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薏苡种仁内生真菌的分离及其抗菌活性



全 文 : [收稿日期] 2014-06-11;2014-09-19修回
 [基金项目] 贵州省教育厅自然科学研究重点项目“薏苡内生真菌的分离及其次生代谢产物活性研究”[黔教合KY字(2013)190];贵州省
普通高等学校创新人才团队“民族药用生物资源研究与开发创新团队”[黔教合人才团队字(2013)30]
 [作者简介] 张万芹(1982-),女,讲师,从事应用微生物学的研究。E-mail:wanqinzhang@qq.com
 *通讯作者:邱国俊(1960-),女,教授,从事医药药学研究。E-mail:qxnzweixiao@163.com
[文章编号]1001-3601(2014)10-0620-0152-06
薏苡种仁内生真菌的分离及其抗菌活性
张万芹1,文廷池2,邱国俊1*
(1.兴义民族师范学院 生物与化学学院,贵州 兴义562400;2.贵州大学 西南药用生物资源教育部工程研究
中心,贵州大学 贵州省生化工程中心,贵州大学 贵州省农业生物工程重点实验室,贵州大学 生命科学学
院,贵州 贵阳550025)
  [摘 要]为筛选薏苡种仁内生真菌的抗菌活性,采用组织分离法,从禾本科黍亚科蜀黍族薏苡种仁中
分离内生真菌,采用菌饼法筛选其抗菌活性。通过5.8SITS 分子系统学鉴定菌种,高效液相色谱法
(HPLC)分析鉴定菌种发酵液正丁醇提取物次的生代谢产物。结果表明:分离共获得23株薏苡种仁内生真
菌,其中,有弯孢霉属、链格孢属、砖孢属、茎点霉属、灰软盘菌属、稻黑孢属、玉蜀黍赤霉属、曲霉属及其他真
菌。57%的菌株至少对测试菌株中的1种具有抗菌活性,且GZR19号菌株具有广谱抗菌活性并鉴定为1种
茎点霉(Phoma sp.),其发酵液的次生代谢产物在该色谱条件下主要有4种物质含量较高,其中可能存在具
有抗菌活性的化合物。
[关键词]薏苡;种仁;内生真菌;分离;鉴定;抗菌活性
[中图分类号]S567.9;Q939.11 [文献标识码]A
Isolation and Antimicrobial Activity of Endophytic Fungi in
Coix lacryma-jobi Kernels
ZHANG Wanqin 1,WEN Tingchi 2,QIU Guojun1*
(1.College of Biology&Chemistry,Xingyi Normal University for Nationalities,Xingyi,Guizhou562400;
2.College of Life Sciences,Guizhou University,Guiyang,Guizhou550025,China)
  Abstract:The antimicrobial activity of endophytic fungi isolated fromCoix lacryma-jobi kernels was
screened by the colony method,then the strains were identified by 5.8SITS molecular systematics,and
finaly secondary metabolites extracted from strain fermentation liquor were analyzed by HPLC.The
results showed that 23 endophytic fungi strains including Curvularia, Alternaria, Dictyo-
mitosporicfungi,Phoma sp.,Mollisia cinerea,Nigrospora oryzae,Gibberella zeae,Aspergillus and
other fungi are isolated.57%strains has the antimicrobial activity against one test strain at least.GZR19
strain with broad-spectrum antimicrobial activity is identified as Phoma sp.and there are main four
substances in secondary metabolites of the fermentation liquor,which indicates that the compounds with
antimicrobial activity may exist in four substances.
Key words:Coix lacryma-jobi;kernel;endophytic fungi;isolation;identification;antimicrobial
activity
  薏苡(Coix lacryma-Jobi)为禾本科黍亚科蜀
黍族一年生或多年生植物,是重要的药食兼用栽培
植物。其种子去除外壳和种皮入药,为薏仁(Se-
men Coicis),又名薏苡仁、薏米、薏珠子等,最早记
载于《神农本草》,是历史悠久的常用中药[1]。其活
性物质具有抗肿瘤、抗炎、抗病毒、抗菌、降血糖、免
疫调节等,以薏苡仁油为原料的康莱特注射液已用
于临床癌症治疗,并且经美国 FDA批准进入治疗
非小细胞肺癌的二期临床试验[2-3]。
植物内生真菌是十分丰富的微生物类群。有文
献报道[4-5],内生真菌系统地分布于植物体的各部分
组织、器官及细胞间隙中,其中叶、叶鞘和种子内的
真菌菌丝含量最多。近年来,药用植物内生真菌逐
渐成为新药或前体药物的潜在资源而广受关注。对
天然药物活性成分的筛选也是现代医药学的研究热
点,植物资源是天然药物的重要来源之一[6-7]。而内
生真菌由于能够产生同宿主植物类似的活性物质,
并能够产生多种次生代谢产物及易于发酵培养等特
点,成为新药或前体药物的潜在资源。自20世纪
60年代以来,国内外学者对薏苡的化学成分及药理
活性开展了多方面研究,首先是含薏苡仁酯活性成
分的康莱特注射液(KLT)是得到普遍应用的抗肿
瘤药物,其作用机理是薏苡仁酯能抑制肿瘤血管的
生成[8]、诱导其细胞凋亡[9]、减少细胞有丝分裂,阻
止细胞增殖[10-11]等。另外,徐梓辉等[12]通过酸水解
纸层析法测得具有降糖作用的薏苡仁多糖,有鼠李
 贵州农业科学 2014,42(10):152~157
 Guizhou Agricultural Sciences
糖、阿拉伯糖、甘露糖、半乳糖、葡萄糖;Lee等[13]用
甲醇从薏仁麸皮中分离出5种有抗肿瘤活性的内酰
胺类化合物等。目前,薏苡内生真菌及其次生代谢
产物的研究处于空白阶段。因此,对薏苡内生真菌
的研究是利用微生物对薏苡资源开发与研究新的思
路和方式。笔者从薏苡种仁中分离内生真菌,并对
其抗菌活性进行初步研究,为研究其次生代谢产物
提供一定的理论依据。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 分离材料 薏苡种子于2013年10月采自
贵州省黔西南州娄纳地区,取材部位为去除外壳及
种皮的种仁。
1.1.2 测试菌株 测试菌株购自中国典型培养物
保藏中心(CCTCC),分别是大肠杆菌(Escherichia
coli)、金黄色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)、枯
草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)和酿酒酵母(Saccha-
romyces cerevisiae)。
1.1.3 培养基 马铃薯葡萄糖琼脂培养基:马铃
薯去皮200g,切成2 mm 小块,加蒸馏水煮沸
30min,4层纱布过滤,收集滤液,蒸馏水补充至
1 000mL,加葡萄糖20g,琼脂20g,pH 自然,
121℃高压蒸汽灭菌30min。待分离培养基不烫手
时加100U/mL青霉素和链霉素,马铃薯葡萄糖液
体发酵培养基去掉琼脂组分。牛肉膏蛋白胨培养
基:牛肉膏3g,蛋白胨10g,氯化钠5g,琼脂15g,
蒸馏水1 000mL,pH 7.2,121℃高压蒸汽灭菌
30min。
1.1.4 试剂与仪器 葡萄糖(分析纯,天津市津北
精细化工有限公司),琼脂粉、牛肉膏和蛋白胨(生化
试剂,北京奥博星生物技术有限责任公司),青霉素、
链霉素(华北制药股份有限公司)。YM 系列不锈
钢(智能型)立式压力蒸汽灭菌器(上海三申医疗器
械有限公司),DL-CJ-1N型超级洁净工作台(北京
东联哈尔仪器制造有限公司),XSP-3生物显微镜
(上海普丹光学仪器有限公司),HPX-9082MBE电
恒温培养箱(常州市伟嘉仪器制造有限公司)等。
1.2 种仁内生真菌的分离纯化
采用组织块法分离[14],选取秋季无病虫、无伤
口的新鲜成熟种子,去外壳及种皮,在超净工作台
上用 无 菌 水 洗 6 次, 解 剖 刀 将 种 仁 切 成
0.5mm×0.5mm小 块,置 于 75% 的 乙 醇 浸 泡
3min,无 菌 水 洗 3 次,用 0.1% 的 升 汞 处 理
2.5min,无菌水洗3次,用解剖刀去除边缘,放在无
菌滤纸上吸干,再接入含有青霉素(100U/mL)和
链霉素(100U/mL)的马铃薯葡萄糖琼脂培养基
中,28℃培养3~7d,待切口处长出菌落,根据其形
态、颜色及长出时间的差异,采用尖端菌丝挑取法挑
取菌落边缘菌丝转接于新鲜马铃薯葡萄糖琼脂培养
基中,培养数日观察其菌落特征,并通过镜检无杂
菌,获得纯化菌落。种仁表面杀菌结束后采用漂洗
液检测法[15]将漂洗液接种到分离培养基上作无菌
对照,同时采用组织印迹法[16]将杀菌结束后的种仁
小块作印迹对照。
1.3 种仁内生真菌的形态学鉴定
将培养7~14d的菌落,用油镜下观察不粗糙
且粘性好的胶带从菌落中心向边缘粘,75%的乙醇
固定,乳酸石碳酸棉兰染液染色,盖上盖玻片,在油
镜(×100)显微镜下观察菌丝及孢子等显微特征,对
照有关资料初步判定真菌的分类,分类检索参照文
献[17]。
1.4 种仁内生真菌的抗菌检测
采用菌饼法[7]对分离到的内生真菌进行抗菌检
测。测试菌的培养见参考文献[7]。菌饼的制备:将
内生真菌分别接入马铃薯葡萄糖琼脂培养基中,于
28℃培养7d,用无菌9mm直径的试管口在酒精灯
下烧热印制菌饼备用。含指示菌培养基:用5mL
无菌生理盐水直接冲洗培养后的指示菌斜面,摇匀
后,采用血球计数法,将菌悬液浓度稀释到浓度为
1×106cfu/mL大肠杆菌(Escherichia coli)、金黄色
葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)、枯草芽孢杆菌
(Bacillus subtilis)、酿酒酵母(Saccharomyces cere-
visiae)。取100μL菌悬液快速倒入40~50℃的牛
肉膏蛋白胨培养基中,摇匀后迅速装到培养皿
(Φ90)中,冷却后得到含有各指示菌的培养基。
将制备好的菌饼用接种针挑取置于含指示菌的
培养基上,长有菌丝的朝上,每个指示菌的培养皿中
放2~3个菌饼。置于37℃的培养箱中恒温培养
24h,观察是否有抑菌圈,采用十字交叉法测其抑菌
圈直径。每株菌重复3次。
1.5 种仁内生真菌的5.8SITS分子鉴定
真菌基因组 DNA的提取采用北京天根试剂盒
进行。PCR扩增根据已知真菌的保守序列设计特
异性引物ITS4与ITS5,引物序列ITS4,TCCTC-
CGCTTATTGATATGC; ITS5, GGAAGTA-
AAAGTCGTAACAAGG均由上海生工生物工程
技术有限公司合成(PAGE纯化)。PCR扩增反应
条件:94℃预变性3min;94℃变性30s,55℃退火
30s,72℃延伸1min,35个循环;最后72℃延伸
5min。基因组DNA的序列工作由北京诺赛基因
组研究中心有限公司完成。测序的rDNA ITS序列
在GenBank核酸序列数据库中进行Blast比对,用
ClustalX 1.83软件对已测定的序列匹配排列,比对
后的序列用 Mega version 5.05程序经1 000次
bootstrap统计学验证,构建系统树。
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 张万芹 等 薏苡种仁内生真菌的分离及其抗菌活性
 ZHANG Wanqin et al Isolation and Antimicrobial Activity of Endophytic Fungi in Coix lacryma-jobi Kernels
1.6 种仁内生真菌的发酵液提取
将薏苡内生真菌接种在15个培养皿中培养
7d,作为平板种子。用解剖刀将长满培养皿的真菌
制成0.5mm×0.5mm的菌块,将菌块接种在装有
100mL马铃薯葡萄糖液体培养基的三角瓶中,每瓶
接种20个菌块,121r/min,28℃下培养14d。用6
层纱布过滤,收集滤液,用正丁醇:滤液的体积比为
1∶1提取3次,旋转蒸发仪浓缩得浸膏。
1.7 色谱分析条件
萃取液过0.45μm滤头,在330nm下检测,选
择Diamosil C18 5μm 250×4.6mm色谱柱进行分
离,选择乙腈作为有机相,水相为pH3.2的乙酸-乙
酸铵(乙酸铵1.25mol/L),有机相10%~100%
(60min),进样20μL观察出峰情况,330nm检测。
2 结果与分析
2.1 种仁内生真菌的分离
由表1可见,从薏苡种仁中共分离到的内生真
菌23株,经过形态学初步判定(图1),分别为弯孢
霉属占4.30%、链格孢属占17.40%、砖孢属占
4.30%、茎 点 霉 属 占 17.40%、灰 软 盘 菌 属 占
4.30%、稻 黑 孢 属 占8.70%、玉 蜀 黍 赤 霉 属 占
8.70%、曲霉属占8.70%及无孢菌类内生真菌占
21.60%。
表1 薏苡种仁内生真菌的分离结果
  Table 1 Endophytic fungi isolated fromC.lacryma-jobi kernels
类别
Types
数量/株
Number
占种仁菌
株数的比列
Proportion
从梗孢目 Moniliales
暗梗孢科 Dematiaceae
多孢亚科 Phragmosporoideae
弯孢霉属Curvularia  1  4.30
从梗孢目 Moniliales
暗梗孢科 Dematiaceae
链格孢属Alternaria  4  17.40
从梗孢目 Moniliales
暗梗孢科 Dematiaceae
砖格孢亚科
 Dictyosporoideae of Dematiaceae
砖孢属 Dictyo-mitosporic fungi  1  4.30
球壳孢目Sphaeropsidales
球壳孢科 Phylosticta
茎点霉属Phomasp 4  17.40
蜡钉菌目 Helotiales
暗皮皿科 Molisiaceae
灰软盘菌属 Mollisia inerea  1  4.30
壳霉目Sphaeropsidales
杯霉科 Discelaceae
稻黑孢属 Nigrospora oryzae  2  8.70
肉座目 Hypocreales
赤壳科 Nectriaceae
玉蜀黍赤霉属Gibberella zeae  2  8.70
散囊菌目 Eurotiales
发菌科 Trichocomaceae
曲霉属Aspergillus  2  8.70
无孢菌类 6  26.10
  注:A,弯孢霉属;B,链格孢属;C,砖孢属。
  Note:A,Curvularia;B:Alternaria;C:Dictyo-mitosporic fungi.
图1 薏苡种仁内生真菌的孢子形态(×100)
  Fig.1 Spore morphology of endophytic fungi
isolated fromC.lacryma-jobi kernals
2.2 分离菌株的抗菌活性
23 株 薏 苡 种 仁 内 生 真 菌 编 号 为 GZR1-
GZR23,其中有GZR11、GZR14、GZR19、GZR21号
菌株具有广谱的抗菌活性(表 2),对大肠杆菌
(Escherichia coli)、金黄色葡萄球菌(Staphylocco-
cus aureus)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、酿酒
酵母(Saccharomyces cerevisiae)均有明显抗性;
GZR3、GZR6号菌株对大肠杆菌(Escherichia co-
li)、金黄色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)、枯草
芽孢杆菌(Bacillus subtilis)有明显抗性;GZR16号
菌株对枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、酿酒酵母
(Saccharomyces cerevisiae )有 抗 性;GZR5、
GZR10、GZR 15、GZR 20、GZR 22、GZR 23对金黄
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表2 薏苡种仁内生真菌的抗菌活性
  Table 2 Antimicrobial activity of endophytic fungi fromC.lacryma-jobi kernels
菌株 编号
No.of strains
抑菌圈大小/mm Size of inhibition zone
大肠杆菌 金黄色葡萄球菌 枯草芽孢杆菌 酿酒酵母
GZR1 - - - -
GZR2 - - - -
GZR3  12.00±0.12  12.00±0.17  11.25±0.11 -
GZR4 - - - -
GZR5 - 11.25±0.15 - -
GZR6  10.25±0.11  10.25±0.17  11.00±0.12 -
GZR7 - - - -
GZR8 - - - -
GZR9 - - - -
GZR10 - 11.00±0.12 - -
GZR11  18.00±0.13  18.50±0.15  12.00±0.19  13.00±0.12
GZR12 - - - -
GZR13 - - - -
GZR14  19.00±0.16  16.50±0.12  12.25±0.10  14.50±0.11
GZR15 - 17.00±0.17 - -
GZR16 - - 10.00±0.19  9.75±0.18
GZR17 - - - -
GZR18 - - - -
GZR19  20.50±0.15  18.50±0.19  12.50±0.12  15.50±0.13
GZR20 - 10.75±0.18 - -
GZR21  18.50±0.11  18.50±0.15  12.75±0.19  14.00±0.17
GZR22 - 10.75±0.12 - -
GZR23 - 10.00±0.19 - -
  注:“-”表示无明显抑菌圈。
  Note:“-”indicates without obvious inhibition zone.
  注:A,GZR19号菌株菌饼背面对酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的抗性形成的抑菌圈;B,GZR19号菌株菌饼背面对金黄色葡萄球菌
(Staphyloccocus aureus)的抗性形成的抑菌圈;C,GZR19号菌株菌饼背面对枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的抗性形成的抑菌圈;D,GZR19
号菌株菌饼背面对大肠杆菌(Escherichia coli)的抗性形成的抑菌圈;E,GZR19号菌株的菌落表面图片;F,GZR19号菌株的菌落背面图片;G,
GZR19号菌株的发酵液。
  Note:A,the inhibition zone to Saccharomyces cerevisiae;B,the inhibition zone to Staphyloccocus aureus;C,the inhibition zone to Bacil-
lus subtilis;D,the inhibition zone to Escherichia coli;E,colony surface;F,colony reverse side;G,fermentation liquor.
图2 GZR19号菌株的抗菌性、菌落以及发酵液
Fig.2 Antibacterial property,colony and fermentation liquor of GZR19strain
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 张万芹 等 薏苡种仁内生真菌的分离及其抗菌活性
 ZHANG Wanqin et al Isolation and Antimicrobial Activity of Endophytic Fungi in Coix lacryma-jobi Kernels
图3 GZR 19号菌株及其参考菌株的rDNA ITS序列的系统树
Fig.3 Phylogenetic tree of rDNA ITS sequenceof GZR19strain and reference strains
色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)有明显抗性。
具有抗菌活性的菌株占总体分离到菌株数的
56.5%,其中,GZR19号菌株抑菌效果明显高于其
他菌株(图2)。
图4  GZR19号菌株发酵液的正丁醇萃取物组分
 Fig.4 Butanol extract components in the fermentation
broth of GZR19
2.3 广谱抗菌活性菌株GZR19号的分子鉴定
在培养基上,GZR19号菌株的产孢结构不明
显,分子系统学(图3)分析显示,该菌株为1种茎点
霉(Phoma sp.)。
2.4 GZR 19号菌株发酵液正丁醇提取液组分
在该条件下,正丁醇提取物中主要有4个组分
含量较高(图4),分别为1号、3号、4号和5号峰,
其含量为1号1%~1‰、3号0.5%~0.5‰、4号
0.2%~0.2‰和5号0.04%~0.004‰。另外,各
物质在250nm处具有更好的灵敏度,紫外光谱下
该溶剂体系获得了239种物质,即该浸膏至少含有
239种物质。
3 结论与讨论
植物内生真菌在植物各组织中普遍存在,且数
量丰富。在分离薏苡种仁内生真菌的过程中,为获
得最大数量的内生真菌,采样时选取无病害、已成熟
且种外壳稍带黄色的种子。种仁表面杀菌处理后,
结合冲洗液检验法和组织印迹法检验种仁表面消毒
效果。在试验中可能有部分薏苡种仁内生真菌未被
分离出来;若改变培养基或培养条件,可能会发现这
些内生真菌。但要尽可能全部分离出薏苡种仁的内
生真菌,还需要进一步研究。
研究表明,从植物内生真菌分离的生物活性物
质51%是以前未发现的化合物[18]。因此,植物内生
真菌因其次生代谢产物丰富而成为应用前景广阔的
微生物资源。利用菌块对峙法初步筛选病原菌拮抗
菌的优点是直观、简便、成本低,是体外有效筛选活
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性内生真菌的方法,其拮抗带宽度或抑菌圈直径是
评价抑菌活性的重要参考指标。抗菌活性试验表
明,超过分离的50%以上的薏苡种仁内生真菌至少
对1种测试菌株有抗菌活性,说明薏苡种仁内生真
菌抗菌活性普遍存在,并且其次生代谢产物中含有
抑菌活性的化学物质。尤其是GZR19号菌株,其对
4种指示菌株的抑菌圈明显大于其他菌株,可能其
次生代谢产物活性成分含量明显高于其他菌株,或
含有其他抑菌效果的化学物质。需大量发酵培养,
追踪其分离得到其具有抗菌活性的化学成分。ITS
序列比对,鉴定 GZR19号菌株为茎点霉(Phoma
sp.)。HPLC对其次生代谢产物正丁醇提取液进行
初步分析显示,有4种组分含量较高,正在进行大量
发酵,下一步希望找到其具有活性成分的化合物。
[参 考 文 献]
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(责任编辑:刘忠丽)
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