全 文 ： 万方数据
238 生态科学
表1物种名称、编号、来源、GenBank登录号
!垒垒!宝：!!：垒!12曼￡i曼!曼璺望!!璺罂望巴垒曼§12坚坚里兰望垒g曼望曼璺望墼望坚虫垒曼登
物种名SpeciesN舭佗 序列自编号NumberofSequence来源source GenB锄k登录号GenB柚kAccession
斑鳢腻删“盘船 MGGD 广东Gu锄gdongDQool756
斑鲮腻删ff口胁s MGzJ 未知unl(Ilo、ⅣIlAF475154
斑鳢M删抛f“s MGFJ 福建Fujian AF416886
大鳍鲮M肌a∞pfPr“sMMGx 广西GuangxiAF430373
丝尾鳢M仃硎“，“s MNLc 未知unl(nownAF499600
(约10rIg)。PCR反应程序为：95℃预变性3111in，然
后95℃变性45s，56℃退火1miIl，72℃延伸1111in，
共进行32个循环，最后72℃延伸10mill。设不含模板
的反应液作空白对照，PCR产物用1％琼脂糖凝胶电泳
检测得到清晰谱带，产物送至上海博亚生物技术有限
公司纯化，并在ABI3730自动测序仪上双向测序。
1．3数据处理：
用ContigEXpress6．0软件对测定的两侧序列进行
拼接，结合人工校对输出。帕基因全序列。其余斑鲮
及大鳍鳢、丝尾鳢@出基因序列来自GeIlBaIll【．。用
ClustaIxl．83软件对表l中5个D帕基因序列进行排
序，应用MEGA3软件输出序列间所有有差异的碱基，
并用ⅪmIlm2．pa翻meter模型计算遗传距离及转换／颠
换值。
2结果与讨论
2．1@m的序列及变异情况
实验获得斑鲮细胞色素b基因的1137bp全序列，
编码379个氨基酸，并以ArG为起始密码子，缺少终
止密码子[7】序列中T、C、A、G四种碱基含量分
别为31．6％、25．7％、29．6％、13．1％，A+T、(HC含
量分别为61．2％、38．8％。将所测定序列与GenBaId【
中另2个斑鲮及大鳍鳢，丝尾鲮cym基因序列进行比
对。用MEGA3软件输出序列间所有有差异的碱基f图
1)，发现在共有的1137bp序列中保守位点902个，
变异位点235个，信息简约位点41个。3个斑鲮@南
基因1 137bp全序列中变异位点20个，占总序列的
1．59％，其中MGGD与MGzJ序列差异位点6个，
GMGD与MGFJ序列差异位点16个，MGZJ与MGFJ
序列差异位点19个。碱基T、C、A、G平均含量
分别为31．5％、25．7％、29．6％、13．2％，A+T和G+C
平均含量分别为61．1％、38．9％38．9％。将斑鲮@如
基因序列用MEGA3转换为氨基酸序列，发现3个斑
鲮氨基酸序列差异位点均仅为2个，从中反应出。帕
基因作为功能蛋白质编码基因序歹“相对比较保守e菱2)。
有研究表明鲇形目鱼类线粒体@出基因相对其
他硬骨鱼类在起始密码子ATG后第10位有3个碱基
缺失，这一特征为鲇形日鱼类所共有【5】，本研究中也
同样存在这种缺失。
3个斑鲮Cvtb基因序列的三联体密码子中第二位
G的出现频率平均12．3％，T平均为42．9％；第三位G
的出现频率平均只有2．6％，A平均为42．O％，从中反
应出C：灿基因密码子碱基使用明显的偏好性。这一现
象与脊椎动物线粒体基因组中碱基G含量较低的特征
是一致的睁】。
表2样品勿柏基因序列问的差异碱基数目(左下角)和氨基酸
序列闻的差异氨基酸数目(右上角)
T铀Ie2 The删mbe体ofVari粤bIegenes quencesn嚣(up”r
triangIe)andthenumbe璐ofVariablealIIinoacidsequenc∞
!!!箜i!竺坚!!!!i墨望g!曼2旦!!曼!塾垒121曼望虫!箜：
MGGD MGZJ MGFJ
斑鳢基因序列间的转换／颠换值为1．O～6．5，与大
鳍鳢的转换／颠换值为5．2～6．5，与丝尾鳢的转换／颠换
值为1．9～2．O。与其他鱼类相似，鳢属鱼类线粒体@m
基因的转换大于颠换‘71。
表3样品Cytb基因序列间的遗传差异(左下角)和转换／颠换
值(右上角)
Table3 Pairwiseratiosofn。ansitions，n．ansversion“upper
triangle)andpercentofsequencesdiff电rences(IowertriangIe)
!Q!型!壁!塾121翌壁垒g!塾竺!!g坚曼坠!箜Q!曼苎!塾垒121璺堡巳!笪：
MGGDMGZJMGFJMMGXMNLC
MGGD
MGZJ
MGFJ
MMGX
MNLC
1．O 6．5
0．005 5．3
O．O】3 O．017
0．078 0．082 0．076
O．198 0．200 O．195
6．5 2．O
6．3 2．O
5．2 1．9
2．0
O．20l
2．2序列差异
从表3可见，斑鳢基因序列问差异为0．005～O．017，
介于一般淡水鱼类m仍NA种内序列变异范围。斑鲮与
大鳍鲮的种问序列差异为0．076～0．082，斑鲮与丝尾鲮
的种问序列差异为0．195～0．201。可见种问@m基因
序列差异大于种内序列差异，这与传统的鲮属分类方
法结果相一致。同时斑鲮与大鳍鲮的基因序列问差异
明显大于斑鲮与丝尾鲮的基因序列间差异，这可能是
由于斑鳢和大鳍鲮同分布于东南水系具有相似的生境
万方数据
3期 堡岗，等：壅鲮细胞色素b基因的初步研究 239
撑DQ001756
撑AF475154
≠≠AF416886
撑AF430373
撑AF499600
jf|}DQ001756
枞F47514
≠≠AF416886
≠≠AF430373
≠≠AF499600
捍DQ001756
枞F47514
撑AF416886
黼F430373
触F499600
捍D0001756
牟AF475154
群AF416886
群AF430373
蝴F499600
22234688
5614892314
TMCCCTCCT
CC～一一一
一C—TT一一TT一
一CC一一TCTTC
3333333333
2345556688
7681243617
TCGAGAA从C
一一A⋯C⋯
CTATACGTCT
6666666667
6677889990
3628573690
TCCTAT^TCC
—T
⋯一一—G一⋯GC—
C—TCTAT—TT
9999999999
3444555666
0235478016
TCCCTTAGAG
一～C—GA
—A一一CC一一GA
CATACCCCGA
11111111
8800112234
5758170361
GATCATTAGT
⋯T一～
一一C—T—CG一一
AG—T—C一一AA
44444444
9900222344
6728069257
ATATCCTACT
⋯一一T一一
GC一一TT—C
C— A一一CCTA
7777777777
000 112222
23595703％
TCTTCCMTG
C⋯T—CA
A 从TAGCcA
1
999990
6778889990
9091240363
CC ATAATAT
—TG一一一
TA—CCGTCTC
11111111
4566678889
5625810395
CACCAGTCTC
T⋯C⋯一一
一CTTTACTCT
4444444455
4667789900
8681432814
CACGCACGAT
一一T一一T一一
一一TA一一TA—C
TGAA—CTATC
7777777777
3333444556
0258178368
TACACCccCT
一——T——⋯一TTT——C
CGTT—T—AT一
1111111”1
0000000000
1122334456
4709580196
CCCCTGACTA
一一～A一一⋯——A—TC一
丁AATCCTT—G
1222222222
9000011223
9014769282
AT CTATAA
～一G—
G一一TT⋯一G
G CT—CTCC一
5555555555
2244556666
3 39262345
TATCACGCTG
⋯一—A⋯一
⋯一C—C—
CCCT一一ATAA
777778
7788889990
1403492581
CAa惦TTGCT
—C一一TCCA一一
TTC—CC从C
1111111”1
0000000000
6777778888
8147890136
CATTTCATAC
—CCC—CG—
A—C—CTTC—T
2222222
3445677778
7095403695
C TTATTCTC
⋯～一一C—
TG⋯CC—CT
一 CCCCCT一一
5556666
789990001
6304780395
TCTATCACTT
G⋯⋯一
G⋯⋯⋯
一G—T⋯C
—TCTC—CTC一
88 8888888
1334445556
9470392582
CATATTTTT
—T—CC^C——一
T—CC—CCCCC
1 11111111
0111111
999012223
7 58712681
TTCACCTAT
⋯T·-T——一一
CCA—G—TCTA
2233333333
990∞01122
1703692824
TAACACTTCT
⋯一一T一一
CCGAGTCATG
666666
2233334456
1701395840
CT ATATTC
～一一C⋯一
T⋯一C一一
TACCCCG—CT
8888889999
7778990111
0346143268
C ACTTTCTA
⋯一C——一一
TCC—C—C——一
一一CTCCCACC
111 1
11
3333耷
24570
A TCC
—C—
GCCTT
图1办曲基因序列间的差异位点(“一”表示碱基相同)
Fig．1VariabIenucleotidesitesin<：)疆bgenesequencesamongthenVesamples．(HyphensindicatenucIeotideidentiqtotoprow
respect．veIy)
和较多的基因交流有关，而丝尾鲮分布于澜沧江，水
流湍急，生境更特殊，分化更快些。
目前斑鲮鱼苗的人工繁殖已经开展，其遗传多样
性研究和保护的重要性日益突出。本研究为斑鲮渔业
利，质资源保护和遗传选育提供了一一些遗传方面的资
料，但由于研究中斑鲮个体数量及地理的限制，未能
较全面的反映其遗传多样性和地理分布差异，这方面
的工作有待于今后进一。一步深入研究。
参考文献
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万方数据
斑鳠细胞色素b基因的初步研究
作者： 任岗， 陈艺燕， 钱开诚， 陈迪， 章群， REN Gang， CHEN Yi-yan， QIAN Kai-chen，
CHEN Di， ZHANG Qun
作者单位： 暨南大学水生生物研究所,广州,510632
刊名： 生态科学
英文刊名： ECOLOGIC SCIENCE
年，卷(期)： 2005,24(3)
被引用次数： 4次

参考文献(7条)
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2.Yamamoto S;Morita K;Kintao S The Cytochrome bGene as a Phylogenetic Marker The Limits of
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3.郭新红;刘少军;刘巧 鱼类线粒体DNA研究新进展[期刊论文]-遗传学报 2004(9)
4.汪永庆;王新国;徐来祥 一种动物基因组DNA提取方法的改进[期刊论文]-动物学杂志 2001(01)
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6.吕国庆;李思发 鱼类线粒体DNA多态研究和应用进展 1998(03)
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引证文献(4条)
1.司从利.章群.马奔.黄小彧.黎瑞宝.乐小亮 基于线粒体细胞色素b基因序列分析的泉水鱼遗传多样性研究[期刊论
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2.司从利.章群.黄小彧.马奔.乐小亮 基于细胞色素b基因序列分析的华南居氏银鱼遗传多样性研究[期刊论文]-海
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3.鲁延付.乐小亮.赵爽.陈泉梅.章群 福建东张水库陆封型香鱼的遗传变异[期刊论文]-生态科学 2009(6)
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