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西藏小麦品种籽粒硬度遗传多样性



全 文 :西北农业学报 2014,23(8):40-44
Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica  doi:10.7606/j.issn.1004-1389.2014.08.007
网络出版日期:2014-08-06
网络出版地址:http://www.cnki.net/kcms/doi/10.7606/j.issn.1004-1389.2014.08.007.html
西藏小麦品种籽粒硬度遗传多样性
收稿日期:2013-09-22  修回日期:2013-12-11
基金项目:青海省高原作物种质资源创新与利用国家重点实验室培育基地开放课题(2011-07);中国科学院知识创新工程重要方
向项目(KSCX2-EW-N-02);国家自然科学基金地区基金(31260322)。
第一作者:李善富,男,硕士研究生,研究方向为植物生物技术。E-mail:ddd_463043656@qq.com
通信作者:李建民,男,教授,硕士生导师,研究方向为植物生物技术。E-mail:beyond_3862740@163.com
李善富1,2,3,4,李建民2,王雪玲2,魏 乐2,李红琴1,刘宝龙1,3,4,张怀刚1,3,4
(1.中国科学院 西北高原生物研究所,西宁 810001;2.青海师范大学 生命与地理科学学院,西宁 810001;
3.中国科学院 高原生物适应与进化重点实验室,西宁 810001;4.青海省作物分子育种重点实验室,西宁 810001)
摘 要 籽粒硬度是影响小麦磨粉品质和食品品质的重要因素。利用单粒谷物特性测定仪、PCR扩增和核
苷酸测序技术,对121份西藏地方品种进行籽粒硬度性状遗传多样性研究。结果表明:西藏品种籽粒硬度平
均值为43.73%,硬度值大于60%的品种有43种,占35.5%;混合麦22个,占18.2%;软质麦56个,比例为
46.3%。符合优质饼干硬度特性的品种有42种,达到34.7%。有5种硬度基因组合类型:野生型、Pina-
D1b、Pinb-D1b、Pinb-D1c、Pinb-D1p。野生型比例最高,占51.22%。Pinb-D1c次之,占21.31%,其余依次为
Pinb-D1b、Pina-D1b、Pinb-D1p。各种组合类型的SKCS硬度值Pinb-D1c>Pina-D1b>Pinb-D1b>Pinb-D1p>
野生型。西藏小麦品种籽粒硬度性状遗传多样性的研究将为青藏高原以及其他地区的育种提供种质资源和
理论依据。
关键词 小麦;籽粒硬度;Puroindoline;遗传多样性;西藏
中图分类号 S512.1   文献标志码 A     文章编号 1004-1389(2014)08-0040-05
Genetic Variation of Grain Hardness of Wheat Cultivars in Tibet
LI Shanfu1,2,3,4,LI Jianmin2,WANG Xueling2,WEI Le2,
LI Hongqin1,LIU Baolong1,3,4 and ZHANG Huaigang1,3,4
(1.Northwest Institute of Plateau Biology,Chinese Academy of Sciences,Xining 810001,China;2.Colege of Biologic
and Geographic Sciences,Qinghai Normal University,Xining 810001,China;3.Key Laboratory of Adaptation
and Evolution of Plateau Biota,Chinese Academy of Sciences,Xining 810001,China;
4.Qinghai Province Key Laboratory of Crop Molecular Breeding,Xining 810001,China)
Abstract Grain hardness was a key factor deciding wheat miling quanlity and end-used food quanlity.
In this study,single kernel characterization system(SKCS),PCR and nucleotide sequencing were em-
ployed for lighting genetic diversity of grain hardness of Tibet wheat cultivars.Average hardness in-
dex of al cultivars was 43.73%.43cultivars had hardness index greater than 60%,accounting for
35.5%of total cultivars;22cultivars were mixed wheat,accounting for 18.2%,and 56cultivars were
soft wheat,accounting for 46.3%.42cultivars had hardness index less than 30,which means they
can be good candidates for biscuit.Five genotypes of puroindoline gene combinations existed in these
cultivars.They were wild type,Pina-D1b,Pinb-D1b,Pinb-D1cand Pinb-D1p .The proportion of
wild type was the highest,and reached 51.22%,Pinb-D1cwas the second,and reached 21.31%,
while Pinb-D1b,Pina-D1band Pinb-D1pfolowed.The order of SKCS value of these genotypes was
Pinb-D1c>Pina-D1b>Pinb-D1b>Pinb-D1p >wild type.These results could provide materials and
theoretical base for wheat breeding in Tibet and other provinces.
Key words Wheat;Grain hardness;Puroindoline;Genetic variation;Tibet
  小麦籽粒硬度是国内外小麦市场分级和定价
的重要依据。硬度值小的小麦磨制的面粉颗粒度
较小,破损淀粉质量分数低,吸水能力较弱,适合
于制作饼干和糕点。硬度值大的小麦磨制的面粉
颗粒度大,破损淀粉质量分数高,具有较强的吸水
能力,适合于制作面包[1-2]。小麦的籽粒硬度性状
主要由位于小麦5D 染色体短臂上的 Puroin-
doine a(Pina)和 Puroindoine b(Pinb)基因调
节[3]。Pina和Pinb基因都处于野生状态时,籽
粒表现为软质;当Pina或Pinb任一基因缺失或
突变时,籽粒表现为硬质;当缺乏D组染色体时,
籽粒硬度最大,称为杜伦麦[4-5]。Greenwel 等[3]
首先发现了小麦的硬度基因pina和pinb,并确
认Pinb基因中223位点的鸟嘌呤(G)突变为腺
嘌呤(A),使得氨基酸序列中第46位点的甘氨酸
(Glycine,Gly)突变为丝氨酸(Serine,Ser),能导
致小麦籽粒变硬,并命名为Pinb-D1b。随后发现
PINA蛋白缺失的突变类型Pina-D1b也到导致小
麦的籽粒变硬[6]。至今为止,研究者已经发现了
Pinb-D1c、Pinb-D1e、Pinb-D1f等不同等位变异不
少于28个。小麦硬度基因的不同突变类型对小
麦籽粒硬度的影响有所差异。如Pinb-D1c突变
类型的硬度值>Pina-D1b>Pinb-D1b[3]。对硬
度基因遗传多样性的研究,将有利于利用硬度基
因的不同等位变异开展小麦籽粒硬度性状的改良
工作。
西藏地区位于中国西南边陲,青藏高原的西
南部,平均海拔4 000m以上,南隔喜马拉雅山
脉,与印度、尼泊尔、锡金、不丹、缅甸等国接壤。
北部和东部与青海、四川、云南等省区为邻。生态
环境变化丰富,并能形成较为明显的生殖隔离,孕
育了丰富的植物生态类型[7]。由于西藏地区地理
位置和交通等方面的原因,对西藏地区小麦种质
资源的收集和研究较少。在本研究中,从西藏收
集到小麦种质资源121份,对其进行籽粒硬度性
状的遗传多样性研究,以期为小麦的籽粒硬度性
状改良提供理论基础和种质资源。
1 材料与方法
1.1 试验材料
以121份西藏地方品种为试验材料。该材料
于2010年和2011年种植在中科院西北高原生物
研究所下红庄生态农业试验站。
1.2 试验方法
1.2.1 籽粒硬度的测定  籽粒硬度测定时,小
麦籽粒的含水量控制在11%~13%。利用Per-
ten 4100 型单粒谷物硬度仪 (Single Kernel
Characterization System,SKCS)测定,每个品系
测定300粒样品,根据仪器显示的测定结果,分别
记录籽粒千粒质量(mg)、直径(mm)、硬度指数
(HI)和含水量(%)及其标准偏差。样品的籽粒
硬度指数、千粒质量、直径和含水量均用300粒小
麦相关指数的平均值来表示,硬度指数值小于40
为软质麦,大于60为硬质麦,介于二者之间为混
合麦[8]。
1.2.2 基因组DNA的提取  每个品系选取3
粒种子,充分研磨,将粉末放入灭菌的1.5mL
Eppendorf管中,按照陈锋等[9]的CTAB法提取
基因组DNA。
1.2.3 PCR反应和琼脂糖胶电泳 分别用Pi-
na基因全长引物和Pinb基因全长引物对121份
材料进行Pina和Pinb全长扩增。Pina基因全
长引物,扩增一个包含有Pina基因全长、长度为
524 bp 的 片 段,上 游 引 物 5′-CATCTAT-
TCATCTCCACCTGC-3′;下游引物 5′-GTGA-
CAGTTTATTAGCTAGTC-3′。Pinb基因全长
引物,扩增一个包含有Pinb基因全长、长度为
597bp片段,上游引物5′-GTGAGCATTAGC-
CAAAGC-3′;下游引物5′-CAGATCAATATA-
CAAGGGTG-3′。以上所有引物均由北京六合华
大基因科技股份有限公司合成。PCR反应体系
与扩增程序、琼脂糖凝胶电泳均按照陈锋等[9]的
方法进行。
1.2.4 测序鉴定  将上述经琼脂糖凝胶电泳检
测到目标条带的Pina和Pinb基因的50μL PCR
扩增产物送样测序,DNA测序由北京六合华大基
因科技股份有限公司完成。
1.2.5 软件分析 用SPSS软件对籽粒SKCS
硬度指数、千粒质量及粒径的平均值、标准差和变
幅等基本量进行统计,并用 LSD(Least signifi-
cant difference)法进行多样本平均数的差异显著
性比较。用 Vector NTI Advance10软件完成序
·14·8期 李善富等:西藏小麦品种籽粒硬度遗传多样性
列比对和分析。
2 结果与分析
2.1 籽粒硬度分布规律
西藏品种籽粒硬度偏低,平均值为43.73,变
幅为2.34~79.02。供试材料中硬度值大于60
的品种有43个,占总材料中的35.5%;混合麦22
个,占18.2%;软质麦56个,比例为46.3%。有
42个品种硬度值低于30,达到34.7%(表1),可
以用作优异饼干小麦的种质资源。本研究还发现
有2个材料的硬度值极低,其籽粒硬度仅为2.34
和5.35,分别为Y1777和Y1859。
2.2 Puroindoline基因变异类型的分布
用Pina和Pinb的全长引物将121个品种中
的Pina和Pinb基因编码区扩增后,由北京华大
基因公司测序。通过 Vector NTI Advance10软
件进行序列比对和分析后发现121份西藏小麦品
种中,除了野生型外有4种突变类型,分别为Pi-
na-D1b、Pinb-D1b、Pinb-D1c和Pinb-D1p。Pina-
D1b 突变类型为基因组中缺失Pina基因,所以
在突变类型序列比较图中未将其标出(图1)。而
Pinb-D1b、Pinb-D1c、Pinb-D1p与野生型Pinb-D1a
核苷酸序列之间均只有一个碱基的差异。Pinb-
D1b突变类型是223位点的鸟嘌呤(G)突变为腺
嘌呤(A)[10],Pinb-D1c突变类型是266位点的胸
腺嘧啶(T)突变为胞嘧啶(C)[5]。Pinb-D1p是213
位点腺嘌呤核苷酸(A)缺失,发生了移码突变[11]
(图1)。121个小麦品种中,26份材料为Pinb-
D1c类型,占21.31%,17份为Pinb-D1b类型,占
13.93%,12份为Pina-D1b类型,占9.84%,5份
为Pinb-D1p类型,占4.10%,其余61份为野生
型,占51.22%(表2)。出现Pina-D1b突变类型
时,Pinb基因均为野生型。
2.3 不同Puroindoline基因等位变异类型对籽
粒硬度的影响
由表3可知,Pinb-D1c类型与Pina-D1b类型
的SKCS硬度值分别为68.80、65.74,显著高于
Pinb-D1b、Pinb-D1p及野生型的56.66、47.53、
24.79。类型Pinb-D1c与类型Pina-D1b的SKCS
硬度值之间差异不显著,而Pinb-D1b和Pinb-D1p
类型之间的SKCS硬度值存5%的显著差异。千
粒质量最高的类型为野生型,为43.60g,其次分
表1 西藏小麦品种籽粒硬度值
Table 1 Hardness index of wheat cultivar in Tibet
级别
Class
硬度指数
Hardness
index
品种数
No.of
sample
百分比/%
Percentage
硬质 Hard >60  43  35.5
混合 Mixed  40~60  22  18.2
软质Soft <40  56  46.3
下划线表示核苷酸序列有差异的位点 Underlined sites represented different sites in the nucleotide sequences
图1 不同Puroindoline b变异类型核苷酸序列比对图
Fig.1 Alignment of nucleotide sequences of Puroindoline b
表2 Puroindoline基因突变类型的统计分析
Table 2 The statistical analysis of Puroindoline type
Puroindoline a  Puroindoline b
品种数
No.of sample
比例
Percentage
代表品种
Cultivars
Pina-D1a Pinb-D1b 17  13.93% Y1916
,Y1869,Y1908,Y1907,Y1876,
Y1-XZW75,Y1891,Y1888
Pinb-D1c 26  21.31% Y1895
,Y1898,Y1875,Y1883,Y1889,
Y1892,Y1878,Y1887
Pinb-D1b 17  13.93% Y1916
,Y1869,Y1908,Y1907,Y1876,
Y1-XZW75,Y1891,Y1888
Pinb-D1p  5  4.10% Y1915,Y1912,Y1904,Y1913,Y1829
Pinb-D1a 61  51.22% Y1879
,Y1886,Y1885,Y1896,Y1903,
Y1900,Y1893,Y1884
Pina-D1b 12  9.84% Y1851
,Y1867,Y1901,Y1852,Y1866,
Y1917,Y1914,Y1773
·24· 西 北 农 业 学 报 23卷
别为Pinb-D1p、Pinb-D1b和Pinb-D1c。除野生型
和Pinb-D1p与Pinb-D1c类型的千粒质量之间差
异显著外,其余各种类型的千粒质量之间差异均
未达到显著水平。5种类型的粒径为2.91~2.97
mm,差异不显著。
表3 不同Puroindoline变异类型籽粒硬度、千粒质量和粒径比较
Table 3 The relation between puroindoline genotype and grain character
Puroindoline a  Puroindoline b
样品数
No.of sample
硬度指数 Hardness index
平均值
Average
标准差
Standard deviation
变幅
Range
千粒质量/g
Thousands
grain mass
粒径/mm
Grain
diameter
Pina-D1a Pinb-D1b 17  56.66b 7.64  43.49~67.92  40.11ab  2.93
Pinb-D1c 26  68.80a 4.43  60.70~79.02  38.41b 2.91
Pinb-D1p  5  47.53c 2.93  44.06~52.12  42.70a 2.97
Pinb-D1a 61  24.79d 10.98  2.34~59.76  43.50a 2.92
Pina-D1b 12  65.74ab  6.43  55.76~75.66  41.75ab  2.97
注:同列不同小写字母表示差异显著(P<0.05)。
Note:Values folowed by different letters within a line are significantly different between types(P<0.05).
3 讨 论
西藏品种籽粒硬度平均值为43.73,属于小
麦籽粒硬度值偏低的地区[12]。丛花等[13]研究的
105份新疆小麦地方品种平均值为63.5,而陈锋
等[9]测得140份中国春小麦品种的籽粒平均硬度
值为50。青藏高原春麦区,小麦单产居全国首
位,但品质较差,表现为小麦蛋白质质量分数低,
面筋的延伸性、粘弹性差,加工的面条、饺子等水
煮制品,耐煮性和口感均不好,易断条、糊汤,馒头
起发性差,无弹性、粘牙[14]。不适合于进行以面
包为制作食品的强筋小麦的培育[15],但是需要低
蛋白质含量的优质饼干和糕点小麦品种的候选基
地,被划分中国弱筋小麦三大亚区之一[16]。而优
质饼干和糕点小麦另一重要指标是籽粒硬度低于
30的小麦品种。121份种质资源中56个小麦的
籽粒硬度值小于40,比例达到46.3%,并且有42
个材料的硬度值低于30,还有2个籽粒硬度只有
2.34和5.35的材料。西藏小麦发现的这一系列
籽粒偏软的种质资源,很可能为该地区的小麦籽
粒硬度改良提供良好的支撑,促使该地区真正成
为优质饼干小麦的生产基地。
西藏地方品种硬度基因的等位变异中Pinb-
D1c有26份,占到所有材料的21.31%。而Pinb-
D1b只有17份。Pinb-D1c 要远多于Pinb-D1b。
Lilemo等[17]研究认为Puroindoline b基因变异
类型中Pinb-D1b突变是最为常见的类型。Pinb-
D1b也是中国黄淮麦区和春小麦的主要突变类
型,分别占到86.5%和51.5%[18-19]。Pinb-D1c在
其他的研究报告中是相对较少见到的[20]。陈锋
等[18]对140份春小麦仅发现5份材料是Pinb-
D1c,其中4份材料来源于青海。西藏和青海是比
邻地区,同属于青藏高原。Pinb-D1c 在西藏地方
品种中出现的频率非常高,很有可能意味着
Pinb-D1c起源于西藏,或者青藏高原。
西藏地方品种中,Pinb-D1c 类型与Pina-
D1b 类型的SKCS硬度值显著高于Pinb-D1b、
Pinb-D1p和野生型,而Pinb-D1c 类型与Pina-
D1b 类型SKCS硬度值之间差异不显著,Pinb-
D1b和Pinb-D1p 类型之间的SKCS硬度值也存
在5%的显著差异,且Pinb-D1b和Pinb-D1p 类型
的SKCS硬度值也显著高于野生型,这与前人研
究[21]的结果一致。
4 结 论
西藏121份地方品种籽粒硬度平均值为
43.73,硬度值大于60%的品种有43个,占总材
料中的35.5%;混合麦22个,占18.2%;软质麦
56个,比例为46.3%。符合优质饼干硬度特性的
品种有42种,达到34.7%。有2个材料的硬度
值极低,其籽粒硬度仅为2.34和5.35,分别为
Y1777和Y1859。Pina和Pinb基因有5种等位
变异组合类型:野生型、Pina-D1b 、Pinb-D1b、
Pinb-D1c、Pinb-D1p。 野 生 型 比 例 最 高,占
51.22%,26份材料为Pinb-D1c类型,占21.31%,
17份为Pinb-D1b类型,占13.93%,12份为Pina-
D1b类型,占9.84%,5份为Pinb-D1p类型,占
4.10%。各种组合类型的SKCS硬度值顺序为
·34·8期 李善富等:西藏小麦品种籽粒硬度遗传多样性
Pinb-D1c>Pina-D1b>Pinb-D1b>Pinb-D1p>野
生型。
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