20 ℃,50 μA、11 h后在胶条两极垫滤纸片除盐,同
时将多余的未被胶条吸收的蛋白质溶液擦干净。聚焦程序:
250 V,线性升压,1 h;500 V,快速升压,1 h;4 000 V,线性升
压,4 h;4 000 V,快速,20 000 VH;500 V,快速,任意时间。
1. 7. 2 IPG 11 cm胶条。蛋白质经过定量之后,取 300 μg,
用水化液稀释到 185 μl,加入到 11 cm聚焦盘中,将胶条胶面
朝下慢慢下压,至胶条完全覆盖在蛋白质溶液中,注意不要
产生气泡。放在聚焦仪上被动聚焦 17 ℃,1 h 后加入矿物
油,主动水化 17 ℃,50 μA、11 h 后在胶条两极垫滤纸片除
盐,同时将多余的未被胶条吸收的蛋白质溶液擦干净。聚焦
程序:250 V,线性升压,1 h;1 000 V,快速升压,1 h;8 000 V,
线性升压,4 h;8 000 V,快速,40 000 VH;500 V,快速,任意
时间。
1. 8 平衡与 SDS -PAGE 参照焦竹青等[14]的方法。
1. 9 染色与图像分析 参照焦竹青等[14]的方法。
2 结果与分析
2. 1 葛枣猕猴桃叶片蛋白质提取方法的确立 6月下旬葛
枣猕猴桃叶片已经是植株的功能叶片,相对而言不属于幼嫩
组织,因此,先用酚提取法对叶片的总蛋白质进行提取,并用
顺序提取试剂盒对蛋白质进行裂解,结果见图 1。由图 1 可
知,白、绿2种叶片样品在提取液Ⅰ中存在显著差异条带,说明
葛枣猕猴桃的两色组织在蛋白质水平存在差异。在上样量
相同的情况下,提取液Ⅰ的蛋白质条带最少,说明在葛枣猕猴
桃叶片中,高亲水性蛋白质含量较低。提取液Ⅱ与Ⅲ中溶解
的蛋白质最多,对其进行双向电泳,结果见图 2。由图 2 可
知,在图谱中的横纹和竖纹都较多,蛋白质点分离效果很差。
相对于顺序提取试剂盒的裂解效果,配制裂解液的极性
较强,能够得到浓度更高的蛋白质溶液,结果见图 3,但从
SDS-PAGE的效果来看,条带依然存在弥散。
TCA/丙酮法提取蛋白质的含量较低,结合极性较强的
配制裂解液,结果见图 3,相对于酚提取法较为弥散的条带,
TCA/丙酮法提取蛋白质条带清晰,没有太多的杂质,因此初
步确定 TCA/丙酮法 +配制裂解液较适用于葛枣猕猴桃叶片
蛋白质组分析。
注:1.白色叶片采用酚提取法与顺序试剂盒中的提取液 I;2.绿色
叶片采用酚提取法与顺序试剂盒中的提取液 I;3.白色叶片采
用酚提取法与顺序试剂盒中的提取液 II;4.绿色叶片采用酚提
取法与顺序试剂盒中的提取液 II;5.白色叶片采用酚提取法与
顺序试剂盒中的提取液 III;6.绿色叶片采用酚提取法与顺序
试剂盒中的提取液 III。
图 1 葛枣猕猴桃叶片总蛋白质的 SDS - PAGE
2. 2 不同 IPG胶条对分离效果的影响 在确定 TCA/丙酮
法与配制裂解液抽提蛋白质的方法后,对不同长度的 IPG胶条
进行比较分析,7 cm胶条与 11 cm胶条的双向电泳图谱见图
4。由图 4可知,7 cm胶条的 2D-PAGE上横纹较重,高丰度蛋
白质占很大比例,经 PDQuest 软件分析,图上可分辨出 180 个
蛋白质点。相对于7 cm胶条,11 cm胶条中高丰度蛋白质比例
下降,低丰度蛋白质的含量显著增加,且小分子量蛋白质变得
清晰,经软件分析,图上可分辨出 450个蛋白质点。
8037 安徽农业科学 2014 年
图 2 酚提取法与顺序试剂盒中提取液 II,III的双向电泳图谱
注:1与 2.采用酚提取法与配制裂解液;3 与 4.采用 TCA/丙酮法
与配制裂解液。
图 3 酚提取法与 TCA/丙酮法提取叶片蛋白质的 SDS-PAGE
3 结论与讨论
酚提取法与 TCA -丙酮 TCA/丙酮法是植物组织蛋白质
提取最常用的 2 种方法。酚提取法适用于较复杂的植物组
织,TCA/丙酮法较适用于幼嫩的组织[15],但 2种方法在不同
的植物组织中对蛋白质的提取效果不同,因此在针对一个未
开展过蛋白质组研究的植物而言,2 种提取方法都要进行
尝试。
葛枣猕猴桃叶片中富含酚类、多糖、核酸、微量元素
等[16 -17],严重影响蛋白质提取效果、等电聚焦及双向电泳图
谱的分辨率。样品制备是建立双向电泳技术体系的重要环
节,也是运用差异蛋白质组学手段研究葛枣猕猴桃叶色变化
机理的首要解决问题。研究表明,TCA -丙酮沉淀法能够有
效降低蛋白质样品中盐、糖类、脂类、核酸等杂质对试验的干
扰[18],结合极性较强的配制裂解液,能有效地将葛枣猕猴桃
叶片中的蛋白质提取并裂解。
通过对不同蛋白质提取方法、蛋白质裂解方法及 IPG胶
条长度的摸索,建立适用于葛枣猕猴桃叶片蛋白质的提取方
图 4 不同 IPG胶条长度对蛋白质点分离效果的影响
(下转第 7350页)
903742卷 22期 许培磊等 葛枣猕猴桃叶片蛋白质双向电泳体系的研究
表 4 果实调查测定结果
品种 硬度∥kg /cm2 果皮颜色 果肉颜色 含糖量∥%
红勋 1号 14. 27 深红 红色 13. 47
冰心 1号 13. 27 黄 淡黄 13. 87
红星 4号 14. 77 黄红 淡黄 13. 60
安 1号 12. 93 黄 淡黄 14. 70
红星 7号 14. 60 洋红 淡黄 13. 55
红星 1号 11. 40 条红 淡黄 13. 50
红星 5号 12. 53 全红 淡黄 11. 00
冰心 2号 12. 27 黄色带条红 淡黄 13. 05
红星 2号 13. 43 条红 青白 13. 29
k9 12. 20 条红 青白 12. 80
2 -4 12. 60 条红 青白 12. 30
311 11. 60 条红 青白 12. 70
黄海棠(CK) 10. 80 条红 青白 10. 70
号 >红星 5号 >冰心 2号 >2 -4 > k9 >311 >黄海棠;总酸含
量为红勋 1号 >冰心 1号 >红星 7号 >安 1号 >红星 4号 >
冰心 2号 >红星 1 号 >红星 5 号 >红星 2 号 > k9 > 2 - 4 >
311 >黄海棠。冰心 1号、红星 1号、红星 5号、冰心 2号、k9、
311、黄海棠果形指数是 0. 8 ~ 0. 9,为圆形或近圆形;安 1 号、
红星 2号果形指数是 0. 8 ~ 0. 6,为扁圆形;红勋 1 号、红星 4
号、2 -4果形指数是 0. 9 ~1. 0,为椭圆形或圆锥形;红星 7号
果形指数是 1. 0以上,为长圆形。
3 结论
(1)高酸海棠的 13个佳系具有早实特性,在试点均能完
成萌动、展叶、新梢生长、开花、结果、封顶和落叶等树木生长
的全物候期,且高酸海棠13个佳系各品种之间的物候期差
表 5 果实加工性能对比调查结果
品种
VC
mg /kg
总酸
g /kg
果形指数
可溶性固
形物含量∥%
风味
红勋 1号 56. 6 17. 32 0. 94 13. 5 酸
冰心 1号 40. 4 16. 14 0. 90 14. 0 酸
红星 4号 42. 4 11. 54 0. 92 14. 2 甜酸
安 1号 40. 2 11. 62 0. 74 14. 8 甜酸
红星 7号 36. 0 12. 58 1. 12 12. 2 甜酸
红星 1号 32. 1 9. 76 0. 82 12. 2 甜酸
红星 5号 30. 9 7. 86 0. 83 11. 2 甜酸
冰心 2号 30. 8 10. 49 0. 88 13. 5 酸
红星 2号 31. 0 7. 34 0. 76 13. 3 酸甜
k9 30. 4 6. 95 0. 89 17. 2 香甜
2 -4 30. 7 6. 15 9. 30 11. 3 酸
311 28. 0 6. 07 0. 85 15. 2 香甜
黄海棠(CK) 20. 8 6. 02 0. 86 15. 6 甜酸
异不大。
(2)花芽结果比例红勋 1号和红星 4号表现最高。
(3)单株产量红勋 1号和冰心 1号较其他佳系高。
(4)综合 VC 含量和总酸含量来看,红勋 1 号、红星 4 号
和冰心 1号加工性能较高。
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104 -107.
(上接第 7309页)
法及双向电泳技术体系,即采用 TCA/丙酮法提取,配制裂解
液裂解,11 cm IPG胶条,300 μg 蛋白质上样量,主动水化可
以获得蛋白质点丰富、分辨率高的双向电泳图谱。
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0537 安徽农业科学 2014年