全 文 :藏药吉子恩保(甘西鼠尾草)DNA提取方法比较
李文渊,王津慧,童 丽,杨 靖,热增才旦,索南邓登,杨 芳
(青海大学 医学院,青海 西宁810001)
摘 要:目的:建立藏药吉子恩保(甘西鼠尾草)DNA的提取方法,为进一步开展分子生药学研究奠定基
础。方法:比较SDS法和改良CTAB法,运用紫外分光光度计和电泳分析方法测定所得DNA样品的纯
度和浓度。结果与结论:两种方法中改良CTAB法所得的DNA质量较高。
关键词:吉子恩保;甘西鼠尾草;DNA提取
中图分类号:R285.5 文献标识码:A 文章编号:1673-2197(2015)07-0011-02
DOI:10.11954/ytctyy.201507005
收稿日期:2014-11-14
基金项目:青海省科技厅项目(2011-N-F19);青海大学中青年科研基金(2012-QYT-1)
作者简介:李文渊(1983-),女,硕士,青海大学讲师,研究方向为中藏药资源研究。
Comparative Study of Methods for Isolation of Total DNA from Tibetan
Medicine Jizi-Enbao(Salvia Przewalski Maxim.)
Li Wenyuan,Wang Jinhui,Tong Li,Yang Jing,Rezeng-Caidan,Suonan-Dengdeng,Yang Fang
(Medical Colege of Qinghai University,Xining 810001,China)
Abstract:Objective:To obtain a method for yielding DNA from tibetan medicine Jizi-Enbao(Salvia przewalski Maxim.),which
lie a foundation for further molecular experiments.Methods:Two different DNA extraction protocols,SDS protocol,and the im-
proved CTAB protocol,were examined and compared.The purity and concentration of DNA were detected by UV spectrophotomet-
ric analysising and agarose gel electrophoresis testing.Results and Conclusion:The DNA isolated by improved CTAB protocol
was with high quality in two different DNA extraction protocols.
Keywords:Jizi-Enbao;Salvia przewalskii Maxim;DNA extraction
甘西鼠尾草(Salvia przewalskii Maxim.)(药材名:甘
肃丹参)为唇形科鼠尾草属植物,藏药名吉子恩保(音译),
与大宗常用中药丹参为同科植物,其有效成分与中药丹参
相似,功能主治亦与丹参相同,在西南、西北地区甘西鼠尾
草普遍作为临床治疗心血管疾病中药丹参的替代品种[1]。
早在20世纪80年代,科研工作者就展开了鼠尾草属植物的
筛选工作,在“七五”国家重点科技攻关项目“丹参类专题研
究”中得出结论:综合比较测定结果,以甘西鼠尾的有效成
分含量高,药理作用最强,质量最好,植物资源丰富,且已有
商品在全国流通,值得推广应用[2]。
此外,甘西鼠尾草作为丹参药材的重要资源之一,有文
献报道其品质甚至超过正品丹参,但目前对于其开发利用
力度远远不够,研究多集中于有效成分含量测定[3]、简单药
理作用[4]、资源调查之类[5],用分子生物学方法对其遗传多
样性、资源评价、分子标记等方面的研究论文甚少。高质量
的DNA是开展上述工作的前提,本文拟研究获得高质量甘
西鼠尾草DNA的实验方法,为开展后续分子生药学[6]研究
奠定基础。
1 材料与试剂
1.1 材料
甘西鼠尾草材料分别采自青海省黄南藏族自治州、甘
肃武威市、甘肃省甘南州、青海省互助县,见表1。样品经青
海大学医学院药学系王津慧教授鉴定为甘西鼠尾草。硅胶
快速干燥后置于-20℃冰箱保存。
1.2 主要试剂
十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)(国药集团)、三羟甲基
氨基甲烷(Tris)(Solarbio)、β-巯基乙醇(AMRESCO)、ED-
TA(国药集团)、SDS(国药集团)、溴化乙锭(EB)(Sigma)、
琼脂糖(GENETECH),其它试剂为国产分析纯。
1.3 主要仪器
冷冻离心机(Eppendorf)、紫外可见分光光度计(上海精
科)、凝胶成像系统(Tanon)、电泳仪(北京市六一仪器厂)、
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水浴锅(东方电工)。
表1 供试材料信息
编号 来源 经度/纬度 海拔(m)
1
2
3
4
5
6
青海省互助扎龙口
青海省互助扎龙沟
甘肃武威市天祝县天堂镇
青海黄南州保安镇拉康村
青海黄南州隆务镇
甘肃省甘南州夏河县甘加乡
101.57/36.52
101.57/36.53
101.68/36.86
102.12/35.72
102.09/35.63
103.01/37.87
2340
2340
2200
2360
2408
2832
2 方法
2.1 SDS法
称取甘西鼠尾草干燥材料0.3g,置于液氮研磨成粉,加
入 SDS 抽 提 缓 冲 液 (100mmol/LTris-HCl(PH 8.0)、
50mmol/L EDTA(PH8.0)、50mmol/L NaCl、10mmol/Lβ-
巯基乙醇900μL和10%SDS 100μL,反复摇匀,于65℃水浴
1h。12 000r/min离心10min,取上清液。加入等体积的酚/
氯仿/异戊醇(25/24/1)摇匀,12 000r/min离心10min,取上
层溶液,加入2/3倍体积的冷异丙醇,摇匀,放入-20℃冰箱
中,30min。离心12 000r/min,5min,倒掉溶液,加入70%乙
醇洗涤2次最后将沉淀溶于50μL ddH2O中。
2.2 改良CTAB法
称取甘西鼠尾草干燥材料0.3g,经液氮冷冻后研磨成
粉末状,立即转入65℃预热后的900μLCTAB提取缓冲液
(2%CTAB,疏基乙醇)中,充分振摇使材料与提取液混合均
匀,于65℃保温90min,其间轻轻倒转离心管数次,冷却至
室温,加入等体积氯仿/异戊醇(24∶1)抽提,摇匀5~
10min,静置分相,4℃离心(10 000r/min,10min),将上清液
转入另一离心管中,重复以上步骤至两相分界明显,取上清
液加入新的1.5mL离心管中,加入500μL纯异丙醇(-20℃
冷冻)。沉降DNA,轻轻颠倒2~3次,可见白色絮状沉淀,-
20℃冰箱中静置15min,离心(12 000r/min,10min)。加入
500μL75%乙醇洗涤1次,纯乙醇洗涤1次,12 000r/min离
心5min,倒掉洗液,通风橱吹干约1h,待总DNA干燥后,加
入50μL ddH2O。
2.3 DNA质量检测
将DNA提取液稀释100倍后,用紫外分光光度计观测
在紫外光260nm和280nm处的吸收值 A260、A280,并以
A260/A280的比值鉴定纯度。DNA浓度(ng/μL)=A260
×50μg×稀释倍数,结果见表2。采用1.5%琼脂糖电泳,
EB染色,凝胶成像系统观察并拍照,见图1。
表2 不同提取方法DNA质量比较
样品
SDS
A260 A280 A260/A280 浓度(ng/μL)
改良CTAB法
A260 A280 A260/A280 浓度(ng/μL)
1 0.192 0.118 1.624 960 0.128 0.071 1.802 640
2 0.194 0.123 1.577 970 0.118 0.065 1.808 590
3 0.194 0.120 1.617 970 0.151 0.081 1.875 755
4 0.186 0.102 1.817 939 0.172 0.089 1.934 860
5 0.173 0.098 1.765 865 0.104 0.054 1.916 520
6 0.194 0.107 1.813 970 0.120 0.065 1.844 600
图1 不同提取方法DNA凝胶电泳
3 讨论
植物基因组DNA质量的好坏决定后续PCR实验的成
败,因此,植物基因组DNA的提取是分子生药学实验的一
个重要环节。本实验以藏药吉子恩保的原植物甘西鼠尾草
经硅胶快速干燥的新鲜叶片作为供试品材料,提取DNA作
为后续PCR反应的模板,根据文献报道,本实验尝试用步
骤较为简便的改良CTAB法和SDS法分别进行DNA的提
取。由表2可知,用SDS法提取的DNA得率普遍较高,但
是A260/A280比值多低于1.8,说明提取的DNA样品中存
在蛋白质或多酚污染;用改良CTAB法提取的DNA得率较
低,但A260/A280比值在1.8左右,说明 DNA的纯度较
高。如图1所示,用SDS法提取的DNA点样孔能看到明显
的亮光,说明样品中含有未去除的蛋白质。
在提取过程中,用改良CTAB法提取的DNA颜色呈乳
白至透明状,但用SDS法提取的DNA颜色普遍较深,呈棕
色至深棕色,可能是甘西鼠尾草中酚类及糖类杂质未被除
尽。综合考虑,虽然CTAB法比SDS法提取的DNA得率
低,但是高纯度的DNA才是本实验的目的,因此在这两种
方法中,改良CTAB法是较为理想的提取方法,其它提取方
法的发掘,还有待进一步研究。
参考文献:
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(责任编辑:魏 晓)
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