全 文 :麦类作物学报 2014,34(4):443-448
Journal of Triticeae Crops doi:10.7606/j.issn.1009-1041.2014.04.02
网络出版时间:2014-4-8
网络出版地址:http://www.cnki.net/kcms/doi/10.7606/j.issn.1009-1041.2014.04.02.html
普通小麦-中间偃麦草易位系08-738的鉴定
收稿日期:2013-11-26 修回日期:2014-03-02
基金项目:国家自然科学基金项目(30370770);四川省教育厅重点项目。
第一作者E-mail:lwj201176@126.com
通讯作者:傅体华(E-mail:futihua@sina.com)
李文静,葛 群,王 仙,唐雪琴,徐 杰,唐宗祥,任正隆,傅体华
(四川农业大学农学院,四川成都611130)
摘 要:中间偃麦草(Thinopyrum intermedium,2n=42)具有大穗多花和抗多种病害等特性,是小麦育
种的重要基因资源之一。为确定普通小麦川麦107与中间偃麦草杂交获得的遗传稳定品系08-738的染色体
组成,采用形态学、细胞遗传学和SSR分子标记对其进行了鉴定。形态学分析表明,08-738具有植株较矮和
小穗数较多的特点。细胞学观察表明,其染色体数目及构型为2n=42=21II。基因组原位杂交(GISH)和重
复序列原位杂交(FISH)结果表明,08-738含有20对小麦染色体和1对小麦-中间偃麦草小片段易位染色体,
易位位于小麦3DS的近末端,且该外源片段可能来源于中间偃麦草的Js染色体组。SSR标记分析显示,位于
3DS 6-0.55-1.00之间的SSR标记xcfd141 能在08-738和中间偃麦草之间扩增出一条特异条带,xcfd141 可
作为该中间易位片段鉴定和选择的标记。
关键词:小麦;中间偃麦草;易位;GISH;FISH;SSR
中图分类号:S512.1;S334 文献标识码:A 文章编号:1009-1041(2014)03-0443-06
Identification of a Translocation Line 08-738between
Common Wheat-Thinopyrum intermedium
LI Wenjing,GE Qun,WANG Xian,TANG Xueqin,XU Jie,
TANG Zongxiang,REN Zhenglong,FU Tihua
(Agronomy Colege of Sichuan Agricultural University,Chengdu,Sichuan 611130,China)
Abstract:Thinopyrum intermedium (2n=42)is an important genetic resource for wheat improve-
ment due to its large and multiflorous spikes and resistances to various wheat diseases.In order to ac-
curately identify the chromosome constitution of the genetic stable wheat line 08-738derived from the
progenies of Chuanmai 107and Thinopyrum intermedium,analyses on the morphology,cytology and
SSR marker on wheat line 08-738were carried out.The result of morphology showed that line 08-738
had shorter plant height and more spikelets per spike than its recurrent wheat parent.Cytogenetic a-
nalysis indicated that this line was stable with chromosome number and configuration of 2n=42=
21II.The sequential GISH and FISH analysis indicated that the chromosome constitution of line 08-
738consisted of 20pairs of wheat chromosomes and one pair of smal segmental translocation chromo-
somes of wheat and Th.intermedium,and the translocation segment was closed to telomere of wheat
3DS and might be derived from the Js genome.The SSR marker analysis showed that SSR primer
xcfd141located on 3DS 6-0.55-1.00could amplify one specific band between line 08-738and Th.inter-
mediumL.Thus,primer xcfd141could be used as the marker to select and identify this smal translo-
cation segment in wheat background.
Key words:Wheat;Thinopyrum intermedium;Translocation;GISH;FISH;SSR
中间偃麦草(Thinopyrum intermedium,2n
=42)属禾本科小麦亚族,为多年生野生草本植
物,再生能力强,籽粒蛋白质含量高,大穗多花,根
系发达,对多种病害具有良好的抗性,是国内外小
麦育种中使用较多和较为成功的小麦野生近缘种
植物之一[1]。目前,人们普遍用EeEeEbEbStSt或
JJJSJSStSt表示中间偃麦草的染色体组[2-3]。吉万
全等[2]认为,中间偃麦草有两个亲缘关系较近的
染色体组且,分别与百萨偃麦草(Th.bessarabi-
cum,2n=2x=14,EbEb)和二倍体长穗偃麦草
(Th.elongatum,2n=2x=14,EeEe)染色体组相
似,还有一个亲缘关系较远的染色体组可能来源
于拟鹅观草(Pseudoroegneria strigosa,2n=2x
=14,StSt);Chen等[3]通过原位杂交技术分析中
间偃 麦 草 的 染 色 体 组,认 为 其 染 色 体 组 为
JJJsJsStSt,其J染色体组与长穗偃麦草和百萨偃
麦草染色体组有关,Js 染色体组则可能是长穗偃
麦草或百萨偃麦草染色体组通过分化而来,而St
染色体组则比较确定,是来自于拟鹅观草。通过
中间偃麦草与小麦进行杂交,已经获得许多具有
多种优良农艺性状、高产、优质、抗病的中间偃麦
草-小麦的代换系、附加系、易位系以及(部分)双
二倍体等中间材料[4],为小麦新品种培育提供了
大量的基础材料或亲本。在这些中间材料中,由
于易位系(特别是小片段易位系)只导入优良的目
标性状染色体理想片段,因而是作物改良最有效
的途径之一[5]。
自1956年Sear[6]利用X射线照射法将小伞
山羊草的抗叶锈基因易位到小麦的6B染色体上
并获得了抗叶锈的易位系以来,小麦近缘种属中
的很多有益基因已经以各种易位的形式被转移到
小麦中,如崔承齐等[7]通过辐射将大赖草的抗赤
霉病基因转移至小麦中,Liu等[8]将中间偃麦草
的抗秆锈病基因转移到小麦中。
原位杂交技术是鉴定普通小麦背景中近缘物
种染色质最常用的方法。Friebe等[9]利用分带-
原位杂交技术分析了一个普通小麦-中间偃麦草
部分双二倍体的染色体组成。刘道峰等[10]采用
顺序GISH-FISH 鉴定了小麦-中间偃麦草易位
材料H96276-2的外源染色体片段位于小麦的2B
染色体短臂上。郝薇薇等[11]利用原位杂交技术
鉴定了一批抗条锈病的小麦-十倍体长穗偃麦草
易位系材料,发现在稳定的抗条锈病材料中都含
有一个相同的易位片段且位于小麦的4DS末端。
这些都说明原位杂交是识别外源染色体片段的十
分有效的技术。SSR(Simple sequence repeat)技
术由于操作简单且具有高度多态性、重复性和稳
定性好 [12]等优点,近年来,在植物的基因定
位[13]、遗传多样性分析[14]、外源染色质的鉴
定[15-16]等方面得到了广泛的应用。
本研究对来源于普通小麦-中间偃麦草杂种
后代的稳定品系08-738进行了 GISH、FISH 和
SSR分子标记鉴定,旨在为小麦品种改良、新品
种培育和遗传研究提供新种质或基础材料。
1 材料与方法
1.1 材 料
本研究所用材料包括:普通小麦品种川麦
107、中国春、中间偃麦草(Th.intermedium)、拟
鹅观草(Pse.strigosa)、百萨偃麦草(Th.bessara-
bicum)以及来自川麦107与中间偃麦草杂交后代
的稳定品系08-738。其中,川麦107和中国春由
本实验室提供,中间偃麦草、拟鹅观草由美国华盛
顿农业种质资源部惠赠,百萨偃麦草由四川农业
大学小麦所提供。
1.2 方 法
1.2.1 细胞学鉴定及原位杂交制片
根尖细胞学检测:种子在23℃的恒温培养箱
中培养至一定根长,选取合适的根尖在冰水混合
物中处理22~24h后用卡诺氏Ⅰ固定液固定,在
1mol·L-1 HCl中(60℃)解离7~10min后用
席夫试剂染色,醋酸洋红复染,压片,镜检。用于
原位杂交制片的根尖则于N2O中处理1.5~2h,
在90%的醋酸中固定10min左右后直接酶解制
片或转移至70%的酒精中于-20℃冷藏备用。
花粉母细胞减数分裂中期Ⅰ(PMC MI)染色体构
型鉴定则选取合适的幼穗用卡诺氏Ⅱ固定液固定
后用醋酸洋红染色,压片,镜检。
1.2.2 基因组DNA的提取及探针标记
08-738、川麦107、中间偃麦草、拟鹅观草、百
萨偃麦草和中国春的基因组DNA提取方法参考
Rogers等人[17]的CTAB法,略加修改。分别使
用中间偃麦草、拟鹅观草及百萨偃麦草全基因组
DNA、Aegilops tauschii重复序列pAs1和黑麦
·444· 麦 类 作 物 学 报 第34卷
重复序列pSc119.2作为探针。中间偃麦草、拟鹅
观草及百萨偃麦草全基因组DNA使用DIG-Nick
Translation Mix(German,Roche)进行标记,重
复序列pAs1使用 Texas Red-5-dUTP(Invitro-
gen)进行标记,重复序列pSc119.2利用 Alexa
Fluor-488-5-dUTP(Invitrogen)进行标记。探针
标记的实验方法参照 Han等[18]描述的方法。封
阻的中国春DNA用高压打断5~10min。
1.2.3 GISH-FISH分析
GISH参照 Gustafson[19]等的方法,略加修
改。杂交液包含:100%去离子甲酰胺7μL,20×
SSC 1.5μL,鲑鱼精 DNA 1.5μL,封阻 DNA
1μL,探针 DNA 1μL,50%的葡聚糖硫酸盐
4μL。GISH 检测后,染色体制片褪色,再进行
FISH杂交,操作流程参照 Han等[18]的方法。使
用Nikon Eclipse 80i显微镜观察和照相。
1.2.4 引物选择及SSR扩增
选用http://wheat.pw.usda.gov网站公布
的位于小麦 3D 染色体上的 15 对 SSR 引物
(xbarc42,xbarc71,xgwm114,xgwm161,xgwm183,
xgwm2,xgwm3,xgwm383,xgwm456,xgwm497,
xgwm52,xgwm645,xgwm664,xgwm71,xcfd141),
参照孙现军等[20]的方法对供试材料进行PCR扩
增和聚丙烯凝胶电泳检测。
2 结果与分析
2.1 08-738的形态学与细胞学观察结果
田间农艺性状调查发现,08-738平均株高为
76.5cm,平均每穗小穗数为23个,比其亲本川麦
107(86.8cm)矮10cm左右,小穗数多3个左右,
同时其顶部小穗较密(图1)。细胞学检测结果表
明,08-738的根尖染色体数目为2n=42,其花粉
母细胞减数分裂中期I(PMC MI)的染色体配对
为2n=42=21Ⅱ,未发现其他的染色体配对构
型,说明08-738是一个在细胞学上稳定的品系。
左:川麦107;右:株系08-738 Left:Chuanmai 107;Right:line 08-738
图1 川麦107与株系08-738的植株形态(A)和小穗形态(B)
Fig.1 Morphology of plant(A)and spike(B)of common wheat Chuanmai 107and line 08-738
2.2 GISH-FISH分析结果
以中间偃麦草DNA为探针,普通小麦中国
春DNA为封阻进行了 GISH 分析。结果显示,
08-738有丝分裂中期细胞中有一对染色体的短
臂近端部清晰的显示出点状的黄绿色荧光杂交信
号,经显微测量,信号区的长度占整条染色体臂
的10%,端部还有10%的部分与其余的染色体都
未被中间偃麦草DNA探针杂交上(图2A)。表
明08-738为小麦-中间偃麦草染色体近端部的小
片段易位系。采用重复序列探针pSc119.2和
pAs1对经GISH分析过的同一张染色体制片进
行FISH分析(图2B),结果显示,发生片段易位
的染色体为小麦的3D短臂近端部,即08-738为
小麦3D-中间偃麦草染色体小片段易位系。
为了进一步明确易位片段来自于中间偃麦草
的哪个染色体组,又采用拟鹅观草、百萨偃麦草的
基因组DNA分别做探针,对08-738的染色体进
行GISH分析。结果显示,08-738的42条染色体
均未出现荧光杂交信号(图2C和2D),表明该易
位片段可能来源于中间偃麦草的Js染色体组。
2.3 SSR标记结果
SSR标记结果表明:15对SSR引物均能在
普通小麦中国春、亲本川麦107、08-738以及中间
偃麦草的基因组DNA中扩增出清晰的条带,其
·544·第4期 李文静等:普通小麦-中间偃麦草易位系08-738的鉴定
中14对引物在08-738植株中扩增出的带型与其
亲本川麦107中扩增的带型完全相同,只有引物
xcfd141 在08-738植株中扩增出一条只与中间偃
麦草相同的特征带(图3),该条带经多次重复都
稳定出现。由于该条带只在08-738与中间偃麦
草中出现,在亲本川麦107中不出现,说明该扩增
片段可能来源于中间偃麦草,因此引物xcfd141
可作为识别和鉴定该易位片段的标记。
A:中间偃麦草DNA作为探针,箭头所示的黄绿色杂交信号为中间偃麦草染色质;B:pAs1(红色)和pSc119.2(绿色)的双色荧光原
位杂交,箭头所示为3D短臂近端部;C和D:分别以拟鹅观草和百萨偃麦草DNA作为探针,未显示任何杂交信号
A:GISH pattern using the genome of Thinopyrum intermediumas probes,yelow-green hybridization signal of Th.intermedium
chromatin was pointed out by arrows;B:FISH pattern using pAs1(red)and pSc119.2(green)as probes,arrows indicated terminals of
3DS;C and D:GISH pattern using the genome of Pse.strigosaand Th.bessarabicumas probes respectively,without hybridization signal
图2 株系08-738GISH核型(A,C和D)和FISH核型(B)(2n=42)
Fig.2 GISH(A,C and D)and FISH(B)on somatic metaphase cels from root tips of line 08-738
1:中国春CS;2:川麦107Chuanmai 107;3:08-738;4:中间
偃麦草Th.intermedium;M:DNA marker 2000
图3 xcfd141 扩增产物,箭头所示为特征带
Fig.3 Amplification patterns of primer xcfd141
(the arrow indicated the specific band)
3 讨 论
本试验采用 GISH-FISH 相结合的分析方
法,确定在08-738中存在一个可能为中间偃麦草
染色质的中间小片段易位,位于3D短臂近末端;
进一步利用拟鹅观草和百萨偃麦草的基因组
DNA分别作探针对08-738进行 GISH 分析,结
果均未出现杂交信号。Chen等[3]利用中间偃麦
草可能供体的全基因组DNA作探针,对中间偃
麦草染色体组构成进行GISH分析认为,长穗偃
麦草和百萨偃麦草染色体组可能是中间偃麦草J
染色体组的供体,Js 染色体组则可能是二者染色
体组分化而来。因此推测08-738中的易位染色
体片段可能来源于中间偃麦草的Js染色体组。
由于在远缘杂交中小麦染色体或外源染色体
·644· 麦 类 作 物 学 报 第34卷
存在结构重排[21],甚至能诱导出新的基因[22],因
此单用GISH-FISH法鉴定小麦背景中的小片段
杂交信号的外源染色质来源,还不充分,将顺序
GISH-FISH法与SSR、RFLP[23-24]等分子标记方
法相结合,才会使鉴定的结果更加可靠。已有研
究表明普通小麦基因组的SSR引物在黑麦、斯卑
尔脱小麦等小麦近缘种属间均具有一定的通用
性[12]。王黎明等[25]研究发现普通小麦的SSR引
物在中间偃麦草中也具有一定的通用性。本研究
采用小麦3D上的SSR标记对研究材料与亲本进
行扩增,发现绝大多数引物在08-738植株中扩增
出的带型与其亲本川麦107中扩增的带型完全相
同,而偃麦草扩增的带型没有规律性,只有引物
xcfd141 在08-738植株中扩增出一条只与中间偃
麦草相同的特征带,而且重复性好,说明具有杂交
信号的小片段确实来源于中间偃麦草染色体。根
据Sourdile等[26]发表的小麦 SSR 物理图谱,
xcfd141 定位于3DS 6-0.55-1.00之间。结合原
位杂交结果,xcfd141 位点可能更接近于3D的末
端。因此标记xcfd141 可作为该易位片段追踪和
鉴定的标记。
远缘杂交中外源染色体与小麦染色体由于亲
缘关系较远,减数分裂期间相互不能配对而形成
单价体,单价体易发生着丝粒间的断裂和融合,从
而形成臂间易位[27-28],但目前对于外源物种与栽
培物种染色体之间发生染色体易位的机理还不是
很清楚。刘道峰等[10]和Zhang等[29]研究认为片
段易位易发生在染色体的端部。发生在染色体臂
中间的片段易位,特别是小片段易位应该是比较
罕见的现象,因为它至少要经过两次断裂,然后准
确地连接。然而在远缘杂种后代及辐射诱导的子
代中,有时发现中间易位会以较低的频率出
现[30-31]。一个著名的例子就是Jiang and Gil[32]
在赖草物种与小麦杂种后代中发现的“斑马”染色
体,该染色体由四部分赖草物种染色体片段和四
部分小麦染色体片段,包括小麦5A染色体的着
丝粒构成,它们是非部分同源染色体之间的易位。
在其他物种与小麦的远缘杂交后代中也会出现非
部分同源染色体之间的易位[30],而且物种内染色
体之间也会发生这种非同源易位现象,如小麦和
黑麦的第四、第五和第七同源群染色体之间的环
状易位[33]。在08-738中,中间偃麦草种质以一
个很小的片段易位到3D的近末端处。这些结果
表明在植物物种的染色体上可能存在易位热点染
色体或染色体位点,容易导致染色体间发生结构
重排,促进物种的进化。因此利用创制的材料深
入研究异源染色体之间的易位机制,对于遗传学
的基础研究以及异源染色体的种间转移及其应用
都具有一定的意义[10]。
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·844· 麦 类 作 物 学 报 第34卷