全 文 :第 33卷 第 2期 生 态 科 学 33(2): 244−250
2014 年 3 月 Ecological Science Mar. 2014
收稿日期: 2013-10-22; 修订日期: 2013-12-13
基金项目: 微藻高效规模化培养及生物燃料清洁制备技术(21013AA065805); 高固碳能力富含生物活性成分的优良微藻藻种选育和评价体系研究(21614101)
作者简介: 彭倩倩(1988—), 女, 硕士研究生, 研究方向为应用藻类生物技术, E-mail:peng19880104.ok@163.com
*通信作者: 李爱芬, 女, 博士, 教授, 主要从事藻类光合生理生化研究, E-mail: tiger@jnu.edu.cn
彭倩倩, 王璐瑶, 李爱芬, 等. 低氮对金色奥杜藻色素-蛋白复合物特性及全细胞蛋白表达的影响[J]. 生态科学, 2014, 33(2):
244−250.
PENG Qianqian ,WANG Luyao, LI Aifen, et al. Effects of low nitrate-nitrogen concentration on photosynthetic pigment protein
complexes and differential expression of proteins in Odontella aurita[J]. Ecological Science, 2014, 33(2): 244−250.
低氮对金色奥杜藻色素-蛋白复合物特性及全细胞
蛋白表达的影响
彭倩倩, 王璐瑶, 李爱芬*, 张成武
暨南大学水生生物学研究中心, 广州 510632
【摘要】 采用 SDS-PAGE 圆盘电泳分离技术, 研究两种氮浓度下 17.6 mmol·L− 1 (高氮组)、5.87 mmol·L− 1 (低氮组)金色
奥杜藻色素蛋白复合物的变化规律。结果表明, 从两种氮浓度所培养的金色奥杜藻细胞光合膜上, 均可分离得到 6 种
色素蛋白复合物条带, 按照迁移速率从小到大依次为 CPⅠa、CPⅠ、CPa1、CPa2、LHCP1、LHCP2。与高氮组相比, 低
氮下电泳分离的复合物条带颜色明显变浅, 尤其 CPⅠ、CPa1、CPa2 三条带仅隐约可见。低温荧光发射光谱显示 CPa1
的荧光发射主峰也较高氮组蓝移 10 nm 左右,说明低氮主要影响光系统Ⅱ。双向电泳和质谱分析结果表明, 氮浓度降低
后藻细胞中有 6 种蛋白表达下调, 3 种蛋白表达上调, 这些差异蛋主要白涉及光合作用、氮素吸收、碳同化、能量转换
等生理过程, 大多与维持叶绿体功能有关。
关键词:金色奥杜藻 Odontella aurita; 氮限制; 色素-蛋白复合物; 蛋白表达
doi:10.3969/j.issn. 1008-8873.2014.02.007 中图分类号:X55 文献标识码:A 文章编号:1008-8873(2014)02-244-07
Effects of low nitrate-nitrogen concentration on photosynthetic pigment
protein complexes and differential expression of proteins in Odontella aurita
PENG Qianqian, WANG Luyao, LI Aifen*, ZHANG Chengwu
Institute of Hydrobiology, Jinan University, Guangzhou 510632, China
Abstract: Six pigment-protein complex bands including CPIa, CPI, CPa1, CPa2, LHCP1, LHCP2 were firstly separated from the marine
diatom Odontella aurita cell grown in two initial nitrate concentrations of sodium nitrate 17.6 mmol·L−1 (high nitrogen concentration) and
5.87 mmol·L−1(low nitrogen concentration) using disc SDS-PAGE electrophoresis. The results showed that bands color of pigment protein
complexes CPⅠ, CPa1, CPa2 of low concentration nitrogen group became light obviously and the fluorescence emission peak of CPa1
hypochromatic shifted 10 nm compared with the high concentration nitrogen group. The result indicated that low concentration nitrogen
possesses certain influence on pigment protein complexes of PSⅡ. The whole cellular proteins of O. aurita grown in low concentration
nitrogen medium were separated by two-dimension electrophoresis and analyzed using proteomic mass spectrometry. The analysis of
differential expression of proteins showed that six up-regulation and three down-regulation proteins were found in O. aurita grown with
low concentration nitrogen medium, respectively. These differential expressed proteins mainly involved in photosynthesis, nitrogen
up-take, carbon assimilation, energy conversion, and most of them were in relationship with the maintenance of chloroplast functions.
Key words: Odontella aurita; nitrate limitation; pigment-protein complex; differential protein expression
2 期 彭倩倩, 等. 低氮对金色奥杜藻色素-蛋白复合物特性及全细胞蛋白表达的影响 245
1 前言
金色奥杜藻(Odontella aurita)是一种海洋单细
胞硅藻, 藻体由几个或多个细胞相连呈链状存在[1]。
在适宜条件下能快速积累二十碳五烯酸 (Eicosa-
pentaenoicacid, EPA)和类胡萝卜素岩藻黄素, 培养
后期细胞还大量积累金藻昆布糖[2]。因此, 金色奥杜
藻是一种极具开发价值的经济微藻。氮是合成蛋白
质的关键营养元素, 微藻在缺氮或氮限制条件下蛋
白质合成速率会降低, 造成类囊体膜蛋白和细胞质
蛋白合成的竞争[3−4]。氮饥饿引起叶绿素 a 丢失和非
光化学猝灭活跃的类胡萝卜素的增加[3−5], 进而影
响能量传递。有报道称在氮饥饿培养条件下, 硅藻
的光合效率、色素含量及生化组成等都发生变化[4−6],
而且 Fv/Fm 显著下降也反映出低氮浓度对微藻细胞
PSⅡ反应中心的破坏[7−8]。金色奥杜藻(O. aurita)的
表观光合生理状况与氮素营养水平直接相关, 低氮
或缺氮条件下, Fv/Fm、叶绿素 a、c 及总类胡萝卜素
含量等相关荧光参数的降低表明 PSⅡ反应中心受
损[9], 而其对低氮环境下的具体生化与分子响应机
制还不是很清楚。本研究以金色奥杜藻(O. aurita)为
材料, 探讨了氮营养限制条件下对藻光合膜色素-蛋
白复合物和细胞全蛋白表达的影响, 旨在了解微藻
氮素营养和细胞光合生理结构以及生长代谢之间的
关系, 为微藻光合生理研究及金色奥杜藻的进一步
研究开发利用提供理论依据。
2 材料与方法
2.1 藻种及培养条件
金色奥杜藻(O. aurita)由暨南大学水生生物中
心微藻生物能源与生物技术实验室保藏。
采用改良的L1培养基培养藻细胞, 在Φ6 cm柱
状光合生物反应器中进行, 通入 1% CO2, 培养温度为
(25±1) , ℃ 光照强度为 150 µmol·m–2·s–1, 24 h 持续
光照。收集对数期的藻细胞离心, 初始 OD750 调为
0.6, 接种于NaNO3浓度为 17.6 mmol·L–1 (全N)、5.87
mmol·L–1 (1/3 N)的培养基中培养至第 6 天取样, 离
心液氮冻存于–80 ℃冰箱备用。
2.2 类囊体膜的制备
采用低温差速离心法制备类囊体膜, 12000 g 离
心收集膜碎片, 并悬浮于 PH 7.8 的缓冲液(20 mM
Tricine, 40 mM MgCl2,80 mM NaCl)中, 于–80℃冰
箱贮存备用, 整个过程在 4 ℃避光下进行。
2.3 色素蛋白复合物的分离
堆积胶浓度 5%, 分离胶浓度为 11%, 类囊体膜
制剂与一定量 30% OG 混匀并加入介质(0.3 M Tris;
10% 甘油, pH 8.8)使类囊体膜中色素终浓度为 1
mg·mL–1, OG (Octyl β-D-glucopyranoside)终浓度为
10%, 低温避光增溶 1 h 后 7000 r·min–1离心 3 min
取上清上样。
2.4 色素蛋白复合物多肽分子量测定
平板的凝胶厚度为 1.5 mm, 浓缩胶 5%, 分离胶
度 15%, 色素蛋白复合物条带从凝胶中切下来, 用
研钵捣碎加入样品增溶液(0.5 M Tris-HCl pH 6.8,
20% 甘油, 4% SDS, 10% 巯基乙醇)过夜增溶, 沸水
煮 5 min, 离心后上样。
2.5 室温吸收光谱的测定
采用 UV-2450 紫外可见双波长分光光度计测定
色素蛋白复合物的室温吸收光谱, 狭缝宽度 2 nm,
扫描速度 200 nm·min–1。
2.6 77 K 荧光光谱测定
采用日立F-4500荧光分光光度计, 在77 K液氮
下, 测定色素蛋白复合物条带的 77 K 荧光光谱, 狭缝
宽度 2 nm, 扫描速度 240 nm·min–1,激发波长 438 nm,
波长扫描范围 600—750 nm。
2.7 色素分析
将 2.3 所得色素蛋白复合物条带切下后, 加入
二甲基亚砜研磨, 过夜提取色素, 12000 r·min–1 离心
10 min 上清为色素的提取液, 上柱前用 0.45 μm 的
滤膜过滤。采用 UltiMate 3000 高效液相色谱分析各
条带色素成份, 流动相 A: 乙腈—水(9:1 v/v), 流动
相 B: 乙酸乙酯, 检测波长: 445 nm, 波长扫描范围:
300—800 nm, 柱温: 20 , ℃ 流速: 1 mL·min–1, 进样量:
20 μL。
2.8 全细胞蛋白的制备及含量测定
液氮研磨至藻体呈白色粉末, 加入细胞裂解液
(7 M 尿素, 2 M 硫脲, 4% CHAPS, 2% IPG—buffer,
Nuclease mix, 0.5 mM PMSF, 2% DTT, Cocktail), 每
隔 5—7 min 涡旋震荡。1 h 后, 12000 r·min–1 4 ℃离心
30 min, 取上清。加入 3—5 倍体积的丙酮(–20 ℃预冷)
混匀, 于–20 ℃冰箱中过夜沉淀蛋白。12000 r·min–1
离心 30 min 收集蛋白沉淀, 用丙酮抽提 3-4 次至上
246 生 态 科 学 33 卷
清无色, 并置于超净工作台上吹干。加入水化液(7
M 尿素, 2 M 硫脲, 2% CHAPS)混匀后保存于–80 ℃
冰箱备用。使用 Brandford 法测定蛋白样品的相对上
样浓度, 计算上样量(每种蛋白样品上样量为 150 µg)。
将每种蛋白溶液的体积用水化液补充至 250 µL, 震
荡混匀后, 以 13000 r·min-1 4 ℃离心 30 min。
3 结果与分析
3.1 O.aurita 色素蛋白复合物的分离与命名
3.11 圆盘电泳分离结果
经多次重复实验获得稳定的 SDS-PAGE 分离
系统, 从 O.aurita 中分离出 7 条含色素的条带, 按
照条带迁移率从小到大, 依次标记为 1—6 和 FP 条
带(如图 1)。
图 1 金色奥杜藻色素蛋白复合物的分离结果(以菠菜为
参照)
Fig. 1 Separation results of pigment-protein complexes of
O.aurita(with spinach as reference)
3.12 O.aurita 色素蛋白复合物的室温吸收光谱
图 2 为 O.aurita 色素蛋白复合物条带的室温吸收
光谱, 条带 1—4 具有相似吸收光谱, 能够吸收 680—
674 nm 的红光和 430—440 nm 的蓝紫光, 说明它们都
含有大量的叶绿 a, 此外, 同时还具有 618—628 nm 的
叶绿素 c 的吸收和 498—503 nm 较低的 β-胡萝卜素的
吸收。因此条带 1—4 主要是 PSⅠ和 PSⅡ的核心色
素蛋白复合物。条带 5、6 除了具有 420 nm、672 nm
Chl a 的吸收和 622—627 nm Chl c 的吸收外, 还具有
500—550 nm 的岩藻黄素等类胡萝卜素吸收, 说明条
带 5、6 是叶绿素 a/c-岩藻黄素捕光蛋白复合物。
3.1.3 色素分析
图 3 为 O.aurita 细胞色素组成, 按照编号, 色素
依次为 1 号叶绿素 c1 (Chlorophyll c1), 2 号岩藻黄素
(Fucoxanthin), 3 号为硅甲藻黄素(cis-Fucoxanthin), 4 号
硅甲藻黄素(Diadinoxanthin), 5号(Diadinochrome), 6号
19-己酰岩藻黄素(Hex-fucoxanthin), 7 号硅藻黄素
(Diatoxanthin), 8 号叶绿素 a 异构体(Ch a allomer), 9
号叶绿素 a (Chlorophyll a), 10号叶绿素 a异构体(Chl
a epimer), 11 号 β-胡萝卜素 (β-Carotene)。
图 4 为 O.aurita 色素蛋白复合物各条带色素组
成, 由图可知, 条带 1 和 3 的色素组成大致相似, 根
据峰的保留时间和峰位可知 1、2、3 号为叶绿素 a
异构体及叶绿素 a, 4 号峰为 β-胡萝卜素。条带 4 的
1 号峰为岩藻黄素, 2、3 号为叶绿素 a, 4 号为叶绿素
a 的异构体, 5 号为 β-胡萝卜素。条带 5 和 6 所含色
素基本相同, 都含有 1 号叶绿素 c, 2 号岩藻黄素, 3
号岩藻黄素异构体, 4 号硅甲藻黄素, 7、8、9 号叶绿
图 2 金色奥杜藻色素蛋白复合物室温吸收光谱
Fig. 2 Absorption spectra of pigment-protein complexes of O.aurita at room temperature
2 期 彭倩倩, 等. 低氮对金色奥杜藻色素-蛋白复合物特性及全细胞蛋白表达的影响 247
图 3 金色奥杜藻细胞色素组成
Fig. 3 The pigment compositions of O. aurita cell
素 a 及异构体和 10 号 β-胡萝卜素而条带 6 中又含
有 5 号峰 19 -己酰岩藻黄素和 6 号硅藻黄素的峰。
条带 7 中 2 号岩藻黄素的含量较高, 而 1 号叶绿素
c, 3 号硅甲藻黄素, 4 号 19 -己酰岩藻黄素, 5 号硅甲
藻黄素均含量较少, 6号叶绿素 a的含量也相对较少,
初步判定条带 7 为游离色素条带。
3.1.4 O.aurita 各条带的多肽组成
图 5 为利用 SDS-PGAE 电泳分 O.aurita 色素蛋
白复合物多肽结果, 图中标记 1、3、4、5、6 分别
表示柱胶电泳中条带 1、条带 3、条带 4、条带 5、
条带 6, M为标准蛋白条带。条带 1中主要分离出 25、
图 4 金色奥杜藻各色素蛋白复合物的 HPLC 色谱图
Fig. 4 HPLC chromatogram of pigment-protein complexes of O. aurita
图 5 金色奥杜藻色素蛋白复合物多肽组成
Fig. 5 The polypeptide compositions of pigment-protein com-
plexes of O. Aurita
26、28、31、33、43、44、65 kD 多肽。条带 3 中
条带较少主要为 32、34、62 kD 三种多肽, 其中 32、
34 kD 为 PSⅡ的反应中心多肽, 条带 4 中分离出的
条带数目较多有 18—20 kD, 24、25、32、34、36、
45、61 kD 多肽, 其中 45 kD 为 PSⅡ的内周天线; 条
带 5 中存在大量的 20 和 22 kD 组成的多肽, 还有少
量的 18、19、25、36 和 43 kD 的多肽; 条带 6 中只
存在 36、43 kD 及 18—20 kD 组成的多肽, 表明条带
5、6 为 O.aurita 中的捕光复合物成分。
3.1.5 O.aurita 各条带的质谱分析
表 1 为条带 1、3、4、5、6 质谱分析结果, 经
数据库比对后发现, 只有条带 1、3、4、6 比对出一
248 生 态 科 学 33 卷
表 1 金色奥杜藻色素蛋白复合物质谱分析数据
Tab. 1 The mass spectrometry data of the pigment-protein complexes of O.aurita
蛋白名称 序列号 相对分子量 得分/% 等电点
条带 1 光系统ⅠP700 叶绿素 a 脱辅基蛋白 A2 光系统ⅠP700 叶绿素 a 脱辅基蛋白 A1
gi/11467571
gi/11467571
82.05KD
83.65 KD
99.99
98.58
7.53
7.14
条带 3 光系统Ⅱ47KDa 蛋白 gi/11467517 56.32 KD 100.00 6.54
条带 4 光系统Ⅱ,CP43 叶绿素 a 脱辅基蛋白光系统Ⅱ D1 蛋白 gi/1185237 gi/11467479
51.84 KD
39.58 KD
98.97
93.37
7.25
5.19
条带 6 开放阅读框 36 光系统Ⅱ蛋白Ⅵ gi/1185129 gi/11467533
3.920 KD
4.920 KD
99.58
97.95
11.70
10.99
定量的蛋白。其中条带 1 中含有 PSⅠP700 叶绿素 a
蛋白 A2 和 A1, 光系统 I P700 蛋白为光系统Ⅰ反应
中心的二聚体蛋白; 条带 3 中含有 PSⅡ中的内周天
线蛋白CP47; 条带4中含有PSⅡ的另一种内周天线
蛋白 CP43 和 PSⅡ中心的 D1 蛋白; 条带 6 中 PRF36
和 PSⅡ蛋白 VI 均为 PSⅡ的捕光色素蛋白复合物。
3.1.6 O.aurita 色素蛋白复合物的命名
按照 Anderson(1978)对菠菜色素蛋白复合物的
命名系统命名 O.aurita 色素蛋白复合物, 根据各条
带的色素组成及荧光光谱、吸收光谱、多肽组成分
析等结果, 将分离到的 7 条带按照迁移率从小到大,
依次命名为 CPⅠa、CPⅠ(光系统Ⅰ复合物)、CPa1、
CPa2 (光系统Ⅱ复合物)、LHCP1 (捕光复合物 1)、
LHCP2 (捕光复合物 2)、FCP (游离色素)。
3.2 低氮对 O.aurita 色素蛋白复合物特性及蛋白表
达的影响
3.2.1 低氮对 O.aurita 色素蛋白复合物分离结果的
影响
图 6 为利用 SDS-PAGE 凝胶电泳分离出的不同
氮浓度下的金色奥杜藻色素蛋白复合物。可以看出
1/3 N条件下CPⅠa较全N中CPⅠa浅, CPⅠ、CPa1、
CPa2 较全 N 变化显著, 仅能隐约看到 CPa1、CPa2
的痕迹, LHCP1、LHCP2和游离色素则变化不大, 说
明氮限制对金色奥杜藻 PSⅡ影响显著。
3.2.2 低氮对 O.aurita 色素蛋白复合物光谱特性的
影响
图 7 为两种条件下 CPⅠa, CPa1 的 77 K 荧光发
射光谱。由图可知, 全 N 下 CPⅠa 的发射峰在
672 nm 处, 还存在 697 nm 处的较低的肩峰, 而在
1/3 N 条件下 CPⅠa 的发射峰位于 673 nm 和 696 nm
处, 且 696 nm 处峰值较高与 673 nm 处峰值相当; 全
N 条件下CPa1 只有一个位于 684 nm处的荧光发射主
图 6 低氮条件下金色奥杜藻色素蛋白复合物的分离结果
Fig. 6 The separation results of pigment-protein complexes
isolated from O.aurita in low nitrogen concentration
峰, 而 1/3 N 的荧光发射主峰则位于 672 nm 处, 较
全 N 的峰位蓝移了 10 nm 左右, 说明氮限制对 PSⅡ
的影响较为显著。
3.2.3 低氮对 O.aurita 全细胞蛋白表达的影响
图 8 为低氮浓度下 O.aurita 全细胞蛋白双向电
泳表达图谱。利用 pH 3—10 的 IPG 胶条, 分离
O.aurita 全 N 和 1/3 N 细胞的总蛋白。经 Image
Master2D Platinum 双向凝胶图谱分析软件对其进行
初步分析, 有 534 个可区分的蛋白点被检测出, 主
要分布在 pH 为 4—7 的等电点区域内, 其中有 65 个
点在两块胶中具有 2 倍以上的差异, 经过 MALDI-
TOF 分析进行蛋白质鉴定和功能预测, 确定了 9 种
蛋白质的质谱信息。如表 2 所示, 其中 6 种蛋白分
别为: 3-磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde-3-phos-
phate dehydrogenase)、RUBISCO 酶(ribulose-1, 5-
bisphos-phate carboxylase/oxygenase)、硫酸盐-ABC
转运蛋白(sulfate ABC transporter protein)、八氢番茄
红素脱氢酶(phytoene dehydrogenase)、RUBISCO 表
达蛋白(Rubisco expression protein)和一个属于 ATP
酶家族的预知蛋白(Predict protein)表达在缺氮条件
下表现出下调趋势; 而有 3 种蛋白分别为金色奥杜
2 期 彭倩倩, 等. 低氮对金色奥杜藻色素-蛋白复合物特性及全细胞蛋白表达的影响 249
图7 低氮条件下金色奥杜藻色素蛋白复合物77 K荧光发射
光谱(EM 438 nm)
Fig. 7 Fluorescence emission spectra at 77 K of pigment-
protein complexes isolated from O.aurita in low nitrogen
concentration
图 8 低氮条件下金色奥杜藻差异蛋白双向电泳表达图谱
Fig. 8 Two-dimensional gel electrophoresis map of
differential proteins of O. aurita in low nitrogen concen-
tration
藻中 ATP 合酶 CF1-α亚基(ATP synthase CF1 alpha
subunit)、线粒体 ATP 合酶的合成酶(synthase of
mitochondrial ATP synthase)和属于 GTP 酶超级家族
的预知蛋白(Predict protein)表达上调。
表 2 低氮条件下差异蛋白质谱分析结果
Tab. 2 The mass spectrometry analysis results of differ-
encial proteins in low nitrogen concentration
蛋白名称 序列号 相对分子量 等电点 得分/%
1,5-二磷酸羧化/
加氧酶大亚基 gi217331141 38KD 7.64 95.4
甘油醛-3-磷酸 gi6979054 36 kD 5.59 93.7
硫酸 ABC 转运蛋白 gi11467510 28 kD 5.90 100
八氢番茄红素脱氢酶 gi217408428 69 kD 5.57 95.8
二磷酸核酮糖羧化
酶表达蛋白 gi116739717 32 kD 7.79 95.2
预测蛋白质, ATP
酶 α/β链的家庭 gi 219110321 56 kD 5.88 99.9
ATP 合成酶 CF1α亚基 gi 11467516 54 kD 4.84 100
线粒体 ATP 合成酶 gi 217406135 58 kD 6.08 100
4 讨论
由圆盘电泳分离结果可知 ,低氮对 O.aur i ta
色素蛋白复合物的影响主要集中于 PS , Ⅱ 该结果与
Loebl 等[10]研究结果一致。色素蛋白复合物光谱主要
由蛋白质结合的色素所发出的, 研究表明色素蛋白
复合体的光谱特性不仅取决于单个色素分子的特性
及色素分子之间的相互作用, 而且还与其蛋白微环
境及色素和蛋白的相互作用有关。因为 Chl a 等色素
分子必须与蛋白质结合才能行使其生理功能, 同时
Chl a 分子的吸收峰在很大程度上与其分子的聚集程
度有关, 聚集程度越高的 Chl a 分子会引起吸收带红
移。由本实验中不同氮浓度的 77 K 荧光光谱可知, 低
氮下光系统蛋白含量减少, Chl a 与之结合较为松散。
由不同氮浓度下色素蛋白复合物的光谱特性及
全细胞蛋白差异表达结果可知, 参与氮素与蛋白代
谢的蛋白和参与光合作用及叶绿素生物合成的一些
蛋白的丰度在低氮条件下均降低, 这与 Hockin 等[11]
研究结果一致。Yang 等[12]研究也表明低氮下, 三角
褐指藻中只有一种捕光复合物蛋白 (fucoxanthin-
chlorophyll a/c protein)上调, 光合作用相关的大多数
蛋白均下调, 这是由于 LHC 表达上调导致活性氧的
大量产生进而降低光合效率。
本实验采用绿胶电泳分离得到的是无活性的色
素蛋白复合物, 由于硅藻没有基质和基粒类囊体之
分, 因此分离纯度较高且具有光合活性的光系统具有
一定的难度, 再加之样品处理条件, 能否充分使大分
子的色素蛋白复合物裂解成小分子的肽段, 有待于对
样品处理方法和手段进行进一步探索。
250 生 态 科 学 33 卷
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