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Research progresses on  methanogenesis pathway  and methanogens in coastal wetlands.

滨海湿地甲烷产生途径和产甲烷菌研究进展


滨海湿地在全球碳循环中起着重要的作用,其甲烷排放量占全球海洋甲烷排放的75%.本文综述了滨海湿地主要甲烷产生途径、产甲烷菌种类及其影响因子.滨海湿地SO42-含量丰富,乙酸发酵和H2/CO2途径产甲烷受抑制,乙酸营养型和氢营养型产甲烷菌丰度较低;而利用甲胺类等“非竞争性”底物的C1甲基化合物歧化途径不受硫酸还原菌竞争底物的限制,兼性营养型产甲烷菌成为产甲烷优势菌.盐度与SO42-含量和植被类型密切相关,影响竞争性电子和产甲烷底物的种类和含量,对甲烷产生途径和产甲烷菌群落结构有重要影响.目前,滨海湿地产甲烷菌群落结构、甲烷产生途径的关键控制因素尚需明确,其对甲烷排放的影响有待进一步研究.

Coastal wetlands contribute about 75% to the global oceanic CH4 emissions, thus play a vital role in global C cycles. In this paper, we provided a perspective on researches on metabolic, phylogenetic, and ecological diversity of the methanogenic archaea and the regulating environmental factors in coastal wetlands. Because of the presence of more favorable electron acceptors such as sulfate, methanogenesis via CO2 reduction and acetate fermentation are limited by availability of substrates, and hydrogenotrophic and acetotrophic methanogens generally express low relative abundance. In contrast, “noncompetitive” substrates such as methanol and methylated compounds have been shown to contribute substantially to methane formation in coastal wetlands, and the facultative methanogens are predominant in those environments. Salinity regulates vegetation zonation and is related to SO42- concentration, by regulating types of methanogenic substrates and contents of competitive electron acceptors, indirectly affects the structure and function of methanogens. Major uncertainties in the current studies include the following: methanogen community structure, the key environmental factors regulating methane pathway, and their effects on methane emissions in coastal wetlands.


全 文 :滨海湿地甲烷产生途径和产甲烷菌研究进展
王  洁1,2  袁俊吉2  刘德燕2  项  剑2  丁维新2  蒋先军1∗
( 1西南大学资源环境学院, 重庆 400716; 2 中国科学院南京土壤研究所, 南京 210008)
摘  要  滨海湿地在全球碳循环中起着重要的作用,其甲烷排放量占全球海洋甲烷排放的
75%.本文综述了滨海湿地主要甲烷产生途径、产甲烷菌种类及其影响因子.滨海湿地 SO4 2
-含
量丰富,乙酸发酵和 H2 / CO2途径产甲烷受抑制,乙酸营养型和氢营养型产甲烷菌丰度较低;
而利用甲胺类等“非竞争性”底物的 C1 甲基化合物歧化途径不受硫酸还原菌竞争底物的限
制,兼性营养型产甲烷菌成为产甲烷优势菌.盐度与 SO4 2
-含量和植被类型密切相关,影响竞
争性电子和产甲烷底物的种类和含量,对甲烷产生途径和产甲烷菌群落结构有重要影响.目
前,滨海湿地产甲烷菌群落结构、甲烷产生途径的关键控制因素尚需明确,其对甲烷排放的影
响有待进一步研究.
关键词  滨海湿地; 硫酸盐; 非竞争性底物; C1化合物歧化; 兼性营养型产甲烷菌
Research progresses on methanogenesis pathway and methanogens in coastal wetlands.
WANG Jie1, 2, YUAN Jun⁃ji2, LIU De⁃yan2, XIANG Jian2, DING Wei⁃xin2, JIANG Xian⁃jun1∗
( 1 College of Resources and Environment, Southwest University, Chongqing 400716, China; 2 Insti⁃
tute of Soil Science, Chinese Academy of Sciences, Nanjing 210008, China) .
Abstract: Coastal wetlands contribute about 75% to the global oceanic CH4 emissions, thus play a
vital role in global C cycles. In this paper, we provided a perspective on researches on metabolic,
phylogenetic, and ecological diversity of the methanogenic archaea and the regulating environmental
factors in coastal wetlands. Because of the presence of more favorable electron acceptors such as sul⁃
fate, methanogenesis via CO2 reduction and acetate fermentation are limited by availability of sub⁃
strates, and hydrogenotrophic and acetotrophic methanogens generally express low relative abun⁃
dance. In contrast, “non⁃competitive” substrates such as methanol and methylated compounds have
been shown to contribute substantially to methane formation in coastal wetlands, and the facultative
methanogens are predominant in those environments. Salinity regulates vegetation zonation and is re⁃
lated to SO4 2
- concentration, by regulating types of methanogenic substrates and contents of compe⁃
titive electron acceptors, indirectly affects the structure and function of methanogens. Major uncer⁃
tainties in the current studies include the following: methanogen community structure, the key envi⁃
ronmental factors regulating methane pathway, and their effects on methane emissions in coastal
wetlands.
Key words: coastal wetlands; sulfate; non⁃competitive substrates; disproportionation of C1 methy⁃
lated compounds; facultative methanogens.
本文由中国科学院战略性先导专项(XDA05020500)、江苏省青年自
然科学基金项目 ( BK20151056 )、林业公益性行业科研专项
(201404210)和国家自然科学基金项目( 41171190)资助 This work
was supported by the strategic priority research program of the Chinese
Academy of Sciences ( XDA05020500), Youth Foundation of Jiangsu
Province ( BK20151056), Forestry industry research special funds for
public welfare projects ( 201404210) and the National Natural Science
Foundation of China (41171190) .
2015⁃07⁃01 Received, 2015⁃12⁃23 Accepted.
∗通讯作者 Corresponding author. E⁃mail: jiangxj@ swu.edu.cn
    甲烷作为重要的温室气体之一,在大气中的浓 度已从工业革命前的 0.722 μL·L-1增加到 2011 年
的 1.803 μL·L-1[1] .甲烷在百年尺度上的增温潜势
为 CO2 的 28 倍,辐照强度占大气层中温室气体总
辐照强度的 18%,强烈影响着全球热平衡.自然湿地
是大气中甲烷的主要排放源,每年向大气排放 177~
284 Tg甲烷,占全球甲烷总排放量的 26% ~42%,在
全球碳循环中起着十分重要的作用[1] .包括盐沼湿
地、红树林和河口湿地等在内的滨海湿地是地球上
初级生产力最大、固碳潜力最高的生态系统之一,大
应 用 生 态 学 报  2016年 3月  第 27卷  第 3期                                            http: / / www.cjae.net
Chinese Journal of Applied Ecology, Mar. 2016, 27(3): 993-1001                  DOI: 10.13287 / j.1001-9332.201603.014
量有机物质的输入为滨海湿地的甲烷产生提供了丰
富的底物,导致滨海湿地有较高的甲烷产生潜力和
排放速率[2] .Bange等[3]估算,河口和大陆架水域的
甲烷排放量占全球海洋甲烷排放的 75%,滨海湿地
是这部分甲烷的重要产生源[4] .但是现有研究表明,
滨海湿地的甲烷排放量通常低于泥炭沼泽等淡水湿
地,而不同类型滨海湿地甲烷排放也呈现较大的变
异性[5-6] .
产甲烷过程是厌氧条件下有机物质降解的最终
步骤,是在严格厌氧条件下产甲烷菌作用于产甲烷
底物的结果.乙酸发酵和 CO2 还原是淡水湿地甲烷
产生的两种主要途径.理论上乙酸发酵和 H2 / CO2
途径对总甲烷产生量的贡献分别是 67%和 33%[7],
其他底物对甲烷产生总量的贡献不超过 5%[8] .但是
由于植被、盐度、底物类型和硫酸盐含量等环境因子
的差异,滨海湿地与淡水湿地、不同类型滨海湿地之
间产甲烷菌种类和甲烷产生途径存在明显不同,继
而导致甲烷排放的变异性.为此,本文综合分析了国
内外不同类型滨海湿地甲烷产生途径和产甲烷优势
菌的变异性及其影响因素,以期为科学评价滨海湿
地在全球甲烷碳循环中的作用提供参考.
1  滨海湿地产甲烷菌类型
尽管存在 SO4 2
-等竞争性电子受体,产甲烷菌仍
广泛分布于滨海湿地和海洋沉积物中.产甲烷菌属
于古生菌域(Archaea)的水生古细菌门(Euryarchae⁃
ota).从系统发育看,产甲烷菌分成 6个目,分别为甲
烷杆菌目 ( Methanobacteriales)、甲烷八叠球菌目
(Methanosarcinales)、 甲烷微菌目(Methanomicrobia⁃
les),甲烷球菌目 (Methanococcales)、甲烷火菌目
(Methanopyrales)和 Methanocellales[9],共计 32 属
(表 1).尽管产甲烷菌在自然界中分布广泛,但仅能
够乙酸、甲酸、CO2 和甲醇、甲胺类、甲硫醇类等 C1
甲基化合物作为产甲烷的底物.根据其利用的底物
可以将产甲烷菌分为 3 类:1)乙酸营养型,通过裂
解乙酸,将乙酸的羧基氧化为 CO2,甲基还原为甲
烷,如甲烷鬃毛菌属(Methanosaeta);2)氢营养型,
主要利用 H2 和甲酸作为电子供体还原 CO2 产甲
烷,如甲烷杆菌属(Methanobacterium);3)兼性营养
型,除可以利用乙酸、甲酸和 CO2 等产甲烷外,某些产
甲烷菌还可以利用 C1甲基化合物,通过H2 还原甲基
化合物中的甲基产甲烷或通过甲基化合物自身的歧
化作用产甲烷,如产甲烷球菌属(Methanococcus).
目前,3种营养型的产甲烷菌在海洋沉积物或
滨海湿地中均有发现.不同类型滨海湿地中产甲烷
菌群落结构特征和产甲烷优势菌存在明显差异.在
许多滨海湿地中,能够利用甲基化合物的甲烷球菌
科(Methanosarcinaceae)是产甲烷优势菌[11] .García⁃
Maldonado 等[12]利用 PCR⁃DGGE 和克隆文库技术
研究发现,墨西哥太平洋沿岸盐池中产甲烷功能基
因(mcrA)绝大部分来自产甲烷球菌科.Parkes 等[11]
发现,英国 Arne Peninsula 盐沼湿地 5 ~ 25 cm 土层
中,能够利用甲胺类的产甲烷八叠球菌科占产甲烷
菌的 60% ~ 95%.Lyimo 等[13]则在红树林沉积物中
分离出 1 株以二甲基硫醚为底物的 Methanosarcina
semesiae MD1T.然而,除兼性菌甲烷八叠球菌科外,
在许多海洋沉积物中,利用 H2 / CO2 的甲烷袋状菌
属(Methanoculleus)和 Methanococcoides 同样大量存
在[14] .甲烷微菌目和甲烷球菌目中的氢营养型产甲
烷菌是长江河口湿地的产甲烷优势菌[15],闽江口芦
苇湿地产甲烷优势菌则主要属于甲烷球菌目中的氢
营养型[16];乙酸营养型的甲烷鬃毛菌是日本 Koito
河口光滩沉积物的产甲烷优势菌[17] .因此,与甲烷
排放类似,不同类型滨海湿地产甲烷菌群落结构特
征也存在较大变异性,二者的耦合关系尚不明了.
2  微生物对电子的竞争利用
根据热力学原理,在电子供体相同的情况下,电
子受体的电势越高产能越大[18] .厌氧条件下,微生
物依次利用 NO3
-、Mn4+、Fe3+、SO4 2
-和 CO2 作为电子
受体进行呼吸作用,分解有机物质以获取生长和繁
衍所需的碳源和能源,产甲烷过程是厌氧条件下有机
物质降解的最终步骤.滨海湿地中 NO3
-、Mn4+和 Fe3+
含量较低,但海水中 SO4 2
-浓度为 29 mmol·L-1 [19] .
研究表明,当 SO4 2
-浓度大于 1 mmol·L-1时,硫酸盐
还原菌活性即不受抑制,硫酸盐还原是滨海湿地最
重要的厌氧过程[20] .硫酸盐还原菌对乙酸和 H2 的
亲和力高于产甲烷菌,能够利用底物的阈值则低于
后者(表 2).
    例如,产甲烷菌Methanosarcina barkeri对乙酸的
亲和力远低于硫酸盐还原菌 Desulfobacter postgatei,
Ks值分别为 3 和 0. 2 mmol·L-1[27] . Methanobrevi⁃
bacter arboriphilus 利用 H2 作为底物时的 Ks 值为 6
μmol·L-1,是 Desulfovibrio vulgaris的 6倍[28] .由于这
种差异,产甲烷菌在与硫酸盐还原菌竞争利用底物中
处于劣势.Oremland和 Polcin[29]向美国 San Francisco
499 应  用  生  态  学  报                                      27卷
表 1  主要产甲烷菌分类及分布特征
Table 1  Orders, families and genera of the methanogenic archaea and corresponding distribution characteristics

Order

Family

Genus
利用底物类型
Substrate
type
最适温度
Optimum
temperature
(℃)
典型生长环境
Typical habitats
甲烷杆菌目
Methanobacteriales
甲烷杆菌科
Methanobacteriaceae
甲烷细菌属
Methanobacterium
H2 / CO2,甲酸 37~45 淡水湿地、沼泽、动物
瘤胃等
甲烷短杆菌
Methanobrevibacter
H2 / CO2,甲酸 37~40 稻田、朽木、动物消化
道等
Methanosphaera H2 / CO2,甲醇 37 动物消化道
甲烷热杆菌属
Methanothermobacter
H2 / CO2,甲酸 55~65 厌氧反应器
甲烷热菌科
Methanothermaceae
甲烷热菌属
Methanothermus
H2 / CO2 80~88 温泉
甲烷球菌目
Methanococcales
甲烷球菌科
Methanococcaceae
甲烷球菌属
Methanococcus
H2 / CO2,甲酸 35~40 海洋沉积物
Methanothermococcus H2 / CO2,甲酸 60~65 海洋沉积物
Methanocaldococcaceae Methanocaldococcus H2 / CO2 80~85 海洋沉积物
甲烷炎菌属
Methanotorris
H2 / CO2 88 海洋沉积物
甲烷微菌目
Methanomicrobiales
甲烷微菌科
Methanomicrobiaceae
甲烷微菌属
Methanomicrobium
H2 / CO2,甲酸 40 厌氧反应器、地下水、
动物瘤胃等
甲烷囊菌属
Methanoculleus
H2 / CO2,甲酸 20~55 沉积物、稻田、油田、温
泉等
甲烷泡菌属
Methanofollis
H2 / CO2,甲酸 37~40 厌氧反应器
产甲烷菌属
Methanogenium
H2 / CO2,甲酸 15~57 沉积物、稻田、动物消
化道等
Methanolacinia H2 / CO2 40 海洋沉积物
甲烷盘菌属
Methanoplanus
H2 / CO2,甲酸 32~40 油田
Methanosphaerula H2 / CO2,甲酸 28~30 泥炭湿地
甲烷螺菌科
Methanospirillaceae
甲烷螺菌属
Methanospirillum
H2 / CO2,甲酸 30~37 厌氧反应器、海洋沉积

甲烷粒菌科
Methanocorpusculaceae
甲烷粒菌属
Methanocorpusculum
H2 / CO2,甲酸 30~40 厌氧反应器、淡水沉积

甲烷砾菌属
Methanocalculus
H2 / CO2,甲酸 30~40 油田
Methanoregula H2 / CO2,甲酸 30~33 泥炭湿地
甲烷八叠球菌目 甲烷八叠球菌科 Halomethanococcus 甲醇、甲胺类 35 海洋沉积物
Methanosarcinales Methanosarcinaceae 甲烷八叠球菌属
Methanosarcina
乙酸、甲胺类 35~60 厌氧反应器、沉积物、
动物瘤胃等
Methanococcoides 含甲基化合物 23~35 海洋沉积物
甲烷盐菌属
Methanohalobium
甲胺类 40~55 盐湖沉积物
Methanohalophilus 甲胺类 35~40 盐湖沉积物
甲烷叶菌属
Methanolobus
甲胺类 37 盐湖沉积物
Methanomethylovorans 甲胺类 20~50 厌氧反应器、淡水沉积

Methanimicrococcus H2 / CO2+甲胺类 39 动物消化道
甲烷咸菌属
Methanosalsum
甲胺类 35~45 盐湖沉积物
甲烷鬃菌科
Methanosaetaceae
甲烷鬃毛菌属
Methanosaeta
乙酸 35~60 稻田、淡水沉积物
甲烷火菌目
Methanopyrales
甲烷火菌科
Methanopyraceae
甲烷火菌属
Methanopyrus
H2 / CO2 98 海洋地热沉积物
Methanocellales Methanocellaceae Methanocella H2 / CO2,甲酸 35~37 稻田、淡水湿地
根据 Sakai等[9]和 Liu等[10]资料编制、补充 According to the information of Sakai, et al.[9] and Liu, et al.[10] .
Bay湿地土壤中添加乙酸和 H2 后,发现 SO4 2
-的存
在抑制了甲烷产生.Purdy 等[30]发现,英国 Colne 河
口湿地有机物质矿化产生的电子,有 98%被硫酸盐
还原过程消耗,而用于产甲烷过程的仅占 2%.
5993期                          王  洁等: 滨海湿地甲烷产生途径和产甲烷菌研究进展           
表 2  产甲烷菌、硫酸盐还原菌和产氢菌利用乙酸和 H2 的阈值
Table 2  Acetate and hydrogen minimum threshold concentrations for methanogens, acetogens, and sulfate⁃reducing bacteria
类别
Type
菌株
Strain
阈值 Threshold
乙酸 Acetate
(μmol·L-1)
H2
(nmol·L-1)
文献
Reference
产甲烷菌 Methanosarcina barkeri 227 1180 - [21]
Methanogens Methanosarcina barkeri MST 850 - [22]
Methanosarcina thermophila CAL⁃1 190 - [23]
Methanosaeta concilii Opfikon 7 - [24]
Methanosaeta concilii VeAc9 <10 - [22]
Methanosaeta thermoacetophila CALS 12 - [23]
Methanospirillum hungatei - 23 [25]
Methanobacterium formicicum - 21 [25]
硫酸盐还原菌 Desulfobacca acetoxidans DSM 11109 <15 - [26]
Sulfate⁃reducing Desulforhabdus amnigenus DSM 10338 <15 - [26]
bacteria Desulfovibrio desulfuricans - 6.8 [26]
产乙酸菌 Acetobacterium carbinolicum - 713 [25]
Acetogens Acetobacterium woodii - 390 [25]
3  滨海湿地甲烷产生途径
根据代谢途径的差异可以将产甲烷过程分为 3
种:乙酸发酵、H2 / CO2 途径和 C1 甲基化合物歧化.
这 3种甲烷产生途径的最后一步均为甲基辅酶 M
还原酶将甲基辅酶 M 还原为甲烷,产生途径如图 1
所示. 3 种甲烷产生途径的典型反应和自由能见
表 3.
3􀆰 1  乙酸发酵途径
目前已知只有甲烷八叠球菌属和甲烷鬃毛菌属
的产甲烷菌可以通过乙酸发酵途径产甲烷.二者通
过裂解乙酸,将羧基氧化成 CO2,而甲基还原成甲烷
表 3  产甲烷反应的标准自由能
Table 3  Free energies of methanogenesis reaction
反应
Reaction
ΔGθ′
(kJ·mol-1CH4)
H2 / CO2还原途径
  4H2+ HCO3-+ H+→ CH4+ 3H2O -136
  4HCOOH → CH4+ 3CO2+ 2H2O -130
  2C2H5OH + CO2→ CH4+ 2CH3COOH -116
  4CO + 2 H2O → CH4+ 3CO2 -196
  CO2+ 4(CH3) 2CHOH → CH4+ 4(CH3) 2CO + 2H2O -37
乙酸发酵途径
  CH3COO-+ H2O → CH4+ HCO3- -31
C1甲基化合物歧化途径
  CH3OH + H2→ CH4+ H2O -113
  4CH3OH → 3CH4+ HCO3-+ H++ H2O -105 (-315)
  4(CH3) 3NH++ 9H2O → 9CH4+ 3HCO3-+ 4NH4++ 3H+ -74 (-669)
  2(CH3) 2NH2++ 3H2O → 3CH4+ HCO3-+ 2NH4++ H+ -73 (-220)
  4CH3NH3++ 3H2O → 3CH4+ HCO3-+ 4NH4++ H+ -75 (-225)
  2(CH3) 2S + 2H2O → 3CH4+ CO2+ 2H2S -74 (-222)
  4CH3SH + 3H2O → 3CH4+ HCO3-+ 4HS-+ 5H+ -37 (-111)
括号内为反应产能 Reaction⁃energies were shown in brackets.
(图 1).兼性营养型的甲烷八叠球菌除利用乙酸外,
还能利用 H2 / CO2、甲醇和 C1 甲基化合物产生甲
烷,甲烷鬃毛菌则是专性乙酸营养型产甲烷菌,只能
利用乙酸产甲烷.乙酸发酵途径中,甲烷八叠球菌属
利用亲和力较低的乙酸激酶(AK)⁃磷酸转乙酰酶
(PTA)途径激活乙酸,形成乙酰辅酶 A;甲烷鬃毛菌
则利用高亲和力的一磷酸腺苷(AMP)⁃乙酰辅酶 A
合成酶途径生成乙酰辅酶 A[31-33] .因此,甲烷鬃毛菌
能够在乙酸浓度低至 5 ~ 20 μmol·L-1的情况下产
甲烷,而甲烷八叠球菌利用乙酸产甲烷的最低浓度
则高达 100~1000 μmol·L-1(表 2).
乙酸发酵是稻田和淡水湿地中重要的甲烷产生
途径[34-35],但在许多滨海湿地和海洋沉积物中却不
是主要的甲烷产生途径[36-37] . Parkes 等[38]通过 14C
标记试验发现,在海洋沉积物的硫酸盐还原层中,乙
酸被氧化成 CO2 的速率要远大于其生成甲烷的速
率,乙酸更多地被硫酸盐还原菌利用,而非乙酸型产
图 1  产甲烷过程
Fig.1  Processes of methanogenesis.
699 应  用  生  态  学  报                                      27卷
甲烷菌.King 等[39]发现,美国缅因州 Lowes Cove 滨
海湿地中产生的甲烷仅有 0.5% ~ 5.5%源于乙酸.
Oremland等[29]发现,乙酸对 San Francisco Bay 滨海
湿地中产生甲烷贡献小于 1%.与上述结果相反,也
有研究发现,乙酸是许多滨海湿地甲烷产生的重要
底物.Blair和 Carter[40]发现,在有机物质含量丰富的
加利福尼亚 Cape Hatteras 滨海湿地,乙酸发酵途径
对甲烷产生的贡献在 25% ~50%.Parkes等[11]估算,
英国 Arne Peninsula盐沼湿地 99%的甲烷源于乙酸
发酵.大量有机物质输入滨海湿地后,SO4 2
-被消耗,
形成部分 SO4 2
-“耗竭”的微域[41] .例如,在盐沼湿地
植物根系或枯落物附近土壤中 SO4 2
-含量可能低至
μmol·L-1,产甲烷菌可以利用乙酸产生甲烷[42] .因
此,在多数滨海湿地中,乙酸发酵不是主要的甲烷产
生途径;而在 SO4 2
-等竞争性电子受体匮乏或有机物
质供应充分的滨海湿地中,乙酸发酵途径可能扮演
着重要角色.
3􀆰 2  H2 / CO2 途径
CO2 还原产甲烷过程广泛存在于厌氧环境
中[10] .利用 H2 / CO2 的产甲烷菌大致可分为两类:含
细胞色素的甲烷八叠球菌目和不含细胞色素的甲烷
火菌目、甲烷球菌目、甲烷杆菌目和甲烷微菌目.前
者通常只能在 H2 分压大于 10 Pa环境中产生甲烷;
后者产甲烷底物仅限于 H2 / CO2,却能在 H2 分压为
1~10 Pa的环境中产生甲烷[43] .
CO2 还原通常是泥炭湿地最主要的甲烷产生途
径[44],尤其是在泥炭湿地的底层和低 pH 的环境
中[45] .在滨海湿地中,H2 主要被硫酸盐还原菌利
用[46],使其分压低于产甲烷菌能够利用的最低
值[47-48] .然而,当滨海湿地有大量有机物质输入时,
SO4 2
-被大量消耗,H2 / CO2 也可能是重要底物.Whi⁃
ticar等[36]发现,在 SO4 2
- “耗竭”的深层海洋沉积物
中,H2 / CO2 是主要的产甲烷底物. Parkes 等[38]通
过14C标记试验发现,H2 / CO2 和乙酸的最高产甲烷
速率均发生在海洋沉积物硫酸还原层以下,H2 / CO2
产甲烷速率是乙酸的数十倍.Buckley 等[49]发现,在
蓝细菌(Cyanobacteria)含量丰富的 Great Sippewis⁃
sett 盐沼湿地表层,蓝细菌的光合或固氮作用产生
大量 H2,导致 H2 含量高达 10%,甲烷主要由 H2 /
CO2 途径产生.因此,与乙酸发酵途径相似,H2 / CO2
途径有可能在 SO4 2
-含量低的微域发挥重要作用.
3􀆰 3  C1甲基化合物歧化途径
产甲烷菌可以利用 C1 甲基化合物,诸如甲胺
类、甲硫醇类和甲醇等产生甲烷.C1 甲基化合物歧
化产甲烷过程中,甲基化合物的甲基直接转移到辅
酶 M的硫醇基上[50],然后甲基辅酶 M 被还原成甲
烷(图 1),每 3 个甲基被还原成甲烷的同时生成 1
分子 CO2 [10] .该途径的主要产甲烷菌为甲烷球菌科
(Methanosarcinaceae)和 Methanosphaera,利用的 C1
甲基化合物底物有:甲醇、甲胺、二甲胺、三甲胺、四
甲胺、二甲基硫醚、甲硫醇、甲巯基丙酸、甜菜碱、胆
碱、硫代甜菜碱和二甲基乙醇胺等[51-52] .
    在稻田和淡水湿地中,几乎所有的甲烷源于
H2 / CO2 和乙酸[7,53],其他途径产生的甲烷非常低
(表 4) [8,54] .滨海湿地中 H2 / CO2 和乙酸等“竞争性”
底物主要被硫酸盐还原菌利用,但硫酸盐还原菌不
能利用甲胺类、甲硫醇类和甲醇等 C1 甲基化合物,
故称为“非竞争性”底物[20,29] .甲醇由植物果胶降解
而来,甲胺类和甲硫醇类的前体则为胆碱、脯氨酸、
甜菜碱和硫代甜菜碱等细胞渗透调节剂.在 SO4 2
-含
量丰富的滨海湿地中,该途径能导致大量甲烷排
放[52] .
Parkes等[38]发现,三甲胺是海洋沉积物硫酸还
原层(5~25 cm)最主要的产甲烷底物,其产甲烷速
率分别是 CO2 和乙酸的 99 倍和 506 倍.King 等[39]
发现,Lowes Cove滨海湿地中 35.1% ~61.1%的甲烷
源于三甲胺代谢.Oremland等[23]发现,三甲胺对 San
Francisco Bay滨海湿地中甲烷的贡献达90%,另外
表 4  不同底物对湿地甲烷产生的贡献率
Table 4  Contribution rates of different substrates to CH4
production in wetlands
地点
Location
湿地特征
Wetland
characteristic
底物
Substrate
贡献率
Contribution
rate (%)
文献
Reference
Lowes Cove, USA 光滩表层 乙酸 0.5 [39]
甲醇 2.4
三甲胺 61.1
甲胺 -
Lowes Cove, USA 藻类着生 乙酸 5.5 [39]
甲醇 0.1
三甲胺 35.1
甲胺 -
San Francisco Bay, USA 盐沼湿地 三甲胺 >90 [29]
Arne Peninsula, UK 盐沼湿地 乙酸 99.0 [11]
H2 / CO2 1.0
Cape Lookout Bight, USA 浅海沉积物 乙酸 25~50 [40]
Vercelli, Italy 稻田 甲醇 0.7~4.0 [8]
Wintergreen Lake, USA 富营养湖泊 甲醇 2.8~4.0 [54]
甲胺 0.3~0.4
三甲胺 0.1~0.2
7993期                          王  洁等: 滨海湿地甲烷产生途径和产甲烷菌研究进展           
10%则源于甲醇.Kiene 和 Capone[55]发现,纽约 Old
Field互花米草湿地中 28%的甲烷源于二甲硫醚代
谢.Purdy等[14]发现,向厌氧培养的 Colne 河口湿地
土壤中添加三甲胺引发大量甲烷产生,并导致属于
甲烷八叠球菌目的产甲烷菌迅速增殖,而甲烷微菌
目则无明显增加.
4  滨海湿地产甲烷菌甲烷产生途径的影响因素
4􀆰 1  盐度
盐度是影响湿地甲烷产生的一个重要因素.较
高的盐度会影响产甲烷微生物的活性,具有一定的
抑制作用.仝川等[56]对闽江口半咸水芦苇(Phrag⁃
mites australis)潮汐沼泽湿地研究发现,在一定范围
内,盐度与甲烷产生呈显著的指数负相关关系.
Rinzema 等[57] 发现, Na+浓度范围为 0. 23 ~ 0􀆰 35
g·L-1时,以乙酸为底物的产甲烷菌活性最强;当
Na+浓度达到 14 g·L-1时,产甲烷菌活性完全受到
抑制.Vallero等[58]则发现,在 NaCl浓度为 25 g·L-1
时,以甲醇为底物的产甲烷菌活性完全被抑制,表明
盐度与底物存在一定协同作用,影响产甲烷菌的功能
发挥.在高盐环境中,甲烷产生途径以 C1甲基化合物
歧化为主,主要以非竞争性底物甲胺、三甲胺、甲醇和
甲硫氨酸等 C1甲基化合物作为碳源产生甲烷[59] .
在滨海湿地 SO4 2
-含量较高的环境中,硫酸盐还
原菌在与产甲烷菌竞争底物乙酸和 H2 中占优势,
只有当 SO4 2
-被“耗竭”后,产甲烷菌才可以利用这
类底物产生甲烷.SO4 2
-含量是导致不同类型滨海湿
地产甲烷菌群落结构和甲烷产生途径差异的最重要
因素.硫酸盐还原菌通过底物竞争、毒害和改变环境
因子等,使 H2 / CO2 和乙酸分别降低 70% ~ 80%和
20%~ 30%[60],然而硫酸盐还原菌并不能利用甲基
化合物等非竞争性底物.因此,在 SO4 2
-含量丰富的
滨海湿地,产甲烷优势菌以兼性营养型产甲烷菌为
主,主要甲烷产生途径为 C1 甲基化合物歧化;而在
SO4 2
-“耗竭”的区域,乙酸营养型和氢营养型产甲烷
菌占优势,乙酸发酵和 H2 / CO2 对甲烷产生的贡献较
高.Purdy等[14]则发现,甲烷鬃毛菌只在河口的淡水
区域出现,而在其附近的海洋沉积物中未能检测到.
4􀆰 2  pH
产甲烷菌对 pH值的变化非常敏感,通常 pH为
6~8时活性最高,超出范围产甲烷活性将受到明显
抑制[61-62] .但 Kotsyurbenko 等[63]对俄罗斯西伯利亚
沼泽研究发现,在 pH 分别为 6.0 和 4.8 时,不同温
度条件下以乙酸为底物产生的甲烷占 60% ~ 68%,
pH降到 3.8时,氢营养型产甲烷菌成为土壤产甲烷
的主要承担者( >92%).胡亚东等[64]从造纸厂阴沟
污泥中分离到一株生长 pH 为 5.5 ~ 9.5 的甲烷短杆
菌(Methanobrevibacter arboriphilus),发现该菌株以
H2 / CO2 和甲酸盐为底物生长,对酸碱环境有良好的
适应性;有研究发现,在酸性和极酸性泥炭沼泽中也
存在大量产甲烷菌[65],表明限制甲烷产生的因素不
仅是 pH,还与其他的环境因素和底物供应有关.
4􀆰 3  温度
温度通过影响土壤中产甲烷优势菌发生更替来
改变土壤的产甲烷能力.较低温度条件下产甲烷菌
为只能利用乙酸的甲烷鬃菌科,土壤形成甲烷的能
力较弱;较高温度条件下产甲烷菌以能利用乙酸和
H2 / CO2 的甲烷球菌科为主,甲烷产生能力相对较
强[66] .产甲烷菌一般在 0~35 ℃下活性较高,同时存
在功能发挥最佳温度,但低于或高于这一温度,产甲
烷菌活性均会受到不同程度的抑制[67] .Van Hulzen
等[68]对荷兰 Nieukoops Plassen 湿地建立甲烷产生⁃
温度响应模型发现,土壤产甲烷温度效应 Q10值同
时与产甲烷菌活性和底物有效性有密切关系.杨平
等[69]对闽江口湿地模拟研究发现,甲烷产生潜力与
温度变化存在一定的指数关系,在低温范围内这一
响应关系更为显著.丁维新等[66]则认为,不同气候
带不同类型湿地土壤最佳产甲烷温度各异,这与产
甲烷菌的类型和对环境的适应能力有关.
4􀆰 4  植被类型
植物是湿地的重要组成部分,不同植物的生理
特性差异导致不同的根系分泌物种类和数量[70],直
接影响湿地中产甲烷底物的供应.产甲烷菌对底物
的选择以及对底物亲和力的不同,导致植被类型不
仅影响湿地产甲烷菌活性,还影响其群落结
构[71-72] .在滨海湿地中,不同植被适应不同的水分
和盐度条件,植物体内合成的非竞争性底物前体也
存在明显差异[73] .Wang 和 Lee[74]发现,互花米草合
成的甲基化合物高于狐米草(Spartina patens)和盐
草(Distichlis spicata);Dacey 等[75]发现,互花米草体
内硫代甜菜碱浓度为 80 ~ 280 mmol·kg-1(以干质
量计),而在狐米草和盐草等体内的浓度则低于 0.1
mmol·kg-1(以干质量计).这种差异可能导致不同
植被类型滨海湿地产甲烷菌群落结构和甲烷产生途
径不同.例如,Yuan 等[76]发现,外来植物互花米草
(Spartina alterniflora)入侵我国滨海湿地后,显著增
加了“非竞争性底物”三甲胺的含量,诱导产甲烷优
势菌由甲烷鬃菌科向甲烷球菌科演替.此外,Senior
899 应  用  生  态  学  报                                      27卷
等[42]认为,滨海湿地植物根系和残体中存在 SO4 2

“耗竭”的微域,乙酸营养型和氢营养型产甲烷菌在
这些微域内存活,导致有植被生长湿地的产甲烷菌
群落结构和甲烷产生途径与无植被湿地存在差异.
4􀆰 5  底物供应
有机物质输入或湿地可溶性有机碳(SOC)含量
的差异也能导致底物供应的不同,并引起产甲烷菌
群落结构出现差异.Bergman等[77]对瑞士 Storamyren
泥炭沼泽研究发现,SOC 含量的差异是造成不同湿
地甲烷产生潜力差异的主要因素.即使在 SO4 2
-丰富
的环境中,底物供应水平对产甲烷菌群落结构和活
性的影响依然明显,Blair 和 Carter[40]发现,在有机
物质丰富的浅海沉积物中,乙酸发酵产生的甲烷占
甲烷总产生量的 25% ~ 50%,乙酸营养型甲烷鬃毛
菌是这一区域的产甲烷优势菌.Buckely 等[49]发现,
在美国 Great Sippewissett 盐沼湿地的微生物垫中,
蓝细菌光合产物发酵及固氮作用可以使微生物垫表
层中 H2 含量最高可达 10%,但不同区域间含量的
差异可达 4个数量级.在这种非均衡条件下,硫酸盐
还原菌很难完全限制产甲烷菌对 H2 的利用[48],在
微生物垫的 0~10 mm土层中,氢营养型产甲烷菌占
优势,但随着深度增加,甲基营养型的比例增加.
5  存在问题与展望
滨海湿地在全球碳循环中起着重要的作用.不
同类型滨海湿地的 SO4 2
-含量、盐度、植被类型和底
物供应等存在着明显差异,导致产甲烷菌群落结构
和甲烷产生途径不同,继而引起不同类型湿地甲烷
产生速率和排放量的差异.目前我国在对滨海湿地
产甲烷研究方面,运用数学模型模拟研究人为扰动
条件下产甲烷菌群落构成多样性、结构特征和环境
因素对甲烷产生途径的影响机制及其对甲烷产生和
排放影响等方面的成果还不多见.目前有待研究的
内容有:1)不同类型滨海湿地产甲烷菌群落结构多
样性及其控制因素;2)滨海湿地产甲烷菌群落结构
特征、甲烷产生途径与甲烷排放通量的关系;3)植
被对滨海湿地甲烷产生和排放的影响机制;4)厌氧
氧化过程、功能菌特征及其对滨海湿地甲烷排放的
意义.
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作者简介  王  洁,女,1988年生,硕士研究生. 主要从事沿
海湿地甲烷排放与甲烷氧化研究. E⁃mail: wangjie0903@
126.com
责任编辑  肖  红
王洁, 袁俊吉, 刘德燕, 等. 滨海湿地甲烷产生途径和产甲烷菌研究进展. 应用生态学报, 2016, 27(3): 993-1001
Wang J, Yuan J⁃J, Liu D⁃Y, et al. Research progresses on methanogenesis pathway and methanogens in coastal wetlands. Chinese
Journal of Applied Ecology, 2016, 27(3): 993-1001 (in Chinese)
10013期                          王  洁等: 滨海湿地甲烷产生途径和产甲烷菌研究进展