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木质素合成关键酶——肉桂醇脱氢酶的研究进展



全 文 :综述与专论
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2010年第 4期
木质素合成关键酶    肉桂醇脱氢酶的研究进展
龚琰 许梦秋
(北京林业大学生物科学与技术学院,北京 100083 )
  摘  要:  肉桂醇脱氢酶 ( CAD )是木质素合成途径的关键酶之一, 它作用于木质素单体生物合成的最后一步。重点综述
了肉桂醇脱氢酶 ( CAD )的在基因家族方面 ,基因调控方面以及蛋白结晶方面的研究进展, 讨论了存在的问题并提出了相关
策略。
关键词:  木质素 肉桂醇脱氢酶 ( CAD ) 调控
Advance in CinnamylA lcohol Dehydrogenase as
a Key Enzyme of L ignin B iosynthesis
Gong Yan Xu M engqiu
(College of Life Sciences and B io technology, Beijing Forestry University, B eijing 100083)
  Abstrac:t  The c innam y l alcoho l dehydrogenase ( CAD ) is a key enzym e in lignin biosynthesis as it cata ly zes the final step in the
syn thesis o fm ono ligno ls. Th is pape r fo cused on recent reports on cinnam yl a lcoho l dehydrogenase in var ious fields, such as gene fam i
ly, regulation and cry sta llization. M eanw hile, som e prob lem s needed to research are suggested and the possib le developments from now
on are forecasted.
Key words:  L ign in C innamy l a lcoho l dehydrogenase Regu lation
收稿日期: 20091120
作者简介:龚琰,女,硕士研究生,研究方向:生物化学与分子生物学; Em ai:l gong6182006@ yah oo. com. cn
肉桂醇脱氢酶 ( cinnamy l a lcohol dehydrogen
ase, CAD, EC 1. 1. 1. 195)是木质素合成途径中第一
个被研究的酶 [ 1, 2]。它是木质素合成过程中关键酶
之一, 催化多种不同的肉桂醛 (香豆醛, 芥子醛, 松
柏醛等 )生成木质素单体的前体物质。目前, 已经
有许多 CAD cDNA从不同的植物中被克隆出来,到
目前为止已在 NCB I上注册的 CAD的完整 mRNA
序列共 187条, 对 CAD cDNA序列分析的结果说明,
它们具有高度的同源性。
1 CAD基因家族
越来越多的试验证明 CAD在植物体内存在着
基因家族。研究者发现拟南芥中有 9个 CAD基
因 [ 3, 4]。它们的相似性高达 70%, 其中的 6个能催
化 5种肉桂醛生成肉桂醇,另外 3个催化能力很低
且只有在底物浓度很高的时候才表现活性。有力地
说明了在拟南芥中木质素单体的合成不是靠单一
CAD催化生成的。A tCAD5和 A tCAD4被证明催化
活性和同源性最高,因而在木质素生物合成中起着
重要的作用 [ 5]。 A tCAD5能有效催化所有 5种底
物, 而 A tCAD4却几乎不能催化芥子醛。
Fan和 Sh i[ 6]研究表明, 棉花纤维中含有 8个
CAD基因。其中 GhCAD1和 GhCAD6的同源性最
高。在棉花纤维次生木质部形成时, 只有 GhCAD6
的表达量升高。系统进化分析表明 GhCAD6属于第
一类,它在木质素合成过程中起着主要作用。 Gh
CAD1属于第三类, 它被认为是对木质素合成有补
偿性作用的机制。氨基酸序列分析表明棉花纤维中
CAD的辅酶结合位点与 bona fide的 CAD的结合位
点有很高的相似性。Tobias和 Chowk[ 7]最近研究发
现水稻中含有 12个 CAD基因。水稻染色体上 9个
不同位点包括 12个基因编码产物截然不同的
CAD,其中 4个与木质化相关的基因在同一位点关
系密切。
目前最新研究表明, 杨树中含有 15个 CAD基
生物技术通报 B iotechnology  Bulletin 2010年第 4期
因或类似基因 [ 8 ]。系统进化分析表明 CAD基因可
被分为 3类,一类存在于裸子植物和被子植物中,另
外两类只存在于被子植物中。所有的杨树 CAD同
源基因,除了 PtCAD4之外, 都属于第一类和第三
类。促进木质部生长的 CAD基因 ( P tCAD4和 Pt
CAD10)属于第一类和第二类。大多数杨树的 CAD
基因在各个组织,如树叶, 茎,外表皮,木质部等都有
表达, 但表达水平不同。
Saballos等 [ 9]报告在高粱中有 14个 CAD类似
基因, 它们分布于染色体的 7个不同位点。与玉米
和大米的 CAD基因相比, 高粱的 CAD基因在基因
的数量,排列和表达方式上都不同。高粱 CAD2是
主要参与木质化的系统发育的 CAD基因,它的基因
中包含有 3个褐色叶中脉突变体的突变位点。Sat
t ler和 Saatho ff等 [ 10 ]报告高粱 CAD4具有 bm r6的表
型,在木质素合成过程起主要作用。
2 CAD基因调控
研究者已经得到 CAD活性降低的转基因烟
草 [ 11]、杨树 [ 12 ]、苜蓿 [ 12 ]、松柏 [ 13]、玉米 [ 14, 15]和拟南
芥 [ 16, 17 ]。研究表明几种转基因植物的 CAD活性被
抑制, 木质素的总含量并未明显改变,但 CAD的底
物肉桂醛增加了,而产物肉桂醇减少。例如, Bauch
er等 [ 12, 18]将从杨树分离出来 CAD的 cDNA, 进行正
义和反义转化,结果表明木质部组织 CAD活性下降
70%,但木质素含量并未下降。光谱分析显示红色
木质部的杨树香兰素和紫丁香基醛含量提高了。这
些情况可能是由于抑制程度不足或存在其它同工酶
的作用,其原因有待深入研究。
近几年有研究者 [ 17]报道, 将拟南芥的两个木质
素合成相关的基因 ( A tCAD4和 A tCAD5)双突变后,
拟南芥与野生型对比出现倒俯茎, 植株呈现俯倒状
态。这是因为植株缺少维管组织,即大分子木质素
含量大量减少。虽然突变植株中的酚醛的含量却
与野生型中的含量一样。但在最后催化反应步骤
上, 突变体仅有很少的能力去生成木质素单体。
而双突变的木本植物也表现出木质素大量减少的
情况。
3 CAD蛋白结晶
3. 1 蛋白结晶的方法及原理
结晶一般分为 3个不同阶段, 分别为形成稳定
的晶核,由晶核生成晶体,生长结束。单晶培养的方
法 [ 19]通常分为 6种, 包括溶液中晶体生长、界面扩
散结晶、蒸汽扩散结晶、凝胶扩散结晶、水热法,溶液
热法及升华法。蛋白结晶最常采用的是是蒸汽扩散
法 [ 20]。其原理是将蛋白质溶液溶解于含结晶剂的
溶液中,悬滴或坐滴于封闭容器的上方,在容器底部
的池液除不含大分子物质外其他物质与液滴相同。
液滴和池液中的挥发性物质不断进行扩散, 直到液
滴的蒸汽压与池液的相等为止。在该过程中发生的
体积变化使结晶剂的浓度升高, 这很有可能导致过
饱和及随后的结晶。
3. 2 蛋白结晶的影响因素
影响蛋白结晶的主要因素有结晶蛋白的纯度,
过饱和度,温度, pH 值, 结晶剂, 压力, 外加物理场,
及其他影响因素,如蛋白质结晶液的浓度,蛋白质的
来源,细菌及真菌引起的污染程度,样品体积及氧化
还原环境等。
3. 3 国外对 CAD蛋白结晶的研究进展
研究者 [ 21]已经在两个不同温度条件下得到拟
南芥的 A tCAD5的蛋白晶体和 A tCAD5与 NADP+结
合产生的二元蛋白晶体。A tCAD5蛋白晶体分辨率
为 2. 0A。A tCAD5与 NADP +结合产生的二元蛋
白晶体分辨率为 2. 6A。通过对晶体结构的解析,
CAD单体由两个结构域组成: 一个是 Rossmann折
叠的核苷酸结合区域 (残基 163- 301) ,另一个是底
物结合区域 (残基 1- 162, 302- 357)。活性中心就
位于这两个区域中间的接合处。有 Zn2+和 NADP+
等催化辅助物就结合在活性中心。
另有研究者 [ 22]得到了颤杨 SAD(催化底物为芥
子醛的反应 [ 23] )的两个蛋白结晶 (纯化过程中分别
用 DTT 和 ME 处理的 )。它们的分辨率分别为
20A和 25A 。其中介绍了 SAD的三维结构, 通
过对晶体结构的解析, 揭示其活性中心与传统 CAD
蛋白活性中心的预测结构截然不同, 分别从晶体结
构和突变体活性检测结果中证明了 SAD对底物芥
子醛的高特异性。
4 问题与展望
通常情况下,在蛋白结晶试验中,不同的研究人
员会用采用不同材料,甚至是相同的材料,所取得的
试验结果也不一样。除了可能与试验材料及试验药
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品等相关,还可能是试验程序的设计和操作方面的
问题。因此,需要科研人员加大试验力度。
经过国内外学者几十年的研究, 现在部分植物
CAD的基因家族成员已被阐明, 极少的 CAD蛋白
质结构已被确定。随着分子生物学方法的快速发展
及研究的不断深入,必将有更多的 CAD基因家族成
员和 CAD蛋白结构被阐明。
参 考 文 献
[ 1] G ross GG, Stockigt J, ZenkMH. Th ree novel en zym es involved in
the reduction of feru lic acid to con iferyl alcoho.l FEBS Lett, 1973,
31: 283286.
[ 2] M an sellRL, G ross GG, ZenkMH. En zym ic redu ct ion of pcoum aric
acid v ia pcoum aroylCoA to pcoum aryl alcoho.l Phytoch em istry,
1974, 13: 24272435.
[ 3] S iboutR, EudesA, Po lletB, et a.l Expression pattern of tw o paral
ogs encoding cinn amy l a lcohol d ehydrogen ases in Arabid op si s isola
tion and characterization of the correspond ingM utan ts. Plan tPhys iol
ogy, 2003, 132( 2) : 848860.
[ 4] T avares R, Aubourg S, Lecharny A, K reis M. Organ izat ion and
s tructural evolu tion of fou r m u ltigene fam il ies in A rabid op sis thali
ana: A tLCAD, A tLGT, AMt YST and AtHDGL2. P lan tM ol B io.l
2000, 42( 5 ) : 703717.
[ 5] K im S J, K im KW, Cho MH, et a.l Expression of C innam yl alcohol
dehydrogenases and their pu tat ive hom ologues during Ara bidposis
tha liana grow th and developm ent: lesson s for database annotations.
Phytoch em istry, 2007, 68( 14 ) : 19571974.
[ 6] Fan L, Sh iW J, H uWR, et a.l m olecu lar and b ioch em ical evid ence
for phenylp ropano id synthesis and p resen ce of w alllinked phen olics
in cot ton fibers. Jou rnal of Integrat ive Plan tB io logy, 2009, 51 ( 7) :
626637.
[ 7] T ob ias CM, Chow k EK. S tructu re of the cinnam yla lcohol dehydro
genase gene fam ily in rice and p rom oter act ivity of am em ber associ
ated w ith lign ification. P lan ta , 2005, 220: 678688.
[ 8] Barakat A, Bagniew skaZadw orna A, C hoiA, et a.l The cinnam yl
alcoho l dehyd rogenase gene fam ily inP opu lu s: phylogeny, organ iza
tion, and express ion. BMC Plant B iology, 2009, 9: 26.
[ 9] S aballosA, E jeta G, San chez E, V erm errisW. A genom ew ide anal
ysis of the cinnam yl a lcoh ol dehyd rogenase fam ily in sorghum [ Sor
ghum bicolor ( L. ) M oen ch ] ident ifies SbCAD2 as the b row n m id
rib6 gene. Genetics, 2009, 181: 783795.
[ 10 ] S attler SE, SaathoffAJ, H aas EJ, et a.l A Non sensem utat ion in a
cinn amy l alcohol dehydrogenase gene is respon sib le for the sorghum
b row nm idrib6 phenotype. P lan t Phys iology, 2009, 150: 584595.
[ 11 ] H alpin C, Kn ight ME, Foxon GA, et a.l Man ipu lation of lign in
quality by dow nregu lation of cinnam yl alcohol dehyd rogenase. The
Plant Journ a,l 1994, 6 ( 3) : 339350.
[ 12] BaucherM, C habbert B, et a.l Red xylem and h igh er l ign in ex
tractab ility by dow nregulating a cinn amy l alcohol dehyd rogenase in
pop lar. Plant Physio,l 1996, 112( 4 ) : 14791490.
[ 13] Ralph J, MacKay JJ, H atf ield RD, et a.l Abnorm al l ign in in a lob
lol ly p ine m utan t. Science, 1997, 277( 5323 ) : 235239.
[ 14] H u Y, L iWC, Xu YQ, et a.l D ifferen tial expression of cand idate
genes for lign in b iosynthesis under drough t stress in m aize leaves. J
App lGen et, 2009, 50 ( 3) : 213223.
[ 15] Guil laum ie S, PichonM, Martinant JP, et a.l D ifferent ial exp res
s ion of pheny lproanoid and related gen es in b row nm idrib bm 1,
bm2, bm 3 and bm 4 young nearisogen ic m aize plan ts. P lan ta,
2007, 226( 1 ) : 235250.
[ 16 ] S iboutR, EudesA, Pollet B, et a.l C innam yl alcohol dehydrogen
aseC and D are the prim ary genes in volved in lign in b iosynthes is
in th e f loral stem of Arabid opsis. The Plant C el,l 2005, 17:
20592076.
[ 17] JourdesM, C ard enas CL, Laskar DD, et a.l P lan t cellw alls are en
feeb led w hen attemp ting to preserve n at ive l ign in con figurat ion w ith
polyphyd roxycinnam aldehydes: evolu tionary im p licat ion s. Phyto
ch em istry, 2007, 68 ( 14) : 19321956.
[ 18] Baucher M, M arc Van, B oerjan, et a.l B iosyn th es is and genetic
eng ineering of lign in. Plant Scien ce, 1998, 17 ( 2) : 125197.
[ 19] H u lliger J. Angew andte C hem ie. In ternat ional Ed ition in E ng lish,
1997, 33 ( 2) : 143162.
[ 20] B lundell TL, John son LN. Protein C rystallography[M ] . New York,
London: A cadem ic Press In c. , 1976, 811.
[ 21] Youn B, Cam acho R, M oinuddin SGA, et a.l Crystal structu res
and catalyticm echan ism of the Arabidopsis cinnam yl alcohol dehy
drogenasesA tCAD5 andA tCAD4. The RoyalSociety of Chem ist ry,
2006, 4: 16871697.
[ 22] Bom atia EK, Noel JP. S tructu ral and k inet ic bas is for substrate se
lectiv ity in Populus tremu loid es sinapyl alcohol dehydrogenase. The
Plant C el,l 2005, 17: 15981611.
[ 23] L i LG, C heng XF, Leshkevich J, et a.l The las t step of syringy l
m onolignol b iosynthesis in angiosp erm s is regu lated by a novel gene
en cod ing sin apyl alcoh ol dehyd rogenases. The Plant C el,l 2001,
13: 15671585.
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