免费文献传递   相关文献

13-脂氧合酶在拟南芥叶片衰老中的作用分析



全 文 :2013年11月 四川大学学报(自然科学版) Nov.2013
第50卷 第6期 Journal of Sichuan University(Natural Science Edition) Vol.50 No.6
收稿日期:2012-12-09
基金项目:国家自然科学基金(91017004,31170252,31070238)
作者简介:孙炎锋(1981-),男,河南新密人,博士研究生,主要研究方向为植物生理与分子生物学.
通讯作者:林宏辉.E-mail:honghuilin@hotmail.com
doi:103969/j.issn.0490-6756.2013.06.039
13-脂氧合酶在拟南芥叶片衰老中的作用分析
孙炎锋1,2,吕 东2,王 丽2,苗 琛2,林宏辉1
(1.四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064;
2.河南大学生命科学学院棉花生物学国家重点实验室,开封475004)
摘 要:促进叶片衰老是植物激素茉莉酸(JA)的一个重要生物学功能.在植物体内,JA最初
经13-脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)的作用而形成.RT-PCR发现,在发生衰老的叶片中,
LOX3、LOX4、LOX6基因转录发生明显上调,而LOX2在叶片衰老后期明显下调.构建了拟
南芥9-LOX活性缺失突变体lox1/lox5,利用该材料以亚麻酸为底物测定了拟南芥叶片发育
不同阶段13-LOX的活性,发现:与幼嫩叶片相比,衰老叶片中 LOX活性明显增强.推测
LOX3、LOX4、LOX6基因在叶片自然衰老中JA的合成中具有重要作用,而LOX2基因在衰
老后期作用减弱.
关键词:衰老;脂氧合酶;茉莉酸;拟南芥
中图分类号:Q945   文献标识码:A   文章编号:0490-6756(2013)06-1391-06
Analysis of the role of 13-Lipoxygenases in Arabidopsisleaf senescence
SUN Yan-Feng1,2,LV Dong2,WANG Li2,MIAO Chen2,LIN Hong-Hui1
(1.Key Laboratory of Bio-resources and Eco-Environment of Ministry of Education,
Colege of Life Sciences,Sichuan University,Chengdu 610064,China;
2.Colege of Life Sciences,State Key Laboratory of Cotton Biology,Henan University,Kaifeng 475004,China)
Abstract:Promotion of leaf senescence is one of the most important function of the phytohormone Jas-
monic acid(JA).In plants,JA is initialy synthesized by the reaction catalyzed by 13-lipoxygenase
(LOX).Four genes are predicted to encode 13-LOX in Arabidopsis genome,however,little is known a-
bout their role in JA regulated leaf senescence.Expression pattern analysis by RT-PCR showed that
LOX3,LOX4 and LOX6 genes expression were significantly enhanced in senescing leaves,while the ex-
pression of LOX2genes decreased in late stage of leaf senescence dramaticaly.The 9-LOX activity defi-
cient mutant lox1/lox5 was acquired and the 13-LOX activities in leaves at different developmental sta-
ges were further measured using linolenic acid as substrate.The activity in senescing leaves was signifi-
cantly higher than that in developing young leaves.The results indicated that LOX3,LOX4,LOX6
might play important roles in JA synthesis during leaf senescence and the importance of LOX2might be
impaired at the late stage of this process.
Key words:senescence,lipoxygenase,JA,Arabidopsis
  四川大学学报(自然科学版)   第50卷
1 引 言
植物激素茉莉酸(Jasmonate acid,JA)及茉莉
酸类物质具有广泛的生物学功能,促进衰老是其最
早被发现的功能之一[1,2].研究发现:培养基中添
加30μM 的JA可以显著促进野生型拟南芥叶片
衰老的发生,并诱导衰老相关基因如SAG12等的
表达,而对JA不敏感突变体coi1则没有这种效
果[3].Kong等在水稻中鉴定到一个新的锌指蛋
白,该蛋白是JA信号通路中的一个负调节因子,
它的缺失显著推迟了植株衰老的起始[4].总之,
诸多证据表明:JA在植物叶片衰老中具有重要调
节作用.
脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX,EC 1.13.
11.12)是一类广泛存在于动、植物中的脂肪酸双加
氧酶,催化含有顺,顺-1,4-戊二烯结构的多元不饱
和脂肪酸加氧反应[5-7].在植物中,根据加氧反应
发生在脂肪酸C原子的位置,可分为13-LOX和9-
LOX [8].JA最初由亚麻酸在13-LOX的催化下形
成氢过氧化脂肪酸,之后在一系列酶的作用下而形
成[9].
模式植物拟南芥基因组中推测共六个基因编
码LOX蛋白,依次命名为LOX1-6,最近生化分析
试验证实:LOX1、LOX5 属于9-LOX,LOX2、3、
4、6属于13-LOX[10,11].在底物识别方面,13-LOX
选择性地氧化亚麻酸,而9-LOX对亚麻酸、亚油酸
则无选择性[10].越来越多的研究发现,LOX在植
物生长发育等诸多过程中都具有重要作用.如:
LOX3、LOX4参与了拟南芥中JA调节的雄性育
性,而LOX2、LOX6则与此无关[12].Chauvin等结
合遗传学、化学等方法分析发现:13-LOX的4个
成员对机械伤害诱导的拟南芥叶片JA快速合成
均有贡献,并且LOX6在植物远端应答伤害信号
中具有独特作用[13].最近的研究还发现:拟南芥
LOX6根部合成的脂氧素在植株应答生物胁迫和
非生物胁迫中具有重要作用[14].同时,9-LOX的
生物学功能也被不断发现.如:有研究发现9-LOX
参与了拟南芥侧根发育及防御反应[15],来自拟南
芥根部LOX5合成的脂氧素则可以促进蚜虫在叶
片的出现[16],而在保卫细胞有较强表达的LOX1
在不依赖 ABA的调节气孔运动和免疫反应的脂
氧素途径中具有重要作用[17].
在衰老的叶片中JA含量增高了4倍[3],为了
研究植物叶片衰老过程中参与JA合成的LOX,我
们通过检测发生衰老叶片中与JA 合成相关13-
LOX基因的表达、叶片发育不同阶段LOX酶活
性,初步分析了可能参与拟南芥叶片衰老过程中
JA合成的LOX,为进一步分析JA调控的植物衰
老过程打下了基础.
2 材料与方法
2.1 实验材料
拟南芥(Arabidopsis thaliana)Col-0生态型
和突变体lox1-3(SALK_012188)、lox5-3(SALK_
050933)购自拟南芥种质资源中心(ABRC).人工
气候室条件:温度20~22℃,光暗周期16h/8h.
2.2 实验方法
2.2.1 拟南芥LOX家族基因进化树分析及蛋白
质序列比对 把LOX蛋白质序列以FASTA格式
输入CLUSTAL X 2.1[18],进行多序列比对,结果
保存为“phy”格式的文件以用做下面的分析或者
用Bioedit软件进行处理.使用系统发育分析软件
phylip 3.6中的SEQBOOT程序生成自举(boot-
strap)值100的数据集,然后使用 Maximum Like-
lihood(ML)方法构建出进化树,最后通过 Tree-
View软件查看结果.
2.2.2 LOX酶活性测定 参照Axelrod等[19]和
Bauelo等[20]的方法,稍作修改.取不同时期拟南
芥叶片各0.3g,液氮研磨,将粉末加入提取缓冲液
(0.2M 磷酸缓冲液和0.99mM EDTA以1∶2混
合而成)中.14000g,4℃离心20min,收集上清储
存于-80 ℃.50mM Tris-HCl,pH 7.4,10.2
mM亚麻酸母液及粗酶提取液组成3mL反应体
系.室温(25℃)反应,用分光光度计读取234nm
处吸光值.
2.2.3 RNA提取和半定量RT-PCR检测 取不
同时期材料,提取总RNA[21].cDNA合成采用In-
vitrogene公司反转录体系合成cDNA第一条链.
稀释后进行 RT-PCR反应引物序列见表1.Ac-
tin2:94℃预变性5min,一个循环;94℃变性30
s,56℃ 退火40s,72℃ 延伸40s,25个循环.
LOX2基因:94℃预变性5min,一个循环;94℃
变性30s,56℃ 退火40s,72℃ 延伸40s,27个
循环.LOX3和LOX4:94℃预变性5min,一个循
环;94℃变性40s,56℃ 退火30s,72℃ 延伸40
s,31个循环.LOX6:94℃预变性5min,一个循
环;94℃变性40s,56℃ 退火40s,72℃ 延伸40
s,29个循环.
2931
第6期    孙炎锋,等:13-脂氧合酶在拟南芥叶片衰老中的作用分析  
2.2.4 lox1/lox5 双突变体的构建和鉴定 以
lox1-3、lox5-3纯合缺失突变体[22]为亲本作杂交,
所得种子自交一代,提取F2代植株DNA,以基因
特异 引 物 (从 网 站http://signal.salk.edu/td-
naprimers.2.html获得)和 T-DNA 特异引物
LBa1进行PCR反应,鉴定获得纯合缺失双突变
体.
表1 引物序列
Tab.1 Primer sequences
基因名称 登录号 上游引物 下游引物
LOX1  AT1G55020 CTGAGCTTGCCTCATCCTAATGGAG  ACCACCACCATTGATCAAGATTTGC
LOX2  AT3G45140 ACGCCAGGCTATGATGCTACG  TGTTCCGCACTTCACTCCACC
LOX3  AT1G17420 CTATGTATGTGCCACGAGACG  AACGCTTGTTGTACGGAGAAT
LOX4  AT1G72520 TTCCTTACCCTAGACGCTGTC  AGACCTGGTCCGTAGATTTCA
LOX5  AT3G22400 CTTATTACAACGACTTGGGTGC  TGTCAGGCAAGGGATACTTCA
LOX6  AT1G67560 AGAAGTCAACCATGCCTACCT  ATAACGGCTGGAGTGTCATAT
Actin2  AT3G18780 TTCCTCATGCCATCCTCCGTCTT  CAGCGATACCTGAGAACATAGTGG
3 结果与分析
3.1 拟南芥脂氧合酶家族基因进化树分析
从图1可以看出:LOX1、LOX5明显与其它四
个成员相分开,这与基于催化位点特异性而划分的
9-LOX和13-LOX相一致.在其他四个成员中,
LOX2与其它三 个 成 员 遗 传 距 离 较 远,并 且
LOX3、LOX4同源性最高.蛋白质序列比对(图2)
结果也表明:LOX1、LOX5与家族其他成员之间氨
基酸一致度(identity)明显较低,而二者之间的一
致度则较高.
图1 拟南芥脂氧合酶基因家族进化树分析
Fig.1 Phylogenetic tree analysis of lipoxygenase gene
family in Arabidopsis thaliana
3.2 不同发育时期叶片中13-LOX 基因表达检测
利用RT-PCR检测了13-LOX各基因的表达,
结果如图3所示.可以看出:LOX3、LOX4、LOX6
基因在衰老叶片中转录明显增强,尤其是LOX6.
LOX2基因在刚发生衰老叶片中的表达水平与之
前两个时期相当,但到衰老的后期,其在叶片中的
表达被显著下调.
图3 RT-PCR检测13-LOX基因在不同发育时
期叶片中的转录表达水平
幼嫩叶片(expanding leaf,EL);完全展开又没发生衰老
的叶片(non-senescing leaf,NS),约1/4发生黄化,处于
衰老早期的叶片(early senescence,ES);超过1/2叶片
黄化,处于衰老后期的叶片(late senescence,LS)
Fig.3 RT-PCR analysis of 13-LOX genes in
leaves at different developmental stages
3931
  四川大学学报(自然科学版)   第50卷
图2 拟南芥LOX家族蛋白质序列比对
Fig.2 Alignment of Arabidopsis lipoxygenase protein sequences
3.3 lox1/lox5双突变体的构建和鉴定
为了进一步检测与JA合成相关的13-LOX活
性,构建了9-LOX活性缺失突变体lox1/lox5.从
图3可以看出:用LOX1、LOX5 T-DNA插入缺失
纯合突变体lox1-3、lox5-3作杂交,鉴定获得了纯
合双突变体,RT-PCR检测发现:双突变体中两基
因的转录被完全干扰.
4931
第6期    孙炎锋,等:13-脂氧合酶在拟南芥叶片衰老中的作用分析  
图4 lox1/lox5双突变体的鉴定
A:lox1-3、lox5-3T-DNA插入位置示意图;B:RT-PCR检测野
生型(WT)和lox1-3/lox5-3双突变体中LOX1、LOX5表达
Fig.4 Identification of double mutant lox1/lox5 by
RT-PCR
(A)Location of T-DNA insertion sites in lox1-3 and lox5-3.
(B)RT-PCR analysis of the LOX1 and LOX5 expression in
wild type(WT)and lox1-3/lox5-3 mutant.
3.4 不同发育时期拟南芥叶片13-LOX活性检测
利用获得的9-LOX活性缺失突变体lox1-3/
lox5-3,以亚麻酸为底物,检测了如图3所示四个
时期叶片中13-LOX酶活性,结果如图5所示.可
以看出:发生衰老的叶片中13-LOX活性明显要比
未发生衰老叶片中的高.
图5 拟南芥不同发育阶段叶片13-LOX活性检测
Fig.5 13-LOX activities in Arabidopsis leaves at dif-
ferent developmental stages
4 讨 论
到目前为止,多方面的证据表明JA参与调节
了植物叶片的衰老过程,然而对其中的机制仍然知
之甚少.在发生衰老叶片中JA的含量增加4倍,
其合成途径也被激活.作为JA合成步骤的第一个
酶,LOX家族哪些成员参与了该过程中JA的合
成,各自贡献有多少?尽管已有报道涉及,然而结
果存在较大差异[3,23,24].主要原因可能有:所采用
的材料不同(如自然衰老的叶片[3,24]、暗处理、其他
胁迫处理诱导衰老的叶片[23]);采用的技术方法
(RT-PCR、Northern Blot、Microarray);及对脂氧合
酶本身认识的限制(如之前人们对9-LOX、13-LOX
的划分及JA合成途径认识较模糊,生物信息学对基
因组中LOX编码基因的预测).因此,有必要对该
过程中参与JA合成的13-LOX基因进行分析.
已有的研究表明:虽同为13-LOX,参与JA的
合成,但各成员之间既有协作(部分功能冗余),又
有分工,可能共同或者独立地参与了JA调控的生
物学过程[12,13].在衰老叶片中,LOX3、LOX4、
LOX6基因转录被显著、持续激活,对LOX2而言,
在叶片衰老早期,其转录水平与之前相当,而到衰
老后期,其转录被明显下调(图3).Buchanan-
Wolaston等报道在衰老早期,LOX2转录有一个
瞬时的增高[23],这可能与取材方法、时期等有关.
与野生型相比,山梨醇诱导的LOX2基因 RNAi
植株离体叶片黄化过程被延迟,在自然衰老过程中
则无明显差异[24],推测LOX2在叶片自然衰老尤
其是后期阶段可能作用不大或者明显减弱,而其他
三个基因作用相对较大,尤其是对JA介导的叶片
衰老而言.此外,我们得到的13-LOX单个基因功
能缺失突变体在叶片自然衰老过程中与野生型并
无明显差异,构建双重、多重基因突变体并对其衰
老叶片中JA含量、衰老进程等进行综合分析或将
有助于我们理解13-LOX各成员在JA介导的叶片
衰老中的作用和各自的贡献.
Bauelos等指出:与开花前后叶片中LOX活性
变化不同,拟南芥发生衰老叶片中LOX活性的大幅
“增高”大部分可能本质上不是酶引起而是由于其他
物质的存在[20].我们对粗提酶液86℃处理1h后
几乎检测不到234nm处吸光值的变化或者与对照
相比无显著变化,这可能是取材、蛋白提取等方法不
同所致.总之,我们的实验为进一步分析LOX参与
的JA调控植物叶片衰老过程打下了基础.
5931
  四川大学学报(自然科学版)   第50卷
致 谢 感谢安阳工学院刘震博士在生物信息学
分析上的指导和帮助.
参考文献:
[1] Ueda J,Kato J.Isolation and identification of a se-
nescence-promoting substance from wormwood(Ar-
temisia absinthiumL.)[J].Plant Physio,1980,66
(2):246.
[2] Jasmonates P B.Hormonal regulators or stress fac-
tors in leaf senescence?[J].J Plant Growth Regula-
tion,1990,9(1-4):57.
[3] He Y,Fukushige H,Hildebrand D F,et al.Evi-
dence supporting a role of jasmonic acid in Arabidop-
sis leaf senescence[J].Plant Physio,2002,128(3):
876.
[4] Kong Z,Li M,Yang W,et al.A novel nuclearlocal-
ized CCCH-type zinc finger protein,OsDOS,is in-
volved in delaying leaf senescence in rice[J].Plant
Phys,2006,141(4):1376.
[5] Schneider C,Pratt D A,Porter N A,et al.Control
of oxygenation in lipoxygenase and cyclooxygenase
catalysis[J].Chem Biol,2007,14(5):473.
[6] Brash A R.Lipoxygenases:occurrence,functions,
catalysis,and acquisition of substrate[J].J Biol
Chem,1999,274(34):23679.
[7] Feussner I,Wasternack C.The lipoxygenase path-
way[J].Annu Rev Plant Biol,2002,53:275.
[8] Andreou A,Feussner I.Lipoxygenases:structure
and reaction mechanism[J].Phytochemistry,2009,
70(13-14):1504.
[9] Wasternack C.Jasmonates:an updateon biosynthe-
sis,signal transduction and action in plant stress re-
sponse,growth and development[J].Ann Bot,
2007,100(4):681.
[10] Bannenberg G,Martínez M,Hamberg M,et al.
Diversity of the enzymatic activity in the lipoxygen-
ase gene family of Arabidopsis thaliana[J].Lip-
ids.2009,44(2):85.
[11] Umate P.Genome-wide analysis of lipoxygenase
gene family in Arabidopsis and rice[J].Plant Sig-
nal Behav,2011,6(3):335.
[12] Caldelari D,Wang G,Farmer E E,et al.Arabido-
pis lox3lox4double mutants are male sterile and
defective in global proliferative arrest[J].Plant
Mol Biol,2011,75(1-2):25.
[13] Chauvin A,Caldelari D,Wolfender J L,et al.Four
13-lipoxygenases contribute to rapid jasmonate syn-
thesis in wounded Arabidopsis thaliana leaves:a
role for lipoxygenase 6in responses to long-distance
wound signals[J].New Phytol,2013,197(2):
566.
[14] Grebner W,Stingl N,Oenel A,et al.Lipoxygen-
ase 6-dependent Oxylipin Synthesis in Roots is re-
quired for abiotic and biotic Stress Resistance of
Arabidopsis thaliana[J].Plant Physiol,2013,161
(4):2159.
[15] Velosilo T,Mart′nez M,Lo′pez M A,et al.Oxy-
lipins produced by the 9-lipoxygenase pathway in
Arabidopsis regulate lateral root development and
defense responses through a specific signaling cas-
cade[J].Plant Cel,2007,19(3):831.
[16] Nalam V J,Keeretaweep J,Sarowar S,et al.Root-
derived oxylipins promote green peach aphid per-
formance on Arabidopsis foliage[J].Plant Cel,
2012,24(4):1643.
[17] Montilet J L,Leonhardt N,Mondy S,et al.An
abscisic Acid-independent oxylipin pathway controls
stomatal closure and immune defense in Arabidop-
sis[J].PLoS Biol,2013,(in press).
[18] Larkin M A,Blackshields G,Brown N P,et al.
Clustal W and Clustal X version 2.0[J].Bioinfor-
matics,2007,23(21):2947.
[19] Axerold B,Cheesbrough T M,Laakso S.Lipoxy-
genase from Soybeans[J]. Methods Enzymol,
1981,71:441.
[20] Bauelos G R,Argumedo R,Patel K,et al.The
developmental transition to flowering in Arabidop-
sisis associated with an increase in leaf chloroplastic
lipoxygenase activity[J].Plant Sci,2008,174(3):
366.
[21] 许墨耘,席德慧,刘名,等.本生烟感染TNV后ET/
JA依赖的防御信号的初步研究[J].四川大学学
报:自然科学版,2011,48(1),241.
[22] Alonso J M,Stepanova A N,Leisse T J,et al.Ge-
nome-wide insertional mutagenesis of Arabidopsis
thaliana[J].Science,2003,301(5633):653.
[23] van der Graaff E,Schwacke R,Schneider A,et al.
Transcription analysis of arabidopsis membrane
transporters and hormone pathways during develop-
mental and induced leaf senescence[J].Plant Phys-
io,2010,141(2):776.
[24] Seltmann M A,Stingl N E,Lautenschlaeger J K,et
al.Differential impact of lipoxygenase 2and Jas-
monates on natural and stress-induced senescence in
Arabidopsis[J].Plant Physio,2010,152(4):
1940.
[责任编辑:白林含]
6931