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Construction of a Versatile Escherichia coli-Bacillus subtilis Shuttle Vector and Its Application in Protease Gene Expression

大肠杆菌-枯杆菌穿梭载体的构建及其在蛋白酶基因表达中的应用



全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2013年第9期
枯草芽孢杆菌是革兰氏阳性细菌,细胞壁不含
内毒素,是一些重要工业酶制剂的生产菌。作为表
达系统,枯草芽孢杆菌因其不含内毒素、高效的分
泌能力、易于高密度发酵等优势被广泛研究。枯草
杆菌表达载体 pWB980 是 Wu 等[1]于 1999 年基于
pUB110 改造构建而得,该质粒具有 P43 强组成型启
动子和改造了的果聚糖蔗糖酶信号肽,在枯草杆菌
中复制赋予宿主卡那霉素抗性,该载体自构建后被
成功应用于多种功能基因的分泌表达[2-4]。pWB980
没有大肠杆菌复制子,因而外源基因克隆操作只能
在枯草杆菌中进行。而枯草杆菌的转化步骤繁琐,
且转化效率相对较低,构建大肠杆菌-枯草杆菌的穿
收稿日期 :2013-03-22
基金项目 :国家“973”计划项目(2010CB833804),国家“863”计划项目(2012AA092104),海洋公益性行业科研专项(201305018)
作者简介 :杨键,男,博士研究生,研究方向 :海洋微生物酶工程 ;E-mail :yangjian@scsio.ac.cn
通讯作者 :张偲,男,研究员,博士生导师,研究方向 :海洋生物学 ;E-mail :zhsmid@scsio.ac.cn
大肠杆菌-枯草杆菌穿梭载体的构建及其在蛋白酶基因
表达中的应用
杨键1,2  游志庆1,2  麦志茂1,2  李洁1  田新朋1  张偲1,2
(1. 中国科学院南海海洋研究所 中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室,广州 510301 ;
2. 中国科学院研究生院,北京 100049)
摘 要: 利用基因重组技术,以枯草杆菌表达载体 pWB980 为骨架,插入大肠杆菌的克隆载体 pUC18 中的抗性基因和复制子,
构建穿梭质粒 pY980coli。将海洋细菌蛋白酶基因 hspa 插入 pY980coli 载体 P43 启动子下游,导入枯草杆菌 WB600 中,可实现活性表达。
关键词 : 穿梭载体 P43 启动子 枯草芽孢杆菌表达系统 蛋白酶 分泌表达
Construction of a Versatile Escherichia coli-Bacillus subtilis Shuttle
Vector and Its Application in Protease Gene Expression
Yang Jian1,2 You Zhiqing 1,2 Mai Zhimao1,2 Li Jie1 Tian Xinpeng1 Zhang Si1,2
(1. Key Laboratory of Marine Bio-resources Sustainable Utilization,South China Sea Institute of Oceanology,Chinese Academy of Sciences,
Guangzhou 510301 ;2. Graduate University of the Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049)
Abstract:  A versatile Escherichia coli-Bacillus subtilis shuttle vector pY980coli was constructed by genetic recombination. Resistance
gene and replicon of pUC18, a cloning vector for Escherichia coli, were integtated into the Bacillus subtilis expression plasmid pWB980. Protease
gene hspa from a marine bacterium was then inserted under P43 promoter of pY980coli, and the recombinant vector was transformed into Bacillus
subtilis WB600. Protease activity was detected in the fermentation broth.
Key words:  Shuttle vector P43 promoter Bacillus subtilis expression system Protease Secretory expression
梭载体会使其更易于操作。
蛋白酶 HSPA 是来自海洋细菌 Halobacillus sp.
SCSIO 20089 的 Thermolysin 家 族 的 金 属 蛋 白 酶,
HSPA 具有与所在家族其他成员相区别的适冷特
性[5]。本课题组前期成功获得编码该酶的全长基因
(GenBank 登录号 JX235368),并将其导入大肠杆菌
中表达,但无法获得有活性的蛋白。考虑到大肠杆
菌与 Halobacillus 属进化距离较远,可能无法提供
HSPA 蛋白加工成熟的内环境,因而本研究尝试将
该基因导入亲缘关系较近的枯草芽孢杆菌中,期望
能实现活性表达。
2013年第9期 147杨键等 :大肠杆菌 - 枯草杆菌穿梭载体的构建及其在蛋白酶基因表达中的应用
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌株与质粒 Halobacillus sp. SCSIO 20089 为
本实验室筛选自南海北部沉积物并保藏 ;枯草杆菌
表达载体 pWB980 及 Bacillus subtilis WB600 由广西
科学院王成华博士馈赠 ;大肠杆菌质粒 pUC18 购自
TaKaRa 公司;Escherichia coli JM109 为本实验室保存。
1.1.2 酶和试剂 PrimeStar DNA 聚合酶,限制性内
切酶,T4 DNA 连接酶及 λDNA/Hind Ⅲ DNA marker
均购自 TaKaRa 公司
1.1.3 培养基 LB 培养基(L):蛋白胨 10 g,酵母
粉 5 g,NaCl 10 g,调 pH 至 7.0 ;培养基中卡那霉素
终浓度为 50 μg/mL,氨苄青霉素终浓度为 100 μg/mL。
1.2 方法
1.2.1 大肠杆菌抗性基因及复制子的克隆 根据公
布的 pUC18 的序列及图谱,设计一对引物扩增该质
粒中的大肠杆菌氨苄青霉素抗性基因表达元件及其
复制子(pMB1)。引物序列为上游引物 pUC18-AflII:
5-GAGCCTTAAGCCACACAACATACGAGCCGG-3 ;
下游引物 pUC18-MluI :5-CGCGACGCGTGACGAAA-
GGGCCTCGTGATA-3,下划线分别为 Afl II 和 Mlu I
酶切位点,便于后续的连接反应。PCR 反应的退火
温度为 55℃,延伸时间为 2 min。
1.2.2 大肠杆菌-枯草杆菌杆菌穿梭载体的构建 构
建策略如图 1 所示。将大肠杆菌的复制子以及抗性
基因插入枯草芽孢杆菌表达质粒 pWB980 中,使得
到的新的载体能同时在大肠杆菌和枯草杆菌中复
制。在大肠杆菌中的抗性为氨苄青霉素,在枯草杆
菌中的抗性为卡那霉素。将经 Afl II 和 Mlu I 酶切的
来源于 pUC18 的抗性 + 复制子基因与经同样酶切的
pWB980 线性片段连接。连接产物转化至 Escherichia
coli JM109。氨苄抗性筛选重组子,重组质粒经酶切
测序验证后,用于枯草杆菌的表达。
PCR
blepwB980
Kan
AfI II
ble
P43 promoter
polylinker
rep Kan
Mlu l
AfI II
Ampr rep pMB1
Ligation
oolylinker
P43 promoter
rep
ble
pY980coli
Kan
Ampr
rep pMB1
Mlu l
PCR
Ampr
lacZ
pUC18
rep pMB1
rep
polylinker
P43 promoter
图 1 大肠杆菌-枯草杆菌穿梭载体构建策略
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2013年第9期148
1.2.3 蛋 白 酶 基 因 hspa 的 克 隆 Halobacillus sp.
SCSIO 20089 基因组 DNA 的提取参考 TaKaRa 细菌
基因组 DNA 提取试剂盒说明书。设计一对引物扩增
编码蛋白酶 HSPA 的前导肽 + 成熟肽基因,在上下
游引物的 5 端分别添加 Xho Ⅰ和 Pst Ⅰ酶切位点(下
划线部分)。上游引物 hspa-sense-Xho Ⅰ :5-GCGC-
CTCGAGGGAAAAAGGAACAGATGTCCAAAAG-3 ;
下游引物 hspa-antisense-Pst Ⅰ :5-GCGCCTGCAGA-
TATACTCCTACATTATCCCAA-3。PCR 反应程序为:
95℃ 5 min;94℃ 30 s,56℃ 30 s,72℃ 2 min,30 个
循环 ;72℃ 10 min。获得的基因片段双酶切回收后
与经相同酶切的载体 pY980coli 连接。重组载体经双
酶切及测序验证后用于枯草杆菌的转化。
1.2.4 异源基因在枯草芽孢杆菌的转化及表达 重
组质粒的转化参考 Spizizen 等[6]的方法。转化后涂
布于含 1% 脱脂奶粉的 LB 平板上,50 μg/mL 卡那
霉素进行抗性筛选。阳性克隆可在抗性平板上生长,
且产生水解圈。接种重组子至 LB 液体培养基中,
28℃,180 r/min 摇床培养 48 h,每隔 4 h 检测发酵
液中的蛋白酶活力。
1.2.5 蛋白酶活力的检测 采用福林酚法,具体操
作参考国标蛋白酶制剂国标 GB/T 23527-2009。
2 结果
2.1 pWB980载体的线性化及大肠杆菌复制元件的
克隆
以枯草芽孢杆菌表达载体 pWB980 为模板,进
行反向 PCR,使其线性化,结果(图 2 第 1-3 泳道)
显示,pWB980 质粒由 3 787 个核苷酸组成,线性化
后在约 3.7 kb 处出现条带,证明成功将该质粒线性
化。线性化的 pWB980 末端分别添加了 Afl II 和 Mlu
I 酶切位点,便于后续连接反应。以大肠杆菌复制质
粒 pUC18 为模板扩增其氨苄抗性基因及复制子,如
图 2 中第 4 泳道在约 2.2 kb 处出现条带,与预期基
因片段大小一致,将其命名为 pUC18-coli。
2.2 穿梭质粒的构建与验证
将 2.1 获 得 的 两 段 基 因 用 Afl II 和 Mlu I 双 酶
切后进行连接,连接产物转化至大肠杆菌 JM109
中,挑选克隆提取质粒进行酶切验证。重组子中的
质粒应同时含有 pUC18 及 pWB980 的 序 列, 即 经
过 Afl II、Mlu I 双酶切后得到 3.7 kb 和 2.2 kb 的两
条带。如图 3 所示,证明构建的质粒同时具备在大
肠杆菌和芽孢杆菌的复制能力,命名为 pY980coli。
pY980coli 的启动子仍仅适用枯草杆菌,因而使用该
质粒表达外源基因时可在大肠杆菌中构建,将重组
质粒再转化至枯草杆菌中进行表达试验。
M 1 2 3 4
4.3
kb
2.3
2.0
pWB980
pUC18-coli
M :λDNA/Hind Ⅲ DNA 分 子 量 标 准 ;1-3 :质 粒 pWB980 线 性 化 产 物 ;
4 :大肠杆菌质粒 pUC18 复制元件的扩增产物
图 2 大肠杆菌复制元件的克隆及 pWB980 载体的线性化
M1 M2 1
pWB980
pUC18-coli
M1 :DL2000 DNA 分子量标准 ;M2 :λDNA/Hind Ⅲ DNA 分子量标准 ;
1 :穿梭载体 pY980coli 经 Afl II 和 Mlu I 酶切产物
图 3 穿梭载体的酶切验证
2.3 蛋白酶基因hspa的克隆及重组表达载体的构建
以 Halobacillus sp. SCSIO 20089 菌 株 的 基 因 组
DNA 为 模 板,hspa-sense-Xho Ⅰ 和 hspa-sense-Pst Ⅰ
为引物,PCR 扩增蛋白酶前导肽 + 成熟肽基因 hspa,
在约 1.5 kb 处出现明显条带,与预期大小一致(图
4-A)。PCR 产物经 Xho Ⅰ和 Pst Ⅰ双酶切后与经相
同酶切的穿梭载体 pY980coli 连接,重组质粒经酶切
验证(图 4-B)后委托华大基因进行测序以确认读
码框正确,命名为 pY980coli-hspa。使用穿梭质粒后,
表达载体构建过程在大肠杆菌内完成,转化及质粒
提取更方便高效。将验证无误的重组质粒化学转化
至 Bacillus sutilis WB600 中。
2013年第9期 149杨键等 :大肠杆菌 - 枯草杆菌穿梭载体的构建及其在蛋白酶基因表达中的应用
构建在大肠杆菌中的穿梭载体,如抗辐射菌属-大肠
杆菌穿梭载体 pZT17[7],苏云金杆菌-大肠杆菌穿
梭载体 pHV-1[8],也有枯草杆菌-大肠杆菌的报道,
如刘成君等[9]以 pREP9 为出发质粒构建 pSUGV4,
梁晓梅等[10]以 pBE2 为骨架采用启动子嫁接成功构
建了 pBE2R。本研究首次以枯草芽孢杆菌的表达质
粒 pWB980 为骨架,插入 pUC18 的复制子和抗性基
因,在大肠杆菌和枯草杆菌中均能稳定地复制,提
高了使用枯草杆菌表达系统的效率。
与大部分 Thermolysin 家族的蛋白酶类似,蛋白
酶 HSPA 的成熟肽前有 199 个氨基酸组成的前导肽,
前导肽与成熟肽共同组成酶原,蛋白酶原无蛋白酶
活性。在蛋白酶自成熟的过程中前导肽会被切割加
工成为有活性的成熟酶。前导肽对于蛋白酶的成熟
不可或缺,扮演分子内伴侣的作用[11]。本研究前
期在大肠杆菌中获得可溶性的前导肽 + 成熟肽的蛋
白,但该蛋白无法自加工为有活性的成熟酶,有研
究报道在大肠杆菌的周质空间可检测到重组蛋白酶
活性[12],提示酶原的分泌可能对其成熟有帮助,而
HSPA 的酶原蛋白又无法分泌至大肠杆菌周质空间。
因此本研究尝试利用分泌能力较强的枯草杆菌对蛋
白酶 HSPA 的基因进行表达,并获成功,为进一步
对研究蛋白酶 HSPA 的结构功能关系提供技术基础。
4 结论
成功构建大肠杆菌-枯草杆菌穿梭载体 pY980-
coli,该载体的应用提高了使用枯草杆菌表达系统的
效率。利用 pY980coli 质粒成功表达了一条在大肠杆
菌中不能得到活性表达的蛋白酶基因,在枯草杆菌
WB600 中实现了活性表达。
参 考 文 献
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26(4):1-5.
1.0
2.0
kb
M1 1 M2 2
4.3
2.3
2.0
6.5
kb
A B
hspa
pY980coli
hspa
M1 :DL2000 DNA 分子量标准 ;1 :蛋白酶基因 hspa 的扩增产物 ;
M2 :λDNA/Hind Ⅲ DNA 分子量标记 ;2 :重组载体 pY980coli-hspa
的 Xho Ⅰ和 Pst Ⅰ酶切验证
图 4 重组表达质粒 pY980coli-hspa 的构建
2.4 蛋白酶基因在枯草杆菌中的表达
载体 pY980coli 中的启动子是枯草杆菌 P43 启
动子,该启动子为组成型,因而阳性克隆无需添加
诱导剂即可在含脱脂牛奶的平板上形成活性透明圈,
而阴性对照的空 pY980coli 转化的枯草杆菌菌落周围
无水解圈(图 5),证明蛋白酶基因 hspa 成功在 B.
subtilis WB600 中得以表达。重组菌体在含 50 μg/mL
的 LB 培养基中发酵 30 h 达到产酶高峰为(48±8)
U/mL。
pY980coli-hspa
B. subtilis WB600
pY980coli
B. subtilis WB600
图 5 重组表达载体在枯草杆菌表达的活性平板
3 讨论
穿梭质粒具有两套来源于不同生物的复制子及
选择标记元件,可以克服亲缘关系较远的两种生物
在遗传上的障碍,实现同一质粒同时在不同生物体
内的复制。由于大肠杆菌遗传操作简便成熟,其质
粒拷贝数高,重组质粒易于大量制备,研究者偏爱
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2013年第9期150
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(责任编辑 马鑫)