全 文 :·综述与专论·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2010 年第 6 期
微生物聚谷氨酸(γ-PGA)合成酶及
合成机理的研究进展
郑重 吴剑光 邱乐泉 钟卫鸿
(浙江工业大学生物与环境工程学院,杭州 310032)
摘 要: γ-PGA是一种可降解的、水溶性的,对人体无毒的生物高分子。目前发现多种微生物能合成 γ-PGA,包括芽孢
杆菌、古生菌和一种真核生物。γ-PGA合成基因可分为 capB、capC、capA、capE和 pgsB、pgsC、pgsA和 pgsE,其表达产物组成的
γ-PGA合成酶复合体与细胞膜结合,并消耗 ATP及底物谷氨酸进而合成 γ-PGA,其中 CapB-CapC(或者 PgsB-PgsC)主要负责
γ-PGA的聚合作用,而 CapA-CapE(或者 PgsA-PgsE)则作用于 γ-PGA 的转运。ComP-ComA、DegS-DegU、DegQ、SwrA 和 pgsB
上游的非编码区则对 pgsB、C、A和 E的表达起重要影响。
关键词: γ-PGA合成酶 合成基因 合成机制 基因调节
Study Progress on Poly-γ-glutamate Synthetase
and Synthesis Mechanism
Zheng Zhong Wu Jianguang Qiu Lequan Zhong Weihong
(College of Biological and Environmental Engineering,Zhejiang University of Tenchnology,Hangzhou 310032)
Abstract: Poly-γ-glutamate is a biodegradable,soluble,natural polymer that is non-toxic to humans,and synthesized by seceral
bacteias including bacillus,archaea and one eukaryote The gene required for γ-PGA contain four genes termed capB,C,A,E and pgsB,
C,A,E The synthetase,organized by the four responding expressed proteins,is anchored to the membrane and uses ATP and glutamate
as the substrates to synthesize γ-PGA And CapB-CapC(or PgsB-PgsC)could be a polymerase,while CapA-CapE(or PgsA-PgsE)
could be the transporter ComP-ComA,DegS-DegU,DegQ,SwrA and an untranslated region located on upstream of pgsB are required for
the expression of genes essential to the γ-PGA synthesis
Key words: Poly-γ-glutamate Synthetase γ-PGA gene Regulation of pgs
收稿日期:2010-03-17
基金项目:浙江省生物化工重中之重学科开放基金项目(200801)
作者简介:郑重,男,硕士研究生,研究方向:应用微生物学与基因工程;E-mail:zhengzhong295@ yahoo com cn
通讯作者:钟卫鸿,教授,E-mail:whzhong@ zjut edu cn
随着人们对生态环境和人体健康的日益关注,
近年来,越来越多的科学家开始专注于自然存在的
多聚物。而 γ-聚谷氨酸(poly-γ-glutamate,γ-PGA)
则成为生物多聚物研究中的热点。
γ-PGA是一种微生物合成的水溶性可生物降
解的氨基酸高分子聚合物,它由 D-谷氨酸或者 /和
L-谷氨酸通过 α-氨基和 γ-羧基形成肽键聚合而成
(图 1)[1],相对分子质量一般在 10 kD - 1 000
kD[2],有些能达到 1 000 kD 以上[3],甚至能达到
2 000 kD以上[4]。γ-PGA具有很强的吸水能力,能
图 1 γ-PGA分子结构图
2010 年第 6 期 郑重等:微生物聚谷氨酸(γ-PGA)合成酶及合成机理的研究进展
够吸附一些重金属和放射性物质的水溶液,防止任
意扩散,所以人们同样看好它作为絮凝剂和重金属
及放射性物质的吸附载体[5]。同时 γ-PGA 还能作
为防冻剂、缓释剂载体、增稠剂、饲料添加剂、保湿剂
和酶固定化材料等[6],它对人类无毒害作用,经过
纯化后,人们甚至可以直接食用。它的酯类衍生物
可替代一些生物不易降解的物质,有较大的前景,如
耐热性塑料和纤维薄膜等。
由于 γ-PGA上述的特点,20 世纪 90 年代以来,
日本、美国等一些发达国家对它的制备与应用的研
究十分活跃,开展了微生物发酵法生产 γ-PGA的研
究,并且如今已有不少企业进行了商业化生产,如日
本明治制果公司,中国台湾味丹公司等,中国大陆也
已经有了相应的 γ-PGA产品(海宁和田龙生物科技
有限公司生产的紫金港牌 γ-PGA)。
虽然 γ-PGA已经有了商业化产品,但是目前对
γ-PGA的合成机制及合成酶的研究并不多。综述
了 γ-PGA生产菌、合成酶基因和合成机理的研究进
展,希望能够为研究者的后续研究提供新的视角和
思路。
1 产 γ-PGA的微生物
γ-PGA最早发现于炭疽芽孢杆菌 Bacillus an-
thracis(1933 年) ,是该菌胞外荚膜的主要成分,结合
在细胞壁上,主要功能是保护细菌不受免疫系统的
影响,因此,γ-PGA是其致病性的重要原因,是一种
毒力因子。Kocianova等[7]在 2005 年发现表皮葡萄
球菌 Saphylococcus Epidermidis 同 样 也 能 合 成
γ-PGA,合成的 γ-PGA 结合在细胞壁上,可能是作
为一种保护屏障,使细菌免受噬菌体和抗体的入侵。
以上两种微生物所合成的 γ-PGA 都是结合在细胞
壁上,是其荚膜的主要组成部分,所以人为地将其分
为结合型 γ-PGA。
其他的 γ-PGA 产生菌所合成的 γ-PGA 都是游
离到环境中的,所以人为地将其分为游离型 γ-
PGA。产游离型 γ-PGA 的微生物绝大多数都是革
兰氏阳性的芽孢杆菌,包括 Bacillus licheniformis,Ba-
cillus megaterium,Bacillus pumilus,Bacillus subtilis,它
们能利用游离的 γ-PGA包裹有毒的重金属离子,抵
御不良生存条件[8],同时 γ-PGA 还能作为营养物
质,在非常时期为微生物提供生存所需。还有 3 种
古生菌,Planococcus halophilus,Sporosarcina halophila
和 Natrialba asiatica,能利用合成的 γ-PGA,降低细
菌周围的盐浓度,改善生存环境[9]。另外,Weber
等[10]于 1990 年发现了惟一一种真核γ-PGA生产菌
Cnidaria。
综上所述,结合型 γ-PGA能够保护病原菌逃避
免疫系统,维持病原菌的毒力,而游离型 γ-PGA 则
能改善微生物生存环境,并为其储备碳氮源。
2 γ-PGA合成酶基因
目前对 γ-PGA合成酶基因有两种的命名法,即
cap和 pgs,是根据微生物合成的 γ-PGA的状态来区
分的。如果合成的 γ-PGA结合在细胞壁上,是结合
型的,就将该菌的 γ-PGA 合成酶基因命名为 cap 系
列(意为 capsule,cap) ,如果合成的 γ-PGA游离到微
生物周围的环境当中,是游离型的,就将该菌的 γ-
PGA合成酶基因命名为 pgs 系列(意为 polygluta-
mate synthase,即 pgs)。
迄今为止,有关 γ-PGA的合成基因的报道主要
集中在一些杆菌属的微生物中(如 B subtilis 168,
B subtilis Natto, B licheniformis, B anthracis 和
S epidermidis) ,其中对 Bacillus anthracis和 B subtilis
的 γ-PGA合成基因研究较为详细。
Green等[11]于 1985 年发现 Bacillus anthracis 的
γ-PGA合成基因存在于质粒 pXO2 上;而 Candela
等[12]在 2005 年发现该菌 γ-PGA合成中所必需的 4
个基因,capB,capC,capA 和 capE。而且,他们发现
在一株质粒缺失的 Bacillus anthracis中,不能合成 γ-
PGA,这证明了 capB,capC,capA 和 capE 是影响 γ-
PGA合成最主要的 4 个基因。
Ashiuchi等[13]在 1999 年报道了在 Bacillus sub-
tilis IFO 3336 中有 3 个基因参与了 γ-PGA 的合成,
分别命名为 pgsB、pgsC 和 pgsA(也有学者称其为
ywsC、ywtA 和 ywtB)。2001 年,他们在 B subtilis
(chungkookjang)中将 pgs 基因敲除,发现 pgs 敲除
菌株无法合成 γ-PGA,进而证明此 3 个基因是 γ-
PGA 合成最重要的 3 个基因[14]。Tarui 等[15]在
2005 年将 pgsB、pgsC 和 pgsA 3 个基因转入烟草中,
发现其可以合成 γ-PGA,这个现象也证明了之前的
论断。但是 Candela 等[9]于 2005 年在该 3 个基因
内发现了一小段开放阅读框,并命名为 pgsE(也有
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生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2010 年第 6 期
研究者将其命名为 ywtC)。该段序列与 capE 同源
性很高,所以 pgsE极有可能参与 γ-PGA的合成。
序列分析证明,capBCAE 和 pgsBCAE 有很高的
相似度,4 个基因一同组成 γ-PGA 操纵子(operon)
(图 2)。
图 2 γ-PGA操纵子
3 γ-PGA可能的合成机理
γ-PGA的合成需要底物谷氨酸,底物的聚合,
聚合物的转运等过程,还涉及到 γ-PGA聚合酶基
因的调控。由于 capBCAE 和 pgsBCAE 的序列相似
度很高,而且 Candela 等[9]报道称微生物合成的 γ-
PGA属于结合型还是游离型,取决于另外的基因
capD /pgsS,所以推测结合型 γ-PGA 和游离型 γ-
PGA的合成机理相同。
3 1 底物谷氨酸的来源
γ-PGA合成所需的底物的来源可分为两部分,
内源底物和外源底物。内源底物是指由微生物通过
其他物质自身合成谷氨酸底物,已知的最广泛的途
径是通过葡萄糖经过糖酵解,生成丙酮酸,然后进入
TCA循环,然后通过 α-酮戊二酸转化成谷氨酸(图
3)。而外源底物是直接添加的 L或 D-谷氨酸。
图 3 γ-PGA可能的合成途径及调控示意图
一般外源添加的底物都为 L-谷氨酸,但是对应
合成的 γ-PGA的谷氨酸构型不尽相同,一般认为是
由 D-氨基酸转氨酶(transaminase)参与的间接途径,
实现由 L-到 D-谷氨酸的转化(图 3)。Ashiuchi等[16]
1998年从 Bacillus subtilis IFO333 中分离到了谷氨酸
消旋酶(racease) ,从而为 γ-PGA生物合成中 D-谷氨
酸的来源问题提供了新的答案。
虽然,目前各种 γ-PGA 生产菌选择哪条途径仍
有争议,但是多种 γ-PGA 生产菌,包括 Bacillus sub-
tilis IFO333[16],B subtilis(chungkookjang)[14],Bacil-
lus subtilis NX-2[17],都是通过直接途径实现由 L-到
D-谷氨酸的转化,因为研究者发现这些微生物在合
成 γ-PGA时,谷氨酸消旋酶活性增高而氨基转移酶
的活性是降低的。
3 2 γ-PGA的聚合机制
在 20 世纪 70 年代,Troy[18]首先在一株产 D-γ-
PGA(即合成 PGA的底物均为 D-谷氨酸)地衣芽孢
杆菌 B licheniformis 中,推测了一种可能的合成机
制:首先,ATP 激活谷氨酸,然后由 ATP 脱去 ppi 形
成的 AMP,与谷氨酸在 γ 位结合,形成谷氨酰-γ-
AMP;然后该物质与一种带-SH的酶或者受体(比如
一些硫脂,暂以 A代称)结合,并随后异构化为谷氨
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2010 年第 6 期 郑重等:微生物聚谷氨酸(γ-PGA)合成酶及合成机理的研究进展
酰-A;然后谷氨酰连接到 γ-PGA片段上,并脱去 A,
完成 γ-PGA片段的延伸。
但是,Ashiuchi 等[14]于 2001 年在一株 Bacillus
subtilis中发现,该菌在合成 γ-PGA 时,ATP 水解形
成的是 ADP,而非 AMP,而由于 capB 的表达蛋白
CapB属于氨基连接酶[18],他们提出了另一条合成
机制。首先 ATP 被 ATP 水解酶水解为 ADP 和 Pi,
然后磷酸基团结合到小分子 γ-PGA 的 C-末端,之
后 D-或者 L-谷氨酸的氨基端与 C 端磷酸化了的小
分子 γ-PGA发生亲核攻击,生成 Pi 并延伸 γ-PGA
链。但是该机制仍待证明,比如引物分子是否是小
分子 γ-PGA,其反应位置具体在何处等。
3 3 γ-PGA合成酶各组分的功能
目前,仍然不知道 γ-PGA合成酶如何催化合成
上述一系列反应。虽然已经得知 γ-PGA 合成的必
需基因(即 pgsBCAE 和 capBCAE) ,但是其合成的各
个蛋白(PgsBCAE 和 CapBCAE)的具体功能,仍待
考察。
在 γ-PGA生物合成过程中,可以人为将其分为
两个部分,γ-PGA 的聚合与 γ-PGA 的转运。1997
年,Eveland[19]对 CapB /PgsB 蛋白进行序列分析,发
现其拥有一段序列与 ATP酶相似度很高,可能含有
ATP酶的活性并含有 ATP结合位点(图 4)。Urush-
ibata[20]于 2002 年称,PgsB 能够在试管中单独催化
聚合 γ-PGA,但是 PgsB 的两种形式(33 kD 和 44
kD)必须同时存在,并且该酶很稳定,对变性剂有一
定抵御能力。但是 Ashiuchi 等[2]于 2003 年用 Uru-
shibata[21]的方法进行验证性试验,却发现没有 γ-
PGA。以上试验,说明 PgsB 是否具有 ATP 酶活性,
仍待研究。但是他们都报道了[13,20]PgsB 和 PgsC 的
混合物具有 ATP 酶活性,说明 PgsB 和 PgsC 很可能
形成一种复合物,进而催化 γ-PGA 的聚合。而当
PgsB,PgsC 和 PgsA 同时存在时,聚合酶的活性
最高[13]。
γ-PGA在细胞内合成,并转运到胞外。由图 4
可看出,PgsB在一端含有一小段高度疏水基团,说
明其与细胞膜仅有一小段结合,其大部分存在于细
胞质中;PgsC全部为高度疏水基团,说明其可能存
在于细胞膜内部;而 PgsA 有 3 部分高度疏水基团,
猜测与细胞膜有多处结合,并可能作用于 γ-PGA的
转运,Ashiuchi 等[14]也做了相同的推测。但是 Can-
dela等[12]于 2005 年报道称,PgsA必须在 PgsE 的存
在时才能有活性,并推测两者可能相互作用,进而形
成某种复合物,并希望通过蛋白双杂交来验证该推
测 PgsE 是否是直接与 PgsA 结合,还是间接作用于
PgsA。
图 4 PgsB,PgsC和 PgsA的结构特点[6]
综上所述,PgsB 和 PgsC 共同存在时,能够催化
γ-PGA的聚合,PgsA 能够增加该聚合反应的速率;
γ-PGA的转运则需要 PgsA和 PgsE同时存在。
3 4 γ-PGA合成的调控
目前,在调控 γ-PGA 合成方面的研究不多。
2002 年,Mader等[21]报道,在 B subtilis 中发现高浓
度的磷酸化的 DegU 能够活化 pgsB,C,A 的转录。
而在 2005 年,Stanley 等[22]报道称在 B subtilis 中,
调控蛋白 ComP-ComA,DegS-DegU,DegQ 和 SwrA
对 γ-PGA 的合成是必需的。他们将 degQ 和 swrA
分别敲除,发现任一的敲除都将导致 γ-PGA不能合
成。而后对 degQ进行了反转录 PCR,发现高浓度的
DegQ对 ywsC(与 pgsB相同)的转录起调节作用,而
SwrA对其转录有细微影响,所以研究者猜测 SwrA
主要在转录后起调节作用。而之前的研究已经表
明,ComP-ComA,DegS-DegU 都能影响 degQ 的转
录,所以他们提出了一种可能的调节途径,见图 3。
Kimura [23]等于 2009 年发现 pgsB 基因上游的一段
非编码区对其表达起重要作用。他们将 lacZ 与
pgsB融合,组成融合基因,并通过检测 LacZ 的表达
来定量表征 pgsB的表达情况,然后用一种外切酶从
pgsB上游-811 开始切除,进而研究上游非编码区域
对 pgsB的表达影响。结果表明,-721(+ 1 为转录起
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始位点)之后的非编码区对融合基因的表达起重要
作用,猜测可能是 ComA或者 DegU需要与该段区域
结合。另外,B subtilis 168 被广泛应用于 γ-PGA 调
控研究,因为该菌是为数不多的、拥有全套的 γ-
PGA合成基因却不生产 γ-PGA的菌株。
综上所述,ComP-ComA、DegS-DegU、DegQ 和
SwrA对 γ-PGA的合成都是必需的。其中高浓度的
DegQ对 pgsB,C,A 的转录起重要作用,而ComP-Co-
mA,DegS-DegU 通过调节 degQ 的转录间接影响
pgsB,C,A的转录,SwrA则主要作用于 pgsB,C,A 的
转录后调控。而 pgsB上游的非编码区对 pgsB 的表
达也有重要影响。
4 展望
目前,很多研究者都着眼于如何通过改变培养
条件,提高微生物生产 γ-PGA 的产量,比如优化碳
氮源比例及种类,添加促进剂及金属离子等,而对
γ-PGA的合成机理关注不足。随着研究的深入和
基因改造手段的成熟,传统方法对 γ-PGA产量的提
高越来越有限,而通过基因和代谢流改造,如提高关
键酶活性,增加正向调控蛋白的浓度等,将会扮演越
来越重要的角色。
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