全 文 :生命科学
Chinese Bulletin of Life Sciences
第22卷 第8期
2010年8月
Vol. 22, No. 8
Aug., 2010
文章编号 :1004-0374(2010)08-0816-01
metagenome 定名为“混杂基因组”为好
赵寿元
(复旦大学遗传学研究所,上海200433)
近年来,有关metagenome和 metagenomics的
报道日益增多,可是对这门新学科的中文定名却是
五花八门,比如metagenome 的译名有元基因组﹑
宏基因组或超基因组等;相应地,metagenomics则
分别译成元基因组学﹑宏基因组学或超基因组学。
在我看来,这些中文译名都未能贴切地反映出
该学科的科学内涵,因而非但不能使读者望文生义
地了解该学科的研究对象,反而徒增茫然之感。为
此,在我编写的《基因和基因组专业词汇》
(2010,复旦大学出版社)中将metagenome译为混杂
基因组,metagenomics 则相应地译为混杂基因组
学。
混杂基因组是指一个生态小环境内各种生物体
的基因组的总和,亦即指的不是某一种生物的基因
组而是许多种生物体基因组混杂在一起的总体。这
是从研究微生物基因组开始逐步发展形成的一门学
科。众所周知,自然界内微生物的种类极多,比
如人的肠道中和 1 克土壤中就有成百上千种微生
物,如果能用基因组研究的常规操作一一获取每一
种微生物的基因组全部信息,那当然是天大的好
事。可是,这做不到。为什么?因为目前能在实
验室的人工培养基上生长的微生物估计只占自然界
微生物种类的百分之一左右。换句话说,我们拿不
到百分之九十九的微生物的细菌菌落,这样也就无
法分离纯化和研究每一种微生物的基因组,其结果
不仅是影响了人们对微生物世界的认识,而且也无
法充分开发利用微生物的基因资源。
1998年,Handelsman等[1]创建了混杂基因组的
研究方法,他们直接提取了土壤样品中的所有微生
物的DNA,其结果是目前可以人工培养的和目前无
法人工培养的所有微生物的基因组 DN A 混杂在一
起,然后把这种混杂基因组DNA制备成混杂基因组
文库(metagenomic library)。从这种基因组文库中虽
然无法分离出每一种微生物的完整的基因组,可是
却能从中分离出各种微生物的基因组DNA,其中包
含了大量的、以前无法认识和克隆的新基因。
混杂基因组学的思路和技术已广泛应用于开发
土壤、深海和极端生态环境中的生物基因资源;还
用于比较研究不同疾病患者的肠道微生物的差别;
了解已灭绝的生物,如猛犸、洞熊以及古人类(如
尼安德特人)的基因组DNA 和相关的基因等。混杂
基因组学已在药物研制、环境保护、生物进化等诸
多领域中取得了丰硕成果。
在了解上述情况后,不知能否获得认同将
metagenome 的中文定名为“混杂基因组”?
[参考文献]
[1] Handelsman J, Rondin MR, Brady SF, et al. Molecular bio-
logical accesses to the chemistry of unknown soil microbes:
a new frontier for natural P products, Chem Biol, 1998, 5:
245-9
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